1HLUA

Structure of bovine beta-actin-profilin complex with actin bound atp phosphates solvent accessible
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of an open state of beta-actin at 2.65 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-ACTIN
molecule tags Complex (acetylation/actin-binding)
total genus 104
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hluA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hluA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1hluA03
2ASPA 1NBWA 5EOYA 2P9SB 3FGUA 2ZGYA 1ATRA 3A5NC 5BRFA 3ULEA 3VEWA 4AM7A 5BPMA 3L0QA 1K8KB 4K41A 4EHUA 4PKGA 2CGLA 1R59O 3C7NB 5KPZA 1BA1A 3FE1A 4MO4A 2KHOA 4EFHA 1BU6O 3MDQA 4BGAA 1YAGA 4FSVA 3VGMA 1NLVA 3LDLA 3DWLA 2BUPA 1YVNA 1HKGA 1BG3A 4DHYA 1KAXA 2IVNA 4M7XA 4RWTA 2QW9A 4B1YB 1NGEA 1RFQA 4M63C 3R8EA 3RSEA 2P9UA 1P8ZA 4I6MA 4BRKA 2QWRA 1XUPO 3WQTA 5AQOA 1MA9B 5FPNA 1BWFO 3DJCA 5AQQA 3SLCA 5AQJA 4JNEA 2FSNA 4IZ9A 2P9SA 4BR9A 5BPLA 5LJVA 2ITMA 4BRMA 4H0YB 2V52B 1J6ZA 4CZKA 4FWOA 1XQSC 5AFUH 1NGHA 2F9WA 3MN9A 4XH4A 1SAZA 3CERA 3SMPA 2NLXA 4CBXA 4BRNA 4FWRA 5B8HA 5AQUA 3HSCA 3ATVA 1IJJA 4H5RA 3VF4A 3ZETB 3LM2A 3VOVA 2D1KA 4FOEA 2Q36A 2Q0UA 4YDUA 3UB5A 4CZHA 4WQ4A 3O80A 4A62A 1C0FA 2D0OA 4XEIA 4XH5A 1NGDA 1T44A 1LCUA 2F9TA 3DXKA 2VYPA 1HUXA 1E4FT 2HF4A 3SJHA 3IDHA 3GBTA 4JD2A 5EVZA 1JCGA 4FO0A 5ADXA 3WEEB 1NGAA 3EZWA 4GY2B 1XC3A 4A2BA 1BOTO 4CZFA 4IJNA 2A3ZA 2A6AA 3L4IA 3LDPA 3ZETA 3VERA 2AA4A 3W0LA 4BREA 1ZC6A 3DXMA 3FZFA 4BQZA 5KQ8A 5JMVA 2A42A 4E1JA 2YJFA 5AZJB 3O08A 4JN4A 3WXLA 1Q18A 2DPNA 4FWQA 2GWKA 3CJ7A 4RCHA 1NGCA 3CJ9A 4JAXA 3QFPA 3B8AX 3H1VX 4QS7A 3VEOA 3P4IA 4IO8A 5FPMA 1TUUA 4GNIA 4H5TA 5AQHA 2IVPA 2QWQA 3WEEA 4QS9A 4WQ5A 5AQTA 2P9NB 2ZF5O 3CETA 3QMLA 5AQFA 4CI6A 2GWJA 2E2NA 4I6MB 2VCPA 1NGBA 2AP1A 2Q97A 1WOQA 4FWKA 1GLJO 3CJCA 4IWVA 1ATSA 2CH5A 1GLDG 3QBWA 3IUCA 3WXKA 5F1XA 1X3MA 5AZJA 4DB3A 4H5WA 3ZX2A 2FXUA 5AQIA 4CZMA 3CJAA 3LDOA 2I7PA 4WYBA 4EAHD 3A5MC 5AR0A 4B1UB 3F9MA 1C0GA 1TYQA 2HOEA 5ADXH 4FWNA 2FSKA 4JHDA 2P9NA 3EKSA 3LM9A 4BVOA 2VWBA 2E88A 1YXQA 5AQYA 1IG8A 3O4WA 2I7NA 3GOIA 3M3ZA 4BRIA 5AQLA 3ATUA 4BRGA 3FZHA 5BN9A 1GLAG 5TKYA 1D4XA 3H6EA 3DXKB 4B9QA 3EL2A 1MDUB 2D0PA 3D2FA 4B1XB 2ASMA 1G99A 3A0IX 4JD2B 3UKUB 3CQYA 5E26A 5AQKA 3KHYA 1DKGD 3EKUA 5FPDA 4MO5A 3EO3A 3DAWA 4B1WB 2HF3A 4FWLA 5AQWA 3CJ1A 3WQUA 3BUZB 5AQSA 4IXCA 5LJWA 1HKBA 2YI1A 1HX1A 2W41A 3FR0A 3D7EO 3MK6A 1T6DA 4PL8A 1U2VA 3GE1A 4F9OA 2QWOA 3DXMB 4PKHA 2ASOA 1SZ2A 3QFUA 4CZGA 4BRCA 2NRHA 3WUHA 3QBXA 2FLOA 4KBOA 1NMDA 3VEZA 3G25A 5F0XA 4BVPA 3VGLA 2D4WA 1JCFA 4FL9A 2A5XA 1ZXOA 2YHWA 1BUPA 2P9LA 3UKUA 5CE3A 3JXUA 2CH6A 3VEVA 4H0XB 2PBDA 2Q1NA 3O5BA 4QS8A 3WXIA 3I33A 4LC9B 2Q2RA 3VF2A 4FOIA 4BR2A 2H3GX 2V51B 4FPAA 5E84A 5BN8A 2QWPA 3BEXA 2UYTA 2OANA 3H45C 3U4LA 3GDQA 4PL7A 3FZKA 2ZWHA 3UE5A 1QQOA 2NZTA 1DEJA 3TPQA 3VETA 4Z94A 1KAYA 3ENOA 2IIRA 3I8BA 2YHXA 3A8YA 4K43A 1Z6RA 5F2RA 3MMVA 5KQDA 2QWNA 4HTLA 3EN9A 1LOTB 4BQLA 3IFRA 3U9DA 3H3OB 1SQKA 1T6CA 3U8XA 1U6ZA 1TYQB 1WUAA 4O8KA 5KPRA 1CZAN 1GLLO 1NM1A 3UKRA 1X9JA 2E1ZA 4JHDB 4CJ7A 4BRDA 3BF3A 5FPEA 1H1VA 4FWPA 3GG4A 4L3QA 3HM8A 3AARA 3GL1A 4A2AA 4NO7A 2QXLA 5AQPA 3CIPA 3KVGA 2CGJA 3JS6A 2E2PA 5BREA 2E8AA 2A40A 3ZEUB 1OKJA 1MWMA 3U9ZA 1KXPA 3VF6A 1QQNA 3D2FB 2E2QA 3AAQA 4J8FA 4YDUC 4BC3A 4WQ4C 3MN5A 4K25A 4H0VB 4CBUA 2QWLA 4B1VA 4ISGA 4BRLA 4BRPA 4A61A 4K42A 3HZ6A 4BRAA 3VENA 3FZMA 3HI0A 1TUYA 3VGKA 3HBTA 4DCHA 3OHRA 3BF1A 3D2EA 4CD3A 4IJAA 2P9IA 3FLCO 1GLEG 3IMXA 3M6GA 1ESVA 4BR4A 5AQMA 1U2VB 3VPZA 4FWMA 4BC5A 1BDGA 1GLFO 4H0TB 3QB0A 5AQRA 2J4RA 2FSJA 2HMPA 4AM6A 1KAZA 4BRHA 3ZEUA 2QWMA 2PAVA 3M1FA 1S3XA 2W40A 3CI5A 4CZIA 4BG8A 1HLUA 2P9LB 1JCEA 5BPNA 2GELA 1MWKA 1BA0A 1ZBSA 3L6QA 4M7YA 5EX5A 2P9PA 5ELZA 4DQ8A 5KPTA 3AY9A 2GTDA 3MN6A 4XH1A 1HJOA 3VEXA 3A5LC 4BGBA 2E20A 2E1YA 3FZLA 4BR7A 2Q31A 2GUPA 5BRHA 3ID8A 1K8KA 4ISEA 3A5OC 5AQNA 3C7NA 3SMSA 4WQ5C 1NGGA 5AQVA 1QZ6A 3CQXA 5I9EB 1NGJA 3ZX0A 3R9PA 1S22A 4CD1A 5EY4A 5JLHA 2QM1A 4BROA 4RTFD 4BR0A 5EXWA 5AZIB 4EHTA 3LL3A 3VEYA 4H0OA 2FF3B 1BO5O 5AQGA 1E4GT 3UKRB 1ATNA 3R6MA 4BRQA 4BR5A 3CHWA 3O6WA 2ZGZA 4H5NA 4PKIA 4MLHA 2GEMA 2P9KB 1HKCA 1V4TA 2BTFA 3MN7A 5LY3A 1Y64A 3H46O 4H0PA 4BG9A 3LDQA 1NWKA 1NGIA 5BRDA 3TU5A 4O5FA 5AQZA 2V7ZA 1QQMA 3C0BA 2V7YA 2YJEA 3H1QA 4BC4A 3O8MA 2EWSA 5AZIA 1GLCG 4Y0WA 4FWSA 5JICA 1GLBG 2WUSA 5AQXA 3J8AA 1QHAA 2FF6A 3AAPA 4CBWA 3D2EB 1YUWA 3WXJA 4BC2A 2IVOA 3KZBA 2P9IB 2YHYA 3O1WA 4EIAA 4NB4A 3ULEB 5JLFA 4BRFA 3FFKB 3WT0A 2P9KA 1V4SA 4CZLA 2YCHA 2Q0RA 3QICA 4C23A 3CJBA 4ISFA 5AFUA 2A41A 3MCPA 3SK3A 1Z05A 1QZ5A 2CGKA 3VESA 4FPBA 3ZX3A 3LDNA 3BP8A 1RGIA 4CZEA 1DGKN 3S41A 4H5VA 4H03B 3ENHA 1HPMA 4B1ZA 5BR9A 3QDKA 2E2OA 1X3NA 4MLEA 3W3DA 4CZJA 1EQYA 3H3NO 3RSEB 2P9UB 3HTVA 1RDWX 1NGFA 4HWIA 2P9PB 3O1BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B9FA 3JYTA 2O8FA 1NK5A 4Z4IA 2P9SB 3A5NC 4NXMK 3VEWA 4AM7A 1ZBIA 2OCEA 4CGGA 3SQ2A 1SKSA 1QHTA 4BGAA 4FSVA 3AVFA 3AA2A 3VGMA 4CJKA 1ASWA 1M1KO 5C10A 5HRPA 3LP1A 1VSIA 4F8RA 2E6MA 1W0HA 5KGXA 4F3OA 1GOAA 4JI6K 4B1YB 4DTXA 4M63C 3MWTA 2P9UA 3RSEA 4AH9A 2G8VA 4I6MA 2VQEK 2QWRA 1MU2A 3E1YA 3WQTA 3DJCA 4JNEA 3NH0A 3OJUA 4BR9A 3ZSVA 5HBMA 2FBTA 5DMRA 4BRMA 2HMIA 4OPHA 1QE1A 1XHXA 1U04A 5A2QO 5GAGP 3QEPA 4DV0K 4Q5VA 1S1XA 2NNWA 3TWHA 3NBPA 4GV9A 3SMPA 5HRNA 4CBXA 5HP1A 2JWLA 3AVJA 3PX4A 1TK5A 4FJGA 1WAFA 4DWIA 3ATVA 4H5RA 3VF4A 1HR0K 3RRGA 4U67L 4B3MK 5HLFA 2Q36A 4YDUA 1Q81O 4CZHA 2GUIA 1HNWK 4M3WA 4RW4A 2ZQBA 1ITGA 1RDBA 1N36K 1NGDA 1T44A 1VQ5N 1RTHA 2VYPA 4BECA 1RDAA 1U49A 3DLBA 2WFBA 3SAFA 1HUXA 4GW6A 3SJHA 4DSJA 4MQ3A 2O8CA 4FO0A 2HHXA 2IC3A 5EU7A 1JJ2M 3KWIA 4FJXA 3LP0A 3LAMA 3WEEB 4HHTA 3VQBA 4FZZA 4GY2B 1XC3A 2KW4A 3NFAA 1HYSA 1BOTO 3P83D 2IDOA 4OGEA 5C12A 1W2BM 2A6AA 3ZETA 1VHXA 4BREA 1TKTA 5DK5A 3MXMA 3DXMA 4FCYA 1BIUA 2A42A 1KVCA 4KO0A 3ZSYA 4DV3K 4ELUA 1X9SA 4JI2K 4KAZA 1OH5A 1XHZA 3NF8A 2P5OA 4DR2K 4E7LA 1BCMA 1NJZA 4HVJA 4J2EA 4FM1A 5D3GA 3VA0A 1TUUA 5AQHA 4H5TA 2ZJRL 2IVPA 4WQ5A 5LMNK 4UQGA 3AA5X 2KZMA 4XJXA 3QMLA 4C1NI 4LFCK 4LSNA 4M45A 1GLJO 3HPHA 5CZ1A 1X3MA 2KFZA 2RPIA 1A5VA 3C65A 5AQIA 1J9AA 5GINA 1U48A 4CGIA 2GBZA 4KB1A 3E9LA 3OYFA 2EX3A 5C25A 4B9NA 3IKMA 3TR8A 2FSKA 3O9TA 4CVNE 3C6AA 3LM9A 3J7ZO 4Z4GA 1ASVA 2E88A 4YORA 4M3XA 1IG8A 1LWCA 3M3ZA 3ATUA 2XY6A 5SZTA 2O4IA 3H6EA 1O13A 3DXKB 4B3TK 1HYVA 3CCLN 1MDUB 3D2FA 2E5LK 3BZKA 4FK0A 3MXIA 4CFBA 3EKUA 5FPDA 4C8OA 4B1WB 1HNVA 3CJ1A 3MEDA 1K73O 2BH1A 2VWJA 5CYMA 1QVGM 4B9SA 4DQQA 1HX1A 3A2FA 3L2RA 3D7EO 3MK6A 1T6DA 1WSFA 3MX2A 4PL8A 1NG9A 4F9OA 2O8BA 1R0AA 3QFUA 4CZGA 4CHNA 4E7KA 3PX6A 4PHTX 3AA3A 4KBOA 4DQRA 3TSQA 3G25A 4BVPA 2D4WA 1JCFA 1BIZA 2JWKA 2UXCK 1FJGK 2ZE2A 3QETA 5CE3A 1RNHA 1J53A 3K57A 4E7HA 2JGUA 4QS8A 3I33A 3T7ZA 4LC9B 4ILGB 2Q3SA 4FPAA 5E84A 1I94K 4M41A 3H45C 3U4LA 1M90O 3DLKA 4BACA 3UE5A 1RT2A 1XC9A 2HVIA 3J80O 5I42A 3THXA 4Z94A 3VQQA 4NCBA 2IIRA 3I8BA 1D9FA 2YHXA 2HHVA 2RKIA 4X66K 1LOTB 4CESA 3IFRA 4CEEA 3H3OB 3NMUA 4J2AA 4V19S 4O8UA 1U6ZA 1WUAA 3UKRA 4N56A 4BE1A 3OYJA 3TAMA 2ZD1A 1VQ8N 2QK9A 2UU9K 3CFPA 4L3QA 1WSEA 2W00A 4EP4A 3GL1A 3LAKA 3HM9A 5AQPA 3CIPA 2HBKA 4ICLA 3KVGA 1RT7A 1NJXA 4AHTA 1MWMA 5M1NA 3VF6A 4YOWA 3KLIA 3OBWA 4DSKA 4K25A 4KHUA 4BRLA 1X1PA 3HZ6A 2A1RA 2VWKA 1F21A 4DCHA 1UAXA 2I5JA 4BY9C 3ZYYX 4CD3A 2Y1IA 4WFNL 1KFDA 3T69A 2BE2A 3CQ8A 4I2PA 3E9OA 2F8TA 4R5PA 1U2VB 4BC5A 1BI4B 3HSTB 3LANA 1D9DA 2O8EA 5AQRA 4BRHA 1S1TA 2W40A 3CI5A 3MXJA 1KRPA 4IOAL 4BG8A 3J7YP 3H08A 4PY5A 1VSJA 1RT5A 1JCEA 4CJWA 3DRPA 2GELA 4RW9A 4FLWA 4LF4K 5EX5A 3TSUA 1VSKA 4I9QA 4DQ8A 2F96A 2VG7A 4MDAA 1N6QA 1NKCA 3VEXA 3A5LC 2WTUA 3DOLA 2NRRA 2GUPA 2NRZA 3ID8A 3EYZA 1IH7A 5AQNA 4JRPA 1NGGA 4JI7K 5AQVA 1Q9XA 4GV3A 2JLEA 4FJ7A 1HYZA 4CD1A 4OPAA 4FZXC 2XY8A 5JENA 4RTFD 2G8FA 3LALA 1JLBA 3OYLA 4KHSA 4ZHRA 4JS5A 2Z1IA 4H0OA 1BO5O 1N34K 3AVNA 1E4GT 1ATNA 2F8SA 1IKVA 2YKMA 1L3SA 3CHWA 1DLOA 4CJLA 4H5NA 4W5TA 2FBXA 1HKCA 3MN7A 4FJLA 1VSEA 4K8XA 5J1EA 3KK2A 2ZJQL 3CFRA 5BRDA 5AQZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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