1JCFA

Mreb from thermotoga maritima, trigonal
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
336
structure length
336
Chain Sequence
MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
molecule tags Structural protein
source organism Thermotoga maritima
total genus 110
structure length 336
sequence length 336
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcfA03
4CI6A 4RCHA 3UKUA 2P9UA 4BRQA 2Q31A 3FLCO 4BRDA 4FPAA 3WEEB 2GWJA 2D1KA 4FWPA 4BRPA 3MK6A 3VOVA 2GTDA 1HPMA 3WXLA 4BR2A 4BC3A 2QWPA 5TKYA 2YI1A 1KXPA 5BPMA 3A0IX 4GY2B 2FF3B 5EX5A 1NGCA 3MCPA 4ISGA 4L3QA 4PKIA 4IXCA 3VEVA 1T6DA 2V7YA 3FZFA 5LY3A 1KAXA 3ZETB 1NMDA 1IG8A 4XH4A 2HOEA 4BR4A 1D4XA 3LDLA 2QWOA 4YDUC 3ZX0A 2FSJA 2IVPA 2CGKA 3TU5A 3UB5A 3LDQA 3QFUA 3A5LC 3VEXA 1HKGA 1SAZA 3D2EB 2PAVA 1SZ2A 3HSCA 1NGEA 5I9EB 4B1VA 4E1JA 5AQFA 1BUPA 3OHRA 2NZTA 3EN9A 1JCGA 1Y64A 4PL7A 3JS6A 4JHDB 1WUAA 3R9PA 2FLOA 3ZETA 3D7EO 4BG8A 4BRIA 3RSEB 2VWBA 4K42A 4XH1A 4H0YB 5ELZA 1GLAG 1ZC6A 3VGMA 3VGLA 3A8YA 4IWVA 3SK3A 1MDUB 1NBWA 3KZBA 3EO3A 3SLCA 2QW9A 1C0GA 1HJOA 3W3DA 3WT0A 4FWQA 2D0OA 4B1ZA 5AQTA 4GNIA 5AFUA 2IIRA 3O80A 2HF4A 5AQMA 4HWIA 1ATSA 3AARA 3S41A 4CZJA 4F9OA 5BPNA 3WXIA 4PKHA 2PBDA 2BUPA 4BGAA 1NGGA 4B1XB 3LM2A 1QQNA 3R8EA 5FPEA 1NWKA 2P9PB 4XH5A 2ITMA 3I33A 2AP1A 2P9LB 4MLHA 2ZGZA 3FFKB 1S22A 1BDGA 1BU6O 1GLFO 1KAZA 5JMVA 5FPNA 3LDNA 5B8HA 4QS8A 4H5RA 4K25A 4BC2A 1E4FT 4WQ4A 1IJJA 5JLFA 2GWKA 4JD2B 1ATRA 1BG3A 1S3XA 1BA1A 3QDKA 2VCPA 3VEWA 3O5BA 4BROA 5AQUA 4K43A 3M3ZA 2P9PA 4LC9B 1ZXOA 1NGFA 1GLJO 3GOIA 4H5NA 4H0XB 1GLDG 1ZBSA 4FWSA 5AQKA 1XUPO 1X3NA 4B1WB 5AQWA 4FWOA 3ULEB 2ZWHA 1Q18A 4IJAA 3CQYA 5JICA 3QICA 4RTFD 4JD2A 3R6MA 3BUZB 1J6ZA 3C7NB 3HTVA 2GELA 1KAYA 3QMLA 3ENHA 4Y0WA 1JCFA 5BRHA 3TPQA 2P9KB 3UKRA 5EY4A 3BEXA 2P9SA 2D0PA 5AQPA 4H5WA 4BQLA 3B8AX 5KPZA 5AZIB 2W40A 3EKSA 3DAWA 4MLEA 1U6ZA 3LDPA 4WQ5A 4QS7A 4HTLA 4H03B 1V4SA 4FSVA 2F9TA 3WEEA 2AA4A 4EFHA 3C7NA 4A2AA 3WUHA 1T6CA 1XQSC 2FSNA 4BRKA 1ESVA 2QWLA 3G25A 1BWFO 4B1YB 1NGIA 1H1VA 2H3GX 2Q1NA 2P9KA 5FPMA 2Q97A 5AQVA 5ADXA 2E2NA 2E1YA 2YCHA 2YHWA 1RGIA 1T44A 3CJBA 1GLBG 5AZIA 4CZGA 4EHUA 3DXMB 5BN8A 5EVZA 3AY9A 4H0VB 5AQHA 4AM6A 4A61A 4BR9A 1Z6RA 3CJAA 3H46O 2CH5A 2GEMA 3AAPA 4Z94A 3VF6A 5KQDA 2KHOA 2ASOA 1G99A 3GE1A 5BREA 2IVOA 3CJ7A 3D2EA 3ZX2A 4H0OA 4CZFA 2CGLA 1GLCG 5AQXA 4CJ7A 3DJCA 5BRFA 3O1BA 3L0QA 4M7XA 2E88A 4H0PA 3LDOA 3QB0A 4CBWA 3DWLA 1ATNA 2QWQA 3M1FA 4JHDA 5AFUH 4H5VA 3WXKA 4BRLA 4BGBA 3CHWA 3HI0A 4B1UB 2V52B 3RSEA 2E1ZA 1MA9B 3VENA 3O4WA 4WYBA 5BR9A 1XC3A 2BTFA 1BOTO 3BF3A 3FR0A 1QQOA 2UYTA 3H3NO 4FWNA 2V7ZA 4I6MB 3VEZA 1DEJA 3CI5A 3M6GA 3SMPA 5AQSA 4H0TB 3WQTA 1QZ6A 5JLHA 5LJWA 2A6AA 3KHYA 3DXKB 1DKGD 3FZKA 3HM8A 3VPZA 3WXJA 2YHXA 3LM9A 2DPNA 1RFQA 3FZHA 3U8XA 2Q2RA 3SMSA 3D2FB 3QBWA 3O08A 1P8ZA 4DHYA 3C0BA 3MN5A 1K8KB 2P9LA 3A5MC 1TUYA 3O8MA 4JAXA 4I6MA 4BREA 5EOYA 3QFPA 1OKJA 2E2QA 1NGJA 2NRHA 2YJEA 4FPBA 2CGJA 4KBOA 4YDUA 3UKUB 2YJFA 3MN7A 1TUUA 2P9UB 2GUPA 3MMVA 2D4WA 4FWMA 3U9ZA 4BRNA 1DGKN 1HKBA 1NGAA 2HMPA 1GLLO 4ISFA 4PL8A 3UE5A 3A5NC 2P9NB 3O6WA 5F1XA 3H3OB 3CETA 2HF3A 2A40A 3FZLA 2YHYA 3D2FA 4AM7A 4CD1A 4BR0A 5AQRA 2F9WA 3IMXA 1K8KA 2EWSA 3U9DA 1NLVA 4CZEA 3CJCA 4DQ8A 4XEIA 5E84A 2FXUA 3H1QA 3GDQA 3VEOA 3ULEA 1YUWA 4IO8A 1RDWX 4MO5A 3U4LA 4CZKA 4BC5A 3GG4A 4CBUA 1YAGA 3VEYA 4BR5A 4BRHA 4CZHA 4O5FA 2CH6A 3GL1A 1YXQA 2P9NA 3MN6A 3VGKA 3ID8A 2QXLA 2A5XA 1EQYA 3P4IA 4WQ4C 5KPTA 4DB3A 4JN4A 2FSKA 4K41A 5AQJA 4DCHA 3ENOA 4BRCA 2E2OA 4CZLA 5ADXH 1HLUA 1BO5O 4CZMA 5AQQA 3CQXA 5AQOA 3BP8A 4B9QA 1X3MA 4BG9A 4BR7A 2E20A 2VYPA 2A41A 2I7NA 2P9IB 1X9JA 4BQZA 1Z05A 4EHTA 3MDQA 4EAHD 1C0FA 3VF4A 3EL2A 2OANA 5AQGA 1HUXA 5AQYA 2QWRA 1HX1A 1U2VB 4BRAA 2Q0RA 2WUSA 3LL3A 1BA0A 2E8AA 4FOEA 2ASPA 1TYQB 4O8KA 2IVNA 2Q36A 1NGBA 2ASMA 3WQUA 4NO7A 1MWKA 1LCUA 1QZ5A 3HZ6A 1HKCA 3DXMA 5F2RA 3GBTA 3ZX3A 2P9IA 3IDHA 3QBXA 4FL9A 4H5TA 4CD3A 1SQKA 2FF6A 1MWMA 3CERA 3ATUA 4WQ5C 5EXWA 5BRDA 1WOQA 1JCEA 4FOIA 4ISEA 4MO4A 5AQLA 3VESA 1U2VA 2NLXA 3H1VX 1R59O 5AR0A 3W0LA 2A3ZA 1TYQA 2QM1A 1CZAN 5F0XA 3SJHA 3J8AA 5KQ8A 3CIPA 3CJ1A 5BN9A 3CJ9A 2V51B 1LOTB 3VF2A 1NM1A 4M7YA 3FE1A 4FWRA 3HBTA 3L4IA 1NGHA 4NB4A 3ZEUB 1GLEG 4FO0A 4M63C 4BC4A 3VERA 5KPRA 2E2PA 4BRFA 3EZWA 5E26A 5FPDA 3BF1A 4RWTA 2QWMA 1QQMA 1V4TA 3FZMA 3JXUA 2ZGYA 3VETA 1YVNA 5BPLA 5AZJB 4C23A 2I7PA 2Q0UA 4FWLA 4EIAA 4CBXA 3IUCA 5AQNA 1NGDA 3EKUA 5AQIA 5LJVA 4FWKA 4IJNA 3O1WA 3I8BA 3A5OC 3DXKA 5CE3A 2ZF5O 3F9MA 2A42A 3H45C 3ZEUA 3IFRA 4BRMA 2J4RA 3L6QA 4PKGA 4J8FA 4BRGA 2QWNA 4CZIA 2W41A 4JNEA 3UKRB 4IZ9A 2P9SB 1E4GT 5AZJA 4BVPA 3AAQA 3MN9A 3ATVA 4QS9A 5AQZA 3KVGA 4BVOA 3H6EA 3FGUA 1QHAA 4A2BA 4A62A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BIZA 1WSGA 1EO1A 4CI6A 2Q31A 3FLCO 3O9RA 4JI3K 2GWJA 2WBNA 3O3FA 3MK6A 4YOTA 4OPJA 3KD1E 1HPMA 2OZSA 4FVUA 5TKYA 4O0JA 3RVCA 3O9QA 4JK7A 2P51A 1NGCA 3NMUA 2HSTA 4IXCA 2E6MA 5LY3A 4E3SA 3AA4A 5GAGP 3M5RA 4KV8A 2QEXN 4DTPA 2QWOA 4GW6A 4B9UA 1LV5A 1NMNA 3G71N 1NK5A 2IVPA 2A1RA 2HNZA 1M1KO 3HSCA 4OVLA 5I9EB 5A2QO 5KRTA 1BISA 1LWFA 3A2FA 3KTQA 3CCRN 5LL6Z 3THWB 3CCJN 4LF4K 3E9OA 3CF5L 3ZETA 4RW7A 3R9PA 3VQDA 1KQSM 1QS4A 3NGZA 4BRIA 5FRMA 2QA4N 4K42A 4JI1K 1NU0A 4PA1A 1KD1O 3U3GA 3PUFA 3VGLA 3A8YA 4IWVA 1MDUB 1RBVA 2Z1GA 3KZBA 3EO3A 4LF6K 1BQNA 1QVGM 1VQ9N 4U7BA 2DFHA 3V9SA 2YKMA 1RDBA 3V1QA 2GBZA 4M3WA 5AQMA 1VSDA 3S5TA 3BY5A 4M3XA 4DUZK 4DTNA 4FJ5A 4B1XB 4FJ9A 2RE2A 1QQNA 4XH5A 4KB0A 3CPEA 5KGWA 4KHYA 2P9LB 1NG9A 3FFKB 1A5XA 1BDGA 1BU6O 4DF4A 3TWHA 2JWKA 2W42A 2HHWA 4DSKA 1JLQA 3CM6A 4AHRA 4EP5A 4K25A 1DLOA 1E4FT 1NJYA 4JI2K 3SV4A 5AJ3K 4C8KA 4F3TA 3QDKA 5JENA 3VEWA 4WCEL 3P39A 3O5BA 5M1KA 1KSPA 4BEBA 3TAEA 1X1PA 4LC9B 3KK2A 3LZJA 5HP1A 1C6VA 3RRGA 1EKEA 4CECA 1NK9A 3VMFB 4A5BA 2PYJA 2G8WA 1LWCA 4Y1DA 1GLDG 1X3NA 3M8SA 4DR6K 5KRSA 4JI0K 3OJSA 4DTMA 3MXJA 4KHQA 3QICA 1IO2A 1XC9A 1NKCA 4DU1A 1J6ZA 4JRQA 3C6AA 4F2RA 3M8QA 1C1CA 5IWAK 4CK1A 4BECA 3ENHA 1HYZA 4BWJA 2P9KB 2O4IA 5EY4A 4ELTA 5AQPA 2W40A 4MLEA 4KREA 1U6ZA 3O9UA 4X64K 4YHHK 5FRNA 4WQ5A 3ENBA 2RF2A 4K0KK 4DR3K 2F9TA 4DV3K 3VTIA 4CIFA 5MLCQ 3C7NA 4K8ZA 4BY9C 4DV4K 1YITN 1RBRA 3RMDA 2VG6A 4ICLA 2E1YA 1VRTA 3JYTA 1EX4A 3SQ1A 4CZGA 3AY9A 4C1NI 1RTIA 4H0VB 4MDAA 2X74A 4FLTA 1T8EA 1Z6RA 3SZ2A 3CJAA 4I2QA 5CZ2A 5GIOA 1KFDA 1S9GA 5C2DA 2KHOA 4CFBA 4N47A 1UA1A 3VA3A 4WE1A 1G99A 1EWRA 4DFJA 3VQ5A 4DTXA 1QSSA 5BREA 2IVOA 4NXNK 4H0OA 4W5QA 2CGLA 3ITHA 4GVMA 1D5AA 3F73A 2Y1IA 4CGHA 4ELVA 4BDZA 3O1BA 4HUFA 4M7XA 4H0PA 3LDOA 5AFUH 2QWQA 3LP0A 2D0BA 4CFCA 3U6FA 1YTUA 1VAZA 3HI0A 3MEGA 4B1UB 1U45A 3DLEA 3AO1A 1TVRA 2YHBA 1VQ8N 4WYBA 1MU2A 3AO4A 3ID6A 3BF3A 1RBUA 3FR0A 3MECA 1DEJA 3SMPA 3C6HA 3L3VA 3MEDA 2IDOA 3WQTA 1L3SA 1TKXA 5JLHA 2NRRA 4DTSA 1NKEA 4I9LA 3VPZA 2O8BB 2YHXA 2DPNA 4GMJB 3TTCA 4CHNA 4H4OA 3THXB 4PUOA 1TK8A 3SMSA 3D2FB 3QBWA 4R5PA 2OZMA 4ID5A 1KCFA 2HHIA 3SAHA 3SJJA 2P9LA 3A5MC 1VQPN 3O8MA 1REVA 3CFOA 3KLIA 3KLGA 4JI5K 4KHUA 4I6MA 5EOYA 4BDPA 2WFBA 2OA8A 1U49A 1OKJA 3OY9A 4CGIA 2YJFA 3PY8A 1IG9A 1VSEA 2VWKA 1N36K 4FM1A 3U9ZA 4ISFA 3K58A 3O6WA 3CETA 1HNIA 2HF3A 1FW6A 3HPOA 3FZLA 2YHYA 4AM7A 4CD1A 1NJZA 2FBVA 2NRVA 4YNQA 5AQRA 2F9WA 2EWSA 4I2PA 4NLCA 4FJ7A 4CZEA 1RT7A 4JLHA 4CF0A 4XEIA 1WBBA 4BE0A 1NOYA 4GV9A 3VEOA 3LAMA 4MO5A 4CZKA 3CCQN 2Y1JA 3GG4A 3TARA 3VEYA 5CY4A 4E19A 3GL1A 3JSMA 3CYMA 1IKXA 5HRSA 4YOVA 1HNXK 5AQJA 3G10A 3OYCA 5ADXH 4B3OA 1HLUA 5AQQA 5AQOA 2KZMA 3IKMA 1X3MA 4BR7A 3QNNA 4NCBA 2E20A 2VYPA 4N41A 2I7NA 1N32K 2OYQA 3VA0A 5TKWA 1KVBA 5JS1A 2D0AA 3TSQA 3TAPA 5AQYA 2YX6A 4UQGA 3OS0A 1U47A 4CJKA 1WN7A 4CHPA 4FOEA 2UXCK 4EZ6A 4O8KA 2IVNA 1NGBA 3WQUA 3AVNA 3THVA 4KB1A 1HNZK 1HRHA 3AO3A 3AVCA 4JI8K 2X78A 3QIOA 4M3RA 2W6KA 3T1AA 4AILC 2YNIA 4X66K 4JKGB 3NVMA 1TAQA 3ZX3A 5CYMA 2D0CA 3QBXA 4H5TA 1KVAA 4CD3A 3G6EN 2FF6A 3QEWA 4CJLA 5BRDA 4WQ5C 1YVUA 1L5UA 5AQLA 4FOIA 3DLHA 4JKFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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