1JCGA

Mreb from thermotoga maritima, amppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
molecule tags Structural protein
source organism Thermotoga maritima
total genus 98
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcgA03
1TYQA 3UE5A 3MMVA 3LM9A 2P9UA 2QXLA 3R9PA 5LJWA 1QZ6A 2P9IA 1K8KA 1G99A 3CQXA 3H6EA 5ELZA 3ENHA 3QFPA 1QQNA 4BRQA 5BREA 2I7PA 2DPNA 3JS6A 1ATNA 2J4RA 1GLDG 1IJJA 4B1ZA 3U9DA 4BRGA 5AQXA 1YUWA 1HJOA 1T6DA 4EAHD 1BO5O 1RFQA 5KPRA 5AQNA 4IO8A 4WQ4C 3C7NA 3HI0A 4XEIA 5ADXH 1U2VA 1ZBSA 5BN9A 4JHDB 4FO0A 1GLEG 1XQSC 1MA9B 1Z6RA 2FSNA 5E26A 4XH4A 3VEVA 4H5NA 3ULEB 3VGLA 3CJCA 5AQYA 3O80A 2GELA 3BF3A 2QWOA 3VGKA 2P9UB 3MN5A 4BRHA 2P9IB 1BA0A 1K8KB 3WUHA 5ADXA 5AQMA 4A2AA 5AZJA 5AFUH 3CQYA 2BTFA 4FWRA 2F9TA 2V7YA 3VOVA 3VGMA 2FLOA 2A6AA 1HKGA 4FOIA 3ID8A 4BC5A 4MO5A 3M1FA 1ZXOA 2CGKA 3A5MC 1X3MA 1T6CA 2BUPA 4EHTA 4H5RA 1GLBG 3I8BA 2ZGZA 1QHAA 1CZAN 3FZHA 4FWSA 4BG9A 3CI5A 1X9JA 4MO4A 3MN7A 3DJCA 3J8AA 3C7NB 3HZ6A 5F0XA 5AQOA 3UB5A 5AFUA 1U2VB 1IG8A 1GLJO 5BPMA 3U8XA 2CH6A 2W41A 1LCUA 1RDWX 4I6MA 4BQLA 3H3NO 3MK6A 3VEWA 4EFHA 3O4WA 3P4IA 3D2EA 3FZFA 1BOTO 2AA4A 4BGBA 3QMLA 3UKRA 3WXJA 4QS8A 1NGJA 1XC3A 3WT0A 4IJNA 5AQVA 4RCHA 5AZJB 3QBXA 3CJ7A 2YJEA 5AQQA 1NGAA 2NZTA 5AQFA 1LOTB 4B1UB 3H45C 3O08A 1HKBA 4DHYA 4K41A 5BPNA 5KPZA 4M7XA 4WQ4A 4C23A 4QS9A 3SK3A 2YHXA 4H5VA 3ATVA 3LDLA 1QQMA 2VWBA 1BU6O 3R6MA 1NGGA 4DCHA 4NO7A 4PKHA 3FLCO 1E4FT 2YHYA 4I6MB 1BUPA 4WQ5C 5AQJA 4CBXA 3D2EB 4MLEA 3U9ZA 1NGEA 4B1VA 3GOIA 3VF6A 1ATRA 4FWLA 3UKRB 4CJ7A 2E2PA 4Z94A 3G25A 3GBTA 4H5WA 4HWIA 2CGJA 4K25A 3ZEUB 3CJ1A 5AQGA 3WEEB 5EOYA 3IDHA 3L0QA 1DGKN 2NRHA 3CJBA 1SZ2A 1S3XA 1NBWA 3CETA 3LDPA 3HBTA 1C0GA 3LDOA 2A41A 3DXMA 3LL3A 3DAWA 1T44A 3VEXA 5BRFA 3FE1A 3A8YA 3BF1A 3ATUA 2I7NA 2YCHA 2QWMA 1YAGA 4B1XB 5JMVA 3W3DA 4EIAA 4FWNA 5AQKA 3IFRA 3WQTA 2E8AA 3CJ9A 2HOEA 2P9LA 1HPMA 1HKCA 4CZIA 3IUCA 5B8HA 4GNIA 3CERA 3H1QA 4J8FA 3KHYA 2VYPA 4JD2A 4BR2A 4CI6A 2VCPA 3DWLA 3DXKA 3VEOA 2Q97A 4PKGA 2W40A 4BREA 4CZJA 5AQIA 5AQZA 5BPLA 2AP1A 3CJAA 4BVPA 4FSVA 4ISGA 4BRLA 1TUUA 3DXMB 5EY4A 3VEYA 2QWQA 4CZEA 5KQ8A 1QZ5A 4H5TA 4WQ5A 3R8EA 3H46O 3JXUA 5KPTA 1NGBA 2V52B 1Q18A 1MWMA 1JCFA 4NB4A 3ZX2A 1HLUA 1S22A 2GWJA 1GLLO 2WUSA 1V4TA 2YHWA 5EXWA 4BROA 4BC4A 5AQRA 2P9LB 5KQDA 1GLCG 1GLAG 2E2NA 3LM2A 3EO3A 3I33A 5AQWA 1Z05A 4AM6A 3AAQA 4JD2B 3FFKB 3DXKB 4FWKA 3WXIA 3O6WA 4L3QA 2Q2RA 3ZETA 2E88A 1HUXA 3U4LA 1BA1A 4CD1A 3ZEUA 4CBUA 2D0OA 2FF6A 3WEEA 4BR9A 4GY2B 2A3ZA 3M3ZA 4IWVA 4H0YB 1SAZA 4QS7A 5JLFA 4H0TB 4DB3A 3FZMA 3QB0A 2FSKA 4H0VB 5AQLA 5AR0A 5I9EB 3A5LC 2KHOA 3H1VX 5F2RA 4LC9B 4CZMA 1DKGD 2GUPA 2QWLA 1NWKA 2ZGYA 3VPZA 1Y64A 3EKUA 5AZIB 4HTLA 3M6GA 2CH5A 4IZ9A 4BVOA 2A40A 1WOQA 2UYTA 2CGLA 3VF4A 4CZLA 2Q0UA 1BDGA 4BRNA 1D4XA 4CD3A 3QDKA 2A5XA 2V7ZA 3IMXA 1JCGA 4BGAA 5JLHA 3GL1A 4MLHA 4CZHA 2FF3B 5LJVA 4JN4A 3D2FA 2Q0RA 4ISEA 5BRDA 3ZETB 1KXPA 5FPDA 1NGHA 4FWQA 2ZWHA 1P8ZA 3WQUA 4BRIA 4IXCA 1BG3A 2PAVA 3MDQA 3A5OC 4JAXA 2ZF5O 2E2OA 3FR0A 5FPEA 5AQPA 2IVOA 4BR5A 4BRMA 4CZGA 1KAXA 4O8KA 5F1XA 4XH5A 4BRKA 4PL8A 2YJFA 2YI1A 4KBOA 5AQSA 5AQTA 2ASMA 3L4IA 4CZFA 5FPMA 3H3OB 2D1KA 3O8MA 1KAYA 4K43A 2E20A 3AARA 4PKIA 3ZX0A 3W0LA 1ATSA 4CBWA 3MN6A 4H0XB 3O1WA 3VETA 5AQUA 4BRFA 2H3GX 2QM1A 3ENOA 2EWSA 2GWKA 5EX5A 2D0PA 4M7YA 4EHUA 3D2FB 4F9OA 4YDUC 2A42A 1TUYA 1X3NA 3FGUA 2HF3A 3S41A 3D7EO 2Q36A 4E1JA 3QBWA 3A5NC 3LDQA 3KZBA 4FPAA 1MWKA 2V51B 2QWPA 2IIRA 2HF4A 3CIPA 4AM7A 1KAZA 5BRHA 3C0BA 3FZLA 3RSEA 3QFUA 1TYQB 4BG8A 1NM1A 2F9WA 4BR7A 5JICA 4WYBA 3ZX3A 2QW9A 4FWMA 5AZIA 3VF2A 1NGIA 1OKJA 2FXUA 2NLXA 3GG4A 3SJHA 1GLFO 3VERA 1U6ZA 2P9KA 1BWFO 4H0PA 1C0FA 1SQKA 4BQZA 5E84A 1HX1A 3B8AX 2Q31A 4BR0A 1J6ZA 2PBDA 2ASPA 3LDNA 3HSCA 2ITMA 4B9QA 2P9NA 1XUPO 2HMPA 2OANA 5TKYA 3GDQA 3KVGA 3VESA 3F9MA 4BRDA 3EL2A 3VEZA 4BRAA 1NGDA 3GE1A 4FL9A 2QWNA 3TPQA 1H1VA 2QWRA 3EKSA 4A2BA 3OHRA 3UKUA 4ISFA 1RGIA 2IVNA 3FZKA 3CHWA 5AQHA 2P9SA 4BC3A 1DEJA 1YVNA 2E1YA 3RSEB 1E4GT 3BP8A 3BEXA 4CZKA 3VENA 1NGFA 2P9PA 3HTVA 3L6QA 4A61A 3WXKA 2E1ZA 3AY9A 4H0OA 4B1WB 5BN8A 3BUZB 4BRPA 5BR9A 2Q1NA 4B1YB 2FSJA 1JCEA 3HM8A 1V4SA 2P9KB 4BC2A 4RTFD 3EN9A 4JNEA 4YDUA 3O1BA 2IVPA 1MDUB 3O5BA 4H03B 4K42A 3TU5A 4XH1A 3WXLA 3MCPA 2P9NB 3AAPA 2ASOA 4RWTA 4FOEA 4Y0WA 1QQOA 3SMSA 1NMDA 4IJAA 1NLVA 2GTDA 5EVZA 3MN9A 3QICA 2D4WA 1R59O 3A0IX 4BR4A 4O5FA 1WUAA 4PL7A 4FPBA 3UKUB 3EZWA 3SMPA 1YXQA 3SLCA 2GEMA 2P9SB 4JHDA 1ZC6A 4A62A 4BRCA 5FPNA 5LY3A 1ESVA 2E2QA 2P9PB 1NGCA 1EQYA 4FWOA 3ULEA 4M63C 4DQ8A 4FWPA 5CE3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TYQA 3AVMA 1RT1A 2P9UA 2QXLA 2WBNA 3R9PA 2FC0A 2P9IA 4KTZA 2HHHK 2E4LA 4OX9K 1XNRK 4FLTA 4DR3K 1QQNA 4BRQA 5BREA 4R79A 3JS6A 2J4RA 1B92A 1IJJA 1GLDG 3AVNA 4CK2A 4CK1A 3OJSA 4BRGA 2E5LK 4M3XA 4IBNA 1N33K 1YUWA 3AV9A 4DLGA 4JYAK 4YNQA 1BO5O 2HHSA 5ADXH 3HI0A 1U2VA 5BN9A 4CEEA 2O8FB 2UXBK 4CJVA 1VSJA 3DLGA 1MA9B 3NF9A 5AQYA 2P51A 4E7JA 4JI6K 1JLBA 1BA0A 1VAZA 5GAHP 5C24A 5AQMA 3QEWA 4A2AA 3THVA 2BTFA 2JGUA 5GIPA 2WFBA 1FJGK 4GVEA 3LP3A 3LPTA 3ID8A 4JK7A 4MO5A 5K14A 1ZXOA 2GUIA 1T6CA 2BUPA 4AHTA 3PLAA 1QHAA 4FWSA 4BG9A 4DG1A 3CCRN 5F0XA 2QKBA 3OA9A 3NE6A 1GLJO 3I0SA 3NGZA 4IG0A 4IEIA 5BPMA 2YX6A 2CH6A 4F4KA 5J2MA 3VQAA 1RDWX 4I6MA 3MK6A 1XWLA 1CZBA 2AA4A 3WNHA 4ILJA 4LFAK 3OYBA 4GKKK 4FJMA 3SUQA 3WT0A 3QINA 4HUFA 3QBXA 3VQEA 4CEZA 4YOUA 1LWEA 1NJYA 3C6TA 2DFEA 2NZTA 3SV3A 2IOCA 3H45C 2NUBA 1HKBA 2RPIA 4K41A 3THXA 3ZSVA 4FJHA 4WQ4A 4LH4A 3OYNA 2O8EB 2HMIA 4IOXA 1QVFM 1QQMA 2IC3A 1BU6O 4CEAA 1NGGA 3BY5A 3AO1A 4NO7A 4O55A 1RDUA 3E9OA 1E4FT 2YHYA 3LP0A 3K9JA 4WQ5C 5AQJA 1SL1A 3S9HA 4AHRA 3D2EB 3U9ZA 4HTUA 1ATRA 3WXMB 3UKRB 2E2PA 4Z94A 3O9QA 4W5RA 4J2DA 4HWIA 2CGJA 5M1OA 3MECA 3ZEUB 3T7ZA 3IDHA 1DGKN 2NRHA 3CJBA 3HRGA 1JJ2M 1ZYQA 2GX9A 3IAYA 1TKTA 4K8XA 4CHYA 4B9NA 1WAFA 3DLLL 3AO5A 3OS1A 3CETA 3LDPA 2G8KA 4HVJA 1QVGM 5CZ2A 1K73O 3EZ5A 3VEXA 3CF5L 5BRFA 3BF1A 2I7NA 5J2NA 3WQTA 5AQKA 4N47A 1BQNA 2P9LA 3OYHA 4LD0A 3EYZA 2O8DB 1T05A 4AILC 2Y1IA 2R7YA 2VCPA 1KFSA 2FBXA 4HUGA 4PKGA 4M3ZA 5JS2A 4BREA 5AQIA 5AQZA 3QERA 1TKZA 4E7KA 3K57A 4BVPA 4FSVA 1Q86O 1WSIA 4UQGA 1Q7YO 4JKHA 4BDPA 4GV6A 3MCAB 4MQ3A 3DRRA 1QZ5A 4DUZK 3H46O 3JXUA 5KPTA 2I5JA 1DLOA 4CHZA 1Q18A 4NB4A 3L3VA 2RN2A 2GWJA 2VGNA 4OPKA 2WUSA 2W6KA 1BGXT 3J7AP 1WLJA 5KQDA 2E2NA 3LM2A 1Q8IA 3EO3A 4BWMA 1L5UA 4DR6K 4CJRA 4CJTA 4PUOA 3J7ZO 3Q7BA 3ZETA 3K0SA 3F9KA 4DR5K 4I7FA 1VQNN 4KHSA 3D6RA 1W9HA 4H0YB 3O3FA 1SAZA 4CFCA 4EZ6A 3HO1A 1LAVA 5JLFA 3PO4A 2Z1JA 2RF2A 3FZMA 3QB0A 5I9EB 3A5LC 4E7IA 2ZD1A 4F3OA 4ELTA 3KJVA 3OBYA 3VPZA 5AZIB 4M41A 4IZ9A 3HPOA 1RDDA 2A40A 3CC2N 4Z0UA 4CZLA 1Z25A 2Q0UA 5J2QA 4BRNA 4CD3A 1D8YA 3QDKA 4IFEA 1VK0A 2UXDK 3IMXA 4MFBA 1HJRA 3D2FA 4DU3A 4CESA 3N4QA 4CGDA 4FWQA 2OTLN 4ILGB 4JAXA 4BECA 3HK2A 3HSTB 1FXXA 2G8HA 1KAXA 4OLAA 3OYJA 4DUYK 4O8KA 3HP6A 5HRRA 2YI1A 3J7YP 3AGKA 5AQTA 3TSUA 1U49A 4CZFA 3O8MA 3V9WA 4FVMA 4Q0BA 3AO4A 4DTSA 3KLIA 3VETA 3ZT2A 2QM1A 3NCIA 2EWSA 5EX5A 1HQUA 5GAGP 4EHUA 1UA1A 4YDUC 5C42A 3FGUA 2IGIA 1R0AA 4JRPA 1W2BM 5J2PA 4AH9A 5FLXO 4E89A 5HP1A 3ZSOA 4LF4K 2NRVA 4E1JA 3OYLA 3VQ9A 1L3SA 4YY3K 4DTRA 3TAPA 4FZYA 1MWKA 1VSKA 4HCBA 4WFNL 2HF4A 2B6AA 1KAZA 5BRHA 4E1NA 4BACA 3RSEA 5HL7L 1XC9A 1VQ8N 4BR7A 1M1KO 2QW9A 2YNIA 3VF2A 1JLQA 3O9SA 3QLHA 1W7AA 1KSPA 4C8LA 4B9MA 1TV6A 1BL3A 4DQSA 2HVHA 2P9NA 1TK0A 3VQ7A 1EWQA 3TAFA 3BGRA 1HMVA 5TKYA 3RMBA 3TWHA 1VQ9N 4BRAA 4FL9A 3TANA 3TPQA 3CQ8A 1JLCA 1VQMN 3KD1E 3KWIA 1QSLA 1DEJA 3QEXA 2P5GA 4CZKA 1N8RO 4L8RB 3PSFA 2P9PA 3WXKA 2E1ZA 4H0OA 4DQIA 1RILA 3T19A 3THWB 3ZSWA 3P38A 5BN8A 3CD6N 5BR9A 4BRPA 4KB1A 4NXNK 4B1YB 3LWMA 1SKSA 2HB5A 4FW1A 3OY9A 3L2RA 4JNEA 3NDKA 4M3TA 1MDUB 3O5BA 1A5VA 3JYTA 4YOVA 4FLVA 3DLBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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