1JCGA

Mreb from thermotoga maritima, amppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
molecule tags Structural protein
source organism Thermotoga maritima
total genus 98
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcgA03
4FOEA 3WEEA 3EKSA 4I6MB 3FR0A 1HUXA 2ZWHA 2ZGZA 1GLFO 3FFKB 3A0IX 3WXJA 2A41A 4BC2A 1XUPO 5KQ8A 4PKIA 2YCHA 5AR0A 3O08A 1KAXA 2P9IA 4H0VB 1HKGA 5KPZA 3A5LC 4CZIA 5ELZA 2PAVA 4JD2A 1X3NA 2E2PA 2NLXA 4BC3A 4H0YB 2J4RA 4CD3A 3AAPA 2YHWA 1GLBG 4EHTA 4BRKA 3H45C 4H0PA 1U6ZA 1NGIA 5F0XA 3G25A 3JS6A 1NGGA 3HM8A 2D1KA 5FPNA 1NGEA 1DKGD 3R9PA 4FWRA 4HWIA 1BU6O 5BPMA 4BVOA 2P9IB 3CIPA 4BG9A 4H0TB 5FPEA 3HBTA 1NWKA 4A2AA 5AQKA 4Z94A 2FSKA 3W0LA 3LDLA 4CBWA 2V7YA 1P8ZA 1J6ZA 2A5XA 4JN4A 3MDQA 5EVZA 3FZMA 4H03B 2A3ZA 4CZMA 3LL3A 4CBUA 1E4FT 5AQIA 2QXLA 1TUYA 3HTVA 3LDQA 5BRFA 3L0QA 1NGDA 1LOTB 3MN9A 1K8KA 2YJFA 2Q0RA 1TYQA 2F9WA 3WT0A 5JLHA 4GY2B 1C0FA 1BO5O 4F9OA 1BWFO 2E2OA 3VF2A 5AQJA 1ATRA 3A8YA 5EX5A 3VOVA 2V52B 2P9KA 3O1WA 4O5FA 5E26A 3QDKA 3WUHA 4B1XB 2E2QA 4DCHA 2H3GX 1T44A 2I7PA 2CH5A 4JHDA 3U4LA 4B1VA 4BQLA 2UYTA 3BF1A 1NGCA 3SMPA 3GDQA 1TYQB 3MK6A 3M1FA 4JNEA 3WXKA 3HZ6A 3WQTA 2F9TA 3IMXA 5BN8A 2E1ZA 3CJCA 4BROA 4A2BA 3CQXA 1JCFA 3MMVA 4JHDB 4CZGA 3GBTA 1ESVA 1RGIA 1HPMA 3ZEUB 3CI5A 5AZJA 3FE1A 1SQKA 3U8XA 2DPNA 2D0OA 5AQHA 3LDPA 2A6AA 2P9NA 2GUPA 4CZFA 5LY3A 3TU5A 3CETA 1HKBA 2V51B 3IDHA 3GG4A 3AY9A 5AFUH 2P9PB 4M7YA 1JCGA 3EL2A 2FF6A 2IVNA 3ENHA 2BTFA 3WQUA 1IG8A 4FL9A 4K41A 3ZETB 4YDUA 2W41A 3MN5A 5LJVA 4WQ5A 4QS9A 5AZJB 1CZAN 2FSJA 5EXWA 2QWMA 1HLUA 1Y64A 1LCUA 1SZ2A 2ASOA 4IXCA 3ZX2A 3EZWA 4B1YB 4DHYA 5B8HA 4QS8A 1WOQA 1MA9B 2FF3B 4B1UB 3O80A 1U2VB 3O6WA 3ZX3A 4ISEA 3IFRA 5I9EB 2P9NB 3CJBA 1NM1A 2QWQA 2A42A 4FWOA 4FPAA 3UKUA 3O4WA 2YHYA 1ZXOA 5BR9A 1BUPA 4BC5A 3UE5A 1IJJA 2IVPA 4J8FA 3O1BA 5TKYA 3U9ZA 1YXQA 4IJAA 5AQOA 2E2NA 3C7NA 5F1XA 1GLEG 4Y0WA 2GWJA 3ULEB 4PL7A 3WEEB 4MLEA 1SAZA 3BF3A 3FZFA 1BDGA 1Z05A 3KZBA 1HJOA 4BRPA 5ADXA 2CGJA 1X3MA 3FLCO 4AM6A 3EKUA 1Z6RA 2QWNA 3UKUB 1JCEA 4EIAA 4FWKA 1QZ5A 2BUPA 3DJCA 2PBDA 4JD2B 4H5RA 3HSCA 3VEYA 2E8AA 5BRHA 2AP1A 4ISGA 5AQWA 2QWLA 3CJAA 1QQNA 2FLOA 1QQMA 2ASMA 1MDUB 5BN9A 1C0GA 4K42A 4BRQA 5BRDA 1NGHA 1T6CA 2P9SA 1ZBSA 3BEXA 2CGLA 5BPLA 3D2EA 1S3XA 4L3QA 3VESA 3L6QA 1NGAA 3W3DA 3FZLA 4B9QA 3QMLA 2HF3A 3DXMA 3OHRA 3QB0A 1V4TA 1MWKA 3VEZA 4CBXA 5KPTA 2GTDA 5AQQA 3LM2A 4BREA 3VERA 4C23A 5AQYA 1GLJO 2P9LA 3SLCA 3H3OB 4AM7A 2QWRA 1YVNA 3D7EO 2AA4A 5AQMA 5BPNA 3ENOA 1K8KB 5AQPA 3CHWA 3VEWA 4LC9B 5AZIA 4BRAA 2QM1A 2FSNA 5AQSA 4BRLA 3EN9A 4A61A 4XEIA 2V7ZA 3MN6A 2P9KB 3CJ9A 3I8BA 3QFUA 4WYBA 1KAYA 4MO5A 2P9LB 5AQGA 1XC3A 3JXUA 1X9JA 1HX1A 2Q0UA 2ITMA 2Q2RA 4H5WA 2HOEA 4HTLA 4BG8A 4BR0A 4BR9A 3AAQA 1ZC6A 5AZIB 4FPBA 1GLCG 5JMVA 5E84A 4BRFA 3R8EA 5FPMA 4DQ8A 3J8AA 4IO8A 4IJNA 2P9UA 3WXLA 2VYPA 4WQ4C 4B1WB 1BA1A 1BG3A 4H5TA 1ATSA 3H1QA 4CZJA 2ASPA 4K43A 3H3NO 3QBXA 4H0XB 2HF4A 4NO7A 2OANA 2ZF5O 1GLAG 4I6MA 5JLFA 2I7NA 4CI6A 2VCPA 1D4XA 4BGBA 1GLDG 3O8MA 4M63C 3VEXA 1V4SA 3ATUA 5AQTA 4BRMA 1NLVA 2IIRA 4M7XA 3GL1A 4FWNA 4BC4A 2GWKA 2IVOA 3DAWA 3IUCA 1KXPA 4CZKA 1NGBA 3M3ZA 5AQNA 2QWOA 3VF4A 1S22A 3A5NC 4PKHA 1YAGA 1H1VA 1DGKN 5AQRA 4CZEA 2W40A 5JICA 3EO3A 2GELA 5FPDA 4BVPA 4BRDA 4BRCA 2HMPA 2CGKA 3BUZB 4EHUA 4PKGA 2YI1A 5BREA 3LDOA 3H46O 3P4IA 3H1VX 4BRHA 1Q18A 4BRGA 3DXKA 3FGUA 2EWSA 2D0PA 3VENA 4XH1A 3UB5A 2E20A 1GLLO 1XQSC 4CD1A 1ATNA 4H5NA 3C7NB 4KBOA 3UKRA 2E88A 5AFUA 3F9MA 5AQVA 3SMSA 3VGMA 4JAXA 4BR5A 4IWVA 3R6MA 4FSVA 4GNIA 4IZ9A 4RTFD 3VPZA 3TPQA 4B1ZA 4CZLA 3DXKB 3AARA 4NB4A 2Q36A 3ID8A 4XH5A 1WUAA 3QICA 2Q31A 1G99A 2ZGYA 4RCHA 3ATVA 3D2FA 4BGAA 3UKRB 2Q97A 1T6DA 3CJ1A 1QZ6A 1YUWA 2P9SB 3RSEA 3D2EB 3GE1A 2NRHA 3VGLA 4EAHD 2D4WA 4BRNA 1R59O 5F2RA 3SK3A 3VEVA 3M6GA 3MCPA 5EY4A 3DXMB 3CERA 4EFHA 3QBWA 2QW9A 2YHXA 3D2FB 4FWQA 4CZHA 3VGKA 3C0BA 1BA0A 4O8KA 2NZTA 3S41A 2YJEA 3A5MC 4BR2A 4E1JA 2KHOA 1RDWX 1QHAA 1KAZA 2CH6A 3SJHA 5KQDA 3HI0A 4FWPA 4MLHA 1HKCA 3RSEB 5CE3A 1TUUA 1NBWA 3WXIA 3ZEUA 3DWLA 2Q1NA 3VF6A 4FO0A 3QFPA 4BR4A 3ULEA 4BQZA 3GOIA 2GEMA 3FZKA 5LJWA 1DEJA 5AQLA 3MN7A 3KVGA 4H0OA 3VEOA 4A62A 4RWTA 4QS7A 4XH4A 1E4GT 3I33A 2P9PA 3LDNA 4H5VA 2E1YA 5AQFA 1RFQA 3ZETA 2VWBA 3KHYA 2A40A 5ADXH 3BP8A 1NMDA 3A5OC 3O5BA 4WQ4A 5EOYA 4FWSA 1NGJA 1NGFA 3FZHA 1EQYA 4ISFA 1U2VA 5AQUA 4FWLA 5AQZA 3B8AX 2WUSA 3ZX0A 1MWMA 3CQYA 4DB3A 4CJ7A 4BRIA 5KPRA 1QQOA 3VETA 4MO4A 2QWPA 4BR7A 2P9UB 4YDUC 3CJ7A 4WQ5C 1OKJA 3LM9A 4K25A 4PL8A 4FWMA 5AQXA 3U9DA 1BOTO 2FXUA 3L4IA 3H6EA 4FOIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EKSA 3NCIA 4F3TA 3P5JA 1HUXA 4C8LA 4V19S 1GLFO 3FFKB 3A0IX 3KD1E 1LWFA 1EWQA 3WXJA 4BC2A 5KQ8A 4Z4IA 2YCHA 5AR0A 3K5LA 4B9TA 3OYFA 4CZIA 5LMUK 2PAVA 4JD2A 4DFKA 1X3NA 2E2PA 2NLXA 4DLGA 4H0YB 4FJIA 1BQNA 3I8DA 1A5WA 4BRKA 1U6ZA 3LANA 5F0XA 3BGRA 1NK5A 3HYFA 1NGGA 4LD0A 1DKGD 2WOMA 5BPMA 1VSLA 4DR7K 3PIPL 3CIPA 3UIQA 3HM9A 3SBGA 4G9ZA 3OYKA 4OVLA 4OKEA 4A2AA 4DUYK 1QSSA 3ZT1A 4CERA 4MDBA 3AA3A 4GKJK 4KB0A 3LDLA 4CBWA 4DR1K 2Z1HA 4FZXC 3PV8A 2QEXN 4KREA 4JN4A 4E19A 3CCRN 4CZMA 2Y1IA 1Q9XA 2HHIA 3MXMA 4PY5A 2NNWA 4JRQA 1NGDA 4KHWA 4X65K 2Q0RA 4DSLA 2X74A 1C1BA 2OPQA 3ZT4A 1BO5O 2OA8A 1BWFO 4DS4A 2XY8A 3QIOA 5AQJA 3A8YA 2V52B 4O5FA 3L8BA 1HQEA 3THXA 4ILJA 3RMAA 3OYCA 2H3GX 3LPUA 4YOXA 5GAHP 4FJ5A 1BL3A 4B1VA 1RT2A 2UU9K 3VTHA 3OYJA 3MK6A 3WXKA 3C94A 1JLAA 1IBMK 4Z4GA 4CGDA 3VA0A 5BN8A 3WQTA 2F9TA 3PIOL 2YNGA 5DK5A 3ZT0A 2E1ZA 2Z1JA 1TK0A 4U67L 3P83D 1U48A 4BY9C 3KKRA 4YFUA 1EXQA 3O9SA 2PYJA 3K5NA 1T7PA 4DG1A 5J2MA 2HW3A 1Y97A 1T3VA 3TAMA 1HKBA 2V51B 3IDHA 4OKKA 5K14A 4HUEA 4KTQA 3SQ0A 1O1WA 1O13A 3EL2A 4JKGA 4FL9A 4CEDA 4YDUA 3MN5A 3DOLA 3O9TA 4QS9A 4AHUA 5AZJB 5EXWA 4DV0K 2QWMA 3CCJN 4KHYA 4NXNK 4CHZA 3SUQA 1MA9B 3O80A 4ISEA 4CIFA 4FZZA 2P9NB 1NM1A 4DQSA 1J5OA 3O4WA 5DM7L 2YHYA 1ZXOA 1BUPA 2VWKA 1RCHA 3U9ZA 5AQOA 3C7NA 2ZQBA 3ULEB 1B9DA 1SAZA 3FZFA 3KZBA 1HJOA 3V9WA 3VQQA 5ADXA 5SWMA 3PSFA 2OTLN 3T19A 4CEEA 3K9KA 2O8DB 2QWNA 3L2RA 3UKUB 1JCEA 4EIAA 3VQCA 1NU0A 3DJCA 2QK9A 4ISGA 3SUPA 3H08A 2WC9A 1QQNA 4DF4A 3ASMA 3KWIA 3V9ZA 1MDUB 3E9PA 4IBNA 4KO0A 4BRQA 4ZTFA 4Z4EA 3AVJA 5FRMA 1KD1O 1IH7A 2HBKA 2HHVA 1S3XA 2GX9A 3DLEA 4L3QA 5CYMA 3L6QA 4GVMA 3FZLA 4RW6A 2VG5A 3DXMA 1NJWA 4WCEL 3QB0A 3SPYA 1W2BM 4YOTA 4LF4K 4JKCA 2GTDA 3LM2A 3EYZA 3RWUA 4IOXA 4B9VA 3HO1A 4AM7A 3PSIA 3OW2M 4CHPA 2AA4A 3O9UA 4ELVA 5AQPA 3ZSRA 3V1QA 1U4BA 2QM1A 2O4IA 1JLCA 3OBYA 4JK9A 4BRLA 3PY8A 3TR8A 3CMAN 2UXCK 3K5MA 1W9HA 4NXMK 3KLHA 2QI2A 4ZHRA 4XEIA 3MN6A 4CJWA 2P9KB 3JXUA 1BI4A 5IWAK 4WFBL 3M8SA 1HYSA 5GIPA 2ITMA 3CFRA 4DR6K 1KVAA 1TV6A 1T03A 1C1CA 3AAQA 3PO4A 1VQ7N 3NGIA 4B8CA 3O4NA 5JMVA 4JEPA 1DTQA 1IKXA 3ENBA 4BRFA 2Y1JA 3AO5A 3L3VA 3OS2A 1TKTA 4DQ8A 4J2AA 3VQ9A 2YKMA 1QSYA 1S1UA 1BA1A 4H5TA 4CECA 1RTDA 4RW7A 3AGRA 3H3NO 4K43A 4NO7A 3HPHA 2ZF5O 4DWIA 4FJKA 1GLAG 1A5VA 2I7NA 4JKDA 4CI6A 4LF6K 2FBTA 1D4XA 4BGBA 4KTWA 1J5EK 1NLVA 4M7XA 2ZJPL 4FJMA 1FKOA 4HVJA 5C42A 3DAWA 1NGBA 5AQNA 5M1PA 4GW6A 3A5NC 3OYDA 1H1VA 1WNSA 4CEOA 5JICA 4O55A 1KQSM 5M1FA 5HBMA 1HQUA 2CGKA 3DRPA 4W5TA 5C2DA 4K8XA 1LWCA 3TSPA 4EHUA 4DR3K 3LDOA 3H46O 4BRHA 1Q18A 4BRGA 1F21A 1N33K 4NCBA 3VQ7A 1CXQA 3VENA 3QETA 3M8QA 1TK8A 4CD1A 2OPPA 5DM6L 2JGUA 5AFUA 1QVGM 2YKNA 3F9MA 4PQUA 4BR5A 4IZ9A 3O3GA 4DKWA 4B1ZA 2RE2A 1GOCA 3CQ8A 3DXKB 1C1AA 4Y1CA 4DQQA 4DR2K 1VSEA 3F9KA 4Z4FA 4XH5A 5HRSA 1G99A 4X66K 3CCVN 2ZGYA 4RCHA 4DTXA 3D2FA 2RPIA 3CJ1A 3C65A 1KFSA 3DLRA 3NMUA 3ID6A 3OYHA 2O8BB 1LAVA 1N36K 3RSEA 4JYAK 3D2EB 3GE1A 4I9QA 3CC7N 5EY4A 1RT4A 3KKSA 4C8NA 2VQEK 4XJXA 5BR8K 2OZSA 2D5RA 3SJHA 3VQEA 2G8VA 1BHLA 5C10A 5KGWA 4KHQA 4O5BA 3VN5A 1N32K 3NH0A 3QFPA 5GAGP 4BQZA 2HHSA 5FDLA 1YI2N 3HPGA 4HTUA 1JLGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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