1NLVA

Crystal structure of dictyostelium discoideum actin complexed with ca atp and human gelsolin segment 1
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
372
structure length
364
Chain Sequence
DVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEQEMATAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
publication title The Structure of Non-Vertebrate Actin: Implications For The ATP Hydrolytic Mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin
total genus 115
structure length 364
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nlvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nlvA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1nlvA03
4K42A 2Q1NA 1EQYA 1MA9B 2OANA 4PKIA 4A2AA 3DXMB 2D0PA 3SLCA 3VERA 1HX1A 1XC3A 2V7ZA 3CI5A 5AQGA 3EKUA 2QWOA 4FWKA 3HTVA 2CGLA 2YCHA 3M1FA 4CBWA 5EY4A 2PBDA 2HOEA 4IJAA 4GNIA 2VYPA 1BA1A 3G25A 4FWLA 3LM9A 4IXCA 1YUWA 2QM1A 4CD3A 1T6CA 5AQUA 1MWMA 4JD2A 2FF3B 3KVGA 4BGBA 2QWRA 3UKUA 4RTFD 2IVNA 4Z94A 4B9QA 1GLDG 4H0VB 3WXJA 1X3NA 3CJAA 3QDKA 3L0QA 1ESVA 3CJ1A 2ASOA 3AY9A 4BR0A 4CZGA 1X3MA 4QS9A 4B1XB 3GDQA 3MK6A 4BRCA 3SMPA 4XEIA 5AQJA 3FE1A 4BRAA 1SAZA 4EHTA 3MMVA 3RSEB 3WEEB 4B1WB 3ULEA 4CZIA 5AZIB 3VEYA 3WXLA 2I7PA 5BRFA 1NGGA 4FOEA 5AQKA 3EL2A 3ZX0A 4CZEA 1NGIA 4BC2A 4CZHA 1CZAN 2QWMA 1S22A 4H03B 1QZ5A 3FGUA 4BRLA 4WQ5A 4H0YB 2ASPA 1KAXA 2Q36A 4H0TB 5JICA 4IZ9A 3KHYA 4BRIA 1C0FA 3FFKB 4FWRA 4BVOA 1J6ZA 3ZETA 2V51B 4WQ5C 1K8KA 4H0XB 3VF6A 3UKRA 2E1YA 1NWKA 1ZBSA 1Z6RA 2I7NA 5FPEA 2A42A 4FSVA 2A3ZA 3GBTA 4FWNA 3FZMA 1ATSA 5ADXA 5FPDA 3QB0A 1GLFO 3L6QA 3MCPA 1HKGA 4H5NA 3TPQA 3IUCA 4H0PA 2FSJA 4QS7A 5AQSA 1NLVA 1RGIA 4CJ7A 4BRQA 1C0GA 1NGHA 2F9WA 4BR4A 2GTDA 4JD2B 2ZGYA 3S41A 4L3QA 3UKUB 5E26A 4EFHA 1BO5O 1SZ2A 4BG8A 2P9SA 2FSNA 3C7NA 4CZLA 3ZX2A 1S3XA 1ATRA 5AQNA 2F9TA 1V4TA 4BG9A 3TU5A 4ISGA 4NB4A 3R9PA 4YDUC 4BC3A 4CBXA 2YI1A 3A8YA 5BRDA 4BR5A 2CH6A 1YVNA 4DQ8A 3GE1A 5KPRA 4DCHA 1RDWX 5AR0A 5AQFA 4XH5A 3H6EA 3O5BA 2NZTA 2NLXA 4MLEA 5TKYA 5AQTA 5ADXH 2FXUA 4FWSA 2P9LA 4J8FA 1HPMA 3OHRA 1HLUA 3VGLA 2YHYA 1KAZA 2HMPA 3BF3A 3O4WA 4B1UB 2ZWHA 3BEXA 3QBWA 1SQKA 3VESA 1D4XA 5AQHA 1JCFA 3FZKA 1T44A 4AM6A 3O6WA 3HSCA 3A5NC 5BN9A 3GG4A 4B1ZA 5AZJA 5AQYA 3D7EO 3O1WA 2P9PB 1NGJA 1HKBA 1Q18A 1TUUA 3L4IA 2E2NA 4H5RA 3ATVA 5CE3A 2Q31A 2HF4A 3LDPA 4FWOA 3ZETB 5KQDA 3BUZB 4BRPA 1K8KB 5AQMA 3UKRB 3CJBA 2ZGZA 2FLOA 5LY3A 2PAVA 3MDQA 5JLHA 1WOQA 2AA4A 2E20A 3QICA 3I8BA 4BRKA 1Z05A 1GLCG 3LM2A 1P8ZA 1BOTO 3O8MA 4FOIA 4I6MA 4BRGA 5KQ8A 2GWJA 4BVPA 3A0IX 2BTFA 2GELA 2P9UA 3B8AX 1NGEA 4FPAA 1GLJO 4JNEA 4JAXA 3FZLA 5AQPA 4O8KA 3ZEUB 3VEVA 1XUPO 4BGAA 3M3ZA 2Q97A 1HJOA 2P9IA 3FZFA 3EN9A 3MN6A 1QQNA 2UYTA 5BPMA 2YJEA 3U8XA 1NGAA 1TUYA 2DPNA 3U4LA 5EXWA 3HM8A 2CH5A 4CBUA 3IMXA 5FPMA 3J8AA 5BREA 4KBOA 2D4WA 2P9SB 3O80A 5AQIA 3CJCA 3GL1A 4CZKA 3C7NB 3EZWA 3IFRA 1QQOA 2KHOA 2IIRA 4WYBA 3DWLA 3FLCO 2QXLA 1HUXA 4QS8A 3UE5A 4C23A 3H3NO 3ZX3A 3D2FA 3JS6A 3C0BA 2A40A 1NM1A 4GY2B 1BG3A 5AFUA 2V7YA 3LDLA 5E84A 3DXKA 4CD1A 3CQYA 1X9JA 2YHXA 4K25A 1BUPA 3CERA 3QBXA 3R8EA 2D1KA 3ATUA 3U9ZA 4JHDA 4O5FA 2W41A 2V52B 4HWIA 4K43A 2E1ZA 4BRFA 5BRHA 4BR7A 3CIPA 4ISFA 1U2VA 4AM7A 4FL9A 2GEMA 4M7XA 3EKSA 4WQ4A 4HTLA 5AZJB 3VPZA 4BQZA 3SK3A 3SMSA 4MO4A 5EX5A 4DB3A 1KXPA 1V4SA 2P9NA 4RWTA 4CZJA 4PL7A 3SJHA 5F0XA 1IG8A 3LDOA 3VETA 3HI0A 1LOTB 4B1YB 1BU6O 3CQXA 3VEZA 3VEXA 2QWLA 4E1JA 3A5OC 3DJCA 2E88A 4BR9A 2IVOA 1BA0A 1YXQA 3ULEB 3CJ9A 5AQQA 2BUPA 2YHWA 3R6MA 4RCHA 1NGCA 4A61A 4FWMA 1GLEG 1TYQA 4PKGA 5AFUH 1OKJA 2AP1A 1NGDA 4I6MB 4BC4A 1YAGA 3O1BA 2E2QA 3WQUA 1ATNA 5ELZA 3AAQA 2P9UB 2A6AA 5JLFA 4BC5A 2CGJA 3VGKA 3VEWA 3AARA 3H3OB 3DAWA 3P4IA 2P9KA 4H5TA 2E8AA 2P9IB 1DGKN 2ASMA 4ISEA 4A2BA 3CETA 1QQMA 3BF1A 4M7YA 3VOVA 1LCUA 2WUSA 4BRMA 4BROA 3BP8A 4H0OA 4K41A 4IJNA 3LL3A 3JXUA 3ID8A 1JCEA 5BN8A 2H3GX 3H1QA 4F9OA 5LJWA 1ZC6A 1E4FT 1GLLO 4H5WA 3LDNA 2QW9A 3D2FB 4MLHA 4NO7A 5AQWA 2W40A 1DEJA 1QHAA 3QFPA 5F1XA 2QWQA 5EVZA 3ENHA 3D2EA 1H1VA 5KPTA 1R59O 1Y64A 2A5XA 2QWNA 5KPZA 5AQLA 4BRHA 3DXKB 5BPNA 3DXMA 2VCPA 4BRDA 1U6ZA 2NRHA 3WXKA 4EAHD 4BQLA 3KZBA 1G99A 5AQOA 2IVPA 4DHYA 4MO5A 4JHDB 1QZ6A 3CJ7A 3W0LA 4EIAA 1JCGA 2D0OA 3A5MC 4BREA 1WUAA 1T6DA 2QWPA 2GWKA 3H46O 3VF2A 3WQTA 4FO0A 3FR0A 1U2VB 1BDGA 2HF3A 1MWKA 4XH1A 5FPNA 3MN9A 3UB5A 1MDUB 2P9NB 4XH4A 3A5LC 2Q0UA 1KAYA 4B1VA 4FPBA 2EWSA 2ZF5O 4FWQA 1NGBA 1ZXOA 2P9PA 3MN7A 3AAPA 2Q0RA 3CHWA 1NGFA 5AQVA 2J4RA 3WUHA 4BR2A 1XQSC 2FSKA 5LJVA 4JN4A 3U9DA 1TYQB 4PL8A 2P9LB 1RFQA 3RSEA 3WEEA 4CZFA 1HKCA 4IO8A 5AZIA 3M6GA 3MN5A 4IWVA 5JMVA 2E2OA 2E2PA 3FZHA 4Y0WA 3H1VX 1BWFO 3O08A 2A41A 2FF6A 1DKGD 2ITMA 3EO3A 4LC9B 3H45C 2GUPA 2P9KB 3F9MA 4CZMA 1NMDA 3WT0A 5F2RA 3QMLA 5B8HA 1IJJA 2Q2RA 3ZEUA 4BRNA 5EOYA 5I9EB 4M63C 1NBWA 4WQ4C 5BR9A 3IDHA 3WXIA 4CI6A 5AQZA 4PKHA 3VENA 5AQRA 3W3DA 4A62A 5AQXA 3HBTA 1E4GT 4YDUA 3VEOA 3I33A 4EHUA 3VF4A 5BPLA 3QFUA 2CGKA 3ENOA 1GLBG 3HZ6A 3LDQA 4H5VA 2YJFA 3VGMA 3GOIA 3D2EB 4FWPA 1GLAG 2VWBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1K9MO 3CD6N 5C42A 3Q7CA 3PX0A 4WFAL 4A2AA 5LL6Z 4JEPA 5I42A 1HX1A 4DV2K 1RT6A 3OS2A 3OYJA 3HTVA 3M1FA 3NF7A 2PBDA 2GV9A 2NUBA 4EZ6A 1BA1A 3LAMA 4C8MA 4DU1A 1OH7A 4FZZA 2KZMA 4J2AA 3SCXA 3CXCM 2QM1A 5DMRA 4DV1K 1T6CA 5AQUA 2NRRA 2KKZA 2HBKA 4O0IA 3EY1A 1LAWA 3KVGA 4DG1A 2QWRA 2G8VA 3RRHA 4FZXC 2I5JA 3NVKA 4UQGA 1QVFM 3S3MA 4JV5K 4DR2K 3AVBA 2VGNA 2ASOA 4BR0A 3IAYA 3CYGA 4FVUA 3OTOK 3TAGA 3MK6A 3SMPA 1IH7A 5AQJA 4AH9A 3MMVA 2DY4A 4DTUA 3I55N 2OPRA 1CZBA 3VQ8A 3ASMA 2YNHA 2I7PA 4OVLA 4CEQA 1QSSA 1BIZA 2B5JA 5AQKA 3EL2A 5CR4A 2G8IA 4QCLA 4B9TA 1NGIA 4BC2A 4CZHA 2QWMA 3MAQA 4JKEA 4H03B 3SBGA 4KO0A 5M1FA 3OJUA 5JICA 4H0TB 4CIEA 4IZ9A 1U04A 3J7AP 4JI6K 3HRGA 4BRIA 1W0HA 3JYTA 3FFKB 1YVUA 4CGHA 4WQ5C 3LZJA 4JRPA 3QERA 4M3TA 3SPZA 3QNOA 3AA2A 3SYZA 1S1XA 4FK2A 1KD1O 4FJ7A 4FSVA 2A3ZA 3GBTA 4FWNA 3CM5A 1OVQA 3THXB 4CEZA 3IS9A 5C15A 1HKGA 3TPQA 4M3RA 5HOOA 1NLVA 1RGIA 4CJ7A 4HUGA 1C0GA 1EETA 4E1NA 4BR4A 4MFBA 4H4MA 3WNGA 4L3QA 4DU3A 4GMJB 1SZ2A 4KPYA 5M1PA 3VQEA 4O8UA 1S3XA 1L3SA 2Z1IA 4BG9A 3BZCA 5CYMA 1SL0A 4UY8O 4NB4A 2E6MA 4YDUC 2OPSA 4C1NK 4CBXA 3EE9A 1VQ8N 4BR5A 1IBKK 3GE1A 3F2KA 3NGIA 3CCEN 3NF8A 4CGGA 2WFBA 4KHUA 2NZTA 2NLXA 5TKYA 5AQTA 4MDAA 3SI6A 2KLAA 4JKCA 3S9HA 1WSEA 1RT2A 4N5SA 3SQ2A 1HPMA 3MECA 1J5EK 3L2VA 2G8UA 3PO5A 2HMPA 3O4WA 3BEXA 4FK0A 1W9HA 3I0SA 1D4XA 2G8KA 5AQHA 1JCFA 4DV7K 5CZ2A 2ETJA 3HSCA 5BN9A 3GG4A 4M3WA 3PO4A 1EX4A 2PFUA 1NGJA 1GOCA 1TUUA 1HRHA 3L4IA 4RW7A 5CYQA 4G9ZA 3SUOA 3ZETB 1K6YA 1TVRA 1SKSA 3SPYA 1XC9A 1XI1A 3RTVA 1DTTA 3OYHA 3BDPA 1B9DA 1RILA 4I2QA 2AA4A 1UOCA 2YNGA 4DKWA 1B9FA 3ZLJA 1K73O 5GIOA 1SKRA 3SAGA 1TV6A 1TK8A 3EYZA 2HHVA 2IGIA 1YTAA 2P9UA 4FPAA 4DV5K 1ILYA 1GLJO 2RHKA 3FZLA 4DMNA 4O8KA 3E9OA 3MX2A 3VEVA 3BY5A 3M3ZA 3LZIA 3TARA 3FZFA 3MN6A 4IBNA 5BPMA 2Z1GA 3K2PA 4DTNA 3AVNA 1NGAA 3L8BA 2O8BB 5EXWA 3DI6A 3VTHA 2D4WA 2FBYA 2OPPA 3GL1A 3IFRA 5C10A 3TAMA 3HXMA 1HUXA 4C23A 1NJYA 3ZX3A 3C95A 1Q82O 3C0BA 4HVJA 2A40A 1NM1A 4FK4A 1ZBUA 5SZTA 1VRTA 5FRMA 1S72N 5AFUA 3P1GA 4YY3K 3SNNA 1WBBA 1X9JA 3D0PA 2YHXA 3V9ZA 1BUPA 3CERA 3QBXA 1N5YA 1VQ4N 5J2QA 5J2PA 1N33K 4BRFA 1RT7A 4BR7A 1X9SA 4CEBA 4FL9A 4WQ4A 2Z1JA 4HTLA 5AZJB 1ITGA 1S9GA 3SK3A 3VQBA 4DB3A 3QNNA 1KXPA 4KFBA 1V4SA 2P9NA 1FXXA 2KFZA 3KKSA 1KVBA 4JKFA 1LWEA 3SJHA 1A5WA 3MWTA 4B1YB 4E1JA 1JXEA 2W6KA 3G71N 3CJ9A 1DT9A 2HHHK 4E89A 3SQ4A 3R6MA 3VA0A 1KQSM 3LDSA 3NH0A 3HPOA 1GLEG 1TYQA 4PKGA 3TAPA 4AHUA 4FJLA 3NDKA 4I6MB 5CY4A 3WQUA 2WBNA 3OYMA 4B3MK 1QTMA 2A6AA 4PHTX 1JLFA 3AVHA 3AARA 3H3OB 3T69A 3DAWA 4X66K 3NH2A 4AQYK 4E3SA 3F73A 1EKEA 1LAVA 2ASMA 1XNQK 3ZT4A 3D6RA 2UUBK 4QAGA 4A2BA 3RMCA 1QQMA 4M7YA 1VQ6N 2WUSA 4BRMA 4CESA 1T03A 5J2NA 3LL3A 1YIJN 3JXUA 3ID8A 3OW2M 1JCEA 2YNIA 3O3HA 4BY9C 2H3GX 2NRTA 3H1QA 1IV0A 1ZC6A 4KI6A 1IBLK 4DTJA 4H5WA 1IKVA 4A5AA 4E7KA 3ZT1A 3V1OA 3TAQA 2HB5A 2HBJA 3UIQA 3V9WA 3OA9A 4EZ9A 4HTUA 5EVZA 2OTJN 3D2EA 1H1VA 4AHVA 3OYNA 5AQLA 1IG9A 5BPNA 3V1QA 3WXKA 4FLTA 3AVCA 4BQLA 1U47A 3ALYA 4CHYA 3NHGA 1KFDA 1WAFA 3TABA 1JXBA 1OVYA 1WUAA 4EP5A 4PA1A 2KFNA 2O8DA 1NJIO 3WQTA 4FO0A 3FR0A 1U2VB 1BDGA 1HYVA 3NH1A 5FDLA 4DQIA 4XH1A 4KHSA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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