1NMDA

Crystal structure of d. discoideum actin-gelsolin segment 1 complex crystallized in presence of lithium atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
DVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEQEMATAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structure Of The Non-Vertebrate Actin: Implications For The ATP Hydrolytic Mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nmdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nmdA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1nmdA03
3ZX2A 1ATRA 4CZFA 4BC4A 4BGBA 4K43A 2YJFA 1J6ZA 2P9IB 1NMDA 3HM8A 4AM7A 3O08A 3BP8A 2I7PA 5EY4A 1OKJA 2P9PA 3HSCA 1QQNA 2P9KB 1RGIA 1BDGA 5E26A 1NBWA 3ZX3A 4XH5A 3EN9A 3FZFA 1JCEA 4QS7A 5LJWA 1QQMA 3KVGA 5AQOA 3O6WA 4H0XB 2E2PA 4FOIA 2GUPA 2E1ZA 5AQGA 4I6MA 3UKRB 2QWRA 4WQ4A 4IZ9A 4BREA 5AZJB 3WXIA 4CZJA 4J8FA 4F9OA 4IJAA 1HKCA 5AQNA 3VEWA 1NM1A 4AM6A 3L4IA 3DXKB 4BROA 2FXUA 2V7YA 1NGGA 4CD3A 2CH5A 3EKSA 2D4WA 1YVNA 2QXLA 2QWQA 3TPQA 3P4IA 1BA0A 5EVZA 2FSKA 1IG8A 3CJCA 2CH6A 4BRGA 3BEXA 3CI5A 5AQVA 4DB3A 1RDWX 4FWRA 5AQSA 3GG4A 4CZLA 3H1QA 3A5NC 3GBTA 4PKIA 4E1JA 4BR9A 4FWNA 1Q18A 4BC3A 1T6CA 3G25A 4CBUA 4DHYA 5EOYA 3RSEA 4BG9A 1U6ZA 2WUSA 4FWLA 4O8KA 1HJOA 3MN5A 1HLUA 3EKUA 1T6DA 1GLDG 5E84A 4CBXA 3S41A 3VGKA 2YI1A 1KXPA 2ZGZA 2HF3A 4BQLA 3ULEB 3CJ9A 3WXJA 2A3ZA 1ATSA 3M3ZA 3CJ7A 4K25A 4FWOA 2PAVA 2UYTA 3A8YA 5AQHA 4H5VA 4BRLA 5F2RA 1DKGD 2YHWA 5BRFA 2YCHA 2ASMA 2P9NB 1MDUB 4YDUA 5AZIB 3UB5A 4A62A 4BQZA 5KPZA 3ENOA 5FPMA 3VF6A 1GLBG 5BREA 3ZEUA 2P9UB 3QBWA 3WT0A 4B1VA 3C0BA 5TKYA 5I9EB 1SAZA 5F1XA 1SQKA 3VETA 2J4RA 1LOTB 5AQMA 1KAZA 5F0XA 2V7ZA 2YJEA 4BC2A 3QICA 2AP1A 4FOEA 3CJAA 2KHOA 2V51B 4BGAA 1BG3A 5AQYA 2YHYA 2NLXA 1T44A 1C0FA 4H0TB 4XEIA 5AQLA 1Y64A 4IWVA 3IUCA 4B1UB 3VPZA 1CZAN 5KQDA 3SK3A 2E1YA 3VOVA 3FR0A 2E20A 2BUPA 1WUAA 4PKGA 1MA9B 2W41A 4B1ZA 4PL7A 4H5NA 3WEEB 3ZX0A 5BRDA 1E4FT 4HWIA 5B8HA 3VEXA 1U2VB 4M7YA 2FSNA 2IVOA 3DXMA 3VF4A 3CIPA 3GDQA 4JAXA 1Z6RA 2A5XA 3ID8A 1XC3A 5FPNA 1NGCA 5JLHA 2FF6A 4BR4A 1X3MA 4JN4A 4FWMA 2GEMA 2PBDA 1K8KA 4QS9A 5BR9A 1D4XA 2QW9A 2Q1NA 2CGJA 4XH4A 3A5LC 5EX5A 2P9LB 3WXLA 4BR0A 2P9SA 2P9PB 2HOEA 4FO0A 4H0PA 5AQRA 4BR2A 1P8ZA 2GWKA 1G99A 4EFHA 4FWSA 4IXCA 2P9IA 1TUUA 2D0OA 3OHRA 5KPTA 3U9ZA 2V52B 2F9WA 1ESVA 1GLJO 4WQ4C 3AAQA 4BRQA 3BF3A 4FPBA 2IVNA 4H03B 2Q0UA 4I6MB 5AQJA 3I33A 2ASPA 5EXWA 3LDLA 3D2EA 3H6EA 3AAPA 3JS6A 3MCPA 1TYQB 4JD2B 2Q0RA 3U8XA 4EIAA 2CGLA 3O80A 1X9JA 1NGFA 4JHDB 3TU5A 3QDKA 4BRKA 3F9MA 2HMPA 3DWLA 3UKRA 2ASOA 3WQTA 4RWTA 4WQ5A 3CJ1A 5AZJA 2ZF5O 2EWSA 4BRNA 1Z05A 1IJJA 2GTDA 1HX1A 4B1WB 3O1WA 1QZ6A 3WUHA 4EHUA 1V4TA 3C7NA 4Y0WA 3RSEB 3UKUA 4BG8A 5AQTA 5BPLA 2VWBA 1HKGA 3CETA 3FZLA 3H1VX 2AA4A 5AQZA 2ZGYA 3VGLA 3B8AX 5ELZA 4CJ7A 3W3DA 2FF3B 5BN8A 4BRCA 1SZ2A 2W40A 1JCFA 2E8AA 4YDUC 3QFUA 5AQIA 3KHYA 3LM2A 4GY2B 2QWOA 3IMXA 3VESA 5AQFA 2Q97A 2Q31A 4MO5A 4DCHA 3QB0A 1NGIA 4JNEA 3ULEA 1HPMA 3SMPA 1C0GA 3ZEUB 1NGAA 5BRHA 4NO7A 3D7EO 3HBTA 1BOTO 3EL2A 1RFQA 3U4LA 3LDNA 3DJCA 5BN9A 4WYBA 2GWJA 2P9NA 5AZIA 5AQWA 1YXQA 2QWMA 3O8MA 3LM9A 4M63C 1QHAA 3D2FA 4CBWA 3KZBA 2A40A 4A2BA 3DAWA 3LL3A 3VEYA 2E2OA 3VGMA 1NGJA 1ZBSA 4EAHD 5BPNA 3A0IX 3L0QA 4H5WA 1NGBA 2F9TA 1MWKA 4EHTA 4BRDA 3MMVA 3SLCA 2IVPA 3IDHA 3O5BA 3H3NO 4IJNA 3GOIA 3LDOA 1NLVA 4A61A 3BF1A 3ZETA 5KQ8A 4QS8A 3H3OB 3FGUA 2E2NA 3HTVA 3DXMB 3R6MA 3UE5A 3VERA 3FFKB 4LC9B 1ATNA 4BC5A 3L6QA 3FZKA 3WQUA 1DGKN 5AQPA 4FWKA 3WEEA 4CZHA 3M6GA 4BRAA 5LJVA 2A6AA 4XH1A 1YAGA 3MK6A 1U2VA 4PKHA 1K8KB 4K42A 1ZXOA 3IFRA 1H1VA 5JICA 2ITMA 2E2QA 2QWPA 3CERA 5AQXA 2FSJA 4B1XB 4BR7A 4B1YB 2D0PA 5AFUH 4RCHA 2P9SB 3WXKA 4RTFD 5AQKA 1QQOA 5CE3A 3M1FA 3MN9A 3EZWA 1V4SA 4BRPA 4CZMA 3FZMA 3CQXA 3CHWA 5AQUA 1BUPA 5JLFA 4MO4A 3QMLA 2P9LA 5AQQA 1TUYA 2P9KA 2QM1A 2QWLA 3MN6A 4FWQA 4Z94A 3CJBA 3FE1A 3HZ6A 3D2EB 4GNIA 3JXUA 4NB4A 1BA1A 1GLCG 4K41A 4CI6A 3I8BA 4HTLA 3FZHA 4WQ5C 1QZ5A 1GLFO 4DQ8A 2A41A 4ISGA 3H45C 5AFUA 4BVPA 3U9DA 2DPNA 4JD2A 1TYQA 3DXKA 1S3XA 3FLCO 3LDQA 3MN7A 4FWPA 3CQYA 2D1KA 4L3QA 4JHDA 1LCUA 3VF2A 1DEJA 3ATUA 3A5OC 2YHXA 3C7NB 3W0LA 2VCPA 3QBXA 3VEOA 3UKUB 4FPAA 2QWNA 4ISEA 3MDQA 1MWMA 5JMVA 1GLLO 1EQYA 3HI0A 3VEVA 1BO5O 4IO8A 4CD1A 4BRMA 4KBOA 1XQSC 4FSVA 2Q2RA 3SJHA 5AR0A 4BR5A 4FL9A 1BWFO 3A5MC 1NGEA 4H0OA 3AY9A 2NRHA 4BRIA 1GLEG 2GELA 3VEZA 5KPRA 3ENHA 4MLHA 3R8EA 2VYPA 1YUWA 1BU6O 2FLOA 4CZGA 1XUPO 4BVOA 3R9PA 1KAXA 4B9QA 4BRHA 3GE1A 4A2AA 4CZEA 5FPEA 1KAYA 2P9UA 4CZIA 5ADXH 2HF4A 1WOQA 2CGKA 1HUXA 1S22A 3ATVA 3D2FB 3GL1A 3H46O 2IIRA 5FPDA 4PL8A 1R59O 3LDPA 3O1BA 3AARA 2OANA 3J8AA 5BPMA 4MLEA 1HKBA 4O5FA 3BUZB 4H5TA 1X3NA 1JCGA 2E88A 2BTFA 1E4GT 3ZETB 4M7XA 2Q36A 1ZC6A 3EO3A 4C23A 1GLAG 1NWKA 4H5RA 2I7NA 1NGHA 1NGDA 2ZWHA 4H0YB 3QFPA 2A42A 4BRFA 5ADXA 2H3GX 3O4WA 4ISFA 3SMSA 2NZTA 4CZKA 3VENA 4H0VB 5LY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5K14A 3SUQA 2XY7A 5HP1A 4CEAA 2P5GA 3AVAA 1YTAA 4RW8A 4W5QA 4CHYA 2P9IB 3ID6A 1U47A 4PUOA 3RWUA 3BP8A 2HW3A 2VG6A 2P9PA 3HSCA 3ZX3A 3S3NA 4XH5A 1JCEA 3T3FA 4JRQA 2G8IA 2O4GA 1VQ7N 4H0XB 3ENBA 3Q7BA 3HP9A 4JV5K 3LP1A 4WQ4A 2HSTA 4I9LA 4J8FA 1HKCA 4BROA 2FXUA 2JGUA 1BCMA 2V7YA 2BGGA 2GV9A 2CH5A 4W5TA 1RNHA 1QSSA 5C0YA 4NCBA 2D4WA 4Y1DA 3PX4A 3BY5A 4KI4A 5EVZA 4FJ8A 3CJCA 1IG8A 4DUYK 4DTOA 4BRGA 5J2NA 3CI5A 3B6OA 4YOVA 4JKHA 3AGRA 4PKIA 3SQ4A 3G25A 4CBUA 1L3SA 4DHYA 3RSEA 1XWLA 1U6ZA 1JJ2M 4DSLA 5KI6A 3MN5A 3OYKA 4X64K 3DM2A 3VGKA 2ZGZA 1L3TA 3ZSQA 5CHIA 4OO1J 1RDBA 4GV3A 3WXJA 1ATSA 3TAFA 5HRSA 4AHCA 4DF4A 4DTPA 4R79A 3A8YA 2XHBA 5HOOA 4BRLA 5F2RA 2P9NB 1MDUB 4CW7B 4DV6K 1T3VA 3VQPA 5KPZA 3EE8A 4BWJA 3CMEN 5SWMA 3QBWA 4B1VA 5I9EB 1VQ4N 3ZT3A 1A5XA 4LD0A 1UAXA 1TK8A 4EZ9A 4BC2A 1JLCA 3HXMA 4I2QA 4E7IA 1NKBA 4B8CA 4H0TB 1Y64A 2PY5A 3IUCA 4B1UB 1JLAA 3SK3A 2O8BB 3O3GA 3VOVA 4OLBA 3QLHA 3CF5L 1EP4A 2I5JA 3CG7A 4ILGB 1NMNA 3SYZA 2G8WA 1WUAA 4PKGA 4B1ZA 4CJPA 3OYJA 3WEEB 4DR5K 5FRNA 3VEXA 1U2VB 2FSNA 3OYIA 3E9LA 2UUBK 1XC9A 2FBYA 5FPNA 5JLHA 2KTQA 1VSJA 4BR4A 4JN4A 3WNHA 2WC9A 4CF1A 4QS9A 4O44A 2W42A 4IDKA 3K5NA 4Q5VA 4XH4A 5TKWA 3WXLA 1TL3A 1N36K 1RBTA 1IKYA 3VN5A 4JRPA 1YJWN 2G8KA 4O8UA 1L3VA 4A59A 2P9IA 3OYCA 4CESA 4O0JA 5M1OA 3KLGA 3ZSXA 1ESVA 2X6NA 3P5JA 3IG1A 4Z4IA 4B3MK 1RDDA 3HL8A 3BF3A 4KHWA 2IVNA 3DLEA 4I6MB 3I33A 2ASPA 3AVBA 1HYVA 3LDLA 3P83D 3JS6A 3U8XA 3D45A 4Z4GA 3DRPA 3QDKA 1NU0A 3M8RA 2VQEK 4BRKA 3DWLA 4OLAA 3LZIA 2ASOA 3U3GA 4WQ5A 1IG9A 1SS6A 1U48A 3QIPA 3CCLN 4BEBA 3CXCM 4CFBA 3KWIA 5JENA 3K9KA 2LSNA 2ETJA 4OPJA 4XJXA 4UY8O 1W2BM 1BHLA 3UKUA 1BQMA 2R7YA 2W6KA 3C6UA 5AQTA 2HHUA 2G8UA 3CETA 1N5YA 3SQ1A 4IFVA 3ZSOA 3VGLA 5ELZA 3T1AA 3OS0A 5GINA 2QI2A 2E8AA 3ZSRA 2EHGA 3KHYA 3V1QA 4NCGA 2PZSA 1JLEA 1I39A 4CK1A 5C12A 3QB0A 3HO1A 4KHQA 4GKKK 1ITGA 1NGIA 2HHQA 3ZEUB 3L2QA 2P1JA 3LDNA 4R5PA 3SUNA 3CCMN 4DQIA 2P9NA 1QVGM 2W00A 3LAKA 5AQWA 1S9EA 5A2QO 3CD6N 3LM9A 4E19A 1E3MA 3D2FA 4O0IA 4CJLA 3OYFA 2A40A 4A2BA 3LL3A 3VEYA 2E2OA 1NGJA 5BPNA 2PYLA 1LWFA 1KC8O 3TAPA 2YHAA 2F9TA 3MMVA 3SLCA 3H3NO 3LDOA 4CEEA 1NLVA 4NLCA 4A61A 4BDPA 5KQ8A 4JKAA 2HNYA 3FGUA 2NUBA 2F7TA 3L2UA 3VQ8A 3DXMB 3R6MA 3VERA 4DR2K 3FFKB 1VAZA 3DYAA 3SJJA 1U49A 2GUIA 3WQUA 1DGKN 5HRNA 3WEEA 2X74A 2JLEA 3PV8A 1KVAA 1HMVA 1WB9A 1U2VA 3MAQA 4PKHA 1K8KB 4A57A 4DTSA 4E7JA 1UA0A 5JICA 3MXJA 4QAGA 2E2QA 4KKOA 5AQXA 2FSJA 2HBJA 5M1PA 2C1IA 1RT4A 1FKPA 4DTMA 3M1FA 1YJ9N 3VA0A 2UXDK 4FJ7A 4DV4K 1EKEA 1V4SA 4BACA 5AQUA 5AQQA 4CERA 2P9KA 2QWLA 4FWQA 3CYGA 3PO5A 1VQ5N 3FE1A 1ASVA 2VG5A 1WBBA 3HZ6A 3JXUA 1TKZA 3AVJA 3OYAA 1S6QA 4O5BA 1VRTA 1GLFO 1NKCA 5C2FA 4DV1K 1LAWA 3QINA 3HOTA 4M3ZA 4FXDA 1N32K 2DPNA 3OJUA 1S3XA 4YOTA 3FLCO 3P39A 4FWPA 4FZZA 3NE6A 4N56A 2E5LK 4CECA 4L3QA 1KTQA 1LW2A 1LCUA 4E7HA 3OTOK 1F21A 3C7NB 3CFOA 4CF0A 1Q7YO 3D6RA 4M3WA 3OYDA 3CYMA 1L5UA 3HI0A 3I0RA 3VEVA 1X9MA 1BO5O 1ZBUA 1M1KO 4DWIA 4JK8A 4BRMA 3CM5A 1BIZA 5C2DA 1XQSC 2Q2RA 2WONA 1KSPA 3NMUA 1BWFO 4JI5K 3ISNC 1JKHA 2O8FB 3IAYA 5KPRA 4M3TA 1RTIA 3O3HA 4MLHA 1SKWA 3PX0A 4FW1A 4KI6A 3EEQA 4KTWA 1IKWA 1B9FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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