1QZ5A

Structure of rabbit actin in complex with kabiramide c
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Trisoxazole macrolide toxins mimic the binding of actin-capping proteins to actin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 358
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1qz5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz5A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1qz5A04
2UYTA 3CJ1A 1X9JA 1GLBG 4FO0A 4MLHA 5ADXH 4DQ8A 3U8XA 4EHUA 3QFUA 2GTDA 4BRQA 1HX1A 2YCHA 2BTFA 2CH6A 5JICA 4FSVA 5ADXA 4QS7A 5AQKA 2GWKA 5AZJB 1ESVA 4HWIA 1XQSC 3ZX2A 1H1VA 3CETA 1NGGA 2GWJA 3J8AA 3VEVA 1YUWA 2AP1A 5BREA 1TYQA 2QWPA 3QBWA 4BC5A 1QZ5A 1DKGD 1X3NA 2E1YA 2V7ZA 1HKCA 1ZC6A 5FPDA 2YHYA 3SMSA 3EKUA 5AQOA 4BRKA 2FXUA 4CZLA 3DXMB 3TU5A 2IVNA 4PKIA 4BRIA 2ITMA 3UKUA 1OKJA 1U2VB 3FZLA 4CD1A 1C0FA 3D2EA 3EN9A 2VYPA 3VGLA 5BPNA 1HKBA 4CZEA 3DXKA 4H03B 2D1KA 3HZ6A 1RGIA 4B1YB 1NGCA 2P9IB 2D4WA 2E20A 2Q31A 3DJCA 1ATRA 4FOIA 4BRNA 4FWQA 4XH1A 1WOQA 4FWSA 1SAZA 4ISFA 4KBOA 4A62A 5EXWA 3H1QA 3LL3A 1WUAA 5EVZA 4C23A 1TUYA 3A5MC 4BGBA 3ID8A 1S22A 2F9TA 2A41A 4IXCA 3FE1A 4CBWA 1DGKN 1X3MA 1NWKA 1ATNA 1GLEG 2FF3B 3D2FA 4Z94A 1NLVA 5AFUH 2QXLA 5E26A 2Q1NA 1SQKA 3UE5A 4EFHA 3QMLA 4BQLA 5AQPA 3EL2A 4RTFD 5AQTA 3CHWA 4BR9A 5BR9A 3EO3A 4BR4A 2GEMA 2ZGZA 3WXLA 3ZX3A 4BVOA 2OANA 2QWMA 3ATUA 4CD3A 3BF1A 2P9LB 3MDQA 3AARA 4H5VA 3W0LA 3WQTA 3VEOA 2NRHA 1K8KA 5BRHA 4BR5A 5F0XA 2Q0RA 4EHTA 1R59O 2DPNA 2HF4A 3CJAA 4B1UB 5BN8A 5LJVA 2YHWA 2CGLA 3AAQA 4BR2A 4FWOA 2YJFA 5AQJA 2Q0UA 5TKYA 3ZETA 4L3QA 4PL8A 3P4IA 3VETA 4CZMA 4CZFA 3EZWA 5EY4A 3QICA 1ZXOA 1MDUB 5AQLA 4EIAA 1Y64A 1NGJA 2NZTA 3ULEB 4BRHA 4BRDA 3WEEB 4BQZA 4JD2A 2E2NA 3ZEUA 4BG8A 3BP8A 4DB3A 2CH5A 5CE3A 4IJAA 1KAYA 4CZKA 4RCHA 5FPMA 2P9SA 4XEIA 2QWNA 4BRAA 2PBDA 1E4FT 4WQ4C 1BO5O 4XH4A 1J6ZA 5EOYA 4H0OA 2CGJA 3H45C 1NGAA 4FWRA 4H0VB 1GLCG 5AQWA 2E2QA 3A8YA 1DEJA 3LDPA 4JN4A 4WYBA 2A42A 3QBXA 2YI1A 3LDNA 3WXKA 4BRLA 3VEXA 2HOEA 2QWLA 3O4WA 2WUSA 1NMDA 2IVPA 3U4LA 3SMPA 4I6MA 1YXQA 4M7XA 3DXKB 3O6WA 3UKRA 1JCFA 1NGHA 1Q18A 4FL9A 3HSCA 5JLFA 1KXPA 2NLXA 4CJ7A 2FSJA 2VCPA 2V7YA 2KHOA 3R8EA 1QQOA 4H0PA 2P9PB 4FPBA 1NGBA 1HKGA 1EQYA 3IDHA 2QM1A 5AQHA 5AQXA 4H5WA 3IMXA 3M1FA 2ZWHA 1D4XA 3DWLA 2ASPA 1CZAN 5AZIA 1NM1A 2QW9A 5AZJA 3H6EA 3O5BA 3VEZA 2P9UA 3H46O 3HM8A 4YDUA 4CBXA 5KPZA 3GBTA 4H5RA 4PL7A 3BUZB 1NGDA 1LCUA 1JCEA 1G99A 1TUUA 4A2AA 5EX5A 4IWVA 3F9MA 4PKHA 3VF6A 5AQYA 3D2FB 2W41A 3D7EO 3DXMA 1MWMA 3QB0A 4BR7A 5F1XA 4MLEA 2IIRA 2PAVA 3QDKA 2HMPA 4JHDA 3CJBA 1BOTO 5BPMA 1Z6RA 3H3NO 1U2VA 5B8HA 4JAXA 4O5FA 3MN7A 4CZGA 2V51B 4BC2A 4YDUC 3ATVA 3ZX0A 5KPRA 3FZHA 3B8AX 1T44A 4A2BA 2YHXA 4IJNA 1BUPA 2P9IA 3A5NC 1P8ZA 2IVOA 3RSEA 3AY9A 3JXUA 3GG4A 1T6DA 3IUCA 5BRFA 4NO7A 3L4IA 4K43A 3VOVA 4B1VA 3VGMA 2P9KA 3O1BA 3IFRA 1IJJA 4H5TA 3H1VX 4K25A 4M7YA 3MN6A 4H0XB 3WUHA 3CI5A 4B1XB 4BRFA 3FLCO 3MMVA 3KVGA 4FWPA 3MN5A 1NGFA 3GOIA 3MK6A 1U6ZA 5LJWA 1GLAG 2E1ZA 4WQ4A 4B9QA 2A40A 5AQMA 5AQGA 1GLLO 3VENA 2E88A 2HF3A 1V4TA 1ZBSA 2P9SB 4CI6A 2GELA 2D0PA 3A5OC 4FWKA 1RFQA 2I7PA 1QQNA 3LDQA 4WQ5C 1JCGA 1XC3A 4DHYA 3VGKA 3C7NA 2P9NA 3A5LC 5I9EB 4GY2B 1V4SA 5ELZA 2E2PA 4GNIA 2A5XA 3WXIA 1NGIA 1TYQB 1E4GT 1RDWX 5AQZA 1LOTB 4I6MB 4K42A 1BA1A 1IG8A 3UB5A 4BG9A 2I7NA 3FZFA 4BREA 4BRGA 3ENOA 3GE1A 3H3OB 1BDGA 3UKUB 1YVNA 3CJ7A 4BR0A 3CQXA 5FPNA 4F9OA 3D2EB 5BPLA 1BG3A 1BU6O 1BA0A 4RWTA 4E1JA 1KAXA 2QWQA 1QQMA 2QWOA 3FZMA 3ULEA 3WEEA 5E84A 4CBUA 3FZKA 4FPAA 5AZIB 2ASOA 3CQYA 3JS6A 5AQRA 2P9UB 1YAGA 3O8MA 5F2RA 4BRPA 2V52B 3AAPA 3A0IX 3MN9A 2Q36A 1HUXA 2FF6A 4AM7A 3FR0A 3S41A 5AQSA 3M6GA 3VEYA 4LC9B 1QZ6A 5JMVA 4M63C 1KAZA 5KQ8A 4FOEA 4ISGA 1MWKA 3ENHA 4Y0WA 1T6CA 4BROA 3U9ZA 2QWRA 3LDOA 2ZF5O 3HBTA 3L6QA 4JHDB 4B1ZA 2Q2RA 1HPMA 1XUPO 3HTVA 3VF4A 3FGUA 2E8AA 3GL1A 1MA9B 1GLFO 3SJHA 3VERA 5AQUA 3VESA 2H3GX 4K41A 4H5NA 3CJ9A 3C0BA 4BC4A 1HJOA 2A6AA 2GUPA 2BUPA 3R6MA 4J8FA 3RSEB 4PKGA 2P9PA 3LM2A 1GLJO 3WQUA 2AA4A 4BGAA 1HLUA 2D0OA 3BF3A 4AM6A 3TPQA 5AR0A 5KQDA 2Q97A 4JNEA 2P9KB 2VWBA 3O08A 1SZ2A 5FPEA 3O1WA 3DAWA 1K8KB 2EWSA 4B1WB 1Z05A 4DCHA 3R9PA 5KPTA 4H0TB 1S3XA 5BRDA 3U9DA 4BC3A 3MCPA 4MO5A 4BRMA 2J4RA 4WQ5A 2W40A 2YJEA 2A3ZA 3ZETB 3I8BA 3VEWA 3CIPA 4CZIA 5JLHA 4HTLA 2FLOA 5AFUA 3CJCA 1BWFO 3VPZA 3FFKB 3LDLA 1NBWA 5AQNA 3KHYA 2ASMA 4BRCA 2ZGYA 3VF2A 4A61A 4JD2B 3C7NB 4CZJA 3ZEUB 2P9NB 4IZ9A 5AQIA 5LY3A 4MO4A 2FSNA 3G25A 3O80A 3SK3A 3HI0A 4IO8A 1C0GA 2CGKA 3I33A 4QS8A 4CZHA 3OHRA 3BEXA 2P9LA 4BVPA 3SLCA 3WT0A 2F9WA 5AQQA 3KZBA 2E2OA 5AQFA 3M3ZA 5BN9A 4XH5A 1NGEA 4ISEA 3W3DA 3L0QA 4O8KA 4FWMA 3CERA 1QHAA 3LM9A 4H0YB 5AQVA 2FSKA 3QFPA 4EAHD 4FWNA 3EKSA 3UKRB 3WXJA 4NB4A 1GLDG 4QS9A 4FWLA 1ATSA 3GDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BE1A 5GAEP 5ADXH 4FO0A 2G8VA 2ITGA 4FSVA 1SV5A 4O5BA 5ADXA 3VQ7A 3TTCA 3CETA 4FM0A 2PYJA 4CJ4A 1YUWA 2AP1A 3K2PA 1TYQA 5BREA 2P5GA 2W42A 1QZ5A 4DMNA 4H4MA 3E66A 1XHZA 4FM2A 1NJIO 3DXMB 4PKIA 4BRIA 3UIQA 4JKBA 3UKUA 1OKJA 1WSJA 3JSMA 1SKRA 3V9UA 3D2EA 3EN9A 5C0YA 2O8EA 3PIPL 3OA9A 4WCEL 2D4WA 1FK9A 4KI6A 2JGUA 4XH1A 4CJEA 1WSIA 1SAZA 4CCHA 2ATQA 4ISFA 4PA1A 5EXWA 3RVCA 1WUAA 4C23A 4BGBA 3ID8A 3OYDA 3HP6A 1U47A 2F9TA 2A41A 3FE1A 1NWKA 2EHGA 1GLEG 2BDPA 5AFUH 2OTJN 4DTPA 1ASUA 4FJHA 3UE5A 1KD1O 3HT3A 1WB9A 4BQLA 4IOXA 3VQ9A 1NK5A 5AQPA 3L2QA 3T3FA 4F3TA 4C1NK 3EO3A 1RTJA 4I9QA 4EZ6A 1VQNN 4CESA 4CGFA 2F7TA 3ZX3A 1D8YA 3I0SA 4CD3A 1SL1A 2P9LB 3AARA 4H5VA 3W0LA 1HPZA 3WQTA 3U3GA 3SV3A 3HJFA 3MX2A 1R59O 2HF4A 4B1UB 5KI6A 4FLUA 3AAQA 3DYAA 2WFBA 3VQ5A 5AQJA 5TKYA 4CZMA 4FJXA 2YHAA 3ID6A 5EY4A 3QICA 1YJNN 3ZT0A 3HVTA 4Q5VA 4KH6A 5K14A 4EIAA 4LH5A 1JLEA 2PY5A 3M8SA 2Z1HA 4JD2A 3CCMN 4DB3A 4IJAA 3OJSA 1ASWA 3P83D 2P9SA 4RCHA 2QWNA 5J2PA 1NK9A 4L8RB 4LF7K 5M1NA 4XH4A 1VQLN 1LWCA 5EOYA 1NKBA 4H0OA 4CJ3A 2CGJA 1NGAA 3C6HA 5KRSA 2HW3A 1W97L 2HNDA 1C1CA 3KK7A 2E2QA 1WAFA 1X9SA 1DEJA 4BEBA 4CGJA 2YI1A 3SI6A 3KK1A 1TKZA 3BGRA 3DMJA 5SWMA 3KIOA 4BRLA 3VEXA 3DRSA 2HOEA 2QWLA 3O4WA 1NMDA 2IVPA 3VN5A 1K73O 4J2AA 1N36K 4M7XA 3S5TA 1O1WA 1BQMA 4PY5A 4FL9A 4YOWA 4FJ7A 2NRWA 4JI3K 1KXPA 1C0UA 2FSJA 1DTQA 4J2EA 4AQYK 4F4KA 4FPBA 4CEBA 2Y1IA 4Z4GA 1VSKA 2HBMA 3CM5A 3TSPA 4DTNA 2ZWHA 2ASPA 5AZIA 1NM1A 2QW9A 5AZJA 4DTXA 3QETA 2P9UA 4LSLA 3GBTA 4PL7A 3NMUA 3I8DA 5GAGP 4E7IA 3T7ZA 3F9MA 4CJSA 2PFUA 3E1YA 3O9QA 3D7EO 3QB0A 3CCVN 5GADP 3KWIA 1D5AA 3K5NA 1BOTO 4CHPA 4DUYK 4CZGA 1GOAA 3F5TA 4IJNA 1BUPA 3G71N 2B4JA 2W00A 3JXUA 4E7HA 4JI8K 3GG4A 4HVJA 5GAHP 1NOZA 3E9OA 2ZJPL 3HM9A 4B1VA 3BZCA 4K25A 1TK0A 4HHTA 4M7YA 2XHBA 2FBVA 2HB5A 1X9WA 2E6LA 3CI5A 3QEPA 3MMVA 3KVGA 3MN5A 2OA8A 3D45A 4DU3A 3RMCA 4WQ4A 5AQMA 4O8UA 2VGNA 1UA0A 1Z25A 4AILC 2P9SB 1OVQA 2GELA 5KTQA 3AVMA 2FBYA 1JCGA 1EKEA 1GOBA 3VGKA 3C7NA 3A5LC 5I9EB 1V4SA 3AVGA 4C8NA 3AVIA 1W7AA 4GNIA 2G8UA 4FJLA 4ZTFA 3PSFA 3AO3A 2A1RA 2HHQA 1LOTB 4XIUA 4K42A 3SJJA 1TKTA 3K57A 3K59A 3UB5A 1RDAA 4O55A 4F8RA 1YVNA 3IG1A 1YITN 2F96A 3CJ7A 4Y1CA 4J2DA 3SAHA 5BPLA 1BU6O 3VQEA 2Z1GA 4E72A 2QWQA 3AVLA 4JKFA 5E84A 4FPAA 1RTHA 1RTIA 5AZIB 4DTSA 3CQYA 1U4BA 5A2QO 4DR5K 2P9UB 3ZT4A 1UWBA 5MLCQ 5IWAK 3ZCMA 2O8CA 3A0IX 3MN9A 2FF6A 5DK5A 2Q3SA 3FR0A 4KAZA 3M6GA 4KHPK 2HHUA 4LC9B 1YT3A 4FOEA 4Y0WA 4JKDA 3K0SA 4M45A 2HBLA 2RPIA 4B3MK 1XUPO 4LFAK 1XNRK 3FGUA 1VQKN 4FLXA 1MA9B 1YVUA 1O13A 1IH7A 4ID5A 3QESA 1RBSA 1HJOA 2BUPA 1NNEA 1RCHA 4YOTA 3OY9A 4V19S 2P9PA 3WQUA 3VA3A 3ZT1A 2F4VK 3CCSN 2XY5A 3NVMA 5CHIA 4AM6A 1T05A 3F73A 3RR8A 3O08A 4RW4A 3DAWA 2D0BA 4LF6K 3T69A 3VA0A 4H0TB 5CY4A 1S3XA 5BRDA 1P90A 4OKKA 3PX6A 5CZ1A 4KREA 3S3MA 3KLHA 4DSFA 4JKGB 2OCEA 4BRMA 3KLEA 4FLVA 3ZETB 4IFVA 3ZLJA 1X1PA 3MWTA 1SKWA 3HPGA 3HP9A 3CJCA 3VPZA 3KHYA 2ZQBA 1F21A 3ZSQA 2ZGYA 3VF2A 1E3MA 3C7NB 4CZJA 4ILGB 4U67L 2FSNA 3L2UA 3K5MA 3MX5A 3WNFA 4KH5A 3NDKA 3VQ8A 3V9SA 4IO8A 3QNNA 4QS8A 3OYBA 4LF5K 5KGXA 4CZHA 4F2RA 3BEXA 5KRTA 3SLCA 3QNOA 4IBNA 3HRGA 3KZBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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