1QZ6A

Structure of rabbit actin in complex with jaspisamide a
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Trisoxazole macrolide toxins mimic the binding of actin-capping proteins to actin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1qz6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz6A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1qz6A04
2HF4A 5AQSA 3VETA 4RWTA 1YXQA 1SZ2A 5AQNA 1NGFA 2HOEA 2YJEA 4IJNA 2CGKA 4B1VA 5JICA 3ULEA 4XEIA 2P9UB 4CZKA 3DAWA 4CBXA 2YHYA 3R8EA 5E84A 4XH4A 1JCFA 2E88A 3A8YA 4CZJA 4A2BA 3MN9A 3WT0A 2IIRA 3FZHA 3U4LA 4BRCA 4CZLA 2EWSA 3VEOA 4JD2B 5BREA 5KPZA 2IVNA 4FOEA 3RSEB 4BQLA 4CZIA 3ZX3A 2E2OA 5EX5A 1HJOA 5JLHA 1BA0A 3DXKA 2W40A 2IVPA 4RCHA 4DHYA 3KZBA 1GLBG 2A41A 4BRNA 3ZETA 4BRKA 2CGLA 1RDWX 2P9PB 3QBWA 3VGMA 3H6EA 1MWKA 5AQJA 3B8AX 3LM2A 3A5OC 3LDOA 4B9QA 4C23A 1QQOA 3QB0A 2ASPA 1C0FA 3EO3A 4K42A 5AQFA 5KPTA 4JHDA 4B1YB 1SAZA 2QWNA 3M6GA 3EN9A 3SLCA 4BRDA 1R59O 1MWMA 2E2NA 2F9WA 3FGUA 5BPNA 3FLCO 3UE5A 3SMPA 3WEEA 1X3MA 4BC4A 5E26A 3LDLA 4EHTA 5AQQA 4M63C 4H0VB 4FWOA 5AQPA 3SJHA 1ZC6A 3ULEB 3VGLA 4BVPA 4AM7A 1RGIA 2P9IA 1HLUA 4H0PA 5KQDA 4ISGA 3WXIA 4I6MA 3CIPA 1ZXOA 2FSKA 5F2RA 2PBDA 3FE1A 1XUPO 3EZWA 1SQKA 1T44A 5KQ8A 2OANA 1TYQA 1BA1A 3FR0A 4O5FA 5AFUH 2QWPA 4BRFA 3DXKB 4DCHA 3FZFA 3CJ9A 4H5VA 4CD1A 4K41A 3ATVA 2UYTA 5F0XA 3WXJA 4CZMA 3DJCA 3QMLA 5BN9A 1OKJA 2QWQA 4B1WB 4BC5A 3ZETB 4CD3A 4B1UB 1DGKN 1Y64A 4FWMA 3BF1A 4BGAA 3O1WA 3LDPA 5JMVA 2E2PA 3GBTA 4PL8A 4MLEA 5FPEA 3DXMA 3A5MC 2E1YA 3O80A 3QFUA 2D4WA 4JHDB 4IJAA 1CZAN 2DPNA 4BRMA 2Q97A 1BO5O 2H3GX 3WEEB 4KBOA 4IWVA 1GLJO 4CZFA 3MK6A 3QICA 4WQ5A 5EXWA 2ZWHA 3I33A 1V4SA 1NBWA 3KVGA 3AY9A 3D2EA 2P9IB 4JNEA 3EKUA 5AQHA 2W41A 4CI6A 4XH5A 2F9TA 1WOQA 4I6MB 1NWKA 3MDQA 1TUYA 1IG8A 4BGBA 1TYQB 5ADXH 5EOYA 2E20A 4MO5A 3IDHA 3H46O 4BR2A 4CZEA 4BREA 2Q1NA 4L3QA 5LJWA 5AQWA 5ELZA 1ATRA 5AZJA 1KAXA 5BN8A 4EHUA 2YJFA 3GE1A 2A42A 3WQTA 3LM9A 3G25A 3VENA 5AQRA 5FPNA 2E8AA 2P9NA 4B1XB 3L6QA 3S41A 3U9ZA 1BDGA 3MN6A 2FSNA 2V51B 3TU5A 1EQYA 3DXMB 1HKBA 4BVOA 1YVNA 1ESVA 3C7NA 4HTLA 1NGBA 4M7XA 3VF2A 4ISFA 2J4RA 4BRHA 3MCPA 1XC3A 3ATUA 3CJ1A 4IZ9A 4FWLA 1GLDG 5FPMA 5AQLA 1Z05A 2QWRA 4BROA 1RFQA 4IXCA 1XQSC 3O6WA 2VYPA 2WUSA 1G99A 1T6DA 4H5TA 3D2EB 3O5BA 3U9DA 1HKCA 4EAHD 5ADXA 1HPMA 1X9JA 3O8MA 4QS8A 1DEJA 1GLFO 4BC3A 4BR5A 5AQZA 3CHWA 5BRFA 2CGJA 4EFHA 1NGHA 5FPDA 3IFRA 4CBWA 4FOIA 3H3NO 2D1KA 4H0YB 4A61A 1WUAA 3BP8A 1J6ZA 5LY3A 3J8AA 1KAYA 2HF3A 3ZX2A 2E1ZA 1DKGD 5BPMA 1LCUA 3ID8A 4H03B 5AZJB 2NRHA 4JAXA 4FWNA 5F1XA 1NMDA 2QWLA 4CBUA 2GUPA 3ZEUA 1MDUB 4CZHA 3VESA 3WXLA 2P9NB 5BPLA 2FF3B 3FZKA 4DQ8A 3D2FA 4FL9A 1X3NA 3C7NB 3LDNA 4YDUA 4AM6A 5AZIA 4B1ZA 4CJ7A 3OHRA 5LJVA 2A40A 2GELA 1YUWA 1V4TA 4WQ4A 3GDQA 1ATNA 3FFKB 3W0LA 1NGIA 4WQ5C 3VPZA 1QZ5A 4A62A 3O4WA 4BRQA 3R9PA 4QS7A 1H1VA 3L0QA 4A2AA 3CERA 2FF6A 4BR9A 1NGJA 3LDQA 2QW9A 4H5NA 3CJCA 1MA9B 2GTDA 4K25A 2ZF5O 3JXUA 2A6AA 3UKUA 1NGEA 3SK3A 2P9LA 5AQUA 3O1BA 4BRAA 2FLOA 3H1VX 5AFUA 4FO0A 3HI0A 1S3XA 1C0GA 3GG4A 3SMSA 1K8KA 1JCGA 3ZEUB 4BRIA 2ITMA 3H3OB 4BC2A 4XH1A 3VF4A 4FWPA 3D2FB 4M7YA 5BR9A 3A0IX 3JS6A 1NM1A 3HTVA 3MMVA 2GWKA 2P9SA 2QXLA 4IO8A 4BRLA 5BRHA 1Q18A 3EKSA 3P4IA 5EVZA 3VGKA 2Q0RA 5AQMA 3D7EO 5AZIB 2BUPA 2Q0UA 4J8FA 3WXKA 4MLHA 5JLFA 2ZGYA 5EY4A 4FWKA 1LOTB 3GOIA 1TUUA 5AR0A 4K43A 3CQYA 3TPQA 4NB4A 2NZTA 3VEZA 3M1FA 5AQYA 1E4GT 4FWQA 4PL7A 1U6ZA 2PAVA 2QM1A 2AP1A 4BG9A 3L4IA 1JCEA 4O8KA 3AAPA 4GNIA 3HBTA 3I8BA 2NLXA 3A5NC 3MN5A 2D0PA 5KPRA 1D4XA 2FSJA 5AQTA 3CJAA 4H0TB 2VWBA 3WQUA 4PKHA 4F9OA 4BR0A 3HZ6A 3H1QA 3UKUB 2P9LB 2I7PA 1GLEG 2QWOA 2Q31A 2YCHA 4PKIA 1U2VA 2Q36A 1BOTO 4RTFD 1HX1A 1K8KB 1Z6RA 4HWIA 2ASOA 5AQVA 2A3ZA 1GLAG 3QBXA 2CH5A 3ENHA 3VEYA 2A5XA 1NGDA 1T6CA 1HKGA 2P9SB 3UKRA 5TKYA 5BRDA 2FXUA 1NGAA 1IJJA 4YDUC 1BUPA 3BUZB 1HUXA 4FWSA 2ZGZA 1BWFO 3FZLA 5AQXA 4WQ4C 3VERA 3HM8A 3MN7A 4PKGA 1BU6O 2GEMA 4Z94A 5AQIA 4BR7A 3VEWA 2YHXA 4Y0WA 5CE3A 1ZBSA 4FWRA 1KAZA 3CJBA 2CH6A 2P9KA 1NGGA 3BEXA 4DB3A 4LC9B 3VEXA 3VOVA 1KXPA 1GLCG 2D0OA 4BR4A 5B8HA 5AQGA 1S22A 3ZX0A 2I7NA 1P8ZA 4FPAA 2BTFA 4H5RA 4MO4A 1QQNA 5AQOA 1GLLO 1YAGA 2V7ZA 3WUHA 3KHYA 1QHAA 3A5LC 2P9UA 4ISEA 2GWJA 1NLVA 3DWLA 5AQKA 4GY2B 1U2VB 3CJ7A 1NGCA 2E2QA 4CZGA 1QQMA 2AA4A 2QWMA 4JD2A 3W3DA 4FPBA 3RSEA 3UKRB 3CI5A 3QFPA 5I9EB 3IMXA 4NO7A 4BRGA 3O08A 3HSCA 3EL2A 3LL3A 2HMPA 4BG8A 4H0OA 3CQXA 2YI1A 3U8XA 3AAQA 2VCPA 4E1JA 2P9PA 2IVOA 4WYBA 2ASMA 3FZMA 3F9MA 2Q2RA 3R6MA 4EIAA 1E4FT 3AARA 4FSVA 2YHWA 2V7YA 2V52B 3C0BA 4QS9A 1BG3A 3UB5A 3GL1A 4H5WA 3BF3A 4JN4A 1ATSA 2P9KB 4BQZA 3VF6A 3VEVA 3QDKA 2KHOA 3ENOA 3IUCA 3CETA 4H0XB 1QZ6A 3H45C 4BRPA 3M3ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HF4A 3AV9A 4Z4EA 1ZBLA 4RWTA 1YXQA 5CY4A 1VRUA 1RBSA 2YJEA 5JICA 3J81O 3KTQA 1TKTA 2P9UB 3PUFA 3NHGA 2YHYA 4EP4A 5E84A 4M3TA 1RTHA 2QKKA 2O8DB 2HHIA 2E88A 1JLEA 3PO4A 5FRNA 4AF1A 3ZT3A 4DFMA 3VQQA 3OY9A 3QLHA 4CGDA 2E2OA 3JYTA 1HJOA 2IVPA 3OS1A 3TTFA 2F8TA 3LALA 2VGMA 3E9PA 4LFBK 1N34K 2WTUA 1RDWX 4CJRA 3VGMA 4BACA 5AQJA 3B8AX 3LDOA 2WFBA 4B9QA 1YI2N 1WSGA 1C0FA 1A5WA 1B92A 2QWNA 2NRWA 3R3LA 1I94K 4JKGB 3OTOK 2E2NA 2F9WA 4RW7A 3FGUA 2HBJA 3D6RA 1KTQA 2P1JA 1LWEA 5BR8K 3VGLA 4E0DA 1NOZA 1RGIA 3DI6A 1GOBA 2NRTA 1IH7A 4H0PA 3NCIA 2O4IA 1BHLA 1QQCA 3CCMN 1ZXOA 3LP3A 3NDKA 3FE1A 3CCQN 3SUQA 3EZWA 4DTUA 5A2QO 3M8SA 1SQKA 1T44A 1Q86O 3JSMA 5DMRA 3L2VA 3AA4A 4JI5K 3S3OA 4E19A 3OYNA 2O8BA 2QWPA 4BRFA 3DXKB 4E1NA 3IRXA 1JJ2M 3L2QA 5M1OA 4CD1A 3KLEA 4CJFA 4J2AA 3WXJA 4CZMA 5BN9A 2LSNA 4BECA 3NGZA 4B1UB 3SAGA 2IC3A 3NF8A 3L3VA 3O1WA 3O9UA 3WNEA 3P5JA 4PL8A 4KH4A 1M1KO 3QFUA 1VQ9N 4KREA 1RTJA 2D4WA 4JHDB 3QINA 4UY8O 4Z0UA 3RMCA 3NF7A 1Q82O 3WEEB 4KBOA 3L4QA 4DSJA 3DLGA 2ZE2A 3QICA 4WQ5A 3TTCA 3QNOA 3VQ8A 3KVGA 3AY9A 5E41A 3KK3A 4JNEA 1Q81O 5AQHA 4DKWA 4FZXC 4XH5A 3L2RA 3EE9A 3F9KA 4BGBA 1TYQB 2E20A 1HR0K 1VSMA 3SJJA 2WBNA 3H46O 5EU7A 1J5EK 4CZEA 1ZBHA 4L3QA 1LAWA 5CYQA 5LJWA 5AQWA 5ELZA 4YNQA 3S3MA 4EHUA 5J2QA 3O4NA 4XIUA 3VENA 5AQRA 5C12A 3L2UA 1HMVA 2E8AA 2P9NA 3L6QA 1FW6A 3U9ZA 2O8EA 3LWLA 2FSNA 3TU5A 1FKPA 4W5RA 1WSJA 1ESVA 4FJHA 4CIEA 2HHSA 2HNYA 4CIGA 2J4RA 2HHUA 3ATUA 3ASMA 1CXQA 4NLCA 3SPZA 1RBTA 4BDYA 5AQLA 4CF2A 2X74A 1KLMA 2WUSA 1IV0A 3D2EB 3O5BA 3LAKA 3O8MA 5GAEP 3CHWA 3O3GA 2Y1IA 4AHVA 4FOIA 3HPHA 5LMNK 1HRHA 1RCHA 3TAMA 3SQ0A 4FJ9A 4A61A 2FBXA 1J6ZA 5LY3A 4WFNL 4BE2A 1KAYA 3ZX2A 4FXDA 1DKGD 4H03B 5HRPA 1EETA 2F96A 5AZJB 1NMDA 4CBUA 3K59A 3QEPA 1NK8A 3AVCA 1MDUB 4HUEA 4FJXA 1RT4A 2HBKA 3QIPA 1S1VA 4FM2A 1W0HA 4DQ8A 4W5OA 3MXIA 5M1PA 3D2FA 3HRGA 4CHNA 4DQRA 3AO5A 1XNRK 1X3NA 3C7NB 1TAUA 3RVCA 3TSPA 3BZCA 1YUWA 3DM2A 3NE6A 3THWB 4NYFA 4H4OA 2YNHA 2W42A 1IKXA 4N5SA 4BRQA 2OZSA 4DR4K 1T03A 3K5NA 2YX6A 5LMUK 4ELTA 3SV3A 2QW9A 2PZSA 3AVLA 2EX3A 2GTDA 4KI4A 2YKNA 3AA3A 3F73A 4CEQA 3ZSYA 4NXMK 1VRTA 3MWPA 4JLHA 4M3UA 2JGUA 1S3XA 3SMSA 2BANA 1K8KA 1JCGA 3ZEUB 4B9SA 1YTUA 3ENBA 1NJZA 3B6PA 3H3OB 1NNEA 5KTQA 4M7YA 5BR9A 4DF4A 3A0IX 3V1RA 3CCVN 2QXLA 4DV4K 5BRHA 1S6PA 4IG0A 2Q0RA 1N8RO 2PFUA 2BUPA 5AJ3K 3PY8A 5JLFA 2ZGYA 1ASWA 1LOTB 2XY6A 1TUUA 1DLOA 4Z4FA 3CQYA 1KC8O 4A57A 1WBBA 1Q8IA 3RRGA 4BG9A 1W9HA 3LAMA 1JCEA 1JXEA 4O8KA 4FJJA 4GNIA 2QK9A 3NVMA 4JS4A 3SQ1A 2O8CB 3CG7A 4DSLA 5HL7L 4H0TB 2VWBA 4PKHA 4F9OA 1CZBA 4F4KA 1C1BA 3HZ6A 3UKUB 4JRQA 2RKIA 3AVNA 3LP0A 3OJSA 2QWOA 3CM5A 4CE9A 1BQMA 4HWIA 4DTNA 2CH5A 4DTJA 4YOUA 1T6CA 3K9KA 1HKGA 3AVFA 3RTVA 5TKYA 2IOCA 4WF9L 2FXUA 3O9SA 1K6YA 4DTRA 4DSEA 3M8QA 5AQXA 3TARA 4KFBA 4WQ4C 1YJNN 1KD1O 3MN7A 3VTHA 4M45A 1D8YA 4BR7A 3M8RA 4O4GA 2YHXA 4LSLA 3SAHA 4Y0WA 3CC7N 1RT7A 4FWRA 2VWJA 1KAZA 3CJBA 1L5UA 1NGGA 1KSPA 1JLCA 4AQYK 1KXPA 1HJRA 3VA3A 1O1WA 4FPAA 1RNHA 3FFIA 3KHYA 1RDBA 2GWJA 1BIUA 4KO0A 3OYHA 2Z1IA 5HRSA 4CESA 4BEBA 4CEDA 4O5BA 4Z4CA 4FLZA 2O8CA 4CZGA 4WE1A 3MX2A 5GIOA 4JK8A 4CJEA 4FK2A 4FPBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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