1RGIA

Crystal structure of gelsolin domains g1-g3 bound to actin
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
371
structure length
349
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
publication title Structure of the N-terminal half of gelsolin bound to actin: roles in severing, apoptosis and FAF
pubmed doi rcsb
molecule keywords Gelsolin
total genus 109
structure length 349
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1rgiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1rgiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1rgiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1rgiA04
4CI6A 2BTFA 2CGLA 3B8AX 4IXCA 4BR5A 3FZLA 1WOQA 3FZMA 4HTLA 2A42A 3UKUB 5F1XA 3O4WA 2V7YA 1K8KA 3QBXA 2ZGYA 5AZIB 1GLDG 1R59O 2P9NA 3VGMA 5EXWA 2E1ZA 4RWTA 1NGCA 3D2EB 4PL8A 5AQTA 3WQTA 1QQOA 3LDQA 5ADXA 4IWVA 2YHWA 2GEMA 2GTDA 3EZWA 4CZIA 3FGUA 1YUWA 3DWLA 4BG9A 2A5XA 1NGBA 5E84A 5JMVA 4XH4A 2VYPA 4MLHA 3VEOA 1ESVA 3CHWA 1GLJO 1KAZA 1TYQB 4IJNA 3M6GA 4BRQA 5AQPA 4L3QA 2P9UB 2P9IA 5AQFA 3WEEA 3VEVA 1EQYA 1HPMA 2F9TA 2UYTA 1GLFO 4YDUC 3GBTA 1HKGA 1BG3A 5I9EB 5LJWA 1D4XA 1Q18A 2NRHA 4JHDA 2YCHA 5AQUA 3ENHA 3QB0A 1GLEG 4EHUA 2FXUA 3UE5A 4BVPA 4RTFD 1Z05A 5JICA 2FF3B 3VERA 3DXKA 4K25A 2F9WA 1LOTB 4ISGA 3DAWA 4BREA 2PAVA 3O08A 3VEZA 3ZETB 3HZ6A 2E8AA 1HUXA 3BF1A 4BRFA 5AQHA 4PKHA 4B1ZA 4FWQA 4EIAA 1QHAA 5LY3A 2AA4A 1CZAN 1RFQA 5AQWA 1NGAA 4CBUA 4BC5A 1YVNA 4BRGA 2FSJA 3WXLA 4JD2B 3MCPA 1XC3A 2IVNA 4IZ9A 1SAZA 2FF6A 3QFUA 3A5NC 5AQMA 4WQ5A 4C23A 2P9LB 2GWKA 3MN9A 4FWNA 4H5VA 2GUPA 2BUPA 4EHTA 3C7NA 3EKUA 2EWSA 5FPNA 4H0XB 1S3XA 3L0QA 2ASMA 3VF4A 2PBDA 4FWOA 3SJHA 4I6MA 3ID8A 2YI1A 3FR0A 4KBOA 4BROA 1C0GA 2YHXA 3IUCA 3A8YA 4FOIA 3JS6A 4WQ4A 3O8MA 3H3NO 3CJAA 2WUSA 1MDUB 4EFHA 3CI5A 2DPNA 3SK3A 4BC4A 4BR9A 2HMPA 5KQDA 3DXMB 1BA0A 4B9QA 3WXKA 3GDQA 3FE1A 2P9KA 5BN8A 3I33A 4CZMA 1J6ZA 1QQMA 2E2QA 2YJEA 3EKSA 3ZX2A 5CE3A 3QDKA 1NGJA 1HJOA 4IJAA 5BR9A 1NBWA 3AARA 1U2VA 1BUPA 4GNIA 2E1YA 4CZEA 3A5MC 2ASPA 3U9DA 1BWFO 2YHYA 2Q36A 3ZEUB 2E88A 3UKRB 1NGFA 2QWPA 2ZF5O 3CJ7A 4BVOA 3H46O 3CIPA 1NGHA 1SZ2A 4DHYA 3UKUA 4FL9A 3D2FA 1NGIA 3VGLA 4BR0A 2Q97A 4ISEA 1QQNA 4MO4A 4BRHA 2E2OA 4PKIA 1HKCA 4GY2B 4LC9B 4WYBA 3WQUA 4CD3A 1JCFA 1QZ5A 3RSEB 3CQXA 1LCUA 4H5TA 3R6MA 3O1BA 3VEXA 1T6CA 2D1KA 1JCEA 4O8KA 2P9PA 1NMDA 2FLOA 3GE1A 1ATNA 4BRMA 2CGKA 3CJCA 5AQNA 1BDGA 4BRAA 4CBWA 4IO8A 2CH5A 3TU5A 5FPMA 1IG8A 4H0VB 3P4IA 2VCPA 3A0IX 1K8KB 3U9ZA 3IMXA 1ZC6A 4CZHA 3AY9A 4AM7A 3MMVA 2D4WA 4CZLA 1RDWX 1WUAA 2H3GX 4EAHD 5EOYA 2QWRA 3VETA 4NO7A 1RGIA 2P9SA 2D0PA 4JNEA 2GELA 1E4GT 3GL1A 3MN7A 3M1FA 2IIRA 4CZFA 3O1WA 2V7ZA 3JXUA 1MWKA 5AQVA 3FZFA 3U4LA 4BRKA 4H0YB 3LDPA 3SMSA 3ULEB 4PKGA 1Y64A 3WUHA 1YXQA 4CBXA 1XUPO 3MN5A 4FOEA 4JAXA 3H3OB 3HBTA 4K43A 5BREA 3WEEB 1KXPA 4Y0WA 1XQSC 1Z6RA 3CERA 3VOVA 3ZETA 4FWKA 1NLVA 5AQXA 3FZHA 3ZX3A 1H1VA 2ZWHA 3S41A 2I7PA 5KQ8A 4A2AA 4A62A 4FPAA 4A2BA 4JHDB 3WXJA 1HKBA 4K41A 2E2NA 4NB4A 3BUZB 3HI0A 5F2RA 3VEYA 2A40A 1E4FT 5ELZA 4B1XB 2P9LA 3DXKB 4BRPA 3LDLA 4H03B 3FFKB 4PL7A 1GLLO 4FSVA 3LM2A 4H5WA 5EVZA 4BGBA 3VPZA 4H5NA 4BRNA 1NGEA 4BQZA 4YDUA 2QWOA 1TUYA 3OHRA 1DEJA 1OKJA 4B1YB 4BRIA 4BRDA 3IFRA 1ZBSA 1KAYA 4FWLA 5BRDA 1KAXA 2NLXA 3EO3A 3LL3A 4XEIA 2AP1A 1U6ZA 3ZX0A 1S22A 4B1UB 2W41A 3H1VX 2ITMA 3C7NB 1TUUA 2KHOA 1ATRA 2V52B 5BRHA 4M7XA 2QXLA 4CD1A 2QM1A 4BQLA 5BPMA 5AZJA 2Q0RA 4I6MB 3W3DA 2Q1NA 1T6DA 3A5LC 1HLUA 5BN9A 5LJVA 1BA1A 5JLFA 1DKGD 4BRLA 4BR2A 1MWMA 4K42A 4DCHA 4DQ8A 3AAQA 3DJCA 4MLEA 2P9KB 3MN6A 3ATVA 3CJBA 3MDQA 3O5BA 5AZIA 5AFUH 3SMPA 2E20A 5EX5A 3U8XA 1T44A 3L4IA 5AQYA 3CJ1A 3D2EA 3G25A 3LDNA 5AQLA 4CJ7A 3GOIA 1U2VB 3M3ZA 4O5FA 2A6AA 3J8AA 1V4TA 2QWMA 4M7YA 3QMLA 3R8EA 4E1JA 4ISFA 1GLBG 4FWMA 2A41A 5BRFA 2ZGZA 2NZTA 3D2FB 3KHYA 3R9PA 1NWKA 1TYQA 2QWLA 2YJFA 1NGDA 4RCHA 5AFUA 2P9UA 1GLAG 3MK6A 4JN4A 2P9NB 5AQKA 3UB5A 3W0LA 2E2PA 1BOTO 3F9MA 3QBWA 3L6QA 2QWNA 3CETA 4BG8A 3H1QA 3CQYA 3GG4A 2ASOA 2P9PB 3AAPA 5F0XA 4BR4A 4H0PA 5FPDA 3CJ9A 4F9OA 5E26A 3ULEA 2A3ZA 1V4SA 1X9JA 2CGJA 2QWQA 4QS7A 4WQ5C 2V51B 3EN9A 4A61A 5AQQA 3WT0A 1SQKA 1BU6O 4H0OA 2P9IB 5AR0A 2HF3A 2P9SB 4FO0A 3TPQA 5AQOA 5AQSA 3VESA 3SLCA 3VENA 4H5RA 4WQ4C 3KVGA 1GLCG 3FLCO 5AQRA 4FWSA 1JCGA 5KPTA 3BP8A 4Z94A 4JD2A 2VWBA 4CZJA 5FPEA 5AQGA 1C0FA 3VGKA 3A5OC 4BGAA 3I8BA 3LDOA 1DGKN 1NM1A 3BEXA 3IDHA 4FWPA 4HWIA 1YAGA 3VF6A 4MO5A 5AQZA 2Q31A 3WXIA 3C0BA 3HTVA 2W40A 4J8FA 2I7NA 2IVOA 4BR7A 5KPZA 5B8HA 1IJJA 4XH1A 4QS8A 4QS9A 4BRCA 4DB3A 4BC2A 3HM8A 3DXMA 5BPLA 5KPRA 1ATSA 4B1VA 2FSKA 1NGGA 2Q0UA 5BPNA 2IVPA 4CZKA 3ENOA 1BO5O 2HOEA 1P8ZA 3ATUA 1HX1A 5AQJA 4B1WB 3VEWA 3ZEUA 2Q2RA 3UKRA 4M63C 3FZKA 3QFPA 3VF2A 1MA9B 3O6WA 3LM9A 3H6EA 2FSNA 3KZBA 3EL2A 2J4RA 2D0OA 2GWJA 1QZ6A 4CZGA 3QICA 4XH5A 5AQIA 1G99A 3RSEA 2HF4A 5JLHA 2OANA 4H0TB 3H45C 5EY4A 3D7EO 5AZJB 4BC3A 1ZXOA 5ADXH 1X3MA 1X3NA 3BF3A 3O80A 4FWRA 5TKYA 4AM6A 3HSCA 2CH6A 4FPBA 2QW9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CI6A 4Y1CA 4OX9K 3B8AX 2I5JA 2YKMA 4HTLA 3P31A 5F1XA 3TABA 1TL3A 3QBXA 2ZGYA 2D0BA 1GLDG 3M5RA 3QNOA 4RWTA 5JVHL 3CFRA 4ID1A 5AQTA 4CJWA 1TV6A 1VRTA 3LDQA 4XIUA 3THYB 4JKHA 4IWVA 1JJ2M 3DLGA 5JMVA 3SUPA 3QEVA 2VYPA 3F73A 3VEOA 3V9WA 4JI6K 3AVFA 1RTJA 3V9UA 1EWQA 4JKFA 1TYQB 4JYAK 1S9EA 4L3QA 4FJGA 5D3GA 3DLLL 4LF6K 4IBNA 3E1YA 3RRGA 1A5WA 1RBVA 3RR8A 1D4XA 3G6EN 1NJYA 4C8NA 4KHNA 1T03A 3CC4N 1XHXA 5KGXA 3CFOA 3NH1A 4WFBL 2FXUA 4BVPA 3NDKA 4ZTFA 3DXKA 4J2AA 4K25A 1LOTB 3QIOA 5KI6A 1A5VA 3KTQA 3HVTA 4KHSA 4CGJA 3AGRA 4CF1A 4GKJK 2GUIA 1Q9YA 2IC3A 4YOXA 2AA4A 1CZAN 3ISNC 2O8EA 4BC5A 1YVNA 4JD2B 3VQDA 4IZ9A 2IVNA 2QA4N 4LFCK 4JKBA 3HM9A 2HHUA 1XNQK 2ZE2A 4KHYA 2E4LA 3SV4A 2GUPA 4OKKA 4Z4GA 3NF7A 5FPNA 3NMUA 3NF6A 3N4QA 4FLVA 3OS1A 3CYGA 4I6MA 3AA5X 2XO7A 4KBOA 2YHXA 3A8YA 5KGWA 2FBVA 3CPWM 4W5RA 4AQYK 4EFHA 1IKYA 4IG0A 1XMOK 1HNWK 2HMPA 5KQDA 1M1KO 1BA0A 3GDQA 3FE1A 3K5OA 2P9KA 4B9VA 1J6ZA 1QQMA 2YJEA 3ZX2A 1U4BA 3QDKA 1NGJA 3I56N 2OPPA 2KZZA 4ELVA 3OYKA 4GNIA 2E1YA 1JXEA 3A5MC 4J2DA 3KK7A 3DMJA 2Q36A 3T1YK 4KI4A 2E88A 3K58A 3QINA 1Q9XA 1NGFA 1FW6A 2ZF5O 3AVBA 1SZ2A 4DS4A 3SPYA 4JKDA 4OO1J 3AVNA 3V1RA 4FL9A 1GOAA 4CJ3A 4CEEA 4A59A 1SKWA 2O8FB 3AA2A 4W5NA 1VSKA 3TWHA 1HKCA 4WYBA 4IOAL 2DY4A 1JCFA 3RSEB 4IFYA 3J81O 5FRMA 1LCUA 4M45A 3R6MA 1TK5A 1CXQA 2JWLA 1T6CA 4C8KA 3ULDA 2JWKA 1SL1A 1NMDA 4IFVA 1ATNA 2DTUA 3F2KA 4E19A 4CHYA 4KH6A 1C1AA 4OKEA 3U9ZA 5C2DA 3VQ8A 4CZHA 2D4WA 3E9OA 5EOYA 1HNVA 3VETA 2F96A 4DUZK 3PX4A 4NO7A 1RGIA 2P9SA 1X9MA 1ZYQA 4JNEA 4CECA 1E4GT 2IIRA 4K8XA 3KKSA 3ZT1A 4E1MA 4KI6A 3JXUA 1WSEA 2F4VK 2IOCA 3I8DA 3ULEB 3SZ2A 1Y64A 3WUHA 1K6YA 3OYGA 4DV2K 4CBXA 4KPYA 4FOEA 3AVMA 4NLBA 1KXPA 1D9DA 1XQSC 3VOVA 1WAJA 3ZETA 3BY5A 1TK0A 2PFUA 3S41A 2I7PA 2GV9A 3CMEN 1UWBA 4A2AA 1IBMK 5KRSA 3ZSYA 4E7HA 4NLCA 1HKBA 4AHSA 3PO5A 4NB4A 3VEYA 2RE2A 2P9LA 3SQ4A 1FK9A 1KLMA 3FFKB 2NRXA 1GLLO 3V4IA 3L2VA 4BGBA 4H5NA 3AV9A 1NGEA 3HRGA 4BQZA 1VAZA 4CJVA 1TUYA 4B1YB 4BRIA 4KB1A 1LWFA 3TAFA 3CPEA 3K2PA 3AO3A 3RMAA 3LL3A 4DQPA 4LF8K 3ZYYX 2FBYA 3LWLA 1S22A 1U04A 1YF5L 3EYZA 2W41A 3S9HA 3K57A 1OH8A 3HO1A 3C7NB 3C6HA 1RT4A 3D6RA 1TUUA 4FLYA 4E0DA 2KHOA 4EZ6A 2V52B 4I2QA 4M7XA 2QM1A 2ZJRL 2KQ2A 4CEOA 5MLCQ 2Q1NA 2R7YA 5LJVA 5JLFA 4JI0K 1DKGD 4BR2A 4K42A 1EWRA 3NF9A 1VQ5N 2UXCK 1KVAA 2KFZA 3DJCA 4MLEA 3MN6A 5AZIA 5AFUH 1CZBA 3L2QA 3U8XA 1T44A 1L3UA 5AQYA 3LDNA 5M1OA 4BWJA 3QESA 3GOIA 1U2VB 3LAKA 4O5FA 3M3ZA 3KK2A 2A6AA 3NCIA 4F3TA 1NK0A 2BANA 1QSSA 4M7YA 3QMLA 4E1JA 4JS5A 4LFAK 2G8HA 1ZBUA 1IKVA 1IBLK 3AVGA 3D2FB 1C0UA 3KHYA 4FJLA 3IRXA 4YY3K 2QWLA 3C65A 4BECA 4DF8A 2YJFA 4RCHA 3MXMA 1GLAG 3UB5A 3W0LA 3P39A 2QWNA 1BIZA 3LP0A 2W00A 4CJRA 1RBTA 3RRHA 4H0PA 2OPSA 3CJ9A 3AA4A 2PYLA 4F9OA 2G8WA 3NH0A 2OTLN 4QAGA 1T7PA 4QS7A 4WQ5C 2V51B 3EN9A 2XY6A 4NYNA 1SQKA 1BU6O 4NCBA 2XY5A 5JENA 4CJQA 3SAHA 3CCLN 1FKPA 1OVQA 2KTQA 1P90A 3CCRN 2G8FA 1WSJA 4X64K 3L3VA 1KC8O 3TPQA 3TAPA 1N6QA 3CCUN 2OA8A 1GLCG 5AQRA 1LW0A 2RF2A 1JCGA 3BP8A 3I0RA 5SWMA 1N34K 4CZJA 3VMFB 1KLNA 4CEZA 3KK1A 4DV1K 4HHTA 3MEEA 5TKWA 3HPOA 4Q0BA 3DM2A 3I8BA 3LDOA 3TSPA 3THXB 2QKBA 4FWPA 4M3ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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