1S22A

Absolute stereochemistry of ulapualide a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
356
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Absolute stereochemistry of ulapualide A
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin
molecule tags Structural protein
total genus 120
structure length 356
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1s22A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1s22A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1s22A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1s22A04
1D4XA 3CJ1A 3RSEB 4FL9A 3WT0A 4PL8A 3FR0A 4M7YA 3VESA 4BRGA 2I7NA 1HKGA 4CBUA 1QZ6A 2ZF5O 5AQRA 1K8KA 3ZEUA 2E1ZA 3C7NB 3FE1A 5AZIA 2FLOA 4BRIA 4JD2A 1HJOA 3M6GA 2E2NA 3WUHA 3D7EO 4F9OA 4CI6A 1NGIA 2Q0UA 2HMPA 2BUPA 4BRKA 4B1YB 3U8XA 5AQOA 4CZHA 2WUSA 4JAXA 5AQSA 4BR9A 4EFHA 1V4TA 2VWBA 2YHWA 1HKCA 5ADXA 3MN5A 3VF2A 3DAWA 3HTVA 3GDQA 1BWFO 1S22A 2E88A 1HKBA 5BRHA 4K25A 1NGCA 2OANA 4CZFA 1EQYA 1NWKA 3D2EB 3GBTA 4BRLA 3D2FA 4PL7A 2P9NA 5FPEA 3HZ6A 2FSKA 5KQDA 1K8KB 3IFRA 3MK6A 4YDUA 3UB5A 5AZIB 2P9IA 3CHWA 3MDQA 3ENHA 1GLFO 2CGLA 3BEXA 3VEXA 1T6CA 2CGKA 4H0TB 1SAZA 3ZETA 1IG8A 4IJNA 4ISEA 4LC9B 5AQIA 4AM7A 4CZKA 2D0OA 5AQHA 3KVGA 1WOQA 2A40A 3F9MA 3FZFA 3JXUA 2F9WA 4BC5A 2FF3B 4FWMA 4IZ9A 2AP1A 4CJ7A 3DWLA 3H45C 2QWQA 4PKGA 3L4IA 3CERA 2V51B 3O80A 4FPBA 1QZ5A 4BRMA 3DXMA 2YHXA 3UKUB 2HF4A 4BR7A 1X3MA 3D2FB 5BN8A 1QQNA 1KXPA 2A42A 2ASMA 3FLCO 1BU6O 1HLUA 3HBTA 5AQPA 3FFKB 3DJCA 1HPMA 1TUUA 2Q97A 1ESVA 5ADXH 3QDKA 1Z6RA 5KPTA 2P9SB 2A6AA 3U4LA 4BGBA 1NLVA 1RFQA 4H5NA 3BUZB 5JLFA 4RCHA 1U6ZA 1BOTO 3LM2A 5BPLA 3QMLA 1TYQA 2YJEA 2P9UB 1XC3A 2GUPA 2P9KB 3A8YA 3FZKA 4DHYA 3ULEB 2IVNA 4FWNA 2QWLA 4NO7A 3RSEA 4M7XA 3A5NC 3A5MC 1P8ZA 3CJBA 5LJWA 1NGGA 1C0FA 3QICA 4Y0WA 2ZGZA 3EKUA 2A5XA 3M1FA 2YCHA 5AQTA 1QQOA 1Z05A 4FWPA 1RGIA 4FSVA 2D1KA 2GEMA 2I7PA 3WXLA 5AZJB 1YVNA 4KBOA 2W40A 3ID8A 3ATUA 4ISGA 2Q2RA 2QM1A 1RDWX 4XH1A 3VETA 4H0YB 1TYQB 4EAHD 4BRCA 4H0VB 4H5TA 2H3GX 1YAGA 5AQJA 4C23A 1KAZA 1BDGA 3SK3A 3MN6A 4A2BA 3W0LA 5JICA 4H5VA 2PBDA 1YXQA 3D2EA 2J4RA 2EWSA 1NGEA 4BC4A 4IJAA 2ZWHA 2Q31A 1HX1A 3P4IA 1ATRA 3R9PA 1GLAG 4BREA 1ZBSA 5AQLA 2YJFA 3AY9A 3ZX3A 3QBXA 1MDUB 3CQYA 4IO8A 2ASPA 3CIPA 3U9DA 3H46O 4BRFA 5LY3A 2QWOA 3LL3A 2V7YA 5KPRA 4DCHA 5AQZA 2FSJA 1NBWA 4A61A 3AAPA 4QS8A 2YI1A 3UKUA 4DB3A 4QS7A 3FZLA 3A5LC 4H5RA 1WUAA 1NGFA 4RTFD 2F9TA 4BR0A 4BRDA 5JMVA 3MN7A 1LOTB 3L0QA 3LDLA 5BRDA 4NB4A 4FWRA 4B1WB 4BC3A 4EIAA 3VERA 5KPZA 3SLCA 3H1QA 3BP8A 2P9SA 2V7ZA 1ZC6A 3OHRA 2ITMA 1Y64A 2A41A 2GTDA 4RWTA 2W41A 2AA4A 3H6EA 4L3QA 3H3OB 4FWLA 2ZGYA 3ENOA 2YHYA 2P9UA 5F1XA 2QWPA 2P9KA 1JCGA 3ULEA 4BQZA 3R6MA 5BN9A 4IXCA 3AAQA 3FGUA 1NGJA 3VEOA 4J8FA 4O5FA 4EHUA 3UKRB 3TU5A 3A5OC 4BR4A 2FSNA 4XEIA 5BRFA 1H1VA 4CZIA 5TKYA 1NGHA 1KAXA 4ISFA 3O08A 4E1JA 1QQMA 4K43A 2D4WA 1GLBG 3EN9A 5AZJA 5EXWA 4I6MA 3WEEA 4BVPA 4CZMA 4MO5A 4BC2A 4HWIA 4JHDA 3R8EA 2E2OA 1V4SA 3VF4A 2GELA 2Q0RA 4XH4A 4M63C 4H0PA 1OKJA 1BUPA 3QFPA 5EX5A 3VGKA 3A0IX 4CZJA 3HM8A 5AQMA 3WXKA 5E84A 3VENA 1SQKA 3VOVA 3G25A 5AQYA 2P9PB 3WQUA 3VPZA 1NM1A 3WQTA 4WQ5C 3H3NO 3KHYA 1MWKA 3IDHA 3CJCA 3GG4A 2QWMA 3FZMA 1Q18A 3M3ZA 4I6MB 3WEEB 4H0XB 4BR5A 4JHDB 5F2RA 3QBWA 3O4WA 5AQVA 1E4FT 1GLEG 4XH5A 4Z94A 4FWSA 2QWNA 2NRHA 4FO0A 1IJJA 2HF3A 2Q36A 5LJVA 4CBWA 2DPNA 5AQNA 5AQFA 2D0PA 3S41A 3BF3A 3LDNA 4YDUC 2FXUA 2CH6A 4O8KA 3QFUA 4PKIA 5FPNA 5CE3A 2E8AA 3HI0A 4CD1A 3ATVA 2VCPA 3VGMA 3CQXA 1U2VB 1C0GA 4JN4A 3WXJA 4BRNA 4H03B 1ATSA 3WXIA 3GOIA 1ZXOA 5AQUA 4A62A 4BQLA 2GWJA 3EKSA 3BF1A 5AQXA 4WQ5A 5AFUH 4HTLA 4FWQA 1BA0A 3CI5A 4FWKA 4WQ4C 2NZTA 4K42A 3I33A 5FPMA 5AQWA 3DXKB 3UKRA 4B9QA 4MLHA 4BR2A 2P9LB 4WYBA 2QW9A 5KQ8A 3O8MA 4BRAA 3VEWA 3SJHA 2GWKA 2IVOA 4MO4A 4CZEA 4B1VA 3AARA 3J8AA 2KHOA 2E1YA 3CJ7A 2IIRA 3I8BA 1NGDA 2BTFA 4CBXA 3L6QA 1TUYA 3O1WA 5AQQA 3LDPA 1JCEA 2A3ZA 4GY2B 3MMVA 3MCPA 3LDOA 3CJ9A 1GLCG 2PAVA 5F0XA 3VF6A 3VEYA 3ZEUB 3ZX0A 4K41A 2QXLA 1DGKN 4AM6A 4BRHA 1LCUA 4JD2B 4CZLA 1NMDA 4B1ZA 1BA1A 3JS6A 1G99A 1GLJO 5BREA 3IUCA 3VEZA 3IMXA 2P9PA 1QHAA 3FZHA 3MN9A 4BVOA 1GLDG 1T6DA 1XQSC 3LDQA 5ELZA 2CGJA 2CH5A 4BROA 1DKGD 5BPNA 2FF6A 4WQ4A 3VEVA 2ASOA 4FOIA 3GE1A 4MLEA 3HSCA 2P9NB 5I9EB 2UYTA 1KAYA 3O1BA 1R59O 2V52B 5E26A 2P9IB 5B8HA 5BPMA 3SMSA 1ATNA 4JNEA 4PKHA 1NGAA 3EZWA 3H1VX 2E2PA 1X9JA 3VGLA 3ZETB 1DEJA 2HOEA 5AQKA 5JLHA 2VYPA 4BRPA 4CD3A 1HUXA 1BO5O 4H5WA 5AFUA 5EOYA 5EY4A 2E2QA 2Q1NA 1YUWA 3UE5A 1SZ2A 4BGAA 5BR9A 3CETA 3O5BA 4GNIA 1S3XA 4EHTA 4FOEA 3C0BA 3DXMB 1GLLO 5AQGA 3CJAA 4A2AA 5EVZA 3ZX2A 2IVPA 1U2VA 3W3DA 3QB0A 4B1XB 3O6WA 2NLXA 1XUPO 1BG3A 5FPDA 3KZBA 4B1UB 2E20A 1MA9B 3C7NA 4DQ8A 3LM9A 5AR0A 4FWOA 3GL1A 3TPQA 4BG8A 4H0OA 4FPAA 1E4GT 3DXKA 1CZAN 2P9LA 4BG9A 1X3NA 3B8AX 3EL2A 1MWMA 2QWRA 1T44A 1NGBA 3SMPA 4BRQA 1J6ZA 4CZGA 3U9ZA 4IWVA 1JCFA 3EO3A 4QS9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PL8A 1HRHA 3IS9A 4DV7K 4OX9K 4CJEA 1RDBA 1S1XA 3S3MA 4LY7A 4CEAA 3V4IA 4DV4K 4A59A 3FE1A 4YOVA 4H4OA 2EHGA 4JD2A 1HJOA 4CI6A 2Q0UA 4AH9A 3HT3A 4DSJA 4CF8A 4KV8A 2WUSA 5AQSA 4JAXA 3WNFA 3DAWA 4F8RA 4FJGA 3GDQA 1B9FA 2E88A 4FJXA 4FLTA 1NGCA 1DTQA 3AVHA 4PWDA 4CW7B 1RBUA 4PL7A 4FJMA 2FSKA 3IFRA 1QSSA 3HO1A 4ILJA 4C1NI 3TAMA 3MDQA 4CEOA 5HLFA 3VEXA 3CCJN 4H0TB 3TANA 1DT9A 1IG8A 5AQIA 3OW2M 4G1QA 2RF2A 2D0OA 5C0YA 5AQHA 2F9WA 1GOBA 2FF3B 3VQ8A 2AP1A 4KH6A 3CCMN 2OTLN 2QWQA 3NGZA 1VK0A 2OCEA 1UA0A 2O8CB 2HF4A 2O8BB 2JWLA 5BN8A 4FW2A 1KXPA 4K8XA 2HMIA 1XHXA 4O5BA 3KKSA 3AA2A 3AO2A 1EKEA 2ZJRL 3FFKB 3E1YA 4DR6K 4AHCA 2Q97A 4RW8A 1TVRA 2F7TA 5KPTA 4F4KA 1NLVA 4RCHA 5J2MA 1BOTO 3LM2A 5CY4A 1TYQA 4Z4HA 1XC3A 2GUPA 3A8YA 3KLEA 2P5GA 3DLGA 1Z25A 4C1NK 4FWNA 2RN2A 4NO7A 3G6EN 4M7XA 3A5NC 4DV5K 3PV8A 2X74A 2BH1A 3WNGA 3QICA 1TK0A 2YCHA 5AQTA 4CJLA 3J81O 4FWPA 3M8QA 2D1KA 3H08A 1YVNA 3ATUA 4PHTX 4HCCA 1NK7A 2QM1A 2OPRA 3T19A 4AHUA 3THWB 3TR8A 4XH1A 3VETA 4IKFA 1RTJA 1SKWA 3K59A 4C23A 3W0LA 2YNGA 4I7FA 3SV3A 4E0DA 1BHLA 2EWSA 1D9FA 5GIPA 4IJAA 1BISA 3TWHA 3P4IA 4YHHK 2IC3A 4YOXA 1ZBSA 4B9VA 1VSFA 4KI6A 1C0MA 3E9LA 3I56N 3ZX3A 3SAGA 4JRQA 3SZ2A 3E66A 4H8KA 4KTWA 1YIJN 3CIPA 3E9OA 2QWOA 2YNFA 3NGIA 4DCHA 4PA1A 2FSJA 3LP3A 4DLGA 2YX6A 1VQKN 4QS8A 3DI6A 3FZLA 2QI2A 3VA0A 2AJQA 3VTIA 1KSPA 4CJSA 3CCVN 3MN7A 1LOTB 4FZYA 1G15A 2VQFK 3CPEA 1S9EA 4IFVA 4CHPA 3BP8A 2P9SA 4N47A 1ZC6A 1BGXT 3OHRA 4C8OA 4RWTA 2GTDA 2W41A 3QEVA 3H6EA 4CJUA 3C6AA 4FCYA 2P9UA 2P9KA 3V9UA 3ULEA 4BQZA 4KHNA 2NRTA 3VEOA 4EHUA 3A5OC 4XEIA 3BZCA 1H1VA 5CR4A 5TKYA 3OBYA 3LZIA 3PLAA 1KRPA 4OGEA 4E1JA 1QQMA 4CHQA 3EN9A 3L8BA 1JXBA 3WEEA 4DLEA 4A5AA 4DU4A 3PIPL 4BDPA 2E2OA 3QEPA 1V4SA 1TAQA 4XH4A 1WB9A 3LPTA 5I3UA 1QS4A 1YJ9N 3QFPA 3VGKA 2VQEK 3VQAA 3N4PA 1RT1A 2B6AA 1Q7YO 3AO1A 3RMCA 1R0AA 3VENA 1SQKA 3KD5E 5LL6Z 1XI1A 5AQYA 3L2VA 1UOCA 3RRHA 3RVCA 4WQ5C 4H4MA 3OS0A 3O3GA 5C25A 2QWMA 4WE1A 4FK2A 1L3VA 1EETA 4H0XB 4RW4A 3PX6A 1S1TA 1RBTA 4YOUA 1NNEA 1YJWN 2NRZA 3RRGA 1FXXA 3EE8A 4FWSA 4LF9K 1ZBLA 3C65A 2O8DB 3AVFA 3AGRA 3NH1A 2Q36A 4DQQA 5AQNA 3OJSA 1M90O 3LDNA 4YDUC 3ZSZA 3PX0A 3OY9A 1U47A 2NRRA 1ZBHA 3OYDA 4BECA 4DR2K 3HI0A 4GKJK 2OPQA 4HCBA 3DRSA 1VQ7N 3VGMA 1U2VB 1C0GA 1WSFA 3CPWM 4DV0K 2GWJA 4CHOA 1VQNN 4WF9L 2G8HA 4FWQA 3OYLA 1IBMK 3QEWA 4B08A 3DYAA 2NZTA 4K42A 5AQWA 3UKRA 1VHXA 5KQ8A 1LAVA 3DMJA 2E6MA 2RPIA 2IVOA 1NJYA 4CZEA 4E3SA 1WBBA 3L4QA 3AARA 4CFAA 3CJ7A 3SI6A 3LP1A 2IGIA 2BTFA 1TUYA 1NK6A 5AQQA 2A3ZA 4CK2A 3I0SA 4CJ4A 4DSLA 1X1PA 4C8MA 4BY9C 3AVBA 2UXDK 3ZX0A 1VSKA 3HM9A 4FZXC 4K41A 2ITGA 4ID5A 2FBVA 1IKVA 2QXLA 1WNSA 4PY5A 3TTCA 1LCUA 4UY8O 4CZLA 3F2KA 3TAQA 5BREA 3IMXA 4ILGB 2PYLA 2NRWA 3P83D 4N56A 4BDZA 4IOXA 2CH5A 2HHVA 1WBDA 5K14A 2FF6A 4WQ4A 3ULDA 1S9GA 4HHTA 4JYAK 2P9NB 5I9EB 4CGFA 3F9KA 2QXFA 4CFDA 3AVGA 2IAJA 3M8SA 2Z1IA 5B8HA 4JKEA 4C8NA 4YY3K 4JNEA 1ZYQA 1NGAA 2E2PA 3ZETB 5AQKA 5JLHA 4BRPA 1L3UA 4W5RA 1BO5O 3QIPA 5EOYA 1NJZA 1K6YA 3NMUA 4Z4IA 1W0HA 2O8FB 5BR9A 2ZJPL 2NUBA 4OJRA 4M3YA 2VG7A 4W5TA 4CJPA 4BDYA 3W3DA 3NBPA 5H1SQ 5C12A 1BG3A 5FPDA 4NCAA 4O0IA 4B1UB 4FVUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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