1T44A

Structural basis of actin sequestration by thymosin-b4: implications for arp2/3 activation
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of actin sequestration by thymosin-beta4: implications for WH2 proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chimera of Gelsolin domain 1 and C-Terminal domain of thymos
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1t44A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1t44A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1t44A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1t44A04
4ISEA 2E2PA 2E2NA 3VF6A 4BRKA 1OKJA 3HBTA 5EY4A 4HTLA 2GWJA 3FFKB 3VGLA 3FE1A 5TKYA 3R9PA 4CBUA 1MWKA 5JMVA 4B1YB 1BA0A 3JXUA 4FWNA 4ISFA 5BN8A 2A41A 4K43A 4IWVA 2NRHA 1U2VA 3DJCA 1WOQA 2E8AA 1GLAG 3B8AX 3FZFA 1NGHA 3CQYA 2FLOA 1KAZA 3CHWA 3EKUA 5AQKA 2Q1NA 3H1QA 4BC3A 2AP1A 4DCHA 3WUHA 3HI0A 4H03B 3H6EA 3U9DA 4M63C 2VYPA 2V51B 2QWNA 4BR0A 4PKHA 2V7YA 3AARA 3H1VX 5FPMA 4LC9B 3FGUA 1T6DA 3GOIA 4XH4A 4BRDA 2A6AA 1U6ZA 4FOIA 3ZEUB 3UE5A 5AQQA 4C23A 4F9OA 1QHAA 1KAYA 2W41A 3BEXA 1P8ZA 4B9QA 3QFUA 5BR9A 3UKUB 1JCEA 3J8AA 4PL7A 3VGMA 2V52B 3JS6A 1MWMA 4M7YA 3IUCA 2GEMA 3QICA 4H0XB 1NBWA 3U9ZA 3DXKB 4H0OA 2D4WA 2NZTA 1GLJO 4IJAA 4K25A 2KHOA 5B8HA 3ZEUA 4BRIA 4EHUA 1K8KB 3ATVA 3UKRB 4EAHD 2CGJA 1E4FT 1D4XA 2HOEA 1X9JA 2E88A 2Q97A 1WUAA 3VEZA 1BG3A 2QWQA 4BRMA 5FPNA 3UKUA 4BRNA 3F9MA 4PKIA 5AQHA 1NLVA 3MN6A 3SJHA 5EOYA 3A5NC 3VESA 3LDQA 3VETA 3QFPA 4IZ9A 3DXKA 5BREA 3O80A 2QWMA 5I9EB 5AQJA 4FWQA 1K8KA 3UKRA 2CH5A 3O4WA 1NGIA 1XC3A 1BWFO 4FO0A 1HKBA 1NGDA 3ENHA 1S3XA 3BUZB 3H46O 5AZJB 1ESVA 2GELA 4BRLA 5FPDA 1XUPO 2E2QA 3VF2A 2FF6A 3ULEB 2E2OA 1ATRA 1QQNA 1NGFA 3GBTA 4BRHA 1YVNA 1NMDA 4Y0WA 5AR0A 4BR7A 4XEIA 2FSKA 4YDUC 3FZMA 1NGEA 3CJAA 4BR4A 4FWSA 1J6ZA 3A5OC 1KAXA 5AZJA 2CGLA 4BQLA 3D2EB 2W40A 3ULEA 5AQWA 3LDOA 1GLLO 3HSCA 3BF3A 4BG8A 3WXJA 3SLCA 1HKGA 2D1KA 4Z94A 1S22A 1C0GA 5AQFA 3L6QA 1IJJA 2FSNA 2QWRA 4FWKA 4WQ5C 3O8MA 3VOVA 4EIAA 4FWPA 2F9WA 3MN9A 5AQUA 4FWRA 3D2EA 1LCUA 3VERA 5KQ8A 2QWLA 4A61A 1IG8A 1V4TA 4FWMA 4H5WA 2D0PA 1GLBG 5E26A 3VEVA 2BUPA 3FZKA 4QS9A 1C0FA 4CZEA 5CE3A 4CJ7A 4E1JA 1X3NA 3I33A 3ZX0A 2VCPA 2P9PB 4NB4A 1BA1A 3BP8A 3VGKA 3ZX2A 1HKCA 1HJOA 4DB3A 2PAVA 3EL2A 4JN4A 3VEOA 3VEWA 3WT0A 2ITMA 4WYBA 4JD2B 4NO7A 2OANA 2ZGZA 4XH1A 4KBOA 2VWBA 4K41A 2PBDA 4I6MB 3GL1A 3KHYA 3R6MA 4O5FA 3GDQA 1SAZA 2P9PA 3SMPA 4BRQA 1Q18A 1ZBSA 3GE1A 4XH5A 1HUXA 5BPLA 3WXKA 4CZMA 3ENOA 3H45C 2Q0RA 5AQTA 4BQZA 4A2BA 3CJ9A 4JD2A 2Q2RA 2Q31A 2I7PA 4BRGA 3MDQA 2P9IB 5BRFA 1QZ5A 4I6MA 4QS8A 1DKGD 2Q0UA 3LDNA 4H5TA 2FXUA 3SMSA 4B1VA 4IO8A 1JCFA 4BR5A 3L4IA 5AQNA 1BU6O 3OHRA 4CD1A 5BPMA 1ATSA 3UB5A 1H1VA 4BR9A 4BROA 1LOTB 5E84A 1G99A 3H3OB 4FPAA 1BDGA 4WQ4A 4H5VA 3FZLA 2NLXA 3LDPA 1ZXOA 3CIPA 2P9IA 3AAPA 1NGAA 3I8BA 4BC5A 4JHDB 3AY9A 3R8EA 4B1ZA 5KPZA 3VEXA 3IDHA 4AM7A 3HTVA 5F0XA 3AAQA 3LDLA 4DHYA 1NM1A 3MN5A 1ATNA 2YCHA 4FWOA 3A5LC 3ZETB 2YHYA 4BG9A 4EHTA 3C7NB 3MK6A 4B1UB 4FL9A 3QBXA 2DPNA 2FF3B 4EFHA 1KXPA 4CZKA 4JHDA 3TPQA 1QQOA 4FSVA 4PL8A 3CI5A 4BRPA 3WXIA 5BPNA 1HPMA 5AQMA 2A5XA 2BTFA 3WXLA 4HWIA 3SK3A 1Y64A 4CI6A 1QZ6A 3ATUA 5AQRA 3ZETA 4CZGA 3VENA 1JCGA 4FOEA 2CH6A 3C7NA 3BF1A 5AQOA 2H3GX 3O5BA 3WQUA 4MLEA 5F1XA 5JLFA 5LJWA 2IVOA 2P9LB 3CJ7A 2ZGYA 4CZFA 2ZWHA 4B1WB 3U4LA 5FPEA 2I7NA 5AZIB 3CJCA 5BN9A 2GWKA 2ZF5O 3FLCO 3G25A 4A62A 4BR2A 2IVNA 5AQSA 3RSEB 1GLCG 4RWTA 1MDUB 1GLDG 2P9NB 3U8XA 5AQVA 3VPZA 5JICA 3CJBA 1NGCA 3LL3A 4CBWA 2P9LA 1HLUA 3WQTA 3KVGA 5AZIA 4A2AA 2P9UB 5KQDA 4CZLA 5BRDA 5LY3A 3IMXA 4H0YB 2QWPA 2YI1A 1RFQA 4BRCA 3IFRA 2GUPA 3RSEA 2YJFA 2P9NA 2V7ZA 1XQSC 1T44A 1HX1A 1YUWA 4BC4A 3O1BA 5ADXA 1BO5O 3QBWA 3O1WA 1Z05A 5EX5A 4H5RA 2EWSA 4CD3A 4BREA 4RCHA 5F2RA 4MO4A 2P9UA 4O8KA 3TU5A 3QMLA 3EKSA 2J4RA 3W3DA 1YAGA 3VF4A 1RDWX 2QWOA 5ELZA 5AQZA 3A5MC 3HZ6A 3M6GA 1QQMA 1SZ2A 1BUPA 1T6CA 2E20A 5AQPA 4AM6A 4ISGA 4PKGA 4BC2A 1NWKA 1R59O 4BRFA 2A42A 4B1XB 2IIRA 2E1YA 1TUUA 4JAXA 2A40A 2AA4A 3EO3A 3L0QA 3MCPA 1MA9B 5AFUA 2FSJA 5EVZA 4FPBA 3WEEB 5ADXH 1ZC6A 3ZX3A 1DEJA 3HM8A 3GG4A 4M7XA 2UYTA 4WQ4C 3CJ1A 3W0LA 3VEYA 3EZWA 1BOTO 5BRHA 5KPTA 4BGAA 1E4GT 4H0VB 1SQKA 2ASPA 4BVPA 2ASMA 2QXLA 5JLHA 3M3ZA 4FWLA 3D2FB 4DQ8A 2F9TA 3CERA 2YHXA 4BGBA 4J8FA 1GLFO 3WEEA 5AQIA 1Z6RA 2D0OA 1TUYA 3DWLA 3H3NO 2ASOA 2P9SB 2Q36A 4CBXA 3CETA 2E1ZA 1YXQA 1DGKN 2P9KB 3D7EO 1X3MA 4IJNA 5LJVA 1NGGA 3C0BA 4GY2B 4RTFD 4JNEA 3ID8A 1EQYA 3MN7A 2HMPA 5EXWA 3D2FA 5AFUH 4H5NA 1TYQB 3QDKA 4L3QA 3S41A 4MO5A 2GTDA 3QB0A 5AQXA 3DXMB 3FZHA 3M1FA 2YJEA 3LM2A 1NGBA 3MMVA 4H0TB 3O08A 2P9SA 2WUSA 2QM1A 4YDUA 5AQLA 2P9KA 3CQXA 4GNIA 4IXCA 1GLEG 4CZHA 4BVOA 5AQYA 1CZAN 4CZIA 5AQGA 4MLHA 4QS7A 2HF3A 4CZJA 2QW9A 4BRAA 3A0IX 2IVPA 1RGIA 1TYQA 2A3ZA 1NGJA 3P4IA 2HF4A 4K42A 3A8YA 3EN9A 3DXMA 3FR0A 1V4SA 3DAWA 2CGKA 3LM9A 5KPRA 2YHWA 1U2VB 3KZBA 4WQ5A 3O6WA 4H0PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VK0A 3WNFA 2E2PA 2RE2A 4OO1J 3SQ0A 3TTCA 2GWJA 1JLBA 3DLLL 4DTSA 4DV7K 3NAEA 3CCEN 4FZYA 5J2PA 1YTUA 1DLOA 2A41A 4DLEA 4OKJA 3S3OA 4DSKA 3FZFA 1OVQA 3O3HA 3LANA 3L2UA 3V6DA 4M3YA 1LWFA 3VQ6A 3K5MA 5DK5A 4I2QA 2AP1A 4KHQA 3HI0A 3U9DA 3V1RA 1Q9XA 2QWNA 4PA1A 2V7YA 1RDBA 5FPMA 3KKSA 1T6DA 3VTIA 1WNSA 1U6ZA 3ZSRA 5AQQA 4C23A 4AHTA 4F9OA 1EXQA 1Q9YA 1QHAA 1KAYA 3BEXA 5BR9A 3AA2A 3J8AA 1WBDA 5J2NA 3VGMA 1EX4A 3MEEA 1TL1A 3JS6A 3TSUA 5C10A 4H0OA 5HLFA 2NZTA 4K25A 3V9SA 5C2DA 4CEAA 3DMJA 3KD1E 1K8KB 1CXQA 2CGJA 4OKEA 1D4XA 3QEIA 1X9JA 2E88A 1JJ2M 3NF9A 1OVYA 1BG3A 2QWQA 3CCRN 4KHWA 3QEVA 5HROA 4BRNA 4PKIA 3KLFA 1UA0A 4CJFA 4PY5A 4MQ3A 1UA1A 3VESA 2O4GA 3LDQA 3TAMA 1B9FA 4NXNK 3IRXA 2BANA 3PSIA 4QOZB 1K73O 3S3MA 2CH5A 5H1SQ 2KTQA 1NGIA 5M1KA 4JRPA 1XUPO 3V9UA 2E2QA 3VF2A 4DUYK 3ULEB 3THWA 3AVFA 1L3UA 5CHIA 4OGEA 3PO4A 4Y0WA 3QIPA 4BR7A 4XEIA 3CG7A 3RRHA 1NGEA 4BR4A 4FWSA 3V4IA 3A5OC 5AZJA 3HJFA 1CZBA 3G0ZA 3ZSVA 2HBMA 4E1NA 3C94A 4RW9A 4FLXA 2D1KA 2HHWA 1C0GA 3EE8A 4G1QA 4FXDA 2BE2A 4FWPA 1LWCA 4M3XA 2F9WA 1RTIA 3AVHA 3F9KA 3VERA 3S9HA 1QSSA 3M8RA 1TK0A 3LPTA 1IBMK 1VSFA 4DTJA 3M8PA 3CM6A 3VQ5A 4DTNA 2O8BA 3KJVA 4QS9A 4KHUA 2FBVA 4CZEA 5CE3A 3OYDA 2P1JA 4LSLA 3I33A 2VCPA 4CVNE 1BA1A 4CF9A 3SCXA 5KGXA 4Z4EA 4ILHA 3K57A 3B6OA 1HJOA 2ZJQL 2PAVA 3EL2A 3WT0A 4W5NA 4X62K 3J80O 2QEXN 5HRPA 4CF2A 4CGFA 4JD2B 4DSJA 3O3FA 3H08A 2OZSA 3PSFA 4K41A 3OYLA 2PBDA 3GL1A 3OYHA 3R6MA 4FM0A 4O5FA 3HYFA 3GDQA 4BRQA 2OPQA 1Q18A 1Z25A 4CZMA 3H45C 4BQZA 2YX6A 4B9MA 4A2BA 3CJ9A 1P90A 1WSEA 4CHYA 4CJEA 4AQYK 2I7PA 4BRGA 4DU1A 3AVCA 3O4NA 2P9IB 3EYZA 1NK6A 1S9EA 1KQSM 1JLGA 3SMSA 4B1VA 3HPHA 4BR5A 3CC7N 3L4IA 3S5TA 3HRGA 5AQNA 4CJKA 1BU6O 1ZBLA 4MFBA 4JRQA 4BROA 1JL1A 3AO3A 4WF9L 4H5VA 2E6MA 1N5YA 1ZXOA 4CHPA 3AAPA 3ALYA 2HBLA 1KLMA 3FFIA 3R8EA 5KPZA 3VEXA 4CJLA 4K8ZA 4AM7A 3SI6A 1S6PA 3ITHA 3LDLA 3MN5A 4DFPA 4DR7K 2Z1GA 4EZ6A 3A5LC 2YHYA 3HM9A 3VA3A 3RMCA 2DFFA 3MK6A 1JL2A 2VQFK 3CYMA 1QQCA 1KXPA 3MEGA 4CZKA 2OPPA 4JHDA 3HVTA 4CJ4A 1QQOA 5J2QA 4LH4A 3LWLA 2A5XA 3WXLA 5C15A 3SK3A 1VQ7N 1QZ6A 3ATUA 1ILYA 3KK2A 4FOEA 5AQOA 2H3GX 4OPKA 3CCJN 4CJ3A 2VG6A 4E7LA 5JLFA 2X74A 4DTUA 3PX0A 3TWHA 2HVIA 3CJ7A 4RW8A 3SUQA 5FLXO 5BN9A 2GWKA 4JKBA 4HCBA 3FLCO 1K9MO 3TTDA 1TK5A 2IVNA 3RSEB 2RKIA 4JKFA 1MDUB 3AVGA 1BL3A 3M8QA 2Y1JA 1NK5A 1T03A 4GV3A 1EP4A 4DV6K 4AHUA 3CF5L 4KTWA 1N32K 4H8KA 4IOAL 1VHXA 4JI8K 4FJXA 1HLUA 1BIUA 3ZSYA 4JKGB 3OYCA 4HUFA 2HHSA 1T7PA 3WNHA 3K59A 2P9UB 1RT5A 5LY3A 4H0YB 5DMRA 1HMVA 2QWPA 2YI1A 1RFQA 3IFRA 4Z4HA 2GUPA 3IG1A 4GVEA 5ADXA 3QBWA 1Z05A 1Y97A 4E72A 2EWSA 5C12A 3ID6A 1TVRA 1YHQN 3VQ8A 4CHOA 1XI1A 2J4RA 3W3DA 4O0JA 4JI2K 2HSTA 3VF4A 2QWOA 5ELZA 1R0AA 3A5MC 4IFEA 1QQMA 4C8OA 1SZ2A 3PX4A 4AM6A 1U04A 4PKGA 1S1XA 4ISGA 3HP6A 3M8SA 1NWKA 3OYGA 4FCYA 2NRWA 4CGHA 2F7TA 3SPZA 3OS0A 2IGIA 2IIRA 2E1YA 3OYMA 4CJVA 2NNWA 1NJIO 1WSIA 2A40A 3EO3A 3MCPA 3I8DA 4CEZA 5AFUA 5EVZA 2UXCK 1ZC6A 5BR8K 4LF4K 2P5OA 1SL2A 3O3GA 2VG7A 3EZWA 3J7ZO 4OJRA 1C1BA 4BGAA 1E4GT 4H0VB 4BVPA 2ASMA 1N34K 1B9DA 1S9GA 4FWLA 2F9TA 1G15A 2YHXA 4BGBA 3V9ZA 3WEEA 5C24A 4B8AB 1A5XA 5FRNA 3H3NO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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