1TYQA

Crystal structure of arp2/3 complex with bound atp and calcium
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
417
structure length
399
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVMS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of actin-related protein 2/3 complex with bound ATP or ADP
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 126
structure length 399
sequence length 417
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1tyqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tyqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tyqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1tyqA04
4XEIA 4CBUA 1NMDA 1SQKA 3VF4A 1JCGA 3FZKA 3VEYA 4H0YB 1BO5O 4JHDB 4AM7A 3U8XA 5KQDA 2FSJA 5EY4A 5EXWA 1DEJA 3DXKA 3H3NO 1T44A 4K41A 3L4IA 4WQ5A 5AR0A 1QQOA 2GUPA 2YI1A 1WOQA 2CGJA 3O4WA 4NO7A 2CH5A 3BF1A 1KAZA 3FZLA 3GOIA 5FPDA 4PKIA 3O8MA 4DHYA 1GLJO 4BRFA 2P9LB 1HKBA 5AQNA 2D0OA 2E1ZA 4IO8A 1C0GA 5E84A 2WUSA 3TU5A 4BRCA 3SMSA 3VF2A 2AA4A 1GLDG 2V7ZA 4BC2A 2AP1A 4BRNA 5CE3A 4FWMA 2P9KA 3ATVA 4C23A 3AAPA 4B1ZA 3ULEA 4KBOA 5BN9A 4XH1A 1GLAG 4BRQA 5AQZA 4B1XB 2GWKA 3CHWA 3CIPA 2QWPA 3GE1A 4JD2A 5LJWA 3CETA 4HTLA 3A8YA 4MO4A 5FPEA 3QBWA 2I7NA 5AQJA 1S22A 3VESA 3ZETB 1BDGA 4CZEA 3FGUA 3QB0A 4QS9A 4RWTA 3O6WA 3I8BA 1IJJA 2FLOA 3MDQA 3L0QA 2UYTA 5TKYA 3KVGA 5LJVA 1NM1A 3WQTA 2FF6A 3J8AA 2NZTA 3HSCA 4O8KA 2YJFA 3CJAA 3GL1A 3ATUA 2ASOA 3CJ9A 4K43A 5AQRA 1QZ6A 3MCPA 2ASPA 4BG9A 2FXUA 2YHYA 4IZ9A 1MDUB 2FSKA 3IDHA 3ZEUB 1Q18A 4CZHA 3WQUA 3SMPA 2A3ZA 1Z05A 3I33A 3VGMA 2GEMA 2PBDA 3R8EA 1NGIA 4BROA 1GLBG 4AM6A 5F1XA 1IG8A 4FWOA 3DWLA 5AFUA 2P9SB 1NGBA 1T6CA 2BTFA 3VGLA 2E8AA 4H03B 1D4XA 3CQXA 2Q0UA 3U4LA 3HZ6A 3O1WA 4HWIA 3WXIA 3GDQA 3OHRA 3H45C 4CZMA 4A62A 3KZBA 2P9PA 5AFUH 5KPZA 2I7PA 3RSEA 4BR9A 1U2VB 2Q0RA 2QWLA 4FWSA 4XH5A 3VETA 5BN8A 4FO0A 1NGFA 2E2OA 3L6QA 3A5NC 3GG4A 4Z94A 3EZWA 4GNIA 1TYQB 5BREA 1RDWX 1NBWA 4FWKA 2P9NB 4BVOA 1MA9B 3VEWA 2E2QA 4FPAA 4ISFA 3VF6A 3WEEB 2QWQA 4JHDA 3WT0A 4CD3A 3LDNA 1Z6RA 1KAXA 2W40A 3FZHA 3CJ1A 5AQLA 4BR7A 4RTFD 4YDUC 4FL9A 3D2FB 2Q1NA 3W0LA 5AQIA 3VPZA 3G25A 2P9LA 3FZMA 4BRAA 4B1WB 1S3XA 5BRDA 5AQPA 1NGEA 2IIRA 1JCEA 2NLXA 1XUPO 2E20A 1Y64A 3LDQA 2QW9A 4BR0A 1NGCA 4FWPA 4IJNA 4CZJA 3B8AX 4BGBA 5AQTA 3IMXA 5AQOA 4WQ5C 2W41A 3BUZB 3M3ZA 1GLLO 3P4IA 2OANA 4CJ7A 2Q31A 2E1YA 3R6MA 2QWNA 3VERA 4M7XA 4BG8A 5AQQA 1K8KB 5AQMA 3A5OC 4IXCA 4F9OA 5AQXA 1ATRA 5BPLA 4QS8A 3U9DA 2GWJA 2V51B 4BR2A 2QXLA 1EQYA 4CZFA 2VYPA 3JS6A 2QWRA 1DKGD 2ZGYA 1LCUA 3DXMB 4B1YB 1HUXA 4H5VA 4FOIA 4EHUA 4M63C 2A41A 3FZFA 3MN6A 4EFHA 3CJBA 5AQYA 1QZ5A 3H3OB 5AQVA 4CBWA 3ZEUA 1YVNA 5AQHA 1HPMA 3O5BA 3EO3A 4ISEA 3CERA 3MN7A 1GLCG 2Q2RA 3QMLA 4JNEA 4B1UB 2P9IB 1SAZA 1U6ZA 3S41A 2P9SA 5AZIB 3QFPA 4PL8A 1T6DA 3ENHA 1NGDA 4BRMA 1JCFA 4WQ4A 4FWLA 1BUPA 5FPNA 3UKRA 3LM9A 4IWVA 5JLHA 5ELZA 4FOEA 4CZLA 5AQKA 3D2EB 1U2VA 3R9PA 1E4FT 1V4TA 3H6EA 4B9QA 5AQSA 4JN4A 2H3GX 3HBTA 4BR4A 2KHOA 4BR5A 5KQ8A 2QWOA 4H0PA 3CJCA 1TYQA 3KHYA 2P9NA 5EX5A 3WEEA 3ENOA 4CZIA 2E88A 2ZF5O 1J6ZA 3AARA 2V7YA 3ZX0A 3VENA 4BGAA 2D4WA 3QDKA 3WXJA 2ASMA 4O5FA 1TUUA 1XC3A 4Y0WA 2A40A 3M1FA 2HF4A 3D2FA 1HJOA 3UKUB 1E4GT 3WXLA 5JMVA 3VEXA 3BEXA 3EKUA 4RCHA 2ITMA 3FE1A 4PL7A 3WXKA 2P9UB 4BRLA 3BF3A 1CZAN 2F9WA 2YHXA 4K42A 3VEOA 2CH6A 2P9PB 3HI0A 3C7NB 3DJCA 3FFKB 3LL3A 5AZJB 1BA1A 5F2RA 1NWKA 4EAHD 4BREA 2ZGZA 4M7YA 3VEZA 3UB5A 3EKSA 3CQYA 3QICA 2IVOA 1NLVA 1NGAA 1YAGA 1RGIA 4FPBA 4I6MB 3AY9A 3ZX3A 1K8KA 5LY3A 1BWFO 4DQ8A 5BR9A 4XH4A 3HTVA 3ZX2A 3VOVA 3VGKA 4E1JA 1TUYA 3ID8A 1NGJA 1QQNA 3DAWA 3EL2A 3ZETA 1C0FA 4J8FA 2E2NA 4DB3A 3DXMA 5E26A 4DCHA 1ZBSA 2QWMA 4CZGA 5BPMA 4FWNA 3W3DA 4MO5A 1HX1A 2HF3A 3BP8A 4BQZA 1BA0A 1QQMA 3GBTA 1P8ZA 2ZWHA 5BRHA 2P9IA 5I9EB 3DXKB 2J4RA 3F9MA 2FF3B 4WYBA 2HOEA 3A5LC 5AQWA 2FSNA 5AZIA 2Q36A 3CJ7A 4EIAA 3IFRA 1MWMA 2QM1A 3LM2A 2IVPA 3LDOA 2CGKA 2YJEA 3SJHA 4CI6A 3O08A 4K25A 3MK6A 3QBXA 4A61A 4QS7A 4CZKA 1YXQA 5JLFA 1WUAA 4BRPA 1BG3A 1BOTO 5JICA 3M6GA 3H1QA 3VEVA 3D2EA 4PKHA 1NGHA 3LDPA 2GELA 5BRFA 4GY2B 3JXUA 1DGKN 4MLHA 2VCPA 5EOYA 5AQFA 2P9KB 3FLCO 1OKJA 3MMVA 3ULEB 4BRHA 5KPTA 2GTDA 4BQLA 2HMPA 3O80A 3C0BA 4JAXA 2Q97A 1GLFO 4H5NA 4NB4A 4BC4A 2NRHA 3A0IX 4JD2B 1HKGA 1ATNA 5ADXA 4ISGA 4CD1A 4H5RA 1ZC6A 3MN5A 4WQ4C 4BRDA 1ESVA 1NGGA 4BC3A 1GLEG 3H1VX 4EHTA 3EN9A 3QFUA 1QHAA 2E2PA 4A2BA 1G99A 1KAYA 4PKGA 1ATSA 5EVZA 4H5WA 4BRIA 4H0VB 4BRGA 4H0XB 4H5TA 1HLUA 4MLEA 3UKUA 5ADXH 5FPMA 1X3MA 3MN9A 2BUPA 1H1VA 2YCHA 5B8HA 1V4SA 3UE5A 4IJAA 2D1KA 1KXPA 1R59O 2IVNA 4BRKA 2P9UA 4BVPA 3UKRB 3WUHA 1BU6O 5KPRA 3SK3A 1XQSC 5BPNA 1LOTB 2YHWA 3U9ZA 4CBXA 4BC5A 3C7NA 2D0PA 5AZJA 4H0OA 1X9JA 2A6AA 5AQGA 3IUCA 2A42A 2A5XA 3O1BA 2EWSA 4FSVA 4I6MA 3HM8A 2V52B 4B1VA 3H46O 1YUWA 2DPNA 1RFQA 4LC9B 3AAQA 2VWBA 1HKCA 1ZXOA 2PAVA 4YDUA 3FR0A 1SZ2A 4FWQA 5AQUA 3D7EO 4H0TB 3RSEB 4FWRA 3A5MC 5F0XA 3CI5A 1MWKA 2F9TA 1X3NA 3SLCA 3TPQA 4A2AA 3LDLA 4L3QA 2CGLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XEIA 1S1UA 5DMRA 2QK9A 3BDPA 3VEYA 4LF7K 1WBDA 4NCAA 3OYIA 4K41A 3MECA 2WFBA 4WQ5A 3SUOA 1EO1A 2FBTA 4AQYK 2O8DB 1B9FA 1XHXA 3O4WA 4NO7A 4W5RA 5FLXO 1FKPA 3BF1A 1KAZA 3G0ZA 4DV1K 3DLHA 3AVIA 4PKIA 3O8MA 1IKYA 4BRFA 3SAGA 2UXDK 3AA3A 1WNSA 4DLGA 2FBXA 3O4QA 5AQNA 3SZ2A 3O9UA 4X62K 4NLCA 5DK5A 1I3AA 3KWGA 1C0GA 1JJ2M 4KH6A 3VA3A 3SMSA 1RDUA 2AA4A 1GLDG 1VRUA 3MAQA 2JLEA 1DTQA 3TSQA 1D9DA 3SQ2A 4CJUA 1N32K 5I42A 2P9KA 1C0MA 1RDBA 5J2PA 1IBLK 3HRGA 3C6HA 3K5MA 4BRQA 4FK2A 5AQZA 4CIFA 3GE1A 4K0KK 4CEQA 1VQON 3C6UA 1SKWA 2I7NA 4FJGA 3ZETB 3VQCA 1BDGA 4CERA 3QB0A 4CF8A 4RWTA 1Q9XA 4HCBA 3OYLA 4YOXA 1GOBA 5GAHP 4DU3A 3QO9A 1RDDA 3M8SA 4K8XA 1RILA 3J8AA 2FF6A 3HSCA 4O8KA 4FJHA 1N8RO 3AVLA 4YOWA 3CJ9A 4CJRA 1C1AA 1QZ6A 4DQRA 4CK1A 3NMUA 4AILC 3NF7A 4ZHRA 4IZ9A 1MDUB 2FSKA 2HHWA 3IDHA 3WQUA 1Z05A 1NK6A 4DSLA 3R8EA 1TKZA 5KI6A 1NGBA 3DI6A 4JKCA 4JI0K 3CQXA 4CJLA 4DTNA 3U4LA 4OJRA 3VQBA 3U3GA 3WXIA 4CJFA 3OHRA 5CZ1A 4CJ5A 5AFUH 1HJRA 1Q8IA 3D6RA 2RPIA 3RSEA 4CCHA 1U2VB 2QWLA 2VWJA 4XH5A 1SKSA 4DR2K 1NGFA 4B3OA 2E2OA 3ZT1A 2NRXA 1ITGA 4HHTA 3KK7A 1MA9B 3VF6A 4FW2A 3ZYYX 2O8DA 4CK2A 5AQLA 1HQUA 4G1QA 3EY1A 4C8MA 2ITGA 4RW8A 5AQIA 2RF2A 4KTZA 4IOAL 2YKNA 1HYSA 1IO2A 4FJ8A 2PY5A 2X6NA 3QINA 1T3VA 5AQPA 4CHPA 1NGEA 4E7IA 1KVCA 4CJVA 2E20A 4DF4A 3SQ4A 4BGBA 5M1QA 4DKWA 3RMCA 2W41A 2VWKA 3ZT0A 3TTFA 4CJ7A 2Q31A 2QWNA 3VERA 4Z4IA 3PSFA 3H08A 3K9KA 1XHZA 2HHHK 4A57A 3TTCA 3AO5A 2HHSA 2V51B 1JLEA 2QXLA 3LPTA 4F8RA 2VYPA 4YFUA 2QWRA 1DKGD 3P1GA 3OYAA 1T05A 1J5EK 3ZSQA 1VSFA 1HUXA 1YJWN 1XWLA 5DM6L 5AQYA 4CBWA 1L5UA 4B3MK 3THYB 4F4KA 3CC4N 2O8CA 5JVHL 4JNEA 3K57A 4IDHA 3C65A 3O9SA 5FRMA 2XRIA 1C0UA 4CECA 1NGDA 1HYVA 4WQ4A 4CJSA 1BUPA 3LM9A 1JLCA 1BI4B 5D3GA 4CEDA 3QETA 4E72A 4C8OA 5ELZA 1LWCA 3T1AA 5CY4A 4CZLA 1L3SA 2JGUA 1RBVA 4DWIA 1U2VA 1JL1A 3R9PA 3H6EA 5FRNA 2ATQA 5CYMA 3HBTA 4BR4A 2KHOA 1T03A 1C6VA 4H0PA 2NRRA 3CJCA 4NLBA 2B4JA 5J2MA 3ENOA 3TI0A 2Z1JA 3VENA 4BGAA 1LW0A 3QDKA 3DLKA 2ASMA 4O5FA 2XO7A 4OGCA 2A1RA 4BE0A 4GV9A 4AHRA 4CJEA 3LP3A 4HVJA 2VGNA 3UKUB 3L8BA 3PUFA 1FW6A 3DLLL 4M3XA 4UQGA 5HRSA 4LF8K 1IKVA 3FE1A 4WF9L 4DV0K 1NJZA 3WXKA 3A2FA 2P9UB 1NOZA 3NAEA 3EZ5A 4FLUA 2P9PB 5AZJB 2DFHA 5F2RA 1NWKA 5KGWA 3J7YP 4WFAL 1X9WA 3EKSA 3CQYA 3E1YA 3OYMA 4E0DA 3QICA 1R0AA 1NGAA 1YAGA 3AGRA 3AY9A 2GUIA 3OYDA 3ZSWA 5LY3A 1T7PA 3CD6N 3J81O 4NCGA 3NCIA 1JL2A 1YI2N 1TUYA 1QQNA 3AVCA 4PA1A 4J8FA 2E2NA 5E26A 3ZSVA 4DCHA 1ZBSA 4W5OA 1HPZA 2JWKA 5BPMA 3LAMA 1CXUA 4FWNA 1LV5A 1QQMA 1KVBA 2KFNA 4CJTA 2HOEA 4EIAA 2QM1A 3ITHA 4K25A 3QBXA 3KLHA 4A61A 1Q7YO 2G8VA 4CZKA 2QEXN 1BI4A 3KK3A 4DTRA 4N56A 5JICA 3AA5X 4WCEL 4DR7K 3NGIA 2QKBA 3VEVA 4DR1K 3SUPA 4DS5A 3K5LA 1O1WA 4RW7A 4GY2B 4X66K 5AQFA 5EOYA 4CGDA 3PIPL 3ULEB 5KPTA 4JKBA 4BQLA 3NDKA 3PSIA 4I2QA 4FLWA 4IKFA 1HNWK 4LD0A 1W9HA 5HP1A 1ATNA 3LAKA 4DTOA 1ZC6A 3ZT4A 1D8YA 1VQ5N 3O9QA 3EN9A 4DTXA 2E2PA 4A2BA 1KAYA 3OVNA 3AA4A 3TARA 1MU2A 4BRIA 3HVTA 4H0XB 3NF6A 4MLEA 3UKUA 1HLUA 1SUQA 4ILGB 5M1NA 2E5LK 2YCHA 3T69A 4DUZK 2QI2A 1YT3A 3UE5A 1TKTA 3LPUA 2IC3A 1S6QA 2P9UA 5E41A 3P38A 3HOSA 4BC5A 2BGGA 1WSHA 5AZJA 3M5RA 3D0PA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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