1TYQB

Crystal structure of arp2/3 complex with bound atp and calcium
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
VLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of actin-related protein 2/3 complex with bound ATP or ADP
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 57
structure length 208
sequence length 208
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1tyqB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1tyqB02
3WXLA 4BRAA 3CHWA 1NGFA 4BREA 4BRGA 3GG4A 1WUAA 3A0IX 3H45C 3CJBA 3AAPA 3CJAA 2VYPA 2YJFA 3ZX0A 3WQUA 4AM7A 3W3DA 4EAHD 5KPZA 5AR0A 5BN9A 3VEXA 1U2VB 2W40A 3U9ZA 2AA4A 1U6ZA 4B9QA 4AM6A 2FSKA 1GLLO 3VF2A 3VETA 4BC3A 4CZIA 1Z6RA 2P9PB 4PKGA 1ATSA 1RFQA 2P9SB 1JCGA 4CD1A 5ADXA 4ISEA 3VERA 1HKCA 2P9PA 2A3ZA 3ID8A 4RCHA 3LM2A 5ADXH 2P9UB 4BR4A 1BA1A 1K8KA 2J4RA 3ENHA 3VPZA 4CZMA 5BRFA 3IMXA 3ZETB 4JN4A 1RDWX 5ELZA 4K25A 4DB3A 1X9JA 2P9UA 4WQ4A 3DXMB 1WOQA 3AARA 4CZKA 4BRKA 3FZFA 3ZETA 4BRMA 3I8BA 3DAWA 2HMPA 3GDQA 3VEVA 3CJCA 3B8AX 2QM1A 5I9EB 3DXMA 2VWBA 3LDNA 1D4XA 5FPDA 3MMVA 3EZWA 2FSJA 4FL9A 3L0QA 4BRLA 2P9LA 2D4WA 4WQ4C 1GLDG 4HWIA 2E1ZA 5AQVA 2ZGYA 2YI1A 5AQNA 5KPRA 2GWJA 1EQYA 3D2EB 4L3QA 3HBTA 3EKUA 2FSNA 1Y64A 1KAYA 4IJAA 1XQSC 4CZFA 3QFPA 2D1KA 3J8AA 5FPMA 4H5VA 3LDLA 3O80A 3D2EA 1YXQA 3QBXA 2V7YA 4CBWA 2I7NA 3P4IA 4BG9A 1NGGA 4H0XB 3ZX2A 3WT0A 4CZGA 4CBXA 1QZ6A 1NM1A 2E2PA 1G99A 1YAGA 2E20A 1HX1A 5AQQA 3M1FA 4B1YB 2QWLA 3MN7A 4BR0A 1YUWA 3MN6A 3EL2A 3GBTA 1QQOA 4BRFA 5AQPA 2NLXA 5BRHA 3JS6A 4MLEA 5JICA 4YDUA 4FPBA 5F2RA 2IVOA 2I7PA 2A42A 5TKYA 2FXUA 3HTVA 3FZMA 5KPTA 4Z94A 1ATRA 2UYTA 1T6CA 3CJ1A 1KAXA 3G25A 4A2AA 3WEEB 4JAXA 5AQZA 1BG3A 1X3MA 3FR0A 3M3ZA 4YDUC 1GLJO 5EOYA 3WEEA 4BRQA 4BRIA 5AQIA 2HF4A 2A5XA 4MO5A 4EIAA 2F9WA 2YCHA 3EO3A 4PKIA 2IIRA 2ZGZA 4H0TB 3BF1A 4B1UB 3IUCA 5KQ8A 1BU6O 4QS9A 1LOTB 1X3NA 4I6MB 4CZHA 3LL3A 5AQXA 1MWKA 4H5RA 2E1YA 4XEIA 4IWVA 4I6MA 3VF4A 3LM9A 3D2FB 1XC3A 3SK3A 1QQNA 5AQHA 4QS7A 4FWLA 4CI6A 3GE1A 1U2VA 4JHDB 3D2FA 3H1QA 4M7XA 4MO4A 1GLCG 1NWKA 3MK6A 2HF3A 2CGKA 3ATVA 2QWRA 4BR2A 4K43A 3VOVA 1ATNA 4H5NA 4BC2A 3SMPA 2ITMA 5AZJB 1MDUB 1GLBG 1SAZA 4EHUA 1TUUA 2P9SA 3CQXA 3AY9A 5AZJA 5BPMA 2OANA 5KQDA 3OHRA 5AZIB 1KAZA 4BVOA 4ISFA 3U9DA 2CH5A 3DXKB 3LDOA 3ZX3A 3MDQA 5BRDA 3HSCA 4IZ9A 3FZLA 1ZC6A 4BROA 4J8FA 3UKRB 3H1VX 1SQKA 3DWLA 4LC9B 1DGKN 4BGAA 2AP1A 4CJ7A 5F1XA 2E2OA 3M6GA 3WXJA 1GLFO 3H6EA 1RGIA 3VESA 3UKRA 1LCUA 2ZF5O 1NMDA 3WUHA 4BR9A 4E1JA 3S41A 4EHTA 4FO0A 4BRHA 4CZEA 1E4GT 3FZHA 2A6AA 4BRPA 3L4IA 1CZAN 5EXWA 1ZXOA 4QS8A 4K41A 3WQTA 2YHXA 2QWNA 4CD3A 3C7NB 3CETA 3LDPA 4IXCA 5AQYA 4H0YB 1YVNA 4A61A 1IJJA 3C7NA 3O6WA 2YHWA 3C0BA 4A2BA 1NBWA 1NGCA 5E84A 4GY2B 1GLEG 1NGIA 5E26A 3A5NC 2BTFA 4M7YA 4H0VB 4C23A 1GLAG 5LY3A 1HKGA 3CQYA 3CERA 4B1ZA 3BP8A 3HI0A 3IFRA 5EY4A 3R8EA 1JCFA 3CI5A 3KVGA 1S3XA 2Q0UA 2QW9A 5JMVA 4NB4A 3VENA 3VEWA 3R6MA 4FWPA 4FSVA 3A5MC 3WXKA 1BO5O 3FGUA 3GOIA 2P9NB 2QWOA 1Z05A 3TU5A 3ZEUB 1MWMA 4BRNA 1ESVA 5EX5A 4B1XB 1V4TA 4BG8A 4O5FA 3H46O 4FPAA 5LJVA 1Q18A 5AQWA 1V4SA 1BDGA 1JCEA 2FF3B 2H3GX 2P9NA 3U8XA 3VGKA 3ZEUA 2GELA 3UB5A 3BF3A 2P9IB 2BUPA 2GTDA 1BOTO 4F9OA 3O1WA 3VGLA 4XH4A 3CJ7A 3SMSA 4BVPA 4JD2B 2P9IA 2QWQA 3O5BA 3AAQA 2P9KB 4H0PA 3JXUA 5AQKA 2ZWHA 4PL7A 3VEYA 3CJ9A 5JLFA 2VCPA 4BGBA 2P9KA 4DCHA 3F9MA 3CIPA 5AQRA 4BR7A 4B1WB 1HUXA 2NRHA 2Q2RA 3VEOA 1TYQB 4BR5A 2ASPA 2YHYA 4IO8A 3QMLA 1NGBA 2PBDA 5BN8A 1DKGD 3WXIA 1S22A 3EN9A 3RSEB 1TYQA 3A8YA 1HKBA 4H0OA 2A40A 4FOEA 3VF6A 4O8KA 4CZLA 2FF6A 3L6QA 3O1BA 3RSEA 3HM8A 3EKSA 3QB0A 4JHDA 4FWKA 2Q1NA 4MLHA 4WYBA 1NGJA 3A5LC 5AQLA 2W41A 3FE1A 3W0LA 1TUYA 4IJNA 4M63C 3DJCA 5AQTA 4GNIA 4KBOA 3H3NO 3UE5A 1NGAA 3O08A 2KHOA 1R59O 1P8ZA 2ASOA 4K42A 4H5WA 2WUSA 4JNEA 3HZ6A 5AQGA 5AZIA 1C0GA 5BR9A 3FFKB 1XUPO 4WQ5A 1K8KB 1KXPA 3DXKA 2V7ZA 3GL1A 4BRDA 1NGEA 4FWSA 4BQZA 2GUPA 1NLVA 1IG8A 3BUZB 3KHYA 4Y0WA 2PAVA 4XH1A 4DQ8A 4CZJA 2D0PA 3KZBA 2QWPA 2CGLA 3ATUA 4NO7A 2A41A 4XH5A 2YJEA 4ISGA 4WQ5C 2FLOA 5AQMA 1QQMA 1T44A 5EVZA 1C0FA 2F9TA 1HPMA 1NGHA 1ZBSA 2P9LB 3MN5A 2NZTA 4BRCA 3IDHA 3MCPA 1HJOA 5AQUA 5FPEA 1QHAA 4PKHA 3TPQA 2ASMA 2Q31A 2CGJA 4RTFD 5AQOA 3O8MA 2HOEA 5FPNA 3QDKA 4FWMA 5LJWA 2E8AA 3LDQA 1SZ2A 4BQLA 2E2QA 4BC5A 2GEMA 3SLCA 3I33A 3H3OB 3QICA 5AQSA 1J6ZA 5JLHA 2V52B 3R9PA 5B8HA 3VGMA 4FWRA 3QFUA 1QZ5A 2CH6A 4CBUA 3MN9A 2E2NA 3O4WA 4EFHA 2IVPA 2QWMA 2GWKA 4RWTA 1T6DA 3D7EO 1E4FT 5BPLA 1BWFO 1H1VA 3U4LA 4FWNA 1HLUA 4FWOA 5F0XA 5BREA 4H03B 4BC4A 4FWQA 2Q0RA 3ULEB 1BA0A 1MA9B 3VEZA 4H5TA 4A62A 2QXLA 4FOIA 3ULEA 3FZKA 2E88A 2Q36A 5CE3A 3A5OC 5BPNA 3SJHA 2DPNA 3ENOA 3UKUB 3BEXA 1DEJA 4JD2A 1BUPA 4B1VA 5AQFA 3FLCO 4PL8A 3UKUA 2D0OA 1NGDA 5AQJA 5AFUA 4HTLA 5AFUH 2EWSA 4DHYA 2Q97A 2IVNA 1OKJA 2V51B 3QBWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OH5A 1WBBA 1SKRA 2Q3SA 1M1KO 3V9XA 3DLHA 2OTJN 2NRVA 1S1VA 2YJFA 4GKJK 3O9QA 3V4IA 1IBLK 5AR0A 5CZ1A 5BN9A 2B5JA 3VEXA 3AVGA 3OYBA 3QERA 3EY1A 4YOTA 2P9PB 3OBYA 4DR2K 3TAQA 3CC2N 3TAEA 1JCGA 4CD1A 3VERA 1HKCA 4BDZA 4RCHA 5ADXH 2P9UB 4BR4A 3OS1A 4DMNA 5DM7L 3VPZA 5BRFA 1S6QA 2HBKA 4DTJA 3CPWM 3DXMB 3MWTA 1WOQA 3LZIA 3KIOA 4ZHRA 3FZFA 2HMPA 3VEVA 3B8AX 4KO0A 4NXNK 4CFCA 2VWBA 3CCMN 1RT3A 4GW6A 1D4XA 2RF2A 3AO1A 4KFBA 3MMVA 1HNIA 4IFEA 1JL2A 3I55N 4BRLA 3DRSA 2P9LA 4WQ4C 2FBTA 4CGIA 1N33K 3SNNA 3SQ0A 4CHZA 1B92A 1IG9A 3MEGA 4PWDA 5FRNA 3AVBA 3D2EB 4L3QA 3HBTA 1HJRA 3QFPA 5M1NA 3LDLA 2V7YA 4LH4A 2BH1A 2UXCK 1UOCA 4M3UA 4CIGA 1HR0K 3HP6A 4CFAA 5C10A 1ZBUA 3THWA 2O8FB 2NUBA 3ZX2A 3WT0A 2EX3A 4CIFA 4CZGA 2KZMA 3QLHA 3CCQN 2QI2A 1G99A 5C42A 5AQQA 3MN7A 3K2PA 3EL2A 4BRFA 1QQOA 5AQPA 5BRHA 3PX4A 2KKZA 2A42A 5TKYA 3HTVA 4Z4EA 2BE2A 1ATRA 4IEEA 3HVRA 2UYTA 1T6CA 2XY8A 4A2AA 4E7KA 2LSNA 3WNHA 3CCLN 4DLEA 4YDUC 5EOYA 3WEEA 1WSEA 5AQIA 2HF4A 1W7AA 4DSLA 4B3RK 4CF1A 1LW0A 4E1NA 3HT3A 5J2QA 4B9SA 2ZGZA 4B1UB 5KQ8A 3MECA 4CFDA 2IOCA 1NG9A 3O9RA 3O9TA 4JYAK 5AQXA 1W0HA 3OJSA 3RR8A 3SQ1A 3ID6A 2HBJA 4IWVA 1U48A 3CM5A 4I6MA 3SBTA 2NRXA 3D2FB 1XC9A 2HVHA 5AQHA 4QS7A 4CJUA 3L2WA 4AHRA 4JHDB 1REVA 3QIOA 1WSGA 1XMOK 2HF3A 2QWRA 4BR2A 4BC2A 1NOZA 5AZJB 1MDUB 1T8EA 4YOYA 2F8SA 3KJVA 4OGEA 4ELVA 3AVLA 1U04A 3V1OA 1TK5A 5AZIB 4BVOA 4OLAA 3B6PA 3J81O 4ISFA 4DR7K 1SS6A 4IG0A 3ZX3A 3MDQA 4IZ9A 1WSJA 3E01A 4ZTJA 4OX9K 2AP1A 2FBXA 1WAFA 2E2OA 4J2DA 3G0ZA 3H6EA 1WN7A 3OYKA 3VESA 4BR9A 1NMDA 4EHTA 3NF8A 3S41A 1O13A 1E4GT 4IOAL 2QKKA 3TAGA 4DFJA 4CJSA 2O4GA 3L4IA 4A59A 5EXWA 1HNVA 2VGMA 4JLHA 4FJHA 2QWNA 3J80O 5AQYA 1VQKN 3O4NA 2XY5A 4N41A 3I0RA 3O6WA 3BGRA 4YOVA 4GY2B 1BCOA 4YOUA 3KKSA 2BTFA 3NH2A 3U3YA 4H0VB 4C23A 5LY3A 1HKGA 2P5GA 2DFHA 3CERA 1FKOA 4H8KA 1LW2A 4I7FA 3HI0A 2IC3A 5EY4A 1JCFA 1QVGM 3CI5A 2Q0UA 5JMVA 4F8RA 3OJUA 4I9QA 3R6MA 1W2BM 3OYHA 3FGUA 1D9DA 4E7LA 2P9NB 1Z05A 1YI2N 5C12A 1ESVA 4OO1J 3C6UA 5AQWA 4OPJA 1BDGA 4KHYA 2FF3B 3ZEUA 1HQEA 3L2VA 3EEQA 3ISNC 3OYAA 3BF3A 1S1XA 4LFCK 4FYDA 1NKEA 2GTDA 3RRGA 4DSKA 1HNZK 4XH4A 4JKGB 3P38A 4DSJA 2QWQA 3AAQA 5C15A 5LMNK 4H0PA 4K8XA 1LWEA 2O8CA 4W5OA 3CJ9A 4YY3K 4BGBA 3O3GA 5KRTA 3KLIA 4DCHA 1L3TA 1EO1A 1FXXA 5AQRA 3CC4N 1YJNN 4M3WA 1LAWA 2E5LK 4YOWA 1FW6A 3VEOA 4FZYA 4BR5A 4DUYK 3QEPA 4IO8A 5CHIA 1NGBA 2ZJPL 4DFKA 1IV0A 2F7TA 2PBDA 4RW7A 1VQ4N 2YNGA 1S22A 3EE9A 3S3MA 1YITN 4X64K 2NRTA 3ITHA 2HHUA 2G8VA 4CZLA 2RKIA 3NAEA 1KVAA 1J53A 3L6QA 4JI0K 1YHQN 3CMEN 5J2MA 3RMAA 3J7YP 4KTQA 4JHDA 4WF9L 4FWKA 2DY4A 3TAMA 4MLHA 3VQAA 4M63C 1KRPA 4GNIA 4KBOA 4AHVA 3H3NO 3UE5A 1NGAA 1R59O 4DV6K 4CGJA 3OYJA 1NOYA 3HOTA 3VTHA 3G10A 4JNEA 5KGWA 3ZT0A 3ZSVA 3DLRA 5AZIA 3MAQA 3V9ZA 1C0UA 4KKOA 4B3MK 1KXPA 3VQ4A 2X6NA 3CPEA 3KLFA 3P83D 4NCAA 3M8QA 3KWIA 5C0YA 1YVUA 3VQCA 2PAVA 3PO5A 4DQ8A 4CZJA 3AO5A 3Q7CA 2FLOA 2DFFA 1QQMA 3SJJA 3E66A 5EVZA 4JK7A 2F9TA 4K0KK 4PQUA 2NZTA 1Q81O 3ZCMA 3TI0A 4CJTA 4V19S 3MCPA 4BE7B 5AQUA 4CJ3A 1QHAA 4PKHA 3TPQA 2ASMA 4BECA 2YV0X 3AGRA 1JXBA 3O8MA 2HOEA 4FWMA 5LJWA 1RT2A 3RVCA 4BC5A 3HRGA 1YTAA 1S1WA 1T3VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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