1WUAA

The structure of aplyronine a-actin complex
Total Genus 113

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
367
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Structural protein
publication title Structure basis for antitumor effect of aplyronine a
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 113
structure length 357
sequence length 367
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1wuaA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1wuaA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1wuaA03
4FOIA 5AQXA 5AQOA 1NGIA 3D2EB 4H0PA 4Y0WA 4CBXA 3I8BA 4BC4A 2NRHA 1BOTO 1NGEA 3QB0A 3A5MC 5JMVA 2FF3B 1MWMA 4CZGA 3CJAA 2FSKA 2P9IB 3H1VX 4NB4A 2FSJA 1DGKN 2AP1A 1D4XA 4BQZA 4CJ7A 4CZMA 1QZ5A 5AR0A 3LDPA 4M63C 5I9EB 3DAWA 4B1VA 2V7YA 4EIAA 5EOYA 4EHUA 5LJVA 3HBTA 4I6MA 2Q36A 4WQ4C 5KQDA 4L3QA 5KPRA 4LC9B 3MN6A 4H0XB 2QWNA 5AZIA 4WQ4A 1KAZA 4BRIA 1LCUA 3AAPA 4YDUC 5FPMA 4CZLA 2D4WA 5EX5A 2ZF5O 3ATUA 5AQKA 5AQRA 3ZX3A 4A61A 5AQMA 2Q0RA 3ID8A 1HX1A 4M7XA 3VEZA 3O1BA 4IO8A 2E1ZA 3CHWA 4FOEA 3WXLA 4BRAA 5AZIB 1BUPA 2W40A 3O6WA 1MWKA 3IMXA 1K8KA 2ASPA 3BF1A 3FZMA 2A41A 3VEXA 1EQYA 1QQMA 2V52B 3G25A 2Q31A 2QW9A 3A5LC 4AM6A 2FSNA 1TUYA 3HZ6A 3P4IA 4BR9A 1R59O 1ATSA 1K8KB 3A8YA 3LL3A 1NGGA 1QQNA 2Q0UA 4H0TB 2QWRA 4FWNA 2FF6A 3VESA 3H6EA 4K42A 3VETA 3QDKA 3VPZA 3ZX0A 5AQJA 1NGFA 3FGUA 3D7EO 4WQ5C 3C0BA 3AAQA 5AQLA 3EN9A 4RWTA 1JCFA 5F2RA 1T6DA 3VEOA 3MN9A 1Z05A 4DHYA 3RSEA 4JNEA 4RTFD 3SJHA 3W0LA 3CERA 4EHTA 1YVNA 2HMPA 3A5OC 3CJ1A 1BDGA 2W41A 1U2VB 5AQGA 4PKHA 5JICA 4FWQA 4C23A 4CI6A 2D0PA 2E2NA 3SMSA 2E2OA 1NGAA 3HTVA 3ZETA 1RDWX 3O4WA 2HF3A 4BG9A 3QFUA 4MO5A 4J8FA 3VEWA 2YHXA 3MCPA 1TYQA 3UKRB 4B1XB 1Z6RA 3O8MA 1KAXA 2YCHA 3MK6A 1C0FA 3LDNA 4BVPA 3ZETB 2P9KA 1ESVA 1BO5O 5KPTA 3UKUA 4BRFA 5AZJA 4PKIA 2E8AA 3WT0A 1NMDA 1QHAA 1ZBSA 4FWMA 3JXUA 2A42A 2BUPA 5KQ8A 1TYQB 4H5NA 4K43A 1SZ2A 4ISFA 4B9QA 1ATNA 3A5NC 3ENHA 3WXKA 1YAGA 5BPMA 4ISGA 2OANA 5F0XA 1IJJA 4BRNA 3VGLA 4BROA 5BREA 4CBUA 4H5TA 3GOIA 3WQUA 5AQSA 1V4SA 2QWMA 3MN7A 4FPAA 3EZWA 4IXCA 4MLEA 1NGBA 2CH5A 3L0QA 4B1WB 3ULEA 4O8KA 1Y64A 3C7NA 3VF4A 1X3NA 4BR7A 2FXUA 3VGKA 3UE5A 5CE3A 3FZKA 4BR4A 3IDHA 1NGDA 4EAHD 1GLCG 4HWIA 3FZHA 5JLFA 1JCEA 4IZ9A 5AQUA 4FPBA 3H46O 4I6MB 4BRKA 3H3NO 4CD3A 2E1YA 5AQYA 4O5FA 3QFPA 3ULEB 3M1FA 1YUWA 2HOEA 3FR0A 3IFRA 1NGCA 1CZAN 4B1ZA 1Q18A 3MDQA 3FZFA 1LOTB 2VWBA 3BEXA 2CH6A 2ASOA 5AQWA 1RGIA 4FO0A 4CZJA 3R6MA 3VEYA 1BA1A 3F9MA 1MDUB 2QWOA 4FWOA 1X9JA 2GTDA 2NZTA 2P9NA 4M7YA 4CZHA 1DEJA 4BRLA 4BRPA 3HSCA 3W3DA 3BP8A 1HLUA 3CJ7A 4GY2B 1S3XA 3CQYA 1ZC6A 1BU6O 3GG4A 4H03B 4BREA 4EFHA 3FZLA 2UYTA 1ZXOA 1OKJA 2CGJA 3QMLA 2P9NB 3O08A 5BRHA 1J6ZA 1KXPA 4BRMA 3SMPA 4AM7A 2GELA 3LDQA 4F9OA 3DXKA 1JCGA 3L6QA 2H3GX 4H5WA 3WUHA 1GLDG 4DQ8A 4K41A 4KBOA 4A2AA 5ELZA 5BPNA 4DCHA 3HM8A 4CBWA 4BC2A 2ZGYA 4H0OA 3EKUA 2KHOA 5AFUA 5JLHA 4H0VB 3H45C 3LDOA 3ATVA 3VGMA 1XC3A 2QWPA 5EY4A 1ATRA 3GDQA 4BQLA 3CQXA 3WEEA 2Q1NA 5FPDA 4MO4A 1HKCA 4CZFA 3SK3A 2J4RA 4BR5A 1HJOA 4IJAA 3RSEB 2I7NA 4ISEA 3UB5A 5E26A 1HKGA 2QM1A 4CZIA 3U9DA 2E88A 5TKYA 4XH5A 3VF2A 4BR0A 2F9TA 2V7ZA 1QZ6A 3S41A 1E4GT 1T6CA 3WEEB 4GNIA 3M6GA 4BRDA 4BGBA 4FSVA 3ZEUA 4PKGA 2IVPA 2HF4A 5AFUH 4BRQA 4QS9A 2PAVA 3HI0A 3WXJA 3I33A 3U4LA 2IIRA 5BRFA 4JN4A 3J8AA 1E4FT 4BGAA 2ASMA 3ZEUB 2P9KB 3M3ZA 4WYBA 2Q97A 3UKUB 1C0GA 5AZJB 4A62A 2D0OA 1SAZA 2CGKA 4BVOA 3LDLA 4IWVA 3DWLA 1HPMA 3TU5A 2QWLA 1MA9B 4JHDA 1HUXA 5B8HA 1YXQA 4CZEA 3DXMA 3CETA 3WQTA 1GLAG 3O80A 1GLFO 2A3ZA 1V4TA 1U6ZA 3VERA 3KVGA 2FLOA 4DB3A 5AQZA 5BRDA 4BG8A 3LM2A 3KZBA 2E2QA 2P9SA 4JHDB 2F9WA 1GLEG 3QBXA 3ENOA 3DXMB 1XQSC 3L4IA 1BG3A 1S22A 1TUUA 4MLHA 3IUCA 5KPZA 1HKBA 4RCHA 4FL9A 3O5BA 2P9SB 3C7NB 3CJ9A 2V51B 4H0YB 5BN9A 1T44A 4E1JA 3VENA 3FFKB 5AQTA 2WUSA 2YJFA 2DPNA 2P9PA 3ZX2A 2BTFA 2IVOA 1NBWA 4BC3A 3D2FA 1DKGD 4YDUA 2GWJA 5EVZA 5F1XA 3FE1A 3QBWA 2A6AA 3U9ZA 2GUPA 3CJCA 2P9PB 3B8AX 4XH1A 5AQPA 2ZWHA 4QS8A 5FPNA 1G99A 4FWLA 3DJCA 2NLXA 5ADXA 1KAYA 3D2FB 1GLLO 3TPQA 3JS6A 4H5RA 4JD2A 4PL8A 1H1VA 3SLCA 3U8XA 3EO3A 1QQOA 4FWPA 4XH4A 3FLCO 5AQFA 2E20A 3BF3A 1NWKA 3H3OB 4BRGA 3LM9A 4BC5A 2YHWA 5BR9A 1GLJO 2CGLA 3EL2A 5BN8A 3CI5A 5FPEA 3O1WA 4B1UB 4PL7A 2VYPA 4XEIA 5AQIA 4JD2B 3R8EA 1NLVA 2QWQA 1WUAA 3KHYA 3VEVA 2P9UA 1WOQA 2IVNA 4CD1A 3DXKB 4JAXA 3GL1A 5LJWA 2PBDA 2ITMA 3VOVA 2I7PA 3AY9A 5AQHA 1BA0A 5EXWA 4QS7A 1U2VA 4B1YB 5ADXH 4WQ5A 3MMVA 3GBTA 3AARA 2P9UB 5AQQA 4HTLA 4CZKA 3QICA 2Q2RA 1SQKA 4IJNA 2P9LA 4K25A 5AQVA 1P8ZA 5LY3A 2E2PA 3CIPA 4H5VA 3UKRA 1XUPO 2A40A 2EWSA 3OHRA 3WXIA 3MN5A 2GEMA 5AQNA 4BRHA 2P9LB 3A0IX 4NO7A 1X3MA 3GE1A 3H1QA 3BUZB 1NM1A 1NGHA 2A5XA 4FWSA 4FWKA 2YJEA 4Z94A 1BWFO 2VCPA 3D2EA 2D1KA 1RFQA 3R9PA 2YI1A 2QXLA 2YHYA 4BRCA 3EKSA 1IG8A 4A2BA 5E84A 3CJBA 4FWRA 1GLBG 5BPLA 2AA4A 3VF6A 4BR2A 2P9IA 1NGJA 2GWKA 2ZGZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1N5YA 3O4QA 4FOIA 1X9MA 1YIJN 2P51A 1E3MA 3S3OA 1KC8O 4H0PA 4M42A 1OH7A 1HNIA 4CBXA 4DS4A 5C0YA 3NFAA 1BOTO 4AH9A 1J54A 3A5MC 2FF3B 1MWMA 4CGFA 3CJAA 4G9ZA 4HCBA 1NK5A 1IKYA 1DGKN 4JKGA 3E9OA 4W5QA 1TKZA 4K8XA 1D4XA 4BQZA 3KIOA 3NAEA 4M63C 3SCXA 4E0DA 4OX9K 1BIUA 4EHUA 3M8PA 1W2BM 4WQ4C 1HQEA 4L3QA 1BL3A 2YKMA 4LC9B 2QWNA 3I8DA 4KV8A 5AZIA 4Z4HA 4BRIA 2OPQA 3OVNA 4FM0A 5AQKA 3ATUA 3ZX3A 3AVKA 4TSXA 4A61A 2Q0RA 3ID8A 2BGGA 2GUIA 2O8EA 4M7XA 3VEZA 2E1ZA 1NG9A 3WXLA 4JI0K 3LPTA 2QI2A 2ASPA 1I94K 2KZMA 3TTCA 4N5SA 3OYDA 3RMAA 4AM6A 4DTNA 3HJFA 5DM7L 4FVMA 1ATSA 2HNYA 4CEOA 2RN2A 1K8KB 1BCOA 4DTOA 3Q7CA 1ZBFA 1RT6A 1NGGA 3KK1A 2Q0UA 4FWNA 4OLAA 3VETA 3QDKA 4K8ZA 2VG5A 3ZX0A 3MWTA 2UXBK 5AQJA 2C1IA 5J1EA 1RTIA 4CEQA 1VRUA 2FBTA 4CEEA 1JCFA 1VHXA 2HVIA 3MCAB 3SJHA 1S6QA 1YVNA 1VQLN 1BDGA 3CCRN 3C6HA 4FWQA 3N4PA 1WSFA 2HBJA 4BWJA 4AHUA 3AA2A 2E2OA 3ZETA 4BG9A 3OY9A 3VEWA 1S1TA 1EP4A 4B1XB 4V19S 2HHQA 3MK6A 4OLBA 1NK0A 1JLAA 1ESVA 1BO5O 4BRFA 1NK6A 4YFUA 2HHHK 4KAZA 1KRPA 3CFPA 1NMDA 1ZBSA 4FWMA 4B08A 4CIGA 1K9MO 1VQPN 1TYQB 4ISFA 1B92A 4B9QA 1RTHA 3KD5E 3K5OA 2HB5A 4GVMA 3WXKA 4CHQA 4BE2A 2Z1GA 2HSTA 2QXFA 5BPMA 4YOYA 4B9VA 1SV5A 3DI6A 1OH5A 2OANA 3OYCA 5F0XA 3RTVA 3ZSZA 4CHYA 3VQDA 3TAGA 5BREA 4WF9L 2VQFK 1NOZA 4CBUA 1WSIA 4H5TA 2QKKA 3GOIA 2NRXA 4AILC 1VSJA 5AQSA 1RBTA 1V4SA 2CH5A 4IFVA 4O8KA 1Y64A 3VF4A 4I2PA 3UE5A 4B3OA 3FZKA 3IDHA 4EAHD 4KRFA 1WBBA 5JLFA 3CQ8A 5HROA 1SUQA 4FPBA 4JK7A 5HOOA 1C6VA 1NU0A 2DFHA 4CJPA 1ZBIA 1JJ2M 1Q86O 2E1YA 5AQYA 4O5FA 4DSJA 4WFNL 1QE1A 3M1FA 3FR0A 2O8BA 3AO1A 1M1KO 2P5GA 5MLCQ 1HR0K 4B1ZA 3PIPL 4JRQA 3MDQA 1U48A 3HXMA 1CXUA 1ASVA 2CH6A 3TAEA 3DLBA 4KB1A 5AQWA 1RGIA 1KQSM 2YKNA 3TR8A 1NJIO 3W3DA 3BP8A 3GG4A 4LSLA 2OTJN 1QTMA 1SL0A 4IOAL 2O8FA 4CJFA 1RT3A 1ZXOA 3P38A 3MXIA 3TSUA 1RNHA 3O08A 2XY6A 2JGUA 3SQ1A 4BRMA 4BEBA 5IT9O 2GELA 4PA1A 1JXEA 4F9OA 4DV6K 3IKMA 1GLDG 3AVMA 5FROA 3SBGA 4KBOA 1HPZA 1ZYQA 4DCHA 1S1UA 2UUCK 4O55A 1QQCA 4CBWA 2ZGYA 3A2FA 1KFDA 3LAKA 1HMVA 4H0VB 4N47A 3HT3A 3OYLA 5J2PA 4IEEA 1C0TA 1XC3A 3TAMA 2P5OA 3S9HA 2RE2A 4BR5A 1EX4A 4GV9A 4CJ5A 3UB5A 4GV3A 5E26A 4JKHA 1HKGA 4CZIA 4KPYA 2YNFA 1J9AA 3TWHA 2PZSA 1WN7A 1KLNA 4XH5A 2D0BA 5HP1A 1JL1A 1E4GT 5GINA 3WEEB 2XO7A 1Q81O 3M6GA 2XY5A 4FSVA 3VTHA 3ZEUA 1TL1A 4PKGA 2HBLA 2HF4A 3HO1A 1RILA 1L3SA 4WE1A 3V81A 3QIPA 4DV1K 2OCEA 2NRWA 3J8AA 4ILGB 2OTLN 4BGAA 4CF8A 2Q97A 1VQ8N 3NVMA 4A62A 1SAZA 1RT7A 4BVOA 3LDLA 2KQ2A 3DWLA 1HPMA 5B8HA 1YXQA 4JKDA 3DXMA 1C0UA 4OPKA 3VQ8A 1U6ZA 3TTFA 1WLJA 1EWQA 1S6PA 3D45A 3VQPA 1RDAA 3T1HK 1IG9A 3SYZA 3KZBA 1FXXA 1GOAA 2P9SA 3MEGA 4B8AB 4CFCA 4KHWA 2HHUA 3ENOA 3PO4A 1S22A 3NF8A 3LANA 4NYFA 4QAGA 2ZD1A 1HKBA 2VGNA 4ILHA 3MXMA 4RCHA 4FL9A 5J2QA 4H0YB 2W42A 4HTUA 1M90O 3OJUA 3VENA 3WNEA 2BTFA 4CJEA 2YHBA 3OW2M 2VGMA 5JVHL 5EVZA 4DFPA 1NK9A 3FE1A 2QEXN 5GADP 5JVGL 3L2UA 1FKOA 2ZWHA 5FPNA 1G99A 1B9FA 1Q8IA 1VSHA 3HVTA 3C95A 4DLGA 4JD2A 1H1VA 2B6AA 3FFIA 3L2RA 4KHPK 1D5AA 3FLCO 5FRMA 4LSNA 1U04A 4B9LA 1W7AA 4BC5A 2YHWA 5BR9A 1GLJO 4H4OA 3V1OA 1SS6A 2O8FB 4B9MA 1KCFA 4DV3K 3F73A 1JLEA 3CC4N 2WBNA 1WOQA 4JKEA 3LDSA 4DU1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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