1YVNA

The yeast actin val 159 asn mutant complex with human gelsolin segment 1.
Total Genus 114
50100150200250300350020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGNTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF
5010015020025030035035030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (8-12)S9 (103-107)S7 (71-72)TIV1 (13-16)TVIII1 (27-30)S2 (16-21)S3 (29-32)EMPTYS6 (65-68)3H1 (62-64)O1 (32-34)TIV4 (76-79)AH1 (55-61)S4 (35-38)TIV3 (71-74)S11 (150-155)AH2 (79-92)TI1 (92-95)3H2 (98-100)TVIII3 (129-132)S10 (131-136)TII3 (108-111)AH3 (113-126)TI8 (353-356)AH13 (359-365)TI7 (352-355)AH4 (137-145)TI5 (332-335)AH10 (287-295)S12 (160-166)TIV5 (156-159)S14 (176-178)3H3 (172-174)TIV6 (165-168)S13 (169-170)AH9 (274-284)AH5 (182-196)AH6 (203-216)O2 (178-180)TI2 (234-237)AH7 (223-232)3H6 (302-304)S16 (247-250)TI3 (242-245)AH8 (252-257)AH11 (309-320)S17 (297-300)TII4 (306-309)S18 (329-330)AH12 (337-348)TI6 (334-337)3H7 (350-352)S19 (357-358)AH14 (369-374)TI9 (366-369)TII2 (44-47)TVIII2 (38-41)S5 (53-54)S8 (75-76)TVIII4 (220-223)S15 (238-241)3H4 (258-262)TI4 (322-325)3H5 (264-267)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of yeast actin V159N mutant
rcsb
molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
total genus 114
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yvnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yvnA04
4M63C 1NGHA 5F1XA 3RSEB 5AQIA 2WUSA 3WEEA 4BVOA 3MMVA 4FWNA 3OHRA 4BR0A 2CGJA 2I7PA 3A5LC 3EKUA 5AQPA 3JS6A 3B8AX 4A62A 3KVGA 1S3XA 3BF3A 3IUCA 1D4XA 5LJWA 1Z6RA 3WXLA 1Q18A 4BRCA 3EN9A 2P9LB 1X9JA 2HOEA 4B1XB 3WQUA 2PBDA 3O80A 3AARA 5AQVA 3EO3A 1YVNA 4FPBA 2QWPA 3EKSA 3UKUA 4CZKA 2Q2RA 2P9KB 1CZAN 1GLAG 2ZGYA 4Z94A 5BN8A 1ZC6A 5TKYA 3P4IA 1NWKA 3LDOA 1X3NA 3FGUA 3FZKA 4BGBA 1EQYA 1NGGA 1ZXOA 5AQUA 2GTDA 1HKGA 4JAXA 3ZEUA 3IMXA 1YAGA 4BRHA 3HM8A 3CJ7A 4NB4A 2AA4A 5BRFA 1QZ6A 3DXMB 4FWPA 4H5RA 4BRGA 3W3DA 4C23A 1C0GA 2E1YA 4M7XA 4CZFA 5E26A 5ADXH 2HF3A 4NO7A 2VCPA 4BVPA 3C7NB 4BR5A 1JCFA 2NRHA 1GLCG 1S22A 1E4FT 3LDNA 2E2OA 5KQ8A 5AQMA 3UB5A 4PKGA 2P9NA 5AQZA 3VETA 4PL7A 3F9MA 2IVOA 3FLCO 3DXKA 3U4LA 3CJCA 4YDUA 4BC4A 4JHDA 1GLBG 2F9WA 4H0YB 3R6MA 1XQSC 3VEVA 2J4RA 4HTLA 3WQTA 2Q1NA 2BUPA 1HJOA 1KAZA 4MO4A 5AQJA 4FWRA 4BR4A 3VEWA 5BPLA 3ULEA 2ZF5O 1SAZA 3KHYA 1XC3A 5EY4A 3FZFA 4A2AA 4BROA 3MK6A 3GE1A 4MO5A 1MDUB 3QBXA 3VERA 3M3ZA 4KBOA 2A42A 1GLLO 2P9PB 4FOIA 2YHYA 3G25A 2CH5A 5AQOA 3A0IX 1GLJO 3CQYA 5JLFA 1OKJA 3H1QA 4PKHA 3BP8A 1V4TA 1QZ5A 3W0LA 1SQKA 3CJAA 4BRQA 4CZGA 1MA9B 2PAVA 3R9PA 4BG9A 3WT0A 4O5FA 3HTVA 2Q31A 4BREA 4FOEA 2GWJA 2W41A 1R59O 1BU6O 1HLUA 4I6MB 2E88A 1DEJA 4H5TA 5BRHA 3D2FA 1KXPA 3O1BA 5JICA 3LM2A 4CZJA 1NBWA 5AZJA 3ENHA 4YDUC 1G99A 3SLCA 2EWSA 3CETA 4A2BA 4BRNA 2P9UA 2E8AA 2IVNA 2KHOA 3WUHA 4WQ4A 4M7YA 2FF3B 3L6QA 2QWLA 2YHWA 3MN9A 1Y64A 3C0BA 1K8KB 2A3ZA 5AQTA 3D2EB 4XH1A 4B1YB 5AQWA 2YHXA 1NM1A 1WOQA 2YJEA 3ID8A 3H6EA 1ATSA 3QBWA 2YJFA 4CBWA 4GNIA 1QQOA 3GL1A 4H03B 5CE3A 3FZLA 1U2VB 4L3QA 3WXIA 3FZMA 4QS7A 4LC9B 2D4WA 4BRIA 4DCHA 3ZX3A 3VEZA 3SK3A 4EFHA 4O8KA 3WEEB 3O6WA 2QWMA 5BRDA 5I9EB 1TYQA 2VWBA 2Q97A 2Q36A 1NGCA 5FPDA 5AQXA 1BDGA 1DGKN 1U6ZA 4FWOA 4H5VA 4H0TB 4CJ7A 4H5WA 4IJNA 4BQLA 1TUUA 2D0PA 3H3OB 3VEOA 4FO0A 1RDWX 2FSJA 2FLOA 1LCUA 2V52B 5AQFA 5AZIA 3VF4A 5JMVA 2ASOA 5AR0A 4Y0WA 3UKRA 1NGDA 5AQNA 4B1UB 4DQ8A 4XH4A 3BUZB 3UKUB 3GOIA 3QICA 1WUAA 4IXCA 2IIRA 3CJ1A 4WQ4C 4BR9A 5KPRA 2BTFA 2A41A 2QWNA 2A40A 5KPTA 5KPZA 4BRDA 3ZETA 3QFUA 2V7YA 3ZEUB 1MWKA 1SZ2A 2P9IA 4PL8A 3M1FA 1V4SA 4EAHD 4IZ9A 2FXUA 5AQRA 2CGKA 3ENOA 3VF6A 2QW9A 4CZEA 3VESA 4QS8A 2I7NA 4XH5A 2E1ZA 3U8XA 4B9QA 2F9TA 3HI0A 4BC2A 1BOTO 3L4IA 1LOTB 2QWOA 3BF1A 4CZHA 5ELZA 2CH6A 4CD1A 2P9NB 1BWFO 4K25A 4B1ZA 1T6DA 1T6CA 3FE1A 1ATRA 4AM6A 3ZX2A 5AQHA 4GY2B 3M6GA 2NZTA 3DXKB 2D0OA 2A6AA 4JD2A 4B1VA 4JHDB 2OANA 4WYBA 2P9SA 3L0QA 1P8ZA 4CBUA 1NGEA 4DB3A 1XUPO 3EL2A 3D7EO 3R8EA 2D1KA 1BA0A 3O1WA 1ZBSA 1KAYA 4RCHA 3RSEA 1NGFA 2ZGZA 3CQXA 5AQQA 3FFKB 4CZMA 3SMPA 4BRPA 5AFUA 3QB0A 2GUPA 3ULEB 5F2RA 5FPEA 5KQDA 3O08A 4B1WB 5AQSA 3JXUA 2A5XA 2QWRA 2V7ZA 5BPNA 4XEIA 5FPNA 3U9DA 3TPQA 4BQZA 3AAQA 5BR9A 5EXWA 3SJHA 2FF6A 2P9LA 3UE5A 1KAXA 4ISEA 4FL9A 4AM7A 5AQLA 1HPMA 1ATNA 4MLHA 3H3NO 1Z05A 3H45C 2VYPA 3VGMA 3VOVA 1BUPA 1HKCA 4JN4A 4MLEA 3MN7A 4ISGA 1TUYA 4WQ5A 4BG8A 1NGIA 2P9KA 5F0XA 1NGAA 2GWKA 3MCPA 3IFRA 2E2QA 3S41A 3TU5A 1E4GT 3AY9A 2W40A 2H3GX 3CJ9A 1IG8A 1IJJA 3LL3A 3D2FB 3QFPA 4A61A 5AZJB 5AQKA 2ASPA 1J6ZA 4FWQA 3IDHA 2P9UB 2FSKA 5EOYA 4EIAA 1BA1A 2YI1A 4BRFA 3DXMA 2Q0UA 3GBTA 3MN6A 3DWLA 4FPAA 1T44A 4IWVA 1RFQA 4F9OA 3C7NA 4H0OA 4H0PA 3H46O 3H1VX 1YUWA 2IVPA 4BGAA 5FPMA 4HWIA 3VGKA 4CBXA 2E20A 3FZHA 4K42A 2UYTA 3LDQA 5AQYA 2HMPA 1NGJA 3A5MC 1QHAA 3ZX0A 1X3MA 2HF4A 4PKIA 3LDLA 5AFUH 2GEMA 5E84A 3LM9A 2ITMA 1TYQB 3CI5A 1QQMA 4E1JA 5BN9A 2V51B 3HZ6A 3FR0A 4WQ5C 3EZWA 2ASMA 3CIPA 1HKBA 2QXLA 1JCGA 4DHYA 2GELA 2QM1A 4EHTA 1RGIA 4H5NA 4CZLA 2Q0RA 5AZIB 3QDKA 3U9ZA 5LJVA 4RWTA 3UKRB 5EX5A 4FWLA 5EVZA 1GLFO 2AP1A 3WXKA 5JLHA 4J8FA 4FWMA 2YCHA 4CZIA 2P9PA 1NGBA 3O8MA 3A5NC 4IO8A 4BRAA 4BRKA 1HUXA 4BC3A 4K43A 3VF2A 4FWSA 2CGLA 1JCEA 3VEYA 3CJBA 3O5BA 4CD3A 2FSNA 3A5OC 4FSVA 2E2PA 3GG4A 5AQGA 3QMLA 4H0XB 3ATUA 2DPNA 1NLVA 3ZETB 4RTFD 3O4WA 4BR2A 5BREA 3LDPA 3BEXA 3VENA 1H1VA 3CERA 3KZBA 2P9IB 4BRMA 4I6MA 3DAWA 1GLEG 3MDQA 4H0VB 4CI6A 3J8AA 2ZWHA 4QS9A 3DJCA 3VEXA 1BG3A 4BR7A 2E2NA 3I33A 5BPMA 3VGLA 3A8YA 1NMDA 3HBTA 4K41A 3HSCA 3ATVA 1HX1A 1QQNA 4IJAA 2QWQA 1YXQA 4JNEA 1K8KA 1DKGD 2NLXA 3CHWA 3WXJA 3D2EA 3GDQA 4EHUA 3I8BA 5ADXA 1ESVA 3SMSA 1MWMA 4JD2B 4BRLA 1C0FA 3MN5A 4ISFA 5B8HA 3VPZA 2P9SB 5LY3A 1BO5O 4BC5A 1U2VA 3AAPA 4FWKA 1GLDG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NGHA 5F1XA 4DR7K 3S5TA 4FWNA 1BIUA 1BL3A 1WN7A 1XI1A 3EKUA 2G8IA 3CC7N 3VMFB 5IWAK 4NYNA 1XNRK 1D4XA 1Z6RA 4PUOA 2UXDK 3VQCA 4CHNA 3OVNA 4OKKA 5M1PA 2P9LB 2HOEA 3SYZA 1QS4A 4B1XB 4NXMK 1CZ9A 3AARA 1KD1O 5AQVA 2HHQA 3K9JA 3MWPA 4CGIA 4QCLA 2P5OA 1YVNA 3RMCA 3PIOL 3HOTA 1VQON 3EKSA 4CZKA 5KRTA 1GLAG 2ZGYA 3O3HA 4OGEA 3R3LA 1NNEA 3THWB 3HVRA 3IS9A 4BGBA 4KTWA 1NGGA 1ZXOA 3DLLL 2KZZA 3LPUA 4JAXA 4DSIA 4IOCL 3T1HK 1QE1A 4XJXA 3DXMB 4H5RA 3MEGA 3K57A 4M3XA 5EU7A 4FJNA 1GLCG 3WNGA 5KQ8A 5AQZA 1U04A 4FJGA 5J2NA 3FLCO 3WNEA 4DTUA 2JWKA 3CQ8A 1NJIO 3CJCA 4YDUA 1WBBA 2XRIA 4H0YB 4DV4K 4NXNK 4IKFA 3V9XA 1SL2A 3AVGA 4HTLA 3DLHA 4WFBL 3J7AP 4E72A 3CF5L 1KTQA 4C8NA 3VEWA 1HNZK 4KTQA 1RTHA 1KC8O 2JLEA 4AHVA 4BROA 3S3OA 1JL2A 3CM5A 4MO5A 4ICLA 4AILC 1YTAA 1L3VA 3HXMA 2O8BB 4CHOA 3NGIA 4UQGA 2HBKA 3CMAN 1NU0A 4HCBA 1XHXA 1GLJO 2VWKA 3TARA 1A5VA 5DM7L 4CIEA 1SQKA 4C8KA 4BRQA 4CGHA 2PAVA 4CZGA 4YHHK 4B9NA 3MXJA 4FJIA 3WT0A 1GOBA 3HTVA 2O8FB 1R59O 4I6MB 1HYVA 2E88A 4IEIA 2BANA 4C8OA 1KXPA 1NBWA 4Z4IA 3SLCA 2NRXA 3CETA 4O0JA 4CESA 2P9UA 3E9PA 3L2QA 2E8AA 5CZ1A 4JK8A 1L3SA 4FZXC 4DG1A 3E01A 2YHWA 3MN9A 4X64K 2KQ2A 3D2EB 3TSUA 1HNVA 5AQWA 4DLGA 4CF8A 4JI0K 1WOQA 2QTDA 3H6EA 3HPHA 3QBWA 2YJFA 4JI4K 4CCHA 3KK7A 3CFPA 4L3QA 3WXIA 4QS7A 4LC9B 2D4WA 2Q3SA 4A59A 4CHQA 4DCHA 3U6FA 4KFBA 4JKGA 3ZX3A 1NJWA 4EFHA 3O6WA 3VA0A 2QWMA 5BRDA 3V81A 1D9DA 4DTXA 1TYQA 1NGCA 5FPDA 3ZT2A 4FJJA 4OPHA 5AQXA 4DKWA 4AF1A 3SV4A 4H5VA 3VTHA 3K59A 4FO0A 1RDWX 1S6QA 4KHWA 4JI6K 3VF4A 4FJMA 5GAGP 1ASUA 2ASOA 5AR0A 3C6UA 4B1UB 3BUZB 4YORA 4CFDA 1GOAA 3RRGA 3UIQA 2KFZA 5CYMA 1S1XA 3CPEA 2QWNA 2A40A 1LWFA 1C1BA 1TAQA 1C0TA 4EP5A 4CJEA 3ZEUB 1KRPA 3K5LA 2HHUA 3HPGA 4KHNA 4M3TA 1V4SA 5AQRA 3VF6A 3QERA 1TKTA 3U8XA 1QVGM 4FLVA 4NCBA 3DRPA 1YIJN 2QWOA 1X1PA 3NH2A 4MFBA 4CZHA 3E66A 4CJKA 5ELZA 5JVGL 5JS2A 4K25A 1T6CA 1ATRA 3HM9A 3DOLA 3M6GA 3DXKB 5JS1A 3QIPA 4DB3A 2D0CA 3HSTB 3R8EA 4LFAK 5C42A 2PYLA 1ZBSA 4DTNA 3RSEA 5D3GA 5AQQA 1LW0A 4CZMA 3DLGA 3SMPA 4FVUA 3TABA 3OY9A 5KQDA 3O08A 4B1WB 5AQSA 4DR3K 3JXUA 4DFPA 3QEXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1NGH A;  5F1X A;  4DR7 K;  3S5T A;  4FWN A;  1BIU A;  1BL3 A;  1WN7 A;  1XI1 A;  3EKU A;  2G8I A;  3CC7 N;  3VMF B;  5IWA K;  4NYN A;  1XNR K;  1D4X A;  1Z6R A;  4PUO A;  2UXD K;  3VQC A;  4CHN A;  3OVN A;  4OKK A;  5M1P A;  2P9L B;  2HOE A;  3SYZ A;  1QS4 A;  4B1X B;  4NXM K;  1CZ9 A;  3AAR A;  1KD1 O;  5AQV A;  2HHQ A;  3K9J A;  3MWP A;  4CGI A;  4QCL A;  2P5O A;  1YVN A;  3RMC A;  3PIO L;  3HOT A;  1VQO N;  3EKS A;  4CZK A;  5KRT A;  1GLA G;  2ZGY A;  3O3H A;  4OGE A;  3R3L A;  1NNE A;  3THW B;  3HVR A;  3IS9 A;  4BGB A;  4KTW A;  1NGG A;  1ZXO A;  3DLL L;  2KZZ A;  3LPU A;  4JAX A;  4DSI A;  4IOC L;  3T1H K;  1QE1 A;  4XJX A;  3DXM B;  4H5R A;  3MEG A;  3K57 A;  4M3X A;  5EU7 A;  4FJN A;  1GLC G;  3WNG A;  5KQ8 A;  5AQZ A;  1U04 A;  4FJG A;  5J2N A;  3FLC O;  3WNE A;  4DTU A;  2JWK A;  3CQ8 A;  1NJI O;  3CJC A;  4YDU A;  1WBB A;  2XRI A;  4H0Y B;  4DV4 K;  4NXN K;  4IKF A;  3V9X A;  1SL2 A;  3AVG A;  4HTL A;  3DLH A;  4WFB L;  3J7A P;  4E72 A;  3CF5 L;  1KTQ A;  4C8N A;  3VEW A;  1HNZ K; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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