2A3ZA

Ternary complex of the wh2 domain of wasp with actin-dnase i
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
361
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural protein
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 120
structure length 360
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a3zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a3zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a3zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a3zA04
4WQ4C 1U2VA 2ZWHA 2GUPA 3WXJA 1U2VB 4IJAA 3ATUA 3RSEA 3M1FA 1WUAA 3RSEB 4BC2A 3EL2A 4NB4A 4EHUA 4M63C 5AQLA 1BOTO 1X3MA 4CZEA 3MDQA 1J6ZA 5AFUH 4H0PA 3CIPA 2VYPA 2W41A 1JCFA 5EX5A 5BPMA 2E1YA 2QWPA 3QBWA 4EIAA 2A42A 4BREA 2E20A 3LDNA 2CH5A 3EN9A 5TKYA 4JN4A 4PL8A 2P9SA 5AQRA 4E1JA 4BRAA 1QQNA 2P9SB 4BVOA 3D2EA 1BA0A 3B8AX 4HTLA 3D2EB 3VEVA 3O6WA 2OANA 5KQDA 3MK6A 4GY2B 1Q18A 4Y0WA 1SZ2A 2E8AA 1NGBA 3GDQA 3VOVA 3MCPA 1MWMA 1GLCG 3W3DA 4L3QA 5AQHA 4B1UB 2CH6A 1ESVA 3FZHA 5ELZA 1NGGA 2QWRA 1EQYA 2D0PA 4EAHD 1D4XA 5AQQA 3VPZA 3U8XA 3CJ9A 3ZX2A 4CZLA 3MN7A 1NGDA 1DEJA 4BRFA 2IVOA 5EVZA 4CJ7A 1KXPA 5BN9A 2BTFA 5AQNA 5JMVA 1YUWA 2HOEA 2A41A 3D2FB 1XC3A 5AQPA 5F2RA 4J8FA 1R59O 2HMPA 1GLBG 3GG4A 2P9IA 2P9IB 4BRGA 1XQSC 3U9ZA 2QXLA 2IVPA 4B1ZA 4RWTA 5AZJA 3VESA 1SQKA 5AZJB 3HBTA 2AP1A 3EZWA 3CJ1A 4H0TB 3ENOA 2CGKA 4BRNA 3ZEUA 5AQYA 3ZEUB 1X9JA 1BUPA 4BRMA 2NZTA 1Z6RA 3SLCA 1TUYA 2I7NA 4FPBA 3BF3A 1ATNA 2A3ZA 4H5VA 3HM8A 3QICA 4GNIA 3VF2A 1GLEG 4B9QA 2Q36A 4BR7A 2H3GX 4BC3A 1T6DA 4FWOA 1NLVA 1HUXA 3LM9A 4FWRA 2BUPA 4FL9A 3A5NC 5AQMA 2QWLA 4B1VA 4I6MA 3HSCA 2YJEA 4I6MB 5KPTA 1BU6O 4FSVA 2ZGYA 2EWSA 3VETA 2ASPA 3FR0A 1DGKN 5B8HA 3IFRA 3FZFA 4IJNA 2A6AA 1V4TA 1IG8A 3A5LC 3OHRA 3CJ7A 4JAXA 3U4LA 4QS9A 5JICA 2PBDA 4NO7A 1BG3A 2P9KA 2P9NA 3AAQA 1NM1A 2P9KB 4BQLA 2P9NB 1ATRA 4B1WB 4CZFA 5CE3A 2ZGZA 3KZBA 3AY9A 4CBUA 4FWMA 4BROA 1MA9B 2W40A 3O4WA 4FWNA 3WEEB 1C0GA 5AQZA 1NBWA 4O5FA 3UKRA 3C7NA 4WQ5A 3VGKA 3C7NB 3UKRB 1QHAA 2AA4A 1HKBA 5BREA 3GBTA 3O80A 2GWKA 2I7PA 3R9PA 2YCHA 3QMLA 1HLUA 2A40A 1K8KB 4B1YB 4H5WA 4YDUC 5E84A 2E2NA 2ASOA 5BRFA 2Q31A 3BF1A 3M3ZA 4PL7A 1JCEA 2P9UB 1XUPO 3LDPA 5AQTA 3HTVA 4FWKA 5EXWA 4XH4A 1LCUA 3FFKB 1Y64A 3SJHA 1T44A 4WQ5C 2QM1A 1S22A 3JXUA 4AM6A 3BUZB 1NGEA 2Q0UA 3A0IX 4BR2A 5KQ8A 4CD1A 4BRLA 1QQOA 5AZIA 1SAZA 5AZIB 3L4IA 1NGHA 4IZ9A 3D7EO 1S3XA 4MO5A 4QS7A 4BRDA 4K42A 3D2FA 4FWSA 4K41A 3GOIA 4BRKA 2QWQA 3BP8A 4H03B 4BQZA 3DJCA 2IVNA 5AQSA 5FPDA 4DB3A 4MO4A 1GLLO 3CJBA 3FZMA 1GLFO 1Z05A 4A2AA 5KPZA 3VF6A 3SK3A 4BRHA 3WXLA 1OKJA 5AQFA 1HPMA 3L6QA 2QWMA 3WQTA 1X3NA 4H5NA 4Z94A 3AARA 1NGIA 2QW9A 3VGLA 5I9EB 3BEXA 3QBXA 2A5XA 5KPRA 1JCGA 4BGAA 1HJOA 4RTFD 4FOEA 3H3NO 1MWKA 4EHTA 1ZXOA 4IWVA 1ZC6A 4K25A 4CD3A 3WXKA 3ZX0A 1NWKA 2FSKA 3LDOA 4BVPA 1KAYA 2FSNA 5BRDA 4B1XB 3CI5A 4DCHA 2Q1NA 1NMDA 3IMXA 1WOQA 4MLHA 5AR0A 3WT0A 5FPEA 4CZMA 2CGJA 2Q0RA 3O08A 2FLOA 4BRIA 2YHXA 4A62A 3VEZA 1RGIA 1CZAN 3UB5A 3DXKB 2KHOA 4ISFA 3VEWA 3KVGA 3DXMA 3DXMB 4BRQA 3VERA 5AQWA 3ULEB 1H1VA 4JNEA 3U9DA 4BR9A 2F9WA 2DPNA 1E4FT 4JHDA 4YDUA 4JHDB 2Q2RA 1HKGA 3HI0A 4FO0A 5LJVA 4XH5A 4IO8A 2HF3A 3HZ6A 1BO5O 3CHWA 1KAZA 3QDKA 4ISEA 1V4SA 3ZX3A 3A5MC 1KAXA 4H0YB 3WEEA 3EO3A 2GELA 1TUUA 3CJAA 3FLCO 3S41A 4AM7A 5AQGA 4F9OA 3LDLA 2V51B 3G25A 2J4RA 4H5RA 4H5TA 2V52B 2YI1A 3DAWA 5AQXA 2IIRA 4CI6A 4CZJA 5BPLA 4H0XB 3H3OB 1BDGA 1K8KA 3AAPA 4KBOA 3CJCA 5AQVA 3QFUA 2VWBA 4CBWA 2D1KA 4M7YA 2P9UA 3MN9A 5AQUA 2FF3B 3O5BA 3W0LA 2E88A 3VEOA 4MLEA 5AQJA 4WYBA 4FWQA 4PKHA 3H6EA 5F1XA 3UKUA 2V7YA 4CBXA 4FPAA 3UKUB 2CGLA 1NGAA 3WXIA 1NGJA 4CZHA 1RDWX 3H1QA 3WUHA 3VGMA 3J8AA 3MMVA 3VEYA 3EKUA 4BC5A 3UE5A 3O1BA 5BPNA 3ZETA 5LY3A 3WQUA 1HX1A 4BR0A 3ZETB 5F0XA 3TU5A 3CERA 5JLFA 3FGUA 4K43A 2GEMA 3EKSA 3P4IA 1BWFO 4H0VB 3H1VX 2HF4A 1TYQA 1TYQB 4FWPA 5AFUA 4PKGA 3VENA 2D0OA 2Q97A 3A8YA 3O1WA 2FXUA 4FOIA 2VCPA 1HKCA 4DQ8A 4BC4A 4BG9A 5AQOA 1YVNA 1GLDG 3H46O 3I8BA 5EOYA 2P9PA 3CETA 3CQYA 3GL1A 3GE1A 2P9PB 4LC9B 4BR5A 2YHYA 2YJFA 1LOTB 2E2QA 2YHWA 3C0BA 1DKGD 4BRCA 2D4WA 3MN6A 5JLHA 1QZ5A 2V7ZA 2GTDA 5AQIA 5E26A 4BG8A 1U6ZA 5ADXH 1GLJO 1QQMA 4RCHA 3SMSA 4JD2A 4A61A 5BN8A 1YAGA 2GWJA 2ASMA 3LL3A 4JD2B 1IJJA 3VF4A 4HWIA 3IUCA 3H45C 2E2PA 1YXQA 3VEXA 1ATSA 3A5OC 4IXCA 2F9TA 3TPQA 4C23A 4H0OA 3DWLA 4XH1A 2E2OA 3KHYA 3R6MA 4QS8A 3F9MA 4A2BA 5ADXA 2E1ZA 2QWOA 4DHYA 3L0QA 3MN5A 3DXKA 1MDUB 3IDHA 4FWLA 4CZIA 5EY4A 4CZKA 3LDQA 3I33A 3LM2A 3FE1A 2NRHA 2UYTA 3ULEA 2FF6A 3M6GA 1P8ZA 1T6CA 3JS6A 2ITMA 5LJWA 2NLXA 4BRPA 2PAVA 4PKIA 2WUSA 4WQ4A 2FSJA 2ZF5O 1QZ6A 1C0FA 3O8MA 1GLAG 3QFPA 2QWNA 2P9LA 4O8KA 2P9LB 1NGCA 5FPNA 5FPMA 1RFQA 1E4GT 3R8EA 5BR9A 3ATVA 3CQXA 1NGFA 5AQKA 3FZLA 3QB0A 4M7XA 1G99A 4CZGA 4BR4A 4EFHA 5BRHA 3FZKA 1ZBSA 1BA1A 3ENHA 4BGBA 4ISGA 3SMPA 3ID8A 4XEIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OGEA 2WTUA 4GV3A 3DRRA 3T1AA 4CF1A 1WUAA 4ILJA 4BC2A 1HNZK 4FJ9A 4YHHK 4C1NK 4DV2K 4KREA 1X3MA 1U04A 5AFUH 3SCXA 4B8CA 1NJXA 5C2DA 3NE6A 2W42A 3KTQA 4CGHA 4OKKA 1KLNA 1TKZA 3DLGA 4JI8K 2D0CA 2KFNA 2G8KA 4KHSA 3O6WA 3S3OA 4GY2B 1NK9A 1KVAA 2NRTA 1NGBA 3VOVA 3MCPA 3P38A 4DTUA 4B1UB 3CQ8A 1ESVA 3P1GA 3QEIA 1RT1A 2D0PA 4I2PA 1WSFA 1CZ9A 4FJXA 4BRFA 4CK2A 2IVOA 4CJ7A 4OPAA 4OVLA 2BTFA 1VQPN 5JMVA 5AQPA 2FBXA 1GOCA 5J2QA 1HQUA 1R59O 4CJQA 1LWEA 4Z4GA 4KO0A 1XQSC 2QXLA 3T19A 1NK0A 4RWTA 4E7JA 2O8FA 2B5JA 2O8FB 3SQ2A 3VESA 4X65K 2QKBA 4M3TA 1BCMA 3KIOA 5AQYA 4WCEL 1WSHA 3OBWA 4FXDA 4CFAA 2GV9A 2PZSA 3ZSXA 4DR7K 3M8SA 3SLCA 3PY8A 1IBMK 4ICLA 2IGIA 1EKEA 3HM8A 4GNIA 4IG0A 4K8ZA 2Z1JA 2O8EA 1GLEG 2Q36A 2O8EB 2H3GX 5LMUK 3MECA 2Z1GA 4FWRA 2BUPA 1DTQA 1LWCA 4OLBA 5AQMA 4DR4K 4B1VA 3TAMA 3AO2A 4FW2A 3TAPA 1BU6O 3KD1E 1ITGA 4CCHA 2YKNA 4J2BA 1X9SA 1ILYA 2ASPA 3FR0A 5B8HA 1VSDA 2HHQA 1V4TA 1RNHA 2QTDA 3A5LC 4DTMA 2HBMA 4LF6K 3OJUA 1BG3A 3D0PA 4KRFA 4JI0K 2UXDK 4FJLA 1ATRA 4CZFA 2ZGZA 3AY9A 1RT4A 2WC9A 3OYKA 4BROA 4Z4CA 1MA9B 2W40A 2HBLA 1TK5A 3O9UA 3V1QA 1HNVA 1ZBLA 4M3RA 4AHCA 3TI0A 3VQPA 4L8RB 1VQ7N 2YCHA 3T69A 2HHXA 2F96A 4ZTJA 4YNQA 3V9SA 5E84A 4IEEA 2ASOA 2NRRA 3BF1A 3DOLA 3M3ZA 4PL7A 4O4GA 3AVGA 4DTJA 3HPGA 3LDPA 4E1NA 5EXWA 3V81A 3RRGA 4MDBA 3FFKB 3SJHA 1YI2N 2F8SA 2E6LA 1KVBA 4WFNL 1JXBA 1NGEA 3A0IX 5AZIA 3CF5L 1SAZA 5AZIB 2RHKA 5KGWA 1X1PA 2KZZA 4YY3K 3D7EO 4AH9A 3EYZA 3SZ2A 1IBLK 4MO5A 4DQPA 4DR6K 4NLCA 4CEDA 3OBYA 4JRPA 3P39A 4JI2K 1BIZA 3LP3A 2QEXN 3HYFA 3MXJA 5M1NA 1VSFA 1UAXA 3V1RA 4MO4A 1GLLO 3QEPA 3CJBA 4A5BA 2UXCK 1FKPA 5SWMA 3VF6A 4CIEA 3CCSN 3WQTA 4CFCA 3V9XA 2QWMA 3THVA 1X3NA 1L3VA 4B9MA 2FBVA 4KKOA 3VGLA 4M41A 4DLGA 4O0JA 1K73O 1W97L 4FOEA 1MWKA 4DU3A 1RT2A 4DKWA 3QEVA 4JKBA 2ZJRL 4CJTA 3PV8A 1TK0A 2HHTA 4DSLA 4DCHA 1NMDA 4JS5A 4OGCA 4PHTX 4CEAA 2E4LA 4CK3A 4EZ6A 3TSPA 4CJKA 1C0MA 3NH0A 1VK0A 5FPEA 3K57A 2OCEA 4EP4A 3O08A 5HROA 4A62A 5C24A 1CZAN 1C1CA 3UB5A 4ISFA 3O9SA 1S6QA 3KVGA 4DR2K 4G1QA 4DS4A 1KRPA 4H4OA 3ULEB 2G8IA 4JNEA 3OYMA 1GOBA 3TSUA 2F9WA 2DPNA 1W9HA 3O9TA 4DFPA 4FM1A 4KPYA 2Q2RA 1HKGA 3QINA 3CHWA 1KAZA 4CGDA 4CEQA 3A5MC 4H0YB 3T7ZA 2NRXA 3WEEA 1S72N 3EO3A 3K0SA 1RDUA 3LAKA 2C1IA 3C94A 4AHUA 4HUEA 3TAFA 3ZT3A 5AQGA 4YOYA 3I56N 3OYBA 1EX4A 4KTWA 2V52B 2IIRA 3NCIA 1CXUA 1VSEA 4H0XB 4KBOA 1N32K 2WFBA 4CERA 3HRGA 2A1RA 1VRTA 4ID1A 2FF3B 3QIOA 3VQ6A 2E88A 5J1EA 3OYNA 3RMBA 3E01A 4WYBA 5M1QA 4I2QA 3HVRA 1Q8IA 4IFYA 3IG1A 4GVMA 3UKUA 1R0AA 3UKUB 2CGLA 1SKWA 5I3UA 3WUHA 3H1QA 4CF9A 3MMVA 1FJGK 4RW7A 1OH7A 3O1BA 3RMCA 4HCBA 2QI2A 5KRSA 3ZT4A 5F0XA 3ZYYX 1Z26A 3AO5A 4DSKA 2F4VK 2GEMA 3EKSA 3P4IA 1BWFO 4H0VB 3H1VX 4DG1A 5FLXO 3VENA 2D0OA 2IDOA 2OPRA 3A8YA 3VMFB 2VCPA 5K14A 3ZT0A 4Z4IA 1NNEA 5EOYA 4KHUA 3GL1A 4LC9B 4O55A 4C8LA 1VQ6N 2YJFA 3LZIA 5M1FA 1VQ8N 1LOTB 2GUIA 2YHWA 4YORA 2V7ZA 1REVA 4FJGA 2GTDA 5AQIA 4FJJA 5ADXH 4E19A 3TTFA 2PY5A 4JD2A 1YAGA 3VQEA 4JD2B 1IJJA 3K9KA 3IUCA 1RT3A 1YXQA 1ATSA 4CJWA 4IXCA 1BQNA 4M3YA 3AVLA 3EZ5A 3AVKA 1TKXA 4DF8A 5MLCQ 3F9MA 4IOCL 4DTNA 2KTQA 3KK2A 4EP5A 2QWOA 3C95A 3L0QA 4GW6A 3DRPA 3DXKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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