2A40A

Ternary complex of the wh2 domain of wave with actin-dnase i
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
362
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 120
structure length 361
sequence length 362
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a40A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a40A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a40A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a40A04
3CETA 4FOEA 3UKUB 4BC4A 3DJCA 3HZ6A 4PKHA 4PKGA 2QM1A 1HKCA 3FGUA 1ZC6A 4AM7A 4MO5A 1HX1A 1Q18A 5JICA 3I8BA 5FPDA 4H03B 1ATSA 1NGDA 4A61A 5BN9A 3LDLA 3C7NB 4K25A 4JHDB 3VEOA 5BRHA 3BEXA 3GE1A 3WT0A 4AM6A 3WXLA 3I33A 1NLVA 4B1ZA 3VGKA 2V52B 4EHUA 3L6QA 1H1VA 2P9UB 3EKSA 3SMSA 5TKYA 1K8KA 4CBUA 3WXIA 2P9SB 3CJ7A 4BRIA 4CI6A 5AQWA 2YHWA 2UYTA 3P4IA 3CJBA 3FZHA 3G25A 3GBTA 4BRPA 2GELA 4IXCA 5BR9A 3VESA 1E4FT 4F9OA 3M1FA 3H45C 5AQKA 4FWPA 3EO3A 4H0XB 5AQVA 3GOIA 3QDKA 1WOQA 3H46O 3JXUA 2P9IB 2QWPA 3R8EA 4CBXA 3R6MA 2J4RA 3L0QA 4L3QA 4A2AA 4EAHD 1QZ5A 4ISFA 3FZFA 3O4WA 4BRGA 4BRLA 4H0YB 4H0VB 1S3XA 2ASOA 2YHXA 2FSKA 3OHRA 3ZETA 3AAPA 4BR9A 2QXLA 2ZWHA 1NGCA 2GTDA 1YXQA 2P9PB 3QICA 4FWOA 5BRDA 3MMVA 3WQTA 2Q36A 4DHYA 1BUPA 2DPNA 4RWTA 1IJJA 5F2RA 4PKIA 2V7ZA 3VF6A 5KPTA 3EN9A 5EX5A 1EQYA 4H0PA 1CZAN 2FSJA 3O1WA 1BG3A 3LM2A 1BO5O 1J6ZA 1GLLO 2E2OA 4CZKA 4CZJA 1GLJO 3IUCA 4FWMA 2E2QA 4O8KA 1GLAG 4EIAA 2YCHA 2I7NA 5KQ8A 2E1ZA 4IZ9A 4CD1A 3QBXA 5BPMA 1U2VA 2OANA 3SK3A 4Z94A 3DXMA 4WYBA 2E1YA 5F1XA 4B1YB 3IFRA 4RTFD 4XH5A 3H3OB 3HTVA 3U9ZA 2AP1A 1NGEA 3D2EA 1IG8A 1X9JA 2FXUA 4FL9A 5KPRA 5EXWA 4H5TA 1K8KB 2GEMA 4A62A 4BG9A 1JCFA 2HF4A 3ZEUA 1NGIA 5JLFA 4B1VA 1Z05A 4LC9B 5LJVA 2P9LB 3MN9A 3ENOA 3UKRA 3M6GA 4EHTA 5AQPA 4CZHA 1TUYA 3H6EA 3CQYA 3FZKA 4H5VA 4FWRA 2HF3A 2VCPA 4PL7A 3HI0A 4RCHA 4FWQA 4DB3A 3MCPA 2V51B 4HTLA 4FSVA 1E4GT 1T6DA 5E84A 5B8HA 4BVOA 1S22A 3A5NC 2PAVA 2BUPA 3CQXA 1BWFO 2VYPA 4K42A 4XH4A 5FPMA 5ADXA 3ULEB 4FWLA 1QQOA 4BRHA 4MLEA 3HM8A 4H0TB 2Q97A 4H5NA 3GL1A 2CGLA 3DXKA 4K43A 3B8AX 3D2FA 1DEJA 1NMDA 3QFPA 4A2BA 3VOVA 3EL2A 5F0XA 1LCUA 2D0OA 2P9KB 2PBDA 3CJ1A 4GNIA 4BR5A 4FO0A 3O5BA 2QWRA 4CBWA 1NM1A 2Q31A 1MDUB 3VF4A 3LDOA 3DXMB 3FZMA 1WUAA 1KAYA 2ASPA 4FWKA 1NWKA 1NBWA 3D2EB 5FPNA 4DCHA 5LJWA 3WEEA 1X3MA 3ZEUB 2D1KA 4BC3A 4KBOA 4K41A 2HMPA 3GG4A 4FWNA 4M63C 1R59O 2A40A 4ISGA 3UKRB 3DAWA 5BRFA 2AA4A 2A42A 4NO7A 5AQGA 3UB5A 1ATNA 3JS6A 2HOEA 3O08A 3O6WA 3LDNA 5ADXH 2EWSA 2ASMA 4ISEA 2A3ZA 1MWMA 3RSEB 5AZJA 2WUSA 4XH1A 2YHYA 5AQYA 3MK6A 3S41A 4BR2A 5FPEA 1NGHA 2FF6A 2FF3B 1XUPO 2NRHA 4IO8A 4H5RA 5AFUA 1YUWA 4IJAA 3L4IA 4BRCA 5EY4A 2IVNA 1DGKN 3VETA 1ESVA 3UE5A 3W0LA 3UKUA 4BR4A 1QHAA 4B1UB 2E8AA 3DXKB 3IDHA 1RFQA 1GLBG 3KZBA 1HPMA 3KHYA 3C0BA 2GWJA 1QZ6A 4BRNA 2KHOA 4WQ5A 3O80A 4IWVA 4YDUA 2ZGZA 2CH5A 4GY2B 4H5WA 4E1JA 1HKBA 5AQTA 4BGBA 3BF3A 3WXKA 5AZIA 1MWKA 3O8MA 4BRDA 1V4TA 4BREA 4BG8A 1BDGA 1BU6O 3VF2A 4CD3A 3U9DA 1SQKA 4CZMA 2IIRA 3CJ9A 2P9SA 4B1XB 1SAZA 4I6MA 4BR7A 2IVOA 4B9QA 1HJOA 1Z6RA 4FPAA 5KPZA 3ZX3A 4Y0WA 3FZLA 4WQ4A 1BOTO 4QS7A 2GUPA 5AQNA 2QWOA 2H3GX 4O5FA 1D4XA 3WQUA 1X3NA 3BUZB 3A5MC 3WEEB 3CHWA 2P9NA 1KAZA 4M7XA 1RGIA 3ZETB 1XQSC 4JN4A 1JCGA 2GWKA 2IVPA 1JCEA 3VERA 3M3ZA 5AQOA 3D7EO 1BA1A 1GLEG 3H1QA 5AQHA 2ITMA 1NGAA 2QW9A 2A41A 5AZJB 4BQZA 2CH6A 1RDWX 2Q1NA 2Q0UA 2ZGYA 3ZX0A 3ZX2A 4CZLA 3HSCA 2E20A 4BR0A 3AY9A 3VEYA 3VEZA 5AQIA 4CJ7A 4XEIA 1MA9B 5AQJA 2I7PA 5E26A 3U8XA 1HLUA 4FWSA 1U2VB 4MO4A 4BVPA 5BREA 2QWNA 2W41A 2QWMA 4BRFA 1TUUA 4BQLA 3J8AA 3ENHA 4EFHA 3SLCA 4BGAA 5BN8A 4JD2A 1DKGD 3HBTA 4IJNA 4QS9A 2CGJA 4CZEA 3H3NO 4C23A 3FR0A 2F9TA 5AZIB 1QQNA 2FLOA 5JMVA 4HWIA 1GLDG 1C0GA 3FLCO 3MN7A 5CE3A 3O1BA 2A5XA 5EOYA 1G99A 3A5OC 4PL8A 3VGMA 5AQQA 4I6MB 5AQMA 5BPNA 3LL3A 1XC3A 3WUHA 3VGLA 2QWLA 2E2NA 3EZWA 1ATRA 3CI5A 4JNEA 4BROA 3QB0A 1TYQA 3MDQA 4JAXA 4NB4A 2P9LA 3SJHA 5AQRA 3EKUA 3A0IX 1P8ZA 2E88A 3LM9A 4BC2A 1QQMA 4BRKA 2P9NB 4CZFA 5AQZA 2W40A 3QMLA 5JLHA 1BA0A 2D4WA 2D0PA 2YJEA 2ZF5O 2NLXA 4QS8A 2Q2RA 4CZIA 3MN5A 5AQSA 4MLHA 3FE1A 3D2FB 3LDPA 3ULEA 1GLFO 1NGGA 3FFKB 2NZTA 1SZ2A 4BRQA 3QBWA 4WQ5C 1T44A 1YAGA 4YDUC 3ATUA 3C7NA 3ATVA 4JHDA 3VEXA 1HUXA 3F9MA 3WXJA 1KAXA 3A5LC 5I9EB 5ELZA 1U6ZA 2P9KA 3TPQA 1NGFA 2VWBA 2P9UA 2F9WA 1KXPA 1NGJA 1Y64A 1C0FA 2YJFA 2YI1A 5AR0A 4H0OA 4JD2B 1ZXOA 3CIPA 2E2PA 3SMPA 3IMXA 4WQ4C 1GLCG 3KVGA 3QFUA 3W3DA 2CGKA 5KQDA 3VENA 4J8FA 1OKJA 3MN6A 5AQXA 3VPZA 5AQFA 5EVZA 2P9IA 1YVNA 1LOTB 4BRAA 1T6CA 2QWQA 1HKGA 5LY3A 2A6AA 4BRMA 3BF1A 2Q0RA 1TYQB 3AAQA 4M7YA 3CJCA 3GDQA 4FPBA 5AFUH 4BC5A 3A8YA 5BPLA 3R9PA 4B1WB 2BTFA 3TU5A 3DWLA 2P9PA 3LDQA 3BP8A 2V7YA 1NGBA 5AQUA 5AQLA 4DQ8A 3CERA 3RSEA 3VEVA 2FSNA 4CZGA 3CJAA 4FOIA 3ID8A 3U4LA 1V4SA 3VEWA 1ZBSA 3AARA 3H1VX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1W9HA 3DJCA 3HZ6A 1BI4B 1J54A 3FGUA 3SAHA 4MO5A 1N34K 5JICA 3KLGA 4X66K 3L3VA 3SQ2A 4F2RA 4FM0A 3P38A 4ILGB 4AM6A 3I33A 5M1QA 4JI6K 1TKDA 1SKRA 4EHUA 3L6QA 3QIPA 3ZSYA 3LP0A 3F5TA 3C6AA 2Z1GA 2E4LA 5C25A 3CCVN 3PV8A 3WXIA 3SJJA 2QA4N 5AQWA 3CC2N 4KTQA 3CJBA 4E7JA 3QNNA 4BRPA 4WCEL 4UY8O 3VESA 1E4FT 3PLAA 3TAGA 4CGIA 4CHZA 1WOQA 3V1OA 4DR3K 2QWPA 4MDAA 1LV5A 4A2AA 2B5JA 2X6NA 4ISFA 3HSTB 4I2PA 1S3XA 4ZTJA 3ZETA 3U3YA 1VQ4N 4C8KA 4H8KA 4FVUA 2B4JA 3WQTA 3KJVA 2Q36A 2DPNA 4RW4A 3AVKA 1IJJA 2ZJPL 3VQ6A 1CXUA 2P5OA 1EQYA 2FBYA 3O1WA 1VQ8N 4FJHA 2RHKA 4BE2A 5CZ2A 4CZJA 1JLBA 3THWA 4NCBA 3IUCA 3OS2A 3MXMA 1GLAG 1EX4A 1SL0A 1TKXA 4CD1A 5BPMA 4DSEA 1U2VA 4WYBA 4B1YB 3KKRA 3U9ZA 3VQ8A 3D2EA 4FYDA 3NF9A 1HNZK 5KPRA 5EXWA 4H5TA 1K8KB 2GEMA 4YOVA 4BG9A 4DTJA 1EO1A 3TSQA 3OYLA 1SUQA 4BWJA 2UUCK 5HRNA 2EX3A 5JLFA 3J7YP 4LC9B 2WOMA 4LD0A 2P9LB 3ENOA 4CERA 4R79A 3FZKA 4H5VA 5GAHP 4FWRA 3VQBA 2HF3A 2VCPA 3HI0A 1JJ2M 4H4MA 1ZBIA 4HTLA 3THVA 4WFNL 5M1FA 4IOAL 4DV4K 1E4GT 3QEVA 3A2FA 1LAWA 1RTIA 4BVOA 1BWFO 2VYPA 4FLXA 5FPMA 1HQEA 4BRHA 1QQOA 2Q97A 3THYA 4X65K 4OPKA 2KLAA 4GV3A 1NMDA 3QFPA 4A2BA 4LY7A 3HPHA 5KGWA 3VOVA 1LCUA 2PBDA 1UOCA 4DS4A 4YOYA 4FO0A 3LWLA 3BDPA 1Q9YA 3AA4A 3MWTA 2W42A 3FZMA 1WUAA 3HRGA 4M41A 2HVHA 4CJTA 3QO9A 1RDAA 1VSKA 3VQAA 3NHGA 1SL2A 5KI6A 4DCHA 4YOUA 3ISNC 4B9SA 4K8XA 4F4KA 4GW6A 4V19S 3CD6N 1HPZA 1YTAA 1S1UA 1VSIA 3T1HK 4LFBK 3GG4A 1VRTA 4FWNA 3DAWA 1IBLK 2D0AA 4DKWA 1L3VA 1KSPA 4K8ZA 3IRXA 5FROA 4PHTX 2AA4A 3PUFA 4JV5K 3THXA 4JKFA 2ASMA 4ISEA 1MWMA 3P31A 4XH1A 2YHYA 4B9UA 4BR2A 1XUPO 3C6TA 1IKWA 3HPOA 1YUWA 1LW0A 1SV5A 4IJAA 3CCUN 4DV3K 3O3GA 1ESVA 3UE5A 2W00A 1HQUA 1I3AA 3ZT0A 4FJXA 5HRRA 3W0LA 5D3GA 4KHYA 3HPGA 1HYVA 2E8AA 3IDHA 3CYMA 3C0BA 4JI3K 1TL1A 1T8EA 2VQFK 2D5RA 3PIPL 2QTDA 3TAFA 2F8SA 1DLOA 3BF3A 1FJGK 2X74A 3O8MA 2WTUA 1V4TA 4RW8A 4O5BA 4IFVA 1IH7A 2UU9K 1EWRA 4G9ZA 1OVYA 3DLEA 1WAJA 3E9LA 4OKKA 4FLYA 1RILA 4B1XB 1SAZA 4FZXC 3OYBA 3LALA 3CMAN 1TGOA 2PZSA 4Y0WA 4DV0K 3OS1A 4QS7A 3KWIA 2RE2A 5AQNA 4FLUA 4NCGA 3BUZB 5LMNK 5CZ1A 3WEEB 4FLVA 4DV5K 4Z4GA 2NRTA 4F2SA 1L3UA 1RGIA 1XQSC 3DM2A 3V81A 4Z4HA 4NXMK 2IVPA 2Z1JA 4LSLA 3OYFA 4KI6A 3M3ZA 5AQOA 2VQEK 1T3VA 1BA1A 5DM6L 3H1QA 3V4IA 3VQ9A 1VQKN 2ITMA 1C1AA 3N4QA 3F2KA 1NK6A 4JS5A 2HSTA 3SI6A 3SV3A 1LAVA 2CH6A 4DSJA 2Q1NA 3ZX0A 3DRRA 3HSCA 4BWMA 1YHQN 3EY1A 1VRUA 2E20A 3I0SA 4DG1A 4CJ7A 4M3UA 1U04A 1LW2A 1HLUA 3U6FA 4KAZA 4BVPA 5GAEP 1YITN 2QWMA 3P5JA 2ZJQL 4CF2A 3VN5A 1C0MA 3SLCA 4BGAA 4JD2A 4DSLA 4M3RA 3UIQA 4QS9A 4KHPK 3E1YA 1VSMA 5JVGL 5AZIB 4W5TA 4DFJA 1WB9A 2YHAA 2ITGA 4HWIA 4KFBA 1ASWA 5CE3A 3O1BA 4FJLA 4CF8A 1G99A 2OPSA 4NYNA 4PL8A 2YHBA 3VGMA 3LL3A 4EZ6A 3VQCA 5J2PA 1BCMA 4FLTA 3EZWA 1ATRA 3CPEA 1NKBA 3CI5A 4J2BA 1ZBFA 4O8UA 5I42A 1RT1A 1TYQA 2B6AA 3V9XA 3MDQA 4JAXA 1TAQA 2P9LA 4CVNE 5AQRA 4N56A 3OJUA 4RW7A 1P8ZA 2YKNA 1KQSM 1RT7A 4FJ5A 5AQZA 4JK8A 2D4WA 1KD1O 2D0PA 2YJEA 4CJVA 4Z4CA 2W6KA 2ZF5O 2Q2RA 3T69A 4CK2A 3SCXA 4CGJA 2VWKA 1QS4A 3CG7A 2RN2A 2R7YA 3K5OA 1JLAA 2NZTA 4BRQA 4E89A 3NBPA 4WQ5C 1T44A 4AF1A 5GIOA 3ATUA 3ATVA 4JHDA 3VEXA 3WXJA 5CYMA 2DTUA 1OH8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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