2A41A

Ternary complex of the wh2 domain of wip with actin-dnase i
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 125
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a41A04
3A5NC 4CBWA 3UB5A 2IIRA 2GTDA 5E84A 1HKCA 2VWBA 3QDKA 3FZMA 2AA4A 3JXUA 3ZEUA 1QQOA 2FXUA 2E1YA 3L4IA 5AQIA 3C0BA 2GWJA 1HUXA 1NGGA 1BA0A 1Y64A 3GG4A 4BRCA 3FZHA 2AP1A 4Y0WA 2P9PB 5LY3A 1Z05A 3VPZA 1GLFO 3MN9A 3BF1A 4FPAA 4BC2A 1QQMA 5EOYA 2A5XA 3ZETB 4H0VB 5FPNA 3VERA 4H5NA 1H1VA 1NGIA 3FE1A 3VF6A 4BRKA 3MN5A 3VEVA 5BRDA 2Q1NA 3ZX3A 1NGJA 3D2FB 3FGUA 4MLEA 3MN7A 3WQUA 3MN6A 3O8MA 1K8KB 4GNIA 5AQHA 3WXKA 3C7NB 3VF4A 3FZLA 4CZMA 2P9PA 1MWKA 1U6ZA 3BUZB 3AARA 4H03B 2ITMA 3H1QA 4BQZA 2CGKA 5AQOA 3FZFA 5TKYA 3ZETA 5I9EB 1NGHA 2YHWA 4XH4A 4BR7A 3DWLA 3D2FA 2IVNA 2WUSA 5FPEA 1SAZA 1K8KA 3O1BA 1ATNA 1QZ6A 3ZX0A 5JMVA 3C7NA 1V4TA 1GLJO 1HX1A 3ZX2A 5AZIB 4K42A 4DB3A 2YHXA 3EKUA 5LJVA 2QWLA 3WEEB 2ZWHA 3FR0A 1SQKA 3F9MA 2ASOA 4H0YB 2Q31A 3A5LC 3VGKA 4PL7A 3AY9A 2QWOA 2YHYA 3U8XA 4EFHA 5BPMA 4CBUA 4DHYA 1QHAA 5AZIA 4EHUA 3MDQA 2UYTA 5AR0A 3ATUA 4DQ8A 2ASPA 3HI0A 3WEEA 3BP8A 1EQYA 2J4RA 4RTFD 3B8AX 3VEWA 4CZHA 4FL9A 3M6GA 5AQTA 3TPQA 2GWKA 1QZ5A 3DAWA 3H6EA 4XEIA 3H46O 3O08A 4WQ4C 1LCUA 3TU5A 4CZFA 1GLLO 3ID8A 1YAGA 3CJ1A 3O1WA 1V4SA 4DCHA 1HLUA 3HM8A 4M63C 4CZEA 3CHWA 4JHDA 5EXWA 4FWRA 1ZC6A 4FO0A 3EKSA 2HF4A 4BROA 3L6QA 1HKGA 4MO5A 4BRPA 2IVPA 3MMVA 3VESA 3VEZA 4H5WA 5AQNA 2ZF5O 2A3ZA 4ISFA 5BR9A 1G99A 3KZBA 1KXPA 4ISGA 1NM1A 1QQNA 1R59O 3RSEB 3L0QA 4FPBA 5AQWA 5AQQA 3DJCA 2NLXA 2V51B 4O5FA 3WXJA 4BGAA 5FPDA 5BPLA 2QWRA 1XQSC 3A5MC 4K25A 5ELZA 4MO4A 1GLAG 3QBWA 4BREA 4BRDA 3VOVA 4B1XB 1X3MA 4CBXA 3O80A 3QFUA 4C23A 2OANA 3H3OB 4BGBA 2FSJA 1DGKN 1RDWX 1Q18A 2VYPA 1HKBA 2EWSA 5AQFA 3LL3A 3RSEA 1RFQA 2V7YA 3BF3A 5JICA 2ZGZA 2IVOA 3SMSA 3CJCA 1IJJA 2PAVA 3KVGA 2P9KB 3VEYA 1P8ZA 1YXQA 4BC4A 3WXLA 3HTVA 1E4FT 3LM9A 3CJ7A 3GBTA 2PBDA 2GEMA 2P9IB 2BUPA 5LJWA 2YJFA 4FWSA 4FWPA 5FPMA 3HSCA 5EVZA 5AQSA 2Q36A 5BN8A 2P9KA 3EN9A 4CZJA 2GUPA 3QBXA 4CZIA 3KHYA 1C0GA 3HZ6A 4QS8A 4BVOA 4H0OA 5BRFA 3QICA 3A5OC 3WT0A 2P9SB 4FWOA 5F1XA 2I7PA 1ZBSA 2P9IA 2QWNA 3QMLA 4BRMA 4CZKA 3ENHA 4A2AA 4IXCA 4FOIA 5EX5A 5AQVA 1E4GT 5KPTA 5JLHA 1GLCG 4B1VA 2P9SA 3M3ZA 3LM2A 3HBTA 5AQUA 4FOEA 1BU6O 2A40A 1T6DA 3VENA 4FWKA 3AAQA 2NZTA 1NBWA 2Q97A 4AM7A 2QXLA 1DKGD 1D4XA 2E1ZA 5KQ8A 4BRQA 2W41A 3I33A 3ATVA 1BA1A 1Z6RA 2A6AA 3VGLA 2CGLA 4F9OA 3O6WA 2D4WA 4IJAA 1RGIA 3LDOA 4BRLA 2D1KA 3CIPA 3UE5A 3GDQA 1NGCA 3U9DA 2GELA 3CJBA 3A0IX 4IWVA 4BR5A 1S3XA 3DXKB 2YJEA 5BRHA 4K43A 1C0FA 4ISEA 4CZLA 3CI5A 5AFUA 4FWNA 2NRHA 2P9LB 5CE3A 5B8HA 1WOQA 3VEXA 3VEOA 4YDUA 1IG8A 4A62A 3O5BA 1X9JA 2D0PA 3JS6A 3LDPA 4IJNA 3ULEB 5ADXA 2P9UB 3DXKA 4BRAA 1NWKA 3LDNA 3CJAA 4H0TB 4AM6A 4BVPA 5AFUH 4M7YA 3I8BA 4PL8A 4JNEA 2H3GX 3GL1A 1HJOA 3CJ9A 2V52B 1ATSA 5AQXA 4BR9A 2P9LA 4PKGA 4HWIA 2A42A 3DXMB 5AQPA 1KAXA 1BUPA 1T44A 5ADXH 2E8AA 1XUPO 4A61A 3ULEA 4XH5A 3VGMA 2P9UA 4BR2A 1S22A 2BTFA 3LDQA 3GE1A 3FZKA 1BOTO 3ENOA 4HTLA 4QS9A 3QFPA 4WQ5A 3CQYA 3FLCO 1NGAA 5KPRA 2HMPA 4PKIA 3DXMA 3VF2A 2FLOA 4RWTA 2FF6A 4BG8A 1CZAN 2QWMA 3O4WA 3EZWA 4EAHD 2KHOA 4I6MB 3UKUB 1MWMA 1BO5O 4JD2B 4QS7A 3H1VX 3R6MA 3WXIA 1BG3A 2DPNA 4IZ9A 4NO7A 5BN9A 3S41A 3WUHA 1NMDA 1NGBA 5F0XA 2E2QA 2D0OA 2E2NA 1OKJA 2ZGYA 2QWPA 4MLHA 5AZJB 3G25A 4I6MA 1J6ZA 3UKUA 3FFKB 4JD2A 2F9WA 3UKRB 4PKHA 3IDHA 1U2VB 4RCHA 4BRGA 3A8YA 4BC3A 1DEJA 2F9TA 3QB0A 1WUAA 4CD1A 4CJ7A 1JCGA 2HOEA 2FSNA 4CI6A 3SLCA 2W40A 3EO3A 3CQXA 2FSKA 3W3DA 1T6CA 4FWMA 3CETA 5BPNA 4A2BA 3R9PA 5AZJA 1TUUA 1NGFA 1YUWA 3UKRA 2YI1A 5EY4A 2YCHA 3WQTA 1U2VA 4FWLA 1NGEA 1MA9B 2CH6A 4H0PA 3U9ZA 4LC9B 4BRFA 1GLDG 3AAPA 1KAZA 5AQZA 4BR0A 3EL2A 4FWQA 1NLVA 3IMXA 4BRHA 4BR4A 2QWQA 2ASMA 2E20A 4L3QA 2Q0RA 2E2OA 4YDUC 5KPZA 3H45C 3IFRA 1TYQB 5AQJA 2VCPA 1XC3A 1GLBG 4BC5A 5AQKA 2E88A 3GOIA 2A41A 2V7ZA 1YVNA 4CZGA 4EIAA 2CGJA 4B1UB 3SMPA 4B1YB 2QM1A 4E1JA 5JLFA 5BREA 4IO8A 2CH5A 3J8AA 3D2EB 4NB4A 1JCEA 1TUYA 2I7NA 4GY2B 1NGDA 1TYQA 4XH1A 4BG9A 3R8EA 2FF3B 5F2RA 4BRNA 4Z94A 2P9NB 4H5TA 3BEXA 4JHDB 4WQ5C 4FSVA 1X3NA 2Q0UA 4B1ZA 5AQLA 3SK3A 4B9QA 3OHRA 1SZ2A 3D2EA 2E2PA 3U4LA 4CD3A 5AQGA 5AQRA 3VETA 3D7EO 3M1FA 4H5RA 4J8FA 1ESVA 1JCFA 3MCPA 4H0XB 4JAXA 5E26A 2P9NA 2QW9A 1KAYA 1BDGA 3SJHA 4EHTA 2Q2RA 3P4IA 3MK6A 1GLEG 3CERA 1ZXOA 3H3NO 1LOTB 4WYBA 3ZEUB 4BRIA 4O8KA 3IUCA 4M7XA 3W0LA 3LDLA 2HF3A 5AQMA 4H5VA 4K41A 4WQ4A 4KBOA 5KQDA 1HPMA 4JN4A 1MDUB 4B1WB 1ATRA 4BQLA 1BWFO 5AQYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1A5VA 1U47A 3O9SA 1R0AA 1O13A 1Q8IA 3O3FA 3ZEUA 5HROA 1WSHA 3U3YA 1IBLK 4YY3K 5SWMA 2E1YA 3V1QA 2A1RA 3C0BA 2GWJA 3GG4A 4DV5K 2ZM6K 3OYCA 4DSKA 5KTQA 3ZSWA 4W5OA 4H0VB 5FPNA 3VERA 4H5NA 1JLEA 3MN5A 5BRDA 1WSFA 2Q1NA 1NGJA 4JI2K 3F73A 3QEVA 1HYVA 3VF4A 4FJKA 1BI4B 4YOYA 2KFZA 3BUZB 1S72N 4CHQA 2OZSA 4DSIA 3MX5A 4XH4A 4BR7A 1RBTA 3BZKA 3DWLA 1O1WA 4DQQA 2WUSA 4DR2K 4IEEA 4M3RA 3AO1A 3E9PA 1HJRA 4ELVA 4GVMA 1KVCA 1GLJO 4RW9A 4E7IA 1LW2A 4GKKK 5LJVA 1WSJA 2ITGA 1UOCA 1D5AA 2ZWHA 3M8PA 3NF8A 3P1GA 1ILYA 1VSHA 4H0YB 4CESA 4KPYA 2X78A 3A5LC 4PL7A 1YVUA 2VGNA 3AY9A 3U8XA 5BPMA 1Q9YA 4B9TA 3J7AP 3QERA 3MDQA 3C6TA 1IBKK 2ASPA 3WEEA 2O8BB 3B8AX 4CJVA 3IRXA 3T69A 1ZBFA 3TPQA 1SL0A 1FW6A 4AF1A 4DTNA 3H6EA 4XEIA 4MQ3A 1VQ7N 1GOBA 1EETA 4WQ4C 4FYDA 2QA4N 3NVKA 1B92A 1C1BA 3KD1E 1YAGA 3O1WA 4M63C 4PWDA 4CZEA 4C1NI 3AVIA 4JHDA 3ZSVA 4KHPK 3L6QA 1HKGA 4N47A 1RTJA 2WC9A 3N4QA 4CGFA 3KKRA 4FXDA 5AQNA 2A3ZA 3E9OA 3C6HA 4ISFA 4G9ZA 3CCJN 1RT7A 2HSTA 2G8VA 1QQNA 4AHVA 2XHBA 3DJCA 4DV6K 5BPLA 2QWRA 5C42A 4J2AA 4FK2A 2YX6A 1RDAA 1XQSC 5ELZA 3A5MC 4JK8A 3SPYA 3DLHA 4BEBA 3WNEA 4JI8K 4B1XB 1VQON 2KQ2A 1DGKN 3HL8A 1D8YA 3SAHA 3LL3A 5M1NA 2V7YA 3QIPA 4IBNA 4CIEA 4LF7K 4C8KA 2PAVA 1JLQA 1EKEA 4C8OA 4O5BA 1P8ZA 4C1NK 1YXQA 4BC4A 3CFPA 3WXLA 1HPZA 1YJWN 3PIOL 1E4FT 3CJ7A 1TAUA 4DV1K 4UY8O 2YJFA 3ZT4A 3NVMA 2IS3A 4FZXC 3VTIA 5M1OA 2WBNA 1OH8A 3TAPA 3QBXA 2UUAK 2HNDA 2FBYA 2HBMA 4QS8A 4BVOA 5BRFA 5DM7L 5F1XA 2HMIA 2O8EA 4HUEA 4DTPA 4BRMA 4IG0A 3ENHA 4A2AA 4J2EA 3RMCA 4FOIA 5GADP 1TL1A 3WNFA 2G8FA 5AQVA 4ILHA 5JLHA 1GLCG 3TSQA 5AQUA 1RBRA 3OYFA 1C0UA 4PUOA 2A40A 3LAMA 2HVIA 4CERA 5FDLA 1BIUA 1UA0A 4FWKA 2IDOA 4KHUA 1HNVA 3AGRA 2QXLA 3SZ2A 1NJIO 5LMUK 3NDKA 1VSMA 3OYLA 5KQ8A 2UXBK 2QI2A 2WTUA 4DTJA 4IDHA 2A6AA 4B3RK 3G6EN 3SI6A 3VGLA 3O6WA 4FJNA 2QKBA 4KV8A 1WLJA 1RGIA 3LALA 5J2NA 3LDOA 3NGIA 2YKMA 4BWJA 3GDQA 5KRTA 1VHXA 2ZE2A 5EU7A 4B08A 5C0YA 4E1MA 3DXKB 3KD5E 3SCXA 3WNHA 4CZLA 3THWA 4CF2A 5AFUA 1BIZA 4DR5K 1N36K 1NJXA 4Z0UA 3SYZA 2NRHA 1HYSA 3OS0A 1WB9A 1IG8A 1BHLA 2XY5A 2W6KA 3O5BA 1X9JA 2D0PA 5ADXA 4BRAA 4B9UA 4AM6A 4DF4A 3ZCMA 3I8BA 4PL8A 4BDYA 1SV5A 3J7ZO 4B3SK 2E5LK 1ATSA 3THYA 2PYJA 1CZBA 2A42A 3CFRA 1BUPA 1S6PA 1IBMK 3O4QA 1L3UA 1XUPO 4XH5A 2P9UA 4BR2A 2OPPA 1S22A 2BTFA 1GOCA 4OJRA 5HBMA 1JLFA 3FLCO 1EX4A 2HMPA 3U3GA 4PKIA 3DXMA 4DQSA 3VF2A 1XHZA 2FLOA 2XO7A 2FF6A 2O4GA 4DV0K 4CJ3A 4YOTA 3AGKA 3NH1A 4EAHD 4I6MB 3VTHA 4UQGA 4JKHA 4AHSA 3DI6A 2VG5A 3R6MA 3TAEA 3RR7A 1FJGK 1RT1A 2DPNA 4E3SA 5JVHL 5CYMA 2YNHA 3WUHA 1SKWA 1HQUA 4CHOA 2E2QA 3QLHA 2D0OA 1OKJA 4W5RA 4GW6A 2JWKA 3FFKB 2RF2A 4CJTA 3Q7CA 4PKHA 4CF0A 3SJJA 2VQFK 5BR8K 3HPGA 1QSSA 2F9TA 4NXNK 1RTIA 4CJ7A 3TTCA 1ZBHA 4EP4A 2W40A 2ZJRL 4JKFA 3THXB 2LSNA 4FWMA 3CETA 3NE6A 3L8BA 5AZJA 4FVUA 1TUUA 3HRGA 1RBSA 3KLEA 1NJWA 4E1NA 5JENA 3DLGA 4LC9B 3F2KA 3AVBA 1SKRA 3MEGA 2HHUA 4BE2A 2QWQA 2ASMA 2E20A 3CCVN 1HQEA 5AQJA 1XC3A 1GLBG 1NK5A 4BC5A 3OS2A 4CFCA 3ZSOA 3GOIA 2CGJA 3EY1A 4OKEA 3L2QA 1TUYA 2Z1HA 4GY2B 4YORA 5JS1A 2HHTA 2JLEA 4XH1A 4JRPA 1RDBA 4LFCK 1TL3A 5F2RA 4BRNA 2P9NB 4H5TA 4EZ9A 3BEXA 1HNWK 4WQ5C 2O4IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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