2ASMA

Structure of rabbit actin in complex with reidispongiolide a
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 363
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asmA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asmA03
5AQXA 2QWLA 4JN4A 3H6EA 2YI1A 5EX5A 3B8AX 1GLEG 1XUPO 4K42A 1QQNA 3L6QA 2QM1A 4DHYA 3LDQA 3FZHA 3CJ1A 2YHYA 4DQ8A 4CBUA 3BF1A 1QQMA 5F2RA 3WQTA 2D4WA 2I7NA 2D0PA 1WOQA 3WUHA 1MA9B 1QZ5A 1J6ZA 3M3ZA 1D4XA 4QS8A 2IVOA 4O5FA 4FWSA 2QWMA 1YUWA 4H5TA 2HF4A 4CD3A 4FWNA 3L0QA 2IIRA 2A5XA 3O4WA 4BRPA 2OANA 4I6MA 4K43A 1BO5O 3R6MA 3TPQA 1Z6RA 5AQTA 1MDUB 3BF3A 4BG9A 3CHWA 2GUPA 5ELZA 1NM1A 4EHTA 2E2PA 3MMVA 3H45C 4A61A 3MDQA 3D2FB 4EHUA 5TKYA 1BU6O 3JS6A 4HWIA 1BWFO 4BR2A 3WQUA 3GE1A 4JHDA 3VEWA 3FZMA 4BR0A 3HI0A 3WEEB 3M6GA 4RCHA 2Q31A 3KVGA 4BC2A 2E20A 3IFRA 2ZWHA 1LCUA 2E2QA 3ZEUB 3VGMA 1NGHA 3FE1A 3MN6A 1T6CA 2I7PA 4BC3A 4CBWA 1NBWA 3ID8A 1NGCA 3VENA 4BRIA 3OHRA 4XH5A 4FWMA 4BC4A 2VCPA 2H3GX 4BGAA 2QW9A 4IJAA 3SMPA 4L3QA 2FF6A 3W0LA 5JMVA 3ATUA 3F9MA 3TU5A 1TUUA 2E8AA 3LDNA 5E26A 1ATRA 4BRFA 2P9LB 3KZBA 3O6WA 1GLLO 3U8XA 4BRGA 4XH1A 4K41A 3C7NB 2E2OA 2P9NB 2E88A 4FO0A 3A5LC 2WUSA 3DWLA 2QWPA 4M63C 4PL8A 4GNIA 5BPLA 1YAGA 3P4IA 5KQ8A 1ATSA 3LM2A 5AQLA 4BR7A 4BR5A 5EOYA 3R9PA 1HPMA 1NGJA 2P9SB 5LY3A 4BVPA 3ZX0A 2Q2RA 4WQ4A 1EQYA 4PL7A 4B1WB 4LC9B 1RGIA 3CQXA 2ZGZA 2FF3B 4H5RA 1SAZA 1U2VB 3GG4A 2W41A 4A62A 3L4IA 3QMLA 3I33A 4BC5A 3VPZA 3AARA 3D2FA 2V52B 1IG8A 5AQGA 1KXPA 4BRMA 4BR4A 1Q18A 3DAWA 3SLCA 3WEEA 3UKUB 3DXKB 1ZC6A 3VGKA 5BPMA 2E1YA 1YXQA 3FZKA 4BRHA 2FSKA 3ZEUA 3EL2A 3ZX3A 4YDUA 3WT0A 4BQZA 4CZIA 4JD2B 1CZAN 4PKGA 5AQYA 1HKCA 2P9UB 3O80A 1T44A 5JLFA 1GLBG 4BG8A 1NGEA 2ASPA 4CBXA 3IUCA 4Z94A 5AZIB 4FPAA 4RWTA 1LOTB 1MWMA 4EFHA 1R59O 1ZXOA 5AQIA 2QWOA 1H1VA 4WQ5A 3AAPA 3LDLA 5AQSA 3BEXA 2P9LA 2CGLA 3O1BA 4WQ4C 4Y0WA 3EKSA 3C7NA 3BP8A 2VYPA 2P9NA 3CIPA 3ZX2A 4M7XA 5E84A 3U9DA 4QS7A 1E4FT 1DEJA 4H5VA 2KHOA 1GLAG 4NO7A 3UKRB 4ISFA 1NGAA 4B1UB 2NRHA 3O08A 2GWKA 5AQHA 3EZWA 3H3NO 2ASOA 2P9SA 5AQNA 2DPNA 1NGIA 5AFUH 3LDOA 3QFUA 4CZFA 2GWJA 5EY4A 5LJVA 4EAHD 2BUPA 4FOEA 1U2VA 4H0YB 4YDUC 3FZLA 3VGLA 3QFPA 3WXKA 4CZGA 2YCHA 1HKBA 5F1XA 3ULEB 2QWQA 2YHWA 3VEZA 2Q0UA 4B1YB 1GLCG 4BRQA 3AY9A 3VERA 4B1XB 2QWNA 1QZ6A 4IWVA 4K25A 3JXUA 3UKUA 3DXKA 3HSCA 4MO4A 1SZ2A 2F9WA 1RDWX 2FLOA 3KHYA 4B1ZA 3QICA 4WQ5C 1NLVA 3MN7A 5BRFA 4PKIA 4CD1A 2YJFA 5BRHA 4JD2A 4CI6A 5AFUA 1BA1A 1ATNA 5AQWA 2P9UA 3U4LA 3IDHA 2PBDA 4FWQA 2AA4A 3HTVA 1S3XA 3O5BA 5AZIA 5AQOA 3GL1A 2J4RA 2V7ZA 4FPBA 5FPNA 3VF6A 2HOEA 4MLEA 5BN9A 4BREA 3QBWA 1E4GT 2A40A 3CQYA 3RSEB 4BRKA 4A2AA 5F0XA 5AQVA 3CJ7A 5JICA 2NZTA 1X9JA 4CZLA 3VEVA 3O1WA 2IVNA 1V4TA 2CGKA 2ITMA 1G99A 3A5MC 1NGFA 5BN8A 3UKRA 2D0OA 4A2BA 2NLXA 4CJ7A 3SK3A 1HLUA 1NMDA 3A5NC 1JCGA 5LJWA 4CZHA 1MWKA 1S22A 4XH4A 5AZJB 5FPEA 3HM8A 5BRDA 4JAXA 2FXUA 2GTDA 3D2EB 1HKGA 4IXCA 5AQUA 4AM6A 4FL9A 3EO3A 4B1VA 2CH6A 3ULEA 3H1QA 3QBXA 1DGKN 5AQRA 3LM9A 3FGUA 2ZGYA 3MCPA 5EXWA 2P9KB 3W3DA 4CZJA 2CH5A 5KPTA 2Q1NA 4F9OA 4BGBA 3EN9A 3ZETB 3FFKB 4IZ9A 3FZFA 5BR9A 3H1VX 3G25A 4HTLA 3WXJA 1ZBSA 2EWSA 2CGJA 4H0VB 3J8AA 5AQQA 2P9PB 3VOVA 3AAQA 3C0BA 3LDPA 5KPRA 4PKHA 3WXLA 3DJCA 4H0TB 1NWKA 4JNEA 5BREA 4FWOA 4FOIA 2A42A 3ENOA 4BRCA 4FWLA 2Q97A 3U9ZA 3D7EO 3CJ9A 1X3MA 3RSEA 3IMXA 5KQDA 4NB4A 1OKJA 3FR0A 1GLFO 2FSNA 3VETA 3LL3A 2HMPA 3CJBA 5B8HA 4H0OA 4M7YA 2YJEA 4FWRA 4MLHA 3VF2A 3A5OC 2P9IB 3DXMB 1RFQA 1HUXA 1WUAA 5FPMA 1NGDA 2W40A 4C23A 1HX1A 2PAVA 4MO5A 2VWBA 1GLDG 3CERA 1JCEA 1SQKA 3H3OB 4E1JA 3VF4A 1K8KB 4IO8A 4H5WA 4B9QA 2V7YA 2QXLA 1TUYA 1V4SA 1XC3A 1U6ZA 1IJJA 3CJCA 5AQFA 4KBOA 5AZJA 4RTFD 4BVOA 1KAXA 3I8BA 3D2EA 5AQPA 4DCHA 1P8ZA 5KPZA 3MN5A 1TYQB 4H03B 3MK6A 1NGGA 2GELA 1XQSC 5ADXH 2P9KA 3SMSA 4BQLA 4BRAA 1BG3A 3M1FA 2IVPA 3CETA 3ZETA 5BPNA 3UE5A 4O8KA 3FLCO 4FSVA 4BRDA 4BRLA 2A41A 3VEOA 3VEXA 3GDQA 4J8FA 1Z05A 2P9PA 4BRNA 1C0FA 3GBTA 3VEYA 1YVNA 2D1KA 4CZKA 3BUZB 5AQMA 4EIAA 1NGBA 2Q36A 1KAZA 1BDGA 1QHAA 1KAYA 4BROA 3CI5A 4DB3A 2GEMA 4FWKA 3SJHA 2E1ZA 3VESA 5AQKA 3UB5A 4FWPA 1BA0A 4CZMA 5ADXA 3ENHA 5JLHA 1BUPA 4XEIA 5FPDA 1X3NA 4H0PA 3WXIA 4H5NA 4I6MB 2UYTA 3MN9A 5AQJA 2ZF5O 5EVZA 1QQOA 4BR9A 5AQZA 2P9IA 3DXMA 1C0GA 2HF3A 4ISGA 3GOIA 3QDKA 3A0IX 3S41A 5AR0A 1BOTO 1JCFA 2ASMA 4CZEA 5I9EB 4AM7A 1K8KA 3CJAA 4JHDB 4QS9A 2A6AA 4IJNA 2A3ZA 2Q0RA 3HBTA 1GLJO 4WYBA 3H46O 3QB0A 4GY2B 3R8EA 5CE3A 2QWRA 2YHXA 2F9TA 2FSJA 1DKGD 3O8MA 2BTFA 3HZ6A 1ESVA 1HJOA 1T6DA 1Y64A 2E2NA 3A8YA 3ATVA 4H0XB 1TYQA 2V51B 2AP1A 3EKUA 4ISEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DWIA 4E7IA 3H6EA 3P83D 1ZBHA 5J2PA 3AV9A 1YJWN 4I7FA 1ZBIA 4K42A 2DFHA 4JK9A 4DHYA 1KC8O 4LF5K 1KVBA 2YHYA 1NK6A 1QQMA 3DOKA 2D4WA 1NK4A 4FJHA 2KKZA 2D0PA 3L4QA 1C6VA 3J7ZO 2UXBK 1MA9B 3L2UA 3K57A 4PQUA 3T1AA 4FWSA 3H08A 3PLAA 3CFRA 1FXXA 2IIRA 2G8IA 4E1NA 3ZYYX 3O4WA 1BO5O 3TPQA 4TSXA 4CK2A 3THYA 3R3LA 4FVMA 2E2PA 4KHNA 3RVCA 1T03A 4GW6A 4FLTA 3NBPA 4CCHA 3JS6A 2YHAA 1BWFO 3DLGA 3LP3A 1NG9A 3FZMA 3M6GA 4FLUA 3AVIA 4BC2A 3HM9A 2E20A 4JKGA 3MXMA 3OA9A 3C6HA 4DU4A 3U3YA 1TKXA 2Y1IA 3PUFA 1JLAA 4BRIA 1OVQA 1QSLA 2D0CA 4BC4A 4CJQA 3CPEA 3LDSA 4IJAA 1HJRA 4B3RK 5KGWA 3SMPA 2W42A 3SQ4A 3HVRA 5JMVA 2NRVA 3P5JA 3ATUA 4KI6A 3F9MA 3TU5A 1OH8A 1TUUA 3LDNA 1ATRA 1VQLN 5LMNK 4ILHA 4XH1A 3CCMN 4LF9K 2E2OA 1SUQA 3KKSA 4FK0A 3SQ1A 1RT3A 2HHSA 5BPLA 1WAFA 3BZKA 1M90O 3AVFA 3J7AP 3IRXA 2OYQA 4RG8A 4LF6K 3R9PA 3NDKA 3Q7CA 4LH4A 2P9SB 4JKFA 4BVPA 4NCGA 4LC9B 4DF4A 4UY8O 2ZGZA 1YHQN 3AA4A 2XY7A 3QMLA 2HHTA 2G8FA 3T7ZA 1U49A 2V52B 2BANA 4CJKA 4BRMA 4W5RA 4BR4A 4CFAA 1TL1A 1P90A 3SLCA 4LFBK 3SNNA 3UKUB 1J5OA 4J2BA 3RR8A 3CPWM 2XRIA 4BRHA 5GIOA 3ZX3A 4N47A 4YDUA 4CF9A 4CZIA 1SS6A 4DFMA 2C1GA 1HQEA 1T44A 5GINA 1ITGA 4YOYA 1GLBG 4Z0UA 3OYDA 4RW8A 3AVHA 4NLCA 4Z94A 2WC9A 4RWTA 1MWMA 4EFHA 1ZXOA 3T69A 4DQIA 4IKFA 3NVMA 4WQ5A 3AAPA 3BEXA 2CGLA 4Y0WA 3BP8A 3ZX2A 4M7XA 2FBTA 4QS7A 3TSUA 4H5VA 5M1OA 1FKOA 1UA1A 1Q86O 4AHSA 4DV4K 3PV8A 3SQ0A 3SI6A 3H3NO 2ASOA 2P9SA 2GWJA 4B3SK 3CF5L 5EY4A 2BUPA 4FOEA 4H0YB 4YDUC 3FZLA 4BE7B 2HNZA 5F1XA 1HKBA 3KWGA 2HHHK 5E41A 4RW9A 3V1RA 4IEEA 4OPJA 4YOVA 3HL8A 2C1IA 2Q0UA 2NRWA 1GLCG 4BRQA 4DTNA 4E89A 3VERA 2PY5A 5M1NA 3UKUA 1Z25A 2I5JA 3CCRN 3VQDA 1VQKN 3NFAA 2FLOA 4F4KA 4JI2K 4WQ5C 2KZMA 3AVCA 4BDYA 5BRFA 1N6QA 2YJFA 2XY6A 4C1NK 5AFUA 4Z4IA 3R1XA 4GV3A 4KKOA 2AA4A 3HTVA 1S3XA 1N33K 3K2PA 5AQOA 1JLFA 1ASVA 5FPNA 2HOEA 4IG3A 4BREA 4YY3K 4WFBL 1E4GT 2A40A 3RSEB 3WXMB 4A2AA 3THXB 5AQVA 4CIEA 3J7YP 1W0HA 4B9UA 2WOMA 4CZLA 4A5AA 2ZJPL 3TABA 3KLIA 3CXCM 2YV0X 4LSNA 2GBZA 2CGKA 2ITMA 1G99A 4HTUA 1HR0K 5AJ3K 3HPHA 3LAMA 2O8CB 1EX4A 4FJIA 4AHRA 4B3OA 2AJQA 1HLUA 4CGGA 4WFAL 1JCGA 3OBYA 1EP4A 3CCVN 1VRUA 3L2VA 1G15A 5AZJB 2NNWA 4ISEA 1YVUA 3CG7A 3CCJN 5AQUA 4AM6A 1KVCA 3AO3A 1VQON 4KHQA 4OGCA 5C25A 4YOXA 4H8KA 1QSYA 4H4MA 4O0IA 2ZGYA 4PY5A 3I0SA 3EN9A 2OPQA 3TTDA 3FFKB 2P5OA 3C94A 4E7JA 4CFBA 3H1VX 3OJUA 4DR1K 1RT6A 1JXEA 2EWSA 1A5WA 1HNVA 4LFAK 2EX3A 1WSHA 4CJ3A 3LP0A 1O13A 4OPKA 3LDPA 3CM5A 1YTAA 1Z26A 1C1CA 3CC2N 4FWOA 2RPIA 3C65A 4O55A 2YNIA 3PY8A 3ENOA 1T05A 3TI0A 3RSEA 3ZCMA 3IMXA 3THXA 4AHUA 1OKJA 3NCIA 1Q9YA 3TAQA 2QK9A 4KB1A 4H0OA 4M7YA 4IOAL 4OX9K 2JGUA 3I0RA 3VF2A 3A5OC 4DV2K 3BGRA 4I9LA 4E0DA 1HUXA 1WUAA 4ELVA 1RTJA 4JI4K 3IG1A 3VQBA 5HRPA 4DTJA 3DOLA 1JCEA 2O8CA 4N56A 4CF1A 3CCSN 4IO8A 3ZT1A 4OPHA 3OYGA 4H5WA 4JKBA 4Z4GA 3P31A 2V7YA 2X6SA 1V4SA 4DS4A 3SPZA 5AZJA 2YNGA 5IWAK 1P8ZA 5KPZA 4LF4K 3DLKA 1U45A 2GELA 5ADXH 1YJ9N 1BG3A 1XHZA 2QA4N 1DTQA 4O8KA 1M1KO 2IS3A 2WONA 3TR8A 4DQQA 2HBLA 5GAGP 2O8BB 1NK9A 2W6LA 1FK9A 1YVNA 3AO1A 4FJJA 2D1KA 1VRTA 1N8RO 4G1QA 3BUZB 5AQMA 4OLAA 2Q36A 3CCEN 1BDGA 4CESA 4NCAA 4DB3A 3O9TA 2YKNA 1IKWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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