2ASOA

Structure of rabbit actin in complex with sphinxolide b
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asoA03
4QS9A 5AQVA 4O8KA 1YXQA 1SQKA 2V52B 1NGCA 1J6ZA 4F9OA 3H1QA 2CGKA 4NB4A 1TUYA 3WQTA 4WYBA 1K8KA 4IZ9A 1HKCA 3HSCA 3SLCA 3ULEB 1U2VB 4PL7A 4H0TB 5AQMA 3L4IA 2DPNA 5AQPA 2J4RA 1T6DA 1MA9B 2YJFA 2ZF5O 3QB0A 4GNIA 3VGLA 5EOYA 3A0IX 3IUCA 1QZ6A 3CQYA 4H5TA 1NGJA 5FPEA 1YVNA 2E2PA 4ISFA 4BVOA 4ISEA 3L0QA 4CD1A 4IWVA 4AM7A 1WUAA 5KQ8A 3GOIA 5BPMA 1CZAN 4QS7A 1BU6O 4FWQA 4JAXA 3RSEA 1NWKA 3CJ7A 4PL8A 3G25A 4CI6A 2QWNA 3IDHA 1JCFA 3CJ1A 3MK6A 3BF1A 1SZ2A 3WXJA 4NO7A 4XH1A 3TU5A 2P9SB 2ASOA 2QXLA 3ATVA 3VF6A 4B1VA 2IVPA 4WQ5A 4CZHA 3SMPA 4BR0A 4BRPA 4DB3A 1ATRA 1NGBA 2WUSA 2A42A 4EHTA 5EXWA 4I6MB 3IMXA 3IFRA 4BRFA 5AQTA 3WQUA 3O8MA 1GLDG 2HOEA 5FPMA 3H46O 4C23A 4H5RA 4BQZA 3QFUA 1GLJO 3LDQA 5BPLA 5KPZA 4FWKA 4FPAA 4FWNA 4BR4A 3UKUA 4CBXA 3M3ZA 3LDNA 5BN8A 1ATNA 5AZIB 4BQLA 2YCHA 2QWMA 1Y64A 3LDOA 1BO5O 2IVNA 1JCGA 3LDLA 4CZMA 4LC9B 4BREA 3UKRB 3TPQA 5AQIA 4EFHA 5AQWA 2GWJA 1XUPO 4KBOA 3HTVA 3ZETA 4BRGA 5BRFA 2GUPA 3AY9A 1TUUA 1WOQA 1ZBSA 2W41A 5EX5A 5AZJA 2FF6A 2VYPA 4B1XB 1QQOA 3KVGA 3FZLA 4GY2B 1DGKN 4BR2A 3S41A 2YI1A 1RGIA 4XH5A 2AA4A 1QQMA 4XEIA 1X3NA 4WQ4C 1P8ZA 3O80A 2V7YA 2PAVA 3B8AX 3ATUA 4B1ZA 1NGEA 1BWFO 4JNEA 4BRCA 4CD3A 4H03B 1S22A 2HF4A 2PBDA 4BRDA 2CH5A 3F9MA 4DCHA 2BUPA 3ENHA 4FOEA 5AQJA 4MLEA 1NGIA 1JCEA 1BOTO 1GLFO 3RSEB 4BRKA 4JD2A 1NBWA 4RWTA 2QWQA 4H0VB 3ZEUA 2A3ZA 1HLUA 5BN9A 2ZGYA 3AAPA 4EIAA 2P9PA 3MN9A 4JHDA 1GLLO 1HUXA 1KAZA 1SAZA 1Q18A 5JICA 2V7ZA 3A5NC 4BC2A 3LM2A 4A61A 1GLAG 3MMVA 5AQFA 5I9EB 4HWIA 3A5OC 3W3DA 3FFKB 4IJAA 1OKJA 1ESVA 3FZFA 3JXUA 4CZEA 3MN6A 4FWMA 3CETA 3FGUA 2E1ZA 3SJHA 3VERA 4BG9A 4RTFD 3UKUB 2A41A 5LJVA 4BC4A 4ISGA 4BC5A 3O1BA 3BF3A 1BG3A 1EQYA 3QDKA 3CERA 4FWPA 3VF2A 2OANA 4HTLA 5FPNA 3CJ9A 3QMLA 2E20A 4CBWA 3ZX0A 3DXKB 2H3GX 3ZETB 1C0FA 3EKUA 2GELA 3LM9A 4BR5A 1YAGA 5AZJB 2FF3B 4E1JA 1LOTB 2P9NB 3A5MC 1DKGD 3VEVA 5KPRA 5AFUH 3P4IA 4B1WB 1ZXOA 1V4TA 2I7NA 3CIPA 4B1UB 1QQNA 2A6AA 3CQXA 3BUZB 2QM1A 3EKSA 4K41A 3I8BA 1V4SA 3WXIA 4IJNA 2E1YA 3U4LA 5E26A 3FZMA 2Q97A 3FE1A 3M1FA 3GE1A 1NGAA 5LJWA 2P9UA 3DXMB 2P9IA 4H5VA 3VETA 5ADXH 3H45C 3HM8A 4JD2B 1S3XA 3D2EB 1BUPA 4IO8A 4AM6A 3ZEUB 5AQNA 3H6EA 5BR9A 4FL9A 4JN4A 2P9PB 4JHDB 4O5FA 5AQLA 4BRMA 4M63C 3AARA 4BGBA 3SK3A 3CI5A 3DXKA 4CBUA 3WXKA 1HPMA 4XH4A 3O5BA 2IVOA 3MDQA 2A5XA 1ZC6A 3UKRA 5EVZA 3DJCA 3QICA 1NMDA 4B1YB 1C0GA 2P9NA 2AP1A 3HZ6A 3ID8A 3VEXA 4EAHD 2CGJA 5AQRA 2NRHA 1RFQA 4FWSA 2FSJA 3H1VX 1Z05A 5JLHA 1E4FT 5ELZA 5CE3A 1NGDA 1RDWX 2Q31A 2FXUA 5AR0A 2E88A 3GBTA 1NLVA 5AQXA 3R9PA 3HBTA 2GWKA 5BREA 4FWLA 5KPTA 3FZKA 3CJBA 3DXMA 2E2OA 4BRIA 5AQSA 4CZFA 3VEOA 1KAYA 3D2EA 3R8EA 2P9LB 1QHAA 4CZIA 3BP8A 4FWRA 5AQGA 2QWOA 1QZ5A 3WEEA 3VEYA 5AFUA 1HX1A 4YDUA 5AQHA 5BRHA 1YUWA 1BDGA 2QWLA 2QWRA 4A2BA 3U9DA 3ZX2A 2E8AA 5AQOA 5JMVA 4BROA 4A2AA 2QWPA 2ASMA 3L6QA 3VOVA 1X9JA 5AQQA 1MWKA 4BRLA 3GDQA 2NLXA 5EY4A 2W40A 4DQ8A 4A62A 3D7EO 2D4WA 1Z6RA 2P9UB 5ADXA 3VEWA 1NGGA 2P9IB 2V51B 4DHYA 5F0XA 4M7YA 4BR7A 4FO0A 3VGKA 3MCPA 2Q1NA 2D0OA 4BRQA 2F9WA 4BG8A 3C0BA 3O6WA 1NGHA 2YHYA 5TKYA 1BA0A 4K25A 3D2FA 3O1WA 2P9KA 4PKHA 3MN7A 2BTFA 4H0YB 4H0PA 2P9LA 2UYTA 4PKGA 1HJOA 1X3MA 3R6MA 3QFPA 2E2NA 2YHXA 2FSNA 1MWMA 4PKIA 4FOIA 4K42A 5LY3A 2Q0RA 3H3NO 3U8XA 4B9QA 3CJAA 1G99A 2KHOA 3A5LC 5BRDA 3FR0A 4WQ5C 3CJCA 3GL1A 5AQYA 1GLEG 4BGAA 2VCPA 4QS8A 1LCUA 2YHWA 1GLBG 2FLOA 3C7NA 3VEZA 4BRHA 3CHWA 2ASPA 4CZKA 3I33A 1T6CA 2D0PA 1TYQA 1H1VA 1R59O 3WXLA 1IG8A 4BR9A 3SMSA 3W0LA 3LL3A 4CZLA 2ITMA 3ZX3A 5KQDA 1MDUB 2ZGZA 2YJEA 3VPZA 4BRNA 4RCHA 3ULEA 1ATSA 1U2VA 3EN9A 4H0XB 3WEEB 4M7XA 3KZBA 1DEJA 2Q0UA 4FPBA 1XQSC 4K43A 5F1XA 2FSKA 2HF3A 2I7PA 3WUHA 4FSVA 5AQKA 4BVPA 2CGLA 3O4WA 2D1KA 3OHRA 3GG4A 5AQUA 4BC3A 3A8YA 1KAXA 4H5NA 2A40A 3LDPA 5FPDA 3EZWA 2VWBA 3ENOA 3H3OB 2GTDA 3EO3A 4Z94A 3VF4A 1HKBA 3UE5A 1NGFA 2GEMA 5BPNA 1XC3A 3WT0A 3DAWA 2ZWHA 2E2QA 3QBWA 3O08A 1K8KB 1KXPA 2P9SA 3AAQA 3MN5A 3UB5A 4WQ4A 4CJ7A 3D2FB 2P9KB 3QBXA 4MO5A 3KHYA 1U6ZA 1BA1A 2IIRA 4H5WA 1NM1A 4I6MA 4BRAA 1HKGA 2NZTA 3JS6A 3DWLA 2QW9A 5AQZA 2EWSA 4CZGA 3J8AA 4MLHA 3BEXA 4FWOA 4MO4A 4CZJA 5B8HA 5E84A 3HI0A 4EHUA 3U9ZA 4Y0WA 5AZIA 5F2RA 4YDUC 3VESA 1E4GT 4H0OA 3VENA 5JLFA 4J8FA 2F9TA 1T44A 3FLCO 3VGMA 2HMPA 3C7NB 2Q36A 3M6GA 2CH6A 4L3QA 1D4XA 1GLCG 2Q2RA 1TYQB 4IXCA 3FZHA 3EL2A 1IJJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RTDA 4O8KA 1SQKA 3HXMA 1OH8A 2G8HA 4K0KK 2WC9A 1J6ZA 3L2UA 3H1QA 2O4GA 4NB4A 1XMOK 3SLCA 3CCEN 2E5LK 2QXFA 2GBZA 3ZT2A 3FFIA 1YJ9N 2YJFA 3K9KA 3CC7N 4FLUA 4FW2A 5EOYA 4DS5A 4V19S 4KH5A 3K59A 5HBMA 4W5RA 2EHGA 4ISFA 1C0TA 3L0QA 3WNEA 1F21A 5KQ8A 2FBXA 4GVMA 4CERA 3VQBA 3GOIA 2FBYA 4JKBA 1BU6O 4BDZA 4FWQA 3THWB 3TSUA 1JCFA 3BF1A 2F4VK 4Z4FA 4B9TA 4X64K 3VF6A 4KHNA 4B1VA 4JI3K 2IVPA 4JKHA 4CZHA 1RILA 4BR0A 4E7KA 1VSIA 4DB3A 1NGBA 1LWEA 2WUSA 3P38A 2P5OA 4CF9A 4I6MB 3SQ0A 3AA5X 1QSSA 5AQTA 3WQUA 3V81A 3LP1A 3H46O 4FJ7A 5FRNA 4H5RA 1RBTA 3LDQA 5KPZA 3NH0A 2KKZA 2W00A 1BCOA 3CMAN 4KTZA 4X62K 3T69A 1RBUA 1QSYA 2IS3A 2HHIA 2IVNA 4CZMA 4JK9A 3JYTA 3V9ZA 4EFHA 3T3FA 2OPSA 4KBOA 4MDBA 2PZSA 3PX6A 4BRGA 3CCRN 3SV3A 1ILYA 4BDPA 1HJRA 2XO7A 4DSJA 4JK8A 3NE6A 3S41A 2HMIA 1LAWA 3SPZA 4W5TA 2OPQA 4FM2A 4FYDA 1RTJA 4XEIA 3KD5E 1X3NA 3AO1A 1D8YA 4YOXA 4DU3A 4GKJK 3O80A 2PAVA 1BWFO 4BRCA 4CD3A 3SI6A 4CEAA 4H03B 1S22A 1SS6A 2HNDA 2PBDA 3KLIA 1BL3A 1OH7A 3QO9A 2CH5A 3F9MA 3O3HA 4FK0A 1WNSA 1NGIA 3F2KA 3AVHA 3RSEB 4BRKA 1TL3A 5J1EA 4Z4HA 1YTAA 4HCCA 1WB9A 4O5BA 5JENA 1C0UA 4JHDA 1NKCA 4X66K 4CVNE 1S1XA 5JICA 2V7ZA 5LMUK 1S6PA 3E66A 4XIUA 4RW8A 4BC2A 4A61A 3K58A 1GLAG 1VK0A 1Q86O 5I9EB 2G8VA 3W3DA 4IJAA 1VQLN 1BQMA 2WBNA 1Q81O 4FWMA 2E1ZA 4RTFD 3UKUB 4A57A 2DY4A 4JI8K 3L3VA 4JK7A 4DFKA 4FJ5A 3Q7BA 4CEZA 3M8RA 1EQYA 3QDKA 3O3GA 2HBJA 2ZJRL 2XY6A 3VF2A 3RVCA 3P5JA 3MAQA 2Z1IA 3DXKB 1EX4A 3ZETB 3PSFA 3QEXA 4OJRA 1C0FA 5C24A 3VQ6A 4CHYA 1YAGA 2NRWA 3NF9A 2D0CA 2W6KA 4KFBA 5GIPA 4CJRA 3ZYYX 5KPRA 3ZLJA 5AFUH 1LV5A 2OYQA 1IH7A 3KTQA 4JKFA 4KB1A 4DWIA 2O8DB 5LMNK 3OS0A 4C1NK 2O8EA 4UY8O 4CJLA 3U4LA 4CJ3A 4H4OA 2G8FA 3MXMA 4XJXA 1YI2N 4OLBA 1XNRK 3OYEA 1VQ9N 2P9IA 3H45C 1JLEA 3HM8A 4JD2B 4FJMA 4FVUA 3D2EB 1BUPA 4IO8A 4LY7A 5BR9A 4KAZA 4HCBA 4FL9A 4O5FA 5AQLA 4M63C 2GUIA 4BGBA 3CCSN 3V4IA 3CM5A 3CI5A 4DUZK 4DV4K 1NMNA 3MDQA 2A5XA 1ZC6A 1HNIA 3QNOA 4CE9A 2QEXN 4E7IA 5AJ3K 3ID8A 4EAHD 3THVA 4LF4K 3HPHA 2FSJA 4F8RA 4G9ZA 1JLCA 1VRTA 4DQPA 3OYHA 4DQRA 4HUFA 4KHPK 2HHTA 4KH6A 3GBTA 4CEOA 4M3RA 1NJXA 1VSFA 1X9SA 4N56A 3J7YP 4AHRA 4E19A 3CYGA 3VEOA 3R8EA 2HBKA 1LWCA 4K8XA 5HP1A 3WEEA 4GVEA 4DV7K 2E8AA 3O4NA 5HRRA 1VQ8N 4ZHRA 4A2AA 1D9DA 1HPZA 3L6QA 2G8UA 1X9JA 1NU0A 3QLHA 4BRLA 2R7YA 3QEVA 5EY4A 3RWUA 1Z26A 1RT6A 4LD0A 4DQ8A 3U3YA 4GV9A 3D7EO 4CIGA 3P83D 3CF5L 3CC4N 1NGGA 4BY9C 4BR7A 4EZ6A 4FO0A 4BRQA 3P31A 3O6WA 2OA8A 2NRZA 3MXJA 3D2FA 3O1WA 2P9KA 4PKHA 2P9LA 4PKGA 1L3UA 1HJOA 1X3MA 3R6MA 2YKNA 3NH1A 2YHXA 3F9KA 1FK9A 4FOIA 4K42A 4CGGA 1W2BM 4B9QA 1G99A 1Q7YO 3AO3A 3FR0A 1N36K 4CJKA 2WFBA 3GL1A 4B8CA 1LCUA 2YHWA 1GLBG 3TSQA 3CHWA 2ASPA 3RMBA 4IFYA 3I33A 2D0PA 4JRPA 5MLCQ 1NOYA 1IG8A 3I0SA 4CHNA 5I42A 4YOTA 4ELUA 3VA3A 3LL3A 3M5RA 4KRFA 2ITMA 3RMDA 4IOAL 3ULDA 1MDUB 2ZGZA 2OCEA 3VQEA 4C8OA 3I55N 3JSMA 3OYLA 4RCHA 1YF5L 3RTVA 4H0XB 4YORA 1DEJA 1XQSC 4AHTA 1TV6A 3PO4A 2FSKA 1CZ9A 2VG6A 2I7PA 4OPKA 3WUHA 2UUAK 3S9HA 4JI1K 2D1KA 5AQUA 2ITGA 4I2PA 3J7ZO 1XHXA 2A40A 4CF0A 3VQ5A 5IWAK 1KFDA 1TGOA 4Z94A 3OJSA 3VF4A 3THWA 1HKBA 1IKXA 1NGFA 3THXA 3I56N 3WT0A 3DAWA 1IO2A 1T3VA 1K8KB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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