2ASOA

Structure of rabbit actin in complex with sphinxolide b
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asoA03
4FO0A 3L4IA 4CBUA 1NGAA 5JMVA 1YUWA 3KZBA 4CJ7A 1DGKN 2GWKA 3CQXA 1ZXOA 4JHDB 1K8KA 2FF3B 2D4WA 3HSCA 2GTDA 2CH5A 2OANA 3BEXA 4BC4A 4BQZA 5AQRA 4B1VA 3H3NO 4I6MA 2Q31A 2VCPA 1BUPA 2E20A 3M1FA 1MWKA 2I7PA 3LL3A 3CJBA 3U9DA 3SLCA 1NMDA 4JD2B 4EIAA 3FZFA 1T6DA 5EVZA 4HWIA 1NGJA 4O8KA 4DB3A 5BPMA 1GLCG 2YJFA 4BQLA 1SZ2A 4NB4A 3AAQA 4ISGA 2HOEA 3MN5A 3O8MA 3P4IA 4FWQA 4RTFD 4BG8A 2P9PB 4CZHA 4BC3A 4CZKA 4BREA 2CGJA 3D2FB 2EWSA 4K42A 3H3OB 4J8FA 1NM1A 1E4GT 3GE1A 2Q0RA 2NRHA 4XEIA 5AZIA 3VF2A 4B1ZA 4BR7A 3FZKA 4FWPA 2YJEA 3ENHA 5AQJA 4A61A 3WUHA 2P9SA 2W41A 3EN9A 2QWPA 3QBWA 1SAZA 1SQKA 3EO3A 4H0VB 4I6MB 3UKRA 3LDOA 3DXMB 2GEMA 2ZWHA 1R59O 3IFRA 4H5VA 3J8AA 3AARA 4FWKA 3O1BA 4IJAA 1BU6O 2Q0UA 3KVGA 2E2PA 2QWNA 2ZF5O 3WXKA 4LC9B 1QQNA 5FPMA 3H6EA 5AQSA 5BRFA 3EL2A 1ATRA 4O5FA 1HPMA 4B1XB 4JAXA 3DWLA 3LDQA 4BC5A 2KHOA 3ULEB 4XH1A 5AQQA 3ATVA 4A2BA 2W40A 1HKBA 2YCHA 3ATUA 3O08A 1X9JA 5E26A 1GLAG 3QICA 3LDLA 3C7NB 4CBXA 1HJOA 2V7ZA 4BROA 2CGKA 3VESA 2CGLA 4DQ8A 1XQSC 2IVOA 1JCEA 1LCUA 3FZLA 4FOIA 4YDUA 3R9PA 2YHWA 5AZIB 4BR5A 1RDWX 4ISEA 4H5WA 3QMLA 5KPTA 4K43A 2P9IA 1S3XA 1ESVA 1KAXA 3MCPA 2QWRA 2QM1A 3UE5A 3ZX3A 1Q18A 4BR0A 4CZIA 1X3NA 5BRHA 3UKRB 1U2VA 2QWOA 5AQIA 5I9EB 1TUUA 5TKYA 1GLLO 3IMXA 5BR9A 4AM6A 4BRHA 4BRQA 4BC2A 2HF3A 5BN9A 2A5XA 2P9LA 3VEXA 1JCGA 3M6GA 3VEYA 1MWMA 2P9KB 1C0FA 4XH4A 1XUPO 1TUYA 2E88A 1NWKA 3O80A 2E1YA 3O4WA 5AQGA 2ASMA 2E1ZA 5KQ8A 4WQ5A 4EFHA 1YXQA 4PKGA 1ATNA 2BUPA 3QFUA 2V52B 3H1QA 2P9NA 1WOQA 3OHRA 5LJVA 3BUZB 2NZTA 3WEEB 3HM8A 5BRDA 5AQPA 3U9ZA 3S41A 3ZETB 1HUXA 1Y64A 3FR0A 4M7XA 3B8AX 4BVOA 1BWFO 3G25A 1U2VB 4BGAA 1U6ZA 5AQYA 2A3ZA 1S22A 4IZ9A 5FPNA 2Q97A 3MN7A 3VETA 3BF1A 2AA4A 2IIRA 2P9LB 4FOEA 4CD1A 1JCFA 4BRLA 3C0BA 3ZEUB 4PKHA 1GLEG 1Z6RA 2P9UA 5F0XA 4CI6A 1TYQA 2FLOA 5AQVA 2ASPA 3EKSA 1NGCA 4BRKA 4BG9A 3SJHA 4IXCA 3IUCA 3FLCO 5JLHA 4H5TA 3QDKA 4FWLA 4B1YB 3CJ9A 1KXPA 1YVNA 2F9WA 1DEJA 1K8KB 5AQFA 2A6AA 5F2RA 3ZX2A 3WXLA 4MLEA 2V51B 3GOIA 3SMSA 3SK3A 5B8HA 1NGGA 3I33A 1KAYA 3U4LA 1MDUB 4XH5A 2YHYA 5KPRA 4CBWA 4IJNA 4K41A 4FWOA 4WQ4A 3FE1A 3JXUA 1ZBSA 3HI0A 2ITMA 2UYTA 3IDHA 5AQHA 4BRPA 4DCHA 2QXLA 5EOYA 3A8YA 1BA0A 4A2AA 3BP8A 1DKGD 2A42A 2P9UB 3LM9A 4CD3A 4MO4A 4FL9A 1ATSA 5AQZA 1QQMA 1X3MA 4H0TB 3O6WA 4H03B 1D4XA 4CZJA 4WQ4C 4BR2A 1MA9B 2E2NA 1P8ZA 2YI1A 3LDPA 1V4TA 1BG3A 3W0LA 5AQNA 1C0GA 2P9SB 3DJCA 2NLXA 5JLFA 1T44A 4QS9A 3EZWA 3WT0A 4F9OA 4QS8A 1GLBG 3WXJA 2IVNA 4FPAA 4CZGA 1QHAA 3GL1A 3H1VX 3VGLA 4BRAA 1IJJA 4FPBA 3WXIA 1NGHA 4BR9A 5AQWA 4YDUC 5LY3A 4BRCA 2AP1A 1WUAA 3VF4A 2F9TA 4GY2B 5AFUA 1XC3A 4JN4A 3VENA 2QW9A 5AFUH 2VYPA 1HKCA 2A40A 2ASOA 1NGIA 3TU5A 4CZMA 4JD2A 4K25A 1HLUA 3FZHA 3VEVA 4FWSA 5KPZA 3VGKA 2DPNA 4PKIA 3ID8A 3LDNA 4NO7A 3MDQA 4H5RA 1YAGA 2HMPA 2P9IB 3VEWA 4CZLA 2J4RA 5LJWA 5EXWA 2P9PA 3CJ7A 2FF6A 4M63C 1ZC6A 3FZMA 3W3DA 3D2FA 3HZ6A 1QQOA 4MLHA 3CJCA 3A0IX 4WQ5C 3AY9A 5AZJA 3MN6A 2BTFA 1GLDG 4EHTA 3ZX0A 4IO8A 2PBDA 1H1VA 5AQTA 4RCHA 4Z94A 4BRFA 2E2OA 3QB0A 4CZEA 2IVPA 3H45C 5F1XA 1NGDA 4BR4A 1HX1A 3DXMA 5ELZA 3A5MC 1NBWA 2D0OA 3GBTA 5BPLA 2YHXA 3SMPA 3CHWA 4KBOA 2FXUA 2GELA 4H0YB 4BRGA 4H5NA 3CJ1A 3WQTA 2VWBA 2FSJA 5BPNA 3VF6A 2HF4A 1LOTB 3KHYA 5BN8A 2P9NB 3A5LC 4IWVA 3I8BA 3QFPA 3UB5A 2D0PA 3ULEA 3VPZA 5AQKA 3FFKB 3D7EO 4HTLA 4JNEA 3O5BA 1HKGA 2Q1NA 4B1UB 2FSKA 3O1WA 2QWLA 3C7NA 4FWRA 5AZJB 1BOTO 4H0OA 3MMVA 3VEZA 5E84A 3TPQA 1RGIA 2WUSA 3ENOA 1IG8A 1OKJA 3VGMA 5KQDA 1GLJO 3R6MA 2H3GX 1NGBA 3L0QA 4Y0WA 4BGBA 1TYQB 1T6CA 1Z05A 2A41A 3QBXA 3CIPA 3WQUA 2Q2RA 4BRNA 4GNIA 2QWQA 4E1JA 1NGEA 4C23A 3UKUA 4CZFA 5ADXA 3A5NC 5AQMA 1QZ6A 3RSEA 4BRMA 5AR0A 5ADXH 4PL8A 3R8EA 4FWMA 4EHUA 3CQYA 3M3ZA 4DHYA 2P9KA 1CZAN 4B9QA 4BRIA 4A62A 3CJAA 1KAZA 2GUPA 1G99A 2PAVA 3F9MA 3MN9A 1EQYA 3CERA 3GG4A 2I7NA 2ZGYA 4MO5A 5BREA 3D2EA 4B1WB 1BO5O 3DXKA 3MK6A 1V4SA 2E2QA 2V7YA 3HTVA 1J6ZA 4PL7A 3JS6A 5JICA 3GDQA 3U8XA 4JHDA 4H0PA 5CE3A 5FPEA 3WEEA 3ZETA 1BA1A 3CI5A 5EY4A 3DAWA 5EX5A 2D1KA 2GWJA 5AQOA 2FSNA 4FSVA 4BRDA 1RFQA 4H0XB 3H46O 3VOVA 3LM2A 1QZ5A 4BVPA 5AQLA 2CH6A 2Q36A 3A5OC 3HBTA 4M7YA 5AQXA 3UKUB 3RSEB 3L6QA 3VEOA 4RWTA 3VERA 2QWMA 1NGFA 1E4FT 3AAPA 3BF3A 1NLVA 2E8AA 4L3QA 3ZEUA 4WYBA 5AQUA 4AM7A 1BDGA 5FPDA 1GLFO 4QS7A 3CETA 3EKUA 4FWNA 3D2EB 4ISFA 2ZGZA 4EAHD 3DXKB 3FGUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B3OA 2VQFK 1IBLK 3KZBA 2PYJA 2GWKA 2XO7A 4A5AA 1ZXOA 2YNIA 2D4WA 4RW8A 2CH5A 3BEXA 4OPHA 4B1VA 1SL0A 1BISA 3EZ5A 2VCPA 4CHYA 1Q9XA 4J2DA 1K6YA 1J9AA 2B5JA 4NYFA 1SL2A 4FK0A 1EO1A 4UQGA 3DLEA 1R0AA 3CFPA 4F8RA 3P4IA 4BG8A 1TK8A 2W42A 4BC3A 4CZKA 4W5OA 4BREA 4KV8A 2EWSA 4KREA 3P38A 3NCIA 4N5SA 2W00A 5K14A 1VSEA 1IKWA 5AZIA 2NRHA 3CG7A 4E0DA 1NJZA 3SQ4A 3AVJA 3H08A 2YJEA 2G8HA 3VMFB 1TKTA 4A61A 5H1SQ 4CGGA 3MWPA 3QBWA 1SQKA 4AHUA 4ILJA 4MDAA 3UKRA 3LDOA 2ZWHA 1IG9A 1R59O 1Z26A 4FWKA 2X6SA 3EY1A 3DRRA 1NKEA 4IJAA 2PZSA 2NUBA 1BI4B 3WXKA 4DR2K 4CJUA 5FPMA 4K8ZA 1S5JA 1ATRA 2XRIA 4B1XB 1C6VA 4ID1A 4Z4FA 4JAXA 3LDQA 4BC5A 3DOLA 5KGWA 5AQQA 4B3MK 2YCHA 1TK5A 3VQ5A 3C7NB 2V7ZA 2CGKA 4Y1CA 3CCSN 1ILYA 1LCUA 2KFNA 4BR5A 4H5WA 3KLIA 4O0JA 1XMQK 5KI6A 3UE5A 1X3NA 3NAEA 4XIUA 5BRHA 1U2VA 2QWOA 4JRPA 1BQNA 4RG8A 4BRHA 2QXFA 4QAGA 2JGUA 3NGIA 3IS9A 2HB5A 2P9LA 5DM6L 4K0KK 3VN5A 5HP1A 3E1YA 1JCGA 1U45A 1HPZA 2DY4A 2P9KB 1C0FA 2O8FB 3WNGA 3SV3A 4KH5A 1NWKA 2OZMA 2E1YA 2VGNA 3O4WA 4JKGA 3PO4A 2UXDK 4EFHA 5KRTA 3PIPL 2B4JA 4JI2K 5M1FA 4PKGA 3PV8A 2O4GA 4FJIA 3THYA 4KI4A 1TAQA 2ITGA 3WEEB 3ZETB 3S41A 1N36K 1TAUA 4KKOA 4HUFA 1A5XA 4JI4K 3SPYA 3RR7A 4F3OA 1Y64A 2FC0A 3FR0A 3B8AX 4BVOA 4F2SA 3OS0A 4JLHA 1N34K 3CMAN 5AQYA 3PX6A 2F8TA 4DSLA 3MN7A 3OYKA 1RDCA 3E66A 3CCRN 3OBWA 3DI6A 3A2FA 3CCQN 4FOEA 4H4OA 4CD1A 1JCFA 1KVBA 4KTZA 5GAEP 1LW0A 3DLRA 3DRPA 1YTUA 3CCJN 4IOCL 4CVNE 4DQRA 2E5LK 5F0XA 1NJXA 3CC7N 5HRNA 4LH5A 1L3VA 4CHQA 4BRKA 1U4BA 4IXCA 3FLCO 4Z0UA 3CFOA 4Z4HA 5JS2A 3QDKA 4DQSA 3CJ9A 4DLEA 3QESA 1QSSA 5DK5A 4DQIA 5FDLA 4DR1K 1C1AA 3WXLA 4LF4K 1NOZA 2V51B 5M1PA 1DT9A 4KHWA 1S1XA 3JAMO 3SK3A 4CEDA 1GOBA 4FJNA 4PY5A 4NXMK 4CBWA 3Q7CA 4CF2A 4IJNA 5GIOA 1FJGK 1QHTA 3VQ7A 4JS5A 1YI2N 2G8IA 2X78A 4BRPA 2HVHA 1RT1A 1CXUA 3KTQA 2O8BA 3O3FA 3SQ0A 2VG7A 4K8XA 3LM9A 1RT3A 1S1TA 4IG3A 4FL9A 1U47A 1W2BM 4BDZA 1ATSA 3NF8A 4CGFA 1K8AO 1X3MA 2HHHK 3T69A 2IGIA 3E9PA 3OYCA 1MA9B 4OPJA 1QE1A 3MEEA 3LP3A 1L3SA 3LDPA 3BZKA 3W0LA 3SUPA 4OPAA 5JLFA 3SBTA 1T44A 4M3TA 3M5RA 3SJJA 4LF9K 4MDBA 3WT0A 2I5JA 4F9OA 3DLGA 4QS8A 4YOWA 1GLBG 3SQ2A 4Z4GA 2OPPA 3WXIA 1NGHA 3THXA 3AVFA 2G8UA 5AQWA 3G6EN 3K57A 4BRCA 2IS3A 2G8FA 1WUAA 2KFZA 3ULDA 2F9TA 1VSHA 3UIQA 4PA1A 1VHXA 1Z25A 3HOSA 1XC3A 4JN4A 4IFVA 2HSTA 3VQDA 1K73O 3ITHA 4CHPA 1VQ5N 5DM7L 1HLUA 4I7FA 5KPZA 3OYLA 4KTWA 3TR8A 4JYAK 4JV5K 3MDQA 1YAGA 4CEBA 4XJXA 4Q5VA 1S6PA 4NCAA 3AO1A 5J1EA 3LZJA 2P9PA 3QLHA 1UAXA 2E6MA 4M63C 3FZMA 4HCBA 4WFBL 4YORA 3LPTA 3AVNA 4B8AB 4EP4A 3SUQA 4WQ5C 4CJKA 3U6FA 4Y1DA 4IOAL 1H1VA 3SAFA 4RCHA 4DLGA 2HW3A 3ZLJA 4JRQA 3H45C 5F1XA 1NGDA 1JLAA 2HBLA 3ISNC 3DXMA 4DTOA 3A5MC 3EE8A 3LPUA 1B92A 1TK0A 3SMPA 4E7IA 4JKGB 4KBOA 2GELA 4O4GA 2HHIA 1HYVA 4DU1A 5IT9O 3VF6A 5GADP 1KC8O 3G10A 4B9MA 5BN8A 1ZYQA 3THYB 3KWIA 3KLFA 3F9KA 4OVLA 4X62K 3UB5A 3NE6A 4DU4A 3VPZA 4OGEA 5AQKA 4HTLA 3QEWA 2ZJPL 1VQMN 1VQ8N 1NK4A 4B1UB 2AJQA 5J2QA 1SKSA 3VEZA 1N33K 4FLTA 3CM5A 3ENOA 3VGMA 2QTDA 3K2PA 4AF1A 3CF5L 2XY5A 1NGBA 1OH5A 3BZCA 2KKZA 4C1NK 3WQUA 1EWRA 2QWQA 3ZSRA 4C23A 3A5NC 3PO5A 4PL8A 5HROA 2DTUA 3C95A 1T8EA 4A62A 3QNOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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