2ASOA

Structure of rabbit actin in complex with sphinxolide b
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of microfilament destabilizing toxins bound to actin provide insight into toxin design and activity
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 129
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2asoA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2asoA03
1ATSA 4IJAA 4H5NA 4BQLA 1ZC6A 4F9OA 4MLHA 3CJCA 5EVZA 1IJJA 1Y64A 1V4TA 3A0IX 1NBWA 4B1VA 4EHUA 5JLFA 4DCHA 3TPQA 4DHYA 3QDKA 1WUAA 5KPTA 4DB3A 3EKSA 3A5MC 4CZLA 2CGLA 4E1JA 3AAPA 3CQXA 3U4LA 2VWBA 4KBOA 2HF3A 3QBXA 1T6DA 1Z6RA 4H0VB 3D2FB 3WXIA 2IVPA 2P9PA 3J8AA 2FSKA 3CJ7A 3VETA 1HKGA 4IO8A 4FWSA 1MA9B 3ZX0A 3F9MA 4FWNA 1BA0A 5JICA 3EKUA 3UKRB 3HSCA 3C7NA 3CJ1A 1NWKA 3ZEUA 3VERA 2AP1A 4BRQA 1GLFO 5AQLA 3WQTA 3VGMA 4BC3A 2I7NA 4BR9A 2QM1A 4CJ7A 1RFQA 2OANA 5AFUA 5B8HA 3DXKB 4I6MA 4MO5A 1U2VB 4FO0A 4H5RA 3IFRA 2V51B 2QWQA 3VEVA 5KQ8A 5KQDA 2P9NA 1JCFA 4ISGA 4JD2A 1GLBG 3VOVA 2GUPA 3WXKA 1NGJA 3ZX3A 5BR9A 4H5TA 4PL8A 3ZETB 3MDQA 4YDUC 4CZEA 3FGUA 4JN4A 3D2FA 4CZIA 1BU6O 3FZKA 5AQZA 3EL2A 1GLJO 3MN9A 5AQJA 2PBDA 3H3OB 3VESA 3O8MA 2A40A 5AQMA 3HM8A 2E88A 4M63C 4H0YB 2QXLA 3A5NC 1YAGA 3UKRA 1BA1A 3CHWA 3ENOA 4CD1A 3LM2A 4C23A 3S41A 2A41A 2GTDA 4FWPA 3EN9A 4CZMA 4Y0WA 3VF2A 3P4IA 3M1FA 1QQNA 1U2VA 3LM9A 5AQNA 1QQMA 1GLLO 4J8FA 4H03B 1QZ6A 5KPZA 1TUYA 3DXMA 2P9IA 4EAHD 3VPZA 1E4GT 1R59O 1YVNA 4WQ4A 1YUWA 4A61A 3WT0A 1T6CA 4WQ5A 1NGGA 4JHDA 3WQUA 3AARA 2Q97A 4HTLA 3HBTA 5AQGA 3WXJA 4H5VA 2CGKA 3LDOA 3W3DA 3FZFA 4HWIA 3LDLA 3O4WA 5EXWA 1NM1A 3U9DA 1BUPA 3KVGA 3MK6A 3O08A 3C7NB 3BF3A 3VF4A 5AQWA 2NLXA 1XC3A 1ZXOA 3LDQA 4H0TB 4QS7A 1BG3A 3VEXA 2FF3B 4RCHA 3O1WA 1S22A 3A5LC 2KHOA 4I6MB 1ATRA 2GWJA 1SZ2A 1OKJA 1NGIA 5AQYA 3GL1A 3I33A 2P9NB 3FR0A 4JD2B 4EHTA 4EIAA 4QS8A 3VEWA 2D0OA 2BUPA 2EWSA 3QICA 3D7EO 4GY2B 3ULEB 1H1VA 5EY4A 5BRDA 3SMPA 3VEOA 1HUXA 1JCGA 1Q18A 4XEIA 3SK3A 2CGJA 2A3ZA 2NZTA 3H1QA 1ZBSA 4A62A 3L6QA 4BGBA 1GLEG 3UKUA 3BP8A 5AQTA 5LJVA 3O5BA 2VYPA 2WUSA 4XH4A 2D1KA 3FFKB 3SJHA 2VCPA 3BEXA 3CERA 1V4SA 4CI6A 3BF1A 4M7YA 3FLCO 1NGFA 3IMXA 3R8EA 3A5OC 4GNIA 5BRHA 1BDGA 5I9EB 4WQ5C 3LL3A 5F0XA 3GE1A 2HMPA 1NGDA 2P9IB 3DXMB 4CZJA 2P9SB 4BREA 3R9PA 1BOTO 3EZWA 2CH6A 5BRFA 2Q2RA 4MLEA 5BPMA 4FWOA 3ULEA 5LJWA 3QBWA 2D0PA 4JHDB 4M7XA 2YHWA 4BRKA 2YI1A 1HPMA 3U9ZA 3WXLA 4NO7A 3H46O 4FWMA 4K43A 4BR4A 3M3ZA 3FZLA 5AQOA 1E4FT 4A2BA 3CJ9A 4ISEA 2IIRA 1BWFO 1G99A 1HKCA 2E2OA 4BR5A 4RTFD 4BVPA 3L4IA 2HF4A 2E1YA 1KAYA 5E26A 4MO4A 5FPNA 3VENA 1LOTB 3I8BA 4BC5A 4FPBA 3MN6A 1KAZA 4B1WB 4CZKA 1IG8A 3CETA 1XQSC 2GWKA 2E8AA 4B9QA 4BR2A 2F9WA 4BRPA 4A2AA 3MN7A 2IVOA 3VEZA 2HOEA 2P9SA 4WYBA 1U6ZA 4IWVA 1EQYA 5AQSA 4BRHA 3R6MA 3O80A 4FWLA 5CE3A 5LY3A 2ZWHA 5EX5A 4BGAA 4BRMA 1TYQA 4BG8A 2QWOA 3A8YA 1JCEA 5JLHA 1CZAN 2Q0UA 3M6GA 4FSVA 2P9LA 3EO3A 1XUPO 4RWTA 5ADXA 5KPRA 2Q1NA 4K42A 1HKBA 2FLOA 1Z05A 3ATVA 1SQKA 5AZJA 4CBXA 5BREA 3HTVA 3IDHA 4BQZA 3B8AX 1DKGD 2Q36A 1MWMA 3UKUB 3CI5A 5AQUA 4BC2A 3SLCA 2E2NA 3SMSA 2P9KA 4BC4A 2A42A 2I7PA 5F2RA 1NGBA 5BPLA 1NLVA 4CBUA 4NB4A 3ZX2A 2QWLA 3JS6A 3CIPA 3L0QA 4BR7A 4XH5A 3MN5A 4QS9A 4YDUA 1WOQA 5E84A 3VF6A 2J4RA 4PKIA 2ITMA 5AZIA 2FSNA 4K25A 4B1YB 5AQQA 4BVOA 3O1BA 4JAXA 3AAQA 3MMVA 2YCHA 1GLAG 2ASMA 5AQFA 2P9UA 5AQRA 4DQ8A 4IJNA 3HI0A 2V52B 4LC9B 3AY9A 1DEJA 4IXCA 1TUUA 2Q31A 2ASOA 1QHAA 4CZFA 1D4XA 2ZGYA 1NGEA 1C0GA 3GBTA 1NGHA 1DGKN 4H0PA 1T44A 1SAZA 2E2PA 3WEEA 3QFPA 1X3NA 3QMLA 3QB0A 4H5WA 3JXUA 2BTFA 3DAWA 3LDPA 4BR0A 3W0LA 2A5XA 5BN9A 4CZHA 4CD3A 5F1XA 4B1XB 3CJAA 2GEMA 3C0BA 3ID8A 4O5FA 3GG4A 4Z94A 5AR0A 5AQPA 4FWKA 1YXQA 2W41A 2IVNA 3VGLA 2FSJA 4B1UB 2YJFA 4WQ4C 3D2EA 5AFUH 2Q0RA 2W40A 2AA4A 3ATUA 3IUCA 3RSEA 4FOIA 1P8ZA 2QWPA 2DPNA 1HX1A 4BRFA 1K8KB 2ZF5O 1ESVA 1TYQB 3FZHA 5BN8A 3CQYA 3HZ6A 4FOEA 4AM7A 4BRDA 2P9LB 3H1VX 1QZ5A 2QW9A 2E2QA 4L3QA 1LCUA 2E20A 2F9TA 3FE1A 5AZJB 2QWRA 2D4WA 3H6EA 4FL9A 2NRHA 2UYTA 1GLCG 1RGIA 1X9JA 4CZGA 4BRAA 3VEYA 2P9KB 4IZ9A 4BRIA 3DJCA 3H3NO 3KHYA 4PKHA 4BRNA 3ENHA 4BRLA 4PL7A 4JNEA 4PKGA 3U8XA 2ASPA 4BRCA 2V7ZA 1ATNA 2PAVA 1X3MA 3GDQA 3OHRA 5TKYA 5AZIB 5AQVA 2YHYA 1QQOA 3MCPA 4BROA 2FF6A 4AM6A 1K8KA 2P9UB 4BG9A 4FWQA 3G25A 2A6AA 5FPMA 1S3XA 3DXKA 2QWNA 5EOYA 5AQXA 4FPAA 1NGCA 4ISFA 3VGKA 3H45C 3WEEB 2H3GX 5ADXH 2FXUA 1NGAA 5JMVA 1C0FA 5ELZA 4CBWA 4O8KA 2YHXA 5AQHA 3ZETA 3UB5A 1MWKA 2QWMA 3KZBA 2CH5A 4H0OA 5FPEA 3DWLA 4H0XB 4BRGA 1J6ZA 4K41A 4EFHA 5BPNA 1KXPA 1RDWX 1GLDG 2V7YA 3LDNA 3O6WA 3WUHA 3CJBA 1NMDA 2E1ZA 2ZGZA 2GELA 2P9PB 2YJEA 5FPDA 1MDUB 3TU5A 3D2EB 3GOIA 3QFUA 5AQKA 1HLUA 1HJOA 1KAXA 4XH1A 3BUZB 5AQIA 4FWRA 1BO5O 4B1ZA 3FZMA 3RSEB 3ZEUB 3UE5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G10A 3N4PA 3EEQA 1XNRK 4F9OA 1J5OA 3C6UA 5EVZA 3ZSQA 1Y64A 4H4MA 1V4TA 4B1VA 1KCFA 3OY9A 3QDKA 4CF8A 1WUAA 3HL8A 4DSLA 1K9MO 3SBGA 2UUCK 1RT4A 1L3TA 4GKKK 4H4OA 2D0CA 2VWBA 4JI1K 1WSEA 3D45A 4DSIA 4CIEA 4M3RA 3J8AA 1HKGA 4IO8A 3T3FA 2G8VA 1N6QA 4DMNA 4FWNA 4I7FA 1BA0A 3C7NA 3DLEA 3VA0A 4DG1A 4MQ3A 3PIPL 1HNZK 4FZYA 3VGMA 3CCLN 5T7BA 1U47A 1NKEA 2QM1A 2YNGA 3TTDA 1QS4A 1RFQA 3HP9A 4DV7K 2YX6A 4FO0A 5M1KA 2QWQA 3G6EN 1VQ9N 5KQ8A 3QO9A 3BDPA 3I56N 1S1TA 2NRTA 1JCFA 3MXJA 5C2DA 3VOVA 2ZQBA 4FVMA 1HRHA 4DV0K 2OPPA 3ZX3A 4WFAL 1YTAA 4LSLA 4DTNA 2Z1JA 3RVCA 2NRXA 3DRRA 4AHRA 3FGUA 4DTOA 4CZIA 3FZKA 5AQZA 4ILHA 2ATQA 4GV3A 3MN9A 4OGEA 4CJFA 5FRNA 1TAQA 2KLAA 2W00A 3TAFA 4M63C 1S6PA 4H0YB 2O8EA 3ENOA 1YJNN 3LM2A 4C23A 3TAQA 3AA4A 2A41A 3F5TA 4FWPA 3EN9A 4CZMA 2VG6A 1VQ6N 1WSFA 3VQBA 4DV5K 2HHVA 4B3OA 1IV0A 2PFUA 3LM9A 3ZSWA 5C15A 1UA1A 4A57A 4AHCA 1JLQA 4NCGA 4CHPA 4OKJA 3HXMA 4F3OA 4WQ4A 1XNQK 3P1GA 1ITGA 2IDOA 1NU0A 2DY4A 3WXJA 4KFBA 4HWIA 3PX0A 1NG9A 3KVGA 3KTQA 3O08A 3BF3A 5AQWA 5D3GA 4FZZA 4X65K 3SAHA 3CD6N 3VEXA 4KPYA 3AVJA 1NJXA 1TK8A 4I6MB 2GWJA 1SZ2A 1OKJA 1NGIA 3VQQA 3AVGA 5SWMA 3KJVA 3I33A 2KFNA 5HOOA 3SV3A 5JVHL 2BH1A 3VEWA 3THYA 5HLFA 3QICA 2XRIA 1NJWA 4GY2B 2JLEA 4MFBA 3SMPA 3QINA 3VTIA 5CY4A 1JCGA 4DTPA 1Q18A 4OLBA 3VQ7A 3KIOA 2A3ZA 3H1QA 4CVNE 4A62A 3L6QA 4BGBA 3QNNA 3MX2A 2IS3A 4TSXA 3BP8A 2G8KA 4JI3K 3LALA 2AJQA 2BANA 1G15A 1ASVA 2D1KA 3T1YK 2VCPA 4BE7B 1IKXA 3S3OA 3BEXA 5HRRA 4FLXA 1V4SA 4DV4K 3IMXA 3LPTA 3A5OC 4GNIA 1QSYA 1BQMA 3LL3A 5F0XA 5J2QA 2HMPA 5J2MA 3SJJA 4HCBA 3RR8A 1S5JA 2VGNA 3R9PA 4X64K 3N4QA 1C6VA 5DM7L 2CH6A 3TANA 2Q2RA 5BPMA 1KQSM 2EHGA 1S1XA 2Y1JA 2YHWA 3VQ4A 2YI1A 3MX5A 1KD1O 3WXLA 4E1NA 3V9UA 4B3TK 5HL7L 3M3ZA 3OA9A 4OKKA 1E4FT 4DFJA 4A2BA 3M8PA 4CFCA 4QAGA 4BR5A 3G71N 5E26A 3NCIA 2DTUA 4DU4A 4PA1A 1I3AA 3ZLJA 4DUZK 4DF4A 4B9QA 4DQIA 1WLJA 1P90A 4E7HA 4A2AA 3OYBA 4NCBA 3LP3A 2IVOA 2HOEA 4FCYA 1EWRA 3LAMA 1EQYA 4BDZA 4BRHA 3O80A 1C1BA 2ZWHA 3CPEA 5EX5A 4BRMA 3SI6A 1YVUA 5JS2A 4B9TA 2ZM6K 4U67L 4FXDA 4QCLA 1Z05A 2I5JA 1SQKA 3MEEA 2Q36A 5AQUA 3S3MA 3LWLA 5I3UA 4CESA 4IOCL 1N36K 2P9KA 4BC4A 2WONA 4CBUA 3DOLA 4HUFA 1GOBA 3CC7N 1WAFA 4O0JA 4PWDA 3WNFA 4JS4A 4KTZA 4XH5A 2O8CB 1NJYA 4E7KA 4MDAA 1WOQA 4YDUA 3VF6A 5E84A 2J4RA 4PKIA 2UXCK 3J80O 3AGRA 3T1AA 4F2RA 1N32K 4CCHA 2ASMA 5KI6A 2X6SA 4FJXA 4FJ8A 5AQRA 4RW8A 2V52B 3K9KA 4KKOA 3V1OA 4IXCA 4N47A 1TUUA 1FJGK 4NXNK 2ASOA 2ZGYA 1NK6A 3AVFA 1C0TA 1DGKN 1SL0A 1SAZA 2WFBA 3QFPA 1X3NA 3AO1A 3JXUA 1KLMA 4E7JA 2BTFA 3DAWA 1DTTA 4CK3A 5F1XA 1KLNA 2D5RA 3C0BA 3ID8A 4JV5K 3L3VA 4CJVA 1RNHA 4NCAA 1TL3A 2HHSA 1LAVA 5AQPA 4M45A 2W41A 3VGLA 3IG1A 2Q0RA 3PX4A 3OYJA 3ATUA 1FW6A 4KB1A 3LAKA 3VQEA 3THVA 2NRVA 1P8ZA 2HVIA 3L2RA 4FJ5A 4DV2K 3CQYA 2O4GA 1U04A 3HPHA 2E2QA 5GAHP 3HPOA 2F9TA 2UXBK 4M3ZA 5AZJB 2VQFK 1A5XA 2BDPA 2QWRA 2GV9A 4JKHA 3OW2M 1QVFM 4HTUA 4MDBA 4JI7K 1WNSA 3MEDA 4CF1A 2RPIA 3VEYA 1VSKA 4PQUA 3DJCA 3K5MA 1BIZA 4BRNA 3ZT2A 3PUFA 2ASPA 1HQUA 1VSMA 3AGKA 4JKAA 4ID1A 5AZIB 4FM2A 2D0AA 2OCEA 1VRTA 3MCPA 2WOMA 2FF6A 5CR4A 3HVTA 1K8KA 2P9UB 4CGHA 5C10A 2VG5A 3CG7A 1S3XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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