2BTFA

The structure of crystalline profilin-beta-actin
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of crystalline profilin-beta-actin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-ACTIN
molecule tags Acetylation and actin-binding
source organism Bos taurus
total genus 106
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2btfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2btfA03
3GE1A 2IVNA 1S22A 5AQVA 4CJ7A 1BO5O 1Z6RA 4EHUA 2Q31A 1WOQA 2A41A 2Q97A 3LDOA 1BOTO 2E2QA 5AQWA 2E88A 3MN9A 5JMVA 2GTDA 1ATNA 3W0LA 4F9OA 3O4WA 1NGGA 1RGIA 4BRGA 2EWSA 5B8HA 4M63C 4XEIA 2ITMA 5FPDA 2PAVA 2E2OA 3GBTA 4PKHA 4YDUA 3ZETB 3HM8A 3EKSA 5AQQA 1H1VA 3SK3A 5F1XA 4XH1A 5AQUA 5AFUA 1KAXA 3P4IA 4M7YA 3A5MC 1C0FA 4BGAA 3BF3A 4CZIA 5AZIA 1QZ6A 4QS8A 4RWTA 2FXUA 4O8KA 1BA1A 4BREA 3R6MA 5AQMA 1C0GA 1X3MA 3DXKA 1Z05A 4GNIA 4WQ4C 4EAHD 4FWRA 4B1ZA 1HKCA 3HI0A 2GELA 3IMXA 4K25A 4BRDA 1V4SA 3QBXA 3O6WA 3LDPA 4CZKA 5AZJB 1NGCA 4Y0WA 3VESA 4FPBA 3UE5A 2ZWHA 3VGMA 3A5NC 3S41A 2PBDA 3LM2A 3QICA 5FPEA 3H3NO 4BC2A 4FWQA 4CBXA 1G99A 4FWPA 4IWVA 4BC3A 3U8XA 1MWKA 3M1FA 3VEWA 1GLBG 1U6ZA 3WXKA 3FE1A 5AFUH 3DXMA 5KQDA 3HSCA 3BP8A 2F9WA 5AQZA 3FZHA 3L6QA 5BN9A 3VEXA 2NRHA 1T44A 4PKIA 3A8YA 2V7YA 3MCPA 2QWRA 3C7NB 4IJNA 2VYPA 2AA4A 3MN6A 4MO5A 5AQSA 4BG8A 3UKRB 2P9SB 1QQOA 2A5XA 1GLCG 1QZ5A 2W40A 1U2VB 2V51B 1LCUA 3FLCO 1R59O 3AARA 4GY2B 2HF4A 4BRQA 4BC5A 4WQ5C 3D7EO 3QB0A 4MLEA 2P9PA 2QM1A 5E26A 1GLEG 4H5TA 4CD1A 1TYQA 3CQYA 4O5FA 5EOYA 2E20A 4I6MB 3FR0A 1NGAA 5AQXA 3ID8A 4L3QA 3CJAA 4M7XA 1DEJA 5TKYA 3WXJA 3W3DA 5KPTA 2J4RA 4BRKA 3FZFA 2QW9A 2QWMA 4H5WA 4K42A 2GWKA 4KBOA 3WXIA 1BU6O 4WYBA 4JNEA 2HMPA 2IIRA 4FWKA 3H1VX 4JHDB 3WEEB 3BF1A 2CH5A 4AM7A 1ZC6A 4RTFD 3ULEB 3O1BA 1DKGD 2P9LB 4BRPA 1E4GT 5AQLA 4EHTA 2FSNA 3A5LC 3R8EA 1ZXOA 4XH4A 1CZAN 2QWOA 5BRDA 3HBTA 4CBWA 1ESVA 2GUPA 3AAPA 3LM9A 3WQTA 3EO3A 5EVZA 4H0YB 2IVPA 4B1VA 4BRIA 2YCHA 3M3ZA 5BPLA 3ZETA 4Z94A 4FWMA 4BRMA 4H0XB 4CZFA 1X3NA 5LJVA 2E2NA 5F0XA 2CGLA 5AQIA 3CJ1A 3QBWA 4BR2A 5BR9A 2NZTA 3MMVA 3MN7A 4BR7A 3AAQA 2D0OA 2Q0RA 4CBUA 3C0BA 3MDQA 1K8KB 3G25A 3U9ZA 2V7ZA 3IDHA 4FSVA 1V4TA 4CZEA 1MDUB 4FWLA 3VF6A 3BEXA 4H5VA 4BR0A 5AQNA 1KAZA 4FWSA 4FOIA 4BRCA 3CERA 2ZGZA 4BVOA 1NMDA 1NGEA 5AZJA 1RFQA 1HKGA 3RSEB 3KVGA 5BN8A 3QDKA 3WXLA 4FWOA 4BRHA 5KQ8A 3O8MA 5EX5A 2FF3B 2BUPA 1S3XA 3B8AX 4A2AA 2VCPA 4QS7A 4IO8A 1NGIA 3L0QA 1P8ZA 3SMPA 1JCGA 3VF4A 5AQFA 4PL8A 5AQJA 4B1WB 1NWKA 1GLDG 4H5NA 4FPAA 3M6GA 3MN5A 4YDUC 4BR5A 3FZKA 3OHRA 1GLJO 3C7NA 4JD2B 3CI5A 3UKRA 2P9SA 4JAXA 3H45C 3CJ7A 4H03B 2YJFA 4H0VB 4B1XB 1U2VA 5EXWA 3I33A 4PKGA 3GDQA 4J8FA 2A6AA 3LDNA 3VF2A 2A3ZA 3ZX0A 4A2BA 4BRAA 3H1QA 2OANA 4DHYA 4E1JA 1ZBSA 4FL9A 2P9UB 5JLHA 2QWLA 2ZGYA 2Q0UA 3LDLA 3TU5A 4I6MA 3SMSA 1GLAG 4RCHA 2YHXA 3FFKB 2Q1NA 4BR9A 4EIAA 1D4XA 3H3OB 5AQRA 4B1UB 3L4IA 4NB4A 1HPMA 3R9PA 1QQMA 2ASOA 3CJ9A 4JN4A 2E2PA 2YI1A 1HKBA 1NGHA 2I7NA 3F9MA 3QFUA 3A0IX 4JHDA 3ZEUB 1NBWA 2E1ZA 3WEEA 1X9JA 5LJWA 1SZ2A 2YHWA 1KXPA 4ISGA 3ULEA 2FF6A 2P9LA 1NGJA 4C23A 2KHOA 2IVOA 3D2EB 4CZGA 2D4WA 2FSJA 1TUUA 3QMLA 4ISEA 3GOIA 1XUPO 1GLLO 1BDGA 2P9KB 4CD3A 3MK6A 1OKJA 4IZ9A 3J8AA 4MLHA 3ENHA 1RDWX 1YXQA 5CE3A 2YJEA 3UKUB 1KAYA 1Q18A 1T6DA 2BTFA 5BPMA 2P9IA 4BQLA 1QHAA 2HOEA 2YHYA 3D2FB 3CETA 4H0TB 4WQ4A 5AQOA 2P9IB 2D0PA 3EZWA 1NGDA 5BRFA 3WQUA 1EQYA 4H0PA 5E84A 1K8KA 3VEVA 3WUHA 4FO0A 4CZHA 4NO7A 3O08A 4FOEA 5ADXH 1JCFA 2HF3A 4B1YB 2W41A 2V52B 4K41A 3VERA 5EY4A 1DGKN 2E1YA 3EKUA 3IUCA 1SAZA 4FWNA 1T6CA 3RSEA 1NM1A 3EL2A 5LY3A 3O5BA 4MO4A 3VOVA 1NGBA 2WUSA 5AQPA 2D1KA 4B9QA 4XH5A 2ZF5O 4LC9B 1HUXA 5FPNA 4H0OA 5AQHA 3VETA 3VGLA 5KPRA 2ASMA 2QXLA 3U4LA 3KHYA 5AR0A 3I8BA 3O1WA 4PL7A 2QWPA 1Y64A 4BR4A 1ATSA 3VEZA 1LOTB 1YUWA 5AZIB 3ATVA 4DB3A 3A5OC 3FZLA 2DPNA 2FLOA 3FZMA 4JD2A 4BC4A 3DWLA 4WQ5A 3CIPA 3IFRA 1BUPA 5AQKA 3VEOA 5BRHA 3DXKB 3ZX2A 4BROA 3CHWA 4CZJA 2Q2RA 1J6ZA 1MA9B 4A61A 4BRNA 4HTLA 4BRLA 2QWQA 4EFHA 2A42A 1TUYA 1ATRA 2CGKA 3LL3A 5F2RA 2UYTA 3VGKA 3ZX3A 2GWJA 3LDQA 2P9UA 5JICA 2FSKA 2F9TA 1XQSC 4IXCA 3O80A 5FPMA 4H5RA 3H46O 5AQTA 3BUZB 4BQZA 2GEMA 3CJBA 4BG9A 4DCHA 1IJJA 3DJCA 3JS6A 1XC3A 3DXMB 5AQYA 3TPQA 2A40A 2I7PA 3VPZA 3SLCA 1HJOA 1QQNA 1IG8A 1NLVA 3SJHA 2VWBA 2Q36A 1BG3A 1BWFO 2H3GX 1HX1A 2CGJA 5AQGA 1SQKA 3ATUA 3FGUA 4CZMA 4BGBA 3GL1A 3ZEUA 4HWIA 3AY9A 2AP1A 1WUAA 3GG4A 1BA0A 4CZLA 1NGFA 3EN9A 1JCEA 4CI6A 3D2EA 2P9PB 3DAWA 1YVNA 1HLUA 4BVPA 2P9NA 3VEYA 4BRFA 5ADXA 2NLXA 3KZBA 3U9DA 2P9KA 1TYQB 3ENOA 4K43A 2CH6A 2P9NB 4AM6A 4IJAA 5I9EB 3UKUA 3QFPA 3VENA 5BPNA 4DQ8A 1MWMA 4ISFA 1GLFO 3HZ6A 3UB5A 4A62A 5BREA 1YAGA 3H6EA 2QWNA 2E8AA 3D2FA 3CQXA 3JXUA 2ASPA 3CJCA 3HTVA 5ELZA 5JLFA 4QS9A 5KPZA 3WT0A 1E4FT
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SKRA 3GE1A 1JLFA 4DTNA 3SUNA 1NU0A 4CIFA 2ETJA 4EHUA 4DR1K 4KTZA 4XJXA 4FZZA 2VGNA 3PX0A 5JMVA 2W42A 2GTDA 5C15A 1S1WA 2FBXA 3ISNC 3O4WA 3C6TA 3NFAA 4HUGA 4AHCA 3CFOA 2EWSA 5B8HA 5FPDA 2PAVA 3GBTA 3S3OA 2X6SA 3AO4A 3HXMA 3HM8A 4K8XA 4K8ZA 1MU2A 4ILHA 3KK1A 4DR5K 3SUQA 4KHQA 4WE1A 4CZIA 5AZIA 4CECA 3TABA 4ID1A 3QINA 5M1NA 2WBNA 3R6MA 5AQMA 1C0GA 4BE7B 4O4GA 4DTUA 3DXKA 1Z05A 2KFNA 1U45A 4FWRA 4E19A 1YITN 2GELA 3IMXA 4BRDA 5K14A 3V9WA 3QBXA 3LDPA 3AVCA 1QSYA 4M3ZA 3VESA 1OH6A 4B3OA 3UE5A 3VGMA 5GIOA 3ZSZA 3SQ4A 3CC2N 2PBDA 3LM2A 5FPEA 4BC2A 1WSFA 4KHWA 4CBXA 2O8EB 2D0BA 1BI4A 4FWPA 3VQ8A 1YF5L 4QOZB 4E7IA 1K73O 3CCQN 1MWKA 1GLBG 3FE1A 5J2QA 3DXMA 2HHVA 4YNQA 4DR7K 4A57A 3O4QA 5BN9A 2UUAK 4HVJA 4RW9A 2VYPA 1KVBA 4MO5A 3AVAA 3LPTA 3J81O 4HUEA 3S3MA 1QVGM 1U4BA 2A5XA 4W5OA 3ZCMA 2XY8A 3SAGA 3KK2A 4CJFA 3DLEA 4MQ3A 4FVUA 2HF4A 1GOAA 4BC5A 3OYDA 3D7EO 2QM1A 2O8BA 3D6RA 4ZTJA 5EOYA 3PV8A 4I6MB 3RMDA 1NGAA 3SBTA 3ID8A 4BDPA 4LSNA 1UAXA 1C1AA 4M7XA 4CEOA 4KRFA 5TKYA 1Z26A 4BWMA 3W3DA 4KHSA 1UA1A 1S72N 3CC7N 3FZFA 3T3FA 1S9EA 1HJRA 4H5WA 2GWKA 4J2EA 3HOTA 3WXIA 5HL7L 3PUFA 4JKHA 4WYBA 4JV5K 3V9UA 3H1VX 3HM9A 4FJHA 3WEEB 1ZC6A 3O1BA 4DFMA 4BRPA 3BGRA 3LWLA 2FSNA 4DF8A 2B6AA 4XH4A 4CJWA 2QWOA 3QEVA 4FXDA 1JLEA 3DYAA 4CBWA 3I8DA 2GUPA 3AAPA 1Q9XA 3EE8A 4JKDA 2IVPA 4B1VA 4JI7K 3SQ0A 4N41A 4X62K 1DLOA 3M3ZA 3ZETA 4ELVA 1VQON 1IKWA 4FLYA 1VQ9N 5AQIA 3PSFA 1QSLA 2HB5A 3VA3A 3VQ6A 1T7PA 3T1AA 4CF0A 3ZSXA 1QSSA 4H4OA 2NZTA 1I39A 3V81A 4CBUA 3VQ5A 2P5OA 1K8KB 5M1QA 3U9ZA 1MDUB 4B3MK 4YOXA 3OBWA 5AQNA 1KAZA 4FWSA 4FOIA 4BRCA 4JS5A 3CERA 4BVOA 2D5RA 1C1CA 3I56N 4FWOA 4E1NA 3VQDA 1VSJA 3SPZA 3L2WA 1S3XA 2YNIA 1HNVA 1KVAA 2VCPA 3G0ZA 4QS7A 1NGIA 4JI3K 2DY4A 1JCGA 3VF4A 5AQJA 1UA0A 1TVRA 2IS3A 2WFBA 4YDUC 3FZKA 3OHRA 3RMAA 3NDKA 2PZSA 3C7NA 3P38A 3UKRA 2P9SA 4PA1A 2YX6A 1I94K 4CJ3A 3DM2A 4C8MA 1N8RO 1NKEA 2YJFA 4B1XB 4M3YA 1NJWA 3K59A 5MLCQ 4J8FA 2A6AA 1YJNN 3VTHA 2E6LA 4DUZK 1KQSM 1YT3A 2D0CA 4DHYA 2O8DB 3K57A 1OH8A 4DR2K 1SL0A 2ZGYA 5JS2A 4IFVA 4I2PA 5TKWA 4B9UA 3HP9A 2UXBK 4CIEA 3PIPL 1WB9A 4LF6K 2YHXA 4X66K 4EIAA 1CXQA 4JI6K 2VG5A 3NE6A 1SL1A 2F4VK 1VSEA 3AO2A 4OLAA 4NB4A 3NBPA 1VQMN 3CCUN 1JLQA 3L3UA 1JJ2M 4JN4A 3C65A 2AJQA 3F9MA 3NAEA 3S3NA 3ZEUB 1SZ2A 2YHWA 4CGIA 4KTWA 2P9LA 2E6MA 1J5EK 3K5MA 2IVOA 4CZGA 5KTQA 1OH5A 1I3AA 1RT2A 3QMLA 1D9DA 3GOIA 3PO5A 4DV7K 2GBZA 3MK6A 1YTAA 4JRQA 1YXQA 3O4NA 1S1XA 1IBMK 2YJEA 3L4QA 2HSTA 4OPHA 3FFIA 3OYCA 3M5RA 4PWDA 2P9IA 4IDKA 4JK7A 4CGJA 2HOEA 4WQ4A 3QETA 2DFEA 1NGDA 1IBKK 2EHGA 1TKZA 4K0KK 3SAHA 5CHIA 4ELTA 3Q7CA 4OO1J 1TAQA 2OPPA 3MEEA 4CZHA 5FLXO 3O08A 2GUIA 4Z4FA 1YI2N 1JCFA 2HF3A 3KWIA 3VERA 1T05A 3ZSQA 4DTRA 3IUCA 2PYLA 1NM1A 3NGIA 2BDPA 4MO4A 4FK0A 2G8KA 3OYMA 4FJIA 3SBGA 5AQPA 2D1KA 4XH5A 3NVKA 3OTOK 4IBNA 1HUXA 4H0OA 5AQHA 4CJEA 1TL3A 2ASMA 4FLVA 4CJVA 3O1WA 2QA4N 3VEZA 3T69A 5AZIB 2ZJQL 3PSIA 3ATVA 5J2PA 3A5OC 2DPNA 4BC4A 3DWLA 4KH4A 3CIPA 3IFRA 1WLJA 3SJJA 3DXKB 3ZX2A 3TAGA 4YHHK 1RT6A 4DTSA 3E66A 1XNQK 4IDHA 1C0UA 2IGIA 3LL3A 4FJ8A 3WNFA 2P9UA 1D9FA 4M3XA 2OTJN 5JICA 4DSKA 4CJQA 4OGEA 2ZJRL 1A5VA 1ZBUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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