2D1KA

Ternary complex of the wh2 domain of mim with actin-dnase i
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the actin-binding function of missing-in-metastasis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 94
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2d1kA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2d1kA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2d1kA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2d1kA04
1K8KB 2P9KA 1D4XA 2ASMA 3M3ZA 4BRCA 4ISGA 1C0GA 3IFRA 3U8XA 1NGAA 3L4IA 4H5RA 1ZC6A 3LL3A 3CI5A 1BOTO 5AQJA 4BRMA 3AARA 4GY2B 3MN6A 5AQWA 4DHYA 1TUYA 3O1WA 3VGMA 2QWLA 4FPBA 5AQPA 4MO4A 1YAGA 3ZX0A 4QS8A 3QB0A 3CJ7A 3IUCA 5KPRA 1BA0A 1TUUA 2I7PA 3H1QA 1QQMA 3W0LA 1IJJA 4B1UB 5E26A 2ASOA 3BEXA 4FO0A 4CZMA 3I33A 5AZIA 2E1YA 1MWKA 2P9NB 2ZWHA 1RGIA 5EY4A 4JD2B 3CERA 5E84A 2D1KA 5AQXA 3VENA 3BF3A 2P9IB 4JN4A 3WUHA 2PBDA 5BPLA 3QBXA 4FWQA 3UKUB 4BRHA 1BWFO 3CQYA 4H0TB 1GLBG 1RDWX 2E20A 1NGGA 3KHYA 5F0XA 1HJOA 3VPZA 2FLOA 5AQOA 2GWKA 1NGEA 3O1BA 3O80A 3SLCA 5AQSA 4H5WA 4BVPA 5BRHA 4HWIA 2ASPA 3ZX2A 1H1VA 1LOTB 2YI1A 4BRNA 2QWOA 4I6MA 1NWKA 3BUZB 2QWRA 1WOQA 1XC3A 2A40A 3H3OB 2P9SA 2P9PA 2HOEA 4BC2A 2IVOA 4H5NA 4M7XA 4MLEA 4EHUA 3FZKA 3SK3A 1MA9B 4O5FA 5EXWA 4K42A 5JICA 1BDGA 1QZ6A 3LM9A 4BG8A 2YJFA 3H6EA 4L3QA 3O8MA 3CETA 3ENOA 2IVNA 4H0OA 4BQLA 4BRDA 4WQ4A 5CE3A 1BG3A 1GLLO 4FWSA 2BUPA 2ZF5O 3BP8A 1V4SA 3RSEB 3QBWA 5TKYA 4BRAA 3B8AX 5KQDA 1G99A 3CJ1A 3QDKA 4FOIA 4BC5A 3R8EA 3GE1A 3HZ6A 5AQKA 5AQVA 1NM1A 3CJBA 3GDQA 3VEOA 1QQNA 2VYPA 3H3NO 3A0IX 4Y0WA 2A42A 3VEXA 3FLCO 4XH5A 1JCEA 3M1FA 4BRLA 2YJEA 2P9IA 3UKUA 3HI0A 1GLAG 2E2NA 2D0OA 4CBUA 3ZEUB 1TYQA 2F9TA 5FPDA 1NGIA 3VESA 3KZBA 5AQUA 2VWBA 3FZFA 5AQGA 4QS7A 4A62A 3CJCA 2HMPA 4FWLA 4RCHA 4A2AA 3VOVA 4BRPA 2NLXA 5KQ8A 2QWQA 4B9QA 1GLFO 2UYTA 3GOIA 3MDQA 3MN7A 4JHDA 4RWTA 3OHRA 3EN9A 5JMVA 5LJWA 1U2VB 3L0QA 2CH5A 3QICA 1NGCA 3CHWA 1CZAN 1T44A 2VCPA 1MDUB 3LDNA 2PAVA 4CZGA 1DKGD 1DGKN 5B8HA 3U9ZA 3RSEA 4FWPA 1BU6O 2D4WA 3EO3A 3HM8A 3ATVA 3LM2A 1SQKA 1QZ5A 4GNIA 3LDLA 1R59O 3DXKB 1YVNA 3FZLA 5AQLA 1E4GT 4HTLA 3W3DA 3C0BA 2GUPA 4FL9A 4BVOA 1QHAA 3JS6A 1SAZA 3EZWA 1T6CA 2KHOA 2Q31A 2W40A 2V52B 3DAWA 2I7NA 3CJAA 1WUAA 2A6AA 4DQ8A 3R6MA 4B1YB 5FPEA 4CZEA 3WQUA 4K43A 4BRGA 5EOYA 4DB3A 1Y64A 1TYQB 1P8ZA 2AA4A 3ZEUA 3F9MA 4E1JA 2CH6A 3WXIA 2E1ZA 4YDUC 5AQMA 3BF1A 5AQRA 2Q1NA 4BR4A 4A2BA 3FZHA 3ULEB 4EIAA 1ZBSA 4JHDB 4FOEA 3LDQA 3SMSA 1ATSA 4LC9B 3VF4A 3J8AA 5AFUA 1JCFA 2H3GX 1U2VA 3ZX3A 2V7YA 5BN8A 1NBWA 2QW9A 3IDHA 4M7YA 4FWKA 3MMVA 4IJNA 3QFPA 5BPNA 2NRHA 2FSJA 3UE5A 3HBTA 3SJHA 2E2QA 4WYBA 4NB4A 5AQFA 2FSNA 3VGKA 1RFQA 4XEIA 4CBXA 2P9LA 3WEEA 2Q0RA 1HKBA 4PKHA 4CI6A 4CZIA 3FZMA 4KBOA 4BROA 4H5VA 2DPNA 4M63C 3JXUA 3DXKA 3AAPA 5F1XA 2YHXA 2V51B 4CBWA 3AAQA 3O4WA 3VETA 3ID8A 2Q97A 4H0VB 4XH1A 2Q2RA 4PL7A 1E4FT 2P9UA 4K41A 1SZ2A 5EVZA 2IIRA 3O08A 4PKIA 2ITMA 4BR7A 2GTDA 1KAXA 4BGBA 1T6DA 3ZETB 3KVGA 3A5MC 4EAHD 4K25A 4H03B 5ELZA 5AFUH 2Q0UA 2D0PA 4A61A 3G25A 3D2FB 3H45C 3WXJA 4B1ZA 1GLJO 1ESVA 5F2RA 4BR0A 4DCHA 4FWNA 4CD1A 3MN5A 1Q18A 3TU5A 3VGLA 4EHTA 3ULEA 5AQQA 1LCUA 1KXPA 1NMDA 4BRQA 2YCHA 1YUWA 4FWOA 3FE1A 3L6QA 4H0PA 5BPMA 3A5NC 3EL2A 3IMXA 2CGJA 5EX5A 4BG9A 2E2OA 2J4RA 3LDPA 5AZJB 5KPZA 2A41A 5FPMA 2CGKA 3CIPA 4B1XB 1KAYA 4CZLA 2FXUA 3VEVA 1XUPO 3WQTA 4ISFA 2F9WA 3DXMB 4IZ9A 1OKJA 3H1VX 3TPQA 2IVPA 5JLHA 1NGBA 3S41A 2P9LB 3WEEB 1KAZA 3D2EB 2FF3B 4CZHA 2W41A 3R9PA 4AM6A 4CZKA 4EFHA 1ATNA 4MLHA 5KPTA 4WQ4C 3UB5A 4BR5A 2FF6A 3VERA 3HSCA 2GWJA 1X3NA 2E2PA 2GEMA 5LJVA 1HKCA 3MK6A 2ZGZA 3DJCA 1NGDA 2P9UB 2YHWA 4IXCA 4B1WB 4JNEA 1ATRA 4BR2A 3VEZA 4CZFA 5BRFA 3EKUA 3ENHA 4BRIA 3ZETA 1Z05A 4BR9A 3D7EO 1BA1A 4MO5A 1DEJA 3C7NB 3CJ9A 1HUXA 3D2FA 3A8YA 3LDOA 5JLFA 4CD3A 3CQXA 3P4IA 5ADXH 2YHYA 1C0FA 1IG8A 3ATUA 3O5BA 3WXLA 4FPAA 1HPMA 1GLEG 1BO5O 3O6WA 1NLVA 2HF3A 4IWVA 3U4LA 1NGFA 4BREA 5AQIA 5AQHA 3UKRB 5LY3A 5BRDA 2A3ZA 4FSVA 3U9DA 4BQZA 2BTFA 1HKGA 3A5OC 2OANA 2QM1A 2QWMA 3AY9A 4BRFA 2Q36A 2QXLA 3A5LC 4BRKA 4AM7A 5AZJA 1Z6RA 4WQ5C 2WUSA 2QWNA 2GELA 2E88A 4O8KA 3VF2A 1V4TA 2QWPA 3DXMA 5FPNA 2EWSA 1QQOA 1J6ZA 3FGUA 4J8FA 3HTVA 4H0YB 2FSKA 2ZGYA 3GBTA 3MCPA 4C23A 1ZXOA 3D2EA 2P9KB 1K8KA 4BC4A 3WXKA 3VF6A 4H5TA 1X3MA 4FWMA 3VEWA 5BN9A 2V7ZA 3MN9A 4H0XB 1NGHA 3H46O 4BC3A 3FR0A 5BR9A 4F9OA 5AQTA 4QS9A 1MWMA 5BREA 4CJ7A 5AR0A 1YXQA 3QFUA 5AQYA 4NO7A 1HLUA 4BGAA 3GL1A 3C7NA 5AZIB 2P9NA 3QMLA 4RTFD 4PL8A 1HX1A 4JD2A 4PKGA 1GLCG 2AP1A 4B1VA 4JAXA 3EKSA 3UKRA 4YDUA 1S3XA 1X9JA 2CGLA 5I9EB 4ISEA 1JCGA 1BUPA 5ADXA 1XQSC 1GLDG 2E8AA 2A5XA 3SMPA 1EQYA 3DWLA 2HF4A 1S22A 4Z94A 2NZTA 4XH4A 3FFKB 4I6MB 3WT0A 1U6ZA 3VEYA 2P9SB 4FWRA 1NGJA 2P9PB 5AQNA 5AQZA 4IJAA 4IO8A 3GG4A 4WQ5A 3M6GA 3I8BA 4CZJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GMJB 1EWRA 4ISGA 2W6LA 3V9ZA 4DR4K 1NGAA 1NK5A 4GY2B 5AQWA 4FZXC 1DTQA 1Q81O 2QTDA 4FXDA 1JLFA 4H4OA 3VQ9A 1SKWA 3QB0A 4IG3A 4F8RA 4CK2A 3H1QA 3W0LA 5C42A 4B3SK 5E26A 2ASOA 3NDKA 1CXUA 4Z4IA 4IFVA 3J7AP 2E1YA 3C65A 1CXQA 2P9NB 2GX9A 4DR7K 4CJLA 2O8BA 2DFHA 3PO4A 2D1KA 1KTQA 5AQXA 1X9WA 3CG7A 5BPLA 1HMVA 4FWQA 3UKUB 3L2RA 4BRHA 3TI0A 3AVKA 1J53A 2E6MA 1XMOK 4GV9A 2E20A 2HHVA 2HHHK 4I9QA 1QSSA 2QA4N 5AQOA 2VQEK 4DR2K 3O80A 2PYJA 3SLCA 5GINA 4A5AA 1VAZA 3JYTA 2O8EB 1J54A 3DI6A 4CF8A 1H1VA 1LOTB 2YI1A 3J80O 4I6MA 1IBLK 2QWRA 2P9SA 2IVOA 4H5NA 4M7XA 3SK3A 4JI4K 5EXWA 1BQNA 4QCLA 4JS5A 4LF9K 3AGRA 4GW6A 4Z4CA 1VSHA 3LM9A 4DLGA 3L4QA 2YJFA 4AHVA 4DS5A 3VQ6A 2F7TA 3ENOA 4BRDA 4BQLA 3LZIA 1ITGA 1QS4A 3U6FA 1V4SA 3OS1A 3QBWA 4DV5K 1NKCA 3CFPA 4KHUA 3QDKA 3CJ1A 1ZBIA 4BC5A 5I3UA 5FROA 1QQNA 4A5BA 2VYPA 3A0IX 2NRTA 3WNFA 1VRUA 4JKBA 3FLCO 3ZLJA 4PWDA 4LSNA 2X78A 1VQ8N 4LY7A 3HI0A 5AJ3K 4FCYA 1WBDA 2BDPA 3PO5A 3TAGA 1W2BM 3ZEUB 4G9ZA 2HHXA 2I5JA 4B9LA 3OYLA 1HNWK 1EO1A 3V1QA 2O8DB 1FKOA 1HJRA 2VWBA 3K5LA 4DR5K 4FWLA 1YTAA 2HMPA 4RCHA 4IO9L 3VOVA 3N4QA 1IKVA 3MDQA 4RWTA 5JVGL 3ZYYX 1F21A 4PA1A 5JMVA 3L0QA 2CH5A 4JKDA 1WAFA 5CR4A 1NGCA 1CZAN 5HOOA 3SAFA 2IDOA 3ZSOA 3SQ0A 4R79A 2JWLA 4FLXA 5M1QA 4FZYA 1TAQA 1N34K 3VQ5A 3LDNA 2PAVA 2VG5A 3CCJN 4FLWA 5TKWA 2D4WA 4C1NI 4CJSA 5GAGP 1OH5A 3QERA 2W6KA 4OLAA 3BZCA 5KRTA 1LWCA 3HJFA 5AQLA 4KKOA 3NBPA 3C0BA 2GUPA 4FL9A 2W42A 3J7ZO 4LF6K 3EZWA 3OYGA 1HNXK 3OTOK 4F2SA 3WNHA 2YNIA 4DV1K 1NJYA 1EXQA 4DQ8A 3WQUA 4BRGA 1Y64A 2JWKA 2XY7A 1P8ZA 1HRHA 3ALYA 2YX6A 4M41A 2BGGA 4XIUA 3WXIA 4AH9A 3C6HA 3S3MA 5SZTA 1WSIA 4BR4A 3KKRA 4FVUA 2KKZA 4A2BA 1Q9XA 3FZHA 3ULEB 1FW6A 1T05A 3QESA 3T7ZA 4EIAA 1BGXT 1ZBSA 3BY5A 4PHTX 3ZCMA 4IKFA 1JLCA 4Z4EA 3CXCM 2F8TA 4CJ4A 1U2VA 4NCBA 5BN8A 4KHQA 1TGOA 4CJQA 3L2QA 3AVFA 2GV9A 4JKAA 3HBTA 3MX5A 4CGDA 4HHTA 2HNZA 4OPAA 1YJWN 4B08A 3VGKA 3I55N 4HCBA 5C12A 1VSIA 4BDZA 2P9LA 3KIOA 2A1RA 3WEEA 1HKBA 1IKWA 5M1FA 2Z1HA 4JI8K 4RG8A 5F1XA 3AAQA 1HPZA 3O4WA 3CFOA 2Q97A 1VQ4N 1BHLA 1NK8A 4FM0A 1Z25A 1C0UA 1SZ2A 5EVZA 5C2FA 1ZBLA 4JKHA 4Q5VA 3FFIA 3O08A 3OBWA 5FDLA 1KAXA 3QO9A 4BGBA 4DG1A 3OS2A 3A5MC 4EAHD 2Q0UA 4B1ZA 4K0KK 1VSKA 4BR0A 4CCHA 3NVKA 3MN5A 3TU5A 3VGLA 3ID6A 4EHTA 4BEBA 1LCUA 4OKKA 2YCHA 4CJTA 1S5JA 4FWOA 3L6QA 3A5NC 3AVNA 3EL2A 5EX5A 4BG9A 4YOYA 2E2OA 4DTPA 1T7PA 1RBUA 5I42A 1O1WA 3EEQA 3LDPA 5AZJB 1VSMA 3P83D 3RRHA 4Z0UA 4B1XB 1KAYA 3RRGA 2KLAA 3VEVA 3AV9A 3NH2A 4DFKA 1XUPO 3OJUA 4ISFA 2F9WA 3DXMB 4DQQA 4IZ9A 4OPKA 4DFMA 5JLHA 3SV3A 1NU0A 4CZHA 3E1YA 4CZKA 3LANA 4BR5A 1Y97A 4O8UA 3VERA 4CFDA 2E2PA 5CHIA 3BGRA 4IOXA 1YIJN 1HKCA 3MK6A 4OKEA 4DTXA 1NGDA 2G8VA 1W0HA 1ATRA 4BE7B 4HUEA 4CIFA 3ENHA 4JEPA 2RKIA 1VQON 4BR9A 1IG9A 3D7EO 3CMAN 4WFNL 1DEJA 1Z26A 1HUXA 1YITN 1NJWA 1KSPA 3P4IA 3ATUA 2O8CB 1GLEG 1D9DA 1NLVA 3LAKA 2HF3A 2VGMA 4IWVA 1IBKK 3K58A 4IDHA 2IS3A 2XY8A 2A3ZA 1RTIA 5JS2A 1I39A 4BRFA 3D6RA 2Q36A 4CJRA 4DQPA 3SUPA 1XHZA 3DLEA 3O3GA 4O8KA 4O4GA 4CHPA 2QWPA 5FPNA 2EWSA 1D9FA 3FGUA 4H0YB 2ZJQL 3KK1A 2KTQA 4FW1A 3AO5A 2OPQA 3E9OA 3D2EA 4FJGA 1K8KA 4BC4A 3VF6A 5HRRA 3DLHA 4CEBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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