2FF3B

Crystal structure of gelsolin domain 1:n-wasp v2 motif hybrid in complex with actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords Gelsolin
molecule tags Structural protein/contractile protein
source organism Homo sapiens
total genus 116
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff3B03
4NO7A 4L3QA 3QFUA 3BEXA 4FPAA 2E8AA 3OHRA 4BR4A 3QB0A 1U6ZA 3FFKB 3WXKA 5LY3A 1BA1A 3BUZB 4K43A 2YHYA 3FLCO 5BN8A 4H0VB 5AQTA 5F1XA 3ZX0A 1IJJA 1ZXOA 2HF4A 2D4WA 1GLBG 3JXUA 4H0XB 3U9DA 4CZJA 1NLVA 4BR9A 1XC3A 2CGKA 2Q1NA 5JMVA 1GLCG 3D2FA 4BC5A 4PKGA 1Z05A 2FXUA 3IDHA 3ZX3A 3IMXA 1KXPA 5JLHA 2D0OA 5AQOA 5BREA 1U2VA 3QICA 3BP8A 4CBUA 3U4LA 3WEEB 5AQUA 5LJVA 3WXJA 4B1WB 1KAZA 2A41A 2QWRA 1RFQA 3EKUA 3ENOA 3LDLA 4ISFA 2P9SA 1C0GA 3HZ6A 4BC2A 4WQ5C 4K25A 5F2RA 1XQSC 2VCPA 4BRHA 2QW9A 2QWPA 4H5VA 3WUHA 5AR0A 3VF6A 1TYQA 2YI1A 3ATUA 3EO3A 3O08A 4BQZA 4ISEA 2H3GX 1NGDA 2ZF5O 4FWSA 3CHWA 3FR0A 2W40A 5AZJA 2OANA 3C7NA 3UKUA 4JD2A 3A5MC 3ID8A 2WUSA 3QBXA 3EKSA 3LM9A 5AFUA 5AQGA 5AQLA 3F9MA 2GELA 4DCHA 4BRMA 4JHDA 2QM1A 4BROA 2V7ZA 3CIPA 5FPNA 3ZEUB 1NGCA 4Z94A 5AQNA 2D1KA 2IVNA 4QS9A 3QMLA 4RTFD 3AARA 1G99A 4CBXA 2QWLA 3DXKB 1RGIA 2P9LA 3LL3A 2BUPA 4J8FA 4BC4A 4I6MA 2IIRA 3P4IA 3L6QA 1XUPO 3MN5A 3EL2A 1MWMA 2P9NA 3FZKA 1RDWX 3CJAA 3FZFA 4MO4A 2A42A 3ULEA 4FL9A 3DXMB 4H0OA 1ZBSA 2Q31A 5AQYA 1LOTB 1HKCA 1BO5O 4GY2B 4FWRA 2QWMA 4XH1A 4H03B 3R8EA 3GDQA 2F9TA 3J8AA 5KQDA 4MO5A 3A0IX 3ENHA 4IO8A 4CD3A 3SMPA 4AM7A 5AQPA 4B1UB 2YCHA 5AQKA 5AQQA 3VESA 1HUXA 1T6CA 3SK3A 1NBWA 4M7YA 4PL8A 3S41A 5BPLA 2E2NA 1NGAA 4BGAA 5KPTA 1OKJA 3HTVA 4FWQA 2V52B 3VEWA 1QZ5A 4EIAA 2E20A 3H3NO 1JCEA 4CJ7A 3SLCA 4JN4A 3GE1A 3CETA 3HI0A 4XH5A 2A3ZA 3RSEB 3W0LA 3A5OC 3G25A 3WEEA 4NB4A 3GL1A 4BVOA 2HF3A 5ELZA 3CJ7A 4IJAA 1HLUA 2P9PB 5AQXA 1MWKA 4FSVA 1JCGA 4JAXA 3VENA 2YJEA 2FSNA 5EY4A 2CH5A 4BRQA 4HTLA 4CD1A 4FWOA 3IFRA 3D7EO 2Q97A 4BQLA 4K42A 1BU6O 3QBWA 5I9EB 5AQFA 2AA4A 4EHUA 1R59O 4H5TA 3LDQA 3ZETB 4BGBA 4O8KA 2Q36A 3UKRB 3H1VX 4JNEA 2Q0RA 5ADXA 4EAHD 5KQ8A 2UYTA 5E84A 1HPMA 4A61A 3O1WA 3ZEUA 4CZGA 4FO0A 5EXWA 4YDUC 4M63C 3GBTA 4BG8A 2FLOA 4O5FA 1NM1A 2ASMA 4CZMA 3MMVA 3O1BA 2HMPA 4FWKA 3WQUA 3AAPA 3DXKA 4GNIA 5EVZA 1TUUA 4C23A 3JS6A 1NMDA 4H5NA 4PL7A 5AQRA 3H6EA 4A62A 2I7PA 1ZC6A 5ADXH 2E2QA 4WQ4C 2NLXA 3KHYA 2P9IA 3I33A 1YUWA 4BRPA 3CI5A 2ASOA 4QS8A 3DXMA 2ZGZA 2AP1A 2J4RA 2GWJA 4BRCA 3EZWA 2QWNA 3TPQA 5JICA 1BA0A 2QWQA 4RWTA 3DAWA 1WUAA 4MLHA 1T44A 4BVPA 4BRAA 2E1ZA 1K8KB 3FGUA 1ATSA 5EOYA 4CZIA 5BR9A 1IG8A 2NRHA 3M3ZA 4A2AA 2CGJA 4CI6A 1C0FA 3EN9A 2V7YA 2E2PA 3AAQA 3LDPA 4WYBA 3QFPA 3CJBA 1BDGA 3R9PA 2PBDA 2P9IB 3VEYA 2ASPA 1QQNA 2DPNA 1H1VA 4BG9A 1YVNA 4BC3A 4BR0A 2QWOA 3TU5A 4CZFA 1YAGA 1S22A 5BRDA 1QQMA 3FZHA 2GUPA 3H46O 4BR2A 2QXLA 3LM2A 2ZWHA 4RCHA 5AQWA 2P9UB 3RSEA 3IUCA 1X9JA 3VGLA 2A40A 3AY9A 4FOIA 4B1XB 3VEVA 1J6ZA 1NGGA 1WOQA 4EFHA 2P9PA 2P9KB 3VF4A 3O5BA 3VOVA 2V51B 3H3OB 2CH6A 4FPBA 3VETA 5AQHA 2BTFA 3O8MA 2VWBA 4DB3A 4PKIA 2Q2RA 2E2OA 3VEXA 4B1YB 1NGJA 1S3XA 3UB5A 1HKGA 1HJOA 1NWKA 1NGBA 2VYPA 5AQZA 4BRFA 3O80A 4BR5A 3SJHA 1SAZA 4WQ5A 3B8AX 3WXIA 4B9QA 3ZETA 4M7XA 3CJ9A 3WT0A 4IWVA 1LCUA 3GG4A 3UKRA 3H1QA 2NZTA 4LC9B 1GLLO 1SQKA 1X3MA 3MN6A 5KPRA 2IVOA 2ZGYA 1NGEA 1E4FT 5E26A 4WQ4A 4H5RA 3VGMA 1GLJO 1ATNA 4E1JA 2Q0UA 1MDUB 4BRNA 1BOTO 5FPMA 1QQOA 3CERA 2GWKA 1Y64A 4BR7A 3VF2A 4IJNA 4BRDA 3R6MA 1MA9B 4DHYA 3A5LC 4BREA 3LDNA 2E1YA 1HX1A 3FZLA 3KZBA 4QS7A 3MCPA 1ESVA 5BRHA 5AZIB 4IZ9A 1SZ2A 3D2EB 4F9OA 2A6AA 1GLAG 4FWPA 3BF1A 5AQJA 4CZEA 4CZLA 3CQXA 3GOIA 4BRLA 3A5NC 5BPNA 3O4WA 4DQ8A 5B8HA 2YJFA 2PAVA 4XEIA 1K8KA 3MDQA 3L4IA 3FE1A 4BRKA 1NGIA 1QHAA 1TUYA 3CJCA 1DEJA 4FWLA 5TKYA 1HKBA 3LDOA 1BUPA 2FF3B 3ATVA 5KPZA 5EX5A 5BRFA 3HSCA 1V4TA 1T6DA 3CJ1A 3H45C 2E88A 3A8YA 3CQYA 4XH4A 3U8XA 4PKHA 3O6WA 1BWFO 3D2FB 2I7NA 1V4SA 2GEMA 4IXCA 4KBOA 2P9UA 3BF3A 4HWIA 3DWLA 4H5WA 4BRGA 5AQVA 1U2VB 1E4GT 1X3NA 3MN9A 1YXQA 4Y0WA 2P9KA 4H0TB 3VGKA 2CGLA 5FPEA 1DGKN 1NGHA 2P9SB 2W41A 4B1ZA 5JLFA 2FF6A 3M6GA 1QZ6A 4CBWA 4CZKA 2A5XA 4CZHA 1TYQB 3SMSA 3U9ZA 3MK6A 3HBTA 2YHWA 3KVGA 5BN9A 2FSKA 3W3DA 2HOEA 5AZJB 3C7NB 3UKUB 4JD2B 3I8BA 5AFUH 2YHXA 1DKGD 4ISGA 4BRIA 1ATRA 3VEOA 1CZAN 4EHTA 5BPMA 2F9WA 1KAXA 3VPZA 5LJWA 2ITMA 2IVPA 3WQTA 4JHDB 2FSJA 4FWNA 1D4XA 3DJCA 5CE3A 1KAYA 5AQSA 1GLFO 1P8ZA 4AM6A 3HM8A 1EQYA 1NGFA 1Q18A 3C0BA 4FWMA 1JCFA 4MLEA 3VERA 4FOEA 3ZX2A 1BG3A 2KHOA 2EWSA 3QDKA 1Z6RA 4YDUA 4H0PA 2P9LB 2GTDA 1GLEG 4I6MB 5AQIA 5AZIA 3UE5A 3WXLA 2D0PA 3D2EA 4B1VA 5F0XA 1GLDG 2P9NB 5AQMA 3MN7A 3VEZA 4A2BA 4H0YB 3ULEB 3L0QA 4K41A 3FZMA 5FPDA 3M1FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HNVA 1N34K 4CERA 2E8AA 4EP4A 4CK2A 3FFKB 4FCYA 4GKJK 4Z4EA 4CJLA 4Z0UA 3OY9A 1BA1A 2HSTA 4WF9L 3FFIA 4C1NI 4N56A 5F1XA 3TTCA 4H0XB 1GLBG 2GBZA 4M3XA 1NLVA 5DM6L 4YOXA 4BR9A 4JI5K 4QCLA 4OVLA 4ELTA 3NGIA 3VQEA 4JI6K 4JV5K 4HCBA 4CF2A 1KXPA 5AQOA 1RTJA 1JKHA 3Q7CA 3BP8A 4AHCA 2HHSA 4B1WB 2A41A 4CFCA 1YITN 1RFQA 1VSJA 4K25A 4CEFA 2QW9A 4B9UA 2QWPA 3SQ1A 3CCUN 3VF6A 1TYQA 2YI1A 3E01A 4I2QA 3K5LA 4ISEA 5LL6Z 3KD1E 3CMAN 3AVKA 1BISA 4J2BA 3ZT3A 1CZBA 4JD2A 1VQ9N 4F3TA 2QXFA 2WUSA 4E1MA 3QBXA 3EKSA 1C0TA 3O3FA 4X65K 3OYIA 4FLYA 4IKFA 5FLXO 2ZJQL 1NGCA 5HBMA 1J5OA 2O8FB 4Z94A 1M90O 4NLBA 5M1KA 3T3FA 1JJ2M 4QS9A 3TTDA 3VQCA 1W2BM 1EO1A 1CXUA 4KB0A 4DSKA 1EWRA 4FLTA 3T1YK 4FK2A 3CPEA 1J9AA 3LL3A 4N47A 3CCMN 1RDBA 3ID6A 4J8FA 2WFBA 5I42A 2YNFA 2HVIA 1IKYA 1IH7A 1XUPO 3QO9A 1MWMA 3K5NA 3FZKA 4DTMA 1VSFA 4MO4A 2A42A 1VQ6N 1U48A 2OTLN 2VWJA 3TARA 2Q31A 4CJ3A 4F8RA 3MXJA 4FWRA 2KKZA 4DU1A 1SKWA 4IEIA 3DOLA 3R8EA 4Y1CA 3HXMA 2F9TA 3J8AA 3PUFA 3RMAA 4R5PA 3ENHA 4IO8A 3CYGA 5KRTA 4DFMA 4CGJA 1T6CA 3HJFA 3MCAB 1NBWA 4PL8A 3S41A 2E2NA 1NGAA 1RTHA 1U4BA 4FJ7A 4E7IA 4FYDA 4KO0A 4CF8A 4EIAA 4O55A 4X66K 2OA8A 4DTOA 4AF1A 2HHUA 4JN4A 3GE1A 3CETA 3V9ZA 3RSEB 1KVBA 3K5MA 3SQ2A 3W0LA 3L2VA 1YTAA 3J7ZO 5ELZA 3LDSA 4GKKK 2P9PB 1Y97A 5AQXA 3CM6A 3OS2A 5FROA 1MWKA 4FSVA 1JCGA 4CJTA 3EEQA 3LP2A 3KLIA 1WNSA 3WXMB 2CH5A 4BRQA 4HTLA 4FWOA 3O9TA 3D7EO 2Q97A 1Q9YA 1B9FA 3ZSZA 5I9EB 3K9JA 5AQFA 5M1OA 3HT3A 3O3GA 3I55N 4EHUA 1R59O 3TAEA 4H5TA 3LDQA 5CZ2A 4O8KA 1JLEA 1QSLA 2Q36A 3KD5E 4O0JA 3H1VX 1VRUA 1KCFA 3DRPA 3UKRB 5ADXA 3NVMA 3SBGA 3M8QA 4A61A 3ZEUA 4IOAL 1TAUA 1VQLN 4I9QA 3OYEA 4M63C 3IS9A 2HW3A 1SV5A 1JL2A 2ASMA 3RWUA 3TR8A 3WQUA 2FBYA 3G71N 1E3MA 4C23A 3JS6A 1NMDA 3SNNA 5AQRA 2I7PA 4Q0BA 4HUFA 4JEPA 4LSLA 3I33A 1YUWA 4BRPA 3CI5A 4PA1A 3DXMA 2ZGZA 4BRCA 4PY5A 2QTDA 3ZSRA 3VQ9A 5KTQA 3CPWM 3PX4A 4BRAA 4W5QA 3FGUA 1ATSA 5EOYA 5BR9A 4LSNA 4FLVA 3L8BA 4F2RA 4DV6K 2CGJA 3EN9A 4CF1A 2E2PA 3AAQA 4CJEA 2HHHK 2ZJPL 3E9PA 4RW7A 2PBDA 3E66A 4C8MA 4FJHA 4JKAA 1QQNA 4BG9A 2BE2A 1YVNA 1JXBA 3DRRA 1L3TA 2HHTA 4CZFA 4NCBA 1S22A 4NLCA 4M45A 1IV0A 2GUPA 1OVQA 4BR2A 1UOCA 3LAKA 3IUCA 5GAGP 4B1XB 1JLBA 4G9ZA 1J6ZA 2KQ2A 4EFHA 1BQMA 1NOZA 4IFYA 2IGIA 2V51B 3H3OB 3NCIA 2OPRA 1WB9A 2VWBA 2C1GA 4Z4CA 4PKIA 2E2OA 3G10A 3UB5A 4CEDA 1NGBA 2VYPA 3PO4A 1SKSA 3O80A 4HVJA 2W42A 1VSLA 1RDUA 4KI6A 3PLAA 2FBXA 3HRGA 3K2PA 4IWVA 3AVJA 4CFAA 3HOSA 4ID1A 1L3UA 3CCVN 2NZTA 3V9WA 1OH5A 1SQKA 4KHSA 1X3MA 3OYMA 3CCSN 2IVOA 3EE8A 4M3UA 2DFEA 1L3SA 2O8DA 2ETJA 5GIPA 4H5RA 3AVHA 1K8AO 1ATNA 2Q0UA 5C15A 3ZT4A 1NG9A 3ZCMA 1KSPA 3MEEA 3KK7A 4IJNA 1RT4A 3IKMA 4B9VA 3R6MA 1MA9B 3A5LC 3LDNA 1X9WA 3HVTA 5AZIB 4R79A 3ENBA 2HHVA 2XY7A 2A6AA 4FK4A 1GLAG 2RKIA 5AQJA 4WFBL 2RE2A 1K9MO 3PSIA 3EE9A 4BRLA 1NJXA 1L3VA 3VQQA 5BPNA 3THXA 4DQ8A 4W5RA 4XEIA 4JS4A 3SUPA 4KTZA 3L4IA 3FE1A 1RBVA 4BRKA 1R0AA 1FK9A 1NGIA 1TUYA 3KK1A 3OYBA 1DEJA 5TKYA 4KHPK 2FBTA 5J1EA 3ATVA 1KQSM 4DFPA 4O0IA 2YNHA 2D0AA 3CJ1A 4TSXA 3LPUA 5M1QA 4XH4A 3DLRA 4A57A 4CJ5A 2F8TA 4CVNE 2A1RA 1I94K 2P9UA 3BF3A 3DWLA 3LALA 4H5WA 5AQVA 1NK0A 4BDPA 1U2VB 1X3NA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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