2FF3B

Crystal structure of gelsolin domain 1:n-wasp v2 motif hybrid in complex with actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords Gelsolin
molecule tags Structural protein/contractile protein
source organism Homo sapiens
total genus 116
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff3B03
4CD3A 5JMVA 1GLEG 5KPRA 3O8MA 1QQNA 2FSNA 3CHWA 3W0LA 3FR0A 3CJAA 4M7XA 4BRDA 3VEWA 4O8KA 4CBXA 4CZJA 2E88A 4BGAA 1X3MA 3A5LC 4WQ4A 3B8AX 5BREA 3IMXA 4FWLA 2A40A 1JCGA 5BN8A 1ZC6A 3CETA 4PKIA 3FLCO 3CJBA 4K25A 4FWPA 2E8AA 1R59O 4FPAA 4L3QA 5F1XA 2IVNA 3H1QA 3ATUA 5AQUA 1T6CA 2P9UB 2WUSA 2GWKA 3VEZA 1TYQB 2HF4A 1RDWX 2E1ZA 1GLBG 4BR9A 5AQRA 4JHDB 3AAQA 5AQKA 2FSKA 4IZ9A 3VGMA 3HM8A 5AQQA 1OKJA 1SAZA 2A5XA 2P9IB 5AQTA 4BR2A 3MN6A 1GLFO 1E4GT 3H1VX 2QWLA 4B1WB 2GTDA 2Q0RA 1NGDA 3MMVA 4JD2A 3VF2A 4BG8A 4CBUA 3QMLA 2GUPA 3WQTA 1ESVA 4BRMA 1MDUB 1HLUA 1ATSA 1D4XA 2Q2RA 2QWMA 1HKCA 4H0OA 3VF6A 4BRNA 3P4IA 1Z6RA 3U4LA 4BRAA 5BRHA 4BGBA 4DCHA 3ZETA 3D2EB 3ENHA 4B1VA 4DQ8A 3TU5A 5ELZA 4A2BA 4BR5A 3ZEUB 5BPNA 3DXMA 3IFRA 2V7ZA 4AM7A 4MLEA 1YXQA 3VEVA 5KQ8A 3CIPA 4FWRA 3QBXA 1K8KA 4CZHA 5EVZA 4HTLA 3OHRA 2P9SA 4IO8A 3VENA 3UKRB 3H3OB 3HI0A 3LM9A 2ASPA 1NGCA 3A0IX 2CH5A 2YCHA 3MN7A 2YHXA 3GDQA 3UKUA 1JCFA 2D4WA 1NGGA 2ASOA 5BPLA 2ZWHA 3FZLA 4K41A 1T44A 2QWOA 3LDNA 5AQLA 5KQDA 4RTFD 2W41A 2GEMA 5LY3A 3CQXA 1ZXOA 2QWQA 1MA9B 4H5TA 3O1WA 4ISEA 1XC3A 3BP8A 4JNEA 2HOEA 3SK3A 5LJWA 3O1BA 3L0QA 1QZ6A 4K43A 4BC5A 3WXIA 3HSCA 3EKSA 5EOYA 4A2AA 4PL7A 4BG9A 2Q31A 5ADXA 1HX1A 4FPBA 3GOIA 4CZKA 5I9EB 4KBOA 3O5BA 1BOTO 3BEXA 3FFKB 5AR0A 1IJJA 4BR7A 1HKBA 2ITMA 1GLDG 4B1YB 4BRLA 5BPMA 2GELA 4H5WA 3BF1A 4I6MA 3MK6A 3KZBA 2P9SB 3M1FA 3RSEA 2HF3A 3FZFA 3IDHA 3QBWA 3WXKA 4CZMA 3AARA 5B8HA 1HKGA 4QS8A 1NGAA 4EIAA 1U2VA 3O4WA 4BRHA 2QM1A 3LM2A 3LL3A 1NMDA 2P9PB 3I8BA 4GY2B 4WYBA 3EZWA 3R6MA 4CZLA 3DXKB 4EFHA 1TUUA 2E20A 4B1ZA 2D1KA 4IJNA 2CGKA 5BRDA 4BVOA 5AQOA 5AQFA 3R8EA 4CZFA 3W3DA 1QZ5A 2P9NA 1H1VA 3QFPA 4RWTA 1G99A 1P8ZA 3VERA 3CJ1A 3DJCA 3F9MA 3HBTA 3GBTA 2J4RA 2Q97A 3FZMA 4QS9A 1MWKA 3ID8A 2ASMA 2H3GX 2D0OA 5JLHA 3C7NB 2YJEA 1BWFO 1RFQA 3L4IA 1BU6O 4WQ4C 4PKHA 3D2FB 1KAZA 1V4SA 5ADXH 4BR4A 3MN9A 4BRPA 2P9KA 2E2PA 4ISGA 2PAVA 2VWBA 4H0TB 2A41A 1HJOA 1KAYA 4H0PA 4NO7A 4WQ5A 5AZJA 4H5VA 3VGKA 5FPDA 4EHTA 2A3ZA 2UYTA 5KPTA 4MO5A 1JCEA 3VEXA 4BR0A 3A5MC 1NGEA 5EXWA 4NB4A 3U9ZA 3UE5A 2FLOA 4XH4A 4LC9B 3SMSA 2V7YA 2A6AA 2NRHA 1DEJA 4O5FA 4BQLA 1NWKA 5AQZA 4YDUA 3H3NO 3GG4A 1GLLO 1X3NA 2P9LA 4FOEA 2E1YA 3ULEA 1WOQA 4PKGA 4EHUA 4IWVA 2FF3B 1ZBSA 2YHYA 3VOVA 2F9WA 2CGLA 4B1XB 4FL9A 5FPNA 2AP1A 2E2NA 1ATNA 2ZF5O 3WEEA 5AQPA 1Y64A 2IVOA 1S22A 3GE1A 4JAXA 3O80A 3HZ6A 1T6DA 5AQJA 3ZX3A 4JD2B 4CZIA 3A5OC 3VF4A 3C0BA 2P9KB 2V51B 3LDLA 4PL8A 1EQYA 3A5NC 5EY4A 5AQSA 5AZJB 1NM1A 3BUZB 4ISFA 1KXPA 2CGJA 2F9TA 2ZGZA 2FSJA 1C0GA 5AFUH 4CI6A 5FPEA 3MDQA 2QW9A 3ZETB 5F0XA 1HUXA 4H0XB 1ATRA 4BROA 2BUPA 2D0PA 4H5NA 2FF6A 2QWPA 2P9UA 1QQOA 3DXMB 4RCHA 1BA0A 1TYQA 2P9LB 1LCUA 4XH5A 1GLAG 1K8KB 4IJAA 4BC3A 5BR9A 4IXCA 4JHDA 2IIRA 2HMPA 4BRKA 5AQNA 1V4TA 3LDQA 3VESA 4B9QA 1E4FT 1TUYA 3UKUB 4DHYA 3L6QA 4EAHD 1KAXA 5EX5A 4BRFA 1QQMA 3U9DA 3UB5A 3EL2A 1Z05A 2PBDA 4CD1A 4BRQA 1YUWA 1RGIA 1IG8A 3M3ZA 2ZGYA 2Q1NA 5FPMA 2QWNA 2OANA 3S41A 3SLCA 4BREA 4FOIA 4BQZA 4FWOA 3D2EA 4A62A 5AQMA 2DPNA 5AZIA 3DAWA 4DB3A 3IUCA 4H03B 3KVGA 3ZEUA 4BRIA 2W40A 3CI5A 4K42A 3JS6A 5JLFA 4F9OA 5KPZA 3VEYA 4Z94A 5AFUA 1YAGA 2V52B 1BA1A 2YI1A 2IVPA 3M6GA 4I6MB 1NGJA 4FO0A 5AQHA 3UKRA 4CZGA 3RSEB 3VPZA 2QXLA 3J8AA 2NZTA 3O08A 5BRFA 3FE1A 3U8XA 2AA4A 4MLHA 3FZHA 3VETA 4BVPA 3AAPA 1U2VB 5AQGA 4A61A 4XEIA 2Q0UA 2GWJA 4BRCA 1HPMA 4M63C 3WT0A 3HTVA 5TKYA 4FWSA 4FWKA 1SZ2A 5BN9A 1LOTB 2EWSA 4GNIA 4H0VB 3VGLA 4FWQA 2P9NB 3CERA 3H6EA 3CJCA 2Q36A 3WQUA 3ATVA 1MWMA 4M7YA 2FXUA 2YHWA 3BF3A 3QB0A 1S3XA 4FSVA 1J6ZA 2E2QA 1GLCG 3QFUA 5CE3A 3I33A 1CZAN 3CJ7A 4JN4A 5AZIB 3TPQA 3WUHA 4WQ5C 3ZX2A 4C23A 4H0YB 1U6ZA 3G25A 3R9PA 3ZX0A 4CJ7A 1Q18A 3GL1A 3EN9A 3EKUA 1C0FA 4BC4A 1DGKN 2I7PA 2KHOA 4B1UB 4HWIA 1X9JA 3D7EO 1SQKA 3WXJA 5AQXA 1NGHA 4FWMA 2E2OA 5LJVA 3SJHA 4QS7A 3MCPA 4XH1A 3H46O 1NLVA 3LDPA 4CZEA 4YDUC 3CQYA 2VCPA 3KHYA 1QHAA 3A8YA 1NGIA 4BC2A 2P9PA 5F2RA 3FZKA 3MN5A 4BRGA 4FWNA 1NGBA 1XQSC 2BTFA 3DXKA 3O6WA 3WXLA 1YVNA 5AQIA 1GLJO 2NLXA 5E26A 5JICA 5AQYA 4AM6A 3ULEB 5AQVA 2YJFA 1BUPA 3H45C 1WUAA 5E84A 4J8FA 1BO5O 1XUPO 3QICA 3ENOA 2I7NA 3JXUA 2VYPA 3QDKA 2QWRA 1BG3A 2P9IA 1NBWA 3AY9A 3FGUA 3DWLA 3SMPA 1DKGD 3VEOA 3WEEB 3LDOA 4E1JA 1NGFA 3C7NA 4CBWA 5AQWA 3EO3A 4MO4A 2A42A 2CH6A 1BDGA 3D2FA 3CJ9A 4H5RA 4Y0WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHNA 3O8MA 4CESA 1TAQA 4CGGA 3HOTA 4CJVA 4BRDA 4DQQA 4R5PA 4FLYA 2OA8A 4A5BA 3EE8A 2E88A 3DI6A 1MU2A 2HNDA 5BREA 2X74A 3IMXA 2WTUA 1ZC6A 4B3RK 3KLGA 2OPQA 3CJBA 1R59O 4FPAA 2IVNA 3PX0A 3H1QA 1T6CA 3LP0A 2P9UB 2WUSA 2GWKA 2IGIA 1JLEA 3LPTA 2HF4A 1LWEA 1JLGA 3PX4A 4DU3A 5AQRA 3VQBA 2FSKA 3TTFA 3VGMA 2ZJPL 4LF9K 3CMEN 3DOKA 1OKJA 4OPAA 4OPHA 1SAZA 4B9TA 3SPYA 4JKGA 1HNXK 4Q0BA 2QWLA 3TR8A 3VQ7A 3MMVA 2O8BB 1VRUA 5GIPA 4CGJA 3ZT3A 1LAVA 1VSFA 4IOCL 4JKCA 4CK3A 1SL1A 1LWCA 4GVMA 4BE0A 4FW2A 2JGUA 1HKCA 1VQ8N 4ELVA 1NMNA 4IO9L 3P4IA 1NJWA 2GX9A 4BRAA 4DCHA 2R7YA 1QS4A 4KB0A 3CG7A 4CE9A 1IKXA 4M3RA 4A2BA 4FJ9A 1F21A 1KTQA 2FBYA 1C1AA 1XWLA 5H1SQ 1SUQA 4FWRA 4IG0A 4CZHA 4CHZA 4HTLA 4NYNA 3OHRA 1L3TA 1K73O 4LFAK 1QVFM 2P9SA 4DLEA 1HJRA 4IEIA 3WNFA 3MAQA 3UKRB 3G0ZA 3A0IX 2CH5A 1NJXA 4JKGB 3CCVN 3GDQA 3KTQA 3JAMO 1NGGA 2ASOA 1VQ9N 3LDNA 5AQLA 3NE6A 2W42A 4EZ9A 1NK6A 3B6PA 3M8PA 2YKMA 5CYMA 3K5NA 3CQXA 4H5TA 3SK3A 3PO4A 4K43A 4RW8A 3QNNA 3EKSA 5EOYA 4LF4K 3VQEA 2Q31A 2FBTA 1T3VA 5ADXA 2IDOA 3AV9A 1KFSA 4B9UA 2UXBK 4CZKA 5I9EB 3NH1A 3C6UA 3BEXA 4JI2K 3FFKB 3SBGA 1IBKK 4AHTA 3T1YK 1T03A 4QCLA 3CF5L 2GELA 1W97L 2NNWA 4HCCA 3MK6A 2P9SB 3RSEA 2HF3A 3KKSA 4CZMA 4G1QA 1NGAA 4E19A 4IDKA 2QEXN 1U2VA 3O4WA 1NMDA 4YY3K 3I8BA 4GY2B 3OBYA 2ZJQL 4FM0A 3RR8A 3R6MA 4B8CA 1TUUA 2E20A 4B1ZA 5BRDA 3L3VA 5AQFA 3J7AP 4WFBL 1QZ5A 1TKTA 3QNOA 3HOSA 1TKZA 3D0PA 3HP9A 1FKPA 1P8ZA 3HL8A 3DYAA 2J4RA 2Q97A 4DSEA 1HQEA 3TSPA 1JL1A 3HPOA 2BGGA 3V1RA 3QIOA 2G8IA 3ZSRA 4CJKA 3O4QA 5JLHA 4KHYA 4PKHA 3D2FB 4FJKA 3RWUA 4BR4A 2E2PA 1S6QA 3BY5A 2PAVA 4B3TK 2A41A 5M1QA 4A5AA 4H0PA 4NO7A 5AZJA 2UXDK 2A3ZA 5KPTA 1JCEA 3L2VA 3VEXA 3A5MC 5EXWA 3AA3A 3U9ZA 1UA0A 5JS1A 1EX4A 3TANA 4CK2A 1VQKN 2NRHA 4O5FA 1NWKA 1IG9A 4YDUA 2OPSA 3AVNA 1WSEA 1GLLO 1X3NA 4KB1A 4O4GA 4MDBA 4KTWA 1BQNA 2HHHK 3KD5E 4CF0A 4V19S 3LAKA 4B9LA 5LMUK 3LP2A 3HVRA 4E7LA 4O0IA 3WEEA 2RHKA 5KRTA 3BGRA 1S22A 3GE1A 3AVHA 3OBWA 5CY4A 4F3OA 3HZ6A 5AQJA 4JD2B 3AGKA 3DLKA 3D45A 1NOZA 2PYJA 1WSGA 3A5OC 3SV4A 3VF4A 5M1KA 1RDAA 2IS3A 2V51B 3TTDA 3MWPA 3SBTA 1A5XA 2P5OA 4BACA 3CCSN 4FLVA 5AZJB 1O1WA 4ISFA 2RPIA 2F9TA 2F96A 2FSJA 4CJ4A 1JL2A 3LWLA 1GOCA 4CI6A 5FPEA 2QW9A 1HUXA 4KHWA 3J7YP 4H0XB 4CGHA 4CEZA 1ATRA 3P83D 1EETA 1XI1A 4K8ZA 1YI2N 3DXMB 4LSLA 2XY7A 2OCEA 3R3LA 1TYQA 3OYMA 3VN5A 4DV2K 3SUQA 1D9FA 4DFJA 2IIRA 4BRKA 5AQNA 1CLQA 4DFPA 3VESA 4JI3K 5J2PA 2VG6A 5KGWA 4B9QA 4CIFA 1E4FT 3KK7A 4DFKA 1VQON 3UKUB 2D0CA 3MCAB 5C2FA 3NH0A 4DF8A 2A1SA 1QQMA 4FM1A 3EL2A 4DTXA 4CD1A 1RGIA 3EY1A 1IKVA 1IG8A 4O8UA 3UIQA 2UUAK 1JKHA 2ZGYA 3AVIA 1ZBHA 5FPMA 1KFDA 1S6PA 4JI0K 1XC9A 4BQZA 3QLHA 3OYKA 4CF9A 4A62A 1XHXA 5HROA 2DPNA 2O8DB 3F73A 3I56N 5AZIA 3P1GA 1JLAA 3KK2A 3ZEUA 4BRIA 2W40A 3OS1A 4I9QA 1NG9A 3MX2A 1QQCA 4BDZA 2B5JA 4DQSA 3P38A 1BA1A 1Z26A 3OS0A 1NGJA 4FO0A 2WC9A 5KRSA 3P31A 1IV0A 3O08A 3U8XA 4F2SA 1IO2A 3VETA 4BVPA 3CCRN 4Z4HA 3G71N 1HPMA 4E1MA 3WT0A 1HYSA 5BN9A 2EWSA 4GKKK 1S1TA 5BR8K 2KZMA 4CEOA 3SQ4A 4FJMA 1J53A 3C95A 3TSUA 1T05A 4DV1K 4OLAA 4X62K 4M7YA 2FXUA 1S3XA 2ETJA 1J6ZA 1IKYA 3L8BA 4NCGA 3I33A 2HW3A 5AZIB 3ZX2A 4WQ5C 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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