2FF3B

Crystal structure of gelsolin domain 1:n-wasp v2 motif hybrid in complex with actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords Gelsolin
molecule tags Structural protein/contractile protein
source organism Homo sapiens
total genus 116
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff3B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff3B03
5E26A 4EHTA 5KQ8A 3D2EA 3VEVA 2HF3A 5AFUA 5AQVA 3EN9A 3SMSA 4H5TA 3FE1A 1ESVA 3QFPA 1BA1A 1U6ZA 2UYTA 3B8AX 4F9OA 4H03B 4BRGA 3HBTA 3U8XA 4FOIA 2P9IA 5ADXH 3D2FA 1NGDA 3FZHA 4K43A 4BR4A 3IUCA 4BRLA 1MWKA 2VYPA 3ZX2A 3CJ7A 2P9PA 4JHDB 2P9KB 5EY4A 2ZGZA 3WEEB 2P9LB 4B1YB 3CIPA 1BG3A 2E2PA 4CJ7A 3UB5A 5FPNA 1BO5O 3VEOA 3CERA 1KXPA 5AQPA 1S22A 1X9JA 2A41A 3U9ZA 3S41A 2YJFA 1ATSA 2E2QA 4MO5A 4I6MB 1HUXA 3WXJA 3VGLA 3CQYA 4WQ4A 3O8MA 2F9TA 1MA9B 3VF6A 2DPNA 4B1UB 4DB3A 1RFQA 1X3MA 4CZJA 1NGJA 4IXCA 3ULEB 3WXIA 4H0VB 1BA0A 1JCEA 1U2VA 4H0XB 5AQLA 3MK6A 4H5VA 4A2AA 1HLUA 3WQUA 4WYBA 1Q18A 4CBWA 3GDQA 3BF1A 1NGEA 3FGUA 1T6CA 1NM1A 5JICA 1P8ZA 3LDLA 4I6MA 1E4FT 3O80A 1TUYA 2Q0UA 4CZFA 1NGIA 3LDNA 3MN9A 3ZETA 3I8BA 3QBXA 1HJOA 2FLOA 1BU6O 2ITMA 2EWSA 3DJCA 4FWOA 4BQLA 2FXUA 2OANA 4B9QA 1SQKA 3P4IA 4BG8A 3C7NB 3KVGA 2E8AA 3EZWA 3GBTA 3I33A 5AQOA 4Z94A 2P9SA 3VGKA 4JD2A 2E88A 2GWJA 1CZAN 2P9UB 3ULEA 5AZJA 3VF4A 5BPNA 1GLCG 4IWVA 4DHYA 2IVOA 4BVOA 5JLFA 4GNIA 4FOEA 5AQMA 5FPDA 5F1XA 4BRFA 3H6EA 1IJJA 1SAZA 3DXKB 5BPMA 1NGFA 3O1WA 5TKYA 4FL9A 1QZ6A 5EX5A 3W3DA 1GLFO 5EVZA 3WUHA 2Q97A 3VF2A 1MWMA 4AM6A 4CZMA 1ATNA 2D1KA 5AR0A 4DQ8A 4J8FA 5BPLA 4CI6A 3CQXA 1EQYA 3MMVA 5AQZA 4BG9A 1XC3A 4FWSA 1KAZA 3CI5A 2V51B 3ZEUA 4IJNA 4B1VA 4FWNA 1DKGD 3BUZB 1YXQA 2VCPA 5ADXA 2YHYA 3HI0A 1NGGA 4DCHA 1V4SA 4EIAA 4RCHA 3D7EO 2E2NA 1YVNA 4L3QA 4A61A 4Y0WA 2A40A 2QWLA 1JCGA 5E84A 4XH5A 1QHAA 4H0PA 4IO8A 5AQWA 4FWLA 3RSEB 4B1WB 2CGLA 2IVNA 3H1VX 5B8HA 4BRHA 1ZC6A 4H5NA 3UKRA 3DWLA 3EL2A 4PL8A 4YDUA 4B1XB 3UKUA 1Z05A 1YAGA 4JNEA 2GEMA 4CZKA 3FZKA 3CJ1A 4RWTA 2E1ZA 4WQ5A 4FWPA 3FR0A 4CZHA 1K8KB 3L0QA 3A5LC 5KPZA 3DXMB 4FO0A 5JLHA 4HTLA 1WUAA 2FSNA 2A6AA 1TYQB 3LM2A 3MN5A 2GELA 2VWBA 3AY9A 3J8AA 1YUWA 3MDQA 3WXKA 2D0OA 4H5WA 3M1FA 3O1BA 2IIRA 2E1YA 4FPAA 2Q2RA 3IDHA 4QS8A 1NLVA 1RGIA 4BR9A 4O5FA 4BVPA 1QQNA 3HTVA 1BDGA 5ELZA 1T6DA 2Q0RA 3CETA 3A5MC 3L6QA 4PL7A 5AQTA 1HKBA 2QWPA 4JHDA 1KAYA 1X3NA 2P9KA 4CD1A 4H0YB 2QWRA 3WEEA 4ISGA 2P9LA 4BREA 1NGBA 3KHYA 5FPMA 4BRPA 5BR9A 4MLEA 3QFUA 4YDUC 2AA4A 3ZX3A 3FFKB 4M7XA 3U4LA 4NB4A 5AQJA 4H5RA 4WQ5C 1GLLO 1BWFO 1BUPA 4BRCA 3VEWA 4MO4A 4GY2B 1BOTO 3H1QA 1S3XA 5AZIB 3SK3A 5AQRA 2FSJA 1R59O 2W40A 3TU5A 3OHRA 5BREA 3GG4A 3H45C 1TUUA 4BRDA 2QM1A 4BC2A 5KPRA 3A5OC 3JS6A 1NMDA 4QS7A 3HM8A 3SLCA 4EFHA 4KBOA 1T44A 3FLCO 5AQUA 3HZ6A 4PKIA 3IFRA 2ASOA 4BC5A 2E2OA 3JXUA 3VERA 3C7NA 3CJBA 4MLHA 5KQDA 3CJCA 1HKCA 2I7PA 3GOIA 5EOYA 4FWKA 2P9UA 3R6MA 2P9NB 4O8KA 2V7YA 3EO3A 3ATUA 1HX1A 2A3ZA 4FPBA 2NRHA 1WOQA 3VEZA 3IMXA 4PKGA 2QWNA 3ZX0A 4BGBA 1XQSC 2V52B 5AQHA 2CH6A 3FZFA 5BRFA 3AARA 2QXLA 1GLBG 2FSKA 3DXKA 2ASMA 5AQXA 2QWOA 4CD3A 2IVPA 3R9PA 3KZBA 3HSCA 3LDPA 4CZIA 3BF3A 3D2EB 1HKGA 5LJVA 5BRHA 2A42A 2J4RA 4PKHA 4M7YA 4CBUA 2YHWA 4JAXA 3FZMA 1LCUA 1NWKA 3VENA 4LC9B 4BR0A 5BN8A 3W0LA 4K42A 3BEXA 1NGCA 3CJ9A 3D2FB 4QS9A 1QZ5A 4XEIA 2F9WA 1OKJA 4B1ZA 2CGKA 2P9PB 1GLDG 4ISEA 5LY3A 3O5BA 3R8EA 3WT0A 3CJAA 1E4GT 1LOTB 4C23A 4CZEA 3LL3A 3EKSA 1GLJO 4EAHD 4H0OA 3RSEA 5LJWA 3VOVA 3VEXA 2GUPA 5AQNA 4XH4A 1XUPO 4K25A 2H3GX 1SZ2A 2QWQA 2YCHA 4AM7A 3VEYA 3QBWA 1IG8A 2BTFA 3H3NO 2D4WA 1K8KA 3QDKA 3A5NC 4BGAA 5AQIA 3DXMA 3G25A 1QQMA 4M63C 4BROA 3MN7A 4FWMA 2NLXA 3AAQA 1TYQA 1U2VB 5AQGA 3O08A 2Q31A 2WUSA 3LDQA 5AFUH 3WQTA 2CH5A 1H1VA 4HWIA 4BRQA 3WXLA 3GL1A 3TPQA 2AP1A 3H46O 3SMPA 3ZETB 4XH1A 2KHOA 3A0IX 3U9DA 3VETA 5F2RA 3AAPA 4EHUA 1ATRA 4IZ9A 1HPMA 2Q1NA 4BR2A 2NZTA 3ATVA 5JMVA 3H3OB 2P9SB 4JD2B 3MCPA 4BR5A 5AZJB 3VGMA 3A8YA 1D4XA 4H0TB 2YJEA 5FPEA 2HF4A 2QW9A 4A62A 2ZF5O 1QQOA 1V4TA 4BRKA 2HOEA 5BN9A 2W41A 5AQSA 4FWRA 1C0FA 1RDWX 3LDOA 3LM9A 5AQKA 1NBWA 3SJHA 1ZXOA 2E20A 3M3ZA 5AQQA 4NO7A 2D0PA 3QICA 3ENOA 3UE5A 4BC4A 1DEJA 2QWMA 3FZLA 5AZIA 5F0XA 1Z6RA 4E1JA 4ISFA 5AQFA 3ZEUB 2PAVA 1ZBSA 1DGKN 2YI1A 1NGAA 1Y64A 5AQYA 3F9MA 1MDUB 3EKUA 2HMPA 1KAXA 4WQ4C 4BRAA 4CZLA 4IJAA 3QMLA 4BQZA 3L4IA 5BRDA 4FWQA 2FF3B 4FSVA 1GLAG 3ENHA 4K41A 2BUPA 4BC3A 2FF6A 3QB0A 3CHWA 3VPZA 5CE3A 1G99A 3DAWA 3VESA 4A2BA 2ZGYA 3BP8A 1J6ZA 1JCFA 2P9NA 5KPTA 5I9EB 2CGJA 3UKRB 4BRIA 3C0BA 4RTFD 4BR7A 3UKUB 1NGHA 2I7NA 3ID8A 4CBXA 2V7ZA 3M6GA 2A5XA 2ASPA 2GWKA 1GLEG 2P9IB 2YHXA 5EXWA 4BRMA 4CZGA 3MN6A 4JN4A 2GTDA 2Q36A 2PBDA 3O6WA 2ZWHA 4BRNA 3GE1A 3O4WA 1C0GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TR8A 3EYZA 4ID1A 3LWLA 3ZCMA 5AFUA 4CEFA 4AH9A 1VQ6N 3FE1A 5C10A 3PX6A 3QFPA 1U6ZA 2UYTA 4F9OA 3HOSA 4CF8A 4H03B 4BRGA 4R79A 2ZD1A 3F2KA 4Y1DA 4I9QA 4BR4A 2KZMA 3QLHA 2P9PA 1KC8O 2RE2A 3OA9A 1VK0A 2FBTA 3OYNA 2P9LB 3CYMA 3DMJA 4KTQA 3UB5A 4BWMA 4KH6A 5FPNA 1BO5O 1KXPA 4OLBA 1S22A 4E7IA 3S41A 2YJFA 4MO5A 3KLEA 4I6MB 4AILC 4DV1K 5DM6L 3NF8A 4CJ4A 3VGLA 1FKPA 4IEIA 4B1UB 2DPNA 1JXBA 1TV6A 2BGGA 3T19A 1X3MA 2YKMA 4IXCA 3AA5X 4H0VB 1BA0A 3BZKA 1S9EA 3AA2A 3D6RA 5JICA 3HXMA 3V81A 2YNHA 1U48A 4JKBA 3VQ5A 4BDYA 1KCFA 3QBXA 1T03A 1HJOA 2ITMA 3VQAA 2OANA 3EZWA 3GBTA 3I33A 4Z94A 2P9SA 1N36K 3VGKA 4JD2A 4YOVA 1ILYA 3KLIA 4JI0K 4CJSA 4CJUA 4IFEA 3KLGA 4DHYA 3V9SA 2IVOA 3VQBA 5JVHL 2PY5A 1N5YA 4FOEA 3THYB 1B9DA 3AO3A 3PIOL 4FJXA 3H6EA 3DXKB 2UUBK 1YTUA 4DR5K 3O1WA 5KRSA 4FL9A 4RG8A 4B9VA 3O9SA 2D0BA 4OKKA 4PA1A 3R3LA 1L5UA 4I2QA 3WUHA 2Q97A 3VF2A 1HQUA 2VG6A 4CJVA 5AR0A 4DQ8A 1T7PA 4J8FA 4FJHA 5AQZA 3VQ8A 4MFBA 4IBNA 1ZBIA 4V19S 4IJNA 2QTDA 3BUZB 3PIPL 5ADXA 5GADP 1GOBA 3KWGA 1NGGA 4M3UA 3CMEN 5HRPA 3U3GA 1KQSM 1WN7A 4A59A 4L3QA 3OS0A 1OH7A 4N41A 2QWLA 3L3VA 5CHIA 3WXMB 1VSDA 1JJ2M 4FJLA 4DFMA 4Z4FA 3AGRA 4F2RA 5C12A 3SI6A 3DWLA 3I56N 1Z05A 3THWB 2GEMA 3QNNA 4CZHA 4LFAK 4CHQA 4W5TA 1YF5L 3L0QA 3A5LC 1N34K 2HBKA 4FO0A 4B9NA 4HTLA 3DLRA 3QIOA 2FSNA 3MN5A 1VSIA 3AY9A 1YUWA 1WNSA 4CK1A 3ISNC 4DR2K 4CIFA 4DSFA 2IIRA 2E1YA 4FPAA 2Q2RA 4LF5K 4CEBA 1RGIA 2KKZA 4KTWA 4BR9A 5HLFA 3HTVA 5ELZA 4X64K 5SZTA 1KAYA 5JS2A 1M90O 3LZIA 3CPEA 1D8YA 3OYMA 3RMBA 4DV6K 4DSLA 3ZSZA 2ZE2A 3KHYA 1LW2A 4C8NA 4MLEA 3QEIA 4IOCL 3DLLL 4M45A 5JENA 4NLBA 4H5RA 1HMVA 4OPHA 1JL2A 4WE1A 4MO4A 4BRCA 1NK7A 3NH2A 3ZT2A 3H1QA 1S3XA 1Q9XA 4CGJA 2FSJA 3KWIA 2UXCK 4TSXA 4HTUA 3O9QA 1NKCA 4BC2A 1VSFA 4NCAA 4WFNL 3SLCA 1T44A 3AVJA 1Q9YA 3IFRA 3N4PA 3L4QA 4F3OA 2O8DB 3VERA 3CJBA 4WF9L 3AVHA 3CJCA 2D0CA 2I7PA 3GOIA 3AO4A 5GIPA 4FWKA 2P9UA 2VWKA 1I39A 1QE1A 2P9NB 4O8KA 5FLXO 4DV5K 3ATUA 1RNHA 3MEGA 2G8WA 2UUAK 4B8AB 1S72N 3O3FA 3DI6A 3ZX0A 2VG5A 5AQHA 4NCGA 1GLBG 1IO2A 4KPYA 3CCJN 3ASMA 3TSPA 4OJRA 3ALYA 3HSCA 3LDPA 3BF3A 3F9KA 2HNYA 3OYEA 1NMNA 4KAZA 1QHTA 4J2EA 1JLAA 4PKHA 4M7YA 5GAGP 4E7JA 4Z4CA 1QTMA 3V6DA 4QOZB 2WFBA 3BEXA 1NGCA 3C65A 4DTSA 4ELVA 4XJXA 4XEIA 2F9WA 4BE2A 4B1ZA 2CGKA 2KQ2A 2P9PB 3TABA 1BI4A 3VA3A 4NCBA 1CZ9A 3LL3A 2QKKA 1TKZA 1YITN 1WSEA 2X6SA 5LJWA 3VOVA 4M3YA 2GUPA 2D0AA 1VQPN 4FVUA 2P5GA 4FYDA 4B3RK 4BWJA 3E9LA 2F8SA 3QBWA 1IG8A 1XNRK 3OYGA 3H3NO 1C6VA 1U49A 2D4WA 1IG9A 3ZYYX 3I8DA 3T3FA 4B9TA 4BROA 2UXDK 4FWMA 2NLXA 2GX9A 4DSIA 4E89A 2B5JA 4RW6A 5AQGA 1ASUA 2DFHA 3KD5E 4YHHK 2WUSA 5AFUH 1UAXA 2W42A 2WTUA 2HHVA 1KVBA 1KLMA 2RPIA 1VQMN 1CLQA 4XH1A 3A0IX 3VETA 4DKWA 4CEQA 4EHUA 3SQ4A 4RW7A 2HBLA 5HRRA 1HPMA 2HHHK 5JMVA 3O9UA 2P9SB 4M3RA 4JD2B 3MCPA 1BIZA 2EX3A 2YJEA 4Z4GA 5M1QA 4LH5A 4A62A 4HCCA 4JI4K 2W41A 1RBUA 4IFYA 4FLVA 3LDOA 5AQKA 3SJHA 2F4VK 3PX4A 3SJJA 1WAFA 3E9PA 1Q7YO 3QEXA 4B9SA 3SYZA 2OYQA 5GAEP 1DEJA 2QWMA 5J2QA 3FZLA 4FLTA 3WNFA 2IGIA 3ENBA 1NK5A 3EE9A 4IEEA 1QQCA 1JLGA 2G8FA 2O8FA 4WFBL 4W5OA 1DGKN 4JK8A 3SBTA 2KFZA 3EKUA 3AVMA 2ZM6K 4BQZA 4YFUA 3L4IA 2AJQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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