2FF6A

Crystal structure of gelsolin domain 1:ciboulot domain 2 hybrid in complex with actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords Gelsolin
molecule tags Structural protein/contractile protein
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff6A03
4EHTA 1T44A 1TYQA 4IWVA 4BR5A 2GWKA 4QS7A 4CBUA 3GOIA 1Y64A 2FF6A 4CZFA 3FZMA 4A2BA 4FPAA 1NGAA 4CZKA 1Z6RA 3GE1A 1NGHA 4A2AA 5BPLA 4BVPA 2A5XA 3A5NC 3W0LA 5LJVA 1HJOA 3C0BA 2E2NA 3I8BA 3VGKA 4BRDA 3B8AX 2VYPA 4K43A 1ZC6A 2E1YA 4IXCA 2AA4A 4JHDA 1WUAA 3O8MA 4E1JA 3SJHA 4BQZA 1GLLO 5F2RA 1S22A 2Q2RA 5ADXA 3ATVA 3EKSA 3QBXA 3D2FB 4B9QA 2ASOA 4BG9A 1OKJA 4WQ5C 1YAGA 5BRDA 3VERA 1YXQA 4H0XB 3D7EO 2Q97A 4MLHA 3R8EA 1HLUA 1RFQA 3AAPA 3QMLA 3I33A 3HTVA 4BRMA 3EZWA 1KXPA 4QS8A 4CZEA 1HX1A 3MK6A 3ZEUB 3WUHA 3KVGA 3RSEB 2DPNA 1S3XA 4FL9A 1QQMA 3D2FA 5AQLA 4BQLA 5AQPA 4B1VA 1ATSA 4Y0WA 3CI5A 1JCGA 2OANA 4QS9A 3A5OC 4FWOA 3BF3A 2E2QA 1GLDG 4B1XB 5F0XA 3ZEUA 4FPBA 1SQKA 4H5NA 3J8AA 2F9WA 3MN5A 3P4IA 4JNEA 4WQ4A 4CD1A 3WQUA 2Q1NA 3MN7A 5EOYA 5AQZA 4EIAA 3CJ7A 4BRPA 1ATNA 5E26A 2GUPA 1Q18A 1D4XA 4RTFD 2QXLA 1HKCA 2KHOA 3GDQA 4HTLA 5LY3A 3VETA 1MDUB 3D2EB 3U9DA 4BC3A 4BVOA 1NGJA 5AQWA 4MO5A 3O08A 4CJ7A 4BR9A 3O4WA 4LC9B 2A42A 2E1ZA 2J4RA 2HOEA 4B1ZA 4H5WA 4CZIA 3DXKA 3F9MA 4K41A 1NBWA 1BA0A 4BGBA 3CERA 2W41A 3H3NO 4PL8A 3MN6A 3D2EA 3ZX0A 4FWQA 1HKGA 3VGLA 2FF3B 1DGKN 3OHRA 2P9KB 1GLBG 3R6MA 3WXKA 2V52B 3QBWA 4H0YB 4ISFA 1BUPA 2NLXA 1IJJA 4EFHA 1C0FA 2H3GX 2NZTA 3VEXA 3JXUA 1KAYA 2V7ZA 3M1FA 3VEOA 1LCUA 3LDPA 3O80A 3ULEB 2QWLA 2P9KA 5BRFA 4BRAA 4GY2B 2Q31A 3LDOA 4L3QA 3ENOA 2D0OA 2QWRA 4A61A 1E4GT 4CBWA 1NGDA 3FZLA 1DKGD 3O1WA 4FOIA 2FSJA 2ASPA 5AR0A 4EHUA 1BDGA 1X9JA 2A3ZA 3ULEA 3EKUA 3VF6A 4H5RA 4JHDB 2GEMA 2Q0RA 1ATRA 3SLCA 4H03B 1HPMA 3MMVA 3ZX2A 3MDQA 1GLEG 3L4IA 2FLOA 4O8KA 1BG3A 4CZJA 1H1VA 3LM9A 5JMVA 2VWBA 3EN9A 1LOTB 2P9UB 4XH4A 3U9ZA 4BC2A 1MA9B 4CZLA 4FWPA 3FZHA 2A41A 1X3MA 3GG4A 3DJCA 3EO3A 4H5VA 5AQVA 4BROA 3QDKA 4XH5A 4A62A 3CQXA 3IMXA 4XH1A 3AAQA 1V4TA 1ZBSA 2ZWHA 2QWNA 2P9UA 1NWKA 4J8FA 2QWOA 3WXIA 2ASMA 1GLFO 3IDHA 4M63C 4BRGA 5AQQA 4FWKA 3DXMB 5FPNA 3CJBA 3U4LA 5F1XA 3H46O 1QQOA 3LL3A 3WT0A 1QZ6A 3VPZA 1QZ5A 4CZHA 3KZBA 4IJNA 2GELA 1RDWX 2YHXA 3BEXA 5EVZA 1NGBA 3ID8A 1MWMA 2P9PB 3SMPA 3DXMA 3DWLA 5AQIA 2CGJA 3DAWA 4F9OA 3KHYA 4BR2A 3GBTA 1XC3A 3DXKB 5BPNA 4Z94A 3CJCA 1DEJA 2P9IA 4FWNA 3LDQA 4O5FA 4BGAA 5AFUH 5ELZA 4MLEA 1QHAA 1MWKA 2P9PA 3M6GA 3A5LC 4FWMA 5BRHA 1TUYA 4NO7A 1J6ZA 3W3DA 2ZGYA 3G25A 1SZ2A 3LM2A 3VEYA 5KPRA 1YVNA 3BF1A 4ISEA 3FGUA 4BR4A 1X3NA 4PL7A 3FZKA 4XEIA 4RCHA 2E2PA 1E4FT 3WQTA 2YJFA 2HMPA 3L0QA 4BRIA 2V51B 2E8AA 5AQJA 2FSKA 1NM1A 3HBTA 4JN4A 4BRQA 3C7NB 4RWTA 1V4SA 2QW9A 1C0GA 4JAXA 2P9NB 3CQYA 1GLAG 4WQ4C 3UE5A 3VF2A 3ZETA 4CZMA 4PKHA 2FXUA 2P9SB 1U6ZA 2QM1A 3TPQA 2I7NA 2BUPA 4K25A 4IO8A 1ESVA 3C7NA 1GLCG 1NMDA 2CH5A 4NB4A 5BR9A 1EQYA 5JICA 4B1WB 2P9NA 3VEVA 4KBOA 4YDUC 1U2VB 4H5TA 3CJ1A 3H3OB 2VCPA 2E20A 2P9SA 1GLJO 3LDLA 5AQGA 3BUZB 3UKUA 2Q36A 2GWJA 4HWIA 4BRLA 4FSVA 2CGKA 1T6DA 2QWPA 4CI6A 4PKIA 1NGIA 1BO5O 3L6QA 1HUXA 4CD3A 4ISGA 4FWSA 2ITMA 4WQ5A 1U2VA 3WXLA 3A0IX 4C23A 3O1BA 3VENA 1BWFO 2CGLA 4FWRA 5FPEA 4B1YB 4BC5A 3VGMA 2D4WA 5JLFA 2W40A 2ZF5O 1JCFA 1WOQA 2IIRA 2YHWA 2PAVA 3M3ZA 5AQHA 2A40A 3O6WA 5AQFA 4DCHA 3BP8A 5AQRA 1T6CA 1NGGA 1BOTO 3SK3A 1RGIA 3MCPA 1BU6O 3ENHA 4BR7A 2I7PA 2YJEA 1QQNA 3UKRB 2AP1A 3FZFA 4BRFA 2V7YA 1ZXOA 2IVPA 1KAZA 1YUWA 1NGEA 3WXJA 3JS6A 5AZIB 2CH6A 3H1VX 1NGCA 3SMSA 4DB3A 2E2OA 3FFKB 5AQMA 5AQYA 2FSNA 3UKRA 2QWMA 3H1QA 5TKYA 3HZ6A 2HF3A 1P8ZA 4K42A 2P9IB 4BR0A 3R9PA 5CE3A 3UB5A 3AARA 3QFUA 5AQTA 4AM6A 5AZIA 3VF4A 5KQDA 3LDNA 1K8KB 4MO4A 1CZAN 3A8YA 3FLCO 1HKBA 4FO0A 2HF4A 2WUSA 2YHYA 4H0PA 4BG8A 3CHWA 3HI0A 4BREA 1XQSC 4BC4A 5I9EB 5BN8A 2EWSA 4H0VB 2BTFA 4M7XA 4H0TB 2GTDA 3H6EA 1K8KA 1JCEA 2Q0UA 2YI1A 3CJ9A 5BN9A 4IZ9A 5AZJB 3VESA 1R59O 3FE1A 4I6MB 3RSEA 3QB0A 5B8HA 3GL1A 4FOEA 3HSCA 4AM7A 4JD2B 4PKGA 4WYBA 4FWLA 3S41A 2IVNA 3ZETB 1G99A 5AQNA 4EAHD 2D1KA 3FR0A 5BPMA 1XUPO 5KPTA 3MN9A 2D0PA 3QICA 1TUUA 3H45C 5KPZA 5EXWA 2UYTA 1KAXA 3CETA 4B1UB 4I6MA 5EY4A 5AZJA 4YDUA 3IFRA 2IVOA 4JD2A 3IUCA 5E84A 3U8XA 1NGFA 5AQSA 5AQKA 5AQUA 1NLVA 5EX5A 3ZX3A 3WEEB 5ADXH 3VEZA 2NRHA 3CIPA 3UKUB 4BRCA 2QWQA 3AY9A 1Z05A 4M7YA 2E88A 4BRHA 4BRKA 1IG8A 3QFPA 4DHYA 4IJAA 4GNIA 1SAZA 4H0OA 2A6AA 4DQ8A 2P9LB 3VEWA 4CZGA 3ATUA 3WEEA 3CJAA 1BA1A 2PBDA 5BREA 4CBXA 5AQXA 3A5MC 1TYQB 5LJWA 3VOVA 3HM8A 2YCHA 5AQOA 3TU5A 4BRNA 5KQ8A 3O5BA 2ZGZA 5FPDA 5JLHA 5FPMA 3EL2A 2F9TA 5AFUA 2P9LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C65A 3MCAB 1BQNA 4BR5A 2GWKA 4QS7A 3HPGA 2FBYA 5HOOA 1Y64A 4CJQA 4WE1A 4FPAA 4HUFA 4DTXA 4N76A 2P51A 5FROA 1RCHA 4L8RB 3W0LA 1HJOA 3C0BA 4CHPA 1VAZA 2G8VA 1Q81O 3I0SA 1WUAA 2O8DA 3O8MA 4RW8A 5F2RA 4KRFA 2Q2RA 1Q82O 3EKSA 4F2SA 3MXMA 4CJ4A 3U3YA 1OKJA 1TV6A 4WQ5C 1SL0A 3VERA 5JS2A 3OS0A 1QVGM 4YOYA 2Q97A 3AA4A 4KV8A 4MLHA 1HLUA 2NRWA 1KXPA 3MEEA 4KH6A 3WUHA 2Z1GA 4CJEA 4FL9A 5AQLA 4PWDA 1VSFA 3CI5A 2OANA 1NK4A 3SAFA 3A5OC 1I39A 1JLEA 2HHUA 3CC7N 1NU0A 4B1XB 5GAHP 4FPBA 4KTWA 3ULDA 4CF1A 4H5NA 5IWAK 4CIFA 3MN5A 3ZSWA 4OO1J 1DLOA 4C8KA 3MN7A 5AQZA 4BRPA 3CCQN 2A1SA 1VHXA 3AO1A 4N56A 1WNSA 4CJVA 4OVLA 2QXLA 4HTLA 4HTUA 3G10A 4KHYA 2KZZA 2FBXA 3LAMA 4BC3A 4MO5A 3I55N 4CJ7A 1VSLA 4J2BA 4CJRA 4IDKA 3WNGA 3D6RA 4LC9B 4DTOA 3SPZA 4FJKA 4H5WA 3ZSRA 3M5RA 2HHXA 1NBWA 1BA0A 4YORA 1RDUA 3RWUA 5CY4A 4JKGA 4YOXA 3VA0A 3VGLA 2BH1A 1WAJA 4CJSA 4CJWA 4IG3A 3OHRA 4FW1A 2O8BB 3K9JA 1GLBG 2V52B 2Z1JA 3AGKA 4DF8A 2NLXA 2PZSA 3MXIA 2H3GX 3V9UA 3BGRA 4JI3K 3OYMA 4LF8K 3LDSA 5SZTA 3ULEB 3QEVA 4Y1DA 4GVMA 4L3QA 4DS4A 4ID5A 1NK9A 3KLEA 4A61A 4CBWA 1RT2A 3K5NA 4FOIA 3PUFA 4FZZA 2Z1IA 2RKIA 4EHUA 5AR0A 1NKBA 4QCLA 5C10A 4ID1A 4O0JA 1EXQA 1C0MA 3VF6A 1U4BA 3SZ2A 1SKWA 3AVMA 4HCBA 3SLCA 4I2QA 3OTOK 3MMVA 4DV0K 4JK8A 2FLOA 4DSKA 1H1VA 2ZM6K 2G8IA 3EN9A 2AJQA 1TK0A 4CGGA 3KJVA 4DLEA 4BC2A 4FWPA 3CFPA 2DFEA 5J2NA 4KHWA 4FJIA 3QLHA 3KK7A 1U45A 4H5VA 4DWIA 3QDKA 4XH5A 3SBGA 1C0UA 2HHVA 3P39A 3K58A 2QWNA 3DM2A 1A5VA 4KB0A 1NWKA 3WXIA 1KC8O 1SS6A 1LW2A 3IDHA 4BRGA 3RMDA 4CGIA 4JI7K 3NE6A 3KKRA 5F1XA 4CVNE 1QQOA 3NDKA 1SV5A 1UOCA 3ZT3A 3NHGA 1M90O 2O8FB 1CXUA 5TKWA 3AO2A 2JWKA 4DU3A 2OPSA 1QVFM 2QA4N 3KZBA 4IJNA 4FJHA 4CECA 4DFPA 3CCUN 1M1KO 5EVZA 1NGBA 4AHRA 3SMPA 1UA0A 1TAUA 3DXMA 5GAEP 1VQPN 4IEIA 3SPYA 4FZXC 1KCFA 2D0CA 1C0TA 2QXFA 1XC3A 3S3OA 1U49A 1IBMK 4FLUA 4MLEA 4JKAA 3PY8A 3RRGA 1TKZA 3A5LC 3P31A 4FWMA 1TUYA 5C42A 1J6ZA 3W3DA 4MDBA 4BACA 2KLAA 1YVNA 3FGUA 1NKEA 1D8YA 1XMQK 4PL7A 4E7IA 5K14A 2YKNA 2FBVA 1E4FT 1VQ9N 4BE2A 4B3TK 4BRIA 1R0AA 1JLBA 2HBKA 3SV3A 3HBTA 3PX0A 4JN4A 3THWB 1LWFA 2P9NB 1VQ4N 4LF7K 2HNZA 2DY4A 3IKMA 1QTMA 2D0BA 1OH6A 3TPQA 1VQ7N 4E0DA 4IG0A 3KD1E 3K0SA 1J9AA 4C8LA 1OVQA 4E19A 4NB4A 4CEAA 2KFNA 4R5PA 5JICA 1S6QA 3VEVA 3DLRA 3H3OB 3I0RA 3T1YK 2E20A 2P9SA 1GLJO 3OBYA 5AQGA 4FVUA 3BUZB 2Q36A 2GWJA 4JI6K 4BRLA 4IDHA 4BY9C 3NH0A 4M45A 1Z26A 1BO5O 3U3GA 2WTUA 2DFHA 4GKJK 1WBBA 1WSIA 4BE1A 1KQSM 2HHHK 1SL2A 3CM5A 4WFBL 4B1YB 1U48A 3VGMA 1WAFA 5JLFA 2ZF5O 1WOQA 3M3ZA 4FJ5A 4JKHA 2IOCA 1T6CA 3SK3A 2ZD1A 4FJMA 1QQNA 4KHSA 3TWHA 4GW6A 4BRFA 4M3XA 3SQ2A 1ZYQA 2IVPA 4LH4A 4ILHA 3JS6A 3HK2A 3CG7A 5AQMA 1VQKN 3DRPA 2YV0X 1P8ZA 3CMAN 4K42A 2VGNA 4F3TA 3EE9A 3G0ZA 4DTPA 1GOAA 3R9PA 3NFAA 4O8UA 3FLCO 2YHYA 4H0PA 3CHWA 3M8PA 3P83D 1RT6A 3V1QA 1FK9A 2UUCK 2BTFA 2IAJA 3E1YA 3KLIA 1BI4A 4DSIA 2YHAA 5BN9A 4F2RA 3SV4A 5AZJB 3VESA 3FE1A 3HVTA 4F4KA 1EETA 4YNQA 3GL1A 2HB5A 4JD2B 3CPWM 4CGJA 2IVNA 4IFYA 1REVA 4J2DA 3PLAA 2D0PA 2UXBK 3OBWA 3VQ9A 3ZSZA 3H45C 4B1UB 3QESA 5EY4A 4Z4EA 4YDUA 3R3LA 3U8XA 5AQKA 5AQUA 1JL2A 4H4OA 3ZX3A 5ADXH 4J2AA 5LMNK 3CIPA 3UKUB 4A59A 4CFBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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