2FXUA

X-ray structure of bistramide a- actin complex at 1.35 a resolution.
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
368
structure length
360
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of bistramide a-actin complex at a 1.35 A resolution
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 121
structure length 360
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fxuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fxuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2fxuA03
4FWRA 4H5VA 3EKUA 5AZJA 1NMDA 2P9UA 5AQTA 2HF3A 5BR9A 2QWLA 2QW9A 3IFRA 3CJ9A 1QHAA 2E2PA 5JMVA 5AFUH 3CERA 3VEXA 2IVOA 3CHWA 2P9LB 5EX5A 3ZETB 3HZ6A 4PKGA 3VGLA 2D4WA 1NGFA 3LM2A 1NGHA 1HJOA 3AARA 4BC2A 5ADXA 4CZGA 1Q18A 1HKCA 1ZXOA 3HSCA 4H5NA 3ZEUA 1YVNA 3GG4A 3S41A 1Z05A 3FE1A 2QWNA 4BR9A 3VPZA 5E26A 2QXLA 3A0IX 4IZ9A 3VETA 4EIAA 5AQNA 4BR4A 3U9DA 3MN5A 3UKRA 4A2BA 3TU5A 1K8KA 3H3OB 3O6WA 5EOYA 3U8XA 2Q31A 2ITMA 2CH5A 1QQNA 5KQ8A 3CJBA 3LDPA 4BGAA 1BO5O 2CGKA 3DJCA 3QFPA 3AAQA 3DXKB 1GLEG 4CBUA 3P4IA 4CZMA 4BRHA 2ZWHA 4BRNA 3HTVA 4CZFA 4A61A 3DXMA 5F2RA 1C0FA 3VENA 2YHXA 3WQUA 3M6GA 4WQ5A 4GY2B 5AQMA 1MWKA 3O8MA 1ATRA 1Z6RA 1G99A 4JAXA 4QS7A 5AQOA 4EAHD 5KPZA 5AQHA 3CJAA 3SK3A 1KAZA 1RFQA 2VWBA 2ASMA 1U2VB 4NO7A 5BN8A 1V4SA 2P9PB 3ULEA 1HKBA 4FWPA 1K8KB 1QQMA 3I8BA 2FLOA 4BREA 4CZLA 3C0BA 2QWQA 2YI1A 4L3QA 1NGBA 3LDQA 2YJEA 2E88A 4IWVA 3WEEB 1Y64A 3TPQA 2E20A 4M7XA 4H5RA 1SQKA 5AFUA 4YDUC 2CH6A 2Q2RA 3C7NB 4A2AA 4RWTA 1DKGD 2ASOA 1EQYA 1CZAN 2D1KA 2OANA 4H0PA 4BG9A 3ZX3A 2ZF5O 4H5TA 4JD2A 4WQ4A 4FSVA 4IO8A 2PBDA 4B1VA 4CZKA 1ATSA 1QQOA 3SJHA 4Z94A 1U6ZA 1BDGA 1GLLO 1NGDA 3G25A 3WXKA 2W40A 5BRDA 4I6MB 3HM8A 4CZHA 3FZFA 5JLHA 4CZIA 4RCHA 3D2EB 2P9NA 2I7PA 3BUZB 3L6QA 2VCPA 1BA1A 2AA4A 5BRFA 3EL2A 4FOEA 4IJAA 5AQZA 2NLXA 4FWNA 3R9PA 4B1XB 3FFKB 4BVOA 4FWOA 1NGJA 4M63C 3HI0A 3MCPA 5AQUA 2V7YA 3UKUA 3F9MA 2HMPA 2V51B 1HLUA 4PL8A 3FGUA 3FZMA 4FL9A 2D0PA 2ZGZA 5AQYA 3WXLA 4H0VB 4B1YB 4B9QA 4BRPA 4QS8A 4Y0WA 3O08A 5BRHA 2Q0RA 5CE3A 1ZC6A 2FF3B 2IVPA 3A5OC 3ZX0A 3MN6A 1X9JA 4MLHA 3JXUA 1XUPO 4BC5A 2A3ZA 3M1FA 3D2FB 3VEWA 1RGIA 2P9KB 3GBTA 3KVGA 5AQFA 1QZ5A 4B1ZA 5BPNA 1HPMA 3EKSA 4BRFA 2YCHA 2QWMA 3EZWA 1R59O 3IUCA 4O8KA 2YJFA 5AR0A 3WQTA 5AQQA 3CI5A 5AZJB 3QBWA 3MK6A 2ASPA 2P9UB 1BG3A 1GLDG 5AQRA 4FWLA 4CBWA 4EHTA 3U4LA 3L0QA 3QMLA 4HTLA 5BREA 3UB5A 3GL1A 1BWFO 3H46O 3VGMA 4C23A 4XEIA 3BF3A 3MN7A 3A5NC 2FXUA 4FWSA 4CZJA 1MDUB 1HUXA 3H1QA 3FZKA 4FPAA 3W3DA 1BOTO 4JHDA 3WXJA 2F9WA 3M3ZA 1ESVA 3U9ZA 3ZEUB 5EY4A 3ENOA 2PAVA 3MDQA 2GELA 1NWKA 1C0GA 3O1WA 1GLBG 5FPEA 2QWOA 1IJJA 4WQ4C 3EO3A 4AM7A 1IG8A 2Q1NA 3OHRA 4O5FA 3O4WA 3UKRB 4ISGA 3LDNA 4A62A 4BG8A 4BGBA 4MO5A 5FPMA 4BRCA 4EFHA 1NGAA 2A6AA 4WYBA 2P9SA 3H3NO 4CI6A 4HWIA 4XH1A 1P8ZA 3JS6A 5AZIA 4K43A 2FSJA 5BPMA 1JCFA 3O1BA 3BF1A 5AQJA 3LDOA 4FOIA 3QB0A 4BVPA 3DXMB 1LCUA 5AQKA 2W41A 3VGKA 2NZTA 1MA9B 1TUYA 1XC3A 2Q0UA 2A40A 3VF4A 4BR2A 3HBTA 2GWJA 3MMVA 5BN9A 3VEZA 1BUPA 5LJVA 3CJ7A 1NGGA 3ATUA 2F9TA 4F9OA 3AY9A 1LOTB 3CQYA 1NBWA 3R8EA 1YAGA 3ULEB 2EWSA 3CIPA 4DHYA 3QDKA 2IIRA 1BU6O 3ATVA 4KBOA 1XQSC 1GLAG 2H3GX 4BROA 3RSEA 3GOIA 1X3MA 3LL3A 3CJ1A 1J6ZA 3O5BA 3CJCA 3BEXA 4BC4A 5I9EB 4BR7A 4CD3A 4H0YB 4IJNA 2E1ZA 4BRAA 4FPBA 4MLEA 3GE1A 1NLVA 4NB4A 4BQLA 3GDQA 2P9LA 5AQIA 1GLFO 1RDWX 5E84A 4J8FA 5JLFA 2KHOA 4JD2B 2GWKA 3QFUA 4H5WA 3A5MC 3ZETA 4BRGA 1KAYA 1NGEA 4E1JA 3IDHA 4H0TB 3H45C 3FR0A 2A5XA 1TYQA 1X3NA 1NGIA 1BA0A 3AAPA 3SMPA 2E2QA 4H0XB 4BRDA 2HF4A 3SMSA 5AQGA 2I7NA 2A42A 1GLCG 2QWRA 2P9NB 2BTFA 4WQ5C 1WOQA 2YHYA 5TKYA 3WXIA 3VEYA 5AQVA 4FO0A 2QWPA 4AM6A 1E4GT 1KXPA 1GLJO 3UKUB 3L4IA 4FWQA 4BRKA 4XH5A 1HKGA 4PKIA 1DGKN 4BRQA 3LM9A 4CBXA 5LY3A 3DXKA 3FZLA 3MN9A 2ZGYA 4DQ8A 5JICA 2GEMA 3KZBA 5AQPA 1TYQB 3H6EA 1WUAA 2E1YA 3UE5A 1YXQA 4EHUA 4K42A 1MWMA 1H1VA 4BRMA 4K25A 2UYTA 3CETA 1NM1A 3D7EO 3QBXA 1U2VA 5BPLA 1T44A 3BP8A 2P9PA 4CD1A 2P9IA 4H03B 4IXCA 1S22A 5EVZA 3A8YA 2VYPA 3FLCO 5AQSA 3VESA 4PL7A 4ISFA 3WEEA 4CJ7A 2Q97A 3WUHA 1KAXA 3LDLA 2E2OA 5AQWA 1TUUA 1SZ2A 1YUWA 3EN9A 4BR5A 1OKJA 2IVNA 4FWKA 4DB3A 3H1VX 3C7NA 4QS9A 4M7YA 1V4TA 3J8AA 2GUPA 4DCHA 4B1WB 3B8AX 2FSNA 4JHDB 5LJWA 2WUSA 2CGJA 1SAZA 1T6DA 5B8HA 2J4RA 3I33A 2P9IB 3VEVA 5ADXH 3A5LC 3O80A 4JN4A 2D0OA 3W0LA 4RTFD 4I6MA 4ISEA 2QM1A 2CGLA 3SLCA 3KHYA 4BR0A 5EXWA 1T6CA 3CQXA 3FZHA 2A41A 3D2EA 1JCEA 4BRIA 2GTDA 5F1XA 4B1UB 1NGCA 3R6MA 1S3XA 3VERA 2FSKA 2P9SB 3DWLA 4GNIA 5AZIB 2FF6A 3VEOA 4FWMA 4LC9B 5FPNA 1JCGA 2Q36A 3ID8A 5AQLA 2HOEA 3ENHA 3IMXA 5F0XA 2NRHA 2E8AA 2E2NA 2V52B 2DPNA 1D4XA 2V7ZA 2AP1A 5AQXA 4JNEA 5FPDA 4H0OA 3VF6A 4XH4A 3DAWA 1QZ6A 5KPRA 1ZBSA 4K41A 3VF2A 3WT0A 5KQDA 1ATNA 4BRLA 1HX1A 3ZX2A 3D2FA 3RSEB 2P9KA 4MO4A 3QICA 4PKHA 4BC3A 3VOVA 1E4FT 4CZEA 2BUPA 4YDUA 5ELZA 5KPTA 2YHWA 1DEJA 4BQZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AZJA 3SBTA 3F2KA 4DFJA 3M8QA 5JMVA 5AFUH 3CERA 4K0KK 4KRFA 2NRZA 2C1IA 3C6TA 4CIFA 2KFNA 3HJFA 2Z1HA 1CZBA 2PY5A 4KH6A 4JI4K 3Q7CA 4CK3A 4BC2A 1HJOA 3AARA 1UA0A 3CYMA 1RT4A 4IDHA 4JKBA 1HKCA 3GG4A 2QWNA 1YVUA 3VPZA 4IZ9A 5KTQA 4ELTA 4ILJA 1X1PA 3LANA 1LWCA 4DWIA 2FBTA 1TK5A 1VQNN 1R0AA 3RWUA 2O4GA 3O4QA 3NAEA 3MWPA 4E7JA 2BE2A 1C6VA 1RTJA 3TU5A 3HP9A 4BWJA 2CH5A 4MDBA 3THYA 4CFCA 3O9RA 1HR0K 3DXKB 3P4IA 4NYFA 1VQPN 4BRHA 4BRNA 3K5OA 3HTVA 3AVJA 4CZFA 2B4JA 1C0FA 3O3GA 3WQUA 3AO1A 2HHVA 4GY2B 2IOCA 4DQSA 4JAXA 3CC4N 4QS7A 4CF8A 1KAZA 3KD5E 2NUBA 4NO7A 4R79A 2P9PB 1XHZA 1QTMA 4KREA 3OBWA 1ILYA 1K8KB 2ZD1A 1YTUA 4UY8O 4CGGA 1KLMA 2E88A 3NGIA 4DU1A 3MX5A 3TPQA 4M7XA 4CJLA 4Q0BA 3IRXA 3L2RA 3MEEA 1ZBHA 4A2AA 1HJRA 1RT5A 2ASOA 4BG9A 3V9SA 3ZX3A 5MLCQ 1VRTA 3P5JA 2ZF5O 1C1CA 3THXB 5C24A 4WQ4A 4UQGA 5J2MA 4FSVA 2E6MA 3C6HA 2PBDA 3KLGA 4Z94A 3V1OA 5HRNA 3OBYA 5BRDA 4I6MB 3HM8A 4MDAA 5JVGL 2W42A 2A1RA 2QKKA 4CZIA 3PO4A 3V6DA 3OYIA 3TTDA 1OH7A 2P9NA 2I7PA 2FBVA 1ASVA 2VCPA 3K9KA 3P1GA 5BR8K 1T8EA 3LP2A 1W7AA 5BRFA 3DM2A 1IG9A 3ID6A 3EL2A 3E1YA 3VQEA 3R9PA 1TAQA 4JI5K 1VQ7N 3BGRA 3FFKB 4BVOA 4FWOA 1JLBA 3HI0A 2V7YA 3AVBA 1JL2A 4FK4A 3CCSN 3FZMA 2D0PA 3WXLA 1SUQA 4DS5A 4JS5A 3KLIA 3K58A 4LSLA 3TAEA 4CIEA 4FM0A 2HVIA 3HPGA 2Q0RA 3SBGA 3NHGA 3EEQA 1ZC6A 2IVPA 4YNQA 3A5OC 3KKSA 4TSXA 4MLHA 2VG7A 3KTQA 3AVIA 1NK7A 4RW7A 1YF5L 1RGIA 2P9KB 1HPMA 3EKSA 4CGJA 3PY8A 3WQTA 3K9JA 3QBWA 3MK6A 2X74A 2P9UB 1Y97A 1VSJA 4I2PA 4JS4A 1B92A 4RW6A 1X9MA 4HTLA 1IBKK 1BWFO 4FLXA 3H46O 4XEIA 3LAMA 4A59A 4CZJA 1U47A 4DQQA 2QK9A 4JHDA 3AO5A 1VSLA 3U9ZA 3D0PA 1VQ6N 3ZEUB 5EY4A 3ENOA 3MDQA 3WNHA 3O1WA 2VGNA 3EO3A 5C2FA 3OYDA 3M8RA 1IG8A 4O5FA 3E9PA 5IT9O 3O4WA 3UKRB 3LWLA 4FLVA 4NCBA 4BG8A 4BGBA 3AO3A 1JLEA 3H3NO 5GAHP 3V1RA 4GV3A 4CI6A 2F8SA 2NRXA 4K43A 2FSJA 1JCFA 3O1BA 3G0ZA 3LDOA 4WE1A 1WAFA 1RTHA 4CGHA 5GADP 3J7AP 2ITGA 5A2QO 2W41A 2WBNA 4Y1CA 4CJQA 1JKHA 1XC3A 2Q0UA 4BR2A 4F4KA 1JXEA 2ZE2A 1BIUA 4EZ9A 1NJIO 4F9OA 5J2QA 1LOTB 3CQYA 5M1PA 3LALA 3ZT3A 1YAGA 2EWSA 3CIPA 2HNYA 2IIRA 1A5WA 4XIUA 4BROA 4WFAL 3RSEA 5AJ3K 3THWB 3HYFA 4JK8A 4CJEA 3CJCA 4PHTX 4CD3A 4Z4EA 3TANA 5JENA 1N34K 4C8LA 3T1AA 4DF4A 3TAPA 2BH1A 3C95A 3ZYYX 3MXIA 1DT9A 3P39A 3HPHA 5JLFA 2KHOA 2UUBK 3KK3A 3A5MC 4JRQA 4FJGA 1NGEA 1UWBA 4PA1A 1X9WA 2Z1JA 1LV5A 3WNEA 4YFUA 3OYJA 1X3NA 3AAPA 1REVA 4YOWA 4BRDA 3IAYA 1TK8A 1VSDA 2O8EB 1VSMA 2QWRA 4IOAL 2BTFA 1LWFA 3O9UA 1CLQA 3OS0A 1ITGA 3U6FA 1NJXA 3VEYA 5AQVA 4DV4K 1KVCA 4CJKA 3L4IA 3ZSYA 4KHQA 3VTHA 4JI8K 4PKIA 4RG8A 1T03A 3NBPA 2O4IA 4E7HA 3DXKA 1QSSA 4FJIA 3MN9A 1Q82O 4KTQA 4DV5K 3H6EA 4FW2A 2D0BA 3KK2A 3SAHA 5HL7L 1I39A 3AGKA 4QOZB 1EKEA 1H1VA 1SV5A 4K25A 4BRMA 4E89A 3CCLN 3SUNA 3E66A 3CETA 1X9SA 1NM1A 3RR7A 1WLJA 1TAUA 2P9PA 4IXCA 4I9LA 5EVZA 3LPUA 3V9WA 1RT2A 3VESA 3CPWM 5GIPA 1MU2A 5E41A 4KFBA 2Q97A 3AA4A 2X78A 4JKHA 3WUHA 4CVNE 2E2OA 1TUUA 3ZSXA 3DLEA 4J2BA 3H1VX 4DUYK 2OPRA 4CJFA 3J8AA 4JKGB 2PYJA 5M1KA 3THXA 3B8AX 2WONA 5LJWA 5FRNA 1LW0A 2WUSA 4JK7A 3HT3A 4CGIA 1S6QA 4IG0A 2P5OA 5B8HA 3MX2A 1VQ4N 2P9IB 1RBUA 4JN4A 2D0OA 4GV6A 4I6MA 3EE8A 5EXWA 1T6CA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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