2GWJA

Spvb adp-ribosylated actin: hexagonal crystal form
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A steric antagonism of actin polymerization by a salmonella virulence protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein
total genus 127
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2gwjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2gwjA04
4B1WB 4CBUA 4H0VB 4JAXA 3TPQA 3KHYA 5AQYA 3O6WA 2D4WA 4FWOA 1GLEG 4BRMA 5JICA 1XQSC 4K25A 3IFRA 2P9SA 3EZWA 3CHWA 4BRHA 1XUPO 3GOIA 2QWPA 1BU6O 3M1FA 4H5TA 5JLFA 3H3NO 3CIPA 3ZX3A 5E84A 3G25A 3HZ6A 5FPMA 3AAQA 3L0QA 5AQHA 2P9NA 3WXJA 5ELZA 4BC3A 4CZGA 2QWOA 4GY2B 1WUAA 1KAXA 4MO4A 1NGGA 4L3QA 1HKBA 4M63C 3MCPA 2D0PA 1YUWA 3EKUA 4BVOA 1BUPA 1ATSA 2P9SB 1Q18A 5CE3A 3UB5A 2NLXA 3SJHA 3A0IX 3DWLA 1KAZA 2H3GX 2QWMA 4BR4A 3H1QA 3HSCA 1P8ZA 3FGUA 2P9LA 2P9NB 3TU5A 3IDHA 3O08A 3LDOA 3C7NA 4FOIA 5BN8A 3I8BA 3VEZA 3H1VX 1GLDG 3CJAA 1Z6RA 4JNEA 3VGMA 5JMVA 2P9IA 5AQNA 5F2RA 4KBOA 3CJCA 3CQYA 4WQ5C 4AM6A 2E88A 2FSNA 5EOYA 2FLOA 1ZXOA 1QQMA 3LM2A 3MN6A 1T6CA 4B1VA 4BGAA 2HOEA 1ZBSA 4JD2A 3SMSA 3CERA 5AFUH 1SAZA 4H5NA 4BRDA 4PL7A 2W41A 5LJVA 3UKRA 5TKYA 4DQ8A 3UKUA 2YJEA 2P9IB 5EX5A 4I6MA 2A41A 2ZWHA 4FL9A 3H46O 4BRNA 3BUZB 1Y64A 1HX1A 2EWSA 2CH5A 3MN5A 1NM1A 1BG3A 2P9KA 3MN9A 2AP1A 3A5OC 3WEEA 1SZ2A 4A2BA 3QFPA 4BRIA 5AQVA 4CD3A 5AQKA 4IJAA 2E1YA 4B9QA 4CZEA 2FF6A 2V7YA 3D7EO 3P4IA 4IZ9A 3UKRB 5KQ8A 3UKUB 4BRAA 4A62A 2FSJA 1HPMA 2CGJA 3A8YA 4FWLA 5AQJA 4CZJA 4M7XA 2HF3A 3M3ZA 4I6MB 3MK6A 3U9DA 3VEOA 4FWQA 1QQNA 4H5RA 5E26A 2E20A 1QZ5A 1YVNA 3BF1A 2V52B 3ATUA 3QMLA 3EN9A 1EQYA 4PL8A 5BR9A 2Q31A 4BR9A 4BR2A 3FLCO 1MWMA 3C0BA 3LDPA 5AZJA 5KPZA 3KZBA 2I7PA 4H03B 4ISEA 3H3OB 4H5VA 1GLJO 3W0LA 3J8AA 3BP8A 5AQZA 4O8KA 3M6GA 2FSKA 1NMDA 3VOVA 1U6ZA 3EL2A 3FZHA 3EO3A 5AQMA 4FWMA 5F0XA 3GDQA 4FWNA 4BRCA 3VF6A 4GNIA 4FPAA 1X3NA 5B8HA 5AQSA 4BRFA 2Q1NA 4H5WA 5AZJB 3DAWA 2ZGYA 1GLBG 4RCHA 4H0YB 1NGAA 3ENOA 5AFUA 3WXLA 2ASOA 4BGBA 1RGIA 3BF3A 3QBWA 3JXUA 1HLUA 1GLLO 2E2QA 4H0PA 1HKGA 4Y0WA 3HBTA 3U9ZA 3VEXA 1NGBA 1K8KA 2IIRA 3ZX2A 4PKHA 3VESA 3AY9A 3HTVA 3MMVA 5LJWA 2OANA 5EVZA 1BWFO 1MA9B 5AQGA 1C0FA 4FWSA 3FR0A 1TUYA 3AAPA 2GUPA 2A5XA 4B1YB 5BPMA 2D0OA 1WOQA 2IVPA 3GL1A 1BA0A 1C0GA 5ADXA 2J4RA 4CBWA 4M7YA 5AQOA 4AM7A 2ITMA 4C23A 4CZKA 1SQKA 4BQZA 3U4LA 1ZC6A 4BG9A 4BVPA 1K8KB 1NGDA 4WQ4A 3VEYA 2VYPA 2V7ZA 3CJ1A 1QHAA 4FO0A 2CH6A 4PKGA 4WQ4C 4XH1A 4H0TB 5AQTA 2GWJA 4CJ7A 1NGEA 1HJOA 2ZGZA 3IUCA 2P9LB 2E2NA 4EFHA 1BO5O 3C7NB 3CJBA 2QWNA 3RSEA 5AQIA 3GBTA 1U2VA 2I7NA 4B1ZA 5BRFA 2D1KA 4CD1A 2QWLA 3FZLA 4CZIA 4QS9A 4CI6A 1R59O 4ISFA 1ESVA 1JCGA 2DPNA 5FPDA 2IVOA 4XH5A 3R6MA 1TUUA 2Q97A 3O1WA 4FOEA 3SLCA 2VCPA 4JD2B 3A5NC 4EAHD 3F9MA 3RSEB 1U2VB 5AQQA 1NLVA 5BRHA 2PAVA 1S3XA 3H45C 4NO7A 2GWKA 1QQOA 3LM9A 5AQLA 3QB0A 1BDGA 2P9UA 1IG8A 1T6DA 1NGJA 3VEWA 3CQXA 1RDWX 1BA1A 2W40A 1Z05A 2QWRA 4BC2A 4FWKA 2NRHA 1CZAN 2P9KB 2YHXA 3WEEB 2UYTA 5AQPA 4CBXA 3B8AX 4LC9B 2IVNA 2GEMA 4FSVA 5JLHA 1JCFA 1D4XA 5FPNA 1MWKA 5AQUA 5BRDA 4EIAA 5BPLA 4BQLA 4FPBA 4BRLA 2HMPA 5AR0A 4BROA 3GE1A 3D2FA 2KHOA 3GG4A 1V4TA 3FE1A 1ATRA 1X3MA 3QFUA 1JCEA 5AZIA 5KQDA 4IWVA 3SMPA 5AQWA 4FWRA 4CZFA 3W3DA 1LOTB 2E1ZA 3CJ9A 4CZLA 3SK3A 2BTFA 3FFKB 1IJJA 4HTLA 3DJCA 3MN7A 2FF3B 3WXKA 1DEJA 2Q36A 3LDQA 3WQTA 2AA4A 1DGKN 3VENA 4RTFD 4QS8A 2Q0UA 3KVGA 4BC4A 4DB3A 2Q2RA 4IJNA 1XC3A 5AZIB 5BN9A 3LDLA 2YJFA 2E2PA 3ZETA 3O1BA 1E4GT 3L6QA 1ATNA 3VERA 4MLEA 3CI5A 4BRQA 3DXMA 1NBWA 4F9OA 1NGCA 5KPRA 3VF4A 2A42A 3FZKA 2E2OA 3ENHA 4BRPA 2F9TA 1GLFO 4RWTA 2PBDA 4K42A 4H0OA 1YAGA 4JHDA 3AARA 3ZETB 2BUPA 2WUSA 3WT0A 3O80A 3HM8A 3FZFA 2HF4A 2QWQA 4B1UB 4JN4A 3ZX0A 4CZHA 5F1XA 2QW9A 1X9JA 3O8MA 2YCHA 3WXIA 1NWKA 2CGLA 3DXMB 3O5BA 3VGKA 5AQFA 3QICA 1TYQA 3LDNA 1KAYA 2ASMA 3ZEUA 4YDUA 4XH4A 4DHYA 4WQ5A 4FWPA 4JHDB 4MLHA 3H6EA 3QDKA 4YDUC 4HWIA 1BOTO 3R8EA 3L4IA 5KPTA 1J6ZA 1NGFA 2ZF5O 1DKGD 4A61A 3WQUA 2F9WA 2A6AA 3D2EA 1HUXA 1E4FT 2QM1A 5EY4A 1HKCA 3U8XA 4CZMA 2CGKA 3JS6A 1TYQB 4XEIA 3HI0A 3MDQA 5AQRA 3VETA 3VGLA 1V4SA 3ZEUB 3EKSA 4IO8A 4BR7A 2V51B 4J8FA 5BPNA 4BR5A 1QZ6A 4WYBA 4Z94A 3I33A 2ASPA 4A2AA 4QS7A 4E1JA 1RFQA 1LCUA 3A5LC 4H0XB 3A5MC 3D2EB 2YI1A 4DCHA 3OHRA 5I9EB 3UE5A 4BRKA 3R9PA 1YXQA 4O5FA 4PKIA 2A3ZA 3ID8A 1OKJA 3ULEA 2YHWA 3IMXA 5ADXH 1G99A 1NGHA 5EXWA 3VF2A 2GTDA 2VWBA 4BRGA 2P9PA 2P9UB 1H1VA 2Q0RA 3FZMA 4ISGA 4K43A 4B1XB 3DXKA 2NZTA 5BREA 4BC5A 4IXCA 1T44A 1MDUB 3LL3A 3CJ7A 5FPEA 3VPZA 3BEXA 3WUHA 3S41A 2E8AA 5LY3A 4K41A 4BR0A 1GLAG 4NB4A 4BREA 2FXUA 1S22A 3VEVA 3O4WA 2GELA 3ATVA 3ULEB 4BG8A 2A40A 1GLCG 1NGIA 1KXPA 2YHYA 2P9PB 3QBXA 4EHUA 3D2FB 4MO5A 3DXKB 2QXLA 3CETA 5AQXA 4EHTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YJWN 4F2RA 4CBUA 5HP1A 4JI3K 3KHYA 3O6WA 2D4WA 4FWOA 1GLEG 4BRMA 3KD5E 2P9SA 3ISNC 4M3RA 3QERA 2BH1A 2ZE2A 3AO4A 3M1FA 4H5TA 3VA0A 5JLFA 3H3NO 3SZ2A 5K14A 1SV5A 3SAGA 2HBKA 3L0QA 2P9NA 3PIPL 4FLVA 3NGYA 3V4IA 2QWOA 3OYGA 3DLLL 3KLEA 3EEQA 1NGGA 2KTQA 4CJ3A 4OLBA 4KH5A 3EKUA 4BVOA 4C1NI 2WOMA 3C6UA 2P9SB 4E7LA 1Q18A 3UB5A 3DWLA 4O0JA 2BGGA 3VQEA 2P9NB 3CXCM 3TU5A 3LDOA 4CECA 2E4LA 3AGKA 3H1VX 4LSLA 2NRXA 4B9NA 2WONA 1NMNA 2FBVA 4Z4IA 1QE1A 3CJCA 2FSNA 4B1VA 1KVCA 2B5JA 4B9MA 3CERA 5AFUH 1SAZA 4BRDA 3O3FA 1OH5A 4JI1K 2W41A 4DQ8A 3I55N 3ZT3A 3TTCA 4IEEA 2NRTA 2ZWHA 1KTQA 4FL9A 1T05A 3VQPA 1XMOK 4FLUA 4LFCK 2NNWA 4B3TK 3T1HK 2AP1A 1WAJA 4JI5K 1VQNN 4W5NA 1SZ2A 3SUNA 3QFPA 3S5TA 5HLFA 1YT3A 1R0AA 3SYZA 1LAVA 4DLGA 3D7EO 3NFAA 3ZT2A 5KQ8A 4A62A 1NK7A 2FSJA 1C0UA 3P1GA 3MEDA 1J5EK 1KVBA 3U9DA 1QSYA 1QQNA 3NGZA 1VQON 4BACA 4CESA 1YVNA 3BF1A 4JV5K 4CE9A 3TANA 1RBRA 3I56N 3ZSRA 3VQCA 3CCVN 1MWMA 3LDPA 1HR0K 4CHQA 3E9LA 3KZBA 3TAPA 4KB0A 1GLJO 3W0LA 3J8AA 4B3SK 4IKFA 3BP8A 2F96A 1XWLA 5AQZA 1XHZA 1QSLA 4IO9L 4GVEA 3VOVA 4YOTA 2VWJA 3ALYA 4FWNA 3WNHA 2Z1JA 4GNIA 3D6RA 3OYKA 2Q1NA 4H5WA 3HT3A 4HUGA 4M3YA 3SQ1A 1K73O 5LL6Z 2G8KA 3K59A 1RT5A 1D9FA 2OPQA 3J81O 1GLLO 2HHWA 4CJFA 4CEEA 3B6OA 5JS2A 4M42A 2IIRA 1N34K 4PKHA 4N56A 3HTVA 4R79A 4FK4A 1EWRA 1KRPA 5LJWA 2OANA 5EVZA 5AQGA 3FR0A 4U67L 4KTQA 5BPMA 2D0OA 2RE2A 4W5QA 5KI6A 1JLEA 2J4RA 3KK2A 5I3UA 2ZJRL 4Z0UA 4OGCA 2ITMA 4BVPA 4BQZA 1ZC6A 4BG9A 1YI2N 4AHRA 3OYHA 1IKXA 1W2BM 1QHAA 4DR4K 2GWJA 2IS3A 2ZGZA 4QCLA 2P9LB 3QEWA 3NH1A 4EFHA 1BO5O 1FKPA 1T3VA 3C7NB 1ZBUA 4X62K 3E01A 4B1ZA 2D1KA 2FBXA 3SUOA 2QWLA 5CY4A 3WNEA 5CZ1A 1ESVA 3ZSVA 2DPNA 5FPDA 3O9SA 2KFNA 1A5VA 1NKCA 3O1WA 4CK1A 1RBVA 4GV6A 4K0KK 1S6QA 1RBTA 4B9VA 3P31A 2HBLA 4CEBA 5AQQA 5HOOA 1NKEA 4E7JA 2PAVA 1S3XA 4NO7A 3CFPA 2GWKA 1QQOA 1CZ9A 3HPGA 3LM9A 2P9UA 1IG8A 3LZJA 3R3LA 4DR7K 1L3SA 3ZSQA 1DT9A 1Z05A 1YJ9N 4I7FA 2YHXA 2UUAK 4CBXA 2E6MA 2GBZA 3O4QA 4FSVA 4NYFA 2HBMA 1WB9A 4B9LA 3SQ4A 5AR0A 1ITGA 3D2FA 5H1SQ 3NF9A 1GOBA 1ATRA 4CGHA 4M3WA 3CM5A 3QFUA 4FK2A 5AZIA 4ILGB 3SMPA 1HQUA 4FWRA 3HOSA 1U04A 3OTOK 5T7BA 4HCBA 1LOTB 3OYNA 3QINA 4Y1CA 4DMNA 3QEPA 1LWCA 4DTJA 1IJJA 4CK3A 4FM0A 3MN7A 4Q5VA 1DLOA 3CCMN 1KQSM 2O8EA 1DGKN 4OO1J 4XIUA 2HNDA 1Z26A 4WCEL 2Q0UA 5BR8K 4DB3A 3HL8A 5GIPA 4M3XA 4DFPA 5BN9A 5AZIB 3NF7A 2PYJA 5GIOA 3L6QA 4W5RA 1TKTA 1A5XA 3M5RA 4C8MA 3VERA 3CI5A 2NRWA 1NBWA 1NGCA 1WSEA 3CD6N 4FZXC 1SS6A 2UUBK 3ENHA 1HJRA 3RMDA 3LAMA 4RWTA 5SZTA 4JHDA 4LH5A 2HHVA 2O4GA 3KJVA 4CEZA 1C1CA 3HM8A 1TV6A 3K9JA 4B1UB 4KI6A 3ZX0A 5F1XA 4DR6K 2QW9A 1X9JA 3O8MA 2VG6A 2YCHA 3WXIA 3V81A 3LDNA 1OH7A 1J5OA 4FM2A 3EE9A 4XH4A 3MX2A 1VSMA 1LAWA 1BCMA 4JHDB 3QDKA 1ASUA 4YDUC 4DV1K 4OKEA 3L4IA 3ZSXA 1NKBA 4CGJA 1J6ZA 4DFMA 4MFBA 4AQYK 1E4FT 2QTDA 1HKCA 4CZMA 2HVHA 4CJPA 5FRMA 4DUYK 3EKSA 3T19A 4V19S 4BR5A 3LP2A 4DTMA 4FVMA 1F21A 3SUPA 4G9ZA 2NUBA 4CEFA 3A5MC 1VQLN 3NF8A 3DRSA 1IO2A 5FRNA 2BANA 2EHGA 4CEOA 1EXQA 4NLCA 4B08A 3MX5A 1L3VA 3IMXA 4HUEA 3IG1A 1G99A 5EXWA 2GTDA 3KIOA 1RTDA 2Q0RA 3FZMA 3H08A 2KQ2A 4K43A 4B1XB 2NZTA 3TAEA 3MEEA 4BC5A 4NCBA 1MDUB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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