2GWJA

Spvb adp-ribosylated actin: hexagonal crystal form
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein
publication title A steric antagonism of actin polymerization by a salmonella virulence protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 127
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2gwjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2gwjA04
3LM9A 1IG8A 3RSEA 4FWSA 3DWLA 2IIRA 3L4IA 1GLLO 4B1XB 2HF3A 3ZX0A 3A0IX 1BUPA 5AQQA 4H0TB 2BTFA 3EKSA 5AQOA 4IZ9A 2P9LB 2J4RA 4A61A 2Q0UA 3MN5A 4EFHA 5AQMA 5BRHA 3AY9A 4M7YA 1SAZA 1NLVA 4IXCA 4BQLA 3MN6A 5AFUH 3R9PA 4PL8A 1Y64A 3ZETA 2QWOA 3WEEB 2P9IB 4H0XB 4BRHA 3MDQA 1E4FT 3MN9A 2FF6A 1DGKN 5AZJA 3EKUA 3M1FA 1NGHA 2GWJA 4FSVA 4B1YB 4B9QA 4ISFA 1NM1A 3A5NC 3LDLA 3SMSA 1NGCA 1T6CA 5ADXH 2QWQA 3DXMA 5JLFA 3CETA 3VESA 4Y0WA 3VF6A 4B1VA 3CJBA 4B1UB 4BR0A 4BR7A 4DCHA 2ASMA 1OKJA 3IUCA 1NMDA 4J8FA 2E88A 1WOQA 3LDPA 1HLUA 2Q36A 2A6AA 4BRKA 3CI5A 3HBTA 2IVOA 4CD1A 3VPZA 4Z94A 3TPQA 2NZTA 4BROA 3UB5A 5EVZA 2YCHA 1T44A 1HX1A 2ZF5O 3A8YA 3KVGA 4FWMA 2P9LA 4CZJA 5KQ8A 3QMLA 4MO5A 5KQDA 3O08A 2ASOA 2YJFA 5KPRA 3G25A 3ATVA 2YJEA 2V52B 3LL3A 4RTFD 3AAQA 3L6QA 2IVNA 4BC2A 2PBDA 2P9KB 5BPNA 3CHWA 1JCEA 3EN9A 5FPMA 3WEEA 4DQ8A 1ATNA 5AQZA 5BPMA 5B8HA 3D7EO 4IO8A 1NGDA 1C0FA 1Q18A 2Q2RA 1SZ2A 4BG8A 4EHTA 1R59O 5F1XA 3D2EB 2CGJA 2E2OA 2HF4A 5F2RA 3FLCO 1D4XA 1GLEG 1ATRA 4BG9A 4M7XA 1KAZA 2IVPA 4FL9A 4FWRA 3JS6A 4K41A 3BP8A 2P9UB 3ULEB 2QWRA 1U6ZA 3ATUA 1BG3A 3VOVA 1YXQA 4BREA 1RDWX 2ZGYA 3EO3A 4FPAA 5AQRA 5AQNA 4BGAA 4BC3A 4CD3A 5EOYA 1XQSC 2P9SB 4H03B 3QB0A 3VGKA 3HTVA 5AZIB 4BRLA 1JCGA 1NBWA 2GWKA 1ZXOA 5FPDA 1RGIA 2H3GX 2QXLA 5AQSA 3VEVA 4CZIA 3OHRA 3FR0A 3M6GA 1NGFA 2V7ZA 2QWNA 4DB3A 4EHUA 2QWMA 1S3XA 4I6MB 3H1QA 5TKYA 3O1BA 5JLHA 4MO4A 3HZ6A 4A2AA 4BRFA 3WT0A 4H5TA 4H5RA 2CGLA 4H5WA 1NGBA 2DPNA 2QWLA 4CZHA 3C7NB 4XH1A 2BUPA 2NLXA 2QW9A 3HSCA 3L0QA 3U8XA 3D2EA 4PKGA 4NB4A 5BN9A 1QQOA 3H3OB 4JD2B 3BF1A 3CJAA 4XEIA 4FWQA 3EZWA 1KAXA 4CZGA 2E8AA 5AQJA 4BC4A 1K8KA 5LJVA 5EXWA 3H46O 5AQVA 4BRAA 1BOTO 2P9UA 3ULEA 3WXKA 2FSKA 3IDHA 2E1YA 3CJ9A 4WYBA 4CZEA 3FGUA 3FZHA 4PL7A 3LDOA 4O5FA 2P9SA 4H0PA 4NO7A 3B8AX 3VEXA 4BRGA 5KPTA 3QFUA 4HTLA 4H5NA 2I7PA 5AZIA 5ELZA 4M63C 1P8ZA 4MLEA 4O8KA 1RFQA 4BRNA 1LCUA 3CERA 3AARA 3IMXA 4KBOA 5AQXA 4XH5A 4FWLA 3D2FB 4I6MA 1QZ6A 4B1ZA 3GOIA 2OANA 3DAWA 1NGGA 2AP1A 4A2BA 1G99A 1GLAG 3JXUA 3O6WA 2FLOA 4F9OA 1NGEA 3O1WA 1MWMA 3QDKA 3IFRA 2D4WA 5BPLA 4PKHA 2QM1A 1BO5O 4LC9B 5KPZA 4B1WB 4BQZA 2VCPA 4BR5A 1MA9B 2HMPA 4BR9A 5EY4A 2UYTA 3UE5A 1MDUB 1ZBSA 3FE1A 3WQTA 4MLHA 5AQLA 2A5XA 4BVOA 4CZFA 3VERA 1NGIA 1TYQB 2P9NB 2P9IA 3MMVA 2D0PA 1BA0A 2KHOA 4FWOA 4IWVA 5AQFA 5BRFA 3UKRB 3CJCA 5BR9A 1GLJO 4IJNA 1DKGD 2W40A 1GLDG 5BREA 3ZEUB 4BRIA 5AFUA 2CGKA 4QS9A 2I7NA 1QHAA 4BVPA 3O8MA 1JCFA 3WXIA 4CZLA 3I33A 5I9EB 4FWNA 3VEOA 4H0VB 1V4SA 1BWFO 1BDGA 5AQKA 1QZ5A 5AQHA 4BRCA 2E2QA 4WQ5C 2FF3B 3UKUB 3VENA 3VETA 3DXKB 4BR2A 4H0YB 3ZETB 4K43A 1HKGA 1S22A 1V4TA 3VEWA 3H45C 3O4WA 4IJAA 5E26A 4WQ4A 4PKIA 1GLFO 5AZJB 1TUUA 3GG4A 3A5OC 3KHYA 4CZMA 4H0OA 5AQTA 2A42A 2W41A 4GNIA 4BC5A 1E4GT 4RWTA 2P9KA 1BU6O 2GELA 4FWPA 3MK6A 4ISGA 3DJCA 2P9NA 3HI0A 4RCHA 1HPMA 3J8AA 5LJWA 3CQXA 1HKBA 3GBTA 4WQ5A 2VYPA 1ESVA 2ZWHA 3FZKA 4XH4A 1U2VB 3HM8A 3KZBA 1YVNA 2Q0RA 1QQMA 2V51B 3AAPA 5FPEA 3R8EA 3ZX2A 1J6ZA 3U9ZA 4CJ7A 4YDUA 4E1JA 3ZEUA 5AR0A 2F9TA 1YUWA 3WQUA 3GDQA 5CE3A 2ITMA 2GEMA 4FOEA 4BRQA 3CQYA 2CH5A 1X3NA 4CZKA 3C0BA 2NRHA 4CBWA 3FZLA 1H1VA 1NWKA 1HJOA 4H5VA 2A40A 2V7YA 3UKUA 1DEJA 3I8BA 3QFPA 3DXKA 1NGAA 4CI6A 3H6EA 3H1VX 4FPBA 2A3ZA 4BRMA 1X9JA 3O5BA 3ZX3A 1XUPO 2E20A 2QWPA 1C0GA 3R6MA 5AQPA 4BRPA 3EL2A 4FWKA 4DHYA 4JNEA 3U9DA 3FZMA 2E1ZA 3BEXA 4FOIA 3QBXA 4C23A 5JMVA 2FSJA 3CJ1A 3BF3A 1TUYA 3P4IA 5BN8A 4JHDB 2P9PB 3C7NA 3WUHA 1U2VA 2A41A 3QBWA 1GLCG 2AA4A 2YI1A 2Q1NA 1HKCA 3GL1A 4K42A 4JD2A 2D1KA 2YHXA 4GY2B 1NGJA 3ENOA 3U4LA 3A5LC 2FSNA 4JN4A 4EIAA 4AM7A 3O80A 1X3MA 2HOEA 4JAXA 1KXPA 3A5MC 3VF4A 5EX5A 3ID8A 4BGBA 3BUZB 3F9MA 2ZGZA 3VGMA 3TU5A 4L3QA 3FFKB 3CIPA 1BA1A 1CZAN 1HUXA 2CH6A 5AQWA 3RSEB 1YAGA 2E2NA 2EWSA 3WXLA 2F9WA 2Q97A 1XC3A 2E2PA 2Q31A 4WQ4C 3MCPA 5AQGA 4ISEA 1LOTB 3SK3A 4EAHD 5AQIA 3SLCA 5AQYA 3VEZA 3W3DA 3S41A 3D2FA 2GUPA 4BRDA 5ADXA 1Z6RA 3VF2A 1WUAA 3VEYA 2FXUA 3LDNA 3M3ZA 5BRDA 3ENHA 2D0OA 1ATSA 3SJHA 5E84A 4AM6A 1EQYA 3QICA 4FO0A 2YHYA 1MWKA 3GE1A 4HWIA 1K8KB 2VWBA 5LY3A 3CJ7A 3LM2A 3FZFA 2P9PA 4JHDA 3WXJA 4YDUC 5JICA 2ASPA 5FPNA 1SQKA 4BR4A 2PAVA 3DXMB 1Z05A 3W0LA 1KAYA 4CBXA 4CBUA 3H3NO 3SMPA 2GTDA 1TYQA 4QS8A 1GLBG 1QQNA 4QS7A 3MN7A 3LDQA 4K25A 1IJJA 3UKRA 1T6DA 2WUSA 5AQUA 5F0XA 4A62A 1ZC6A 2YHWA 3VGLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IG8A 3L2UA 4DS4A 3DWLA 4OGCA 3WNFA 4AHUA 3L4IA 4CHYA 2QK9A 4JI7K 5D3GA 1OH6A 3ZX0A 3MAQA 4Y1CA 3HXMA 4H0TB 3TTFA 4IZ9A 4O0JA 1LAWA 2O8DA 1RT7A 1RDUA 1MU2A 1ZBIA 4A61A 2Q0UA 2VQFK 1U47A 3ASMA 3KKRA 4M7YA 1JLQA 1HPZA 2O8EA 5GAGP 3O3FA 3SI6A 4QAGA 3I0SA 1SKWA 4E7KA 3MDQA 2XRIA 4CHZA 4CW7B 5AZJA 4ISFA 1NM1A 3A5NC 4B08A 5FLXO 3DXMA 4LFBK 5JLFA 3VF6A 2A1RA 1KVBA 3O9UA 3L2VA 3RTVA 1RILA 3HL8A 4O0IA 1M1KO 4FVUA 4Z4FA 2A6AA 3DRRA 4N56A 4DFJA 4CD1A 4BROA 1T44A 3A8YA 3KVGA 1KC8O 3QMLA 3NVKA 4M3XA 3QEWA 1ASWA 4DR3K 3O08A 2ASOA 3U3GA 4C8MA 1XMQK 4W5NA 1NOZA 3WNGA 4AHSA 3HVRA 4GV3A 3AAQA 3QO9A 3AVHA 4BC2A 3SPYA 1JCEA 4L8RB 4DV3K 3WEEA 4HUFA 3OTOK 1QS4A 2JLEA 1SUQA 4W5OA 1C0FA 4DFPA 1Q18A 1YI2N 4FJXA 4BG8A 4IOXA 4H8KA 1VSKA 4BE2A 2E2OA 3L4QA 2A1SA 2O8FA 3ZSYA 1VQNN 1RTIA 2X6SA 4HTUA 3BP8A 1U6ZA 4CFBA 4KHYA 3EO3A 4AHTA 3KKSA 3L2WA 4DSJA 5EOYA 1D8YA 3J81O 3QB0A 4ICLA 1N34K 3LP2A 4LF4K 1P90A 4DSFA 2DFFA 1QVGM 3OJSA 3M6GA 2ZM6K 1K8AO 4DB3A 4OVLA 2QWMA 4WF9L 3KWGA 4OO1J 1S3XA 3H1QA 4R5PA 4A2AA 4H5TA 1I94K 2OTJN 1NGBA 2DPNA 3DOLA 2R7YA 1N8RO 3THVA 2E6MA 2NLXA 4GW6A 2Z1HA 4YY3K 3VQ4A 1NOYA 5DMRA 4ID5A 4A5AA 3J7YP 4JD2B 3T1AA 3CJAA 4XEIA 4HVJA 1KAXA 4DQSA 2DY4A 3OYFA 2G8WA 4BC4A 3EYZA 3IG1A 1QQCA 3QINA 3H46O 1BOTO 3V4IA 3T3FA 2FSKA 3G0ZA 1C0MA 3THWA 4B9VA 3FZHA 4CFAA 2ZD1A 4FJKA 1KFSA 1S1XA 3LDOA 1HNVA 3B8AX 2IAJA 2DFHA 2HNDA 1BIUA 4HTLA 2C1GA 5C15A 4KH5A 1P8ZA 2RHKA 4NYFA 3K5OA 4O8KA 4V19S 1HYSA 4BRNA 3AARA 5AQXA 3QEXA 4FWLA 4EP5A 3IKMA 5GIOA 2QKBA 3SNNA 2D0BA 3K9KA 1KRPA 5GIPA 3THYB 2AP1A 1G99A 1GLAG 3O6WA 1NGEA 4CK1A 3O1WA 3IFRA 4FCYA 5BPLA 2ZJPL 5FRNA 3PUFA 2E6LA 3LP0A 3VQEA 1RBVA 3CCJN 1BO5O 4BQZA 1T3VA 4BR5A 1MA9B 2DTUA 3UE5A 4NYNA 4CEAA 3PLAA 1Z25A 4YOVA 3FE1A 4O55A 2WONA 3AVLA 4CZFA 1YTAA 3LANA 2P9NB 4JS5A 2D0PA 2W6LA 5AQFA 3SYZA 1NK8A 4M3RA 2HMIA 3UKRB 4KAZA 3ZSVA 4FJGA 1U4BA 5BR9A 4F3TA 4Z4CA 4IJNA 3SUQA 4KPYA 1RNHA 1BL3A 4LSLA 3K2PA 3CPWM 3TABA 3OYMA 3J7AP 3NF7A 4QS9A 3T1HK 2KKZA 5HRPA 3VQAA 4RW4A 3KWIA 3AVGA 3VEOA 3K59A 1NJYA 1BDGA 5AQHA 1LWCA 1WSGA 3CFRA 4JRPA 2E2QA 2G8UA 1NK5A 1E3MA 4BR2A 4DQIA 4C1NI 3LAMA 4PHTX 4IJAA 4FZXC 3MCAB 3A5OC 2NRWA 2WBNA 4K8ZA 3SAGA 2W41A 4BC5A 4DV1K 4JI1K 3VTIA 4FWPA 3O3GA 2JWLA 4O44A 4JKHA 4DTJA 4Z4GA 1HKBA 4WQ5A 2VYPA 1ESVA 2ZWHA 4BE0A 3KZBA 4CJPA 3AGKA 3CCVN 3O3HA 1K9MO 3ZSOA 5GAEP 4YHHK 4DV7K 4E1JA 3ZEUA 3NDKA 4RG8A 2UXDK 4CGIA 3AO3A 3WQUA 1C1CA 4I2QA 2YHAA 3ALYA 2HHIA 1XNQK 1N33K 3CQYA 5JVHL 4F2SA 4NCBA 4M45A 2HBLA 4YFUA 2YNFA 4H5VA 2V7YA 2UXBK 1TK5A 1DEJA 1SV5A 2YHBA 3VQ6A 3G71N 3QFPA 4KREA 3MX5A 4IDKA 4GV6A 1S5JA 3OVNA 3HOTA 4FPBA 1EWQA 3O5BA 2HBKA 3R6MA 4BRPA 4CEQA 3EL2A 4KRFA 4OPAA 3CM5A 4PA1A 3FZMA 4C23A 3LDSA 2FSJA 3SQ0A 3BF3A 5CY4A 1TUYA 5M1FA 3ZSRA 4JHDB 3RVCA 1U2VA 1TK8A 1LW0A 2DFEA 3QBWA 1GLCG 2YI1A 4BECA 4JI0K 4JD2A 2XY5A 2IOCA 4JKEA 3LWMA 1TKTA 3U4LA 3TAFA 4JN4A 3P1GA 3P31A 1RT6A 3O9TA 3B6OA 3PO4A 3ID8A 2HHSA 3J80O 3TR8A 3C95A 3OS0A 4AHCA 5C2DA 2GX9A 3F9MA 2PYLA 4JI5K 2E4LA 4DR5K 1N32K 4CHQA 5AQWA 3NAEA 2EWSA 3SUOA 4CJRA 5KTQA 4C8OA 1HR0K 2F9WA 3ZSWA 2GBZA 4WQ4C 4ISEA 3SK3A 4DTXA 3VEZA 3DLRA 1IBMK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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