2GWJA

Spvb adp-ribosylated actin: hexagonal crystal form
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A steric antagonism of actin polymerization by a salmonella virulence protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein
total genus 127
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2gwjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2gwjA04
3D2EB 5ELZA 3VPZA 1NGFA 3H45C 4B1WB 4BR5A 4EHTA 2NZTA 3EO3A 3WXLA 3CI5A 4BRAA 4CD3A 2A42A 5BPMA 1KAZA 1HLUA 5AZJB 2FSNA 5EVZA 5AR0A 2YHYA 2E2NA 3SJHA 4HTLA 4FWQA 3ATVA 2V52B 5E26A 3LL3A 3H1VX 3ATUA 5BN9A 3UKUB 5E84A 4BRCA 3ID8A 1BA1A 4BQZA 3FFKB 2I7NA 3GL1A 4FWLA 1HKBA 1MDUB 2P9UA 2E20A 2P9IB 5F0XA 3FZMA 2QW9A 4FOIA 4M7XA 1DGKN 5BRDA 2A6AA 1GLJO 1GLCG 2W40A 4K43A 2P9SB 5F2RA 2CGJA 1U2VA 3LDOA 4O8KA 5AQJA 3SMPA 2Q2RA 5AQQA 3FE1A 1IG8A 4H0PA 1XQSC 3VESA 5AQYA 1TUYA 4ISEA 5AQGA 5AQZA 5AQLA 2V51B 4IZ9A 4MO4A 1NGIA 2ASOA 3R6MA 3U9DA 3DXMA 4WQ5A 2CGLA 4I6MA 4BREA 3MCPA 4E1JA 2BTFA 1JCEA 1ESVA 5AQUA 3VEXA 1E4FT 4JNEA 3U9ZA 4CZMA 3AAPA 2V7ZA 1EQYA 1BO5O 1X3NA 4B1VA 1QQOA 2FSJA 2YHWA 3A5LC 4Y0WA 5F1XA 3KVGA 4PL8A 3H3NO 4BRPA 3VGLA 3MN5A 4H0OA 1QZ5A 2H3GX 1QQNA 4YDUC 2NLXA 3HSCA 1YAGA 4IWVA 1IJJA 2P9UB 3QBXA 4A2BA 5FPMA 4M7YA 3D2FA 2P9NA 1C0FA 2GWKA 3R9PA 1R59O 1SZ2A 3A5NC 3FZKA 4DQ8A 3ZX3A 1K8KA 1U2VB 2FF6A 4PKHA 3F9MA 4ISGA 1BA0A 1NGGA 5JICA 4IJNA 1NGAA 2V7YA 3SLCA 4FOEA 4CBWA 2YCHA 3EKUA 1BU6O 3O6WA 3QDKA 3TU5A 3O1BA 5B8HA 3WXKA 3O80A 2IIRA 3CETA 1J6ZA 4I6MB 2E1YA 4BRHA 4H5NA 1TUUA 2E1ZA 3FZHA 5EXWA 2GWJA 4CZEA 4CJ7A 3H1QA 4BVOA 4BRDA 3MK6A 5BPLA 4JD2A 2QXLA 3R8EA 2HF4A 1KAYA 3FLCO 5AQNA 4PKGA 5CE3A 1KXPA 3UB5A 2VCPA 5EOYA 4BRIA 2E2OA 1NGDA 5ADXA 4FWNA 3HTVA 3G25A 2J4RA 4JAXA 2P9LA 2Q1NA 2FF3B 3D2FB 4GY2B 1HKCA 2P9PA 4C23A 2P9NB 2QWNA 5AQIA 1V4SA 3M6GA 3VERA 5AQFA 3VF6A 3GDQA 4CZLA 1K8KB 3BEXA 4CZJA 2OANA 4FWRA 4BG9A 2EWSA 2HMPA 2QWOA 2PAVA 1RDWX 1OKJA 3CJ9A 5AFUA 4YDUA 2P9KA 3UE5A 4JHDA 4BR0A 4CZKA 3MN7A 5JLFA 2Q97A 3ULEB 4PL7A 2VWBA 3SMSA 4NB4A 5KPZA 3WT0A 3DXKA 4QS8A 4B1ZA 2ZGYA 4XH5A 5AQMA 1YVNA 2E2PA 4CI6A 2QWPA 5BRFA 5KQDA 2FSKA 4CD1A 2A40A 3L4IA 3WEEB 5BRHA 1ZXOA 3A8YA 3JXUA 3AY9A 1NLVA 4BROA 4AM7A 4K42A 3WXIA 3VF2A 3GBTA 3H46O 3FGUA 5TKYA 4K41A 2P9LB 4CZHA 3ZEUA 2QM1A 3IFRA 1C0GA 3ENOA 5AQXA 5FPDA 4RCHA 3VGMA 2F9WA 1NM1A 1CZAN 4MO5A 5BN8A 3M1FA 3ZX2A 1BOTO 3DWLA 1MWKA 2CH5A 1WUAA 2PBDA 2E2QA 2W41A 2YI1A 4H5TA 1BG3A 4BRFA 4EFHA 1QHAA 2IVNA 3J8AA 5AQVA 2P9KB 2UYTA 4JHDB 2I7PA 3HI0A 2A3ZA 3O08A 4FWMA 4XH4A 4DB3A 4J8FA 3MN6A 4WQ4C 5FPNA 3VEVA 1ATSA 2A5XA 2ASPA 4BRKA 3OHRA 3DXKB 1V4TA 2AA4A 3DJCA 1HX1A 1KAXA 2E88A 3U4LA 5AQKA 1TYQA 4A62A 1NBWA 1HUXA 3B8AX 3KHYA 5AQSA 2Q36A 5EX5A 2D0PA 1GLLO 4BG8A 5BPNA 3P4IA 3MMVA 5LY3A 3GE1A 2IVOA 3DXMB 3WXJA 3LM2A 4DHYA 3GOIA 3CIPA 4FO0A 2D0OA 5KPTA 3LDLA 4RTFD 4PKIA 1NGEA 2NRHA 2ZGZA 3MDQA 3H6EA 4BRLA 2ASMA 3TPQA 5KQ8A 4BR4A 2QWQA 3I33A 3CJ1A 3CJAA 3KZBA 1JCFA 1U6ZA 4BRGA 1YXQA 5BREA 1MA9B 4H5VA 2BUPA 1JCGA 3O8MA 4BC4A 1X3MA 1NGJA 3L0QA 1NWKA 4K25A 2VYPA 5AQRA 4AM6A 3A0IX 3JS6A 4MLEA 4L3QA 4CZIA 1RGIA 2Q31A 3D7EO 3EKSA 4HWIA 1D4XA 1TYQB 3MN9A 3QBWA 3QB0A 2A41A 1BUPA 3HM8A 3CJ7A 1P8ZA 3WUHA 2D1KA 1DEJA 1XC3A 1WOQA 1NMDA 4QS9A 4FWSA 1GLBG 3BF3A 4FWPA 4EAHD 3CHWA 3IMXA 3SK3A 5LJWA 1HPMA 4DCHA 4CBUA 4WQ4A 4JN4A 3L6QA 2YJFA 4A61A 3C7NA 4FSVA 4BRNA 4BR2A 5FPEA 2IVPA 3I8BA 2E8AA 3VEZA 2GUPA 4BQLA 4A2AA 1S22A 4JD2B 5KPRA 1GLAG 2FXUA 3IUCA 4FWOA 1BDGA 3VEYA 3LDPA 4Z94A 4IXCA 4GNIA 4F9OA 3GG4A 3QICA 4BGBA 1T6DA 3VGKA 4CBXA 1T6CA 1RFQA 4WYBA 4CZGA 2QWRA 4H5RA 4XH1A 3CJBA 2P9PB 3S41A 4NO7A 3UKRA 3FR0A 3O1WA 4BR7A 3LM9A 3RSEA 1LCUA 1HKGA 1Q18A 4ISFA 1QZ6A 3VETA 4B1UB 3ZX0A 3FZLA 4QS7A 2KHOA 4BVPA 3QMLA 4RWTA 4EIAA 3A5OC 5AQWA 4BRMA 1YUWA 3IDHA 3AARA 4B1YB 1DKGD 3BUZB 4B9QA 4BR9A 5AQOA 3H3OB 5JLHA 3ZETA 2FLOA 3C7NB 2QWLA 3O5BA 5LJVA 1Z05A 2Q0RA 2F9TA 1Y64A 3A5MC 3O4WA 1NGBA 5EY4A 4BGAA 5ADXH 4MLHA 3VEWA 1ZBSA 1HJOA 4IJAA 1GLDG 4BRQA 1S3XA 3CQYA 3WQUA 1G99A 2YHXA 5AZIA 5JMVA 2Q0UA 3EN9A 2HF3A 4KBOA 1BWFO 3VEOA 4BC3A 1GLEG 1ZC6A 2CGKA 3W3DA 1XUPO 3D2EA 3ZEUB 4LC9B 5AFUH 1ATNA 4M63C 3CQXA 4BC2A 3BP8A 3LDQA 3UKRB 3EZWA 3C0BA 3WQTA 3RSEB 1E4GT 3FZFA 2CH6A 4FWKA 2QWMA 5AZJA 3HBTA 4FPBA 4B1XB 1LOTB 4BC5A 3QFPA 2YJEA 3UKUA 4H0TB 1NGHA 4FL9A 4H03B 3ULEA 2ITMA 2GTDA 4EHUA 4CZFA 3LDNA 1SAZA 3EL2A 4IO8A 3U8XA 1NGCA 2P9IA 3ZETB 4WQ5C 1X9JA 1H1VA 4XEIA 2D4WA 3VF4A 3CJCA 4H0VB 3DAWA 5AQTA 1MWMA 2P9SA 2HOEA 1SQKA 2GEMA 4O5FA 1T44A 1GLFO 5AQHA 3M3ZA 2GELA 1Z6RA 3WEEA 4H5WA 2ZF5O 3CERA 5AZIB 3W0LA 4H0YB 3ENHA 1ATRA 2AP1A 5I9EB 3QFUA 4H0XB 5BR9A 2DPNA 2WUSA 3AAQA 3HZ6A 4FPAA 5AQPA 3VENA 1QQMA 3VOVA 2ZWHA 3BF1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OPAA 3D2EB 4GW6A 2G8HA 5ELZA 3VPZA 2G8WA 2FBYA 4BR5A 2NZTA 3KIOA 3CI5A 4BRAA 4CD3A 3OJSA 1KAZA 4KPYA 2FC0A 3ASMA 5EVZA 4DFPA 2V52B 1VSMA 4GVMA 3L2RA 3VQQA 4DQPA 2HHIA 3ID8A 1BA1A 2JWKA 3FFKB 3GL1A 1L3TA 1HKBA 1MDUB 2P9UA 4FOIA 4KTWA 3F73A 4KREA 4B3OA 1REVA 4TSXA 4K43A 4OJRA 2P5GA 4KHQA 3T7ZA 1U2VA 4O8KA 4F3TA 5AQJA 3SMPA 5AQQA 2HHQA 3FE1A 1S1UA 4H0PA 3CD6N 2DFEA 3NH1A 5AQYA 3SQ2A 3AVLA 4DU1A 2W6KA 3ZSWA 2XHBA 1NGIA 2ASOA 1ZYQA 4WQ5A 3HYFA 2CGLA 4I6MA 1NJXA 4K8ZA 2QTDA 5M1OA 3K57A 2KQ2A 3U9ZA 2V7ZA 3AVMA 4IOCL 2VWJA 1X3NA 4IFYA 4DV0K 1J53A 2YHWA 3A5LC 4Y0WA 3CPWM 4LFCK 2Q3SA 4PL8A 3KKSA 3QEPA 2BGGA 2DY4A 3F5TA 1QZ5A 2X74A 4F8RA 3LPTA 4A2BA 4HUGA 3D2FA 3I56N 2P5OA 1VAZA 1C0FA 2GWKA 3R9PA 3V1OA 4DLEA 1SZ2A 4BY9C 1WB9A 1JKHA 2FF6A 4WE1A 4PKHA 4CW7B 3WNEA 2YX6A 5JICA 4FJ5A 4IJNA 4CHYA 2O8FA 3EKUA 4WFBL 4DQIA 1YJNN 3WXKA 3O80A 4DTPA 4CK1A 2W00A 4DU4A 4BRHA 4H5NA 1TUUA 4OPJA 3FZHA 5EXWA 4DS4A 3S9HA 4CJ7A 4A5BA 4BVOA 4BRDA 3K58A 2HF4A 1RT1A 4FLWA 5AQNA 5DM6L 5HRRA 1S1XA 1ZBHA 3I0RA 5CE3A 3KK1A 1KXPA 2VCPA 5EOYA 4BRIA 2DFFA 3CYMA 3QESA 4CJRA 3PY8A 2D0CA 2P9NB 2QWNA 3O9QA 1V4SA 3M6GA 1JLEA 3F9KA 5AQFA 1K8KB 4JKCA 3MWPA 1Q8IA 2VG6A 4CIFA 1BCOA 4FLVA 3CFOA 1J5EK 4BG9A 2Z1GA 1RDWX 3CJ9A 4KAZA 1ASWA 3LANA 3UE5A 4JHDA 4CZKA 3LP3A 3MN7A 3L2QA 2HMIA 4HUEA 1NKBA 1GOAA 4PL7A 4BECA 3SMSA 1JLAA 1KVAA 4OLAA 3WT0A 4CJSA 4QS8A 1Q7YO 4E7JA 4B3SK 1DLOA 2G8FA 5BRFA 2QWPA 5KQDA 4NLBA 3KTQA 3VQ6A 4CD1A 1D5AA 1X9MA 3A8YA 1NU0A 3JXUA 4RG8A 4K42A 3GBTA 1S1TA 3FGUA 4RW7A 4B9VA 2B6AA 3VQCA 4DV3K 4E3SA 4E7HA 2PY5A 3ENOA 5AQXA 4RCHA 5DMRA 1QVGM 1CZAN 3TSPA 5BN8A 2HBLA 3RR7A 5SWMA 1QSSA 1NJIO 1BOTO 4J2DA 2PBDA 2W41A 4BRFA 2YI1A 3ZSYA 4EFHA 3PX6A 2IVNA 2DFHA 2JGUA 4LD0A 3PX4A 4J8FA 1ATSA 4BRKA 2Z1IA 3THWB 2QKKA 1V4TA 2AA4A 4CK2A 4FYDA 3CC4N 4A62A 4U7BA 4BWJA 4PY5A 1LW0A 4CEQA 4DTXA 3ZT2A 1HUXA 4B3RK 2UUBK 1G15A 3DRRA 4EP4A 2Q36A 2YNFA 5EX5A 4BE0A 3ID6A 4J2EA 1WSGA 4XIUA 3DXMB 2Z1HA 2WBNA 3WXJA 4UY8O 5JENA 3CIPA 4IO9L 1T03A 4AQYK 2D0OA 5KPTA 4JI7K 2NRHA 1T05A 5DM7L 4DTJA 1NG9A 1ITGA 3TPQA 4M3WA 5KQ8A 3HOSA 3I33A 4KHNA 1RDCA 3U3YA 1EP4A 3KZBA 1U6ZA 4W5TA 2E5LK 4N41A 3L4QA 1MA9B 4CEZA 1IBMK 1X3MA 4CEBA 4FJJA 4IEEA 4FLTA 1I3AA 2VYPA 5AQRA 3M8QA 3JS6A 2OPRA 1RGIA 4ZTFA 2ATQA 4KKOA 3D7EO 4EZ9A 5J2NA 3DRSA 4JLHA 4CECA 1LWEA 3DMJA 3MN9A 3QBWA 3QB0A 2A41A 1BUPA 5HLFA 3WUHA 3S5TA 2D1KA 2FBXA 4CJVA 2RHKA 4IG3A 3JSMA 3QEWA 3KK7A 4E19A 3IS9A 1BI4A 5GAHP 3T1YK 1LV5A 1NOYA 1GLBG 3BF3A 3ZSZA 4DCHA 4CBUA 3DLRA 3ZT1A 3QEXA 1OH6A 4YOXA 4BR2A 4JI4K 3RMCA 2P51A 4KO0A 4WCEL 2E8AA 4JI8K 3OYIA 1J9AA 3LP2A 4C8KA 4BQLA 4A2AA 3WNGA 4PUOA 4DSIA 5KPRA 5FROA 3LDPA 2DTUA 3OBYA 3RVCA 3J80O 3VGKA 1RFQA 1JLCA 3TAMA 4CZGA 2QWRA 3THVA 1SL2A 2XY8A 4XH1A 3OYGA 3M8SA 3DLHA 1T8EA 3UKRA 3O1WA 5C2FA 1EXQA 1Q18A 3KLIA 4ISFA 4QS7A 1I39A 4IOXA 2I5JA 3LALA 3LWLA 3QMLA 3O4NA 4RWTA 5AQWA 1XNRK 3AVNA 2IC3A 3TAEA 4LF6K 2YNGA 4B1YB 1DKGD 3BUZB 4B9QA 3CMAN 3CCLN 3LPUA 4FVUA 3H3OB 4CEEA 1Q9XA 5J2PA 1RBTA 2FLOA 3C7NB 2OZSA 3DLEA 4JI3K 3VA3A 3S3MA 1NGBA 3V9ZA 4CJTA 4DLGA 4MLHA 3VEWA 1HJOA 3N4QA 4IJAA 1GLDG 4KH6A 3CQYA 4BRQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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