2HF3A

Crystal structure of monomeric actin in the adp bound state
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
374
structure length
364
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Expressed Non-polymerizable Monomeric Actin in the ADP and ATP States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
molecule tags Contractile protein
source organism Drosophila melanogaster
total genus 124
structure length 364
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2hf3A03
5AZIB 3M3ZA 3VF4A 4B1ZA 3BUZB 2KHOA 3ZX3A 3MDQA 4BRDA 1ZC6A 2GWKA 4K41A 3L0QA 3G25A 4CZEA 3EN9A 4FWNA 5KPZA 3VGLA 4RCHA 3HBTA 5JICA 2CH6A 5EOYA 4EHTA 5BRDA 2QM1A 4XH1A 5AQUA 3WXLA 1RGIA 5EY4A 3SJHA 1GLLO 4CZKA 5LJWA 1BWFO 2AP1A 3CJAA 4PKIA 3A5NC 3ULEA 3IFRA 1GLAG 2QWRA 4FWQA 4I6MB 2F9WA 4O8KA 3D7EO 3VEVA 3CJ1A 5AFUH 2P9UB 4H03B 4FOIA 1NGHA 4B1VA 5AQWA 2HF3A 4B1XB 3H45C 3EO3A 1NGGA 3VOVA 4JAXA 3S41A 4BR5A 4FWSA 3H1QA 3D2EA 4BR2A 4HTLA 5AR0A 4BG9A 5AFUA 1KAZA 3EKSA 3LDLA 4FO0A 1MWKA 2Q36A 3HZ6A 3ATVA 5EVZA 3MCPA 1NBWA 4DHYA 3ZETA 2CGLA 1GLEG 5AQSA 3WXIA 4XH4A 3DAWA 2QWLA 3SLCA 3D2FB 3ENOA 1U2VA 2P9KB 1ATNA 4DB3A 1QQNA 2HOEA 4BRKA 1Y64A 4BRNA 1RDWX 2FF3B 1NGDA 3FLCO 3UKUB 1MWMA 2E2PA 2HF4A 3CJ9A 3R6MA 4WQ5C 2ZWHA 4WYBA 4BR9A 2D4WA 3CHWA 4BREA 2VCPA 4CI6A 1IG8A 3AY9A 2QW9A 2F9TA 4JD2A 1NGJA 3U4LA 1HKGA 3VETA 1S3XA 4CZJA 5TKYA 3UKRA 3UB5A 4BC4A 1IJJA 5F2RA 3HTVA 2FXUA 1TYQB 3QDKA 4PKHA 5AQRA 4YDUC 2FLOA 3CETA 2E2NA 3GE1A 3A8YA 2YCHA 5AQHA 3FFKB 2QWPA 4ISFA 3O1WA 2P9IB 1BOTO 4Y0WA 3A0IX 2V51B 3VPZA 3QMLA 1E4GT 2P9PA 5BN9A 4KBOA 3H46O 2FSKA 3CERA 1ESVA 5AQKA 3BF3A 4WQ4A 3O6WA 2GUPA 5AQVA 2GEMA 2Q0RA 2Q97A 4BROA 2D0OA 3BP8A 3BF1A 4EAHD 4XEIA 4DCHA 1QZ6A 4BVPA 3GDQA 3KHYA 3W0LA 3EZWA 5AQIA 4A62A 2BUPA 1HUXA 4MLHA 1LOTB 4IJAA 4B1WB 5AQMA 2A6AA 5AQPA 5AZJB 5BRHA 3CJBA 4BRGA 2I7NA 1BA0A 3RSEA 3A5MC 4FWOA 1NGCA 4H0PA 1V4TA 4MO4A 4JNEA 1X3MA 3KZBA 2QWMA 2I7PA 2IVNA 3DXKA 3I33A 2A40A 5I9EB 2P9SA 2E1YA 4QS9A 5AQOA 2IIRA 4Z94A 3KVGA 4AM7A 4MO5A 1T6DA 2Q31A 4CD1A 2CH5A 2E2OA 3ENHA 3CI5A 4HWIA 4JN4A 3U9DA 4A2AA 4PL7A 1TUYA 4IXCA 1MDUB 1GLFO 5BPNA 5AQQA 1C0GA 1NGAA 1HPMA 3QFUA 1X3NA 3QICA 2A3ZA 4JHDA 4BRLA 2W41A 1ZBSA 2V52B 4BQLA 4L3QA 5BPMA 1NM1A 1SAZA 1XC3A 1YVNA 3VERA 1T44A 3DJCA 4NB4A 5ELZA 2P9NB 3EL2A 1ATSA 3C7NA 4ISGA 4BC3A 3QFPA 4H5WA 3O8MA 4A2BA 4I6MA 4IJNA 2YHWA 3CQYA 4BRHA 3QBWA 4BRFA 4LC9B 3F9MA 4BG8A 5AQFA 4XH5A 5AQYA 4BGAA 5KQDA 3B8AX 3FZFA 4K25A 1K8KB 3QB0A 3WUHA 2YHYA 1C0FA 3MN7A 2ITMA 2PBDA 1V4SA 3JS6A 2P9LB 2Q1NA 3A5LC 2YI1A 5JMVA 4JD2B 4F9OA 4AM6A 1KAXA 3LL3A 4EFHA 3VEWA 2P9KA 3MN9A 3UKRB 1NLVA 1Z6RA 2ZGYA 1YXQA 3U9ZA 1LCUA 4PL8A 4RWTA 1QQMA 3UKUA 3ID8A 4ISEA 3UE5A 2ASPA 5AQXA 3ZEUB 1EQYA 5BPLA 2BTFA 3DWLA 4BC2A 2ZF5O 1CZAN 2PAVA 2J4RA 1NMDA 4C23A 1XUPO 4CJ7A 3VEZA 1JCFA 3BEXA 4B1YB 5KPRA 4GNIA 1D4XA 2P9PB 4NO7A 3WT0A 1HJOA 5BRFA 2YJEA 3DXMA 5AQNA 3FGUA 3VENA 1TYQA 3VEOA 2A42A 1NWKA 3O08A 4GY2B 2ZGZA 4H0VB 1YAGA 3EKUA 2GELA 3FZKA 3LDOA 3FE1A 4PKGA 4K42A 2GTDA 2E1ZA 3GBTA 4H5NA 2VYPA 4B9QA 3CQXA 2P9IA 4BRMA 1KAYA 4FWKA 4IWVA 1ZXOA 1HKCA 1X9JA 3VGKA 3MMVA 3SK3A 5KQ8A 1JCGA 3HM8A 3H1VX 1TUUA 4H0XB 5BR9A 3O80A 3MN6A 2UYTA 4FWMA 1G99A 2IVOA 3WEEA 4QS8A 1U6ZA 3OHRA 1NGBA 5KPTA 1P8ZA 1J6ZA 2D1KA 5F1XA 2QWNA 3ULEB 1QQOA 5AZIA 4FPBA 2NRHA 5AZJA 1DKGD 1ATRA 1NGFA 3IMXA 4H0YB 3QBXA 4J8FA 4CBWA 3TU5A 2YHXA 4WQ5A 3VF6A 4CBUA 5FPDA 5FPMA 5AQZA 1BU6O 4JHDB 3WXKA 3FZHA 1T6CA 5EXWA 4M7YA 2AA4A 4WQ4C 3SMPA 3D2EB 2QWQA 4CZFA 4IZ9A 3MN5A 3AAQA 1QZ5A 3R9PA 2ASMA 4FL9A 5AQLA 3C7NB 2EWSA 3LDNA 1E4FT 1NGIA 3VEXA 1RFQA 2E20A 3LDQA 3ZETB 4H5VA 4FWPA 5BN8A 3HSCA 4BRQA 4BRAA 5BREA 2P9UA 4YDUA 5JLHA 1U2VB 3VESA 1GLCG 2D0PA 4BVOA 4BRPA 1JCEA 2DPNA 5EX5A 2GWJA 4A61A 4CD3A 3CJCA 4QS7A 1BG3A 3WQUA 5F0XA 4M7XA 2YJFA 1GLDG 2P9NA 4B1UB 4BQZA 2OANA 2Q2RA 2IVPA 5B8HA 4CBXA 4BR7A 3L4IA 4EHUA 3LM2A 3R8EA 1SZ2A 3VF2A 2HMPA 3H3NO 3H6EA 4MLEA 4IO8A 4CZLA 1S22A 3D2FA 3H3OB 3AAPA 2E2QA 1GLBG 1YUWA 3I8BA 4FWLA 3M6GA 4K43A 1Z05A 1K8KA 4FSVA 2FSNA 3VEYA 5AQGA 3FZMA 4O5FA 3O4WA 5LY3A 5AQJA 2VWBA 4H0TB 3GG4A 2E88A 2P9LA 1NGEA 3LDPA 4CZHA 1WOQA 2W40A 3ZX2A 4H0OA 1DGKN 4BRCA 1BUPA 1HKBA 3FR0A 4CZGA 4DQ8A 3ATUA 2QXLA 5JLFA 3U8XA 3SMSA 3DXMB 3L6QA 2ASOA 3O5BA 3AARA 2H3GX 3LM9A 5LJVA 1HLUA 2A41A 3ZEUA 4FOEA 3J8AA 4RTFD 3CIPA 2NLXA 3VGMA 4BGBA 3IDHA 2Q0UA 3WQTA 1HX1A 1Q18A 4H5RA 3GL1A 1QHAA 1MA9B 3W3DA 3A5OC 1SQKA 1BDGA 3WXJA 5ADXH 4E1JA 4H5TA 1OKJA 2CGJA 2E8AA 2WUSA 2FSJA 5AQTA 1H1VA 1KXPA 2A5XA 2V7ZA 4CZMA 1BO5O 1XQSC 5FPNA 3C0BA 4BRIA 2NZTA 5CE3A 4BR0A 3P4IA 3M1FA 1DEJA 3HI0A 4FWRA 4M63C 3GOIA 3IUCA 3RSEB 1BA1A 3MK6A 4FPAA 5E84A 4BR4A 5ADXA 1GLJO 5FPEA 1WUAA 2FF6A 3O1BA 2CGKA 2V7YA 4EIAA 3WEEB 3DXKB 2P9SB 3FZLA 3TPQA 1R59O 3ZX0A 3CJ7A 4CZIA 4BC5A 3JXUA 2QWOA 5E26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M3ZA 3P31A 3BUZB 5BR8K 3ZYYX 4AILC 1IKVA 2GWKA 1JLGA 2VGMA 1WNSA 3SZ2A 4DFKA 3EN9A 4RG8A 3K58A 4LF7K 1GOCA 4Z4GA 3KK7A 1DTTA 1S6PA 2YNHA 3LP0A 5LMUK 5EOYA 1DLOA 4ZTJA 5AQUA 3CF5L 2PY5A 4B9VA 4H4MA 3I0SA 4BDYA 2ZM6K 3PX6A 3ULEA 3IFRA 1GLAG 4FWQA 4F2SA 3V1RA 2F9WA 1RT4A 4O8KA 4JKFA 3VEVA 2D0CA 4Q5VA 1TKTA 4CJRA 4AHCA 3O3HA 3MAQA 4CF0A 5JS1A 3R3LA 3LDSA 5AQWA 2HB5A 3H45C 1HPZA 3V9XA 2XY7A 3T69A 3VOVA 3S41A 4FWSA 4BR2A 3QINA 4BG9A 5TKWA 4CIFA 4FVMA 5AFUA 3L3UA 1VHXA 3U6FA 4C1NI 4ILJA 3J7YP 4DHYA 2KFNA 2QWLA 2XY8A 3D2FB 4IFYA 3HP6A 1JL2A 2ETJA 4DV2K 2Q3SA 2Z1IA 4DQQA 3TTDA 1NGDA 3FLCO 1CLQA 2E2PA 3J7ZO 3QEWA 3R6MA 3SNNA 1BQMA 4BREA 3HRGA 2X78A 1IG8A 4Q0BA 1BISA 4KFBA 1YI2N 4DQPA 3G0ZA 3AV9A 5GAHP 1S3XA 4CZJA 5TKYA 3UB5A 2HHXA 3HTVA 3TAGA 1LWCA 3MXIA 2FXUA 1YITN 3QDKA 5AQRA 4GKJK 4AF1A 3LP2A 2ITGA 3KWGA 3AVBA 3CETA 3OYMA 4I9LA 4LF5K 4Z0UA 4WFAL 2WTUA 4X62K 3FFKB 4ISFA 3SPZA 4Y0WA 1RTJA 4DTPA 4CFAA 4DWIA 2FSKA 2YNGA 5AQKA 4DS5A 3C6AA 2QI2A 1ASUA 2ZD1A 2GEMA 4J2DA 3QERA 1RDAA 3I0RA 1WBBA 2BGGA 3W0LA 4A62A 4OKJA 3PSIA 3DOLA 4MLHA 3L2VA 3CPWM 3B6OA 4IJAA 2NRVA 2OZMA 4FLZA 3LAKA 5AZJB 1QVGM 5C0YA 2VG6A 5GADP 1WAFA 4DTNA 1NKBA 4H0PA 1V4TA 4Z4HA 2I7PA 4I9QA 3NBPA 1XNRK 2E1YA 5FDLA 2KLAA 1S5JA 1X9WA 4CIEA 3KVGA 4FLUA 1VSLA 4FZZA 2OA8A 4CD1A 1KC8O 2OYQA 3ZT2A 2CH5A 2B6AA 2LSNA 3CI5A 4A2AA 3U9DA 4R79A 1QS4A 1HR0K 4M3UA 1IO2A 1I94K 3TSUA 1MDUB 1GLFO 3NF6A 5BPNA 3DLBA 1WSFA 3VQ4A 4BRLA 1OH5A 2G8IA 4Y1CA 4NLCA 3EEQA 1EWQA 2D5RA 1T44A 4NB4A 5FROA 1VQNN 3EL2A 1SUQA 5C42A 4H5WA 4CJEA 3NGIA 2HHHK 3ISNC 1RT2A 2BANA 3NHGA 3F9MA 4FK2A 3M8PA 5C2DA 5AQYA 3B8AX 3KWIA 1N6QA 5CYMA 1RT5A 2YHYA 4FJKA 2O8EB 1HQEA 1C0FA 3KK3A 4K8ZA 3QETA 2HBLA 4MFBA 4UY8O 2YI1A 3PO4A 4DV5K 3JSMA 3QESA 1ZYQA 5HL7L 3CCVN 4YOTA 1BI4B 3MN9A 1REVA 3OYKA 1Z6RA 3OS1A 1A5VA 2NUBA 3U9ZA 4BWMA 3SQ4A 3AVIA 1XMOK 4LFAK 3ZT0A 1RTDA 1IG9A 3UE5A 4H8KA 1N36K 3D6RA 1C1CA 3C6TA 3F9KA 4KO0A 1RDDA 3O9RA 2ZF5O 1J5EK 3RRHA 5HP1A 4CJ3A 3K5OA 4NXMK 1SS6A 5GINA 4CEAA 2UUAK 2WC9A 4EZ6A 3WT0A 4E1MA 2YJEA 3AO4A 5CZ1A 3T3FA 2ZGZA 4H0VB 4CF9A 4E1NA 3EKUA 1LWEA 3FZKA 4W5TA 4GV9A 4O0IA 4K42A 3GBTA 3HOSA 2VYPA 4Z4IA 2RKIA 1RDUA 3SV3A 4MDBA 3SV4A 4LD0A 3MWPA 3QEXA 4JRQA 1TV6A 5HRPA 2O8BA 3IRXA 5LL6Z 3PY8A 4LH4A 1JCGA 3HM8A 2NRXA 4GMJB 1G99A 1JL1A 4QS8A 4JI2K 1HMVA 2QWNA 3CMAN 1NK9A 5AZIA 5AZJA 1DKGD 1UWBA 3CFRA 1HNWK 1W7AA 3QBXA 1D8YA 4J8FA 1P90A 2PYJA 3TU5A 3VF6A 4CEEA 4QAGA 4ZHRA 4JHDB 1FK9A 3I56N 5EXWA 4I7FA 1HYSA 3D2EB 4YOYA 3SUQA 4RW8A 1J54A 5J2QA 2HHSA 4K8XA 2GX9A 4WF9L 2ZJQL 2ASMA 3ZSVA 3QIOA 1IH7A 1E4FT 3S3OA 3VQ7A 1JLQA 1RFQA 3LDQA 4GW6A 4NLBA 3TARA 4H5VA 5BN8A 3HSCA 4BRAA 4DSFA 5JLHA 4YDUA 3L2RA 1NJIO 4DV7K 4BVOA 2KKZA 4KRFA 4YORA 3S9HA 3AVMA 4A61A 4CD3A 1M1KO 3CJCA 1BG3A 3WQUA 5F0XA 4M7XA 1QSSA 4QOZB 4JKGB 2RN2A 4B1UB 1S9GA 4BQZA 4DTRA 2Q2RA 3ZT4A 4CFDA 1Y97A 1I3AA 3SPYA 3U3YA 1KVBA 4JI7K 1DT9A 1S22A 5C15A 3HT3A 3SUNA 1VRTA 4CF8A 3A2FA 2VG5A 4FSVA 2O8CB 2FSNA 1J5OA 2ZJPL 3QEPA 2O8EA 4N76A 2G8UA 4B3OA 2E88A 4CJ5A 4EP5A 1NOZA 1WOQA 3P5JA 4KPYA 1ZBFA 3ZX2A 3V6DA 4KI6A 4H0OA 4JI3K 1HKBA 3FR0A 4B9UA 3CC4N 1BI4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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