2HF3A

Crystal structure of monomeric actin in the adp bound state
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
374
structure length
364
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Expressed Non-polymerizable Monomeric Actin in the ADP and ATP States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
molecule tags Contractile protein
source organism Drosophila melanogaster
total genus 124
structure length 364
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf3A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2hf3A03
5JICA 4I6MB 1BA0A 3MN6A 4H5VA 2ITMA 4B9QA 3BP8A 4F9OA 4M7XA 2QWLA 3C7NA 4JD2A 3QFPA 3VEZA 3DXKB 4FWLA 2P9PA 4BRAA 1U6ZA 3EKUA 4FOEA 2YHYA 4DCHA 1NGDA 3LDQA 2ASPA 3SMSA 4BRHA 3GBTA 1QZ6A 4B1WB 2Q1NA 3VENA 2E88A 2E20A 1DKGD 3H45C 3OHRA 5JLHA 1E4FT 2E2NA 5FPDA 4XH1A 3AAQA 5AQFA 4BRCA 4BVOA 2BUPA 2NLXA 3A5OC 3B8AX 4FWSA 3HTVA 4BR9A 1X9JA 4LC9B 1NGBA 2P9NB 2DPNA 2Q97A 3D2EA 1J6ZA 2FSKA 3FZKA 1NGCA 2P9KB 1SQKA 4H03B 2BTFA 2YJFA 4HWIA 2P9IB 3O5BA 3U8XA 3ATUA 1QHAA 3EKSA 4BREA 2FF6A 2UYTA 3O08A 2QWPA 2IVPA 5AQOA 3MN5A 4EFHA 3WEEB 1TYQB 3D7EO 5LJWA 5E84A 4XH5A 3BF3A 1Z05A 5AQSA 3C0BA 4PL8A 1GLLO 4H5NA 4CBWA 4BG9A 1GLAG 2A42A 3RSEA 4JD2B 4A2BA 2WUSA 1NGJA 2PBDA 4XEIA 1MDUB 4K25A 5AFUA 2GTDA 5F1XA 1KAXA 4BGBA 5AQXA 4JHDB 3WT0A 3IMXA 4KBOA 2QWOA 5AQMA 3VOVA 1MWKA 4ISFA 3ATVA 1V4SA 2I7PA 5KPTA 5AQVA 1SZ2A 3VEYA 3VGMA 1HX1A 3SK3A 4IJNA 2QWRA 3ZETA 3H6EA 4H0XB 4FWQA 3WQUA 1P8ZA 1Y64A 3LL3A 5FPNA 3SLCA 3D2EB 2QM1A 4FWKA 4XH4A 3H3NO 2HF3A 4BVPA 5I9EB 1NGAA 1NMDA 5F2RA 4PKHA 2GUPA 1BU6O 3VGLA 3ULEA 2D0OA 3HM8A 3J8AA 1Q18A 2A3ZA 2H3GX 3FE1A 1BWFO 5KQDA 2FSNA 1C0GA 3FZHA 2QWQA 3QFUA 1ZC6A 4RTFD 4BRMA 4BC4A 4C23A 5BPMA 2GWKA 4RWTA 2HOEA 4H0YB 3CI5A 1XUPO 3SMPA 4DHYA 2VYPA 2QWMA 4H0TB 2D0PA 3VEXA 4Z94A 4EIAA 3G25A 4FPBA 3TPQA 3WXIA 4CJ7A 4J8FA 3R9PA 4BR0A 1ZBSA 3JXUA 4CZLA 2HMPA 1IG8A 5AFUH 2E2PA 4JHDA 5KPRA 5EX5A 2W41A 1OKJA 3O4WA 3LDNA 3QDKA 5FPMA 3WXKA 4BR4A 1HLUA 1GLEG 2IVOA 3QBWA 4FWRA 2KHOA 2NZTA 3ZETB 4MLHA 1MWMA 3CQXA 3FLCO 1GLFO 4M63C 3WXLA 1S22A 4A61A 4B1XB 3EO3A 2Q36A 1TUUA 3LDOA 4BRPA 2VCPA 3VF6A 1X3MA 5E26A 3DXMA 2AA4A 3EZWA 4FL9A 4CBXA 2AP1A 3ULEB 2ASMA 1HUXA 3A5NC 4FWNA 1DGKN 1BA1A 1NBWA 1HPMA 2P9LA 3KZBA 1ATSA 4CZKA 1QZ5A 5BN8A 4L3QA 4K42A 1BDGA 5B8HA 2A6AA 3U9DA 5AR0A 4H5TA 4GY2B 2W40A 1ZXOA 2IVNA 3MMVA 5BPLA 3MDQA 1T6CA 1KXPA 2CGLA 3CERA 4BC5A 1ESVA 1NWKA 2D1KA 1LCUA 1R59O 4AM6A 4MLEA 5EY4A 2E1YA 3FGUA 1YAGA 5AQYA 2OANA 3BUZB 4BQLA 5EOYA 1K8KB 4H0PA 1EQYA 5AQHA 1SAZA 1MA9B 1H1VA 3FR0A 4HTLA 4DB3A 4CZEA 3MN7A 2YCHA 3R8EA 4BC3A 4DQ8A 5F0XA 3H1VX 3H46O 2P9SA 3QICA 1HKBA 1JCFA 3I33A 4BRLA 3F9MA 5FPEA 3ENHA 3WUHA 4E1JA 5BRDA 3CETA 2E2OA 4CZMA 2YI1A 2E1ZA 3VETA 3HI0A 3A5MC 4WQ5A 4JN4A 3ZX0A 3I8BA 1S3XA 3VEOA 2GEMA 4K41A 3M6GA 4QS8A 2FSJA 3EN9A 3FZFA 5BREA 4WQ5C 4BRIA 2D4WA 3WXJA 4FO0A 3DXMB 2NRHA 5AQTA 3ENOA 2Q2RA 2VWBA 1E4GT 4MO5A 4BR2A 1U2VA 3P4IA 4H5WA 3U4LA 1V4TA 3UKUA 1QQNA 2P9LB 1XC3A 2QWNA 3HSCA 4BR5A 5BPNA 3FFKB 3GE1A 2ZF5O 5ADXH 1JCEA 3IDHA 4IWVA 3TU5A 3R6MA 5EXWA 5AQUA 1HJOA 3IFRA 2ZGZA 2FF3B 2Q0RA 3O8MA 2ZGYA 1G99A 3IUCA 1ATNA 5AQPA 1WUAA 2F9WA 1TUYA 1CZAN 3CJCA 1D4XA 2CH5A 2V52B 4JNEA 5JLFA 2CH6A 2PAVA 4ISEA 3MCPA 3CJ9A 3CQYA 4O5FA 3VERA 3JS6A 2IIRA 3O6WA 1K8KA 3EL2A 2P9SB 3AAPA 3D2FA 3HBTA 4FWPA 3GDQA 4B1VA 4BRDA 4A62A 4H0VB 3VGKA 3H1QA 4BRQA 3ZX3A 4AM7A 2YHWA 4B1YB 3L0QA 1QQOA 3VPZA 5AQWA 3MN9A 5AQGA 3U9ZA 4BRFA 5LJVA 3HZ6A 2A5XA 4H0OA 1QQMA 4FOIA 2FLOA 4M7YA 1X3NA 4BRKA 5CE3A 1YXQA 3BEXA 1U2VB 5AQIA 4WQ4A 4FSVA 3UKUB 4BGAA 1RFQA 5AQJA 3S41A 4EHTA 3DAWA 1NLVA 1RGIA 3MK6A 5ADXA 2J4RA 1GLBG 4CD1A 3UKRB 1NGFA 5EVZA 4WQ4C 4QS9A 2A41A 2Q0UA 2YHXA 3GG4A 3DJCA 3KVGA 2V7ZA 1RDWX 3CJAA 2ASOA 2QW9A 1GLCG 5AZJA 4CZFA 1NGHA 3VESA 3GL1A 4BRNA 3ID8A 1BO5O 5AQRA 3LM9A 3ZEUB 4A2AA 4NB4A 4FWOA 3WQTA 2GWJA 4BC2A 5AZIA 4CZGA 1JCGA 3A5LC 1Z6RA 5AQLA 2ZWHA 4CZIA 3D2FB 4PKGA 4WYBA 4RCHA 1IJJA 3LDPA 5AQQA 3CIPA 3CJBA 3QB0A 3CJ1A 4CZHA 2P9UA 3DWLA 3LDLA 2A40A 4PKIA 4CD3A 4H5RA 3CJ7A 1T6DA 4K43A 1NGEA 2V7YA 1DEJA 5LY3A 3C7NB 3QMLA 4BROA 1HKCA 3W3DA 4I6MA 4B1UB 1GLDG 2QXLA 1NM1A 2GELA 1T44A 2P9PB 1XQSC 4MO4A 3UB5A 4IJAA 4B1ZA 1KAYA 3VF2A 4YDUA 4IO8A 5AQZA 4BQZA 2YJEA 3DXKA 5KQ8A 3ZX2A 2HF4A 1GLJO 3L4IA 4ISGA 1C0FA 4YDUC 1LOTB 3FZLA 4BR7A 4EHUA 4IXCA 2E2QA 3UKRA 5AZJB 3LM2A 5BN9A 1NGGA 3VF4A 2FXUA 4BRGA 3AARA 1BOTO 4CI6A 3W0LA 1WOQA 3O80A 4FWMA 1YUWA 2E8AA 3QBXA 1HKGA 3CHWA 3VEVA 2CGJA 5BRHA 3AY9A 3KHYA 4GNIA 5AZIB 5AQNA 5TKYA 2Q31A 1NGIA 3SJHA 2CGKA 3A8YA 4O8KA 3VEWA 3ZEUA 2I7NA 2P9NA 3GOIA 4NO7A 4EAHD 3O1WA 3M3ZA 1BUPA 2P9KA 3FZMA 1ATRA 1YVNA 3H3OB 5AQKA 4BG8A 3A0IX 2P9IA 5BR9A 2P9UB 5JMVA 3BF1A 4FPAA 4QS7A 3L6QA 5BRFA 3M1FA 4IZ9A 1KAZA 3O1BA 5KPZA 1BG3A 4JAXA 5ELZA 2EWSA 2V51B 4Y0WA 2F9TA 4CBUA 4PL7A 3WEEA 3RSEB 4CZJA 1TYQA 3UE5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JICA 1NK5A 4DTNA 3OYKA 4B9QA 3MECA 4IDKA 2D0BA 3QFPA 1SKWA 1NJYA 1CXQA 1OVQA 4M42A 4CW7B 3M8QA 3O4NA 4KHQA 2HBKA 3KLGA 2G8VA 3LDQA 3THXB 3SMSA 4BRHA 4B1WB 1QZ6A 4JKCA 1NK4A 3SAGA 2X6NA 1OVYA 3MEDA 5FPDA 1U04A 4CJQA 4BVOA 2BUPA 2NLXA 2VQEK 4FWSA 1GOCA 1VSKA 3HTVA 1X9JA 1VQPN 2P9NB 2IGIA 2DPNA 4PHTX 3D2EA 3OS2A 1SQKA 4LFAK 4H03B 1B9FA 1REVA 4JKGA 3ALYA 2P9IB 3O5BA 3F73A 4OGCA 4CJFA 3KWIA 1RBRA 1JL1A 2GX9A 3K9JA 3O08A 2QWPA 2IVPA 2HNZA 5AQOA 3CQ8A 1ZBUA 4LF7K 2YNFA 4WFAL 1VQ5N 3T1YK 2P5OA 3C0BA 1GLAG 3L2QA 5HBMA 4DSLA 4GW6A 1D5AA 1VK0A 5AFUA 5F1XA 1WSHA 5CYQA 3KTQA 4JYAK 1HNWK 4OGEA 2R7YA 3HVTA 1RDCA 2HW3A 2HHXA 4DTJA 1S1VA 4C8LA 1V4SA 5KPTA 5AQVA 1SZ2A 2IS3A 3RMCA 4HTUA 3AVCA 4C1NK 3LANA 4DQSA 1VQ9N 3VN5A 2QWRA 3H6EA 2DFEA 3SUPA 3K5LA 4K8ZA 3NDKA 3THWA 1O1WA 4YOXA 4FWKA 1VHXA 5HLFA 1G15A 3H3NO 2HF3A 4BVPA 2HMIA 4GMJB 2GUPA 4BY9C 1BU6O 3VGLA 3SNNA 3OY9A 3SBGA 1KLMA 3MXMA 1T03A 2YKMA 4IG3A 2A3ZA 3FE1A 1BWFO 5KQDA 1U45A 4FLXA 4RWTA 4RTFD 3V1QA 3ZLJA 2HOEA 5M1FA 3E01A 3TABA 3VQ7A 4ILJA 1RT7A 1Z25A 3G25A 4OPJA 3TPQA 4CJ7A 4H4OA 2X74A 1NKCA 4GKJK 1CXUA 3HSTB 3KK1A 1ASWA 3IAYA 1TKTA 3G10A 4IBNA 1SS6A 4Z0UA 5AFUH 4B3TK 3LP1A 3O9UA 3ZYYX 4DR5K 3G0ZA 3P31A 4CHYA 5KPRA 3SPYA 4CHNA 1NG9A 3KD1E 4R5PA 2YX6A 3S3NA 1HLUA 3SQ0A 2NZTA 3M8PA 4MLHA 4J2AA 1KFDA 4LFCK 1MWMA 1S72N 1GLFO 1ZBHA 2OA8A 3WXLA 4A61A 4N56A 3CYGA 2Q36A 2YV0X 3LDOA 4ILGB 1KSPA 4QAGA 4DU3A 3JYTA 1X3MA 2KTQA 1HQUA 3DXMA 3ZSXA 3L4QA 2NRWA 3A5NC 4FWNA 3KIOA 1BA1A 2P9LA 2ETJA 3KZBA 5JVHL 3ULDA 3SQ4A 4FK4A 1IBKK 5BN8A 4HUGA 1NJZA 1BDGA 3LPUA 1QE1A 4AF1A 4H5TA 1KFSA 2HNDA 3MMVA 4CEZA 1KXPA 3K5NA 4I9QA 3WNFA 4WE1A 2FBYA 3FGUA 5AQYA 3OYJA 1H1VA 5C2FA 4QOZB 2YCHA 4JK8A 4ZTJA 4GV3A 4DQ8A 2NNWA 2QKBA 3QIOA 1QSSA 1VQMN 4DTMA 1LW2A 1HKBA 1TGOA 4JKFA 3F9MA 2VQFK 4A59A 5BRDA 5LMUK 4FM1A 2YI1A 1IV0A 1VQKN 3DLEA 3TI0A 4FLUA 2C1IA 4WQ5A 2W00A 4KHSA 4OPAA 1BQNA 3DRRA 3CMAN 4F2RA 2HBLA 1C1AA 1NOYA 3AO5A 4M41A 4CEAA 4KB1A 1T8EA 1V4TA 3SUNA 4J2EA 3ZCMA 3DLGA 5D3GA 4BR5A 3FFKB 4ZHRA 1JCEA 3IDHA 3AA4A 4CIFA 4RW9A 3LP0A 2Z1GA 1HJOA 3OYHA 4LF4K 1SUQA 5C25A 2IDOA 2ZGYA 4KHPK 2F9WA 4YOUA 2WC9A 1CZAN 1HYZA 4I9LA 3OJSA 3CXCM 1XI1A 2CH5A 2V52B 4JNEA 2CH6A 2PAVA 3NGIA 3SQ1A 3LP3A 4LSLA 4M3ZA 1K8KA 3EL2A 3C6AA 3VQ6A 3UIQA 3D2FA 3HBTA 4B1VA 4A5BA 4A62A 3OW2M 1HRHA 4OKKA 3AO2A 3VGKA 3G6EN 3H1QA 3LAMA 3TANA 3MEGA 5HL7L 3RMDA 4B1YB 3L0QA 1LW0A 2QI2A 3C95A 4N76A 3OBYA 4X65K 1QQOA 3ZT2A 4E1NA 5AQWA 1KTQA 5AQGA 5GIOA 5GAGP 3HZ6A 2HBMA 5GAEP 1X3NA 1O13A 4MDAA 5KRTA 3S9HA 1YXQA 4EP5A 1U2VB 5AQIA 4CEQA 4B3SK 4IEIA 4BGAA 4FJXA 2YHBA 3AVLA 1MU2A 1EKEA 1VQLN 1ASUA 4YOWA 2UUCK 1GLBG 4CD1A 3UKRB 4NYFA 1A5XA 4QS9A 2Q0UA 3GG4A 3AVMA 3BY5A 1IKXA 3DRPA 1NK6A 5HRNA 4CZFA 3V1OA 3VA0A 3T1HK 2O8CA 3ASMA 2LSNA 3ZEUB 4NB4A 1VSJA 1K6YA 4DUZK 3E1YA 5AQLA 2ZWHA 4CEFA 5J1EA 4WYBA 1IJJA 4PUOA 1TL1A 4DG1A 3QB0A 1VRUA 3CD6N 4OLAA 3DWLA 4CD3A 3WXMB 2E5LK 4K43A 1WBBA 1K9MO 4FLVA 1BIUA 1RT1A 3I0RA 1XC9A 3QMLA 1N34K 2O8DA 3L3VA 3E66A 5C15A 4B1UB 2GELA 3HL8A 2E6MA 1S9EA 1XHZA 4MO4A 2NRRA 1S1UA 4CJ5A 4BQZA 3LP2A 1Q9YA 1GLJO 3L4IA 3DLLL 1YF5L 3THXA 4EHUA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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