2OANA

Structure of oxidized beta-actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
366
structure length
355
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Molecular and Structural Basis for Redox Regulation of beta-Actin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
total genus 116
structure length 355
sequence length 366
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2oanA03
4AM6A 5AFUA 2E20A 4JN4A 1CZAN 3SK3A 4CJ7A 3KVGA 3W3DA 3ZX2A 4B1ZA 5F1XA 1NLVA 2D4WA 4JNEA 3FZMA 4IWVA 4CZFA 3IMXA 1LOTB 1OKJA 3R9PA 3BEXA 5ADXH 3VEZA 3AAPA 2AA4A 3WQUA 3GOIA 3WUHA 2VCPA 2YHWA 4K25A 2P9LB 3DJCA 1MA9B 4B1WB 4XEIA 4KBOA 4BRLA 3IFRA 4CZIA 3D2EA 3ATUA 3DAWA 3AY9A 1Z6RA 4XH1A 1BU6O 3LL3A 1NGEA 3VPZA 4H03B 5EVZA 2HF4A 4BR4A 2ZWHA 1TYQA 3WEEA 1E4FT 3UB5A 4WQ5A 5AQKA 1SAZA 3FZKA 4FWNA 4EHUA 4RTFD 1ZBSA 1JCEA 2E1ZA 4O8KA 4QS8A 5KQ8A 1HPMA 3QFUA 2E2QA 3LDPA 3R8EA 3HTVA 5AQTA 1NGCA 5BRHA 2QWPA 1K8KA 5FPDA 4H5VA 3M1FA 4CZJA 2P9NA 2A42A 5JLHA 1P8ZA 2ZGYA 2E8AA 3CJ9A 4RWTA 1QZ6A 4BRGA 4H5WA 3GL1A 3D7EO 5BRDA 3CI5A 2OANA 3JXUA 3ZX0A 2P9SA 4FWLA 1U6ZA 5F2RA 3O1BA 4J8FA 3U4LA 2YJFA 3MN5A 1TUYA 3EKUA 4DQ8A 4L3QA 2P9PA 2QWRA 1U2VB 4I6MA 5BN9A 3U8XA 4RCHA 2IIRA 2QWLA 1RFQA 3QICA 3EL2A 3ULEA 5AQPA 1QHAA 2KHOA 3LM2A 3FZLA 4CBXA 3DXKB 3AAQA 3GE1A 5FPMA 3LM9A 1NGGA 2A3ZA 4FWQA 3ID8A 3VF6A 4CZEA 4HWIA 1GLDG 4FWRA 4BQLA 1GLLO 5AZIB 3WXJA 3DXKA 4FPBA 2E1YA 3L6QA 4YDUA 4FWMA 1YXQA 1TUUA 3W0LA 3CJAA 3CERA 5AQRA 1DKGD 4PL8A 3UKUA 3C7NA 3LDOA 1NM1A 3HI0A 4K42A 4QS9A 4H0PA 2V52B 4BRDA 4BRNA 2FXUA 2E2OA 3H6EA 4BRCA 1SQKA 4BREA 3LDLA 3J8AA 3SMSA 2PAVA 1DEJA 3CQYA 3GG4A 4HTLA 3A5NC 3R6MA 4BR7A 2P9IA 3H1VX 5E84A 3O5BA 2P9UA 3L0QA 3JS6A 1YUWA 1WUAA 1ATRA 1J6ZA 4F9OA 3LDNA 4BRKA 3ENOA 1BDGA 2A40A 1KAXA 2FF6A 2QXLA 3FZFA 3QB0A 1ZC6A 3CETA 3I33A 4JD2B 5AZJB 4CBUA 2QM1A 2GTDA 2YI1A 1ZXOA 1NGFA 3FGUA 3DXMB 1NBWA 4PKHA 2ASPA 3VETA 4CZMA 4BC2A 2IVOA 5LJVA 1HKGA 2ASOA 2YHXA 3SJHA 5BPNA 3A8YA 1V4SA 3M3ZA 5AQGA 5I9EB 2H3GX 2A5XA 4H0YB 2FF3B 4BC3A 4H0OA 2CGJA 1S22A 3RSEB 3VGMA 3WXLA 4DHYA 4FOEA 5AQXA 4FWKA 2P9LA 4BROA 2YCHA 3F9MA 1GLJO 5AQFA 4ISGA 1HKCA 1V4TA 3TPQA 5FPEA 4JAXA 4EIAA 3L4IA 4DCHA 3MN9A 3A0IX 1BUPA 3MK6A 5CE3A 3ATVA 4YDUC 4E1JA 1BG3A 1QQNA 5ADXA 3AARA 3VGLA 1YAGA 3CIPA 4B1XB 2I7NA 2GWJA 1E4GT 1C0FA 2CGKA 4BGAA 1WOQA 4FSVA 3VOVA 5EY4A 5JICA 3SLCA 2NLXA 4XH4A 1Y64A 4FO0A 2V7YA 1ESVA 5AQJA 4XH5A 1XUPO 3CJBA 1HJOA 1HLUA 3VEYA 2EWSA 3QBXA 4H0XB 4K43A 3HZ6A 2D1KA 5KPZA 3KHYA 4IJAA 4B1YB 4PL7A 4NO7A 3HM8A 2VYPA 5KPRA 5FPNA 2I7PA 4BR0A 4BC5A 4WQ4C 3QMLA 2CH6A 3ZETB 2A6AA 5AQWA 1C0GA 3U9ZA 4BQZA 3IUCA 4FWOA 3BP8A 2V51B 5KPTA 4BRMA 3ZEUB 1GLEG 3I8BA 1GLAG 3D2FB 3VGKA 5BREA 5BPLA 3VEXA 2V7ZA 3P4IA 3MMVA 1U2VA 3H3OB 3VESA 3O80A 4B1VA 1QZ5A 5AQUA 5EOYA 2E2PA 1Z05A 1HX1A 3DWLA 3VEOA 2Q36A 1JCFA 5AQQA 1G99A 5B8HA 1BO5O 2FSJA 3GDQA 4H5RA 4MO4A 3GBTA 5AZIA 2YJEA 1X3NA 2HF3A 2D0PA 2UYTA 3O6WA 2GELA 1JCGA 4GNIA 3UKRB 2WUSA 2ZGZA 1T6DA 3IDHA 4IXCA 4WYBA 3WT0A 1R59O 4EHTA 3FLCO 3ENHA 2BUPA 2FSKA 3M6GA 4AM7A 3O08A 3VENA 1RGIA 4FPAA 1SZ2A 3BF3A 5AFUH 2D0OA 2GWKA 1NMDA 3H46O 4BGBA 1X3MA 4Y0WA 5E26A 3VEWA 4BR9A 3VF4A 4BRAA 4EFHA 5LY3A 3OHRA 3LDQA 4A2AA 4LC9B 4FOIA 4A61A 3UE5A 2Q97A 3BF1A 3S41A 1BOTO 4WQ4A 3QBWA 1GLFO 5BR9A 4A2BA 4NB4A 2IVNA 4DB3A 2Q31A 2PBDA 2QWMA 4JHDB 4CZGA 3FFKB 4QS7A 4IO8A 4JD2A 1IG8A 4O5FA 2AP1A 5AZJA 3O1WA 4H5NA 3EN9A 3EKSA 1Q18A 2HMPA 3DXMA 3HSCA 4CD1A 3MDQA 4B1UB 4BRHA 3VERA 2Q0UA 4BR2A 2Q0RA 3MCPA 2Q1NA 3G25A 2NRHA 3H45C 4H5TA 3RSEA 4A62A 3CJ7A 1X9JA 4EAHD 2ZF5O 3D2EB 3FR0A 3A5OC 1NGJA 5JMVA 5KQDA 1BA0A 1KAZA 5EX5A 5TKYA 3A5LC 2QWNA 3CJCA 1IJJA 4MLHA 4M7YA 3QDKA 1QQOA 3FZHA 5AQYA 5AQSA 1TYQB 4CI6A 1EQYA 4MO5A 3WEEB 2ASMA 1ATSA 2QW9A 3C0BA 3H1QA 4C23A 2Q2RA 4H0VB 1XC3A 4MLEA 1GLCG 2QWQA 4B9QA 4CZLA 5LJWA 3CQXA 1HUXA 1DGKN 1NGIA 3ZX3A 3WQTA 5AQMA 1K8KB 4ISEA 4IJNA 5AR0A 2P9NB 5ELZA 4CD3A 4BR5A 4BVOA 4BVPA 2J4RA 2NZTA 3O4WA 2ITMA 2YHYA 3EO3A 5BN8A 3MN6A 1T6CA 3KZBA 5AQHA 1NWKA 2HOEA 3U9DA 3TU5A 1NGAA 3QFPA 1KXPA 5BPMA 4BG8A 3H3NO 1BWFO 4PKIA 5AQZA 4CZHA 1T44A 5BRFA 2P9SB 1H1VA 3ZETA 4ISFA 3FE1A 2FSNA 3VF2A 4BRQA 4FL9A 4BRIA 3ZEUA 2P9PB 5F0XA 1MDUB 2QWOA 3D2FA 1D4XA 4I6MB 2GUPA 2W41A 3HBTA 1RDWX 4BRPA 2BTFA 3VEVA 3SMPA 3ULEB 4M7XA 4CZKA 1ATNA 4FWPA 1GLBG 2F9TA 3WXIA 1MWKA 4BG9A 4BC4A 1YVNA 2FLOA 3WXKA 2E2NA 4Z94A 1HKBA 2DPNA 3B8AX 2P9KB 2W40A 4CBWA 3UKRA 1S3XA 4M63C 3UKUB 3C7NB 1BA1A 4GY2B 5EXWA 1MWMA 1NGHA 2P9KA 4BRFA 4WQ5C 1QQMA 2CH5A 3O8MA 4K41A 5AQNA 5AQLA 4PKGA 3CJ1A 2GEMA 5AQIA 1XQSC 2IVPA 1KAYA 1LCUA 2F9WA 2CGLA 2A41A 2P9IB 5AQOA 4IZ9A 1NGBA 2P9UB 1NGDA 2E88A 3CHWA 5JLFA 3MN7A 4FWSA 3BUZB 5AQVA 3A5MC 2VWBA 4H0TB 3EZWA 4JHDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FYDA 3SK3A 3ZX2A 4CF8A 3L2VA 1NLVA 4LF5K 1NG9A 2D4WA 3OA9A 5J2NA 1S1WA 1D9DA 2XY7A 2HHXA 3LDSA 3OYBA 4CHZA 4CEFA 4X66K 2AA4A 3GOIA 2Y1JA 3HOSA 4O55A 4O0IA 2YHWA 4KHSA 3CM5A 1DLOA 4B1WB 4KBOA 3QIOA 4BRLA 4CZIA 3R1XA 3CC2N 3AVLA 4DFKA 1NGEA 4OO1J 1X9MA 2HF4A 2OPRA 3NGZA 2ZWHA 1JLCA 3ZSXA 4FLUA 1S5JA 2YX6A 3CYMA 4DV6K 1JCEA 4O8KA 3E9LA 4QS8A 3V1OA 3SAHA 5JENA 4JKDA 3C6AA 3VA0A 3R8EA 4KB1A 4KB0A 3HTVA 4JKEA 1VSDA 5AQTA 3K5LA 5FPDA 5BRHA 3C6TA 3K9JA 4LFAK 4MFBA 3HSTB 3LZIA 3M1FA 2ZM6K 1CZ9A 3CCMN 2A42A 3WXMB 4CFBA 2GUIA 4U7BA 3TSPA 1NK9A 1GOCA 1JJ2M 3KTQA 1S1UA 4CVNE 4FWLA 2UXBK 4J8FA 3U4LA 1OVYA 1IBKK 1D9FA 1N8RO 3AVCA 3CXCM 3KD5E 4TSXA 3TANA 2P9PA 5BN9A 3U8XA 4RCHA 1NJYA 3EL2A 3OVNA 1QHAA 3LM2A 1JL1A 3FZLA 4CBXA 2O8BA 4LY7A 5FPMA 4FW1A 1C1BA 3V9XA 4CIFA 1I39A 3WXJA 1C1AA 3DXKA 3G6EN 3L6QA 1HNXK 3QEPA 4FWMA 3W0LA 4DFMA 3CERA 4LH5A 1RILA 3LPUA 1VQ5N 2RPIA 4BWJA 1YTAA 4QS9A 3LZJA 2V52B 1RBSA 4E3SA 3T1HK 5KI6A 4W5OA 3H6EA 1FKPA 4YY3K 1HYVA 4BREA 3NMUA 4CFDA 2UU9K 3EZ5A 2Q3SA 3CQYA 3A5NC 1C0MA 4BR7A 3RRGA 5E84A 4BDYA 2P9UA 4Z4FA 2KZMA 1S1XA 1YUWA 2X74A 1K73O 3LAMA 4CIGA 5C25A 4YOWA 1VHXA 3ZSOA 2KZZA 1KAXA 3CETA 3I33A 4BWMA 2Z1JA 3AO5A 5AZJB 4CEDA 4CBUA 1XMQK 2YI1A 1KC8O 2Z1GA 3S3NA 2UUCK 4YORA 2IVOA 5LJVA 4X65K 5BPNA 3A8YA 3E9PA 5I9EB 3V9UA 1RDDA 3OYFA 3JAMO 2CGJA 4DHYA 2RE2A 4FWKA 4BROA 3F9MA 1V4TA 3DYAA 3ZSZA 1OH5A 3MN9A 4DR6K 3L8BA 3SUQA 3NGYA 2P5OA 2E6MA 5C10A 5LMNK 4JYAK 4JKCA 1VRTA 2EX3A 3AARA 5ADXA 2UXCK 4KHPK 3O4QA 3OJUA 3KD1E 3L3VA 3WNHA 3K58A 3KWIA 1TAUA 5EY4A 5JICA 3O4NA 5C2FA 3TAFA 1VSIA 4FO0A 5M1QA 2WOMA 4RW6A 1Q9XA 5AQJA 5GAGP 3ZT1A 1HLUA 1WN7A 3IG1A 4KHQA 3QBXA 4H0XB 3CCVN 4CJVA 5GAEP 5KPZA 3KHYA 1W7AA 4IJAA 1RDUA 5KPRA 3MEDA 5HRSA 3AVKA 3QINA 1JL2A 3AVAA 2A6AA 3MX2A 1C0GA 1JXEA 4DV3K 3U9ZA 3FFIA 3ZT3A 4M3YA 1RDBA 2HW3A 4BRMA 1GLEG 3HK2A 1GLAG 4KKOA 1BQNA 3VEXA 2V7ZA 1U2VA 4DLEA 3O80A 3UIQA 4JRPA 4AHTA 4CJSA 1QZ5A 4HHTA 1L3TA 1HX1A 4CCHA 4K8XA 3THXA 5GAHP 3VQBA 4B9MA 4I9LA 5B8HA 1RT5A 2FSJA 5CY4A 1T05A 4HCCA 1QSLA 5H1SQ 3TABA 2UYTA 4ZHRA 2GELA 2VG7A 3UKRB 4YFUA 1T6DA 4MQ3A 4WYBA 2PY5A 3R3LA 2UUBK 4BE0A 2BANA 2RF2A 3RVCA 4AM7A 3VENA 1BL3A 1KCFA 2QA4N 1DTTA 4FK0A 4DV2K 1RTHA 4CJLA 1QS4A 5AFUH 4DTNA 1JLGA 3O9UA 4A5AA 3QIPA 1YI2N 4EFHA 2HHHK 3CYGA 3TTCA 3UE5A 4FCYA 2QEXN 3RMAA 2G8VA 3S41A 2XO7A 3ALYA 3ENBA 4EP5A 3LWMA 4JHDB 4DV1K 3FFKB 4QS7A 1OH7A 2HHVA 4JD2A 4OPHA 3AGRA 4DKWA 2NNWA 3V6DA 3MDQA 4CK1A 3SAGA 4B1UB 4BRHA 3P5JA 3VTIA 1VQKN 1RBRA 2XY8A 2HVIA 2DFEA 4IOXA 3QEIA 3IS9A 2NRHA 3H45C 1VQMN 3V9ZA 5C15A 1X9JA 4EAHD 3D2EB 3AGKA 4HUEA 1RTDA 2G8WA 1RNHA 2QWNA 3ZSVA 3RMDA 4JKGB 3QDKA 3FZHA 2O8FB 1EQYA 3WEEB 1NK7A 2QW9A 4FLWA 3H1QA 1N6QA 4C23A 5KRTA 3U3YA 4CEZA 3CCLN 1R0AA 4B3TK 1XC3A 4I9QA 1QE1A 1UOCA 5FDLA 1GLCG 3AVBA 2XRIA 3THVA 2HB5A 2UXDK 3ZX3A 4PWDA 4E7KA 1WSIA 4R79A 2P9NB 5ELZA 4CEOA 4BR5A 4FK4A 4BVOA 3O4WA 3Q7CA 4DLGA 4X64K 1BHLA 3ZYYX 3ZLJA 1WSFA 1KVCA 1NGAA 5BPMA 4PKIA 1BWFO 5BRFA 4WFAL 2XHBA 4AHCA 4DTRA 3ZETA 3FE1A 2A1SA 2FSNA 4BRQA 1B92A 5HL7L 2GUPA 1KVBA 3VEVA 3LAKA 3ULEB 1NNEA 4M7XA 1VSMA 1T8EA 2QK9A 4M3XA 4FWPA 3THWB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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