2OANA

Structure of oxidized beta-actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
366
structure length
355
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular and Structural Basis for Redox Regulation of beta-Actin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
molecule tags Structural protein
total genus 116
structure length 355
sequence length 366
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2oanA03
1ZBSA 4FSVA 4I6MA 4IWVA 3WXKA 3VGKA 3RSEA 1X3NA 4B1ZA 3WEEB 4FWPA 4BGAA 2NZTA 3QBWA 4WQ4C 4WQ5A 2Q31A 4CZKA 4CD1A 3VEZA 5AQXA 4FPAA 3CQXA 2V52B 4QS7A 5AQTA 2A40A 3IUCA 3VGLA 4ISFA 4YDUC 3M1FA 2P9LA 3C7NA 4H0TB 4BR2A 2VWBA 3CJ9A 1T44A 3DXKB 3ZX2A 1J6ZA 2E1ZA 4PL8A 2GTDA 4FO0A 5AQMA 3FZKA 4MLHA 4C23A 4NO7A 5BN9A 4H5NA 4BC3A 4A2BA 4H03B 3M3ZA 2PAVA 4BRIA 1RFQA 2YI1A 1X9JA 4FWQA 2FSJA 1D4XA 4H0XB 3OHRA 4Z94A 3ID8A 4HTLA 3QFPA 4BC4A 2Q2RA 1C0GA 5AQLA 2F9WA 3BEXA 5E84A 1ATRA 4WQ5C 2A6AA 3MN7A 3D2FB 1MA9B 1BU6O 1E4GT 4MO5A 3H3NO 1U2VA 3CJ1A 2ZWHA 5FPEA 3CJ7A 1GLEG 5AQYA 3W3DA 2P9UA 3D2EB 4EHTA 3CJBA 2IVNA 3I8BA 4H5WA 5EVZA 2OANA 3ENHA 5AQRA 2D0OA 3UB5A 3FZFA 4HWIA 3VOVA 2E8AA 1NMDA 4B9QA 5ADXA 1TYQA 1XUPO 3KZBA 3ZX3A 4F9OA 3ZETA 1R59O 4FWKA 4AM7A 2A3ZA 2VCPA 3UKRA 3ULEA 3WT0A 4E1JA 4JD2B 4FWOA 1HX1A 2FF3B 3VETA 1QQMA 2YCHA 1SQKA 2WUSA 3LDLA 1V4SA 3GOIA 3LM2A 4IZ9A 3MN5A 2EWSA 2BTFA 3H3OB 3AAPA 1LOTB 1YAGA 1HPMA 1BUPA 2QM1A 1CZAN 2A5XA 1U6ZA 1Y64A 5AZJB 3DXMB 4BGBA 3SK3A 2H3GX 1YXQA 2D0PA 3R8EA 3JXUA 4H0VB 1ATSA 4CI6A 2P9IB 1QHAA 2BUPA 2E2OA 3R6MA 5BPLA 4XH1A 3UKUB 3IFRA 1HUXA 4K25A 1H1VA 1IJJA 3HSCA 3WXJA 4JNEA 5AQSA 4FWLA 1GLJO 1NGCA 2FSNA 2UYTA 2GUPA 2GWJA 3H46O 3L4IA 5AQZA 3LDNA 2CH6A 4JHDA 3A5LC 4DB3A 5ADXH 2YJFA 2P9NA 3HBTA 1S22A 2QW9A 2W40A 4LC9B 3WEEA 3A8YA 4CZJA 4BRCA 3MN9A 1S3XA 2IVPA 3CHWA 4XEIA 3HI0A 4QS8A 4CZFA 2QWLA 4MLEA 5BPNA 1WUAA 2V7ZA 3IMXA 3HM8A 4L3QA 3CERA 3QBXA 2I7PA 3VENA 3GL1A 4DHYA 4FWNA 4BRMA 3G25A 2I7NA 2KHOA 4B1WB 2P9SB 2CGJA 5F1XA 4JAXA 2QWMA 3TPQA 2AP1A 4CJ7A 1WOQA 4WYBA 3WXIA 3O6WA 1RGIA 3DXKA 4BRHA 4H0YB 1OKJA 4BRDA 3FLCO 1K8KB 5BRFA 1NWKA 1MWMA 1QZ6A 1TUYA 1HKBA 4EFHA 5B8HA 3U8XA 4EAHD 1NGGA 1NBWA 3LDQA 1NGHA 3BF3A 5AQGA 5AQQA 1GLDG 4B1YB 3SMPA 2NLXA 5AFUH 4GNIA 2DPNA 5KPTA 3VERA 1E4FT 5BPMA 2E2PA 1X3MA 5BR9A 4BR5A 3ATUA 3QDKA 2QWRA 4BR9A 1P8ZA 4ISGA 3H45C 4CZLA 2PBDA 3ZEUB 3VEWA 3CI5A 4BG9A 3AAQA 3D2EA 3F9MA 2FF6A 2J4RA 4FOEA 3QICA 1NGBA 2GELA 3A5NC 5E26A 2FXUA 3W0LA 2CGKA 1MWKA 1QQNA 4BRKA 1Z05A 3QB0A 4PKIA 2YJEA 1KAZA 1ATNA 1KXPA 4JD2A 1T6CA 3VEXA 5TKYA 1BG3A 2GEMA 3MN6A 4A61A 3O80A 1TUUA 2P9PB 2V51B 3U9ZA 3VEVA 4M7YA 4XH4A 3FFKB 3MMVA 1BO5O 3R9PA 5JMVA 1HJOA 4BVPA 1T6DA 5AZJA 5AZIB 1Q18A 2CH5A 2P9KA 4H5TA 1NLVA 5AQWA 4ISEA 2P9IA 2YHWA 4K41A 1JCGA 3MDQA 4O8KA 4EHUA 2YHYA 3S41A 1C0FA 4QS9A 3UKRB 1JCFA 3DAWA 5LY3A 3GDQA 1XQSC 1IG8A 4FPBA 2A41A 5EOYA 5JLFA 1Z6RA 4O5FA 2ZGYA 5KPZA 3EO3A 3EN9A 3O1BA 5KQ8A 3IDHA 3VPZA 3GE1A 3HZ6A 3BF1A 5AQKA 5AFUA 2HOEA 5BRDA 3B8AX 1G99A 4RCHA 3I33A 4CZMA 4RTFD 4BQLA 1GLFO 1NGDA 4BRPA 1GLBG 3EKUA 3L6QA 4K43A 4BRGA 4BRAA 4YDUA 3VGMA 4IXCA 5JLHA 3P4IA 4CZGA 5FPDA 4BROA 2QXLA 2QWPA 3U4LA 1JCEA 1XC3A 3A5MC 2W41A 2ZGZA 1EQYA 1YUWA 1BOTO 3QFUA 3VF2A 3WUHA 1QZ5A 3WQTA 5AQFA 4B1VA 4EIAA 3LDOA 3L0QA 1NM1A 3CQYA 4BR0A 3WQUA 4DQ8A 3GG4A 2Q0UA 3QMLA 4AM6A 5AQNA 4KBOA 4FL9A 2IIRA 5AR0A 3LDPA 4BRNA 5F0XA 5I9EB 5AQOA 4H5VA 5EXWA 1BA1A 2Q36A 3C0BA 4H0PA 3FGUA 4GY2B 4B1UB 2Q0RA 3EL2A 4I6MB 3RSEB 2QWNA 5AQIA 4A2AA 3D7EO 4DCHA 2QWOA 3CIPA 5FPMA 5FPNA 3TU5A 2HF4A 3EKSA 5JICA 2E2QA 3SLCA 1HKGA 4J8FA 2ITMA 3ATVA 3ZEUA 2QWQA 4BVOA 3KVGA 4RWTA 2Q1NA 3VESA 4BRQA 3KHYA 1KAXA 2P9LB 3C7NB 1DKGD 3D2FA 1NGFA 5AQJA 3SMSA 5CE3A 3H6EA 3MCPA 4NB4A 2FLOA 3O4WA 4BRFA 3O08A 3BP8A 3H1QA 3VF6A 3AARA 4K42A 4CBWA 3FZHA 5KPRA 3U9DA 4CZEA 1HKCA 3GBTA 3SJHA 1SAZA 3FZLA 3VEYA 1ESVA 3ENOA 4CBUA 3A5OC 4BRLA 4FOIA 5AQPA 4BC5A 4JN4A 1ZC6A 2F9TA 2HF3A 3A0IX 4CZHA 4CBXA 1RDWX 3CETA 1MDUB 2P9PA 3M6GA 5EX5A 5BRHA 4BR7A 5LJWA 5AQVA 3VF4A 3ZX0A 2HMPA 3WXLA 1U2VB 3UE5A 4BQZA 2Q97A 2P9UB 4BREA 5AZIA 4BR4A 5ELZA 3J8AA 1GLAG 1GLLO 4Y0WA 4B1XB 1LCUA 1ZXOA 1NGJA 2CGLA 3DXMA 4MO4A 2E1YA 3DJCA 4FWMA 1TYQB 2AA4A 2IVOA 3ZETB 4IJAA 3AY9A 1SZ2A 2ASPA 3UKUA 3DWLA 2D1KA 3ULEB 2FSKA 1DEJA 2E2NA 1KAYA 2E88A 4M63C 3BUZB 3O1WA 4WQ4A 1BA0A 1NGIA 3O5BA 2NRHA 4BG8A 3VEOA 4CZIA 2YHXA 2ASOA 1BWFO 3MK6A 4BC2A 2GWKA 4IO8A 3JS6A 3EZWA 2P9KB 3FE1A 3LL3A 1DGKN 5LJVA 3HTVA 1NGAA 3H1VX 2ZF5O 4PKGA 4A62A 2VYPA 1BDGA 1GLCG 4M7XA 1QQOA 1HLUA 5KQDA 4H5RA 4XH5A 4PL7A 2A42A 3FZMA 2D4WA 2ASMA 3LM9A 2E20A 3CJCA 5AQHA 5AQUA 4CD3A 2P9SA 1V4TA 5F2RA 3FR0A 2V7YA 4H0OA 5BREA 4FWSA 5BN8A 3CJAA 4PKHA 4IJNA 4JHDB 5EY4A 2P9NB 4FWRA 1K8KA 1NGEA 1YVNA 3O8MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I6MA 4FSVA 3WXKA 3RSEA 2PYJA 3LZIA 1VSEA 2HHHK 3RR7A 1N33K 4FLTA 5EU7A 2Z1HA 3IRXA 4BWJA 3THVA 4JI3K 3KD5E 4FYDA 4JK9A 5JVHL 4CZKA 4H8KA 5AQXA 4FPAA 1QS4A 2BH1A 3VA3A 2F96A 1OH5A 3C95A 1CLQA 3PX6A 4CEQA 4KTWA 3T1AA 3CG7A 3M1FA 2P9LA 3CJ9A 3L2UA 4ZHRA 1JLBA 3TTCA 2E1ZA 3VTIA 3FZKA 3AO2A 2ZM6K 4Z4FA 4IEIA 1RILA 1OH8A 3K2PA 2F8TA 3SPYA 2PAVA 5FROA 3OYAA 1W2BM 4FJIA 1RFQA 4JKDA 2O8EB 1X9JA 4DQRA 4W5RA 4H0XB 1WSGA 1VQNN 4HTLA 4Z4IA 4BC4A 2YV0X 4KREA 1TV6A 3CFOA 4C8OA 3MN7A 3AVKA 1MA9B 1BU6O 2VGMA 3D2FB 2D0CA 5CZ1A 3W3DA 3RMCA 1RTDA 2IVNA 3I8BA 3RMAA 1IV0A 1JLQA 4M3WA 1JLGA 4B3RK 3ENHA 5K14A 5AQRA 3OJUA 4LD0A 3SCXA 2KZMA 1BHLA 4J2AA 2A3ZA 3A2FA 3LAKA 4JD2B 4KB0A 4FWOA 1HX1A 3C6UA 3TAPA 4BE0A 3VETA 1HNXK 1HQUA 1EXQA 1CXQA 1HRHA 3LDLA 3LM2A 4CESA 5HRNA 1HYSA 1BQMA 2VWKA 4DUZK 1YAGA 4DU3A 1SL0A 1U6ZA 4JKEA 3G4SN 5AZJB 4CHOA 2H3GX 3TARA 4BE7B 4FM2A 4YOXA 3HO1A 4H0VB 1S9EA 4CJPA 3NBPA 3B6OA 2X74A 3UKUB 3AVMA 1RDBA 1K6YA 2HBLA 4JNEA 1IG9A 3AO4A 4DQIA 4FWLA 2PZSA 4YHHK 4DV7K 4M3UA 1OVQA 1HNVA 4N56A 4YOTA 1TK0A 2O4IA 3MX2A 4JHDA 4DSIA 2KZZA 2YJFA 1XI1A 4CJQA 1L3TA 1S22A 3V6DA 3PV8A 4FK0A 2HBKA 3E9LA 3WEEA 4LC9B 1B92A 1S3XA 1W97L 2IVPA 4IG3A 3MXJA 4CZFA 4MLEA 5BPNA 4PA1A 4DTMA 3CERA 3VENA 3MEDA 3T19A 2E6MA 4JI4K 2Z1IA 2KHOA 2P9SB 4JAXA 4KV8A 4RW8A 4CJ7A 3S3OA 3E1YA 4G1QA 4OPAA 4N41A 4M3XA 3CC7N 4H0YB 2QEXN 3MEGA 5BRFA 1NWKA 4CJ4A 3LPTA 5SZTA 4GKJK 1HKBA 1NGGA 3G0ZA 4CHNA 1NGHA 5M1KA 4V19S 1VQPN 3EY1A 2BANA 1NG9A 2DPNA 2XHBA 3PX0A 4PQUA 5BR9A 4FLYA 3CCSN 1LW0A 1TL3A 4L8RB 3H45C 3NCIA 4FJGA 3CI5A 3AAQA 2KTQA 3HVTA 4CEFA 3SV3A 1QQCA 3LZJA 3KLGA 3D2EA 4PHTX 4AHRA 3L2WA 1SKSA 3HYFA 2ZJQL 3QICA 3DRPA 3KTQA 1NGBA 2GELA 1EX4A 5E26A 4CJVA 1NK8A 4BRKA 4A57A 3M8RA 1XMOK 1IKXA 2YJEA 4DS5A 3P83D 1S9GA 4E3SA 4FJ9A 3TAFA 4JEPA 1OVYA 5TKYA 3DLGA 3MCAB 4CECA 3Q7BA 4CK3A 2V51B 3TSUA 3U9ZA 3THWA 2BDPA 2O8CA 4M7YA 1ASVA 3LANA 4CK1A 4B8CA 1VQ6N 3SQ1A 4DTUA 4NCAA 2BGGA 1Q18A 4JI0K 4JK7A 2YNFA 4NCBA 1ZBIA 2D0BA 3QESA 4X66K 2DTUA 3DAWA 5LY3A 4KHPK 4O5FA 2I5JA 1NU0A 4CJWA 4FVUA 3EN9A 2ZE2A 1VRUA 3KKSA 5BRDA 2W6KA 4B9MA 5FRNA 4RCHA 4B3OA 3I33A 4DTOA 1FXXA 3F9KA 1HPZA 1NGDA 3KWGA 3O4QA 1U04A 3EKUA 4DLGA 4BRGA 1REVA 3VGMA 5JLHA 3P4IA 4JK8A 4J2DA 4CJ5A 1XC3A 4LY7A 3QFUA 4B1VA 4EIAA 1QZ5A 3E9OA 1WNSA 3HL8A 1ILYA 4BR0A 3TANA 2B4JA 4DQ8A 4C1NK 5C12A 3HRGA 2NRZA 4BY9C 3CPEA 1I94K 4KBOA 1LW2A 5I9EB 3ZT4A 4F8RA 5C24A 2O8FA 5EXWA 3CM5A 3ZSRA 3SYZA 3C0BA 2OA8A 3CYGA 3OYMA 4B1UB 3TTDA 2Q0RA 3LAMA 4JI7K 4CEZA 1BI4B 4HVJA 2QWNA 3D7EO 4TSXA 4DR1K 4GKKK 4OLAA 5JICA 4RW6A 3I0RA 2E2QA 2UXBK 4KHUA 3ZLJA 3ATVA 3LWLA 4B9TA 2QWQA 2E4LA 2Q1NA 3VESA 3D45A 1KAXA 3SPZA 3HSTB 3C7NB 3OBYA 5C2DA 1NGFA 1NK5A 3AO1A 4NXMK 5M1QA 2X78A 3TAQA 3BP8A 2P1JA 3NDKA 4K42A 1X9WA 3FZHA 4H4OA 1O1WA 3CF5L 3U9DA 4CZEA 4AILC 3SJHA 1Q9XA 1KLMA 3ZT0A 1LAVA 3DYAA 3VEYA 1WSJA 1FW6A 4NYFA 4BRLA 4B3SK 3ID6A 4BC5A 2XY8A 1ZC6A 2F9TA 2HF3A 2HHTA 3A0IX 4AHVA 2HHXA 4LF7K 3NVKA 2OPSA 3CMAN 1MDUB 4I2QA 4LFCK 2IDOA 5BRHA 3OYKA 2YX6A 5AQVA 2KQ2A 1DTTA 3VF4A 3ZSQA 3ZX0A 4O44A 1YVUA 1U2VB 3WXLA 1X9MA 4BQZA 4AQYK 4KO0A 5AZIA 5ELZA 1GLAG 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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