2P9IA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp and crosslinked with gluteraldehyde
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
410
structure length
393
Chain Sequence
GRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 131
structure length 393
sequence length 410
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9iA03
3VEVA 1NGCA 1XQSC 5B8HA 4BRMA 2OANA 3O1WA 3S41A 3LM2A 3R8EA 3HSCA 4BRCA 1S22A 4FWPA 3VF2A 5LJVA 1QHAA 3AARA 5EVZA 3C7NA 5KQDA 4FWQA 4BRAA 4XH5A 1T44A 4K25A 4BRDA 2HF4A 2Q31A 2P9UA 2I7NA 3G25A 5AQFA 3DXMA 4B1VA 2F9WA 2E2QA 2FLOA 3GE1A 1DKGD 3ZX0A 3MN7A 3ULEA 3VGKA 2YJEA 4ISFA 4RTFD 4K41A 3VETA 4M7YA 4BRKA 3QICA 3M6GA 3F9MA 1NGJA 3QMLA 3DAWA 3BUZB 4CZHA 3VF6A 4EAHD 1T6DA 4H0PA 3CERA 3FE1A 1LOTB 3A8YA 3EKUA 3VEOA 4BG8A 3AAPA 4BQZA 4A62A 5JLHA 1MWMA 1QQOA 1KAXA 4WQ5C 3A5MC 4PL7A 3VEWA 1NMDA 1GLDG 2J4RA 3SJHA 1X3MA 3VENA 5EY4A 3GL1A 3QFUA 1QZ5A 3UB5A 5AQLA 1NGHA 3BEXA 4CBXA 3QBXA 1YUWA 2ITMA 3ZEUB 2P9KA 3O1BA 3D2FB 1NGAA 3IMXA 3JXUA 3LDQA 4CI6A 1HKGA 2FSKA 3EN9A 3BP8A 4BRFA 5AQHA 5FPEA 1SZ2A 3C7NB 2HMPA 2PAVA 2YHYA 4B1UB 2GEMA 3C0BA 1BWFO 1V4SA 4ISGA 1MA9B 3H1VX 2FXUA 2YHXA 2E1YA 4FWRA 4BVPA 1T6CA 1P8ZA 4Y0WA 3VOVA 3O8MA 5FPNA 2QWLA 1JCFA 3MMVA 2ZGZA 3RSEA 5LJWA 3DXMB 3P4IA 4CZEA 2FSNA 4L3QA 5AZJA 3EZWA 4BR2A 1KXPA 4BRIA 3ULEB 5BN8A 2EWSA 1HKCA 4JHDA 1KAZA 3SMSA 3W3DA 3CI5A 1ATNA 4B1YB 2GUPA 5EOYA 5AQRA 4B1WB 3R6MA 1DEJA 2H3GX 3WXJA 4FOIA 4K42A 5BRFA 3HTVA 3VERA 4A2BA 1K8KA 1E4FT 3WXIA 3GOIA 2UYTA 2ZWHA 4IZ9A 3EKSA 3H3NO 3HBTA 3MN9A 4JN4A 5AQJA 3H3OB 2D0OA 3WQTA 2WUSA 2IVPA 3ENOA 4NO7A 3WEEA 5I9EB 4BR9A 3H46O 3EL2A 1JCGA 2P9KB 3MDQA 3B8AX 3TPQA 5KQ8A 1JCEA 2D1KA 1BG3A 4FWSA 4CD3A 1TYQA 4XH1A 5ADXA 4CZFA 3MK6A 4BC3A 2Q97A 2QWMA 3U9DA 4BR5A 3CJBA 4QS9A 1KAYA 3CJ9A 4MO4A 4B9QA 3A5LC 4FPBA 4FPAA 3BF1A 1BA1A 3FZFA 2Q36A 3VEYA 1EQYA 2IVOA 3O4WA 5CE3A 1C0FA 3QB0A 2QW9A 4PKHA 1Z05A 4CZMA 2QWRA 5AQTA 2E2PA 3HI0A 5BRHA 2CH6A 2GWJA 3RSEB 1NGFA 5LY3A 2GWKA 3QDKA 1ZBSA 3CHWA 5AZJB 2NLXA 2PBDA 4E1JA 5AQIA 3D7EO 5BN9A 4BRNA 2E8AA 4JHDB 4BRQA 4KBOA 3HZ6A 2CH5A 4YDUC 3UKRA 3FZKA 5E26A 1IJJA 4M7XA 2YHWA 4H03B 4BR4A 2QWNA 3JS6A 1RDWX 1H1VA 4FL9A 4MO5A 4F9OA 3CIPA 1OKJA 2CGJA 3I8BA 5JMVA 3H1QA 1K8KB 2VYPA 2W40A 1ATRA 2A41A 1ESVA 3ID8A 4CZJA 4IXCA 3TU5A 5ADXH 4XEIA 2YCHA 3FZHA 3LL3A 1WUAA 4MLEA 3WEEB 3VGMA 3WT0A 4EHTA 3U9ZA 1NGGA 1NGEA 1E4GT 2VWBA 4BR0A 4BR7A 1SQKA 1TYQB 2P9SA 5AQQA 1BOTO 5FPDA 2I7PA 3WQUA 4CZKA 5KPRA 3LDNA 4J8FA 2V52B 1WOQA 1BUPA 4HWIA 3LDLA 1GLBG 3DWLA 4H0YB 4DHYA 1Q18A 1QZ6A 5JICA 3D2EA 3ZX3A 1NGBA 4PL8A 4BC5A 3VESA 1BO5O 4H0XB 5TKYA 3QBWA 5BPNA 5BPLA 2P9NA 5AQNA 2YI1A 2P9IA 1XUPO 2Q0RA 1C0GA 3A0IX 3IDHA 3VPZA 4BGBA 3I33A 4CBUA 3WUHA 5AQWA 2E20A 4JD2A 1XC3A 3VGLA 3ATVA 4DCHA 3AAQA 3WXLA 1Y64A 1NWKA 3MN6A 2GELA 5BPMA 4FWKA 4IWVA 1NLVA 3DJCA 3UKRB 2QM1A 4NB4A 3MN5A 3GG4A 4FSVA 3M3ZA 3VEZA 3ENHA 1HLUA 3CQYA 1RGIA 4A61A 1GLJO 2AP1A 3R9PA 3IUCA 3ZX2A 3ZETA 2HF3A 3MCPA 2NZTA 2ASMA 4WQ4A 2V7YA 4BG9A 3KVGA 3L6QA 4CZGA 3HM8A 5AZIA 3SMPA 4BRPA 2DPNA 5AQOA 4A2AA 1GLLO 2E2NA 3LM9A 2D0PA 4C23A 4GNIA 4DB3A 2ASOA 1V4TA 4PKIA 3CJCA 4RCHA 4B1XB 1QQMA 2P9SB 4IJNA 1D4XA 3ATUA 3M1FA 3A5OC 4JAXA 3U8XA 4MLHA 1Z6RA 2ASPA 5E84A 4HTLA 4CD1A 3UKUA 1NM1A 3FFKB 4WQ5A 2IVNA 2GTDA 1BU6O 4B1ZA 3D2EB 3FZLA 3UE5A 4AM6A 1BA0A 1X3NA 2A3ZA 3A5NC 3VEXA 3BF3A 1HKBA 2CGLA 4BRGA 2P9NB 2P9IB 1HUXA 2V51B 3AY9A 4IO8A 3O5BA 4QS8A 1NGDA 4O8KA 5AQZA 3WXKA 1HX1A 2A5XA 4BGAA 4JD2B 3DXKA 4I6MA 2NRHA 1RFQA 5AQMA 5F0XA 5AQSA 1TUYA 1ZC6A 2Q2RA 2KHOA 5AQKA 3CJAA 2P9PA 1ZXOA 2FF6A 1YAGA 2QWOA 4H0TB 1TUUA 4FOEA 5EX5A 3OHRA 2VCPA 3QFPA 3IFRA 4LC9B 4JNEA 1R59O 2W41A 2A6AA 3VF4A 1MDUB 2E2OA 4WQ4C 5BRDA 5JLFA 4CZIA 3L0QA 4O5FA 4Z94A 5F1XA 1U2VA 2HOEA 3LDPA 4H5TA 5AQYA 3U4LA 3ZETB 3W0LA 4FWNA 1IG8A 4H5WA 5AZIB 3O6WA 3H6EA 1NBWA 2F9TA 2YJFA 1CZAN 3O80A 1GLFO 1SAZA 5EXWA 2FF3B 2E1ZA 3J8AA 1YXQA 4ISEA 4H5VA 1QQNA 3UKUB 2P9LA 5AQVA 4EFHA 4BROA 4FWMA 1ATSA 4IJAA 4BRHA 4K43A 4H0OA 3H45C 1BDGA 4BQLA 3FR0A 3FLCO 5AQXA 3O08A 4BRLA 1G99A 2Q0UA 4FWOA 2E88A 3CJ1A 4BC2A 2D4WA 4CZLA 1DGKN 2AA4A 3GBTA 4EIAA 5AR0A 4XH4A 5AFUA 3DXKB 1GLAG 4I6MB 5F2RA 4DQ8A 4PKGA 5KPZA 1NGIA 3LDOA 1HPMA 1MWKA 4M63C 1S3XA 1U6ZA 4WYBA 2P9PB 4H0VB 2ZF5O 2P9UB 2Q1NA 4BVOA 2A42A 2BUPA 3KHYA 1GLEG 4CBWA 3SLCA 1HJOA 4BC4A 3FGUA 4QS7A 1U2VB 4BREA 4CJ7A 2QWPA 2A40A 3GDQA 2V7ZA 3CETA 4H5RA 5AQPA 3CQXA 2CGKA 3L4IA 5FPMA 1J6ZA 2BTFA 1GLCG 1X9JA 1YVNA 3CJ7A 5AQGA 4YDUA 3SK3A 2QXLA 4AM7A 5KPTA 4EHUA 3FZMA 5ELZA 5BREA 5BR9A 3KZBA 3EO3A 4RWTA 5AQUA 2ZGYA 4H5NA 2P9LB 1LCUA 4FWLA 2QWQA 2FSJA 5AFUH 4FO0A 3ZEUA 4GY2B 2IIRA 3D2FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C95A 1VQNN 3K0SA 4DTNA 4DFJA 3TR8A 4DSKA 4OKEA 3SAHA 1RDAA 2OPRA 3LANA 4K25A 3RTVA 1HYVA 3T1HK 4BRDA 2ZJQL 1IBMK 2XY5A 4GVEA 1LWCA 4FK2A 2Z1JA 1JLCA 5J2QA 1CZ9A 5HL7L 1XHXA 2P9UA 1DT9A 2KTQA 4CJEA 3VA0A 4IEIA 3CM5A 2E5LK 2E4LA 2FLOA 3HPHA 3ULEA 2YJEA 1NJXA 4PY5A 2HHQA 3D45A 4BRKA 3E01A 3OYBA 1VRTA 4PQUA 4EAHD 2RE2A 1SL0A 4W5QA 3TTFA 4DUZK 2QKBA 3KK3A 5JLHA 3CMAN 1KAXA 4CK2A 4MFBA 2EHGA 4DQRA 5H1SQ 4B9LA 1JL1A 1GLDG 2J4RA 4JKDA 3VENA 5EY4A 1NJIO 3QFUA 3KK2A 2YHAA 5LMUK 1QZ5A 5AQLA 3OYCA 3QBXA 1YUWA 1KVCA 3ZEUB 1LV5A 3HPGA 4LF8K 4JKGA 3O1BA 4FJNA 3KK7A 1OH5A 5GAGP 1XMOK 3SNNA 3LDQA 4CI6A 4B3SK 4DU1A 1HKGA 2WC9A 2FSKA 3EN9A 5DM7L 2KQ2A 3D0PA 3RMBA 1N34K 2YHYA 3C0BA 4FXDA 4CECA 3MXMA 2E1YA 2JWKA 4DR3K 4CJUA 1T6CA 4FJLA 2Z1HA 4DR7K 3O8MA 4CHYA 5FRMA 2QWLA 3RSEA 1ZBLA 4H4MA 4CZEA 1HNXK 4H4OA 4BRIA 3ULEB 4E3SA 1KAZA 4DTXA 5DMRA 3SPZA 2VG6A 1ATNA 4B1YB 1UA1A 4CK1A 3KIOA 4B1WB 4J2AA 3AVAA 4MQ3A 3VQ6A 4W5OA 3WXJA 4FOIA 1WBDA 4K42A 4N47A 4DFMA 1NJWA 1K8KA 3WXIA 3TAQA 1VSDA 4JN4A 1UWBA 4LSNA 2D0OA 3PSIA 4M3UA 2IVPA 4JKBA 3ENOA 4NO7A 4CJKA 4J2EA 3C94A 4YORA 3ZT0A 4JKGB 1D9FA 1UOCA 5ADXA 2QWMA 3U9DA 4DR2K 4W5TA 3CJ9A 3DRPA 4B9QA 4DTUA 4FPBA 4FPAA 3BF1A 5CZ2A 3HL8A 3FZFA 1JXBA 2Q36A 3VEYA 2EX3A 3O4WA 1C0FA 1WNSA 5IWAK 3OYDA 4DS5A 3O4NA 3F73A 2UUCK 2CH6A 4JEPA 3RSEB 4FJXA 5LY3A 4CEFA 4ZHRA 2GWKA 1X9WA 3DRSA 3CPEA 3LWLA 5AQIA 3WNFA 1KVBA 3HOSA 5BN9A 2E8AA 4BRQA 3THYA 3HYFA 2X78A 4KBOA 4CJLA 4C1NK 2CH5A 1VSFA 4OPKA 3QLHA 2FBYA 3BDPA 1ILYA 3SBTA 4LD0A 2QWNA 4NYFA 3SYZA 1RDDA 1JLFA 1K8KB 2W40A 3CC4N 3KD1E 2HHHK 1ESVA 1IV0A 3QETA 3OA9A 3I0SA 1HNWK 3OYIA 4CFCA 5AJ3K 1ASVA 1WUAA 2O8FA 4BACA 1NK0A 1U49A 2HHIA 3U9ZA 1NGGA 2JGUA 1NGEA 3KLIA 3S3OA 4HUEA 4B9UA 2QTDA 3QEVA 1BOTO 3NF7A 4FZXC 3WQUA 5FRNA 1RDUA 4KKOA 4CZKA 5KPRA 2V52B 1OVQA 1BUPA 3NBPA 3NFAA 3M8PA 3D2EA 4PL8A 5SWMA 4BC5A 3THWA 3HVTA 3DLHA 3VESA 1SKRA 4H0XB 1TKZA 1DTTA 5AQNA 2P9IA 1XUPO 3A0IX 1IBLK 2F96A 1P90A 3CFRA 3WUHA 3HT3A 5AQWA 4F4KA 3HP6A 4LFBK 4JD2A 3THYB 3ZLJA 3TAPA 1NWKA 5BPMA 3U3YA 4FWKA 3HVRA 3WNHA 1HYSA 1TK8A 2QM1A 4NB4A 2OYQA 3SPYA 3M3ZA 3ITHA 3AVKA 4KHSA 1HLUA 2AJQA 2X6NA 4GKJK 3CQYA 4M41A 3QESA 5HRSA 4OPAA 4YHHK 4DSIA 4DUYK 2QXFA 3ZX2A 4CJFA 1WBBA 2NZTA 4BG9A 4DMNA 1SS6A 2O8FB 4HUFA 4BE1A 4BRPA 5AQOA 1T7PA 1GLLO 4DFKA 4GNIA 1T3VA 3CCLN 3AO4A 4KAZA 4PA1A 2KFZA 2ASPA 2XY7A 4CD1A 3ZSQA 1NOZA 1EETA 4F8RA 2HVHA 2IVNA 3DOKA 4F3OA 3EEQA 1RDBA 3D2EB 4G9ZA 4E1MA 4CGJA 1X3NA 2A3ZA 1N8RO 1S72N 2D0BA 3THWB 2PYJA 3NCIA 1WLJA 5M1FA 3BZCA 3N4PA 2WBNA 1IH7A 1T03A 1N5YA 2P9IB 1UA0A 1HUXA 4IO8A 4JK9A 4KH5A 2ZQBA 5AQZA 4FJMA 1FK9A 1HX1A 4JD2B 4IKFA 3CXCM 3OVNA 5AQMA 2PZSA 5F0XA 5AQSA 1OVYA 1TUYA 1HMVA 1BHLA 4DU3A 2Z1GA 3DLBA 5EX5A 3OHRA 2VCPA 3QFPA 4LY7A 4JNEA 1R59O 2A6AA 3LP2A 1LAVA 1N33K 1MDUB 4WQ4C 2VGNA 3RMCA 1NK4A 3U3GA 1NKBA 5LMNK 5F1XA 4DU4A 4B3TK 1U2VA 2HOEA 5AQYA 1YJ9N 5KGXA 4V19S 3RWUA 1EWRA 2HBLA 3OBYA 1BCOA 2F9TA 1GLFO 3TSUA 4Z4EA 5EXWA 4YOWA 2HMIA 2E1ZA 1IG9A 4ELTA 2YKMA 2YNGA 3QO9A 4NLBA 4OVLA 1YXQA 4CGGA 4EP5A 3PV8A 2DFHA 5C15A 1OH6A 3CC2N 2P9LA 3DI6A 4IJAA 4BRHA 2VWKA 4H0OA 3FR0A 1S6QA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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