2P9IB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp and crosslinked with gluteraldehyde
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
354
structure length
272
Chain Sequence
VVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALDDMKHLWDYTFGPLLTEPPMVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 76
structure length 272
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB02
3.30.420.520 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9iB03
1TYQB 1BA0A 1T6CA 3LDNA 1TUUA 4BRCA 4CZEA 4FWLA 1NGAA 5B8HA 5ADXA 1SAZA 3VENA 3I8BA 2VCPA 4XH1A 3A5OC 1JCEA 1ATRA 1C0FA 2E2PA 3CQYA 5AQTA 1WOQA 5AQKA 1NGCA 3HI0A 4IO8A 4BGBA 3QICA 1YXQA 1T44A 1XC3A 5AFUH 2OANA 3ZX2A 1BG3A 3C7NA 4A62A 3UB5A 4BR4A 1NM1A 4PKIA 3O08A 1DKGD 3C7NB 4HWIA 2QWQA 3VEVA 2FXUA 2QW9A 2AA4A 3ZEUB 5F1XA 2BUPA 3HSCA 2GELA 3GL1A 4CZGA 4MO5A 4BR2A 2E88A 3C0BA 3SMPA 4EAHD 3LDQA 1BDGA 3LDLA 3A5MC 3EL2A 4B1UB 4EHUA 1NGHA 4DQ8A 4AM7A 2D1KA 5AQGA 1BOTO 4H0OA 5AZJA 1JCGA 3W0LA 3GDQA 3M3ZA 2QWNA 4IXCA 2P9SA 2P9KA 3OHRA 3O8MA 5AZJB 2AP1A 4BRKA 5FPNA 2A5XA 1JCFA 1DEJA 2P9KB 2P9SB 5AQSA 3LL3A 4F9OA 2D4WA 3M6GA 2HF4A 2QWPA 1IJJA 1T6DA 5E26A 2P9LA 1NGJA 4EIAA 2P9LB 5EY4A 4A2BA 2HF3A 3QFUA 2QM1A 1GLDG 2HMPA 1NGIA 4CD3A 4H0PA 3JXUA 1HJOA 1U6ZA 1V4TA 4K42A 3QFPA 2PBDA 3D7EO 2WUSA 4CJ7A 5AQWA 3W3DA 4K41A 3FZMA 3H46O 4NO7A 3BF1A 4MO4A 5AQXA 1X9JA 3EZWA 3A0IX 4FWOA 2GWKA 2YJFA 4WQ5A 1GLAG 4NB4A 3FLCO 3EKSA 5JICA 2D0PA 4DB3A 2KHOA 3ZX3A 2E1ZA 2P9UA 3GBTA 3WXJA 4CZJA 3MN7A 5AQHA 2E2OA 4H0YB 4M63C 2P9UB 2CGJA 2QWLA 2Q0UA 4YDUA 4CI6A 1TUYA 2QXLA 4BROA 1QHAA 1Y64A 4FO0A 5BN8A 5JLHA 1U2VA 4ISGA 1KAZA 5AQRA 2VYPA 2DPNA 1DGKN 4H0XB 1U2VB 5AQPA 4H5VA 2FSKA 3ENHA 4B1ZA 4B9QA 5AZIA 3CETA 4B1XB 4FWRA 2GTDA 4BR0A 5AZIB 4JAXA 4YDUC 4JN4A 4WQ4A 3MN5A 3RSEA 4RWTA 5EXWA 3RSEB 4BC5A 3KHYA 4FWKA 3VF2A 4BRHA 3SK3A 1QQOA 1QZ6A 4JHDA 2V52B 5LJVA 1J6ZA 3CJBA 4Z94A 5ELZA 4JHDB 3I33A 3AY9A 4BVOA 3FZFA 1Z6RA 1ATSA 5EVZA 3AARA 5BREA 1GLFO 2FLOA 4FPBA 5AQJA 4WQ4C 1GLJO 1WUAA 3CIPA 2W40A 1D4XA 1G99A 4A61A 4ISFA 3VPZA 3AAQA 4H0TB 3L0QA 1X3MA 2ZF5O 4O8KA 3A8YA 1HUXA 4BRPA 2Q2RA 3ZX0A 2QWRA 4FOIA 1YVNA 5BRHA 4PKGA 1YAGA 5AQYA 3HZ6A 5F2RA 3CJ9A 1E4FT 3FE1A 1RDWX 1V4SA 3CJ7A 1BU6O 1XUPO 5AQLA 3MDQA 3BEXA 5KPTA 3H3NO 5AQOA 3R6MA 1X3NA 4BRDA 3QBWA 4MLEA 2D0OA 2QWOA 1RFQA 1IG8A 5JLFA 4WYBA 4FWNA 3H6EA 3QDKA 2P9NA 3VEYA 4PKHA 3SJHA 1KXPA 3D2EA 3WUHA 3EO3A 1HKBA 5KQ8A 2P9NB 3DWLA 3HBTA 3CJAA 3D2EB 3IFRA 4H0VB 5BRFA 5AQQA 2E2NA 2GUPA 3LDOA 2F9TA 1ZXOA 4IZ9A 3VF6A 1BO5O 2YCHA 2E20A 3O5BA 4CZIA 4EFHA 3CERA 2W41A 5E84A 3B8AX 3VEWA 1S22A 1NBWA 3L6QA 3JS6A 4BRAA 2Q1NA 3A5NC 3DAWA 4BG8A 3O80A 2ZGZA 3ENOA 4H5RA 2YJEA 3R8EA 3R9PA 4BC3A 3VGLA 3FZLA 4FSVA 1C0GA 4Y0WA 2F9WA 5LJWA 2IVOA 3VGKA 3P4IA 3ATVA 3QBXA 5CE3A 5AQMA 4BQZA 3EKUA 2YHWA 5BPMA 5FPMA 4B1WB 4PL7A 3WQTA 1GLBG 1SQKA 3KVGA 5AQUA 2FSJA 2FF3B 3ZETA 3DXKA 1ATNA 2FSNA 3AAPA 2V7ZA 3ZETB 3ULEA 4E1JA 4H03B 1MA9B 3ID8A 4ISEA 3VGMA 2I7PA 1NMDA 2P9IA 2Q97A 5AQFA 4FWMA 3J8AA 3ULEB 2BTFA 4J8FA 3TU5A 2P9IB 3FZHA 2I7NA 3O6WA 4B1VA 4JNEA 3WXIA 4IJNA 3WQUA 2NLXA 3U8XA 4O5FA 4K25A 2GWJA 2CGLA 3G25A 4BQLA 4FPAA 1QQNA 2Q0RA 4BR5A 4BG9A 4H5NA 4M7YA 3CJCA 3QMLA 2ASOA 3CHWA 5BRDA 3GE1A 3TPQA 1P8ZA 5AQIA 5JMVA 4BR9A 4BRMA 5AQZA 3U9DA 4BRQA 2E8AA 2NZTA 4L3QA 1GLLO 2HOEA 3ATUA 5BN9A 5BPNA 4EHTA 3QB0A 1LOTB 1NGFA 3FGUA 3U4LA 2EWSA 1GLCG 2GEMA 4GNIA 3HM8A 5KPZA 3O4WA 1MDUB 3WT0A 3LDPA 3EN9A 3O1WA 3IUCA 4FL9A 4C23A 4DHYA 1Q18A 3VERA 3BF3A 2PAVA 5I9EB 2ZWHA 2UYTA 3BUZB 1BWFO 3H1VX 4XH5A 3CQXA 1HLUA 1R59O 3IDHA 4CZHA 4XEIA 1YUWA 3BP8A 1GLEG 4RTFD 3H1QA 4CD1A 4DCHA 5LY3A 2V7YA 5TKYA 5FPEA 1HX1A 3CJ1A 1HPMA 3VEOA 1QQMA 4IWVA 1EQYA 5KQDA 2A42A 4BRIA 4PL8A 4QS7A 4CBUA 2CH6A 3D2FA 3M1FA 3VESA 1KAXA 3D2FB 3ZEUA 2ZGYA 3VEXA 4BC4A 4K43A 3UE5A 1ZC6A 1H1VA 1LCUA 4AM6A 5BR9A 2ITMA 3F9MA 5BPLA 4BGAA 3DXMA 2IIRA 5EOYA 3DXMB 2Q36A 3O1BA 3MN9A 4BVPA 4CBWA 1SZ2A 5AQNA 4BR7A 1NGEA 4QS8A 1NGGA 4KBOA 1NGDA 2J4RA 4BRFA 2A40A 4JD2A 4FOEA 5AFUA 2H3GX 3IMXA 1E4GT 1MWKA 4JD2B 1BUPA 2ASPA 3GG4A 4FWQA 2A3ZA 5FPDA 2ASMA 2YHYA 3VEZA 3MN6A 3FZKA 3H45C 3LM9A 4XH4A 3WXKA 3MCPA 4QS9A 4A2AA 3MK6A 3H3OB 4B1YB 2A41A 5EX5A 3SLCA 3CI5A 4H5WA 4IJAA 1OKJA 2E1YA 4H5TA 3DXKB 4BREA 1HKGA 4M7XA 3WXLA 1RGIA 3U9ZA 2QWMA 4I6MA 2P9PA 3VETA 3DJCA 3WEEA 3FFKB 4I6MB 1S3XA 2P9PB 1NWKA 1HKCA 3WEEB 4BC2A 2YHXA 3SMSA 1K8KA 2Q31A 2A6AA 1ESVA 1K8KB 5F0XA 3MMVA 3UKUA 4CZLA 2FF6A 3HTVA 4LC9B 1MWMA 2E2QA 1NGBA 3A5LC 3UKUB 5KPRA 4CZMA 1NLVA 4CBXA 1Z05A 4BRGA 3S41A 5ADXH 1KAYA 4WQ5C 3VF4A 3FR0A 2CH5A 1XQSC 1QZ5A 3L4IA 4HTLA 2V51B 2IVPA 4MLHA 2YI1A 1ZBSA 3UKRA 4GY2B 4BRLA 5AQVA 4BRNA 3LM2A 3UKRB 2CGKA 4CZFA 1CZAN 4FWPA 2NRHA 4FWSA 2IVNA 1BA1A 5AR0A 3KZBA 2VWBA 4RCHA 1TYQA 3VOVA 3GOIA 4CZKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VQ4A 1TYQB 1VQLN 3OJSA 4LH5A 5LMUK 1YIJN 4BRCA 4HCCA 1NK4A 3AV9A 1SAZA 3VENA 3I8BA 3M8QA 3ULDA 2VCPA 1IV0A 1JKHA 3K5OA 1QSLA 3OYJA 3QETA 1ZBHA 1NKEA 1WOQA 4WCEL 4CIEA 4BGBA 3LAMA 3QICA 3TABA 1T44A 2HVIA 3KTQA 3C7NA 3RMCA 3HT3A 3CPWM 4EP4A 2QA4N 2HHSA 2ZE2A 4ID5A 3OYCA 1NOYA 3ZEUB 1VQ8N 1CXUA 2GELA 2NNWA 4MO5A 4FJ9A 2NUBA 2E88A 3C0BA 2ATQA 1X9WA 4EHUA 1IH7A 2O8FB 1FJGK 3M3ZA 3KJVA 4IXCA 3O8MA 1ITGA 5AZJB 3KK1A 1CXQA 1T05A 4JK8A 4W5TA 1VRUA 5AQSA 4BE0A 2D4WA 1J5OA 4M3UA 4Z4EA 1NKBA 4ELTA 5E26A 3TAMA 3VTHA 3DLBA 3VQ6A 3M8SA 3QLHA 1SKWA 4KB0A 4KHQA 5KI6A 2HF3A 4A2BA 2QM1A 2HMPA 4CESA 4FK2A 2XY8A 3LZIA 3D7EO 2WUSA 4FLZA 3OYMA 1L3SA 3FZMA 1ZYQA 4B08A 2HHTA 3LPUA 4ILHA 2OA8A 3EYZA 3R3LA 2YJFA 1ZBUA 4CHYA 3FLCO 1N34K 1S6QA 3KLFA 5JICA 3THXB 3OBYA 1NK6A 2D0PA 3NFAA 3BZKA 2KHOA 4LF4K 3ZX3A 4IDHA 4JI5K 2P9UA 4CZJA 2E2OA 4DSIA 2R7YA 2QWLA 2CGJA 4PY5A 3SCXA 1QHAA 3CPEA 1KAZA 1HQEA 5AQRA 2DPNA 2IAJA 4KRFA 1DGKN 5AQPA 4B8CA 2FSKA 3VQDA 3OTOK 1IKWA 4B9QA 5JENA 1QS4A 1VSDA 2F8SA 3QO9A 2QKKA 3V1QA 1LWCA 3CCSN 4KH5A 4BR0A 3KKRA 4IFVA 5AZIB 4JN4A 4WQ4A 3MN5A 1O1WA 3RSEA 3O9SA 5KRSA 3QIOA 3O4QA 3KHYA 4CJPA 2V52B 2RHKA 2YHBA 4GV6A 4DV4K 5EVZA 3G4SN 4KHSA 4FJMA 3AARA 4FPBA 2FLOA 4WQ4C 3DLRA 3CIPA 2W40A 1Q86O 1TKDA 2XHBA 4DV1K 3OVNA 4ISFA 3VPZA 4DG1A 3T1HK 2KLAA 1RDDA 3ZX0A 4DFMA 4RW9A 4CK3A 4CEFA 2QWRA 1KTQA 2A1SA 4YOUA 4K8ZA 4CW7B 3E1YA 3ALYA 3U6FA 3KK2A 3QEPA 4ZTFA 4GKJK 4IG0A 3CJ9A 3QEVA 1TK0A 1RDWX 4C1NK 5JS1A 4FK0A 3CJ7A 1BU6O 3MDQA 4DSEA 4JLHA 2FC0A 4BRDA 5SWMA 3TSQA 3QBWA 2D0OA 1IG9A 4JS5A 4CJLA 4MFBA 3AA4A 2D5RA 1KLMA 3SBTA 4W5RA 3L2UA 3VEYA 4PKHA 4FJ7A 4F3TA 4KI4A 3D2EA 3O9TA 1RBSA 4IG3A 3EO3A 3V9SA 1UOCA 2HHUA 2WC9A 3CJAA 4UY8O 3DYAA 5AQQA 4ILJA 5CYMA 2E20A 3O5BA 4G1QA 4OJRA 4CZIA 4YOWA 3CERA 3QNOA 2F8TA 3VEWA 4Z4GA 3A5NC 3NGZA 3O80A 2ZGZA 5JVGL 3ENOA 2YJEA 1C0GA 4IOCL 4V19S 4X66K 4BDZA 3P4IA 2E6MA 3MWTA 5CE3A 4CGJA 5AQMA 4DR1K 2NRRA 5HRSA 2RPIA 3ZSRA 1QSSA 4NYNA 1E3MA 4B1WB 5HOOA 1IKXA 2FSJA 4CGHA 3ZETA 3VQ9A 4DTRA 4AILC 1KD1O 3AAPA 4YOVA 3QERA 1Q9YA 1EX4A 4FJJA 2C1GA 2P9IA 2G8WA 1S1UA 3G0ZA 3TU5A 1RBRA 3O6WA 4B1VA 1Z25A 2YNFA 1VQKN 4JV5K 1KFDA 2NLXA 3U8XA 3DLEA 4K25A 2G8IA 2GWJA 1QQNA 4L8RB 1NJIO 4CVNE 4M7YA 4PUOA 2ASOA 3CHWA 2O8BB 3GE1A 3QEWA 2ZJRL 4JI1K 1VSHA 4BRMA 1TK8A 1LAVA 3O3FA 3MXMA 1L3VA 2E8AA 2NZTA 2UUCK 3C6TA 4CHZA 3HK2A 1RTIA 2WONA 2PYJA 1G15A 3WXMB 4IOXA 1L3UA 3RWUA 1GLCG 1LW2A 3O4WA 1A5WA 3G71N 4ZTJA 3LDPA 2DFHA 3IUCA 3ISNC 4FL9A 4C8MA 4JKEA 4H8KA 5C2FA 1NKCA 1KSPA 3CCLN 3PO5A 1D9FA 3L2WA 3VA3A 1QQCA 2FBVA 3SQ2A 3CQXA 4CHNA 2HMIA 3OS2A 4KB1A 1YUWA 3AVKA 3BP8A 3TANA 4CD1A 1TGOA 3TR8A 2BE2A 3SUQA 2V7YA 4A57A 1VK0A 3KK3A 1CLQA 1HPMA 1BCMA 4IWVA 4CJVA 2A42A 4RW8A 3CCJN 4CJUA 4PL8A 5M1QA 2CH6A 1I94K 4NYFA 3D2FA 3THYB 1RT3A 1KAXA 5FROA 4OPJA 5DK5A 3NH0A 2ZGYA 4B9NA 5BR9A 1TAUA 3AO5A 1YITN 3F9MA 1HMVA 5HRNA 3DXMA 5EOYA 4K0KK 2Q36A 3MN9A 4CHQA 1HPZA 4O55A 3HL8A 1ZBLA 4N5SA 3TTCA 4BRFA 3S3OA 1D8YA 2H3GX 4Q0BA 3VQ7A 4E0DA 4CEEA 1REVA 1MWKA 4JD2B 1RT2A 1C1CA 3O9RA 4C1NI 4W5QA 3S5TA 2ASPA 2A3ZA 4LFCK 2YHYA 2P5GA 3MCPA 4A2AA 3S3MA 1BISA 2A41A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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