2P9KA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with atp and crosslinked with glutaraldehyde
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
411
structure length
393
Chain Sequence
GRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 126
structure length 393
sequence length 411
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9kA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9kA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9kA03
1T44A 2I7PA 3H1VX 1BA0A 5F0XA 2V51B 1EQYA 1YVNA 2UYTA 2E1ZA 3MMVA 1G99A 2W41A 1OKJA 4MO5A 4K41A 4CBWA 3I8BA 2BUPA 4I6MB 4JNEA 5EY4A 3VESA 1GLEG 2QWRA 4FWNA 2P9KB 1X3NA 4EHUA 2E2NA 2P9UA 3ZETB 5AR0A 5BRHA 5F1XA 2CGLA 1NLVA 5AQJA 3A5OC 3CHWA 4FO0A 4BGBA 2V7YA 5AZIB 2A40A 1KXPA 3BEXA 1TYQB 4CBXA 1V4SA 3HZ6A 4H5VA 4B1VA 3VOVA 3FR0A 1QQOA 1XUPO 3GDQA 4E1JA 2YHXA 3SMPA 1U6ZA 4QS7A 2OANA 1U2VB 3U9DA 1YXQA 3DXKB 3OHRA 5AQHA 5AQMA 4FWMA 4BVPA 4H0TB 1R59O 4XEIA 3EL2A 3BUZB 4WQ4C 2CH5A 3WXJA 1V4TA 4A61A 5AQSA 1H1VA 3ZEUA 3WEEA 3JXUA 3CJ9A 2GELA 2E88A 3ULEB 3WT0A 4CD3A 3WXKA 3RSEA 2CH6A 3DWLA 4HTLA 4K43A 3LM2A 4BC5A 4XH5A 3BF3A 4GY2B 2EWSA 1ZXOA 1CZAN 4BRMA 2W40A 5AQVA 3HTVA 5B8HA 5AQWA 3UKRA 4AM7A 1J6ZA 4H0VB 3U8XA 3VETA 4BR4A 3CERA 3W0LA 1QQNA 4WQ5C 1MWKA 4FSVA 4CZGA 1HUXA 1GLCG 3DJCA 5AQNA 2AA4A 2ASOA 4BR0A 2HOEA 1E4FT 4BGAA 4L3QA 1RDWX 3LDOA 1Z6RA 5FPEA 2A42A 2ASMA 4FWKA 3W3DA 3C7NA 3WQUA 2YHYA 3O1BA 4BRCA 3EN9A 2ZGZA 4BRHA 5BPNA 3A5MC 3FZLA 3CI5A 1NGFA 2P9UB 1E4GT 1X3MA 3FZFA 3LDPA 3R8EA 1NM1A 2FSNA 1LOTB 2VYPA 4ISEA 3I33A 3VEVA 4BRFA 1Q18A 3QFPA 5AQOA 1GLBG 3F9MA 3MN7A 5JLHA 2CGJA 3IMXA 3EO3A 4A2AA 2QWOA 3AY9A 1TUUA 3U9ZA 3ZX3A 3D2EA 2NRHA 2NZTA 2E2PA 4FWRA 1NGBA 4M63C 3S41A 2CGKA 5I9EB 3CQXA 4RCHA 4A2BA 3DAWA 1S22A 5AQFA 1HKGA 1TUYA 3M3ZA 4BRAA 3H45C 3ID8A 1KAYA 3O6WA 4BRKA 4WYBA 4CZHA 5FPMA 1ESVA 4H0PA 4YDUC 3VGLA 3LDQA 3KVGA 2VWBA 3GBTA 3CJAA 1HKCA 4C23A 2FXUA 3ZEUB 4BRLA 2HF3A 3WEEB 4M7YA 2Q36A 1T6CA 2QWMA 3CIPA 3QDKA 5ADXA 3B8AX 4O8KA 3RSEB 2E2OA 1JCGA 3VEXA 2GWKA 5AZJA 1QZ5A 3CJCA 3AAQA 4RWTA 2YJFA 3VEOA 3UE5A 1ATRA 1DEJA 3O1WA 4JHDA 4JAXA 5AQKA 4FWSA 4K42A 4IZ9A 1KAXA 3UKRB 3WXIA 5KPZA 4DCHA 4FWOA 2YI1A 3M6GA 2Q31A 4CZIA 2ZF5O 4DB3A 4H0XB 2E1YA 4FWPA 3FE1A 3A0IX 3BP8A 4QS9A 4QS8A 4CZKA 2DPNA 4MO4A 4B9QA 3H6EA 3KHYA 2QXLA 1LCUA 1HLUA 3C7NB 4PKHA 5BRFA 3ATVA 3GE1A 4BRGA 3MDQA 2ITMA 5BREA 4HWIA 5BR9A 4IXCA 1MWMA 3O4WA 2Q0RA 4GNIA 3M1FA 4BR2A 3O8MA 1C0GA 5TKYA 1T6DA 4H03B 5ADXH 4PL7A 2D0PA 1DGKN 1NWKA 2F9WA 2GWJA 5AFUA 3VF6A 2P9IB 3FGUA 3VEZA 2IVNA 1XQSC 5AQQA 3KZBA 3QMLA 2GUPA 2D1KA 3D2EB 3ZX2A 1D4XA 5E84A 3WQTA 2P9SA 1NGDA 4IJNA 4B1UB 5EVZA 3VGKA 4BR7A 2KHOA 4AM6A 4H5RA 2E20A 3FFKB 1BOTO 5BRDA 2FF6A 1BWFO 3ZX0A 1MA9B 3D2FA 3HBTA 1IG8A 1XC3A 4H0YB 4EHTA 2VCPA 3FZKA 3O5BA 3VF2A 4H5TA 3IDHA 3MN9A 4WQ4A 5AQLA 2FSKA 4JD2A 5KPTA 4ISGA 2GTDA 4NB4A 1P8ZA 1Z05A 5AQZA 3QB0A 2HF4A 1YAGA 1SQKA 1GLFO 4Y0WA 1IJJA 3IFRA 2P9PA 4BR5A 1QZ6A 5AQIA 1BU6O 4B1ZA 1SAZA 1YUWA 5LJVA 3QICA 2A3ZA 4JN4A 3UKUA 3FLCO 2GEMA 1NGGA 3QBXA 5AZJB 1BA1A 1S3XA 4Z94A 5ELZA 2E8AA 2V52B 3LM9A 1HPMA 1BDGA 1NGIA 3JS6A 5AFUH 4JHDB 4LC9B 2YCHA 3MN5A 5KPRA 1BO5O 1DKGD 4BC2A 2P9LA 1GLLO 2FSJA 2F9TA 5EXWA 5KQDA 1RFQA 4CI6A 4RTFD 4IJAA 1NGJA 5BPLA 1NGHA 2Q2RA 3AAPA 3SMSA 4WQ5A 2WUSA 5AQXA 2QW9A 4DHYA 2ASPA 1JCFA 1ATNA 4FPAA 1NGCA 5JLFA 3CJBA 2BTFA 2Q1NA 2YHWA 4XH1A 3DXMA 4PL8A 3FZHA 3O80A 3SLCA 3R9PA 3WUHA 2ZGYA 2A41A 3TU5A 4BC4A 2HMPA 4CD1A 2QWPA 3EKUA 3EZWA 5EX5A 4CBUA 3BF1A 5FPDA 4A62A 2P9NA 1JCEA 5LY3A 1QHAA 2IVOA 1ZBSA 4BQZA 3ENHA 5BPMA 3WXLA 3L6QA 3VEYA 2Q97A 2Q0UA 4B1YB 4EFHA 5BN8A 1K8KA 1GLJO 2FF3B 3H46O 4H0OA 1NMDA 2P9SB 4M7XA 4F9OA 3H3OB 4FOEA 1BG3A 3D2FB 4FL9A 4MLHA 3LDLA 3J8AA 3MK6A 4IO8A 3U4LA 3CJ7A 3GL1A 3O08A 4B1XB 4JD2B 1KAZA 4FPBA 4YDUA 3LDNA 1ATSA 3VEWA 2QWQA 4BR9A 3C0BA 4K25A 5AQPA 2P9PB 1SZ2A 1HKBA 3IUCA 3UKUB 1HJOA 4BROA 3HSCA 4BREA 4CZLA 2D0OA 4IWVA 4I6MA 3CQYA 4XH4A 3L0QA 3G25A 4BRQA 5AQUA 1QQMA 4BC3A 2P9KA 1Y64A 4CZJA 4BG8A 5AQRA 5AQGA 5EOYA 3ZETA 2IVPA 4MLEA 3ENOA 2QWNA 4NO7A 5FPNA 3VENA 2P9LB 4H5WA 3P4IA 3QFUA 3VPZA 5AZIA 1BUPA 1TYQA 5LJWA 3QBWA 2NLXA 1WUAA 2AP1A 4O5FA 1NGEA 3HM8A 2QWLA 3CJ1A 2QM1A 4BRNA 4CZFA 2IIRA 4BRPA 3UB5A 4ISFA 5JMVA 1GLAG 3ATUA 1U2VA 3DXKA 3DXMB 3H1QA 4KBOA 3SK3A 2A6AA 4FOIA 2FLOA 2E2QA 3CETA 2ZWHA 5AQTA 4CJ7A 4CZMA 2I7NA 3A8YA 4EAHD 2D4WA 1HX1A 2P9NB 3EKSA 4BRIA 3AARA 5JICA 4FWLA 3HI0A 3MCPA 5KQ8A 5F2RA 5E26A 1NBWA 4PKIA 3A5LC 2A5XA 3H3NO 3R6MA 3SJHA 1NGAA 1WOQA 3ULEA 4H5NA 1K8KB 2YJEA 3GG4A 3L4IA 3FZMA 4FWQA 4J8FA 4BRDA 4BVOA 2V7ZA 3LL3A 4PKGA 4B1WB 5AQYA 5BN9A 3A5NC 2P9IA 1X9JA 2J4RA 5CE3A 2H3GX 3VGMA 1GLDG 3TPQA 1MDUB 2PAVA 3VERA 4BG9A 3MN6A 4CZEA 1C0FA 4EIAA 1ZC6A 3D7EO 1RGIA 3GOIA 4BQLA 3VF4A 2PBDA 4DQ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T44A 1WAJA 3H1VX 2RE2A 4GKKK 1EQYA 1WBBA 2W42A 5SZTA 1G99A 2IDOA 2W41A 1I39A 4FCYA 3I8BA 3DLBA 2BUPA 1T05A 4M3YA 3VESA 4YOXA 1RCHA 4FWNA 4ZHRA 2P9UA 5F1XA 1NJXA 4DG1A 1RDCA 3SV3A 2DFFA 1NLVA 2OZSA 3TWHA 4B9LA 4IDKA 3ZSOA 4ZTFA 2VG7A 4BGBA 5J2MA 3CYMA 3NF7A 1KXPA 1TYQB 1WB9A 1V4SA 4H5VA 4B1VA 1O1WA 3L2RA 2JWLA 1KVCA 1X9SA 2Z1GA 3FR0A 2IS3A 3VQPA 2QI2A 1ASUA 4QS7A 1TAQA 1NJYA 3VQQA 5FRMA 2OANA 4DTRA 3THVA 4LD0A 1U4BA 3BZCA 4H0TB 4OVLA 1OH8A 1C1BA 4DTJA 3OYAA 5DK5A 1TK5A 3CM6A 4KI4A 1JLCA 4A61A 1X9MA 3JXUA 3O3GA 3ZYYX 1G15A 5J2QA 4JEPA 2E88A 3OYCA 3VQ7A 3WT0A 2YKMA 5MLCQ 4FJKA 2CH6A 3V81A 2F4VK 3L3UA 1IH7A 4AHVA 3ZT4A 4AQYK 1XNRK 4XH5A 4B3MK 4FZXC 3AO5A 2PYLA 4KO0A 4BRMA 4BACA 4FK2A 3PX0A 3HTVA 5B8HA 3UKRA 4CHOA 3JAMO 5IWAK 3KLEA 1VQ8N 1U47A 4KH5A 1N36K 4Y1CA 3LP0A 3K58A 4FJNA 3DI6A 3KIOA 4NXNK 1VQPN 3W3DA 3C7NA 3WQUA 5CHIA 3O1BA 2HHIA 3EN9A 4CJRA 4EZ9A 2UUCK 3FZLA 1KSPA 3TSPA 3TAEA 1RDAA 4JKDA 3R8EA 1NM1A 4JK7A 3NAEA 4BRFA 4IO9L 2VYPA 3VEVA 3QFPA 4PQUA 1GLBG 5JLHA 4DSFA 5CZ2A 3U9ZA 1HR0K 3D2EA 2NZTA 1XI1A 1SUQA 2CGKA 1ZBIA 5I9EB 4F2SA 3CQXA 4B8CA 4JKFA 3OYHA 1YTAA 3CCJN 5J2NA 1TUYA 3MXIA 3T3FA 3O6WA 4WYBA 3OA9A 3ZT3A 3TSQA 4M3TA 5FPMA 3ZLJA 3G10A 3PUFA 4H0PA 4OPAA 2P51A 5KRTA 2VWBA 4YHHK 3GBTA 1IBMK 2HHTA 5C42A 4CHZA 2FXUA 3ZSYA 2VGMA 1T6CA 3T1HK 4ZTJA 4CJQA 3QDKA 4O8KA 4ELTA 4N76A 3VEXA 2GWKA 3CYGA 3S3OA 3AAQA 2FBVA 4ELUA 3UE5A 3O1WA 4NLCA 4JHDA 1A5XA 5CR4A 4FWSA 3HVRA 4JKEA 4K42A 4DS4A 3TABA 3RMBA 1J5EK 1KAXA 3AO2A 2KFZA 4FWOA 1RBSA 4BE1A 1RTDA 2Q31A 4YORA 2ZF5O 4DB3A 2VG5A 2E1YA 3ID6A 1NK6A 1QVFM 5TKWA 3SYZA 3FE1A 3A0IX 4QS9A 4QS8A 4CZKA 4B9NA 4NXMK 4B9QA 1SKSA 4PKHA 2YNGA 4CHQA 2NUBA 4CGIA 1EX4A 3MDQA 2ITMA 3MX2A 3C6AA 1RBVA 1ZBFA 4HWIA 5CYMA 1KCFA 1Q86O 4FM1A 2Q0RA 2WC9A 4GNIA 2LSNA 2ATQA 3O8MA 5TKYA 1T6DA 4H03B 3AVIA 1NWKA 1QSLA 2WTUA 5AFUA 4J2EA 5A2QO 3RR7A 3AVLA 3KK3A 3I8DA 4CIFA 3I56N 3RRGA 4N56A 1C0TA 3V4IA 3QMLA 2D1KA 2PYJA 5E84A 5M1FA 3LP1A 3OYNA 4OKEA 4RW6A 3PX4A 1JL1A 4DV2K 5EVZA 3CCEN 1HNWK 3VA3A 1BOTO 4NCAA 2FF6A 3ZX0A 5DMRA 1XC3A 2UXBK 4C8NA 3HL8A 1WBDA 4JRPA 1K8AO 4JI1K 4DSIA 5SWMA 5AQLA 4B9TA 3MX5A 2FSKA 2RPIA 3ZCMA 3QB0A 4O0IA 1YAGA 4KHQA 3IFRA 1S6PA 1N6QA 3DLEA 5AQIA 3NMUA 4OJRA 5LJVA 1ILYA 2A3ZA 4H4MA 1N5YA 1W7AA 3QBXA 1QSSA 1BA1A 1S3XA 4FZYA 2NRZA 1D9DA 2O4IA 3JS6A 1C0UA 3O9TA 3AA5X 3OYMA 4DTPA 2IAJA 4W5OA 3ZSZA 4BC2A 1GLLO 5EXWA 3SUQA 5KQDA 1RFQA 3THWB 1NGJA 5BPLA 1NGHA 3AAPA 3SMSA 4WQ5A 5I3UA 2WUSA 5CY4A 3L2VA 2QW9A 2YX6A 4DHYA 2B5JA 2OTLN 1JCFA 3AVKA 1ATNA 1A5WA 3TAFA 4FPAA 5JLFA 2BTFA 2YHWA 3DXMA 3HOSA 3O80A 4CK3A 3SLCA 3R9PA 3RMAA 3K5LA 2ZGYA 3G71N 3J81O 4BC4A 2HMPA 3EZWA 5EX5A 1VHXA 3THXA 3OJUA 2P9NA 1JCEA 3Q7CA 5LY3A 4JI3K 1QHAA 1EO1A 3FFIA 1IBKK 1ZBSA 1B9DA 2BDPA 3ENHA 2XY6A 3WXLA 4DQSA 4WF9L 1VSMA 1IKXA 5BN8A 2Q97A 2Q0UA 3V9WA 5M1KA 4MFBA 3ZSXA 1K8KA 3L8BA 3D0PA 2NRRA 3E1YA 3RWUA 3LP3A 4Z4GA 1BG3A 1LWEA 3AVAA 4E19A 2F8SA 1RDBA 3D2FB 4FL9A 3KKSA 4DU1A 5JVGL 4DTUA 2QKKA 1RTHA 1XNQK 3LDLA 3J8AA 3R3LA 3EE9A 3VQ4A 4IO8A 5LL6Z 4GKJK 2O8DA 3U4LA 4DQQA 1XHXA 1CXUA 5BR8K 3GL1A 1U49A 1TK0A 1Y97A 4JD2B 2VWJA 1Q7YO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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