2P9LB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
203
structure length
201
Chain Sequence
IQAVLTLYAQGLGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 54
structure length 201
sequence length 203
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9lB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9lB02
3UKRA 3OHRA 1LCUA 5ADXH 4BC4A 1ATSA 1MWMA 3ENOA 4FWOA 5F0XA 3A0IX 5AQZA 5AQNA 4NO7A 4K43A 4O8KA 1TUYA 2P9LA 5AZIA 3FZLA 3QBWA 5BN9A 4YDUA 4I6MB 3D2EB 2VYPA 3HI0A 4FO0A 4WYBA 2HOEA 3I8BA 4BRAA 1HJOA 2CGKA 4LC9B 3VPZA 1C0GA 5EOYA 4BG9A 5AQTA 4BR7A 3JXUA 3WXJA 4BRMA 3D7EO 4JNEA 5AQKA 2V7YA 3UKUA 3CJAA 4FPAA 3A5LC 4I6MA 3S41A 4BRCA 2E20A 1ZC6A 4CD3A 5AQRA 2IIRA 5BPLA 3O8MA 3FZMA 3VEXA 3C7NB 3CQXA 5TKYA 3QMLA 1S3XA 3GOIA 3H45C 5AQSA 1KAYA 4BRKA 4BRHA 3M1FA 3O5BA 3ZEUB 3TU5A 3QB0A 4FWRA 4ISEA 2FSKA 3C0BA 5AQUA 3VGKA 2QWQA 2EWSA 3C7NA 4FWNA 2P9KB 1BDGA 4HTLA 5FPNA 3R8EA 5AZJA 1XC3A 1T6CA 2A3ZA 4M7XA 3VGLA 1T44A 3WT0A 3RSEB 3LDLA 1JCEA 3ZEUA 1NGAA 3IFRA 1ESVA 3R9PA 3VERA 1QZ5A 5CE3A 1ZBSA 2P9KA 3QBXA 4H5WA 4BVPA 1MDUB 2OANA 4XH5A 2Q31A 2GUPA 3RSEA 4FWPA 1GLDG 3LDQA 3A5NC 4A61A 4FOIA 3M6GA 3CQYA 4BRGA 3MCPA 3JS6A 2I7PA 3AY9A 1NGFA 3MN7A 3FZKA 3EL2A 2P9SB 4HWIA 2V51B 3MK6A 3VF4A 3GL1A 1S22A 5LJVA 3O6WA 2P9IA 4CBUA 2IVNA 1NGDA 2FXUA 1SZ2A 4IJAA 3WEEB 4IWVA 4NB4A 4PL7A 2YHXA 3LM2A 4WQ5C 1X9JA 1TYQA 2P9SA 4BROA 3O1WA 4EFHA 4H0YB 2CGJA 1HX1A 2YJFA 1WOQA 4FSVA 3UKRB 5BRDA 1YVNA 2VWBA 4BRPA 4K25A 3DWLA 1NGCA 4BRNA 1E4FT 1GLLO 4IZ9A 2A40A 2FLOA 3ZX2A 1H1VA 4EHTA 3M3ZA 2GWKA 4H03B 5F2RA 5AZIB 2F9TA 2FF3B 3WUHA 3LL3A 1WUAA 5BR9A 1NGGA 3ZX0A 1P8ZA 3DXKB 4AM7A 3VEZA 5AFUH 1BOTO 5ADXA 1K8KB 3MMVA 3QFUA 4IXCA 3MN9A 5AQGA 5BPMA 3LDNA 5BPNA 1GLAG 3UKUB 3CJ1A 1CZAN 4CZIA 3HSCA 2E88A 1BG3A 5EX5A 1MA9B 3GG4A 1XUPO 3HTVA 4C23A 3DAWA 3IDHA 3EKUA 3DXKA 4H5NA 3ZX3A 5F1XA 1HKCA 1K8KA 3O80A 4CZMA 3A8YA 2QWMA 3DJCA 3VENA 4FOEA 4H0OA 1NLVA 3QICA 5JICA 3ATVA 3A5MC 4CJ7A 3CHWA 2IVPA 3WXIA 2FSNA 4GY2B 2E1ZA 3WQTA 4CD1A 1U2VB 5AZJB 2A5XA 5ELZA 3MN5A 5AQIA 3AAQA 4CBWA 4EAHD 2D0PA 3CJ7A 3BF1A 4K42A 4BREA 5B8HA 3LM9A 4FWLA 5FPMA 2DPNA 4DQ8A 2V52B 4MLHA 1IG8A 4JD2A 1GLBG 2QWRA 4PKGA 1BWFO 1U2VA 2J4RA 3VGMA 3EZWA 1V4TA 3AAPA 1RDWX 3UB5A 2P9PB 2WUSA 2E2NA 3WXLA 4K41A 5I9EB 5EXWA 4B1WB 3W3DA 3D2FB 3LDPA 3O08A 3VESA 1IJJA 1YAGA 5JMVA 2E1YA 3FFKB 1MWKA 4FPBA 3QFPA 3O4WA 2IVOA 4CZGA 2P9PA 4JHDA 2ZGZA 4JN4A 1Q18A 4CZLA 4Z94A 3H1VX 1QQMA 4BGAA 2P9IB 4FWSA 4B9QA 5KQ8A 2KHOA 5AQYA 3D2FA 2CGLA 2HMPA 4H5TA 3VOVA 3TPQA 4H5VA 4WQ4C 4B1VA 3GE1A 2YHYA 1TYQB 1NMDA 3BEXA 2QM1A 3KHYA 4J8FA 3SMPA 3ULEA 4EIAA 1ATRA 2P9NA 1XQSC 1JCFA 3IMXA 1GLEG 3CJBA 4FWMA 2Q2RA 4WQ5A 4A2AA 4BRIA 1KAZA 4RWTA 2Q1NA 2Q97A 3CERA 1NGEA 4BRDA 4L3QA 2YCHA 2A6AA 4M7YA 4BR0A 4IO8A 4A62A 5AQLA 4KBOA 1EQYA 3GBTA 4BR9A 4DB3A 3L4IA 3VF2A 3ENHA 4BVOA 5BN8A 2ZWHA 3U8XA 1Y64A 1T6DA 3BUZB 3VEYA 3SMSA 3VEOA 3BP8A 5EVZA 4B1XB 2QWOA 3J8AA 1HLUA 1BA0A 3MN6A 3CJ9A 2GWJA 4PKIA 2W41A 2HF4A 4XH1A 3HM8A 4CZEA 4BR4A 2A42A 1X3NA 3O1BA 2AP1A 2E8AA 5AFUA 1ZXOA 5LY3A 4BC3A 1GLCG 3VETA 4CZFA 4E1JA 4BG8A 3SLCA 4GNIA 1YXQA 4H0TB 2H3GX 2Q36A 1NGHA 5JLHA 4ISFA 3B8AX 5AQOA 1NM1A 4ISGA 3MDQA 2Q0RA 4H0PA 5AR0A 4H0VB 4O5FA 4PKHA 4BGBA 4FL9A 1NBWA 4XH4A 4JD2B 5AQWA 5BREA 5KPRA 5AQMA 3FGUA 3W0LA 4XEIA 2CH6A 2E2QA 3R6MA 5E26A 1JCGA 1NGBA 2Q0UA 4YDUC 3H1QA 4M63C 2YHWA 2PAVA 4MO5A 4BQLA 5EY4A 1HKGA 3I33A 1QQOA 3D2EA 3KVGA 1R59O 4FWQA 3U9DA 3EO3A 1Z05A 2QWNA 2D4WA 3H6EA 3FZHA 4BR5A 4DHYA 2HF3A 1J6ZA 2QW9A 4JHDB 4QS9A 5JLFA 1BUPA 2PBDA 2ITMA 2GTDA 5BRFA 3H3NO 3VF6A 2NZTA 3VEVA 3FE1A 4Y0WA 1U6ZA 1RGIA 1RFQA 5E84A 1KAXA 5FPEA 2ASPA 3SJHA 4BC2A 4BR2A 4EHUA 2VCPA 1NWKA 4RTFD 3HBTA 2AA4A 2E2OA 5KPTA 3QDKA 1D4XA 2GELA 4WQ4A 5AQXA 2P9NB 3ULEB 4BQZA 2UYTA 4BRLA 2E2PA 4H0XB 1HPMA 4BRFA 3ZETB 5AQHA 1SAZA 4JAXA 3CJCA 4BRQA 2V7ZA 3CI5A 5KQDA 5AQQA 4MLEA 4CBXA 1DKGD 2ZF5O 1LOTB 4RCHA 3FLCO 3GDQA 3ID8A 5AQJA 1BA1A 4FWKA 1OKJA 3A5OC 3BF3A 5AQVA 4B1UB 3KZBA 1HUXA 3F9MA 2ZGYA 3ZETA 2FF6A 4PL8A 3CETA 2D0OA 1G99A 4CZHA 2QWPA 2ASOA 2QWLA 3CIPA 1E4GT 5FPDA 4F9OA 5AQPA 1GLFO 2D1KA 1X3MA 2NRHA 2P9UB 3L6QA 1DGKN 4IJNA 2GEMA 1DEJA 3L0QA 2FSJA 4CZKA 3IUCA 3LDOA 2CH5A 3H3OB 4B1ZA 3UE5A 4MO4A 1NGJA 3FZFA 4H5RA 5AQFA 3U9ZA 4CI6A 4CZJA 3FR0A 3U4LA 2NLXA 1QQNA 3ATUA 3G25A 1YUWA 4B1YB 3WQUA 2BUPA 2F9WA 2P9UA 4AM6A 1C0FA 1Z6RA 5KPZA 1SQKA 5LJWA 1QZ6A 2QXLA 1QHAA 4QS7A 4DCHA 3SK3A 1KXPA 2A41A 3DXMB 3EKSA 1BU6O 1TUUA 2BTFA 3EN9A 1BO5O 3AARA 2ASMA 3H46O 4BC5A 2W40A 3HZ6A 2YI1A 3VEWA 3WXKA 1HKBA 3WEEA 1GLJO 3P4IA 4QS8A 2YJEA 1ATNA 2I7NA 5BRHA 2P9LB 1V4SA 1NGIA 3DXMA 4A2BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CGHA 3TAPA 4BC4A 3V9UA 2O8CB 5D3GA 4JI5K 2YX6A 4JI4K 2D0CA 3V6DA 2O8EB 4NO7A 4K43A 3VQ6A 4DFMA 2P9LA 3FZLA 3AVAA 3TSQA 3D2EB 1Q9YA 1S9EA 2XO7A 4BRAA 1RDAA 1B9DA 4LC9B 4PA1A 4G1QA 1RILA 4BRMA 3ID6A 1SL1A 2NRRA 4Q5VA 4I6MA 3RWUA 2PYLA 4B3MK 5BPLA 4CGIA 3FZMA 1NG9A 2ZJPL 1DTTA 3PUFA 1S3XA 3TANA 5SWMA 3AVIA 3L2VA 1IG9A 5M1OA 4BRKA 4BRHA 4B8AB 1VQ5N 4LF7K 4YFUA 3HPHA 4NYNA 2NNWA 2EWSA 3OYGA 4FWNA 5AZJA 4WFBL 5FPNA 3M8SA 4DU3A 1XC3A 2OPSA 1T6CA 3OYCA 3LDLA 1JCEA 3S3MA 3ZEUA 5FRMA 1FKOA 3HP6A 2KFZA 2EX3A 4DSJA 1ZBSA 2P9KA 1L3VA 1MDUB 1VSJA 4DF8A 2O8DB 1XMQK 1X9MA 3MWPA 2NRVA 4EP4A 3A5NC 1JL1A 4FOIA 3CQYA 2I7PA 3SUNA 1D8YA 4UY8O 3TAQA 5DK5A 4DV6K 3OS2A 5H1SQ 5LMNK 4HWIA 3VF4A 4M3TA 4JKHA 5LJVA 3HK2A 2KZZA 4CBUA 2FXUA 1SZ2A 1ZBIA 4Z4IA 3F9KA 3C6AA 1NJYA 4NB4A 4PL7A 2YHXA 2QEXN 4DU1A 3LM2A 2HMIA 4M3RA 3PX0A 1F21A 2E4LA 1MU2A 2CGJA 2OPRA 1S1UA 1WOQA 4FSVA 3UKRB 3KLIA 3N4QA 3LAKA 1YTAA 4YOWA 4BRNA 2YKNA 1CZ9A 1FW6A 1BIZA 4CEDA 4AHRA 4KB0A 3BZKA 5HBMA 3WUHA 4F3TA 3K2PA 4O5BA 1RBRA 4DQSA 3MWTA 5DMRA 3VEZA 5AFUH 5J1EA 2PZSA 1G15A 5JENA 3P38A 3MMVA 4X66K 2QKKA 1REVA 5BPNA 4QAGA 1GLAG 3QIPA 1CZAN 3HSCA 4KFBA 2E88A 2JWKA 4KHPK 4CVNE 3AVBA 3DAWA 1GOCA 3DXKA 1HKCA 1WSHA 3K59A 4CZMA 3E9OA 3A8YA 1HQUA 4LF6K 4H0OA 4TSXA 3PV8A 1J53A 4MDBA 5JICA 3ATVA 4MQ3A 2HSTA 3NGZA 2FSNA 1ZBLA 1S1XA 3BDPA 5AQIA 4CBWA 1DT9A 2VGNA 4BREA 3BF1A 4DWIA 3AVFA 3CC4N 5FPMA 2HHTA 2DPNA 4FJ5A 3QEVA 4C8KA 1SKRA 3U3YA 2QWRA 3WNFA 2J4RA 3AAPA 1B9FA 2OPQA 2OPPA 2HBKA 4LFBK 1ITGA 4EZ6A 4GW6A 4H4MA 1TKDA 2E2NA 2YV0X 4C1NK 1EETA 3ZSOA 4A5AA 3TABA 3S3OA 1TK5A 4KHUA 3AVNA 2UXCK 3L3UA 4DQQA 3B6PA 4B9VA 3LDPA 3VQPA 4J2AA 2XY7A 4B9MA 4JI2K 4NYFA 4JHDA 2ZGZA 3VQBA 3CCUN 2XY6A 2YNIA 1Q18A 1SL0A 3IRXA 4IFEA 4LH5A 4B9QA 5KQ8A 4DR2K 1JLQA 3TPQA 3LWMA 1BISA 3LZJA 3SMPA 1TYQB 1NMDA 4J8FA 3ULEA 5KGXA 4OPJA 1GLEG 1BHLA 3ITHA 3PY8A 1BGXT 2NRZA 3T19A 1SS6A 4N5SA 4M7YA 3THWA 4IO9L 3BGRA 1EQYA 3OYIA 4AHVA 1LV5A 1NMNA 3L4IA 4G9ZA 3ENHA 1Y64A 1KVBA 3V1QA 3BUZB 3VEYA 1C1CA 4CHQA 1JLGA 3OJSA 4HUEA 1ZBUA 2Z1JA 2NRXA 5EVZA 3KLFA 1N34K 1HLUA 3RMAA 1BA0A 4CJWA 2QKBA 3MN6A 5BR8K 3CJ9A 3ALYA 3OS0A 3AA2A 4LSLA 1BL3A 3AVCA 4XH1A 2RPIA 1WAFA 4CJ4A 4RW7A 1EP4A 4KTWA 3TTFA 4CZEA 4Z4FA 3A2FA 4CECA 2A42A 4CK1A 1IKXA 1HYVA 3MEGA 4BEBA 3ZT2A 2E8AA 1ZXOA 4BC3A 3VETA 4CJEA 4CZFA 4YOXA 4BG8A 4HUGA 4OO1J 3HL8A 3I0RA 1YXQA 4H0TB 1XC9A 1HNXK 1WN7A 3WNHA 1A5VA 1NGHA 3NH1A 3B8AX 1Q86O 1FXXA 1SKWA 3P31A 4Y1DA 3O3FA 5AQOA 4FLUA 4H0PA 2Y1IA 1UOCA 4JK8A 3K58A 3E01A 4FL9A 3T7ZA 4CF8A 4NXMK 3O4QA 1W97L 2DTUA 1S6QA 4I9LA 3E9LA 1C0MA 1P90A 3H1QA 4M63C 3L2RA 4FJXA 2YHWA 2PAVA 4MO5A 4ILGB 4BQLA 4HCBA 5EY4A 1HKGA 3DLHA 5C0YA 3KD5E 1U04A 3FZHA 1RTHA 5SZTA 1D9DA 4DSIA 4N76A 4CF9A 2HHWA 5JLFA 1WBDA 1QVFM 2ITMA 1NK0A 2Z1HA 5GIOA 2RF2A 3CCJN 3HVTA 1C0UA 1RFQA 5K14A 5FPEA 2D5RA 3SJHA 1Q82O 3KK2A 1NWKA 4RTFD 1YVUA 3AVMA 3KWGA 3QDKA 1D4XA 2GELA 3TAFA 1W9HA 2UYTA 4JRQA 3VQ5A 4DTNA 4JAXA 4BRQA 3CI5A 3C6HA 5HRPA 3KK7A 3THXA 2ZF5O 1T05A 1HPZA 4RCHA 1SKSA 4ID5A 1VRTA 4ILHA 1BA1A 4FWKA 2UUAK 3TTDA 3ZETA 1RT4A 3CETA 2UXBK 1N8RO 1G99A 4DQPA 1S1VA 1T3VA 4KI4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4PWD A;  2GWJ A;  3SAG A;  4FVM A;  4FK0 A;  4GKK K;  4FJ9 A;  3MX5 A;  1JLE A;  3ZT1 A;  2VGM A;  1GOB A;  4MDA A;  3O1B A;  4O44 A;  2AP1 A;  5C12 A;  4B3T K;  5AFU A;  4LF9 K;  2KLA A;  5LY3 A;  1YF5 L;  3BY5 A;  4GNI A;  3T3F A;  4F4K A;  2HNZ A;  3L2Q A;  1W7A A;  2Q36 A;  2A1R A;  3OW2 M;  3NF8 A;  4B3S K;  3KKR A;  3O9Q A;  3MDQ A;  5J2P A;  3SBT A;  5AR0 A;  3ZSQ A;  2B4J A;  4E3S A;  4WF9 L;  4XH4 A;  3TAM A;  2RN2 A;  4PQU A;  5BRE A;  5KPR A;  5AQM A;  2VWJ A;  3FGU A;  2VQE K;  3W0L A;  1EWQ A;  4AHU A;  2CH6 A;  2E2Q A;  5E26 A;  3OYJ A;  3MX2 A;  4E7J A;  5KI6 A;  4E0D A;  3KVG A;  4FWQ A;  4ELU A;  4EP5 A;  3HVR A;  3H6E A;  2HF3 A;  4JI1 K;  5GIN A;  1SUQ A;  3L8B A;  2QW9 A;  3CCR N;  2Q3S A;  1K6Y A;  3OBW A;  4C8M A;  4B9T A;  2IOC A;  3ZLJ A;  4IFV A;  1BUP A;  4OPK A;  3H3N O;  3VF6 A;  2PFU A;  1U6Z A;  3D45 A;  1RGI A;  5E84 A;  1KAX A;  3C6T A;  1NKB A;  3TSU A;  4BC2 A;  4EHU A;  5GAD P;  1TK0 A;  1ILY A;  2E2O A;  4CGF A;  1K8A O;  3C65 A;  2P9N B;  1KVA A;  2O8F B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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