2P9LB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex
Total Genus 54
2040608010012014016018001020304050
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
203
structure length
201
Chain Sequence
IQAVLTLYAQGLGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKI
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS2 (164-169)TIV2 (169-172)3H1 (176-178)TIV3 (170-173)AH2 (186-200)S3 (180-182)S1 (154-159)AH1 (141-149)TIV1 (160-163)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
total genus 54
structure length 201
sequence length 203
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9lB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9lB02
2P9SB 3JXUA 3QICA 1YAGA 3CJBA 2P9LA 2NZTA 4QS7A 2YI1A 4HWIA 1NM1A 1U6ZA 4H0XB 3EKUA 3D7EO 2E2NA 3QBXA 3C7NA 4BRLA 5LY3A 1ATSA 3MN6A 4PKIA 4BRDA 5AQUA 5AZIA 1BWFO 1RFQA 2D0PA 2BUPA 5AQKA 3TPQA 1HKBA 1Y64A 2HF3A 5BRDA 4BRMA 3VF2A 5FPMA 3SMSA 3CIPA 3U9DA 4BC2A 3U9ZA 5E84A 4CZFA 4FO0A 1IG8A 2YJFA 1ZC6A 5AQYA 3KVGA 1R59O 3VF4A 3LDQA 1ZBSA 1D4XA 5AR0A 2F9TA 4I6MB 4BR4A 4CZKA 3H3OB 3GE1A 1HKGA 1QHAA 4FWQA 3D2EB 4M7XA 2ZGZA 1XQSC 5AQNA 3ZX0A 2ZWHA 3LDLA 2I7NA 4WQ4C 5ADXH 2YHXA 3MN9A 3CETA 3WXJA 1LCUA 5ADXA 4B9QA 1C0GA 2CH6A 2GWJA 4C23A 4CI6A 4FWMA 4IJAA 4J8FA 4H0TB 4K43A 1ESVA 3U4LA 3O4WA 1TUUA 3O1BA 1BU6O 4MO4A 4QS8A 4BC3A 3WEEB 1Z6RA 4WQ4A 1BA1A 3BP8A 2E1ZA 4DHYA 4DQ8A 1TUYA 4BG8A 4FL9A 2WUSA 4WQ5C 3VEWA 1S3XA 4EFHA 3BEXA 2Q31A 3VOVA 2FXUA 1X3MA 1QZ6A 4IWVA 4XH1A 2P9IB 3EZWA 2QXLA 4JNEA 5BRHA 3QDKA 3U8XA 3WXLA 2FLOA 4BR7A 2CGLA 3VERA 5LJWA 5AQOA 4BC4A 2E8AA 3VESA 5E26A 3W0LA 3VF6A 2A6AA 3WXKA 3VEVA 4NB4A 3WUHA 4ISEA 3CI5A 2FF3B 1BOTO 1ZXOA 2GTDA 5AQJA 4CBXA 5BREA 2A3ZA 3FZLA 5AQSA 2YHYA 3IFRA 2E88A 3HSCA 3QFPA 2ITMA 5F1XA 2E1YA 5FPDA 4BG9A 4FSVA 3DJCA 3WQTA 1YVNA 5EVZA 5BRFA 2YHWA 3CJ7A 3DXKB 3M3ZA 3EO3A 1HJOA 2D1KA 5AZJB 4F9OA 4Z94A 1OKJA 5BN8A 4GY2B 2E2PA 2FSJA 4AM7A 3H6EA 5BPLA 4CZIA 4EIAA 4HTLA 1NMDA 3BF1A 4BR2A 4XH4A 3O6WA 3VENA 2QW9A 4H03B 5AQMA 4CBWA 4MLHA 2CGKA 3A5OC 3C7NB 3VEYA 1HX1A 1V4TA 3UE5A 1T44A 2QM1A 3A5MC 1BUPA 5F0XA 2W41A 4CJ7A 3O5BA 5AZIB 3VGKA 4FWOA 3CHWA 2YCHA 1C0FA 2ASOA 4FWPA 2A42A 2QWMA 5BPMA 4DCHA 1GLFO 4RWTA 3AY9A 3EN9A 4CBUA 1BO5O 2PAVA 2I7PA 4CZLA 3ULEA 5KQ8A 3MDQA 1NWKA 4RCHA 4EHTA 2P9KA 1MWKA 1NGJA 5AQXA 2BTFA 4H0OA 1WOQA 4BVPA 3ZETB 4CZJA 1J6ZA 5KPTA 5B8HA 4BR9A 3C0BA 4WYBA 3QMLA 3B8AX 2Q1NA 3DXMB 3ID8A 2AP1A 3QFUA 3VEXA 1E4FT 3O08A 2VYPA 5BN9A 3MMVA 1ATRA 2W40A 3HBTA 4CZHA 2A5XA 2VWBA 3ZETA 1GLLO 1NBWA 5AQVA 3WQUA 4BQZA 3ZX3A 2HOEA 4B1ZA 2H3GX 2A40A 3MN7A 4H5RA 3LM2A 1SAZA 1WUAA 3UKUA 5EXWA 2GUPA 1KAZA 3DXMA 4CD3A 3WXIA 1NGAA 1P8ZA 3LDPA 2PBDA 4O5FA 2A41A 2FSNA 5AQZA 4ISGA 3SMPA 4CZGA 4PL8A 2ZGYA 2GEMA 5EOYA 3FR0A 1K8KA 4BC5A 3UB5A 3LDOA 4BR0A 3LL3A 3FFKB 3VETA 4YDUC 4EAHD 3G25A 3R9PA 5BPNA 5JLFA 2P9NB 4PKHA 5TKYA 5JMVA 1HUXA 2ASPA 4BRIA 1NGFA 1BA0A 2QWLA 2P9UA 1H1VA 4A2AA 1MDUB 3KHYA 4FOEA 3QBWA 1EQYA 2P9NA 3L0QA 3FZFA 4H5WA 3RSEB 2KHOA 4YDUA 1YXQA 2UYTA 2E2OA 1TYQB 2NRHA 5AFUH 4A2BA 4BREA 4IZ9A 3I33A 1Z05A 2AA4A 4BRGA 5AFUA 3O80A 5AQFA 4NO7A 1GLCG 1SZ2A 1XUPO 4FOIA 5AQWA 2FSKA 3RSEA 4BRKA 3GOIA 4H5VA 3ZEUA 3ATUA 4BQLA 4BRFA 1TYQA 1DEJA 1QQOA 1XC3A 3CJ9A 2IVPA 1KAYA 4H5NA 4BRQA 2ASMA 5EX5A 4AM6A 3AAQA 3W3DA 5BR9A 5JLHA 2QWOA 2EWSA 4ISFA 1MWMA 3MK6A 2GELA 4JN4A 3LDNA 2V52B 1NGCA 1HPMA 2QWNA 4BGBA 3HZ6A 3ULEB 2CGJA 1HLUA 2P9KB 3H1QA 1MA9B 4EHUA 3L4IA 3ENOA 3IUCA 4FWKA 2V7ZA 4H0YB 3M1FA 5JICA 2Q97A 4E1JA 5F2RA 3CJAA 3FLCO 5I9EB 2FF6A 1YUWA 4DB3A 4BGAA 3DAWA 2IVOA 3H45C 3L6QA 3DWLA 5AQHA 1X3NA 5EY4A 5AQPA 3VGLA 2QWRA 3VPZA 3CQYA 1E4GT 3QB0A 1U2VA 4Y0WA 5ELZA 2HF4A 2ZF5O 4BRCA 3UKUB 1GLEG 3WT0A 4JD2A 2Q0RA 2IIRA 3F9MA 4B1YB 2V51B 4BRAA 5KPZA 4JHDA 5AQGA 2P9SA 4IXCA 3SJHA 4B1UB 2Q36A 4B1WB 3IDHA 3R6MA 4KBOA 1S22A 3FE1A 3UKRB 2OANA 4K41A 3A5LC 1X9JA 1K8KB 4K42A 3GBTA 4O8KA 4B1XB 4H0PA 3P4IA 1DGKN 5FPEA 1RGIA 1JCEA 1JCGA 4BROA 4FWRA 3KZBA 3MCPA 3UKRA 3ZX2A 3BUZB 4RTFD 2D4WA 3BF3A 2P9UB 1NGGA 2D0OA 4BR5A 1T6DA 1QQMA 1RDWX 2CH5A 4XH5A 4LC9B 4FWNA 3ATVA 3HI0A 5AQTA 2DPNA 3VEZA 4BRHA 1IJJA 5LJVA 3R8EA 4I6MA 1NLVA 1CZAN 2QWPA 3FZMA 5CE3A 1NGDA 3S41A 1GLDG 4H5TA 4L3QA 1DKGD 4A61A 2GWKA 4CZEA 3D2EA 4FPBA 3HM8A 1GLJO 4IO8A 2VCPA 5AQLA 4MO5A 4MLEA 3A0IX 1JCFA 1GLAG 3H3NO 1SQKA 3H1VX 1BDGA 2HMPA 3A5NC 3ZEUB 2E2QA 2QWQA 4CD1A 3VGMA 4FPAA 3I8BA 3CJCA 4FWSA 3A8YA 4M7YA 4BVOA 3O1WA 3FGUA 4B1VA 5KQDA 3O8MA 3WEEA 3EKSA 4FWLA 1NGEA 4M63C 2Q2RA 3M6GA 1QZ5A 3CERA 5AQRA 3D2FB 5AQIA 3EL2A 4A62A 4WQ5A 3HTVA 5KPRA 1HKCA 3CQXA 3VEOA 4BRNA 1LOTB 3MN5A 2P9IA 1KXPA 1ATNA 5FPNA 3AAPA 1KAXA 4H0VB 3SLCA 3FZKA 2V7YA 3D2FA 3GG4A 3GL1A 4CZMA 4QS9A 2P9PB 3J8AA 4GNIA 5AQQA 4PL7A 3FZHA 2F9WA 1G99A 2NLXA 3H46O 4JAXA 4BRPA 3LM9A 3ENHA 3GDQA 1NGIA 2IVNA 1NGHA 2E20A 2J4RA 2P9LB 1BG3A 2Q0UA 3OHRA 1Q18A 4K25A 3IMXA 1T6CA 3JS6A 2P9PA 1NGBA 1U2VB 2YJEA 3DXKA 3TU5A 1QQNA 3CJ1A 5AZJA 3SK3A 4JD2B 1V4SA 4IJNA 4XEIA 3AARA 4PKGA 4JHDB 1GLBG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HSTA 5KRTA 4DFPA 4OPAA 2HHQA 4CIGA 1RDBA 1VQ7N 1HYZA 3OTOK 4H0XB 3D7EO 3CCSN 2E2NA 4DQPA 5BR8K 2PY5A 3THWA 2Z1GA 3L2RA 1NNEA 1X9SA 3S3MA 3P1GA 3SUPA 4DTMA 1Z26A 1Q7YO 5AQKA 2NRRA 2O8CB 3E9LA 4WF9L 2QA4N 1S1XA 1YHQN 4GVMA 1VAZA 4DTJA 3AO1A 4XJXA 1RDAA 4BC2A 3U9ZA 4CJTA 4CJFA 5AQYA 2XY7A 3CYGA 4E7IA 1R59O 1ZBSA 1HRHA 3J7YP 3HO1A 3MWPA 5AR0A 2DTUA 2F9TA 3THVA 4CZKA 4BR4A 4KRFA 2HHVA 3NGYA 1YJ9N 3KK3A 3GE1A 1J5OA 1HKGA 1QHAA 4M7XA 1BCOA 3G4SN 1W9HA 5CYMA 4CHNA 1JLFA 4FK4A 1BCMA 4FM2A 1LCUA 4CJUA 4B9QA 4FM1A 4CI6A 4JI6K 4BECA 4OX9K 4ILGB 1Q8IA 4W5OA 1BU6O 1FXXA 1VSHA 4N41A 1T7PA 1OH7A 4WQ4A 1BA1A 3I55N 4BE1A 4DHYA 4IBNA 1X1PA 4JEPA 4WQ5C 3BEXA 5FRNA 2KFZA 3RMCA 3LPUA 2P9IB 4U67L 4NYFA 5LL6Z 4AHSA 1M1KO 3U8XA 4JKHA 3VERA 5LJWA 5I42A 2E8AA 3VESA 3L8BA 4KHPK 3WXKA 4F2RA 4NB4A 3J7AP 1ZXOA 3BDPA 1N8RO 3CCMN 3MX2A 4DR5K 4EZ9A 1KD1O 3CYMA 4KPYA 1EX4A 4DTSA 4JI2K 5BRFA 3KJVA 3HP6A 1CLQA 4FZXC 1HJOA 5AZJB 2G8FA 3O9TA 1LW2A 3B6PA 4Z4IA 1XNQK 5BPLA 5CZ1A 3ZT4A 3LZJA 2KZZA 1OVYA 2QW9A 4PA1A 2OTJN 4MLHA 4OVLA 4DV6K 3THWB 2ZQBA 4E89A 2HNDA 3QESA 2ZJQL 3O5BA 4Y1DA 4CHOA 3MECA 2YCHA 4QAGA 4LF7K 4FWPA 3OYEA 2QWMA 3T1AA 1GLFO 1B92A 3LP1A 5I3UA 1SKSA 2PAVA 1C6VA 3S9HA 3F9KA 4CFDA 3MDQA 2O4IA 1JLAA 1IBKK 3L2VA 4DV3K 1HNVA 1XMQK 1ITGA 2UUAK 1NGJA 3QEWA 3ZETB 1C0MA 4N47A 5KPTA 5B8HA 5KTQA 3NF7A 3B8AX 2Q1NA 3OBWA 4A5AA 4ZTJA 2AP1A 3E66A 4NXNK 3CCVN 3OYMA 4CZHA 2VWBA 3OYNA 4JI8K 3O4NA 4CJKA 1NK0A 3OYCA 3MN7A 3TAGA 3ITHA 2HHUA 5EXWA 3NDKA 3CFRA 4LFBK 4CD3A 2PBDA 5C2DA 4ISGA 4DTXA 4WE1A 4B08A 3SMPA 4E3SA 2HHTA 4PL8A 2GEMA 5EOYA 1X9WA 4HCBA 2OZMA 4BC5A 3DRPA 4EAHD 3G25A 2JWLA 1C1BA 1HUXA 4ZHRA 2YNFA 1NGFA 2YKMA 3BGRA 4GKKK 4KTQA 1H1VA 4DFKA 4M3ZA 1MDUB 2WOMA 3CM5A 4WFBL 3KHYA 3VQPA 3SUQA 1YTAA 4KHUA 3PO5A 2UYTA 3VQ7A 2NRHA 4BREA 4LY7A 4BRGA 2R7YA 3O80A 3CMAN 5DMRA 1SZ2A 1XUPO 3RSEA 3RMAA 4H5VA 3ATUA 4BQLA 4O5BA 3I8DA 3P38A 3VQ6A 4H5NA 3M8RA 4ID1A 5EX5A 4YORA 4UY8O 1VSEA 2EWSA 3ISNC 3AVMA 2HHSA 4DSIA 1VQ9N 3HSTB 5A2QO 3OYGA 4NCAA 4IKFA 4B9NA 4QOZB 3AVLA 1IBLK 5KRSA 4Z4EA 3HK2A 2O8EB 3ENOA 3V1RA 3TWHA 3I0SA 3K5LA 4DV5K 4H0YB 5JICA 5DM6L 4FJGA 3CC2N 3LPTA 3VA3A 3OYIA 1VQLN 4E1JA 4DB3A 1IKXA 1WSHA 1EWQA 3OJUA 3OYJA 2O8DA 5AQHA 3SJJA 3VGLA 3VPZA 1KTQA 4AF1A 2YX6A 1U2VA 3O3GA 5HRNA 3TAEA 4BRCA 2ITGA 4IOCL 3MXJA 2Q0RA 2IIRA 4BRAA 5SZTA 4YOXA 4B1UB 2Q36A 2G8HA 4KBOA 1S22A 3K9JA 3FE1A 3UKRB 3IAYA 4CJEA 4CEAA 4IFYA 1GOAA 4GMJB 5IWAK 3P4IA 5FPEA 3SPZA 2PYJA 3MWTA 3SYZA 4M3YA 1JCGA 1VSDA 4FLUA 2RHKA 3AA2A 1L3VA 3MCPA 1UWBA 3ZX2A 1TK8A 4LF4K 3OS2A 3SV3A 3T7ZA 3KD1E 5HROA 1N36K 1SS6A 3AGRA 3JAMO 4BR5A 3OYDA 1QQMA 2CH5A 1HNIA 4XH5A 4KHNA 4EP4A 3ATVA 3HI0A 3KLIA 4DQSA 4I6MA 1CZAN 2KLAA 3FZMA 2ZM6K 3S41A 3LDSA 2FC0A 4HHTA 3D2EA 3DLBA 3HM8A 3K0SA 1CZBA 4IO8A 2VCPA 5C42A 2B6AA 4KB0A 4LF8K 3OBYA 3A5NC 5HRSA 4CGFA 3M8SA 4JYAK 1WSFA 1FW6A 3I8BA 3CJCA 4FWSA 4JK8A 2ZJRL 4IG0A 2PZSA 4M7YA 3FGUA 3B6OA 3EEQA 4Z4HA 4B1VA 5KQDA 3SAFA 5GIOA 3WEEA 4I2QA 4DQIA 1L3SA 3AVNA 3MEGA 3V9XA 3V9UA 5JVHL 4B9SA 1DT9A 5AQRA 1LWEA 2B4JA 2VGNA 5AQIA 4ELTA 1HKCA 4JKGA 3DI6A 3CQXA 4BDYA 3MN5A 2LSNA 4J2AA 1VSIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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