2P9NA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
415
structure length
397
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 123
structure length 397
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9nA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9nA03
1U2VA 1JCFA 3CIPA 3MDQA 4J8FA 4M7YA 3QFUA 5FPNA 1QZ6A 4EAHD 1JCGA 1EQYA 1NGDA 1QQNA 3ULEA 4BR7A 4CZKA 4M7XA 5BPMA 4JD2A 4MLHA 3HZ6A 5B8HA 2Q0RA 2EWSA 3QMLA 2P9UA 2F9WA 2H3GX 3LL3A 1KAZA 4H5NA 4IXCA 2A3ZA 5BPNA 3MK6A 2GTDA 5AQIA 1TYQA 1T6CA 2FF6A 3EZWA 3R6MA 3IUCA 1G99A 4H03B 3R9PA 3TPQA 4FL9A 1E4FT 1ATNA 4H0VB 1K8KB 4L3QA 3QDKA 1V4SA 2Q1NA 4BREA 4E1JA 2I7PA 5AQHA 1LOTB 3O80A 1BA1A 2D1KA 5F0XA 5AZIB 1DGKN 3CI5A 3W0LA 5F1XA 3ZEUB 3ZX2A 2GEMA 3LDQA 3C0BA 1X9JA 3D2EB 1J6ZA 1KXPA 2QWMA 1XC3A 5JLHA 3SLCA 3VEWA 5BN9A 1BO5O 1SQKA 2P9NB 4H5VA 1H1VA 4FWLA 4JN4A 4H5RA 4NB4A 2YHYA 5BR9A 1QHAA 3VF4A 4ISGA 3VEZA 2ZWHA 5E26A 2QWPA 3UE5A 3FZHA 1ATRA 2CH6A 4A2BA 4QS9A 3BP8A 1S22A 4DB3A 3D2FB 4BC2A 3GOIA 1T6DA 4BROA 3CJ7A 3UKUB 4PKHA 1D4XA 4CBUA 4A61A 4B1ZA 5ADXH 2YJEA 2IVNA 3S41A 4H0YB 1ZXOA 1GLLO 1YVNA 4FWKA 3FZMA 2CH5A 2HF4A 2FSJA 4PL8A 4B1WB 5LJVA 3EO3A 2YCHA 3VF2A 5JICA 4GNIA 2A40A 5KQDA 4MO5A 4BRLA 3A0IX 4PKIA 5AR0A 3J8AA 1QQMA 5AQQA 2FSKA 3M6GA 2BTFA 1BA0A 5AQRA 3VEVA 2P9LA 1OKJA 3SK3A 1WOQA 4CZMA 5FPDA 3AY9A 4BG9A 4CZJA 3L0QA 3GG4A 4BR4A 3FE1A 5AFUA 3A8YA 3MMVA 4A2AA 3CQYA 4H5TA 3VEXA 1GLCG 2P9PB 3OHRA 5AQTA 4XH4A 5AQYA 3WEEA 4H0XB 3H1QA 3ZX0A 1NGGA 3CJBA 5AQOA 3CJCA 1CZAN 4FOEA 4Y0WA 2W40A 2ASMA 1NGBA 1GLBG 4BR0A 1XUPO 4EHUA 5KQ8A 5BRHA 3DXKA 4K41A 2OANA 5AZJB 5FPEA 5BRDA 1X3MA 2E20A 3WXJA 2ASPA 3JXUA 3WXIA 2GWKA 3CJ9A 4B1XB 4CD3A 5AQUA 2V7YA 4CZEA 5AQJA 1Y64A 5EX5A 1BU6O 3VGKA 3MN9A 4DQ8A 3MN7A 4XEIA 4BRDA 2P9KB 3BEXA 3MN5A 5LY3A 5AQVA 2P9SB 3C7NB 4EIAA 1XQSC 2QWLA 3ZETA 2FXUA 5BRFA 4PKGA 4BGBA 4WQ4A 2P9IB 3ATUA 1SZ2A 3DXMB 3W3DA 1NWKA 3A5NC 3L6QA 3QFPA 1ZBSA 3AAQA 1GLAG 3O4WA 4FWRA 3WT0A 3H1VX 2V7ZA 3WXLA 4BC3A 1Z6RA 1HLUA 3A5LC 4JHDB 4IWVA 3GL1A 1MDUB 4FWPA 3FZLA 2E2PA 3VF6A 3H46O 3SJHA 4CJ7A 3LDPA 1GLJO 2A42A 1R59O 2A5XA 5KPRA 3VPZA 4PL7A 2CGJA 3IMXA 1U2VB 3RSEA 5BN8A 2E2QA 4DHYA 4M63C 2IVOA 2E8AA 2Q36A 3WXKA 1TUUA 3R8EA 4I6MA 4H0OA 4K43A 4YDUA 3ULEB 4CD1A 1YXQA 1V4TA 5I9EB 2YI1A 4JD2B 3MN6A 3O1WA 2CGLA 1DKGD 3EKUA 3O6WA 3ENHA 4CZLA 1NM1A 2ZF5O 1GLEG 2P9UB 4NO7A 4CZHA 4BRAA 5JLFA 2F9TA 2A41A 4A62A 2WUSA 4FWOA 1ATSA 1YAGA 1TYQB 1Q18A 1RGIA 2ITMA 3TU5A 4WYBA 2V52B 3ATVA 2NLXA 2YHWA 4H0TB 4CBWA 3VESA 3AAPA 3KVGA 1WUAA 1Z05A 4RWTA 2QWQA 1NGCA 1IJJA 2GELA 2NRHA 5AQLA 3EL2A 1HUXA 5F2RA 3AARA 1RDWX 3GDQA 3FZKA 2CGKA 4RTFD 2ZGZA 1MA9B 4EFHA 3LM9A 4BVOA 3HI0A 3H3OB 4FWMA 3B8AX 1X3NA 4BRHA 4BVPA 4EHTA 2FF3B 5KPTA 5E84A 4BRKA 3CHWA 3UKRA 3DJCA 4WQ5C 5AQMA 2KHOA 2YJFA 2J4RA 3H6EA 4F9OA 3FZFA 2QWOA 4GY2B 1QZ5A 2FSNA 3QBWA 3IFRA 1SAZA 3FFKB 2D0OA 3GE1A 3ID8A 2E1YA 5AQNA 2UYTA 2NZTA 4FPBA 2D0PA 3CERA 3JS6A 1JCEA 2Q31A 3O5BA 4WQ5A 4IZ9A 1C0GA 3BF3A 4DCHA 2E2NA 1S3XA 2E88A 5AQPA 3VGLA 2PAVA 4O8KA 5AQWA 5KPZA 3CETA 3VGMA 3QICA 2V51B 1GLFO 4CZFA 2FLOA 4WQ4C 5AFUH 1LCUA 2Q2RA 1K8KA 5EOYA 1BDGA 4KBOA 5AQXA 3VERA 3FLCO 4IJNA 5AZIA 5LJWA 4BRPA 3ZEUA 3UKRB 3SMPA 1HX1A 4CZIA 3CQXA 3D2EA 5AQGA 3EN9A 2I7NA 4BR2A 2P9LB 3ENOA 4LC9B 4BGAA 1HKGA 4H0PA 3H45C 2HOEA 3VETA 4B1UB 3BUZB 2P9NA 5AQSA 1IG8A 2Q97A 3KZBA 4BC4A 1GLDG 2HMPA 5CE3A 4YDUC 2QWNA 3WEEB 2ZGYA 1YUWA 4FPAA 4FOIA 4MLEA 4XH5A 4BRGA 1BG3A 3U8XA 4JAXA 5AQKA 4B9QA 1ZC6A 3D2FA 1NGHA 3HSCA 3M1FA 5JMVA 2AA4A 3DXKB 3UKUA 4AM7A 3ZX3A 4IO8A 2IVPA 4IJAA 2Q0UA 4ISFA 4BC5A 4BRIA 5ELZA 2QXLA 3G25A 5EXWA 4BQLA 2VCPA 2QWRA 2HF3A 3FGUA 3O08A 4AM6A 1NGAA 3L4IA 2W41A 3LM2A 4BRMA 3U9DA 4FWQA 1MWMA 3F9MA 4O5FA 5EVZA 2E1ZA 3I8BA 3IDHA 1ESVA 4CZGA 3LDNA 3QB0A 4RCHA 3MCPA 3KHYA 1P8ZA 3HTVA 5EY4A 3ZETB 2GUPA 4BG8A 3WUHA 4CBXA 4BR9A 3GBTA 1BOTO 4MO4A 3LDOA 1C0FA 5AQFA 5ADXA 3U9ZA 1NLVA 1BWFO 4HWIA 3BF1A 2D4WA 1HKBA 4QS7A 3D7EO 1NGJA 2GWJA 2BUPA 2DPNA 3WQUA 4B1VA 4C23A 3WQTA 3O1BA 3RSEB 2P9PA 3M3ZA 3O8MA 4XH1A 4FWNA 1HPMA 4I6MB 4BRCA 1E4GT 1NGIA 4CI6A 5BREA 5TKYA 2VWBA 3VEOA 3U4LA 4BR5A 3A5MC 3QBXA 1BUPA 1HKCA 5FPMA 5AZJA 4H5WA 3EKSA 3LDLA 3H3NO 3I33A 3VOVA 4ISEA 4B1YB 1KAYA 3CJAA 4BRNA 3A5OC 2QW9A 2A6AA 4K42A 2PBDA 2ASOA 2YHXA 2P9KA 4K25A 4BRQA 4HTLA 2P9SA 3C7NA 3VENA 3SMSA 4BRFA 1KAXA 4FSVA 3VEYA 1T44A 4BQZA 1NGEA 3HBTA 2IIRA 2VYPA 4FO0A 2P9IA 1QQOA 1HJOA 4Z94A 3DWLA 3UB5A 3DXMA 3DAWA 1NGFA 2AP1A 1MWKA 4JHDA 1U6ZA 1TUYA 4JNEA 2QM1A 4FWSA 4QS8A 5BPLA 3HM8A 1NBWA 5AQZA 1NMDA 1DEJA 1RFQA 3CJ1A 3FR0A 2E2OA 3P4IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V9SA 2P5GA 4KHQA 3MDQA 4KAZA 1VAZA 4DQRA 1QZ6A 1NK6A 1JCGA 4OPJA 4IKFA 4JKAA 5FDLA 4MLHA 5B8HA 4FJLA 4OKEA 4FM1A 5FRNA 3M8PA 5BPNA 4RW6A 2NNWA 5AQIA 5AJ3K 3R6MA 3IUCA 2Z1HA 4FJKA 4C8OA 5GIPA 4L3QA 4BREA 2I7PA 3ZSWA 4FJHA 3VQQA 5F0XA 3AO2A 5AZIB 1DGKN 3KIOA 3VQEA 4NCAA 3ZX2A 4JKFA 4FJ8A 1DT9A 4FW2A 2GX9A 3CCLN 4LF9K 3EZ5A 2VGNA 2PY5A 2E6MA 4FWLA 2G8IA 5HRSA 4H5RA 4C8MA 2O8FB 5BR9A 2ZWHA 5E26A 2QWPA 4WFNL 3ZSYA 3FZHA 1VQPN 3AVKA 4QS9A 3BP8A 4FVMA 4LSNA 1EWQA 5KI6A 3UKUB 3OVNA 3O9TA 4CF1A 2DY4A 1TKXA 4I2QA 3JAMO 4GKKK 3BZKA 4CERA 1S9GA 2IVNA 1W2BM 1VQMN 5CY4A 3ZT3A 2W42A 4HUEA 4DS5A 1TL1A 3I0RA 1Q9XA 2CH5A 4E19A 4PL8A 3LWMA 2E4LA 3KLHA 1N36K 4EZ6A 2Q3SA 3EO3A 4LH5A 4O0IA 4GNIA 5KQDA 3VQBA 5D3GA 5AR0A 1UA1A 1D9DA 4B8CA 5AQQA 2OTLN 2FSKA 2ATQA 4GMJB 3SK3A 4CZMA 4KHWA 4BG9A 3L0QA 1HNWK 2YNFA 4BR4A 5AFUA 4J2DA 4A2AA 3HJFA 1VSEA 1S6PA 4H5TA 3VEXA 5FLXO 1YJWN 1GLCG 4OGEA 3QLHA 5AQTA 4H0XB 4KB0A 3DLHA 4E7IA 2ASMA 3QNOA 1NGBA 4I7FA 4CJKA 4DTRA 1XUPO 2QK9A 4CFAA 4OLBA 3D0PA 4DTSA 3O3GA 2OANA 3OYMA 4FLWA 5BRDA 4GV9A 2E20A 3WXJA 3WXIA 3JXUA 3P31A 3CJ9A 4OKJA 4JKEA 4DTJA 3KK7A 2V7YA 4ZHRA 2KW4A 2B6AA 1Y64A 4BRDA 2P9KB 4CGHA 3BEXA 3MN5A 3C7NB 1VQON 3N4QA 1GOAA 3KK1A 2QWLA 5DM7L 4LFBK 1TGOA 2FXUA 1SKSA 4WQ4A 3DXMB 3W3DA 4FWRA 3WT0A 1ZBSA 3O4WA 4KO0A 4U67L 1VSIA 3VQ4A 1ZBLA 4MDBA 4IWVA 4FWPA 2E2PA 3VF6A 1RCHA 3SJHA 3LDPA 4FLVA 4FJGA 1GLJO 2A42A 1R59O 1HRHA 2A5XA 5KPRA 3VPZA 4PL7A 4K0KK 2BANA 1U2VB 1T8EA 1HYVA 5HRRA 1W0HA 1TKZA 3OYAA 4B3TK 3SQ2A 4I6MA 5J2QA 3AA3A 3OA9A 2VGMA 4CD1A 4AHRA 2YI1A 4CJTA 3MN6A 1RDCA 5BR8K 3WNFA 3QETA 1RTJA 1NKCA 4IO9L 1GLEG 2P9UB 2Y1IA 1RDUA 2HVIA 2YHAA 2XY6A 2F96A 2A41A 2WUSA 1YAGA 4YOUA 4WYBA 1WSHA 4DQQA 3SPYA 1CZBA 2YHWA 1LAWA 3AAPA 1Z05A 4KI6A 3SUQA 1N33K 1NK5A 1KFDA 4NYFA 2G8WA 4BACA 3GDQA 3CCJN 3MXMA 3RRGA 4RTFD 2F8TA 4BVOA 2QXFA 3HI0A 3K5OA 1X3NA 4BRHA 4CJ4A 1SKRA 4KHUA 2X78A 1NJZA 4E7LA 3M8RA 4CJ3A 2HBJA 3CHWA 3UKRA 3EE9A 4WQ5C 1RILA 3H6EA 4JS4A 1IBLK 1P90A 3J80O 4DQIA 1Q7YO 2FSNA 3NE6A 3THYB 1F21A 3IFRA 1UA0A 3SBGA 2G8UA 3IAYA 2D0OA 1IH7A 2X6SA 4FZXC 3ID8A 3U3GA 3JS6A 2Q31A 3O5BA 1Y97A 4AHSA 3BF3A 3U3YA 4FLYA 2O8DB 1RDAA 5AQPA 1HNXK 4FLZA 3HT3A 4AQYK 3QICA 4CZFA 1GLFO 1HMVA 4E89A 3IG1A 4GKJK 4F3TA 4WQ4C 5AFUH 3KJVA 3HK2A 2KZZA 1U47A 3OW2M 4JI0K 1LWFA 3E9PA 3S3MA 4BECA 1JLBA 2RF2A 4W5QA 1TAUA 2QEXN 4BRPA 2YKMA 3QINA 2DFEA 3MCAB 1RBSA 1QSYA 3EN9A 4CF9A 4LH4A 4BR2A 4DR2K 4K8ZA 1K73O 1HKGA 4CFBA 3H45C 3VETA 1C0MA 4YY3K 3AVJA 4HUFA 5AQSA 1IG8A 3ZSRA 2Q97A 3LP1A 4BC4A 3Q7BA 4LF4K 2ZM6K 4YOXA 2YNGA 1NU0A 1O1WA 2QWNA 4NCBA 4YORA 1J5OA 1YTAA 4B3OA 4MDAA 1YUWA 4N76A 3TR8A 4FOIA 1BG3A 3KLIA 4JAXA 4B9QA 1ZC6A 5M1FA 3M1FA 3OBYA 3AV9A 2Q0UA 4IOXA 4BRIA 5T7BA 4JI7K 4RW9A 5EXWA 5C0YA 3NFAA 3WNGA 2HF3A 3FGUA 4JI8K 1NGAA 5C15A 2D0CA 4PHTX 4CGFA 3G0ZA 3F9MA 1S1TA 5EVZA 2E1ZA 1IBKK 1DLOA 4KH5A 5SZTA 2QI2A 4OPAA 1KVAA 3WUHA 3C6AA 3ZCMA 2HHWA 3TSUA 1SL0A 1L3TA 1S1WA 1BWFO 4OVLA 4HWIA 4K8XA 3LP3A 4JKGB 2GWJA 3T3FA 4FJXA 5GADP 3J7AP 2DFFA 1Z25A 3QERA 1B92A 2QKBA 2QTDA 3ZT4A 4XH1A 4X64K 1KC8O 5BREA 2HB5A 3AA2A 5M1KA 2BH1A 3QEVA 2EHGA 2XRIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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