2P9NB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
QAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 51
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9nB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9nB02
5FPDA 4BG9A 1V4TA 4PKHA 4BR9A 4M7YA 4FOEA 4O8KA 2ASOA 2BTFA 4KBOA 3CJAA 1NLVA 4NB4A 2ZGZA 3A5OC 4B9QA 5AQNA 1T44A 4K41A 4CJ7A 2GWKA 2QWOA 3GG4A 3FGUA 4CI6A 1MDUB 3VESA 1QZ5A 3L4IA 1MWMA 5F0XA 3U4LA 3H6EA 3ZETA 3O8MA 1BWFO 4AM6A 4FWRA 1GLEG 4H5VA 4FWQA 4CD1A 1U6ZA 3U9DA 5JICA 5LJVA 2PAVA 4Z94A 3UE5A 3WQUA 1ZC6A 2A40A 2ZWHA 3D2FA 4BR2A 1QQOA 2ZF5O 5B8HA 3LDOA 2GTDA 3C0BA 2Q0RA 2V7ZA 3J8AA 5AQPA 1SQKA 4XH4A 2DPNA 2PBDA 3M6GA 4CBUA 4GY2B 3RSEB 4PKGA 3ZEUA 2GWJA 3D2FB 3HZ6A 5AQKA 1RGIA 3ULEB 2D4WA 2E20A 4M7XA 5JLHA 2VWBA 2D0PA 4BGAA 1MA9B 4YDUA 2A41A 3R6MA 4CD3A 4A61A 4XH5A 3B8AX 1NM1A 4B1XB 1Q18A 2P9KB 3GL1A 3D2EA 1NGJA 5FPNA 1IJJA 2CH5A 1HKBA 2UYTA 5AQVA 3FZHA 2IIRA 3UKRB 3IMXA 4BROA 3O5BA 2W40A 4BRFA 2E2OA 3O80A 4I6MA 3CJBA 3H45C 2D0OA 4BC5A 4H0XB 1T6CA 3UKUB 4BRCA 3SK3A 2E2NA 3MN5A 3ZX2A 4FWLA 5AFUH 4BRNA 5JLFA 3DXKB 3UB5A 2Q0UA 4H0OA 1JCGA 2Q2RA 3ID8A 3MN6A 4I6MB 3F9MA 4A2AA 1CZAN 5ADXH 1EQYA 4H0YB 1D4XA 3GDQA 4JD2B 3ZX3A 4K42A 2P9LA 4BRQA 4H03B 4QS8A 1HKGA 4WYBA 5EY4A 3JS6A 1C0GA 2ASPA 4FWSA 3FE1A 3VEWA 3WXIA 5AFUA 1GLJO 4BREA 2Q31A 2E8AA 2QWLA 1GLAG 3H46O 3M3ZA 3CI5A 4WQ5C 1BOTO 1YVNA 2V52B 3CJCA 4CZMA 5ADXA 1YXQA 1X3MA 2CGKA 3QBWA 3LDLA 1NMDA 3R8EA 4E1JA 1H1VA 2P9IA 3MDQA 4BC3A 4BRPA 5BR9A 3QFPA 4BC4A 4BRLA 4QS9A 5AQSA 5AQGA 3VEVA 3WXJA 3U9ZA 4EHUA 3MN7A 3A5NC 2FF6A 2P9IB 3LDPA 4JHDB 1LCUA 3I8BA 4BR5A 3VOVA 2YJEA 3FFKB 4BG8A 5AQOA 1NGFA 1TYQA 3VEXA 5E26A 3QDKA 3WEEA 2A42A 3IFRA 4RTFD 4QS7A 1NGAA 3O6WA 1K8KB 4H5TA 4MO5A 4C23A 2ZGYA 4BR4A 4CBXA 4O5FA 3VGKA 2QXLA 3CHWA 4BC2A 1E4FT 3A0IX 3LM2A 1TYQB 3WEEB 3QMLA 3IDHA 2IVPA 3SMSA 4YDUC 5BPMA 2OANA 2BUPA 3VEYA 3BP8A 3A5MC 1J6ZA 4PL8A 1S3XA 1TUYA 3DAWA 1U2VB 2QWPA 3LM9A 3VGLA 1NBWA 3RSEA 4BRAA 5AQZA 2FSJA 4BVOA 3ULEA 1V4SA 4H5NA 4PKIA 5BRHA 4EFHA 1NGEA 4H0PA 3QFUA 3BF1A 1GLFO 2YHYA 5E84A 1HX1A 1NGIA 4EHTA 1DGKN 5AQUA 3SMPA 4B1YB 2P9KA 1LOTB 5AZIB 1YAGA 4CZEA 1IG8A 4CZLA 2D1KA 1WOQA 4IO8A 3O08A 3P4IA 2ITMA 4CZFA 3HBTA 2FSKA 3EZWA 1RFQA 2VYPA 2W41A 3CJ7A 4J8FA 4JNEA 3UKRA 2HOEA 2QWNA 2V7YA 2YI1A 2P9PA 1ZBSA 2Q36A 4WQ4A 4L3QA 3UKUA 5JMVA 1GLLO 5AQQA 3SJHA 4F9OA 4CZGA 4FSVA 2A6AA 1HPMA 4FL9A 3WXLA 3DXKA 3HSCA 5EVZA 3VGMA 4LC9B 4Y0WA 1SZ2A 3BF3A 4A2BA 1XC3A 2P9PB 4RWTA 4JD2A 3DJCA 1QZ6A 4H0VB 3TU5A 5BRDA 1MWKA 3ATVA 3CJ1A 1HUXA 2A5XA 1BO5O 4ISFA 1JCFA 3ENOA 3O1BA 2CH6A 5AR0A 1ATRA 2HMPA 3W3DA 1OKJA 2EWSA 2E1YA 2VCPA 4AM7A 4ISEA 2NLXA 5AQFA 5KPTA 3OHRA 3EL2A 3LDNA 3FZKA 3VENA 2IVNA 3AARA 3HTVA 4FWPA 3FLCO 1WUAA 1SAZA 3GOIA 3I33A 2F9TA 2J4RA 3ZX0A 1GLDG 3QBXA 2P9SA 1HKCA 2I7NA 2Q1NA 3TPQA 1HJOA 2E2PA 3VF6A 2HF3A 3QICA 4JHDA 4NO7A 4GNIA 4CZJA 4MO4A 1T6DA 1NGCA 1NGGA 2I7PA 2QWMA 4HTLA 2P9SB 5BPNA 4B1WB 1ZXOA 1S22A 3O1WA 2FSNA 2F9WA 3LL3A 4BGBA 4FPBA 1K8KA 5AZJB 5BPLA 3L6QA 4EAHD 3GE1A 3CERA 4BRKA 3CJ9A 4ISGA 1NGDA 2P9NA 1YUWA 2FF3B 5EX5A 3C7NA 1HLUA 4DCHA 1E4GT 1BU6O 4B1UB 3M1FA 3LDQA 3SLCA 4HWIA 3D7EO 2NZTA 4FO0A 3BEXA 4EIAA 1U2VA 3FZFA 1ATSA 1NGBA 2P9NB 5ELZA 1RDWX 3G25A 3C7NB 4K25A 2YJFA 3EKSA 3VPZA 4PL7A 5AQRA 1BUPA 3ATUA 1ATNA 5AQHA 1ESVA 4WQ5A 5I9EB 1XUPO 2GEMA 2H3GX 4FWNA 4WQ4C 4BRMA 3WT0A 3WQTA 1NWKA 3EKUA 2AP1A 5AZIA 4IWVA 2QWQA 4JN4A 2E88A 2YHWA 2GELA 1QQMA 3CETA 3FZLA 4FWMA 4CZHA 2CGLA 5TKYA 3MK6A 3O4WA 1JCEA 4BQLA 1KXPA 4H5RA 2QWRA 4BQZA 2NRHA 2GUPA 4BR7A 5LJWA 3ENHA 3ZETB 3R9PA 4BRGA 4FOIA 2QM1A 4FWOA 5FPEA 1QQNA 4FPAA 2A3ZA 3S41A 4CBWA 5KQDA 4A62A 3HI0A 5KPZA 2ASMA 3A8YA 1GLBG 1X3NA 3FR0A 4B1ZA 3VERA 3H1QA 3VF4A 1C0FA 3DWLA 3JXUA 1R59O 4H0TB 2AA4A 5BN9A 4IXCA 4BRIA 1QHAA 3AY9A 5AQXA 5BREA 4IJNA 3ZEUB 2V51B 4MLEA 1BDGA 3H1VX 4XH1A 4CZIA 1Z6RA 2YHXA 2E2QA 3EO3A 3KHYA 4H5WA 5KPRA 3WUHA 1KAXA 3L0QA 4FWKA 3WXKA 3EN9A 4MLHA 1Y64A 3QB0A 4IZ9A 5AQTA 5KQ8A 1TUUA 3CQYA 1BA1A 1KAZA 3D2EB 1X9JA 1DEJA 4CZKA 4DB3A 2Q97A 2KHOA 1P8ZA 4XEIA 5AQWA 1BA0A 3H3NO 1BG3A 4RCHA 2P9UA 3DXMA 5EXWA 3W0LA 5F1XA 3VEZA 4B1VA 3AAPA 2FXUA 4DQ8A 4BR0A 3CQXA 2IVOA 3VEOA 4BVPA 5FPMA 3HM8A 5AZJA 3CIPA 5CE3A 2QW9A 3FZMA 2HF4A 4DHYA 1XQSC 2P9UB 3MCPA 3DXMB 4M63C 2WUSA 5F2RA 4BRHA 3GBTA 5BRFA 3U8XA 3IUCA 4JAXA 5AQLA 3KZBA 2P9LB 3BUZB 5BN8A 5AQMA 1KAYA 3H3OB 5AQYA 1DKGD 1GLCG 1G99A 3MN9A 3KVGA 2FLOA 3A5LC 2CGJA 5AQJA 2E1ZA 5LY3A 3VF2A 4IJAA 2YCHA 3VETA 5EOYA 3AAQA 1NGHA 4K43A 5AQIA 3MMVA 1Z05A 4BRDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SQ0A 3AV9A 1W7AA 1N34K 1IKYA 1HRHA 3QEWA 4LF5K 1DT9A 5CHIA 4WFAL 1VSJA 3L2WA 3K5MA 1YIJN 5DMRA 4E7LA 4NB4A 4FZYA 2ZGZA 4V19S 3K57A 3O9QA 4B9QA 5AQNA 2GWKA 1SL0A 2BH1A 2ITGA 2G8WA 3CCJN 1HYZA 2Z1JA 3DLLL 1MDUB 4DFKA 3CFOA 3L4IA 4B08A 4CJ4A 2HHXA 1GOCA 4DR7K 3NF7A 3PSIA 3OYMA 3ZSOA 1L3TA 1XNQK 1REVA 4CEEA 2OTLN 1BWFO 4JKGA 4H5VA 1VQ4N 5CR4A 3K2PA 4KO0A 1RBUA 5LMNK 2PAVA 1VQ7N 1NMNA 4O5BA 3CM6A 2ZF5O 4FLVA 3O3HA 2V7ZA 3F73A 4CBUA 5LMUK 5GAHP 2LSNA 3PY8A 4CEDA 2W6KA 2GWJA 3HZ6A 4E19A 1RGIA 2E20A 3AVJA 4CF0A 1X9SA 3AA5X 4IO9L 2D0PA 3NH2A 1S9GA 4IFYA 3PIPL 4CD3A 4XH5A 1VQPN 3B8AX 3K5NA 2C1GA 3HP9A 4DTOA 1IJJA 5LL6Z 2UYTA 1TL1A 4LH4A 4E7KA 4M45A 1QSSA 2IIRA 4DS4A 3C6AA 3I8DA 2W40A 4BRFA 1EX4A 3OYJA 4I6MA 2YX6A 3G0ZA 3H45C 4RW4A 2W00A 3AVGA 2D0OA 4H0XB 3TAEA 1T6CA 3UKUB 1T03A 2E2NA 3IRXA 4BRNA 1FW6A 4DTMA 4AHSA 5GINA 2Q0UA 4H0OA 4A2AA 2NUBA 5ADXH 1EQYA 3V9UA 1D4XA 5E41A 3ZX3A 1Q82O 4I2QA 1MU2A 3O9SA 4BRQA 3ASMA 3VQ9A 2HBJA 3JS6A 1OVQA 2ASPA 4DR6K 3WXIA 3QINA 3VMFB 1CXQA 2E8AA 4DU1A 4O4GA 1WNSA 4IFEA 1K73O 4OPJA 1X3MA 2NRXA 2CGKA 1SKSA 1HMVA 1UAXA 3LDLA 3R8EA 1H1VA 3EE8A 1BIUA 2F96A 3OYIA 1VQKN 5BR9A 1NKBA 3DOLA 4BC4A 1GOBA 4LD0A 3VEVA 2NRZA 5AQGA 5AQSA 4BRLA 4DTXA 1LWCA 3RMDA 4F8RA 3WXJA 4B9UA 3U9ZA 1P90A 1BL3A 4PWDA 3AVNA 3V9WA 4G9ZA 2OTJN 1WN7A 3KKSA 2JGUA 2IDOA 3PX6A 3D6RA 1S1TA 3OVNA 1XNRK 4BR5A 2GBZA 3VOVA 5AQOA 3VEXA 2IS3A 3CPEA 5GIOA 4C1NK 4RTFD 1K8KB 3QEVA 3KK1A 2ZGYA 5T7BA 4O5FA 3VGKA 3CHWA 2YNGA 3PX4A 3CM5A 1XMQK 2F8TA 3S3NA 3DRRA 4IG3A 2VGNA 2XY8A 3QMLA 3IDHA 4WF9L 4CJQA 2XY5A 3P31A 3BP8A 2PY5A 4CJFA 3A5MC 1RDBA 3CF5L 4BRAA 3CPWM 1C0MA 3SUPA 2O4IA 4FLYA 2FSJA 4JI7K 4QCLA 3VTIA 3SJJA 3L8BA 4DUYK 3CMEN 2ZJQL 3T1YK 3CYMA 4Y1DA 2DTUA 3C6TA 3PIOL 2X6SA 4A59A 4I7FA 2HHUA 3RMCA 2W42A 4Z4CA 4CZEA 1YJNN 1BCOA 5MLCQ 4CZLA 2P5GA 1WOQA 4CK3A 3O08A 1HNXK 1HPZA 4DSIA 1LWEA 4DLGA 1U45A 1RFQA 2W41A 4JNEA 2KZMA 3AVLA 4JKFA 4AH9A 2Q36A 5BR8K 4WQ4A 4L3QA 3UKUA 4CZGA 4OX9K 2A6AA 2O8BA 4HTUA 4FL9A 3LPUA 4N76A 4LFBK 3QLHA 3HK2A 2P9PB 3TWHA 4CIEA 3LPTA 3DJCA 1C1BA 1E3MA 1MWKA 3E9OA 3TAMA 1BO5O 4IG0A 4ISFA 1ATRA 3W3DA 4KH6A 1GOAA 3SV4A 2KLAA 2G8HA 1ZBLA 3LZJA 1M90O 3EL2A 3LDNA 3FZKA 1RTHA 4Z4GA 3HTVA 4CJEA 2DFFA 2RPIA 1WUAA 1RILA 3ZYYX 3ZX0A 3SAGA 3QBXA 2P9SA 4CHYA 2RKIA 5CY4A 2Q1NA 3WXMB 1HJOA 3HRGA 2E2PA 3THXA 3AO2A 4FM1A 4FLXA 1OH7A 4IDKA 2JLEA 4CFAA 1RNHA 2O8CA 4MO4A 1T6DA 2QWMA 4B9NA 4DWIA 2F9WA 1I94K 1K8KA 5AZJB 1SL2A 1C0TA 4BRKA 4OKJA 4FCYA 4ELUA 1NGDA 4DU3A 1EETA 5GIPA 2FF3B 2OPRA 4M42A 1BU6O 3EZ5A 4DLEA 3BY5A 4DFPA 4EP4A 3NH0A 3HPGA 5ELZA 1OH5A 3DLBA 1SUQA 2EHGA 4DR5K 1QVGM 4ZHRA 1J53A 3KK7A 3WNFA 5FLXO 4FWNA 4GMJB 3FFIA 4JI8K 3WT0A 3AO1A 3WQTA 3RMAA 1RBRA 2O8EA 2QWQA 5JS1A 4J2EA 1QQMA 4BE7B 1VQLN 4CHOA 4KRFA 3MK6A 4CK2A 3TI0A 3B6OA 1JCEA 3O4WA 4H5RA 1Z25A 1QS4A 3BZCA 3HPOA 1QQNA 3J7ZO 3Q7CA 4UQGA 2A3ZA 3S41A 4CGJA 4CBWA 5KQDA 4A62A 4Q5VA 4FJ5A 3FR0A 4DSFA 4B1ZA 4F3OA 3JXUA 4JI3K 3G71N 4IXCA 4BRIA 2HBKA 2HNYA 3CC2N 1NKEA 2Y1JA 1YTUA 1NJXA 4M3XA 3AY9A 5AQXA 1VSEA 4GKKK 2ZD1A 1KLMA 4IJNA 2OA8A 3ZEUB 2W6LA 4ILHA 4MLEA 5M1OA 1BDGA 1Z26A 1WLJA 4O55A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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