2P9SB

Structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with atp/mg2+
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
TGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 54
structure length 197
sequence length 197
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9sB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9sB02
3C0BA 3LDNA 3FFKB 1RFQA 1KAXA 4FSVA 2Q97A 3VETA 5E26A 3DWLA 2A5XA 2P9SB 4H5WA 3CJ7A 1BDGA 4I6MA 2ZF5O 1HKCA 3HSCA 2OANA 2QWPA 2VCPA 3GOIA 4BRKA 2FXUA 4H0XB 3H3NO 4BROA 3I8BA 2QWQA 2QWOA 4RCHA 3ZEUA 4FPAA 1P8ZA 4BRFA 3DXMA 3HBTA 4WQ4C 5BPNA 4M7XA 1XQSC 4BRQA 2QM1A 4LC9B 3VERA 2QWNA 1NGJA 5AQTA 4BRDA 5BN9A 1Q18A 5ADXH 3MN5A 3VESA 1NGBA 3SJHA 3KHYA 2GWJA 4BR7A 4BGBA 3BEXA 5AZJB 4CZHA 3VF6A 3IUCA 4H0OA 3QB0A 1JCEA 3ZETB 2V51B 4M63C 5F2RA 5AQSA 3WXJA 1SZ2A 5JICA 3GL1A 1QQOA 3FR0A 4AM7A 3O8MA 2FSNA 1U6ZA 3RSEB 1TUUA 4DQ8A 1JCFA 5KPZA 3VEXA 4MLEA 5AQNA 1BA0A 2GWKA 3HTVA 3MDQA 5AZJA 2P9NB 1KXPA 2AP1A 3FE1A 5EXWA 3BF3A 3DAWA 2H3GX 5LY3A 5ADXA 4IZ9A 4XH5A 3O80A 3HI0A 4FWQA 3ZETA 1TYQB 2V7YA 2QXLA 1Z6RA 3MK6A 2F9WA 4K43A 5JMVA 3UB5A 4RTFD 5EOYA 4AM6A 1QZ5A 2E20A 3RSEA 5AQJA 3FZKA 1HX1A 4XEIA 5TKYA 2E2PA 4QS9A 4H0VB 3L4IA 4B1UB 2CH5A 1IJJA 1DEJA 1H1VA 2IIRA 2P9NA 3VEZA 1BUPA 2EWSA 4H5TA 3QBXA 5AQPA 1K8KA 4A2BA 2W40A 1YAGA 1NLVA 2CGKA 4BR4A 3FZMA 1TYQA 3CJ9A 3I33A 3H1QA 5JLHA 3QMLA 3AAPA 4BVOA 4EIAA 2IVOA 5BRDA 2FSKA 1ATNA 5FPDA 1HUXA 4FWNA 4H0YB 1NGHA 1HKGA 1C0GA 5AQUA 3QFUA 3AAQA 4H5RA 4M7YA 4BQLA 1TUYA 2V7ZA 5AFUH 5AQRA 4H0TB 4ISFA 1LOTB 2P9PA 3CI5A 5BRFA 2IVPA 3BF1A 1GLAG 3D2FA 4BREA 3CHWA 4FWPA 1WOQA 4BRAA 3R9PA 1ZBSA 3SK3A 1X3MA 4DB3A 3VENA 3FZHA 4JAXA 4K42A 4BVPA 4GY2B 3VGKA 3EKSA 1ZXOA 2BTFA 4FO0A 5AQVA 1RDWX 2FLOA 1OKJA 3D2EA 3DXKB 1YVNA 3ATUA 3M1FA 4FOIA 3EZWA 1MA9B 1HPMA 2ZGZA 3MCPA 2Q1NA 5LJWA 3CQXA 5AFUA 4BGAA 3L0QA 4BG8A 3U9ZA 3M6GA 3EL2A 5BR9A 2Q0RA 3WQUA 3GE1A 1GLFO 3CJAA 3H46O 1QQMA 3LDPA 4CZLA 2YHYA 3ATVA 4BC5A 2QW9A 2P9LB 2YJFA 3J8AA 4ISEA 4BC4A 3R8EA 3DXKA 2E1YA 4HTLA 3VGLA 3H6EA 4BG9A 1BWFO 5FPMA 1RGIA 3O08A 1NGCA 4EHUA 4K41A 4CZFA 1JCGA 1CZAN 3H3OB 3OHRA 4QS8A 2E2QA 4BQZA 3QBWA 3L6QA 3CQYA 3FZLA 2WUSA 3WXLA 2YHXA 3SMSA 1G99A 2Q31A 4JD2B 2HF4A 3JS6A 4IJNA 1BA1A 2Q0UA 4YDUA 1XUPO 4BRLA 2P9LA 5AQYA 5AZIA 5B8HA 4IWVA 4PKIA 4H0PA 3QFPA 3LDQA 3KZBA 1X3NA 3WT0A 3VF2A 2P9KB 2VWBA 2AA4A 5AQZA 2E2OA 4BR5A 3QDKA 3P4IA 1K8KB 4J8FA 3O4WA 3VPZA 4CZMA 4JD2A 2NLXA 5EY4A 4XH4A 2ZGYA 4YDUC 2A6AA 4JNEA 1SAZA 3QICA 4O5FA 3HM8A 2D1KA 3ENHA 3MN7A 3G25A 1DGKN 5F0XA 1SQKA 4EAHD 1J6ZA 5BPLA 5LJVA 4CZIA 5AQQA 4BC3A 1GLDG 3WEEB 2P9KA 3VEVA 4EFHA 5AQKA 1NGDA 5AQOA 2P9PB 1GLEG 1BG3A 4BC2A 4E1JA 3D2FB 1YXQA 3UKUB 1NGAA 4CD3A 3A5NC 2W41A 4BRIA 1V4TA 1V4SA 4F9OA 2PBDA 1GLLO 4B9QA 2F9TA 1QQNA 2BUPA 1YUWA 4Y0WA 4GNIA 1NGFA 2Q36A 4FWOA 2PAVA 2CGJA 1S22A 3A0IX 3WEEA 3CJCA 3CJBA 5AQFA 3D2EB 4FPBA 5AQLA 3CJ1A 3LDOA 1HLUA 4IJAA 3IDHA 1HJOA 5EX5A 3H1VX 3ZX3A 3ULEA 2D0PA 2V52B 3UKUA 1DKGD 1QZ6A 2IVNA 3SMPA 2P9IB 5BREA 1Y64A 4MO5A 1NGEA 4O8KA 1LCUA 3VGMA 4FL9A 3O1BA 3ENOA 2YHWA 3D7EO 4EHTA 2YI1A 3HZ6A 4BR0A 2CGLA 3U4LA 4CZKA 3BUZB 4IO8A 2ITMA 4NO7A 4H03B 4MLHA 3CERA 1KAZA 1NGGA 1E4FT 3W0LA 4H5NA 4KBOA 4A61A 1R59O 2FF6A 3O5BA 2ASOA 2KHOA 4CZJA 2P9IA 1HKBA 1NGIA 2NZTA 4RWTA 3A8YA 4BRNA 1NMDA 2ASPA 3ZX2A 4B1VA 2GELA 2YCHA 3F9MA 4CZEA 5EVZA 4PL7A 1BU6O 4FWKA 3WXIA 3O6WA 4WYBA 5AZIB 3VOVA 3U8XA 2D0OA 4BRMA 2E88A 1GLCG 4IXCA 1S3XA 2HOEA 4FOEA 2A42A 1ZC6A 2P9UB 3M3ZA 1BOTO 3TU5A 2ZWHA 2GEMA 1NM1A 1BO5O 3IFRA 3KVGA 5E84A 1C0FA 3UKRB 2A41A 4PKHA 1ESVA 2P9SA 1T44A 4BRPA 2FSJA 1XC3A 3EO3A 4B1XB 3DJCA 4JN4A 1GLJO 4CBWA 4FWMA 3IMXA 4CBUA 5KQDA 2Q2RA 3SLCA 3ZX0A 5ELZA 5BPMA 4PKGA 1U2VB 2P9UA 4NB4A 4B1ZA 4BRCA 1NBWA 5KPTA 3UKRA 3MMVA 2QWMA 3A5LC 1T6CA 4FWSA 3O1WA 4XH1A 2UYTA 3FLCO 3WXKA 3LDLA 2D4WA 4HWIA 3BP8A 5KPRA 3U9DA 4A2AA 3H45C 3LM9A 4Z94A 1GLBG 4CD1A 1ATRA 2E1ZA 4FWLA 3B8AX 1MWKA 2QWLA 3FZFA 5BRHA 1U2VA 2ASMA 2I7NA 3A5MC 4FWRA 5F1XA 2GUPA 4B1YB 1D4XA 1IG8A 2NRHA 5CE3A 3CETA 4PL8A 4L3QA 1MDUB 2A3ZA 5FPEA 3ULEB 4C23A 1E4GT 1NWKA 2VYPA 2E2NA 3EKUA 2FF3B 3VEYA 3AARA 5AQXA 4WQ5A 4CBXA 3UE5A 4DCHA 5FPNA 4JHDB 3GDQA 1WUAA 3GG4A 4MO4A 2J4RA 5KQ8A 3CIPA 1EQYA 4H5VA 2I7PA 2CH6A 3WUHA 4K25A 5AR0A 1X9JA 2YJEA 1MWMA 3R6MA 5AQHA 3MN9A 3AY9A 3S41A 4BRGA 4BR9A 5I9EB 3WQTA 3ID8A 4ISGA 4CI6A 3TPQA 3A5OC 3VF4A 5AQMA 2HMPA 4BR2A 1ATSA 4WQ5C 3GBTA 3C7NB 3W3DA 1T6DA 3EN9A 1Z05A 2QWRA 4JHDA 1KAYA 4CJ7A 3LL3A 5JLFA 3LM2A 3MN6A 2A40A 3FGUA 4I6MB 4B1WB 3VEOA 4DHYA 2HF3A 5AQWA 1QHAA 2E8AA 4CZGA 5BN8A 5AQIA 4BRHA 4QS7A 3ZEUB 3JXUA 3VEWA 5AQGA 3C7NA 2GTDA 4WQ4A 3DXMB 4A62A 2DPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HHVA 4DUZK 2ZJQL 1RDBA 2ZQBA 5CY4A 4FSVA 2Q97A 1XNRK 3DWLA 2P9SB 1BDGA 3CCJN 5IWAK 3HSCA 4DFKA 2ZM6K 3GOIA 2KFZA 1EKEA 4FYDA 2FXUA 4JI7K 2QWOA 3PUFA 4AILC 4CEQA 1RTIA 2O8EA 3THXB 2HBJA 3DXMA 5BPNA 2RHKA 4GMJB 1XQSC 3PX6A 3TI0A 4Y1CA 3RWUA 4WCEL 2HVIA 1Q18A 3AA5X 3MN5A 3QIOA 3CCLN 3JAMO 1NGBA 4BE0A 1N34K 4CZHA 4PWDA 1BI4A 2HHQA 3VQ5A 4N56A 1EWQA 3TSPA 4FJKA 3KLHA 4OKKA 1UOCA 1RNHA 3LP1A 5J2MA 3ZLJA 1S5JA 1VSMA 4H4MA 4EZ9A 1UA1A 2OA8A 2YNIA 3E1YA 4DR4K 4G1QA 1S9GA 1Q8IA 1TUUA 3VQEA 3HTVA 4CJ4A 4QOZB 3FE1A 1SL1A 1BQNA 3DAWA 5ADXA 4IZ9A 1L3TA 4OO1J 3AA3A 2V7YA 1A5VA 3VQBA 1RBUA 4DV4K 3ZT2A 2F9WA 1DLOA 2EX3A 3UB5A 1QSYA 4RTFD 5EOYA 2E20A 3KKSA 5AQJA 5TKYA 4H0VB 4CHPA 3F2KA 1G15A 1D5AA 1H1VA 2P9NA 2DTUA 3L2QA 4CESA 1K8KA 1YAGA 3O9RA 5FRNA 5C12A 4OX9K 3DLBA 3I33A 4JS5A 4PA1A 5JLHA 4EIAA 4DSEA 1RTDA 1ATNA 4JI5K 4CEDA 1BISA 3AO4A 4LH4A 4DFJA 1C0GA 2O8BB 1DTTA 1OH7A 4LF5K 4I7FA 4NXNK 3QFUA 3I55N 5SWMA 3CMEN 2Q3SA 3AVKA 2E4LA 1WSGA 3ALYA 3P5JA 4H0TB 2P9PA 1YTUA 2IVPA 2AJQA 3P38A 4FK2A 3NHGA 2QI2A 1W2BM 4NYFA 3OS0A 3HT3A 4YFUA 4DB3A 1F21A 3OTOK 2QXFA 2KKZA 1LW0A 1ZXOA 4DG1A 3PY8A 1RDWX 4B9TA 3HYFA 1BIUA 4B3RK 4KKOA 3VQ6A 4NXMK 3SAHA 3DXKB 2YV0X 3OYLA 3M1FA 4CJLA 4R5PA 3TTDA 4LF6K 4FZYA 1S1XA 3THWA 2E6MA 4DSLA 3MCPA 1J53A 4XJXA 4K8XA 3OYIA 4BG8A 4H4OA 3RMDA 2O8DA 2P1JA 4WFAL 4CW7B 1QVFM 1XMQK 3IS9A 4JI6K 4N5SA 4KPYA 1NK5A 2NRRA 4CGJA 2P9LB 4ISEA 3JYTA 1ZBLA 3MAQA 2G8WA 5C15A 3SUNA 5FPMA 4DSFA 3O08A 4HCCA 4EHUA 3JSMA 3V1OA 4DTJA 2G8IA 3OHRA 2W6KA 3P1GA 3CQYA 4A5BA 3OYFA 2PYJA 3C6UA 4CF2A 5M1KA 1Q82O 1G99A 2YNFA 4JD2B 2HF4A 2GV9A 3PSFA 2HNZA 3LPTA 5K14A 2W42A 4O4GA 5AQYA 1VAZA 5M1OA 4IWVA 3QFPA 3KD1E 4KH6A 3LDQA 2JGUA 1X1PA 1HNWK 5IT9O 4JKGB 3CC7N 1KSPA 5AQZA 2BDPA 1RBSA 4KHUA 3P4IA 3QERA 2O8FA 5HLFA 4XH4A 3S3OA 4YOYA 2OPRA 3ENHA 2FC0A 4I2PA 1RDDA 1SQKA 4U7BA 2WFBA 1FKOA 2UUBK 5FLXO 3WEEB 3VEVA 4FW2A 3T3FA 3PV8A 3NF9A 1NGDA 1UAXA 1BG3A 1NK4A 1LW2A 1YF5L 3HVTA 2Z1IA 3ITHA 2QEXN 5SZTA 4KV8A 4ZTFA 1RILA 1V4SA 1JXEA 1TVRA 4BDPA 4B9QA 1YUWA 3ZT3A 1VSIA 4CJWA 1S22A 3A0IX 3CJBA 4FM1A 3ZSVA 4B9SA 1C1BA 4FPBA 5AQLA 1DTQA 1T3VA 3H1VX 1BCMA 3O9UA 3VQDA 4CERA 1QZ6A 3SMPA 3RMCA 3G0ZA 1D9DA 3C6AA 3ISNC 2P9IB 4O55A 4MO5A 4OPJA 3OBWA 4A59A 4YOWA 1N8RO 4CIGA 3PLAA 4FJ7A 4DU3A 1TL3A 2ITGA 3HRGA 1B9FA 4AF1A 3L3UA 3MXMA 4HCBA 1KAZA 4BE1A 3W0LA 3HL8A 4E7IA 1HYZA 1R59O 5CZ1A 1Q86O 4PY5A 1UWBA 4DU1A 2KLAA 3ZSOA 3K5LA 4BRNA 4KO0A 2ATQA 1JXBA 3ZX2A 1RTHA 1VSDA 2GELA 4FVMA 3ZCMA 4PL7A 3DMJA 1BU6O 3WXIA 4M3WA 3NF8A 4I2QA 3AVAA 4BRMA 3J7YP 3CD6N 1VHXA 5H1SQ 1S3XA 3TAFA 4CGHA 2HOEA 2NRWA 3TAEA 2A42A 4KHPK 3KLEA 1N5YA 3KKRA 3CM5A 1J5OA 1BOTO 3NAEA 2ZWHA 2GEMA 3IFRA 3RMBA 4Z0UA 1EXQA 1W0HA 1KCFA 2A41A 1ZBIA 2WTUA 4K0KK 5GIPA 3NDKA 4M3ZA 1TKDA 3K9KA 3EO3A 3ZSWA 3HO1A 4B1XB 4JKDA 4FWMA 1HNIA 5KQDA 3OYAA 4KHSA 4A57A 2UU9K 3ZX0A 4OKEA 1T7PA 1RDCA 1XNQK 4PKGA 4AH9A 4CJFA 3KK1A 3K57A 1S1UA 1NK8A 3B6OA 1Z25A 1R0AA 2QWMA 2YHAA 1IKYA 2ETJA 4OPKA 3O1WA 2UYTA 5GAGP 3Q7CA 3WXKA 2D4WA 4DV0K 1VRTA 1HJRA 1DT9A 5KPRA 4A2AA 1TGOA 3H45C 5DMRA 4BWMA 3NH2A 2QK9A 1RDAA 1S1VA 4FWLA 5KGXA 1MWKA 2QWLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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