2P9SB

Structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with atp/mg2+
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
TGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 54
structure length 197
sequence length 197
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9sB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9sB02
4O5FA 4K25A 4BRCA 2I7NA 2Q2RA 3ATVA 2BTFA 2GUPA 4RWTA 4WQ4C 5BRDA 5EX5A 3GG4A 3GOIA 5AQTA 4BC4A 1OKJA 2HMPA 4IJNA 2V7YA 2D0OA 5ADXA 2GWKA 2VCPA 5JLFA 4BVOA 4FWMA 2P9NA 3EZWA 3UKRB 5AQKA 1WOQA 4Z94A 3CQYA 4AM6A 1IG8A 1LOTB 3VF4A 1Z05A 4H0PA 3U9DA 2E2OA 1HUXA 4XH1A 3I33A 2P9IB 4H0VB 3R9PA 2P9KB 3DXMA 2FSJA 2ITMA 5EVZA 1MWKA 4FL9A 1NGBA 1X3NA 3CJCA 3DXKB 3EL2A 3BF3A 1QQMA 1NGAA 2Q97A 4CD1A 1E4GT 3EN9A 3MN9A 4K41A 4CBXA 2QM1A 1YXQA 2QWOA 4CZIA 3CI5A 2FF6A 3VERA 1NGFA 3GE1A 3ID8A 1ESVA 1G99A 3A5LC 3FGUA 4B1WB 1TYQB 2CH6A 3VF2A 1BDGA 3KHYA 1YVNA 4IWVA 5AQRA 3QB0A 2P9LA 5BRHA 4BRAA 4PKIA 1DKGD 1U6ZA 1ZBSA 4DHYA 2E1YA 4BC5A 1IJJA 2FSNA 3MDQA 3BUZB 4BGAA 5I9EB 4CI6A 2YHXA 4BRFA 3IFRA 3LDQA 4A62A 4H5WA 4L3QA 1HPMA 3ENHA 2Q1NA 3CETA 3ZETA 3F9MA 3VEZA 3WEEB 1QQNA 1QHAA 4BRDA 2HOEA 2GTDA 1NGHA 4H0TB 1QZ6A 2V51B 3WXLA 4EIAA 2E8AA 5ELZA 2HF4A 3OHRA 3MN7A 3SMPA 3D2FA 3CHWA 4CZGA 3VGKA 1GLDG 2PAVA 3UE5A 4ISGA 4FOIA 5BREA 2GEMA 4PKGA 3FFKB 1S3XA 2CGLA 3L6QA 1BA0A 1NGDA 1T44A 3GBTA 3JXUA 3O1WA 1RDWX 2BUPA 4FWLA 5E84A 5AQJA 1XC3A 4PL8A 1Q18A 4PL7A 4QS7A 4CZJA 3I8BA 1MA9B 3CJAA 5AQUA 3MCPA 1SZ2A 2NLXA 3M6GA 3O08A 4EAHD 4I6MA 2AP1A 4BRGA 3QBWA 5AQPA 4FWQA 1GLEG 1RGIA 4JHDA 2NZTA 4DQ8A 4NB4A 3DAWA 3FE1A 3DWLA 3KZBA 1YUWA 3SJHA 4BQZA 3D2EB 2D4WA 1NLVA 3CJBA 4CZHA 4FWOA 1T6CA 3H46O 3VENA 3FZKA 3TPQA 1DGKN 5BN9A 3ULEB 2E1ZA 1H1VA 2YHWA 4LC9B 3MMVA 3U4LA 1Z6RA 3QFPA 1K8KA 2WUSA 1BO5O 5BPNA 4YDUC 2HF3A 3VPZA 1TUUA 3P4IA 5AZJA 3BF1A 5AQXA 4BR9A 4BRPA 3HM8A 4FWSA 2P9PB 4M63C 4CJ7A 3UKUA 3ZETB 4FPBA 1NM1A 2CGJA 5AFUH 4ISFA 3WXIA 4J8FA 4BC3A 5AR0A 5KQ8A 2UYTA 4FWRA 3ZEUA 2A41A 5BN8A 4H5TA 3H6EA 4BRKA 4CZMA 2W40A 4A2BA 3C7NA 4H0YB 2NRHA 3H45C 1NGIA 4MLEA 4BVPA 2YI1A 3IMXA 5JMVA 3A5NC 1DEJA 2VWBA 1JCFA 2E2PA 1X9JA 2ZGYA 3MN6A 3O1BA 1TUYA 2GELA 4BREA 4GY2B 2D0PA 3DJCA 3J8AA 5AQGA 1NGCA 3GL1A 5JICA 5B8HA 4I6MB 5BRFA 2Q0RA 5AQNA 4JN4A 1GLFO 3VEVA 2QWQA 4XH4A 4EHUA 1C0GA 1X3MA 3MN5A 3BEXA 3SLCA 4B1YB 5F0XA 2A3ZA 3O8MA 3W3DA 3LDOA 2P9UA 2Q0UA 1U2VA 3FZHA 4DB3A 2FSKA 3L0QA 3FZMA 3WT0A 3ZX0A 2W41A 3G25A 2CH5A 1QZ5A 4FWKA 3QBXA 2P9SA 1KAZA 1NBWA 4WQ5A 5LJWA 1GLAG 3LDPA 4BR5A 4IXCA 4DCHA 3EO3A 2A5XA 2QWRA 5TKYA 4BRIA 3RSEA 3A8YA 1BA1A 3AAPA 5ADXH 3HSCA 5KQDA 3FZFA 1XUPO 4EFHA 3BP8A 4BRLA 5AQOA 3TU5A 1CZAN 2P9NB 2IVNA 1EQYA 4NO7A 3ZX2A 3GDQA 2V7ZA 3CIPA 4FWPA 3VETA 1Y64A 1J6ZA 1BWFO 3WXJA 3FZLA 4BG9A 3CJ1A 3VEXA 3ZEUB 5EOYA 4B1UB 4MO4A 5FPMA 2QWPA 3UKRA 4BC2A 5CE3A 1KAXA 3D7EO 4CD3A 2VYPA 2ZWHA 3O80A 5JLHA 3DXMB 3IDHA 5AQVA 3O6WA 4H5RA 3WUHA 2E2NA 4B1ZA 3VEYA 3HTVA 4WQ4A 1LCUA 2F9TA 4BR2A 3ENOA 4CZKA 3W0LA 1QQOA 2Q31A 2P9IA 3CERA 5KPZA 4BR0A 2I7PA 2E20A 4BR7A 5AQSA 2AA4A 1D4XA 3B8AX 1XQSC 4H5VA 3CQXA 4PKHA 3O5BA 5F2RA 5LY3A 4JD2A 3VOVA 3MK6A 2P9LB 2ASPA 1U2VB 4JNEA 4RTFD 4BRHA 3U9ZA 4Y0WA 2ZF5O 2QWLA 1TYQA 2OANA 5AQFA 3UB5A 2P9SB 3C0BA 4FOEA 2H3GX 1P8ZA 1BUPA 2GWJA 1JCEA 3LM2A 3RSEB 3ZX3A 5KPTA 3LM9A 4E1JA 3VGLA 3R6MA 1R59O 3H1VX 4M7XA 1ATRA 5FPEA 1SQKA 3CJ9A 4K43A 3KVGA 4H0OA 1S22A 3D2FB 5AQQA 3HI0A 2IVOA 4KBOA 4BRNA 1RFQA 3M1FA 3VGMA 2DPNA 3WEEA 3CJ7A 4WYBA 1E4FT 4EHTA 3H3NO 2ASMA 4B1VA 2A40A 3AARA 3U8XA 3A5OC 4BROA 5AQLA 3LL3A 5AZIA 2IVPA 5EY4A 2A6AA 2J4RA 5BR9A 1V4TA 4RCHA 3EKSA 2FF3B 1GLCG 4XH5A 4H0XB 1HLUA 3H1QA 3VEWA 3VESA 3HBTA 3QFUA 4B9QA 1BOTO 4JHDB 4BG8A 3WQUA 3QDKA 4ISEA 4B1XB 5F1XA 1NGGA 3S41A 3LDLA 1YAGA 1V4SA 3AAQA 5AQIA 1NGEA 1GLBG 4CZEA 1HKBA 4JD2B 3FLCO 1HKCA 4A61A 1WUAA 3D2EA 3HZ6A 5EXWA 1NWKA 2A42A 1C0FA 3QICA 1K8KB 3AY9A 2PBDA 3SK3A 3ULEA 5AQYA 2QXLA 2KHOA 4CBUA 5E26A 2D1KA 5AZJB 3JS6A 2QWNA 1MDUB 3L4IA 4HTLA 1ZXOA 3UKUB 2YJFA 3VEOA 5FPNA 2E2QA 4FO0A 2CGKA 4H03B 4IZ9A 4C23A 3M3ZA 3ATUA 4IJAA 4CBWA 4QS9A 1BU6O 4CZLA 1ZC6A 2P9PA 4MLHA 1BG3A 5AQHA 2QW9A 1GLJO 4BR4A 4AM7A 3A0IX 4IO8A 4JAXA 2ZGZA 4M7YA 3C7NB 3FR0A 3A5MC 4BRQA 5AFUA 2YCHA 1T6DA 3LDNA 4HWIA 4YDUA 3R8EA 1HKGA 5AZIB 5FPDA 2ASOA 5AQZA 1GLLO 2P9KA 1HX1A 2IIRA 2Q36A 1NGJA 4O8KA 5AQMA 3QMLA 3DXKA 4BGBA 1SAZA 3IUCA 1ATNA 4FSVA 4WQ5C 3WQTA 2EWSA 4XEIA 3WXKA 5BPLA 4FWNA 4FPAA 5LJVA 3VF6A 1KXPA 2F9WA 4MO5A 2E88A 4F9OA 5BPMA 2FXUA 4H5NA 2P9UB 5AQWA 4GNIA 3O4WA 4BRMA 1JCGA 1NMDA 3SMSA 2YHYA 4K42A 2V52B 3H3OB 5KPRA 1HJOA 4BQLA 2FLOA 4CZFA 1MWMA 4QS8A 1KAYA 4A2AA 2YJEA 3EKUA 1ATSA 2QWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TSXA 1RDCA 5DM7L 2Q2RA 3CFOA 2F4VK 3QEWA 1TAUA 3LZJA 2P5GA 4BC4A 4BDPA 2A1SA 1OKJA 4CEFA 3L3VA 1S1TA 1LWFA 4CW7B 2HHVA 1T8EA 2GWKA 3JYTA 1C1BA 5JLFA 1KQSM 4CJFA 4CFAA 2P9NA 2JWLA 5JS1A 1WOQA 4DS5A 4AM6A 2KW4A 3VF4A 2E2OA 1XMQK 1L3VA 2P9IB 3SQ0A 4DR6K 3I56N 2D0BA 4OPHA 1X3NA 1NK0A 4JV5K 4UY8O 2HNYA 3K5OA 3PUFA 2Q97A 3PX6A 3EN9A 3MEGA 4LF4K 1RBSA 3BDPA 1YXQA 2QWOA 4IFEA 2UUCK 4BE1A 3CI5A 4M42A 3GE1A 5FROA 3MX2A 3SUQA 1QSSA 1ESVA 1J54A 5J2MA 3THWA 2ZQBA 1YVNA 4FJJA 1T3VA 4BRAA 1U6ZA 2VG5A 5M1OA 1IKWA 3BUZB 3P1GA 1Q9YA 4CI6A 2YHXA 4KTQA 3PV8A 3HPHA 4H5WA 4L3QA 4OLBA 1SL1A 3DMJA 1Z26A 4CGIA 4BWMA 4E7JA 4CJTA 3DOKA 1KSPA 1S1XA 3KK1A 1NOYA 3ZETA 4Z4CA 2ZJPL 4IDHA 4F3OA 3WEEB 4DV6K 1QHAA 2HOEA 2GTDA 1P90A 4H0TB 3WXLA 5ELZA 2HF4A 2XHBA 4N56A 2NRXA 5GIPA 1HQUA 1VQ6N 4CZGA 4GVMA 3LP0A 1WBDA 2YNGA 3UE5A 5BREA 1S6PA 3CFRA 4DKWA 4HTUA 4OO1J 3L6QA 1JLAA 1NK8A 3OYJA 3T7ZA 3V4IA 4FWLA 5AQJA 4CK1A 2HMIA 1XC3A 1RDDA 4F3TA 3U6FA 3RRGA 1J53A 4CZJA 4PL7A 3MCPA 3KKSA 3KWIA 4I6MA 4FWQA 3ASMA 1GLEG 4CHPA 4E1NA 3RMDA 4BE2A 3DAWA 3WXMB 3DWLA 1CZBA 1JKHA 3KZBA 1YUWA 4PQUA 1EO1A 4BQZA 1B92A 3D2EB 4FJ9A 3BGRA 2G8WA 3VQDA 1RCHA 1QE1A 4JI0K 4JRQA 2YHWA 3OYCA 4EP4A 1C1CA 3QFPA 4DLEA 1LAVA 1BO5O 3PIOL 2HF3A 3DRPA 1CZ9A 3VPZA 1QS4A 1BHLA 1TUUA 2BE2A 3LWMA 3BF1A 5AQXA 4Z4FA 3HM8A 4CJ7A 3TAMA 5M1PA 3QESA 2CGJA 4M3ZA 4LF9K 2X6NA 3LP1A 5AR0A 3L2UA 3SV4A 4DQIA 2P51A 3CC7N 1Q86O 3H6EA 1RT5A 1RDBA 1KC8O 3C7NA 1KVBA 2NRHA 4FZZA 4HUGA 3K5LA 2YI1A 4M3YA 2VWBA 1JCFA 4LY7A 1SKWA 1TUYA 3IS9A 3J7AP 1HJRA 1VSEA 2D0PA 5AQGA 1ITGA 1NGCA 1KD1O 3NH1A 3ZCMA 2Q0RA 5AQNA 2UU9K 1YJNN 4E7KA 3SNNA 1NNEA 4EHUA 2RE2A 1TV6A 1X3MA 3E1YA 4FK2A 1C0MA 1U2VA 4YNQA 1C1AA 3L0QA 1JLFA 3FZMA 3WT0A 3ZT0A 3ZX0A 4B9VA 2W41A 3G25A 3N4PA 4FWKA 4KHYA 1U04A 3KK2A 1KAZA 4WQ5A 4KHSA 4ID5A 1IO2A 2GX9A 3MXMA 1C0TA 3O3FA 3CCUN 3HSCA 5KQDA 3K0SA 3M8RA 4L8RB 4LSLA 3O4NA 3BP8A 3HPOA 3J7ZO 3VQ7A 2P9NB 3PX4A 1TK5A 1JLEA 4Y1CA 1RT6A 3ZX2A 3I0RA 4LF8K 3B6PA 4FWPA 1Y64A 3QEVA 3WXJA 3FZLA 3T19A 3ZYYX 4CIEA 3M8PA 3VQ6A 4MO4A 2G8FA 4X62K 3UKRA 5CE3A 1KAXA 1NJWA 4CD3A 4KREA 2FBTA 2ZWHA 5BR8K 4B3RK 5AQVA 1VQ9N 1YIJN 4H5RA 4B1ZA 3M8SA 3TTCA 3U3GA 2KLAA 4DLGA 4GV6A 4CZKA 1VQMN 2HHTA 1QQOA 3HYFA 5DK5A 5J2QA 2WFBA 4BR0A 1ZBHA 1NJIO 4B3OA 1JL2A 3F73A 2VWJA 4C1NK 1S6QA 2X6SA 3NF6A 1XQSC 3CQXA 4PKHA 3O5BA 5LY3A 1HRHA 4B9UA 5HROA 1DLOA 2I5JA 1YJ9N 2ETJA 3ISNC 3L2QA 3HM9A 5DM6L 5AQFA 3UB5A 2P9SB 4FOEA 2H3GX 4E72A 3T1AA 3R1XA 3LM2A 1JL1A 3O9SA 4KH4A 4JI5K 3SQ4A 2HVHA 4X64K 4E1JA 2OZMA 4YOWA 3R6MA 3H1VX 4CF2A 3CJ9A 3HOSA 4KHQA 1YF5L 2IVOA 4KBOA 4BRNA 1RFQA 4DSEA 2DPNA 3CJ7A 1ZYQA 2ASMA 2A40A 5JS2A 1VSHA 4DUYK 3CC4N 3LL3A 2IVPA 5EY4A 2A6AA 3ZT2A 1U4BA 3SZ2A 2J4RA 3EKSA 4H0XB 1U47A 3K9JA 1HLUA 1W0HA 4GKKK 5H1SQ 3NBPA 4BG8A 5KGWA 3WQUA 2O8DB 2JGUA 1N32K 4MFBA 3QERA 4ZTFA 1RBRA 3LDLA 4CEBA 1V4SA 3CFPA 2WBNA 4JKBA 4DU4A 1SL0A 4I9QA 1GLBG 5HRSA 3OYMA 3AVCA 3ZSYA 3K9KA 1LAWA 3FLCO 4DR3K 4RW8A 4FLTA 1ZBUA 5FLXO 3L8BA 1B9FA 1C0FA 2PBDA 5K14A 3ULEA 4CGGA 4HHTA 2KHOA 4AHSA 4CBUA 2BGGA 3MEEA 4AH9A 1MDUB 3L4IA 4DV3K 4HTLA 2D0AA 3VEOA 3TABA 4N76A 4H03B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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