2P9UB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with amp-pnp and calcium
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
248
structure length
222
Chain Sequence
TEPPMIQAVLTLYQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 59
structure length 222
sequence length 248
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9uB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9uB02
4BRNA 1QQNA 1IJJA 1WOQA 4EIAA 2GUPA 4CZFA 1BO5O 3VETA 3CJAA 3LM9A 4XH1A 4M7XA 1NBWA 1BWFO 1HLUA 2P9UA 4BG9A 5I9EB 2E2PA 4WQ4C 5EXWA 4RCHA 4PKGA 1H1VA 4JHDB 4H0YB 5AQPA 4I6MB 3MMVA 3WEEB 4B1ZA 3R6MA 5FPDA 1NGEA 4JD2B 3ZEUB 2I7PA 2IIRA 1T44A 1SQKA 1ATNA 1Y64A 2FSNA 4HWIA 2E88A 3CJ7A 1GLFO 2Q0RA 2V7ZA 4PL8A 3EO3A 5AQZA 3CETA 4FWRA 5AQQA 3M6GA 3VEVA 3M3ZA 2YJFA 1GLEG 3VEZA 4H03B 3ATVA 2FF3B 3MN6A 3CERA 4BQLA 5FPNA 1X3NA 4CZEA 4BR2A 2EWSA 4YDUC 2P9PA 1Z6RA 3JS6A 1NMDA 2V51B 3QFPA 2YHYA 1X3MA 1E4GT 2DPNA 3ULEA 1D4XA 4MLEA 1TUYA 3O6WA 4CD1A 5E26A 3L0QA 1SAZA 3WUHA 5E84A 3VOVA 4FL9A 4XH5A 4QS8A 3LDLA 3ZX2A 3AAQA 4EAHD 4H0VB 2HF4A 1HKCA 3CJ9A 2AP1A 2Q36A 4O5FA 4QS9A 3IFRA 3DJCA 5B8HA 4XH4A 3UKUB 3DAWA 2CGJA 4H5TA 4QS7A 4CI6A 4E1JA 3H1QA 2HOEA 2HF3A 3TPQA 3C0BA 5CE3A 4FWLA 4JNEA 2P9IB 4BRLA 1MWKA 3WXJA 4ISGA 4BVOA 5AQKA 2A40A 3ENOA 3GDQA 3H3NO 3O4WA 1GLBG 1RGIA 3QDKA 3A5OC 4B1XB 2P9LA 3FGUA 1GLDG 4BGBA 4CZJA 3CI5A 1HJOA 2D1KA 2YI1A 2ASMA 4XEIA 3EN9A 3VF6A 4BC5A 5AQUA 1QHAA 1K8KB 3O5BA 4BRHA 2ZGZA 3EZWA 2QW9A 5EY4A 3EKUA 2CGKA 3H45C 2P9UB 1KAXA 2QWLA 3QFUA 5BRHA 2Q0UA 4B1UB 3LDNA 1XQSC 2KHOA 3U9DA 4CZIA 2QWQA 2P9KB 5AQVA 3BP8A 3FZMA 5AFUH 5KQ8A 3LDQA 3EL2A 4BRFA 4BRGA 4BC3A 3C7NA 3UKRB 3BF3A 1Z05A 2GWJA 1RFQA 5JLHA 1BU6O 3DWLA 4FWQA 4DCHA 3R8EA 3GOIA 3I33A 4BRDA 1S3XA 4DHYA 1MA9B 1U6ZA 4CD3A 2QWNA 1GLJO 1KAZA 1NGCA 2BUPA 1QZ6A 5F0XA 3KVGA 5AR0A 4BR7A 1GLLO 2A42A 2P9PB 4CJ7A 1X9JA 3BUZB 5LY3A 4WQ4A 5AFUA 4FWMA 3ULEB 1Q18A 3DXKA 3WT0A 4Z94A 5AZJA 2P9NA 4IXCA 1BA0A 1NWKA 3OHRA 4JAXA 4DQ8A 1TUUA 2QWOA 1BA1A 1ZXOA 3ZETB 5BREA 1NGDA 4BRMA 3LDOA 3VEYA 3A5MC 4BG8A 2E2NA 1KXPA 2FLOA 4H0PA 5EVZA 5TKYA 5AQFA 5BN8A 3LDPA 3W0LA 4BQZA 4FPBA 2V52B 2FXUA 4H0XB 3WXKA 3FZFA 3R9PA 1E4FT 4EFHA 3H1VX 3D2EB 1T6DA 3A8YA 4WQ5C 1YUWA 4MO4A 5LJVA 5BRFA 4YDUA 3VESA 2P9LB 1NGHA 5AQHA 3SJHA 4K41A 2GWKA 1GLCG 5AZIA 3RSEA 1LOTB 1ATRA 4DB3A 1YAGA 2NLXA 3VERA 3U4LA 2ASOA 3O80A 3WXIA 4BRIA 1JCFA 3SMSA 4BR0A 4CBWA 1V4TA 1LCUA 3VENA 5AQXA 1BOTO 3CHWA 3MK6A 2P9SA 1DGKN 4RWTA 4A62A 4FSVA 4FWKA 3U8XA 4BGAA 2WUSA 1HUXA 3CJ1A 3ZX3A 4HTLA 4B1YB 1EQYA 1R59O 4FWPA 5ELZA 3MN9A 3AARA 1NGFA 3ATUA 1QQMA 3MCPA 1MDUB 4NB4A 4IWVA 4JN4A 3IDHA 3IMXA 5JLFA 1TYQB 2A5XA 2E2OA 5AQTA 1NGIA 1GLAG 3C7NB 1QZ5A 1U2VB 3A5LC 5AQLA 3IUCA 5KPZA 3GBTA 4IZ9A 5AQJA 5AQNA 3J8AA 4I6MA 3L4IA 2YHXA 3BEXA 5BPMA 3KZBA 2GELA 5AQSA 1NGBA 3FZHA 4BR5A 5AQWA 5AQGA 3D7EO 2IVNA 4BRAA 4EHUA 4H0OA 2UYTA 2E2QA 3SMPA 1DKGD 4M7YA 3DXKB 2IVPA 5AQIA 4BR9A 1BDGA 2YHWA 5KPRA 4ISFA 1NM1A 4FWNA 4A2AA 2AA4A 4J8FA 2YCHA 3HSCA 4Y0WA 3QICA 1XC3A 1J6ZA 1SZ2A 3U9ZA 3ZX0A 2W41A 2D4WA 3I8BA 1RDWX 3H46O 1KAYA 4M63C 1BG3A 2ZF5O 2YJEA 2D0PA 2J4RA 1OKJA 5EX5A 5BRDA 4FWOA 2QWMA 4IJNA 3UE5A 3UKUA 3WXLA 3RSEB 5AZIB 5KPTA 5FPEA 4CZKA 2E1YA 3CIPA 5BR9A 3CQYA 4K42A 3LM2A 5AQRA 3H6EA 5LJWA 3FR0A 4MLHA 1QQOA 2HMPA 1T6CA 2P9SB 4BRCA 3AAPA 5F1XA 2VWBA 1NGJA 2A3ZA 3D2FA 4IJAA 3VEOA 4BRQA 1JCGA 4BRPA 2VYPA 5EOYA 5ADXH 4CBXA 2I7NA 4K25A 3S41A 3F9MA 3FZLA 4GY2B 3P4IA 3GL1A 4WQ5A 3VGMA 2ITMA 1YXQA 1K8KA 2E1ZA 3VPZA 3ENHA 3FLCO 3LL3A 2PBDA 4AM7A 4KBOA 4F9OA 3W3DA 3VEXA 1NGGA 4B1WB 2FSJA 3MN5A 3BF1A 3VF4A 3DXMA 5KQDA 1NGAA 2QWRA 3VF2A 4MO5A 4BC4A 2P9KA 3FE1A 2PAVA 4B1VA 4K43A 3HM8A 2CH6A 1HX1A 1WUAA 2IVOA 4PKIA 2ASPA 4IO8A 3CJCA 5ADXA 1NLVA 3UKRA 4CZGA 1HPMA 3L6QA 4H0TB 2Q2RA 1IG8A 3A0IX 5AQMA 4PKHA 2V7YA 5F2RA 2ZGYA 3GG4A 1JCEA 4RTFD 3WQTA 4A61A 3HBTA 3KHYA 5JICA 3O08A 1G99A 1ZBSA 5FPMA 4CZLA 1ATSA 4CBUA 4CZHA 2CGLA 4WYBA 3HZ6A 1ESVA 1CZAN 1HKGA 3AY9A 2Q31A 4FOIA 4B9QA 3UB5A 3FZKA 2QXLA 3CJBA 3JXUA 3QMLA 4FOEA 3ZETA 1V4SA 4JHDA 4H5WA 1C0GA 3H3OB 3HI0A 2OANA 5BPNA 3WEEA 5AQOA 4FPAA 4LC9B 2VCPA 4JD2A 3VEWA 3ZEUA 2BTFA 3O1BA 2NZTA 2Q1NA 2ZWHA 4A2BA 3EKSA 2A6AA 3SLCA 1P8ZA 5JMVA 3D2EA 1HKBA 5AZJB 3MN7A 2P9NB 4FO0A 3WQUA 4L3QA 1XUPO 4BREA 4BVPA 4H5VA 3D2FB 2QM1A 2F9TA 2A41A 4O8KA 1S22A 4BROA 3O1WA 2Q97A 1ZC6A 2CH5A 4BR4A 4AM6A 4GNIA 2GEMA 3GE1A 3MDQA 3QBWA 3TU5A 5BPLA 5BN9A 2NRHA 2FSKA 1YVNA 3VGKA 2W40A 2QWPA 4EHTA 3CQXA 3SK3A 1BUPA 3DXMB 3VGLA 1MWMA 2E8AA 4BC2A 4H5RA 3FFKB 4H5NA 3QBXA 5AQYA 1TYQA 2GTDA 3M1FA 2P9IA 4C23A 1U2VA 4FWSA 4NO7A 2FF6A 2F9WA 3HTVA 4CZMA 3B8AX 4ISEA 4BRKA 2D0OA 3QB0A 3O8MA 3A5NC 1DEJA 2E20A 4PL7A 3G25A 2H3GX 1C0FA 3ID8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5H1SQ 5M1OA 1QQNA 2O4GA 2RN2A 2BGGA 4IOXA 3TTCA 1BO5O 3CJAA 2XRIA 2O8FB 1KFDA 3SBTA 4BG9A 2E2PA 3QNNA 3KLEA 1KVAA 1HJRA 5A2QO 1H1VA 2FBTA 5AQPA 1HYSA 4I6MB 3MMVA 3WEEB 4X66K 4ICLA 3R6MA 1UA0A 1LWEA 2I7PA 1Y64A 1JKHA 3CCSN 1WSIA 2FSNA 2KFNA 1W0HA 4FJ5A 5J2MA 4AQYK 3LWLA 3EO3A 4NXNK 5FRNA 4F2SA 4JI1K 3VEVA 2IDOA 1U48A 1U49A 3DRRA 2HNYA 3ATVA 3T3FA 3EE9A 3VA3A 4CZEA 2RF2A 2FBXA 1CZBA 3M8SA 3DM2A 3JS6A 1D9DA 1SL2A 2YHYA 4DR6K 2DPNA 1VSIA 1TUYA 2P5GA 4AF1A 5E26A 3KKSA 4CK3A 4QS8A 3ZX2A 1HMVA 1WAJA 4H0VB 3KLHA 3ISNC 1HKCA 2Q36A 4B9VA 1LAVA 3IFRA 3OYGA 5B8HA 3OVNA 2HSTA 3ZYYX 4CI6A 4E1JA 1BQMA 5C12A 4CFBA 2HF3A 3C0BA 5CE3A 1MWKA 1D5AA 2O8EA 1A5VA 4N56A 4G9ZA 3ZSVA 3SJJA 3NH0A 1WSHA 1VQMN 2A40A 3K9KA 4FLYA 4CGIA 4CZJA 3FGUA 4NCAA 3PUFA 1YJ9N 2ASMA 4XEIA 3EN9A 3VF6A 4FK0A 1C1BA 4BC5A 3CC2N 3C65A 5FLXO 4O8UA 1FKPA 3C95A 4BRHA 4NYNA 5IWAK 2CGKA 5GIOA 3TR8A 4CIFA 3QFUA 5BRHA 2HVIA 3NF8A 1T05A 2GV9A 4JEPA 1XQSC 1SV5A 2QWQA 3DMJA 3BP8A 5AFUH 2OYQA 3OY9A 2VWKA 3E01A 4M3TA 3AO5A 3C7NA 3UKRB 2YKMA 1RFQA 2Z1IA 4RW4A 4IKFA 3ZSYA 3QEPA 4FWQA 1B9DA 4DCHA 3OYIA 3R8EA 3GOIA 4WFNL 4ELTA 1MA9B 2QWNA 1GLJO 2KTQA 3NMUA 5CYMA 1QZ6A 5F0XA 3KVGA 1VRUA 3KK7A 4FWMA 1BI4A 1RCHA 3WT0A 4CGDA 1L3UA 2P9NA 4KB1A 3O4QA 1BA0A 3OHRA 1JJ2M 1BA1A 1ZXOA 3CG7A 1REVA 4CEDA 4CFCA 2ZE2A 3K5NA 2HHQA 4DUYK 1NGDA 4DG1A 3LDOA 1UWBA 3VEYA 3TAPA 2FLOA 4NYFA 5AQFA 1NK8A 4CEZA 2QEXN 4JI0K 4CF9A 4FPBA 2FXUA 2YNIA 4IDHA 3FZFA 3THWB 1WBBA 4Z4GA 1VQ4N 2VQFK 3RR8A 3TTDA 4DFJA 4DUZK 1CXUA 4MO4A 5DK5A 5BRFA 3OYMA 2OPRA 3UIQA 4KKOA 1T7PA 2GWKA 3J7AP 4CHPA 4DB3A 2F4VK 3HL8A 3U4LA 2PY5A 4I7FA 4AHSA 1HNZK 3SMSA 5DM7L 3C94A 4K0KK 2VG6A 3M8RA 2P9SA 1DGKN 4AHCA 4A62A 3J81O 1NK6A 3U8XA 4BGAA 4BE1A 3CJ1A 1DT9A 1J5EK 4HTLA 1GOAA 3LANA 2NNWA 4Y1DA 1EQYA 2GUIA 3CFPA 2EX3A 3AA5X 5AJ3K 2DTUA 1LWFA 3AARA 3P39A 2HMIA 3ATUA 1IG9A 4X62K 4DR1K 2ZQBA 1OVQA 2E2OA 4LFCK 3KK2A 4OJRA 1GLAG 3C7NB 3IS9A 3QESA 5J1EA 1X1PA 2WOMA 3NBPA 5KPZA 2WONA 3ZSWA 3BEXA 4CHQA 2GELA 2O8BA 3PX0A 3LWMA 3SCXA 3CCUN 1SKRA 3CYMA 3D7EO 4WFAL 3RMDA 3SMPA 4F8RA 3ZT1A 1BI4B 1KC8O 1JLEA 4DF8A 4BR9A 1BDGA 2HVHA 1W97L 1WAFA 3U6FA 2YHBA 3AA2A 3TAQA 4A2AA 3C6UA 3K0SA 1LV5A 1NG9A 3V81A 4J8FA 1NU0A 2YCHA 4KO0A 5I3UA 4Z4CA 1J6ZA 3V1QA 3ZX0A 2D4WA 3I8BA 3CF5L 1KAYA 4JKBA 1N33K 4FZZA 1JLGA 3B6PA 3P31A 3K59A 3K5OA 3QETA 3ZT0A 1IKWA 3SUNA 3N4PA 4CZKA 1EXQA 2E1YA 2G8HA 4FJHA 1XI1A 3LM2A 5LJWA 1C1AA 3NDKA 2VG7A 4MLHA 1EKEA 4FM1A 1DTTA 2HMPA 1UOCA 2P9SB 4HHTA 4BRCA 3AAPA 2Y1JA 5F1XA 2I5JA 4FCYA 2VWBA 4H4OA 4BRQA 1JCGA 3A2FA 3RMCA 3SUPA 3MXJA 3CCQN 3S41A 3FZLA 3C6TA 3GL1A 1YXQA 1K8KA 2E1ZA 3VPZA 1YVUA 3ENHA 3LL3A 1S1TA 3CFOA 4BWMA 2GBZA 1X9MA 4F9OA 5HRSA 1NGGA 2FSJA 3K5LA 3VF4A 5LL6Z 4DTPA 4YY3K 4BC4A 2XO7A 2O8BB 4FJ8A 4DV4K 4J2BA 4CJLA 2ZJPL 3HM8A 4GV3A 2CH6A 1HX1A 1CZ9A 3BZKA 3KIOA 3CJCA 1C6VA 4JI2K 3OS0A 1IH7A 1HPMA 2A1SA 2KLAA 2ZGYA 1D8YA 4E3SA 1JCEA 5M1KA 3QNOA 4GV6A 2OA8A 4B8CA 4KHPK 1I39A 5HP1A 5JICA 3CXCM 1ZBSA 1NK9A 1HRHA 4CZHA 2CGLA 4KHWA 3U3GA 1XC9A 2JGUA 2NRRA 1HKGA 5C25A 2Q31A 3UB5A 3HYFA 5DMRA 4FVMA 3DLEA 1SS6A 3ZCMA 3FFIA 4H5WA 3H3OB 4FJIA 4PQUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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