2PAVA

Ternary complex of profilin-actin with the last poly-pro of human vasp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the recruitment of profilin-actin complexes during filament elongation by Ena/VASP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 129
structure length 361
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2pavA03
3M1FA 2YHXA 2E88A 5KQDA 5BRHA 2ASPA 4O8KA 2ZGZA 1LCUA 5AZJA 2Q36A 3DAWA 3H3NO 4BRPA 2CGJA 1X3NA 3DXKA 1S3XA 4FOEA 1V4SA 5FPNA 2GUPA 3FR0A 4MLHA 3R8EA 5ELZA 3WXIA 3MN6A 4BC2A 2IVPA 2GEMA 4A2BA 3A5LC 1HUXA 1NBWA 3O80A 2CH6A 2QWNA 2AA4A 2BUPA 3VERA 2I7NA 4FWOA 2IVOA 4FSVA 5AFUH 4BR5A 4JHDA 2FXUA 5AQMA 3C7NA 4A62A 5I9EB 3LM9A 3U9ZA 3VGMA 3AAPA 4WYBA 4B1XB 4NO7A 1J6ZA 3G25A 4CZKA 4DHYA 2AP1A 2P9UA 2P9SB 4CZEA 4H0PA 1NGIA 1U2VB 2NRHA 5E26A 1NGDA 1KAXA 1GLJO 4BR2A 3R6MA 1SAZA 1YVNA 3SLCA 3ZX2A 5AQJA 3BF1A 4BGBA 2PAVA 2YJFA 3AARA 5AQRA 5EVZA 4FPBA 1ATRA 1YUWA 1EQYA 2EWSA 3F9MA 4FWLA 3O08A 2P9SA 2A41A 3QBWA 3ZETB 3VEZA 2HOEA 2W40A 3U8XA 1C0FA 3GDQA 3IMXA 4PKGA 3O6WA 5AQHA 3JS6A 1Z05A 2P9LB 3L0QA 5AQGA 4H0XB 2VCPA 4H5NA 4CI6A 1DGKN 3A8YA 1U6ZA 3O5BA 1Q18A 4FWKA 4BRNA 2F9WA 4DB3A 4I6MA 3CJBA 3DXMB 3WXLA 1KXPA 3HSCA 3A0IX 3I33A 2FLOA 4IWVA 2FSJA 1XUPO 4B1YB 3ZETA 3ULEA 3ZEUB 4BG8A 1QHAA 4FWRA 4PL8A 4BRQA 2YI1A 2YJEA 3BF3A 2Q0UA 4EIAA 4BRAA 4B9QA 5AQTA 4DQ8A 1NLVA 4CZFA 1C0GA 3WXKA 1NGJA 5BPNA 2FSKA 3VF2A 1WOQA 3UKUA 1RDWX 2GTDA 1MWMA 3L6QA 3CJ1A 1WUAA 5AQIA 2FSNA 1JCEA 3LDNA 3VEOA 2P9KB 4PKIA 3CERA 3VOVA 3H6EA 1K8KA 2CGLA 3B8AX 2P9IA 3H46O 3MN7A 2P9PA 4IXCA 1ZBSA 1NGAA 3KVGA 3M3ZA 2E2QA 1QQMA 4Y0WA 2E1ZA 4YDUC 4CJ7A 3S41A 3QBXA 1HKGA 5AR0A 5AFUA 2P9KA 1HX1A 1NM1A 3ID8A 2KHOA 5AQSA 4WQ5C 2E2PA 1H1VA 1TUUA 2QWPA 4NB4A 5AZIA 1GLBG 4BVPA 3MN5A 5AQLA 5JLHA 2I7PA 2E20A 1BUPA 1E4FT 4AM7A 2QWRA 3D2FA 2QXLA 1DEJA 3WEEA 4HTLA 3FGUA 4XH5A 3UKRB 2A42A 4H5VA 4ISFA 3GG4A 3SJHA 4KBOA 4BRKA 2HMPA 4RTFD 5BREA 1BWFO 3CJ7A 2D0PA 3QFUA 4H5WA 1YXQA 4BR9A 3O1WA 1BG3A 4FPAA 4JD2B 4J8FA 5AQVA 3D7EO 3SMPA 4DCHA 2YHYA 2H3GX 1KAZA 2E8AA 2QW9A 1BO5O 3ENOA 3IUCA 3CI5A 2GELA 4H0OA 3ATUA 3LDQA 5F2RA 5EY4A 4E1JA 4IO8A 4XH1A 1V4TA 4GY2B 1GLFO 1Y64A 3AAQA 3VPZA 3VF4A 1BA0A 3VETA 4MLEA 1NGFA 1TYQB 2WUSA 1ATNA 3AY9A 3O4WA 3HZ6A 2FF3B 3DWLA 4XH4A 3MK6A 2ASMA 2QWMA 1XC3A 3D2EB 4H0TB 4BQZA 5F1XA 4ISEA 3H45C 3J8AA 3M6GA 5BRFA 1U2VA 3W3DA 3WT0A 4H5RA 4CZGA 3EZWA 3FZHA 1SZ2A 1LOTB 2ZGYA 2QWOA 3BP8A 2E2NA 4XEIA 1X3MA 3LDLA 3CJCA 4CZHA 4RWTA 3U4LA 3VEXA 3D2EA 1GLLO 4BR7A 1ZXOA 3JXUA 3OHRA 4WQ4A 1NMDA 3EKSA 3FZMA 3BEXA 2Q97A 4BRMA 2OANA 2P9LA 2ZWHA 4BRIA 4BRCA 2Q2RA 2VYPA 2YCHA 4FWNA 2DPNA 4HWIA 5AQZA 3TPQA 3DXMA 2ASOA 4BGAA 4CZIA 1MDUB 5KPZA 5BN8A 2GWJA 5BN9A 2F9TA 2QM1A 3ZEUA 4B1UB 3CJAA 3FLCO 5B8HA 4IJAA 2A40A 1TUYA 3A5MC 5KQ8A 3VF6A 2D4WA 5AQFA 5AQWA 2D1KA 1Z6RA 4CBUA 2NZTA 4C23A 2V51B 3O1BA 2P9NB 4BRHA 5CE3A 1GLCG 3CJ9A 3VGLA 3RSEB 3KZBA 1NWKA 5JMVA 2IIRA 1T6DA 3H3OB 3A5NC 1HLUA 3VGKA 4LC9B 3C0BA 5ADXH 1T6CA 3FZKA 1RFQA 3FE1A 1SQKA 1QQNA 3KHYA 1JCFA 5FPDA 2A5XA 3QFPA 3WXJA 2P9NA 3SMSA 4BRDA 1MA9B 4BG9A 4EHTA 1R59O 3ATVA 1E4GT 3EO3A 1IJJA 4PKHA 3CHWA 3IDHA 4CBWA 4PL7A 1ATSA 4O5FA 4B1VA 4EHUA 3UB5A 3EKUA 2CH5A 5TKYA 4BRGA 1BU6O 1BOTO 3CQYA 1YAGA 5JLFA 3HTVA 4K43A 1MWKA 1QZ6A 4CD3A 4EAHD 4FO0A 5E84A 1CZAN 3LDOA 4BC4A 4JHDB 1QQOA 4K42A 2E2OA 3C7NB 3U9DA 1GLEG 1NGGA 1S22A 4M7YA 4BRLA 3UKRA 1X9JA 4CZLA 4BVOA 2V7YA 4BR0A 1BA1A 4RCHA 4BQLA 3LL3A 5EOYA 1HPMA 2P9UB 1P8ZA 3W0LA 3VESA 3BUZB 2E1YA 3HBTA 3LDPA 5AQQA 3WUHA 1GLDG 4AM6A 2GWKA 5AQNA 3A5OC 4MO4A 1HKCA 3CQXA 1ZC6A 1BDGA 3P4IA 5BPLA 5FPMA 3TU5A 4BREA 4JD2A 3VENA 4FL9A 5AQPA 1QZ5A 3CETA 1NGEA 3MCPA 4Z94A 4BC3A 5AQKA 4CZMA 3VEVA 5EXWA 5LJWA 3I8BA 5AQXA 3WQTA 4FWSA 3H1QA 4H03B 2QWQA 4CZJA 2CGKA 3FZLA 2FF6A 4QS9A 2ITMA 1GLAG 1ESVA 1T44A 4JN4A 4IJNA 5KPRA 4QS8A 3H1VX 3O8MA 3R9PA 2YHWA 2Q1NA 1TYQA 4M7XA 2UYTA 2Q31A 2PBDA 4IZ9A 2VWBA 4FWQA 4I6MB 4CD1A 3IFRA 4QS7A 3MMVA 3VEYA 5F0XA 5LY3A 2V7ZA 3GBTA 5EX5A 3QMLA 4A61A 2HF3A 3ULEB 2V52B 3FZFA 4M63C 1NGBA 3QICA 1HJOA 4ISGA 5ADXA 3LM2A 4BR4A 2J4RA 4BROA 1NGHA 4MO5A 3UKUB 4K25A 4B1ZA 4WQ4C 3CIPA 3GOIA 4EFHA 4L3QA 5AQYA 1NGCA 5AQUA 4A2AA 3SK3A 3QB0A 1D4XA 2A3ZA 2HF4A 3L4IA 4GNIA 5LJVA 1K8KB 2BTFA 3EN9A 1RGIA 4JAXA 2P9IB 2ZF5O 3ENHA 3VEWA 2P9PB 5BR9A 3UE5A 4H5TA 2Q0RA 3ZX0A 3MN9A 3QDKA 2NLXA 3DJCA 5BPMA 1DKGD 1G99A 1KAYA 1HKBA 1OKJA 1XQSC 3EL2A 4H0YB 4F9OA 5FPEA 4H0VB 4YDUA 4FOIA 1JCGA 3WQUA 5BRDA 4JNEA 5JICA 4BRFA 3ZX3A 2D0OA 5KPTA 5AZJB 2W41A 5AQOA 4B1WB 2QWLA 5AZIB 4FWPA 1IG8A 3GL1A 4K41A 4WQ5A 3DXKB 3HM8A 4BC5A 3GE1A 4CBXA 3RSEA 3HI0A 3D2FB 3MDQA 3WEEB 4FWMA 2IVNA 3FFKB 2A6AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YHXA 5KQDA 2ASPA 4I2QA 1LCUA 4IFYA 3L4QA 2O4IA 2E4LA 1IKWA 3TTCA 4BRPA 4AHVA 4DLGA 3DXKA 3MEGA 2PYLA 3OYDA 4F8RA 2B4JA 2FBYA 3WXIA 4IOXA 4BC2A 1KD1O 4GV3A 2O8BA 1VQON 2D0BA 3O80A 4LSNA 2OPQA 4FLVA 1D9DA 2AA4A 3T7ZA 4DTRA 4FM2A 4OO1J 4CFDA 2KZMA 3VERA 3TWHA 1W2BM 1YI2N 4CHZA 3LDSA 3VTHA 1KTQA 4A5BA 4BR5A 2O8DB 1RBUA 2NRRA 1U48A 1ILYA 2IOCA 3AAPA 3WNEA 5DM6L 4FJNA 5FRMA 1JL2A 3CCUN 3NF7A 1SL1A 3ZCMA 1KVBA 4BDZA 3QERA 3CC7N 2HHXA 4NXNK 2YJFA 4ID5A 1EKEA 3O9QA 4WCEL 1VSKA 4JI8K 1WSEA 3ZETB 1WSFA 2Y1JA 3U8XA 3U3GA 2W6KA 3CMEN 3ITHA 4PKGA 4CGJA 1Z05A 3AA4A 5AQGA 1N33K 4H5NA 1IKVA 4CI6A 1HNWK 3O5BA 4ILGB 4DB3A 1NK7A 4I6MA 3CJBA 4OVLA 1TAUA 4B9MA 3HSCA 3CFOA 4B9UA 2FSJA 4PL8A 4FWRA 2YJEA 1S1XA 2Q0UA 4EIAA 4BRAA 4CJ4A 5AQTA 1UAXA 4F3TA 4CZFA 4J2EA 4FLXA 5CR4A 1XHXA 1NGJA 4FJLA 2FSKA 3VF2A 3CPEA 3L6QA 1JCEA 3TAPA 1YITN 4Q5VA 1NK4A 4PKIA 5C15A 5E41A 3EY1A 3HYFA 1D9FA 4C8KA 2I5JA 4B9VA 2HBKA 5I3UA 4AILC 3AVAA 4CK3A 1QQMA 3ASMA 3KKSA 4Y0WA 3TARA 4IO9L 3TTDA 4C8LA 2PFUA 3VQDA 3F9KA 3NAEA 4X65K 2P9KA 4I9QA 1J5OA 1NG9A 1NM1A 3E1YA 4JKBA 1Q9XA 3HPHA 4FCYA 1N5YA 2KHOA 2DY4A 5AQSA 4E1MA 5H1SQ 3U3YA 3CC2N 1H1VA 3UIQA 3MN5A 2IC3A 3D6RA 5JLHA 2ATQA 2E20A 1BUPA 1E4FT 3M8PA 2QWRA 3G6EN 4XH5A 4M45A 3ZSZA 3VA0A 2HHTA 3KK7A 3CFRA 4KBOA 3DRPA 4CCHA 3A2FA 3QEIA 4RTFD 1BWFO 2D0PA 4H5WA 4IG0A 4JV5K 4JI7K 1TGOA 3C6TA 1QSLA 3O1WA 4YOVA 1BG3A 5HRNA 3OJSA 4FPAA 4IBNA 2OTLN 5LL6Z 3SMPA 4DCHA 4PA1A 1KVCA 3OJUA 1KAZA 2E6LA 1BO5O 3C6HA 3ENOA 3QLHA 3CI5A 4I2PA 3OTOK 3NDKA 4E1JA 4IO8A 4CF9A 4E0DA 3CCQN 4GY2B 4KAZA 3AVGA 1Y64A 4E89A 1JXBA 1NGFA 3HPGA 1XNRK 3KWIA 1U47A 3AY9A 2WONA 5TKWA 5GAGP 1VQ8N 1VSEA 5F1XA 3G71N 3CXCM 3J8AA 4OKKA 3OYFA 1U2VA 3THWB 3C6AA 5C10A 1SZ2A 1NNEA 3KLFA 4XEIA 1X3MA 3CJCA 4FJKA 3DLLL 4RWTA 2B6AA 4GW6A 2BANA 3NGYA 3OHRA 4WQ4A 1KLNA 1Q7YO 3O3HA 3TAMA 3BEXA 4IFVA 4DUZK 1IG9A 2ZWHA 1GOBA 1RT3A 1SKWA 4BRCA 2Q2RA 1S1UA 2VYPA 3DOKA 4HWIA 5AQZA 2A1RA 3TPQA 3DXMA 3OVNA 3AVFA 1X9WA 4BGAA 2OZMA 1MDUB 1SS6A 3QEVA 3KK3A 5BN8A 1IBMK 2GWJA 3ZEUA 3NFAA 4DV0K 3CJAA 3FLCO 4FJGA 4KHPK 3C94A 4Y1DA 2DFHA 3VF6A 4IFEA 5AQFA 4DTNA 3VQBA 4CBUA 4PY5A 1OH8A 2VG6A 1GOCA 4J2AA 3RSEB 1RTJA 4E7JA 1SV5A 5JMVA 4LSLA 1QSSA 3VGKA 3LPTA 1RFQA 1QSYA 2XO7A 4KH4A 1SQKA 3MCAB 3LP1A 5KGWA 3CCEN 2D5RA 1L3UA 2P9NA 3SMSA 4Z4HA 4BG9A 4YOTA 4PL7A 4CGFA 4QOZB 2O8FB 4JS5A 5M1KA 1X1PA 2HW3A 3SUPA 4NYFA 5CYMA 3UB5A 3EKUA 1KCFA 4BRGA 2HBMA 1BOTO 1YAGA 4K43A 2Q3SA 3S3MA 4BE7B 4DQQA 1MWKA 1P90A 1QZ6A 1UWBA 2FBTA 1DTQA 4EAHD 4DTXA 1TKDA 1JXEA 2E2OA 4OKJA 4E1NA 4BRLA 2VWKA 4A59A 1QE1A 4CZLA 4BVOA 1F21A 1NOYA 4N41A 4RCHA 4CEEA 4LF5K 4DV6K 4RW8A 3NVKA 4FLZA 3BUZB 4DV5K 2E1YA 4EP5A 5AQNA 4IKFA 3SNNA 1A5VA 4CF1A 4MO4A 4GVMA 1HKCA 3CQXA 1B92A 5FPMA 4OPKA 4JD2A 1UOCA 4FL9A 2VG5A 3L2WA 1QZ5A 3CETA 1WSGA 3V1OA 2OZSA 3E9OA 3I8BA 4CZJA 2CGKA 4JI3K 1VSLA 1X9SA 1RCHA 1R0AA 5KPRA 2OPSA 4QS8A 1VSFA 4KTWA 2YHWA 3FFIA 1TAQA 2PBDA 3TAGA 3T19A 1BQNA 4I6MB 3NH1A 3HL8A 1WAJA 4CEZA 3MMVA 3WNGA 3MEDA 3GBTA 3G0ZA 1ZBUA 2V52B 4BWMA 1HJOA 5FLXO 4BECA 4BR4A 1S6PA 4BROA 4LF4K 3HP9A 3T1HK 2C1GA 5AQYA 1UA1A 1O13A 4A2AA 4DV1K 1D4XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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