2Q1NA

Actin dimer cross-linked between residues 41 and 374
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
369
structure length
345
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHLTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 114
structure length 345
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q1nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q1nA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q1nA03
4WYBA 4BRPA 1C0FA 3WXLA 1HJOA 4BR4A 1GLLO 2Q1NA 3LDLA 5ELZA 3SLCA 3VEXA 4E1JA 3B8AX 1YVNA 2P9UB 4H0PA 5AFUA 1H1VA 2QWQA 3QMLA 4ISFA 4JHDB 4BC2A 1NLVA 3AY9A 1Y64A 2W40A 4M7YA 2E2OA 4BRLA 4FWQA 3CQXA 4CBUA 1V4SA 5AQMA 4EHUA 2HMPA 1P8ZA 1BU6O 4XH5A 5AQPA 3S41A 2Q2RA 3VPZA 2ZF5O 4BROA 3KHYA 3MN9A 3HBTA 3QB0A 3O08A 5FPMA 2YJEA 3W0LA 4FWSA 5AQNA 2E2QA 1LOTB 4BRMA 1RGIA 3H3OB 2FSJA 4A2AA 3EN9A 2D4WA 1NBWA 4RCHA 2P9NB 3DXMB 2W41A 2ZWHA 4CBXA 3M3ZA 4O8KA 2VWBA 5AR0A 5EY4A 5AQJA 3FLCO 4H5RA 5LJVA 4AM7A 4B1WB 2Q0UA 3I33A 5AQKA 3SMPA 5ADXH 3LDQA 4JD2B 1JCFA 4CJ7A 3VF6A 3UB5A 3H45C 1TYQB 2GEMA 3MN5A 1U2VA 2QWNA 3H1QA 3U4LA 2F9WA 4BGBA 3A5NC 3GBTA 5B8HA 1QQNA 2HF4A 2P9PB 5BRFA 4B1YB 3C7NA 2FF3B 4FWPA 1T6DA 3FZHA 1X3MA 4H03B 2CGKA 5AQGA 1NGDA 4DQ8A 2IVNA 3D2FB 2QWMA 3VESA 2ASMA 2I7PA 2E1ZA 3R6MA 5FPNA 3O1BA 3HM8A 3FZKA 4BQLA 5F0XA 1SQKA 3ENOA 3QFPA 4F9OA 3EZWA 4BQZA 3KZBA 4BRFA 3DJCA 3HI0A 4CZIA 2P9SA 1QQOA 1X3NA 4AM6A 5AZJB 3G25A 3DWLA 5JMVA 2YHXA 1E4FT 3GL1A 3L4IA 3IDHA 2QM1A 3BP8A 4H5TA 1Z6RA 3FZMA 4KBOA 3QDKA 1NGCA 4QS9A 4FWMA 4Y0WA 2P9IA 4CZEA 1NGAA 1BO5O 4H5NA 2NZTA 3D2EA 3EO3A 4H0OA 4BRCA 4H5WA 1Q18A 5F2RA 1QQMA 4FPAA 4XH4A 1BWFO 3UE5A 4IO8A 4DCHA 1T6CA 5BN8A 5AQQA 5AQSA 5JLFA 4BC4A 2E2PA 4FL9A 3MK6A 4YDUC 4JAXA 3DAWA 3AAPA 3A5LC 3R9PA 3MCPA 3WEEB 4B1ZA 4EFHA 3ZX3A 3O1WA 4A61A 1HLUA 1T44A 3CJBA 3GOIA 3M6GA 3DXKA 4MLEA 2A6AA 3QICA 3LDPA 4IXCA 5BPLA 1ESVA 3H1VX 2QWRA 4IJAA 2KHOA 4J8FA 3SK3A 3FFKB 3UKRA 4BC3A 5JLHA 2E20A 2Q97A 3O8MA 3VGMA 5BR9A 1WOQA 4BRNA 3ZETA 1NGFA 3CETA 1GLAG 3A8YA 1QZ5A 2E1YA 4K41A 1JCGA 3O5BA 3MMVA 4BGAA 4M7XA 2UYTA 1NGGA 5AQOA 5EXWA 5AZIA 4FPBA 3GDQA 1ZXOA 1R59O 3FZLA 3C0BA 2A40A 3O4WA 3L6QA 4BG9A 1NGBA 5AQUA 2ITMA 3HZ6A 2HF3A 2P9KA 3ULEB 1TUUA 1EQYA 2WUSA 4EHTA 4CZHA 3VEOA 2I7NA 1XC3A 3CHWA 2NLXA 2VCPA 2CH6A 3TPQA 4I6MB 2V52B 4MO4A 4NB4A 1GLDG 3ZX2A 3IUCA 3UKUA 4B1XB 1GLEG 4CZKA 4EIAA 2ZGZA 3KVGA 4HTLA 4PKHA 3RSEA 1HPMA 4O5FA 4QS8A 1NM1A 3VENA 4H0VB 4PKIA 3F9MA 5KPTA 4BRHA 4DB3A 1WUAA 4RTFD 2P9LA 3SJHA 2YI1A 4BRDA 3BF3A 2V7YA 3EKUA 3ID8A 1NGHA 5AQZA 1IG8A 3VEWA 3VGKA 3EKSA 3LDOA 2GELA 3WXIA 3A5OC 3U9DA 1NMDA 3ZEUB 1NGEA 1HKGA 4FWLA 4H0TB 4DHYA 4JN4A 3ATVA 2IVPA 5E84A 4CD3A 4WQ4C 3LM2A 4PKGA 1LCUA 3MN7A 2F9TA 1K8KA 3D7EO 4BRKA 4IJNA 4CD1A 4CZFA 3EL2A 1QHAA 3H3NO 4YDUA 1DKGD 2AA4A 1HUXA 2FSKA 2GWJA 1XUPO 3CJ7A 2D1KA 2CH5A 3JS6A 2EWSA 2HOEA 2P9UA 1BUPA 3IMXA 4H5VA 4JHDA 3ENHA 1HKBA 2Q36A 3QFUA 5CE3A 3L0QA 1KAYA 4K43A 5LJWA 4BVOA 1BDGA 2E8AA 3VGLA 3A5MC 3JXUA 3QBXA 4FWKA 5AQLA 1GLJO 3VEVA 4BR7A 3A0IX 4FWRA 1ATSA 4RWTA 2QWPA 3GE1A 4MO5A 3BEXA 4NO7A 4BR2A 1MDUB 1U2VB 3O6WA 2P9NA 3DXMA 1E4GT 4BRQA 3C7NB 5AQYA 3ATUA 4GY2B 3U8XA 1MWMA 4A2BA 3LL3A 3VETA 2H3GX 2BTFA 1U6ZA 1CZAN 1SAZA 3W3DA 3O80A 4JD2A 1G99A 1TYQA 4JNEA 2GWKA 2BUPA 1MA9B 1QZ6A 4BG8A 1GLFO 2P9PA 4PL7A 2ASOA 4H0XB 1NWKA 1GLCG 2A5XA 2D0OA 2P9SB 4FWOA 5AQHA 2ASPA 1D4XA 2YCHA 4L3QA 3D2FA 5BRHA 5EX5A 4B1VA 3J8AA 2Q31A 1XQSC 1YAGA 1OKJA 3ZEUA 4A62A 1JCEA 3U9ZA 4FO0A 5F1XA 2P9IB 3CQYA 4WQ5C 4FWNA 1Z05A 3D2EB 3CJCA 1YUWA 2A3ZA 2FXUA 5AQRA 4CZMA 3LM9A 4XH1A 5AZJA 1ZBSA 2D0PA 2NRHA 3VF4A 4MLHA 4BR5A 5BRDA 3WXJA 5BREA 5LY3A 1ZC6A 4PL8A 4C23A 3CJ9A 4WQ4A 1BA0A 4FOEA 4XEIA 3HTVA 2YHWA 2OANA 1GLBG 1TUYA 4LC9B 3M1FA 3R8EA 3WXKA 3DXKB 2FLOA 1KAZA 1MWKA 2CGJA 3CJ1A 1HX1A 2VYPA 3FZFA 4FSVA 3GG4A 3I8BA 3UKRB 1RFQA 4CI6A 4IWVA 1DGKN 3ZETB 4GNIA 4Z94A 2QWLA 3FGUA 2PBDA 1V4TA 3WEEA 5FPDA 5JICA 2E88A 3OHRA 1BA1A 1KAXA 1C0GA 3TU5A 2ZGYA 2CGLA 1SZ2A 3VEYA 5AQWA 2AP1A 3VERA 4CBWA 1BG3A 1RDWX 5AZIB 3CERA 2FF6A 5AQFA 3CJAA 1KXPA 3SMSA 5KQ8A 1X9JA 5E26A 5BN9A 3P4IA 3MDQA 4FOIA 5I9EB 2IVOA 1YXQA 5ADXA 3ZX0A 4QS7A 1BOTO 1S3XA 2P9KB 3WQUA 4BR0A 3AARA 2IIRA 2YHYA 5BPNA 2QXLA 3VOVA 4BRIA 1NGIA 2E2NA 2QWOA 2DPNA 4M63C 4CZLA 5AQVA 1ATNA 4BRAA 3VEZA 2A42A 4H0YB 4ISGA 3MN6A 3WQTA 5KPZA 1NGJA 5EOYA 4K25A 3UKUB 4CZGA 2FSNA 3QBWA 3ULEA 5KPRA 5TKYA 3CIPA 3AAQA 2Q0RA 1HKCA 3BUZB 1S22A 3CI5A 3LDNA 2A41A 3RSEB 4EAHD 4IZ9A 3FR0A 5AQTA 5AQXA 4BR9A 3BF1A 4BRGA 1ATRA 4K42A 2PAVA 4I6MA 4CZJA 2GTDA 2YJFA 1J6ZA 2J4RA 2V7ZA 3HSCA 2V51B 2P9LB 4BREA 5FPEA 4WQ5A 4BC5A 4B1UB 3WT0A 3FE1A 5EVZA 5BPMA 4B9QA 5KQDA 5AFUH 5AQIA 4HWIA 2GUPA 2QW9A 3WUHA 4BVPA 4ISEA 1DEJA 3VF2A 1K8KB 3H46O 1IJJA 3H6EA 3IFRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M8SA 4BRPA 3WXLA 1HJOA 1GLLO 3KK1A 3K57A 3VEXA 4LFAK 2RHKA 4FJIA 3QINA 4KI4A 1NU0A 4BC2A 4JI4K 4M7YA 4WF9L 4JI2K 4B9LA 4JKAA 1K8AO 2OCEA 4NCBA 3CQXA 4TSXA 2Z1GA 3A2FA 3S41A 1J54A 2Q2RA 4V19S 2KLAA 3KWIA 3MN9A 4RW7A 4AF1A 4DQSA 2YNGA 3OY9A 1RGIA 3DXMB 4M41A 1QSYA 1JL1A 5HRSA 4CE9A 1VQ5N 2UU9K 4FJNA 3KK2A 3AO3A 5CR4A 5LJVA 4PQUA 2Q0UA 3VQPA 2Y1JA 2HBKA 5ADXH 1JCFA 3V1OA 3H45C 3AVCA 4B9NA 5BRFA 2P9PB 4B1YB 3AGRA 4DQRA 2FF3B 4FWPA 1KVAA 2YV0X 3ZT4A 4H03B 4CJQA 3ZT1A 4DQ8A 4JI8K 5C24A 3OYAA 3DYAA 1HYZA 1NK5A 1S1VA 3U3YA 3O1BA 4M3TA 4BQLA 4U67L 5I42A 3HJFA 3ZSYA 1SQKA 3KIOA 4DR2K 3SUNA 4M3UA 3WNEA 4F9OA 1I39A 4GMJB 4BE0A 4QCLA 4RW9A 3KZBA 3ZT2A 1IBMK 2P51A 1RDCA 3SAGA 3K5NA 4M3RA 1QQOA 1BL3A 4DU3A 1QVGM 5GAEP 3SNNA 4KHWA 2HVHA 5H1SQ 2XY7A 4B9SA 2G8IA 4CF0A 4KBOA 3DLRA 3SZ2A 3QDKA 4FWMA 5FDLA 2G8HA 1NGAA 4CJVA 4OPHA 2NZTA 3D2EA 3BZKA 3VQEA 1C1AA 1L3UA 4M42A 1VQMN 3T69A 4OJRA 3ZYYX 3VMFB 3JAMO 1BISA 1Q7YO 1T6CA 4FJGA 3RMBA 2E2PA 3FFIA 4CFAA 3A5LC 3E1YA 1RTHA 2FBVA 3WEEB 1WNSA 4EFHA 4YOUA 1VHXA 4JI7K 1K73O 5HRRA 3HYFA 3DM2A 1VSEA 3DXKA 2A6AA 1WSHA 2JWLA 5BPLA 1ESVA 1ILYA 2C1GA 1KCFA 2QTDA 4DMNA 2KHOA 3Q7BA 3UKRA 3FFKB 3J7AP 3CF5L 2Q97A 3DLBA 4BRNA 3ZETA 1X9SA 1JJ2M 4KHPK 5CHIA 3ZSOA 4CEBA 2KQ2A 3A8YA 2VG5A 4DSIA 4MQ3A 1RBSA 1QZ5A 2E1YA 3AVHA 3MMVA 3AVFA 5C12A 4M7XA 2UYTA 3NAEA 2RKIA 2AJQA 5AQOA 5AZIA 3B6PA 1JLAA 1KD1O 1R59O 1T8EA 3C0BA 2A40A 2UXDK 1F21A 4YY3K 4BDZA 4ELUA 3IS9A 5AQUA 3HZ6A 2HF3A 3ULEB 3LALA 2WUSA 4CZHA 3QEVA 3SV4A 3LANA 2GBZA 3ZSVA 5GIPA 3HPHA 1S5JA 4CGHA 3AVBA 3IAYA 3P38A 4I7FA 3MX5A 4B1XB 5M1QA 4GW6A 3TAMA 1W7AA 4E19A 1IV0A 1NM1A 4IEIA 4O5BA 1S6QA 4CJWA 1Q82O 1HJRA 4DB3A 3TI0A 1XMQK 4MDAA 4IFEA 4BY9C 3WNHA 4KFBA 3M5RA 1LWFA 3WXIA 3F5TA 1EWRA 4B9UA 1NGEA 2JLEA 1WB9A 1ZBLA 4JN4A 2IVPA 5E84A 1QS4A 4WQ4C 4PKGA 5C2FA 4OLAA 5HBMA 4BRKA 1YVUA 4IJNA 4CD1A 4FJJA 1FJGK 3QEWA 3I0SA 1YITN 3O3GA 4LF6K 3CJ7A 2PYLA 4I2QA 2ZE2A 4ZHRA 3CCMN 2P9UA 3O9TA 1BI4B 1VQKN 1S1WA 3CMAN 4Z4HA 1S72N 4H5VA 3ENHA 4CJFA 2NRTA 3I55N 4DUYK 3VQ9A 3AO4A 3ZSRA 4BVOA 5FLXO 3HOTA 2RPIA 2E8AA 1BCMA 2F8SA 3A5MC 4E0DA 4E7LA 4IOAL 3THYA 4FWKA 5AQLA 1KVCA 3A0IX 1ATSA 3MEDA 4YNQA 3V9WA 4ZTJA 1TKXA 3ZSZA 3PIOL 1U2VB 3OYFA 2P9NA 3ULDA 3LPTA 5C2DA 3MXIA 1E4GT 4BRQA 3OYKA 4UQGA 5J2NA 4DFKA 4AHVA 4Z4EA 3AA2A 3U8XA 3C6HA 1MWMA 1BIZA 5DMRA 3LL3A 3OYLA 2BTFA 3TSQA 1RTIA 1CZAN 4CF1A 1DTQA 2HNDA 5DM7L 3S3MA 4JNEA 3CG7A 2BUPA 4DR4K 4BG8A 1GLFO 2B4JA 1EP4A 4KTQA 2P9SB 2A5XA 4JKGA 4JI1K 4A59A 1U49A 3ENBA 1NKCA 4L3QA 1XHXA 1RBTA 5BRHA 3CC7N 5DM6L 4Q0BA 3J8AA 4N5SA 4LF8K 1YAGA 3ZEUA 3U9ZA 2R7YA 4WQ5C 3TAGA 1NJZA 2OTLN 3AVMA 2EHGA 4BEBA 1Z05A 1YUWA 1LAVA 2A3ZA 1XNQK 4FM0A 3SQ1A 3NVKA 4FCYA 4BR5A 5BREA 1W0HA 1KC8O 3PSFA 3CJ9A 2WC9A 4WQ4A 1KTQA 2OANA 4U7BA 1YI2N 4KH5A 3VQQA 2HW3A 2KW4A 2I5JA 1C1CA 3VA3A 4FSVA 3O9RA 4DTMA 3NF7A 3K5OA 4CI6A 4IWVA 3QERA 5LL6Z 4FZYA 1RILA 1VQ7N 2YHBA 2QWLA 4B9MA 4CJTA 4JK8A 2PBDA 1HNWK 5JICA 1BA1A 3G6EN 4YOTA 3NGZA 2ZGYA 4FK2A 4B8AB 4DU1A 4FM1A 1Q9YA 2KZZA 3AVKA 2HHSA 2AP1A 1TAQA 4ILGB 2FBTA 3KD1E 5AQFA 1S6PA 3P4IA 3MDQA 4NYNA 5I9EB 3ZX0A 2NRZA 3HRGA 3AARA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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