2Q97A

Complex of mammalian actin with toxofilin from toxoplasma gondii
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Toxofilin from Toxoplasma gondii forms a ternary complex with an antiparallel actin dimer
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein/cell invasion
source organism Toxoplasma gondii
total genus 113
structure length 353
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q97A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q97A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q97A03
3FLCO 1Q18A 3VF6A 2YHYA 3U8XA 1X3MA 3C7NB 1GLAG 4ISGA 4BRIA 3D2FB 5TKYA 3M1FA 4Y0WA 4BVPA 4K43A 5ELZA 4J8FA 1GLDG 2D4WA 3W3DA 4PKGA 3R9PA 3ZEUA 1MDUB 3UB5A 3MK6A 4ISEA 4CZFA 4AM6A 2P9NB 4C23A 1BO5O 4XH4A 4B9QA 5AZJB 4H0YB 4L3QA 3VGLA 4BGAA 3QFUA 4O8KA 4BC3A 2E1YA 3H45C 4H0TB 3WT0A 2E88A 4FWNA 4CBWA 4I6MA 2VCPA 5AQWA 3HBTA 5AQZA 4O5FA 5JLFA 4RCHA 4A61A 3VENA 5AQOA 3VEOA 3ZETB 1TUUA 4FO0A 3BEXA 1C0FA 1CZAN 1Y64A 2CGKA 3CIPA 3O80A 4CZJA 3HTVA 1HPMA 4H5TA 2P9IB 3B8AX 2A40A 2QWMA 3GDQA 2BUPA 4BR4A 4BRHA 1DGKN 4DB3A 1P8ZA 1TYQA 1WOQA 1S22A 5AQVA 4BR5A 2IVOA 1SAZA 2FSNA 3UKUB 1NMDA 3D2EA 3RSEA 5BRFA 4ISFA 2YHWA 5AQRA 4PKIA 1E4FT 1GLCG 2EWSA 2NZTA 5E26A 5I9EB 1JCGA 2Q36A 4BRFA 3QBXA 2Q1NA 4AM7A 2J4RA 1YXQA 2W41A 4LC9B 4BRQA 3CJCA 1XQSC 1X9JA 1QQOA 4IWVA 4BROA 5E84A 3ZX3A 5BPMA 1K8KB 4CZEA 4CZIA 2GWJA 1GLEG 4DHYA 4EHUA 4BC2A 5ADXA 4WQ5C 4IXCA 5AQMA 1GLJO 1OKJA 3LL3A 4H0OA 4WQ4A 4H5NA 3CJ1A 3FZFA 3R6MA 3FZMA 2P9LB 3OHRA 5AQXA 3LM9A 4HTLA 4BGBA 5AQHA 5BN8A 4BRLA 2A41A 1NGAA 2E20A 1LOTB 3VF2A 3H6EA 4WQ4C 3ZX0A 2ASOA 5KPZA 4H0VB 3WXKA 3LDOA 5AQIA 1NGIA 4MLHA 4K41A 3AAPA 3VEXA 5JICA 4GNIA 2ASPA 5B8HA 1QQNA 1ATSA 5AQKA 3VPZA 1NGHA 2QM1A 3UKRA 1ZBSA 4FSVA 2AA4A 4CZGA 4FWPA 4JHDA 3H1VX 4A2AA 2F9TA 3LM2A 4FOIA 3VGMA 2GUPA 4FPBA 4BRPA 1RDWX 2IIRA 2P9SB 4K25A 5EVZA 1YVNA 1JCEA 3EZWA 2ZGYA 2GWKA 3DXKA 1NBWA 4BVOA 1YAGA 3DJCA 3FR0A 5AQFA 1ZC6A 1BUPA 1NGFA 5KQ8A 3M6GA 4BQLA 2A6AA 1GLBG 2OANA 1V4SA 2HF4A 3H1QA 4B1ZA 1QQMA 2A42A 2UYTA 2VYPA 4BR7A 4DCHA 3A5MC 4CI6A 4M63C 1RGIA 3WQTA 1IJJA 4BRAA 1J6ZA 3VEYA 4CZLA 2P9PB 1NGJA 3ULEA 2HOEA 4FL9A 2P9KA 3HI0A 4H5WA 1KXPA 1MWMA 1E4GT 1GLLO 5BRDA 3C0BA 3AARA 2GELA 5AZIB 5KQDA 4FWMA 2KHOA 3QICA 1BOTO 1BG3A 4YDUA 2V51B 4F9OA 1H1VA 2E2QA 1NGGA 3WEEB 4CBXA 3JXUA 2Q2RA 5KPRA 1BDGA 4XH1A 4YDUC 4NO7A 3FZHA 5FPMA 3WXLA 4CZMA 2IVNA 2QW9A 5BR9A 1LCUA 3CJAA 4CZHA 2QWLA 3H46O 2P9UA 5F1XA 1BU6O 1HJOA 3FZKA 1U2VB 5AQLA 3M3ZA 2CH5A 3EKSA 4CJ7A 3A8YA 3DXMA 1EQYA 1GLFO 3VERA 3GL1A 3BP8A 3LDNA 4JNEA 5F2RA 3MDQA 1JCFA 3BF3A 4B1XB 4M7YA 5BRHA 4BC4A 2PAVA 4WQ5A 3DWLA 1NGBA 2VWBA 2W40A 4XEIA 5FPEA 3CQXA 4NB4A 3ZEUB 4A62A 3SMPA 5AFUH 2CH6A 3VESA 1HKGA 2I7NA 4B1UB 2QWNA 1XC3A 1SZ2A 4B1YB 1WUAA 2Q0UA 2V7ZA 1NWKA 1ATNA 2ZF5O 3KZBA 2A3ZA 2IVPA 2QWOA 3L6QA 4JD2A 3QFPA 5JMVA 2E8AA 3EL2A 3C7NA 4I6MB 1QZ5A 3WXIA 3D2FA 3LDLA 2WUSA 2QXLA 3GE1A 4FWQA 3U9DA 3VGKA 3JS6A 3L0QA 4BR9A 2NLXA 1KAYA 3O1BA 2ZWHA 5EOYA 3H3NO 3CETA 1Z05A 4IO8A 3EO3A 1X3NA 2FXUA 3GOIA 2PBDA 1TYQB 3QB0A 3SLCA 3I8BA 4H5RA 2V52B 4BQZA 1Z6RA 3BUZB 2E2NA 4BR2A 4CD1A 4EIAA 5AZJA 3VEVA 3D2EB 3RSEB 3FFKB 4MLEA 2BTFA 5AQQA 3A5NC 1ZXOA 1G99A 2A5XA 3A5OC 1NLVA 4FOEA 4BC5A 4BRNA 3W0LA 2HF3A 4BRCA 1NGEA 2ITMA 3CJBA 3WXJA 4A2BA 1BWFO 3ZETA 4HWIA 4JN4A 4FWRA 4BG8A 3SMSA 1BA1A 5AQPA 3O5BA 3SJHA 4KBOA 5FPDA 5EXWA 4IJNA 1RFQA 2P9IA 5EY4A 1HLUA 2H3GX 5BPLA 3F9MA 1IG8A 2V7YA 3IUCA 3UKUA 3ID8A 3MN9A 3L4IA 1MA9B 3VF4A 5JLHA 3HM8A 1T6CA 3LDQA 3VETA 5BN9A 4RWTA 4BRGA 3O08A 3IDHA 4FWLA 3MN6A 3TU5A 5FPNA 2YHXA 1HKCA 3CJ9A 3CERA 2QWRA 5AQSA 3O8MA 2YI1A 1DKGD 1NGCA 4RTFD 4H5VA 3QDKA 2QWPA 5AQTA 3ATVA 4Z94A 4H0XB 4BR0A 1K8KA 3G25A 4PL7A 5AQJA 1T44A 1DEJA 3R8EA 4B1VA 5LJWA 3EKUA 3TPQA 3UKRB 5BREA 4E1JA 2D1KA 4JHDB 1U6ZA 1YUWA 1HX1A 2P9LA 2GEMA 4BRDA 3CQYA 3SK3A 2FF3B 4K42A 4FWOA 3D7EO 4QS7A 2E2PA 1MWKA 4CD3A 3DXKB 5AQUA 4DQ8A 1TUYA 3J8AA 1ESVA 3UE5A 1BA0A 3ATUA 3EN9A 4MO4A 3IFRA 2Q0RA 1ATRA 3MN5A 2D0OA 3ENHA 3QMLA 3FZLA 2CGJA 3O6WA 3CJ7A 3ENOA 5BPNA 2FLOA 3ULEB 1HUXA 3WQUA 3O1WA 4FWSA 2P9KB 3MCPA 4CZKA 3AY9A 3CI5A 4H0PA 2P9SA 2YJEA 3HSCA 4H03B 2F9WA 2CGLA 2HMPA 2FSJA 5ADXH 1NM1A 2E1ZA 1V4TA 4IZ9A 3LDPA 4PKHA 4XH5A 4B1WB 3IMXA 4M7XA 3FE1A 1KAXA 4IJAA 4QS9A 1D4XA 5AFUA 3FGUA 4JAXA 3A0IX 3VOVA 5KPTA 2I7PA 2YCHA 4QS8A 4WYBA 1HKBA 5AR0A 1S3XA 2Q31A 2GTDA 4GY2B 5LJVA 2P9PA 3S41A 3BF1A 3HZ6A 3VEZA 4MO5A 2P9NA 2P9UB 2YJFA 3H3OB 3U9ZA 5F0XA 3VEWA 3O4WA 4EAHD 3AAQA 4BG9A 5AZIA 4BRMA 1R59O 3DXMB 2E2OA 2FSKA 1C0GA 2FF6A 3U4LA 4EHTA 4EFHA 3QBWA 2Q97A 3GG4A 5CE3A 3WEEA 5LY3A 3WUHA 1KAZA 2AP1A 2ASMA 3A5LC 4BRKA 1NGDA 4BREA 3KVGA 4CBUA 2NRHA 1QHAA 3MN7A 4PL8A 3P4IA 2DPNA 3ZX2A 3CHWA 4FPAA 4FWKA 1T6DA 2ZGZA 1QZ6A 3DAWA 1XUPO 5AQNA 1U2VA 3KHYA 5AQGA 2QWQA 3GBTA 3I33A 3MMVA 5EX5A 2D0PA 5AQYA 4JD2B 1SQKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FLCO 4CJEA 5C2FA 3AVFA 3QIPA 4OPJA 3U8XA 3C7NB 5TKYA 1D8YA 4CEOA 4BVPA 3VQ7A 5ELZA 3QIOA 3W3DA 2DFFA 3OYFA 3CYGA 3J7YP 1TL3A 3UB5A 3ZLJA 1XC9A 5GIOA 3AVGA 4B3MK 4BDZA 2O8FA 1W0HA 3VGLA 4L3QA 2WC9A 4BGAA 4BC3A 3KK2A 1ZBLA 4H0TB 3E9PA 4FCYA 4FLTA 4CF9A 4A61A 5AQOA 1I39A 3ZETB 3DLGA 3SUPA 4FO0A 4RW7A 4KREA 3RTVA 2QXFA 4KTWA 2P9IB 3OBWA 4JKDA 2BE2A 3ZSWA 4BR4A 4CERA 3OS1A 3RSEA 4DTOA 5AQRA 1UA1A 2EWSA 3C95A 1NKCA 1CZ9A 4OLAA 4PUOA 4AHVA 2O8BA 5I9EB 2HMIA 2FC0A 2Q36A 3DRRA 1EKEA 2Q1NA 3LPTA 2YKNA 2J4RA 1VHXA 4H4MA 3NDKA 3KIOA 4E7JA 3QNNA 3CJCA 1WB9A 4IWVA 2W6LA 4DU3A 1K8KB 5LMUK 1GLEG 4Q5VA 2F8TA 4KHUA 3AGKA 4WQ5C 5AQMA 1C6VA 3ZT4A 1BCOA 1OKJA 1RDDA 2PZSA 3LANA 3FZMA 4JKCA 4CW7B 3NH0A 5AQXA 1Z26A 1QS4A 1D5AA 4BRLA 2A41A 5FLXO 3THVA 4FM1A 4H0VB 1WAFA 4W5NA 3MEGA 4DTPA 4K41A 5JICA 4GNIA 5B8HA 1J9AA 2KFNA 1TKDA 1ATSA 2ZJPL 4JV5K 4ZHRA 4QOZB 4FWPA 5HRRA 3QO9A 1W97L 1C0UA 2O8DA 4CCHA 1WSEA 3CCLN 2HHQA 2B4JA 3CFOA 2GWKA 3LWMA 3DJCA 3VQBA 1L5UA 4E7LA 4DS5A 5AQFA 1NGFA 4B8AB 3OJSA 2A6AA 2E6LA 4YOYA 3NGIA 1QQMA 2OPSA 2YNFA 4KRFA 2XY6A 1GOCA 2VYPA 4DCHA 3WQTA 5C10A 4DR7K 1C1BA 4Z4EA 1NGJA 3ULEA 3SPZA 4GKJK 3K57A 1N34K 4DV5K 1QTMA 3T1AA 1T03A 3DOKA 5BRDA 4IOCL 2UU9K 3C0BA 1SKRA 4I9QA 4FXDA 2X6NA 1VQ5N 4FZYA 4Y1DA 3F2KA 3F9KA 4BACA 1BG3A 1SS6A 4YDUA 4OKJA 4M3RA 2V51B 3DLRA 2VQEK 3QEVA 4DV0K 4MFBA 2DY4A 1H1VA 3M5RA 4YOWA 2E2QA 1KVAA 3BY5A 3LAMA 3G10A 1HNXK 4DS4A 1BDGA 4NO7A 1OH5A 5FPMA 3V9ZA 2O8CB 1B9FA 1BQMA 2QWLA 3SAFA 3PSIA 4YHHK 3G0ZA 3EE8A 3CF5L 2BH1A 2O8DB 5SWMA 3FZKA 3G71N 3HO1A 2NRTA 3EKSA 4JKGA 4CJ7A 2B6AA 1XNQK 3DXMA 1S1XA 1L3UA 2HBJA 4BY9C 1Q9YA 1Q7YO 1JLGA 3VERA 4DTNA 3K5LA 3BP8A 4JNEA 1W2BM 3O9RA 2XRIA 3HM9A 4JLHA 4DFMA 2KKZA 1G15A 1WSJA 2PAVA 3RR7A 3IRXA 3P83D 5FPEA 4PY5A 4A62A 2JWLA 3U3YA 3O9QA 4LY7A 2CH6A 4QAGA 2I7NA 1XC3A 4JK8A 4EZ9A 3D0PA 4DFJA 4B1YB 2Q0UA 2V7ZA 4FLVA 2ZF5O 3SV4A 3ENBA 5J2NA 2IVPA 2NNWA 4Z0UA 3OW2M 1KCFA 4RG8A 2D0BA 4I6MB 3KJVA 2QXLA 1YIJN 1HNWK 3JS6A 3NH2A 3HPGA 2X78A 1VSLA 5T7BA 4JK7A 3NGZA 3O3GA 1T8EA 4IO8A 3EO3A 3SUOA 4QCLA 2FXUA 2PBDA 1TYQB 3QB0A 4JI5K 3A2FA 3OJUA 4BR2A 5AZJA 3TAGA 1SL0A 3CCJN 2HVIA 1HQEA 4DR4K 1REVA 1QHTA 4BC5A 4BRNA 4KHSA 4DTJA 3THXA 1OH7A 1CXUA 2BGGA 1NJIO 3DLBA 4HWIA 5JVGL 4CEQA 1JLEA 3SJHA 2RF2A 5EXWA 2QI2A 4DR5K 2XY5A 1S1UA 2ZJRL 5CYMA 3UKUA 5H1SQ 3S9HA 1U49A 3KK1A 1TL1A 1MA9B 1GOAA 3HM8A 4DQSA 3Q7BA 1T6CA 1NK7A 4OKEA 2P51A 1RT7A 2HHHK 3F73A 5FPNA 2OYQA 1HKCA 1K8AO 3CJ9A 4NXNK 4DR6K 4YORA 3O9UA 2IC3A 4O44A 1NGCA 3K2PA 1RTJA 5AQTA 4E72A 3SPYA 4KI4A 3QEPA 1C0MA 4DR3K 3KLIA 4IG0A 4BE0A 5AQJA 4IFVA 3OY9A 5I3UA 4B1VA 4DWIA 3TPQA 1LWFA 1U04A 2D1KA 2IS3A 5I42A 4BRDA 3O9SA 2FF3B 4ZTFA 4K42A 1YJWN 4FWOA 3NE6A 1A5WA 3E66A 4E19A 4W5OA 1T7PA 2C1GA 5GAHP 3THXB 2HHUA 3TR8A 2GUIA 1TUYA 1BA0A 1WBDA 3ATUA 1YI2N 1RDUA 2FBYA 3PSFA 5CR4A 3L2WA 3KD5E 3ENHA 3FZLA 1EETA 1TK0A 2F4VK 3HOSA 3AA2A 3CQ8A 4LF6K 4DTSA 2P9KB 3MCPA 2G8IA 2P9SA 2YJEA 2F9WA 2HMPA 3ZSVA 2E1ZA 3TTDA 1RT2A 2WTUA 3LP1A 3N4QA 3CCVN 3I8DA 4JAXA 4X64K 4NLBA 3VOVA 1ASWA 2C1IA 2I7PA 4OKKA 3EYZA 3V9SA 5AR0A 2IOCA 1RT6A 5LJVA 3KWGA 2P9PA 4KHWA 3I0SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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