2VCPA

Crystal structure of n-wasp vc domain in complex with skeletal actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Interactions of isolated C-terminal fragments of neural Wiskott-Aldrich syndrome protein (N-WASP) with actin and Arp2/3 complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 104
structure length 370
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2vcpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2vcpA04
3HTVA 2FF6A 3AAQA 4FOIA 1QQNA 3EO3A 1RGIA 1XC3A 2P9NA 3FZKA 2FSJA 1GLFO 3H1VX 3ZETB 5AFUH 1Z05A 4E1JA 5BRHA 4EAHD 1BA1A 5F1XA 1WOQA 4CZGA 3A5LC 4GY2B 5I9EB 1H1VA 2P9UA 1GLCG 3O8MA 2D0OA 4PL7A 4MLHA 5FPEA 3F9MA 3LDQA 5AQUA 4EHUA 4BRMA 3J8AA 3VETA 4B1VA 2FSNA 2W41A 2Q0RA 4WQ5A 3D2FB 1KAZA 3MN6A 2ZGZA 3U4LA 4BVOA 4ISEA 5ADXA 4BR4A 5AQVA 1NWKA 3EKUA 3FGUA 3L6QA 4JN4A 3IMXA 4BRGA 1GLEG 4JHDA 4B1UB 5AQJA 3IDHA 3CJCA 2QWPA 3KZBA 2A5XA 1D4XA 4IWVA 4CZLA 5BN9A 3SJHA 1XQSC 5BRFA 1HKCA 3UKUA 4FWLA 1ATRA 3VENA 4EHTA 5EOYA 3MDQA 2ZGYA 2E88A 2Q0UA 2QWNA 5EXWA 1IJJA 3CJ1A 4M63C 5AQQA 4BRLA 4IJAA 2NLXA 3AY9A 2QWOA 4IO8A 4FPAA 2W40A 2NZTA 3LDPA 5E26A 4LC9B 5F0XA 1T6CA 2P9NB 1K8KA 1BDGA 5EX5A 4AM6A 5AQPA 3VEOA 5JICA 4BQZA 5AQKA 1NM1A 4BG9A 3MN9A 1NGAA 1OKJA 3FZFA 3U9DA 3RSEB 1TYQA 3WEEB 1X9JA 1ZC6A 3UKRB 3S41A 1NMDA 3EZWA 3FZHA 1C0GA 1Z6RA 3DJCA 3WT0A 3VF2A 1GLDG 2GWKA 4H5RA 5BN8A 4FO0A 4M7XA 5AQMA 2E2OA 3ENHA 3QBXA 2ITMA 3EKSA 4JHDB 4L3QA 1E4GT 3WQTA 5BREA 4JD2A 4FWOA 5BPNA 3I33A 3UE5A 3FE1A 4BRPA 5AZIB 4WQ4C 4KBOA 3FZMA 1KXPA 3A5NC 3UKUB 3BF3A 1S22A 4RTFD 4CBXA 2QM1A 2ZF5O 1JCEA 4BRCA 4BQLA 3O4WA 4H0XB 4BC4A 5AR0A 1V4TA 1NGFA 4I6MB 2P9IA 3HSCA 5KQ8A 4A2AA 5ADXH 1NGBA 3CETA 3VEXA 4BGBA 3GBTA 3CI5A 3ZX2A 5LJWA 2E20A 5EY4A 4H0PA 5AQYA 4BC5A 4BR7A 4DHYA 4YDUA 4BRDA 3DXMA 1BU6O 4FOEA 2Q36A 3QFPA 3VF4A 5JMVA 1DKGD 5E84A 1TYQB 4HTLA 4ISGA 1S3XA 5AZJA 4FWMA 1CZAN 4DCHA 2F9WA 2VWBA 5KPTA 1HJOA 2P9LA 3ULEA 5B8HA 2QXLA 3GDQA 1P8ZA 4FSVA 1U2VA 3KVGA 3VESA 1QHAA 5KPRA 3O08A 4FL9A 3M3ZA 4H0OA 3VPZA 1R59O 2V7ZA 4QS7A 4FWQA 3FFKB 2E2PA 3R8EA 4CI6A 2GEMA 3LDLA 2YHYA 2QW9A 3LM9A 2VYPA 3AARA 1SQKA 4FPBA 3SMSA 5AQGA 4BRAA 4H5TA 2YCHA 3CJ7A 3VEWA 4A62A 1MWKA 4A61A 4GNIA 1KAXA 4JD2B 2GELA 4HWIA 3O1BA 1RDWX 4XH5A 3P4IA 2P9SA 3CERA 3W3DA 3VOVA 5AQLA 4JAXA 3LDNA 3DXKA 4RCHA 3W0LA 2V52B 2ASMA 4BRKA 4CBWA 1JCFA 4CZKA 4AM7A 3CQYA 2ZWHA 3FZLA 4B1WB 4CZMA 4F9OA 3SK3A 3BF1A 5AQNA 3VGKA 3HM8A 4B1XB 3O80A 4BG8A 5LJVA 4JNEA 2QWQA 3DAWA 1NGDA 5BRDA 3ATUA 5AQXA 4XH1A 2P9UB 3WXKA 2V7YA 3BUZB 4K41A 2CH6A 4BR2A 2IVNA 4WYBA 1ATSA 4EIAA 4B1ZA 3D7EO 3ZETA 3L4IA 3LM2A 1QQMA 4PL8A 4FWRA 4CBUA 4H5WA 1E4FT 4BRNA 2NRHA 3IFRA 3O1WA 3AAPA 5KQDA 2HF3A 1NGIA 3C7NA 5AQZA 4O5FA 3ULEB 2HF4A 3A5MC 1U2VB 2WUSA 2AP1A 3LDOA 1GLAG 3VGMA 3D2FA 4CD3A 4M7YA 4XEIA 1NGJA 4H03B 5AQRA 2Q31A 1BWFO 2YJEA 3G25A 5AQIA 4FWKA 2F9TA 2HMPA 1YUWA 2EWSA 1ESVA 1DEJA 2A3ZA 3QFUA 1X3NA 3QMLA 4CJ7A 4CD1A 3H3NO 3SMPA 2CH5A 2P9PA 5AQOA 2E1YA 2E2QA 1NGGA 3WXIA 1ZBSA 4BVPA 4BROA 1NGHA 1X3MA 1ZXOA 3MK6A 2CGJA 4BC3A 1V4SA 3VF6A 2BUPA 2A42A 3DXKB 3JS6A 2UYTA 2E8AA 3D2EA 4EFHA 1G99A 1LOTB 3QDKA 4XH4A 3UB5A 3FLCO 3BEXA 2BTFA 3L0QA 4H0YB 3VEZA 3ZX0A 1MA9B 4BC2A 4K43A 2AA4A 5F2RA 1K8KB 3TU5A 2I7NA 4BR0A 4BRFA 3VGLA 4H5NA 1RFQA 1BG3A 2QWMA 4Z94A 3GG4A 1KAYA 5LY3A 4WQ4A 1NLVA 2YHXA 5BPMA 1BOTO 2A6AA 2CGKA 4QS9A 4DB3A 2Q1NA 3QICA 1XUPO 5AQTA 1HKBA 1Y64A 2CGLA 2FF3B 3HBTA 5EVZA 3QBWA 4BRIA 2IIRA 2V51B 2PAVA 4A2BA 3MMVA 4ISFA 3A5OC 3C7NB 4B9QA 3WXJA 1SZ2A 1BUPA 4H0TB 2IVOA 3RSEA 3WEEA 5BPLA 3QB0A 5FPMA 2I7PA 3WUHA 3CJ9A 1QZ5A 5FPNA 3C0BA 2E1ZA 2D1KA 3UKRA 3KHYA 2QWLA 3I8BA 1LCUA 4CZHA 3CHWA 2YHWA 2FXUA 4Y0WA 4FWSA 4RWTA 3ENOA 1ATNA 2H3GX 4PKIA 3O5BA 2GTDA 2P9KA 5ELZA 3DWLA 3HI0A 3IUCA 5AFUA 3CQXA 4J8FA 3VEYA 2P9PB 2Q2RA 4DQ8A 3EN9A 3GE1A 3FR0A 1TUYA 3H6EA 2YJFA 4PKHA 2J4RA 3MN5A 4IZ9A 1NGCA 2QWRA 4BR5A 5AZIA 4C23A 3CJBA 5TKYA 2P9IB 3MCPA 3TPQA 3ZEUA 3D2EB 3B8AX 1HKGA 4MO4A 1TUUA 5KPZA 3ID8A 2IVPA 1C0FA 2A40A 4BRHA 3ZX3A 5AQSA 4B1YB 1HLUA 3GOIA 1T44A 3JXUA 1QZ6A 4I6MA 1JCGA 3HZ6A 2A41A 4FWPA 3DXMB 1GLBG 2FLOA 4BGAA 4NB4A 3R9PA 3M1FA 4CZIA 1GLJO 3CJAA 2YI1A 1IG8A 3ATVA 2KHOA 4IJNA 3H46O 1U6ZA 4IXCA 4BREA 4MLEA 4H0VB 3MN7A 4CZJA 2OANA 2ASPA 1MWMA 2Q97A 5AZJB 1YVNA 4BRQA 2FSKA 2P9LB 3WQUA 2DPNA 1Q18A 4PKGA 3H1QA 3VEVA 5JLHA 4K25A 2VCPA 3A0IX 3CIPA 1YAGA 3U8XA 2ASOA 1DGKN 4MO5A 5BR9A 3SLCA 1NBWA 1HX1A 4FWNA 2E2NA 2GUPA 4H5VA 5CE3A 2GWJA 1NGEA 1WUAA 4CZFA 3O6WA 3R6MA 3VERA 5AQFA 2P9KB 3LL3A 5AQWA 1BO5O 3WXLA 4BR9A 2P9SB 3M6GA 3OHRA 1T6DA 4YDUC 2HOEA 3H3OB 5AQHA 1GLLO 1EQYA 3U9ZA 1J6ZA 3A8YA 1QQOA 4K42A 2D4WA 3H45C 4NO7A 2PBDA 4CZEA 4QS8A 4WQ5C 3ZEUB 3EL2A 1BA0A 1SAZA 5FPDA 5JLFA 4O8KA 1HPMA 3GL1A 1HUXA 1YXQA 3BP8A 2D0PA 1MDUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AAQA 5GIOA 1QQNA 1XC3A 3OYLA 4ZHRA 3THXB 3F2KA 3H1VX 5C10A 1Z05A 4EAHD 2HBLA 1ZBFA 1WOQA 4CK3A 2IS3A 2KZZA 1KTQA 4JV5K 1RT3A 4AHVA 3V9ZA 4B9LA 4GY2B 5I9EB 3P38A 3U3GA 1Z25A 4FLTA 4MLHA 2Z1IA 3F9MA 5AQUA 4BRMA 3R3LA 3CMEN 3AVNA 4NCAA 3NH1A 4WQ5A 3MN6A 4BE0A 2ZGZA 3WNEA 3U4LA 4C1NK 4ISEA 5AQVA 1NWKA 4ILHA 1K73O 2D0AA 2ZQBA 3VQ6A 3ZT3A 3L6QA 4JHDA 2UXBK 4A5AA 3TAEA 1L3UA 3IDHA 4BWJA 1D4XA 4CZLA 1IV0A 3C95A 1C1CA 5BN9A 3ALYA 3SJHA 1HKCA 3E01A 4RW4A 2ZJPL 3RRHA 4FWLA 1A5XA 2JWKA 3MAQA 5EOYA 4N47A 2GV9A 5EXWA 3CJ1A 3K5NA 4KB1A 1JXBA 5AQQA 1I39A 1CLQA 1HNVA 4O0IA 3T1HK 1RDUA 2I5JA 3LPUA 4IO8A 3HP6A 4X62K 2W40A 1GOCA 5F0XA 4LC9B 3SUNA 2WC9A 1WSJA 2KLAA 4NCGA 3VEOA 4AM6A 5JICA 2YNFA 4BQZA 2UXCK 1I3AA 4W5QA 3NBPA 1NGAA 1DTTA 4Y1CA 4FLUA 4NCBA 3ENBA 3FZFA 3U9DA 3SZ2A 1EO1A 1TYQA 2FBVA 1UA0A 4CEFA 1X9JA 5HLFA 3NMUA 1LAWA 3LP1A 4FVMA 3S41A 1NMDA 4WF9L 4DR7K 1LWEA 1Z6RA 4KH4A 4BEBA 5HRNA 1TK5A 1SKWA 3DYAA 3AVCA 2GWKA 2RE2A 4FO0A 2YKNA 1U04A 4IEEA 4M7XA 3O9SA 3ZSQA 3K58A 4JHDB 5GINA 2HHUA 4FWOA 3U6FA 2WONA 2HNDA 4BRPA 5AZIB 2XY8A 1Y97A 4JRPA 4RTFD 1K6YA 2QM1A 4R5PA 3EE9A 3EE8A 1C0TA 3SPYA 4I9QA 4QOZB 2ZE2A 3MWTA 3AA4A 4JEPA 5KQ8A 4CEQA 3RVCA 3PSIA 3GBTA 3CI5A 5HOOA 1SUQA 1BI4B 5EY4A 4HUGA 4CJRA 4H0PA 5AQYA 2PYLA 2VQFK 4LF8K 3CXCM 5CR4A 3HT3A 4DUYK 4WCEL 2Q36A 3OYJA 4B3SK 3LPTA 2KFNA 1TYQB 1BISA 3LP2A 4KHQA 5AZJA 3MXMA 1REVA 2F9WA 2VWBA 1HPZA 4IBNA 4DV0K 3GDQA 3ZT2A 4LF7K 2X78A 4IFYA 4M45A 3OYMA 2FBXA 2Q3SA 3KVGA 2FBYA 1C0UA 3K2PA 1QHAA 1VQNN 5KPRA 3O08A 2V7ZA 4DV2K 4FWQA 1RBSA 2E6MA 3FFKB 4EZ9A 2JWLA 3R8EA 3Q7BA 4DTSA 4K0KK 3CFPA 3C94A 1CZ9A 5AQGA 3OYAA 3VEWA 4A62A 3KJVA 4G1QA 1TV6A 2OTLN 5D3GA 3K5MA 4HWIA 3O1BA 1IKVA 4DTPA 3L3VA 3ZSOA 4FM2A 3TSPA 3E9PA 4IEIA 4DV1K 3W0LA 3DLHA 1VRUA 4OKEA 4CBWA 1Q81O 3PO4A 1TKTA 4DQRA 3TR8A 4AHTA 1OH5A 3FZLA 5I42A 4X66K 3QNNA 3MX5A 4DSKA 5AQNA 3VGKA 1JLGA 4JNEA 4C8MA 3B6OA 4XH1A 5CZ2A 3FFIA 3AA3A 2P1JA 4WYBA 1ATSA 4EIAA 4OLBA 3D7EO 5GAGP 4M3WA 3VQBA 2VWJA 3C6TA 2UXDK 3L4IA 4AILC 4PL8A 4B9MA 4CBUA 3IFRA 3O1WA 1HRHA 3ZYYX 1T8EA 4N41A 4M3XA 2HF4A 5JS2A 2WUSA 2AP1A 2QKKA 1S1TA 3ZSRA 1SKSA 1NGJA 4DTOA 2Q31A 3IKMA 2OTJN 3SCXA 1YUWA 4CJ7A 2A3ZA 1VSLA 4OKJA 1RT2A 2CH5A 3SMPA 4U67L 4DU1A 2XY7A 2E1YA 4BVPA 1ZBSA 3RRGA 3M5RA 1S72N 4CJLA 4BC3A 1UOCA 2ETJA 1Q82O 2BUPA 2A42A 1NKEA 1RBTA 2KZMA 4GKKK 1LOTB 2BTFA 3VEZA 1IKYA 3F73A 4KH5A 2GBZA 2HW3A 2AA4A 1K8KB 3PY8A 2I7NA 4ID1A 4BR0A 4M3TA 3P31A 4H5NA 1RFQA 3KD5E 4CJPA 1VQMN 1BG3A 2Y1IA 3B6PA 4YOTA 3SQ4A 1KAYA 5LY3A 4FJ9A 4WQ4A 1NLVA 4CJ5A 5BPMA 4DTNA 4JI2K 1NNEA 2HBJA 3HRGA 1TKXA 4KB0A 3HBTA 3O4QA 3PX4A 3PLAA 4DV3K 2Y1JA 3TABA 4BRIA 3LANA 2PAVA 1C1BA 3CC2N 3MMVA 1HNIA 4CCHA 3HO1A 3C6AA 1NOZA 1U47A 1KSPA 4DTXA 2IVOA 1SL0A 4F2SA 3WEEA 1D9FA 4NXNK 4DQPA 1QZ5A 5FPNA 4DTUA 5HRRA 2QWLA 2YV0X 1LCUA 1TVRA 2A1RA 2YHWA 2G8KA 3ENOA 4M3RA 3O5BA 3ULDA 2GTDA 2P9KA 5C15A 5GAEP 1SL1A 4ELUA 1JLBA 4DQ8A 3EN9A 3T69A 4Z0UA 3CYGA 1TUYA 3OS0A 3H6EA 2HBKA 2YJFA 5CY4A 2J4RA 3OYCA 1NGCA 1JLQA 3QEIA 4BR5A 2HHSA 4C23A 3RR7A 3B8AX 4CJTA 2VG5A 1BCMA 4EP4A 3ID8A 2IVPA 1NJXA 1ZBHA 5C42A 1XI1A 5AQSA 5J1EA 1K9MO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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