2WUSA

Bacterial actin mreb assembles in complex with cell shape protein rodz
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
LRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Bacterial Actin Mreb Assembles in Complex with Cell Shape Protein Rodz.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
molecule tags Structural protein
source organism Thermotoga maritima
total genus 96
structure length 335
sequence length 335
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2wusA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2wusA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2wusA03
5BRHA 3WXIA 3VEVA 2E88A 4O5FA 3VGMA 2D1KA 3BF1A 3VEWA 4Z94A 4XH1A 2A41A 4K41A 1JCGA 2A5XA 3ZETB 1MA9B 1RFQA 4EAHD 3CI5A 3CQYA 1HX1A 3D7EO 5TKYA 5AZIB 4NB4A 2CGKA 1SQKA 2HF3A 2Q97A 3R8EA 1BG3A 1NGJA 1P8ZA 3ZEUA 1Y64A 2D0PA 3MN6A 5AQRA 3VF2A 2E2QA 5KPRA 3WEEB 3D2EB 1NGBA 1C0FA 5BN9A 3CHWA 2WUSA 3EN9A 4IXCA 4JD2B 2A42A 3LDNA 4CZKA 2HF4A 3R6MA 4FWPA 1NGAA 3FR0A 3O08A 4YDUA 2NRHA 4BR2A 4EHTA 3ZX2A 4BG8A 3DXMB 5LJWA 3FZKA 4CD1A 5EVZA 4H5TA 3VERA 3MN5A 2PAVA 5F2RA 4FL9A 3AARA 1G99A 5AZIA 4CZJA 1ESVA 3VEXA 2A3ZA 4H5VA 1DGKN 3DXKA 5AFUH 4YDUC 4Y0WA 4FWRA 1NGEA 5B8HA 4B1YB 5JLHA 1BUPA 4PKHA 3WEEA 3D2EA 4JAXA 5AQFA 4RCHA 2P9PB 2P9UB 3U8XA 3O1BA 3H1VX 3I8BA 5AQGA 4H0XB 4JD2A 1QQNA 5BR9A 3QICA 4FWNA 3CIPA 3LDLA 4CZEA 1NGDA 5AQMA 1GLAG 3LM9A 4BRNA 1KXPA 4FOEA 3DXMA 3QDKA 2HMPA 2ITMA 1Q18A 3O8MA 3CJAA 2P9IB 1HPMA 5E26A 3FE1A 3VPZA 1NGCA 3GOIA 1V4TA 1ZXOA 1NWKA 4H0PA 5AQJA 4CZFA 5KPZA 3O80A 3IUCA 2CH5A 3CJCA 4HWIA 1ATNA 3MMVA 1GLLO 4WQ5A 2EWSA 3W3DA 2QWOA 5AQHA 3U4LA 4J8FA 2Q0UA 4M63C 4K42A 3UB5A 1HJOA 4H0OA 2IVPA 4K43A 5FPMA 3TU5A 5KQDA 2P9UA 3LL3A 1JCEA 2VCPA 3A0IX 2ZGZA 1QZ6A 1WOQA 2E2PA 2P9SB 4ISGA 3MN7A 1NMDA 4RTFD 2GELA 3IMXA 1OKJA 1JCFA 1DKGD 4PL8A 4BRIA 2YJFA 3M1FA 4FPAA 4WQ5C 1MWKA 3UKRB 5LY3A 4BRAA 3AAPA 2A6AA 3H1QA 3L6QA 1KAZA 4BC2A 1S22A 2QWLA 3QB0A 3QFUA 3HI0A 4B1WB 1U2VA 5AQIA 3RSEA 3FGUA 1V4SA 4I6MB 5AQXA 4XH5A 3WUHA 1GLFO 2PBDA 4FWMA 3WQUA 2VYPA 4BC3A 5AZJB 4PKGA 2AP1A 2CGJA 3GBTA 4BRGA 4E1JA 4BRCA 3HSCA 2IVNA 4M7YA 3VF4A 3A5LC 1KAYA 2P9SA 3FLCO 1X3MA 5AQNA 1C0GA 2E8AA 3IDHA 1LCUA 3O6WA 4MLEA 3OHRA 4BR5A 2H3GX 3UKRA 1HKBA 5AQSA 1X3NA 5FPDA 4DCHA 3M3ZA 3JXUA 5AQOA 1IG8A 1H1VA 1ATSA 2GTDA 4CZIA 5KPTA 2YCHA 3SMPA 3LM2A 2QM1A 1E4GT 2P9KA 3BP8A 1NGFA 4QS7A 3UKUB 4BGAA 2P9NA 4I6MA 2FF3B 4XEIA 4AM6A 3SK3A 3ATVA 3VGLA 3GG4A 3QBXA 3ZETA 3ENOA 5AZJA 5FPEA 4JHDB 4BGBA 2KHOA 3C7NB 5FPNA 5ADXA 2HOEA 4CD3A 3BF3A 4IZ9A 2I7NA 4IWVA 3CETA 4CBWA 5EY4A 5BREA 2F9WA 3M6GA 3ID8A 2QWPA 1D4XA 1T44A 4H5WA 5AQWA 1NGHA 3VF6A 1TYQB 1K8KB 1LOTB 4FWLA 3WXLA 4MO5A 5JLFA 4A2BA 3MK6A 2W41A 3SLCA 3AAQA 3EZWA 3AY9A 1BWFO 1QZ5A 2V52B 1T6CA 3P4IA 4FOIA 2F9TA 3ENHA 2QWQA 3U9ZA 2QXLA 3WQTA 3UKUA 4GY2B 5KQ8A 2BUPA 4ISEA 2CH6A 5AR0A 4B1UB 4JHDA 1BDGA 5AQLA 5AQQA 4DQ8A 3GL1A 3H6EA 3EKSA 4CZMA 3CJ1A 1YXQA 3EL2A 4WYBA 3S41A 5JMVA 4CZGA 4L3QA 5BRFA 4B9QA 5E84A 3MDQA 5I9EB 3G25A 1IJJA 1K8KA 1TYQA 2OANA 3ZX3A 4BR0A 3KZBA 4BRFA 3CJBA 4BR9A 4FWOA 5EXWA 1Z6RA 4FWQA 4RWTA 1E4FT 2Q2RA 2P9PA 3VGKA 3D2FB 3ULEB 2YHYA 3QMLA 5ELZA 5JICA 4IO8A 4CBUA 2NZTA 4CBXA 2GUPA 5AFUA 2V7YA 3VENA 2IVOA 4BC5A 5F0XA 1R59O 3CQXA 3VEZA 4IJAA 2FSNA 3SJHA 2GWKA 2VWBA 3L4IA 3VEOA 4BRDA 1BOTO 4ISFA 2P9IA 2W40A 2ASMA 1BO5O 4C23A 5AQZA 4GNIA 1GLBG 3GE1A 3C0BA 3MCPA 1XUPO 3EKUA 1XQSC 2ASPA 5AQKA 4BRLA 3H3OB 4WQ4A 2Q0RA 1Z05A 2BTFA 3MN9A 3DWLA 1HLUA 3ULEA 4XH4A 5AQVA 2ZF5O 3H46O 4O8KA 1HKCA 1SZ2A 1ZBSA 4H5NA 1QHAA 1NBWA 1X9JA 1RDWX 3KHYA 1RGIA 4CZLA 5ADXH 3O4WA 4KBOA 3TPQA 4WQ4C 5BPMA 3LDPA 5AQUA 2FXUA 4B1XB 5BPLA 4M7XA 2P9LB 1S3XA 1NGGA 3WT0A 1ATRA 3A5OC 1QQOA 2CGLA 1HKGA 3JS6A 3A8YA 3ATUA 4A61A 3BUZB 4BRQA 5EX5A 3O1WA 2YI1A 1YAGA 4FSVA 3DXKB 4K25A 3U9DA 2UYTA 1U6ZA 1ZC6A 3B8AX 1NM1A 2J4RA 1BA0A 4QS9A 4MO4A 4FPBA 4CI6A 4MLHA 4A2AA 4DHYA 5AQPA 4BG9A 3DJCA 1EQYA 5BN8A 1XC3A 4IJNA 3VOVA 4AM7A 2Q36A 2IIRA 3IFRA 1MWMA 2I7PA 4BRKA 2FSKA 2P9LA 2E1ZA 5EOYA 4BRPA 4FO0A 2E1YA 4H03B 2D0OA 5BRDA 3UE5A 4PKIA 1YUWA 4DB3A 1MDUB 2YHXA 4F9OA 1BU6O 2E2NA 3KVGA 3LDQA 5BPNA 2FSJA 1GLEG 4A62A 2V51B 4BRMA 3A5MC 5AQTA 2GWJA 4EHUA 3C7NA 2NLXA 2D4WA 1BA1A 1TUUA 2FLOA 3CJ9A 2QWRA 4BRHA 1GLDG 4BVOA 1CZAN 4BQZA 1GLJO 3FFKB 5AQYA 3QBWA 2QW9A 3H45C 1QQMA 1KAXA 1GLCG 2E20A 3A5NC 4QS8A 3R9PA 3VEYA 5CE3A 4FWKA 2AA4A 4CZHA 3HZ6A 3FZFA 3O5BA 2E2OA 1WUAA 4PL7A 2A40A 2QWMA 3QFPA 3J8AA 3FZMA 4H5RA 2V7ZA 1SAZA 3H3NO 1U2VB 3WXKA 3RSEB 2YHWA 1J6ZA 4H0TB 3VESA 3CJ7A 2FF6A 3BEXA 3SMSA 4BR7A 3VETA 3EO3A 4BQLA 2DPNA 4LC9B 4B1ZA 4NO7A 3F9MA 3HBTA 1DEJA 4BR4A 1NGIA 4BC4A 3WXJA 4H0VB 1YVNA 5LJVA 4JNEA 3I33A 4FWSA 1NLVA 5F1XA 3CERA 2ASOA 3ZEUB 3HTVA 4EIAA 2QWNA 3W0LA 3DAWA 2YJEA 3FZLA 2GEMA 3D2FA 4H0YB 4BVPA 4EFHA 1TUYA 4BREA 2Q1NA 4BROA 2ZWHA 4B1VA 2ZGYA 3LDOA 3L0QA 1HUXA 3GDQA 4JN4A 2Q31A 1T6DA 2P9KB 3FZHA 3HM8A 4HTLA 4CJ7A 3ZX0A 2P9NB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OYNA 2FC0A 2UXCK 4O5FA 3KK1A 3BF1A 3VEWA 4CGHA 1TAUA 1XHXA 2A5XA 5CZ1A 2VQFK 1RFQA 4BWJA 4F8RA 2ZD1A 3OJSA 3VA3A 3L3UA 1BG3A 1YTAA 1TKZA 4OPHA 1HNWK 2P5OA 3VF2A 2FBXA 2NUBA 2IGIA 3WEEB 1NGBA 1O13A 1YI2N 1C0FA 4CEDA 4DFKA 3F73A 4A5BA 2O4IA 1QE1A 3CHWA 1C0UA 4JD2B 3TAGA 3DM2A 3ZT3A 3FR0A 4YDUA 2NRHA 4BR2A 3RMBA 4JI1K 1KFSA 1IH7A 3K5OA 5HRNA 1RBVA 2O8EB 1EWRA 4CD1A 1SL2A 3KK3A 4A5AA 4J2AA 2ZJPL 1NMNA 1J53A 5F2RA 3VEXA 4AHUA 3DXKA 3O3FA 1EWQA 4FWRA 5B8HA 5JLHA 3O4QA 1BUPA 4CJRA 4PKHA 1JLCA 3OY9A 3WEEA 4ZTJA 5AQFA 3U8XA 3H1VX 3P38A 3KD1E 3I8BA 3VQBA 3ZLJA 4H0XB 4JD2A 4JK7A 1Q81O 1QQNA 4FK0A 2G8HA 3CIPA 4CZEA 2G8IA 4BE1A 5AQMA 2KTQA 2WFBA 1GLAG 4CJ4A 2WONA 1BQMA 1LW2A 1OH7A 2O8EA 1Q18A 3CJAA 3QEWA 2HBMA 3FE1A 3VPZA 4GKJK 3GOIA 4DWIA 5AQJA 4CZFA 3FFIA 2F4VK 4BE0A 2PFUA 1CZBA 3PSFA 1GLLO 1B9FA 1LAVA 1RDDA 4O55A 4WQ5A 2AJQA 2WC9A 4H0OA 3TU5A 4CGFA 2O8CB 2UUAK 3LDSA 4DQPA 1VAZA 3M8RA 2ZGZA 5IWAK 2E2PA 2OPSA 5KI6A 4NXNK 1NMDA 3B6PA 3HP9A 1RDAA 3NE6A 1MWKA 3UKRB 2P5GA 4BRAA 1VQ4N 4EZ9A 1FKPA 4DR1K 1S22A 2HHUA 4IEEA 3QB0A 3PIOL 4RW7A 2KFNA 4IDKA 1IKWA 1U2VA 4OKEA 3CCQN 2B6AA 3L8BA 2G8UA 1Q8IA 3QNNA 4NCBA 3RWUA 4FWMA 1KFDA 2VYPA 4CHPA 2O8CA 4FJJA 1IV0A 4N47A 4DSIA 4M7YA 3CC7N 4E72A 1KAYA 3FLCO 3LALA 2E8AA 3HO1A 1LCUA 3OTOK 2YKNA 4MLEA 3Q7CA 4JI4K 2XO7A 3UKRA 4JLHA 1TL1A 3JSMA 3M3ZA 3JXUA 3SBTA 1VK0A 2HHHK 1ATSA 2GTDA 1HQUA 3CQ8A 5KPTA 2YCHA 2G8FA 5KRSA 1TKXA 3AVLA 2P9KA 1Z25A 3CCEN 1NGFA 1U47A 1TV6A 5KGXA 3UKUB 1NK7A 5AJ3K 2BANA 4K0KK 5JENA 4K8ZA 3HL8A 4XEIA 5E41A 3J81O 4FLYA 4C8LA 4MQ3A 3AA5X 3VGLA 1RT5A 3ZETA 2RHKA 1BHLA 2KHOA 3DRSA 3SAGA 4J2EA 1LW0A 4AHSA 2I7NA 4IWVA 4CBWA 3S3NA 2QWPA 4CCHA 4H5WA 1WSGA 1G15A 3L2QA 5JLFA 3AAQA 3EZWA 1WAJA 4CFAA 3V4IA 3P1GA 1VSKA 2QXLA 1BISA 3UKUA 2HBLA 4GKKK 4GY2B 4CGJA 4UY8O 5AR0A 3B6OA 4B1UB 1KVCA 3CG7A 4Y1CA 5AQQA 4DQ8A 3GL1A 3KLIA 3EZ5A 4M3ZA 3CJ1A 1YXQA 3MXJA 3RMAA 1L3VA 4CZGA 4B9QA 2VG6A 3NGIA 1A5VA 2VGNA 2NRVA 3KZBA 4BRFA 5EXWA 1Z6RA 1E4FT 2Q2RA 1JKHA 3OA9A 4C8KA 3ULEB 3QMLA 5ELZA 4FJ9A 4HCCA 4DF4A 4CBXA 1NJIO 5AFUA 2V7YA 4DR7K 3VENA 2IVOA 4BC5A 5F0XA 3VEZA 5HRSA 3ID6A 2HBKA 1U04A 2GWKA 2VWBA 3VEOA 3DLGA 3HPOA 1W2BM 2W00A 1BOTO 4ISFA 4C23A 3J7AP 4CF0A 5AQZA 2HSTA 1BI4B 1NG9A 3PSIA 3T3FA 4YOWA 3AVAA 4FM1A 2ASPA 4FLTA 2C1IA 3HVRA 4C8NA 3SQ0A 1J54A 1I39A 5GADP 1CLQA 3DWLA 1HLUA 3ULEA 4IG3A 2F96A 5AQVA 2JLEA 4CGDA 3MEDA 4O8KA 1VQNN 1HKCA 1SZ2A 1QHAA 3HT3A 1ITGA 1RDWX 3KHYA 5D3GA 4CZLA 3O4WA 4KBOA 4WQ4C 3OVNA 4ILHA 5AQUA 1C1AA 3V81A 2KW4A 2P9LB 1S3XA 1BI4A 5LMUK 1ZBFA 5I3UA 4A61A 3LP0A 4KHQA 4Q0BA 2NRRA 1BCOA 2UYTA 4CHNA 4DTOA 1QVFM 4KB0A 4Z0UA 4A59A 2P1JA 1BA0A 3VQDA 4CI6A 4MLHA 4JV5K 5AQPA 4OGCA 4R79A 3SPYA 5BN8A 1XC3A 3KLGA 3RRHA 1HMVA 3VOVA 2Q36A 3QEXA 3PX4A 2I7PA 3WNHA 2P9LA 5J2NA 4DUZK 1LAWA 3VTHA 4FO0A 2E1YA 1RTIA 2D0OA 3ZSRA 5TKWA 4JI0K 2YHXA 4F9OA 3LDQA 3CYMA 4PHTX 3CCUN 4YY3K 1NK8A 3CMAN 5AQTA 5GIOA 4FLUA 4ID5A 2X74A 1BA1A 1TUUA 3CJ9A 1LWFA 1GOBA 1QSLA 2HHWA 2HB5A 4KFBA 1FKOA 3HP6A 4HUGA 1JL2A 4BQZA 5AQYA 1QQCA 1KAXA 4FJGA 5C24A 3A5NC 3LP2A 4KTWA 3D0PA 3AVMA 4IO9L 1QSSA 4IOAL 4CGGA 4CJQA 2E2OA 4B9NA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1VSD A;  1N36 K;  5C15 A;  4GNI A;  4YOX A;  2HHQ A;  3P83 D;  4DKW A;  3NH0 A;  4XJX A;  3KJV A;  1WSE A;  4BRL A;  3NF7 A;  1RBS A;  3MEE A;  4WQ4 A;  2Q0R A;  4DTM A;  3ASM A;  3TAF A;  4FJM A;  3MN9 A;  4HCB A;  1UA0 A;  3T19 A;  2GX9 A;  2ZF5 O;  4YOU A;  1VQ7 N;  4O0I A;  4Z4H A;  4GV9 A;  1ZBS A;  4B9V A;  1S9E A;  4W5R A;  1X9J A;  1RGI A;  5ADX H;  4YOV A;  1ZBI A;  3VQ6 A;  3I0S A;  3HOS A;  3LDP A;  2ZM6 K;  4B1X B;  5BPL A;  3HM9 A;  2D0B A;  4M7X A;  3TSQ A;  1NGG A;  2QTD A;  1ATR A;  1S5J A;  3CFO A;  4BAC A;  1HKG A;  4LH4 A;  2BDP A;  3NH2 A;  3A8Y A;  3BUZ B;  4BRQ A;  1CXU A;  3D6R A;  1X9W A;  3QEV A;  2OZS A;  3V1O A;  1YAG A;  4F2S A;  2HHT A;  1EKE A;  1U6Z A;  1XMQ K;  1ZC6 A;  3TAP A;  3B8A X;  1NM1 A;  3KWI A;  3IS9 A;  3DLE A;  3AVJ A;  3SUO A;  4E7H A;  4FCY A;  1MU2 A;  1EQY A;  4IJN A;  3Q7B A;  3TAN A;  4DU1 A;  2IIR A;  5GIP A;  1MWM A;  3C6H A;  2FSK A;  3VQ5 A;  2E1Z A;  4BRP A;  3MCA B;  3ZSY A;  4H03 B;  3OYD A;  3UE5 A;  4F3O A;  3TAR A;  4Z4E A;  1NKC A;  1MDU B;  4ID1 A;  5BPN A;  1BU6 O;  3KVG A;  1KLN A;  1GLE G;  2R7Y A;  1R0A A;  4WCE L;  4BRM A;  3A5M C;  4FM2 A;  3VQ7 A;  3KLE A;  3OYC A;  1VQ9 N;  2NLX A;  2D4W A;  4E7K A;  5HOO A;  2HNZ A;  2FBY A;  4ZTF A;  2QWR A;  4BDP A;  4BRH A;  3CC2 N;  4NLB A;  3AO1 A;  3ZSX A;  1CZA N;  4G9Z A;  4CJ3 A;  4B9S A;  3H45 C;  1QQM A;  1GLC G;  3TAB A;  3PX6 A;  3TWH A;  1JLE A;  2AA4 A;  4CZH A;  3HZ6 A;  3FZF A;  4DSF A;  5KRT A;  3O5B A;  1NU0 A;  2A40 A;  4CJE A;  3FZM A;  3DLB A;  1ZYQ A;  2V7Z A;  1SAZ A;  3LAK A;  3WXK A;  3NH1 A;  1HNI A;  2JWK A;  1J6Z A;  3CJ7 A;  3ZSW A;  4KHP K;  2DPN A;  3SUQ A;  4NO7 A;  1REV A;  4Z4I A;  2ZJR L;  1CZ9 A;  1YVN A;  4M3U A;  4JNE A;  3I33 A;  2WBN A;  3THW A;  4OLB A;  3ZSO A;  4X64 K;  2ASO A;  3HTV A;  4JRP A;  3ENB A;  4JI5 K;  4PA1 A;  1RTJ A;  4BRE A;  4EFH A;  1KTQ A;  2XY5 A;  2Q1N A;  3TAQ A;  2KKZ A;  1D9F A;  2IAJ A;  3LP3 A;  3OYL A;  3OW2 M;  2BH1 A;  4CF9 A;  2DTU A;  2Q31 A;  1T6D A;  4B3S K;  4LF5 K; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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