2YJEA

Oligomeric assembly of actin bound to mrtf-a
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
367
structure length
333
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a pentavalent G-actin*MRTF-A complex reveals how G-actin controls nucleocytoplasmic shuttling of a transcriptional coactivator.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
molecule tags Motor protein
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 114
structure length 333
sequence length 367
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yjeA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2yjeA03
2F9TA 2Q0UA 1SQKA 3IFRA 4FO0A 4FWPA 4XH5A 5BN8A 4BVPA 1HUXA 2YJFA 3ZEUA 1D4XA 3O6WA 3WQTA 2Q2RA 3SMSA 2D0OA 4BRFA 4BR2A 3ZETB 1BOTO 3MN7A 3A5LC 3CJ9A 5KPRA 2QWOA 4B1XB 1BUPA 3LDNA 2ZGZA 4J8FA 4IJAA 3KZBA 3FZLA 2ASOA 4BR7A 3VGMA 2WUSA 3MN9A 3ZX2A 1SZ2A 3QFPA 3QMLA 2IVOA 4EHTA 4HWIA 2P9SA 2D4WA 2P9NB 4H5WA 2E88A 4JHDB 3W3DA 4DB3A 5F0XA 1U2VB 3MK6A 5AQWA 4BRQA 1G99A 3QFUA 1XUPO 2OANA 5AQSA 1YAGA 2Q31A 4FSVA 1TYQB 4BC2A 4WQ5C 3UKUA 3VEVA 5F2RA 2Q36A 1RGIA 3O08A 4PKIA 1U6ZA 3G25A 3AY9A 2YI1A 4QS8A 4RWTA 2P9IA 2YHXA 3LDQA 5JMVA 5BPLA 4BR0A 2BUPA 4XH1A 3EN9A 1E4FT 5E84A 3I8BA 5AQHA 5EX5A 3A5MC 2VWBA 3CJAA 2F9WA 1LOTB 2NRHA 5AZJA 3QICA 4FWQA 1NGAA 4PKGA 3RSEB 3CHWA 1JCGA 3IMXA 5AQFA 2VCPA 5AQYA 4BG9A 1ATNA 2CH6A 4FOEA 5LJWA 4F9OA 1MWMA 4H5TA 2GUPA 4GNIA 3BP8A 5ELZA 4IO8A 1RFQA 4FWOA 1K8KA 1HJOA 2IVNA 2IVPA 1NGBA 3H1QA 3ID8A 2J4RA 3VEOA 3HSCA 3UKRA 4AM7A 5AR0A 3FLCO 4I6MA 4FPBA 3D2EB 3FGUA 2CGJA 5EXWA 4A61A 1T6CA 4K43A 3AAPA 3D7EO 3I33A 3ZX0A 1EQYA 2E2PA 4CZFA 3DAWA 2CGLA 2HMPA 5ADXA 3FE1A 3HTVA 3ZEUB 2E8AA 2GTDA 4CZIA 1BA1A 4ISFA 5BN9A 3HBTA 1JCFA 1MA9B 5FPMA 3VETA 3R9PA 3R8EA 2ASPA 4NB4A 1NBWA 4IJNA 4NO7A 5LJVA 5AQQA 4BRHA 3A0IX 5BPMA 1Q18A 3DJCA 3GE1A 3CJ1A 4YDUC 3WEEB 5AZIA 3LL3A 4O5FA 3VF2A 3CQXA 4QS9A 5BPNA 2E1ZA 2P9PA 1QZ6A 4FWSA 2KHOA 4FWLA 4EHUA 3BEXA 2ZF5O 3VEXA 4L3QA 3EL2A 3JS6A 3MCPA 1NGGA 4H0PA 4BRKA 2ASMA 3VEWA 4H0TB 3A8YA 1NMDA 1P8ZA 5B8HA 2D0PA 3WUHA 1ESVA 4BQZA 4BRNA 3CETA 4H5RA 3MDQA 4EIAA 3S41A 1ZXOA 4BR9A 4CZGA 2VYPA 1DKGD 3GDQA 3M1FA 4CD1A 3DXMB 3MN6A 3CJ7A 1BA0A 1IG8A 4DCHA 1YXQA 4H5NA 4M7YA 4Y0WA 1XQSC 4A2BA 2QWPA 1KAXA 2FSNA 4FWNA 5JLHA 3D2FA 5AZJB 3O80A 1GLBG 2D1KA 4BRCA 5AFUA 4WQ4A 1NGEA 1GLLO 3EZWA 4BRDA 2YHYA 3C7NB 2FXUA 2QWRA 3TPQA 3A5NC 2DPNA 3ULEB 4C23A 2A40A 3CIPA 2V51B 4H0VB 3GL1A 4H0XB 4EFHA 2NZTA 5AQVA 5BRHA 4EAHD 3HM8A 5EOYA 2A6AA 3VGLA 4B1WB 3UKRB 1KAZA 3W0LA 1QQMA 3LM2A 3B8AX 3J8AA 4CZHA 5FPEA 2GELA 3VOVA 3EKUA 1Y64A 4FWKA 3ENHA 3VGKA 2EWSA 2FF3B 5JICA 1DEJA 2AP1A 2P9KA 5AQTA 1LCUA 4B1UB 4GY2B 2P9LA 5FPNA 2QWLA 3CERA 1CZAN 4BREA 3VEZA 3VENA 3SJHA 3ZETA 4IWVA 4JAXA 3O1WA 3H3NO 3FZHA 1QQOA 2ZWHA 4BGAA 1BDGA 3L0QA 5AQMA 4M7XA 4DQ8A 2W41A 5KPZA 3HI0A 3LM9A 5BRFA 4BRAA 3H3OB 1WOQA 4M63C 2YJEA 1NGJA 2H3GX 1BG3A 1WUAA 4CBXA 4WQ4C 1BU6O 3QBWA 1T44A 2AA4A 3CI5A 5LY3A 4XEIA 3SLCA 3FZMA 2A42A 4MLEA 3VERA 3H45C 1BO5O 5AFUH 3QDKA 2A5XA 3EKSA 1TYQA 5AQNA 4JN4A 1J6ZA 4BVOA 4HTLA 2HF3A 3LDLA 5AQGA 1NWKA 5E26A 1GLCG 2NLXA 3O5BA 2V7YA 1MDUB 2P9UA 4PKHA 1GLDG 3VESA 1ATRA 3BF3A 5JLFA 1TUYA 4IXCA 4BR4A 2PBDA 2QWMA 4CZEA 2GWJA 1HPMA 3DXKA 3QBXA 5KQDA 1GLJO 3FZKA 3U8XA 3D2FB 1YUWA 3SMPA 2E1YA 3BF1A 4CZKA 3RSEA 4BC5A 4BRIA 2P9SB 2V52B 1E4GT 5AQPA 4BRPA 1ZC6A 4A62A 1HKCA 1HX1A 3WXIA 3ZX3A 4BQLA 3QB0A 3FZFA 3BUZB 2QWNA 1JCEA 1HKBA 4FOIA 4JD2A 5AQZA 3P4IA 4FWRA 2ZGYA 3GBTA 3ATVA 3UKUB 3WXJA 4WQ5A 3O4WA 3U4LA 3VPZA 1TUUA 3WT0A 4B9QA 4WYBA 3CJCA 2P9IB 3D2EA 3IDHA 1NGFA 4K41A 5BRDA 3ENOA 3HZ6A 3TU5A 5BR9A 5F1XA 1ZBSA 3M6GA 1SAZA 5AQXA 2FSKA 2CH5A 4AM6A 2P9KB 4CD3A 4PL8A 2P9LB 2HF4A 3AAQA 3U9ZA 3C0BA 4QS7A 4BGBA 1T6DA 5ADXH 2YCHA 3SK3A 4KBOA 4BRMA 1GLEG 2GWKA 1HKGA 1BWFO 1C0FA 1K8KB 2CGKA 2QW9A 4A2AA 3WEEA 4BRLA 2E20A 5AQOA 5AQJA 1X3MA 4CBWA 4K42A 4BC4A 1QQNA 4O8KA 4ISEA 4I6MB 5FPDA 1X3NA 4H0OA 2W40A 3VF6A 3L4IA 2BTFA 1OKJA 2FF6A 4BG8A 3M3ZA 5KQ8A 3FFKB 4MO4A 5AQIA 2YHWA 3CJBA 4CZLA 4CBUA 3A5OC 1NLVA 4CI6A 3ATUA 4DHYA 5I9EB 1C0GA 2V7ZA 2P9UB 3WXLA 3FR0A 4CZJA 2IIRA 3DXMA 3WXKA 2Q0RA 4E1JA 3WQUA 3F9MA 5AQRA 3CQYA 1GLFO 1KAYA 1MWKA 1QZ5A 2FSJA 1RDWX 5BREA 1YVNA 3KHYA 5KPTA 4IZ9A 3DXKB 1Z6RA 4XH4A 4YDUA 3UE5A 4ISGA 5AZIB 3OHRA 4CJ7A 2P9PB 3LDPA 3H1VX 3O8MA 4H5VA 5CE3A 5EVZA 2P9NA 1DGKN 3H46O 3U9DA 1HLUA 4JHDA 4H0YB 4BR5A 1Z05A 3C7NA 1NGDA 2E2NA 3ULEA 4MLHA 1U2VA 4BC3A 4FPAA 1KXPA 4JD2B 1V4SA 1S3XA 2Q1NA 5AQUA 4BRGA 2PAVA 2I7NA 4Z94A 5TKYA 3KVGA 1QHAA 2A41A 2GEMA 3VEYA 1GLAG 5AQLA 3IUCA 4B1ZA 3MMVA 3GG4A 4LC9B 4FL9A 3UB5A 3JXUA 2QWQA 4BROA 3AARA 5AQKA 2FLOA 2A3ZA 3R6MA 2UYTA 4MO5A 1IJJA 3L6QA 1ATSA 3VF4A 1R59O 2HOEA 1NGCA 1NM1A 2QM1A 2E2OA 1H1VA 4FWMA 2Q97A 4RTFD 3H6EA 3GOIA 1NGIA 4RCHA 4CZMA 4PL7A 2QXLA 4H03B 1X9JA 4B1YB 3O1BA 2ITMA 4B1VA 1XC3A 2I7PA 4JNEA 1V4TA 4K25A 3MN5A 2E2QA 3LDOA 5EY4A 3DWLA 1S22A 3EO3A 1NGHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OGCA 2Q0UA 1K8AO 2RHKA 1JLFA 3BDPA 2YJFA 2JGUA 4DR1K 1S1XA 3O6WA 2Q2RA 3LAMA 4FZXC 2D0OA 1RTIA 1YIJN 4BRFA 5M1QA 3SUOA 4MDBA 3ZT3A 1WNSA 1BOTO 3TTCA 3MN7A 4FVMA 3CJ9A 4I9LA 3KZBA 1LV5A 4OKEA 4IBNA 1ASVA 4AH9A 1QVGM 5IT9O 2WUSA 3RMAA 3WNHA 3PX0A 1S1UA 3QEVA 1VRTA 3RWUA 2X78A 4DLGA 1RT5A 3OJSA 1EETA 3MK6A 3L2VA 3HPHA 3QFUA 2OANA 1TYQB 1DT9A 4BC2A 3UKUA 1TVRA 2VWJA 4PKIA 1SS6A 2YI1A 3T19A 4RWTA 3DRPA 5JMVA 1R0AA 4BR0A 2BUPA 3LP3A 2VQEK 2IS3A 4KO0A 2VWBA 3VQ5A 4IG3A 4PA1A 2O8DA 4IKFA 3QICA 3LANA 3K58A 4PKGA 3CHWA 1JCGA 2O8FB 2VCPA 5AQYA 4EP4A 5LJWA 4F9OA 3V9XA 4H5TA 4OGEA 3ASMA 2ZD1A 4JK7A 4FWOA 5TKWA 3DLLL 1EO1A 3H1QA 1JJ2M 3TANA 1BL3A 4I6MA 4K0KK 4RW6A 3ZX0A 1NNEA 3DAWA 2XHBA 4IEIA 1C0TA 5KGWA 4KH6A 3ZEUB 5HRNA 4NCBA 4ISFA 1GOBA 5JVGL 4DFMA 3O3HA 3TAFA 1VQ8N 2NRXA 4LF4K 4NB4A 1NBWA 4IJNA 3A0IX 5BPMA 4EZ6A 4LSNA 2R7YA 3DJCA 3DOKA 2G8WA 2OTLN 2FC0A 4M3TA 4O5FA 4FLZA 3CQXA 4CHOA 4DQSA 2E1ZA 3PV8A 1QZ6A 4FWSA 2KHOA 4EHUA 3BEXA 2ZF5O 3AGKA 3MCPA 4H0PA 4IOXA 4BRKA 3CCUN 2D0PA 1ESVA 4OLAA 3VA3A 4BQZA 4B3MK 2X74A 1M90O 3CETA 1I94K 4CHPA 2OPQA 3MDQA 4FJ8A 3M8PA 5C0YA 4E89A 1CZBA 3VQAA 4KAZA 4CZGA 4Z4GA 2HNZA 1WSFA 1YJWN 4CD1A 2PYLA 3O3GA 4FM1A 2G8FA 5CYMA 1BIZA 4CEFA 3THYB 4Y0WA 2JWLA 2QWPA 1KAXA 4FWNA 3J81O 3D2FA 1B92A 3B6PA 4WQ4A 2HHXA 1NGEA 4IDKA 5FDLA 3F2KA 1Q9YA 1DTTA 4CIGA 2V51B 3GL1A 1EP4A 1N36K 4A5BA 4DSKA 3HM8A 2OCEA 5AJ3K 1RT3A 2YNHA 3QERA 3SUNA 4LY7A 5E41A 4DR7K 4OPAA 3UKRB 3QEPA 1SUQA 1RBUA 4JS4A 1ZBLA 3LPTA 5FPEA 3TAQA 1BQMA 3VGKA 4CW7B 2HHWA 2E6MA 1A5WA 3SAGA 2P9LA 3JSMA 4IOAL 1XI1A 1C1AA 1O1WA 4DV3K 3SBTA 3ID6A 4KH4A 3SQ4A 1W97L 3SJHA 3BZKA 3ZLJA 4L8RB 4JAXA 1F21A 2D5RA 4BWMA 1NMNA 1RBSA 3FZHA 4BGAA 1NJXA 4DQ8A 1QTMA 5BRFA 2F4VK 1G15A 1RT7A 4B8AB 3H3OB 1VK0A 4JI0K 2ZJPL 4XIUA 3P1GA 4U67L 3K5OA 4GV6A 3DLKA 4J2BA 5HL7L 1BU6O 4LF9K 4ELTA 4E7LA 3I8DA 2HHVA 1IO2A 1P90A 4DS4A 4CHNA 1VQLN 4MLEA 1X9MA 3VERA 1BQNA 4DU3A 3HK2A 3EKSA 4PWDA 1VSEA 4BVOA 3LDLA 5AQGA 3RTVA 1NWKA 1QVFM 3R3LA 3THWA 5M1NA 3VESA 1RDCA 1Z25A 3C6UA 1SKSA 4IXCA 1W7AA 4BR4A 1W0HA 1NK5A 2PBDA 2QWMA 3TARA 4H4OA 1HPMA 1GLJO 4ICLA 1YUWA 3VA0A 3V9ZA 3RSEA 4BC5A 2P9SB 4ZTJA 1E4GT 3U3GA 3KK2A 2IOCA 2O4GA 4BDPA 3UIQA 1E3MA 2VGNA 4LFCK 4CGGA 4CJLA 3ZX3A 5FRNA 4H8KA 1L3VA 2QWNA 4K8XA 3P83D 4N5SA 4Z4HA 4FWRA 2LSNA 3LWLA 4E1MA 3SPZA 4WQ5A 3OYJA 4BWJA 3VQ4A 4B9QA 3TSPA 2F8SA 2P9IB 3CC2N 3ENOA 5F1XA 3TU5A 4YOVA 4C8LA 4CESA 3ZT2A 1TK5A 2DFEA 3C6AA 4FW1A 2HNDA 1YJNN 1HPZA 2P9KB 3OYIA 4QS7A 4BGBA 3AVMA 4O55A 1VQ4N 3SK3A 2KTQA 1SKRA 4CGJA 2QW9A 4A2AA 5AQOA 4DTNA 3J7AP 4DTPA 4BC4A 4J2EA 4ISEA 3VF6A 5C24A 1FK9A 5GAGP 4M42A 1OKJA 4WF9L 3BGRA 3N4PA 3FFKB 4MO4A 5AQIA 3MEDA 4DQRA 3FFIA 3A5OC 4DHYA 3HRGA 1XHZA 2HVIA 3ZT1A 1C0GA 3THXA 1GOAA 4LFAK 4CZJA 3DXMA 4CEOA 2DFHA 4KHNA 3QINA 4CF0A 3OYMA 1RTDA 4XH4A 3HM9A 4YDUA 1CXUA 5AZIB 3OHRA 3SV3A 1YHQN 2P9PB 3OVNA 3CMEN 3H1VX 1UA0A 3QEIA 3EZ5A 4DTXA 1EXQA 2HBKA 2P9NA 4NYNA 1DGKN 3SQ2A 2UUBK 2O8EB 1KFSA 3C7NA 1IG9A 4B9MA 2GX9A 3VQCA 4JKBA 1U2VA 4BRGA 1JLGA 4Z94A 4LH5A 5FRMA 3KVGA 1QHAA 2A41A 4E1NA 3I0RA 3VEYA 5AQLA 1RCHA 3IUCA 4B1ZA 3MMVA 2WFBA 4CE9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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