2ZWHA

Model for the f-actin structure
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
374
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The nature of the globular- to fibrous-actin transition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein
total genus 114
structure length 374
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2zwhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zwhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zwhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2zwhA04
3LM2A 5KPRA 3IUCA 3LM9A 5AQYA 3IDHA 4FL9A 4K43A 1RDWX 4ISEA 1KXPA 3DXMB 4B1WB 5FPDA 3VPZA 2YHWA 4FWNA 1KAXA 3VGLA 1DGKN 4BREA 3M1FA 3ENHA 3EKSA 3GE1A 5F2RA 2VWBA 4BRGA 3H3OB 3O6WA 1T6DA 1NGHA 3UE5A 2QWNA 4YDUC 1H1VA 4CBWA 1SQKA 3DAWA 3C7NB 4PL8A 3VF6A 3CIPA 1NBWA 4CZEA 2FSKA 4FWRA 2ZF5O 1QZ6A 5E26A 3TPQA 5ELZA 5KPZA 4CZJA 3H6EA 1HKCA 3RSEB 1JCFA 1NGFA 5FPEA 2D0PA 4B1ZA 2YI1A 3VGMA 1EQYA 3VENA 2J4RA 5FPMA 3LDPA 3ULEB 3U4LA 4GY2B 3SMPA 3GL1A 3CETA 1NGBA 3FE1A 2P9PA 4IXCA 4JN4A 3AAPA 3QFUA 2PAVA 3D2EA 4IJNA 4BC4A 4XEIA 3CJCA 1NGEA 4XH4A 3ZEUB 5JLFA 2CGLA 2QWQA 4CD1A 4EFHA 2FF3B 1TYQA 5EVZA 4H5TA 4J8FA 5BPMA 2YCHA 4IO8A 4HWIA 3MDQA 2CH6A 5AQUA 4CZGA 4JD2B 3WXJA 2BTFA 3GOIA 3VETA 5AZJA 4HTLA 4BC2A 2ZGZA 1NMDA 2E2QA 4FSVA 3BEXA 1GLEG 2D0OA 2EWSA 1NM1A 1YVNA 2P9UB 3VEWA 2QW9A 3FLCO 4JHDB 2HMPA 1P8ZA 3F9MA 1U2VB 1ATRA 3HSCA 4DCHA 2QXLA 4CZHA 3FGUA 3GBTA 4B1XB 2Q1NA 5AQQA 4FO0A 4H5NA 2P9LA 3QICA 2CGKA 1BU6O 2CGJA 4E1JA 1LCUA 5AQPA 1MWMA 1SAZA 4PKGA 4B9QA 1NGGA 5JLHA 4K25A 3A0IX 2BUPA 5AQMA 3O4WA 4XH5A 4B1VA 4H0PA 5BR9A 1HJOA 2P9IB 4CI6A 2D1KA 2QWPA 3CQYA 3LDLA 3WXLA 5BRHA 2IIRA 3MN6A 3B8AX 4YDUA 1C0GA 4RWTA 4FOEA 3O1WA 4CJ7A 2Q0UA 4QS9A 2A3ZA 4A2BA 5AQFA 1NLVA 4H0YB 2ASOA 5AZIB 5BN9A 5AQTA 4BRKA 3ATVA 1MDUB 5BRDA 3FZMA 2YHXA 3SK3A 5B8HA 1SZ2A 4H0VB 3CJAA 3QFPA 4WQ5C 3ZETA 4B1YB 3P4IA 4BGAA 1BA1A 2Q36A 2W41A 4BR2A 2E2PA 5EY4A 3H3NO 3W3DA 5JICA 5AQXA 3VGKA 2QWOA 2QWRA 1GLAG 1E4FT 3U8XA 4BVOA 4FWMA 4B1UB 2W40A 5AFUA 3LL3A 4IWVA 5AQHA 2F9TA 4WYBA 5KQ8A 3SLCA 4BRDA 2WUSA 4PL7A 5AQIA 4BRFA 5KQDA 2PBDA 5I9EB 2VYPA 2OANA 3WQTA 2P9KB 3SJHA 3BP8A 2E88A 2A41A 1X3MA 2FXUA 1HX1A 2HF3A 3O5BA 1KAYA 3C0BA 1K8KA 1ATNA 4CZMA 4A62A 1Y64A 1NGJA 2V52B 3W0LA 5ADXA 4KBOA 1TUYA 1DKGD 1NGAA 3A8YA 4FWPA 4XH1A 3GDQA 4QS7A 2P9PB 5LY3A 4BROA 3C7NA 3FZHA 2D4WA 3UKUA 2H3GX 4EHTA 2P9SA 3D2EB 4FWKA 5ADXH 4FOIA 2FSNA 5BRFA 4A2AA 3VEOA 1RFQA 4ISGA 4BRAA 2E2NA 1BOTO 3IFRA 3CJ7A 4WQ4C 4CZLA 1V4SA 2ZWHA 3KZBA 3UB5A 2VCPA 3ULEA 3L6QA 5BREA 1V4TA 3KHYA 5AZJB 5AQRA 3FZLA 3AAQA 1NWKA 5BPLA 2HF4A 3CI5A 3L4IA 4BC5A 3A5MC 3VEYA 3EL2A 3ZEUA 4L3QA 3U9DA 1T44A 4BRHA 2Q31A 2NRHA 1JCEA 4BRQA 3A5LC 1G99A 3CQXA 2V7ZA 4JNEA 1S22A 4WQ5A 4CD3A 5AQOA 3GG4A 5KPTA 5AQNA 2ZGYA 3R8EA 3VF4A 1NGIA 4BR7A 3A5OC 3ENOA 4QS8A 1WOQA 1HKGA 1Q18A 2ASPA 3WUHA 3M6GA 3DXKA 4RCHA 3SMSA 2FF6A 4JAXA 1T6CA 4JHDA 1BG3A 4BC3A 4CZIA 4K42A 4I6MB 4PKIA 4MLHA 4BGBA 4BRIA 1U2VA 3VEVA 3J8AA 5AQJA 3O8MA 4EIAA 4H5VA 3A5NC 1HPMA 1D4XA 3JXUA 2Q2RA 4BR5A 4BRLA 4BRMA 3IMXA 2P9NB 3MN5A 1QHAA 3O80A 3FR0A 4ISFA 2YJFA 2HOEA 4EHUA 1HLUA 5TKYA 4CBXA 5CE3A 1OKJA 4K41A 4M7YA 3D2FA 1IJJA 3VOVA 3EN9A 3L0QA 3WEEB 2A42A 3QMLA 2GTDA 1S3XA 1GLBG 4O5FA 4H5WA 2AA4A 2Q97A 3H1VX 3R6MA 3H45C 3CJ1A 4H03B 5AQSA 4DHYA 4MLEA 4M63C 1BDGA 2E1ZA 3QBXA 5F1XA 1ATSA 3UKRA 2FLOA 3H46O 3S41A 3VEZA 2I7NA 2NZTA 3DWLA 1NGCA 4BG9A 1BUPA 4CZFA 1ZXOA 1GLFO 4WQ4A 4RTFD 3CJ9A 1Z05A 3I33A 2V7YA 4FWSA 3CJBA 3AARA 5F0XA 5EX5A 1MWKA 2QWMA 1YUWA 1C0FA 5AFUH 3CHWA 1GLDG 4BRPA 2I7PA 4BQZA 5EOYA 3OHRA 1X9JA 5AQVA 1DEJA 4M7XA 5AQZA 4BRNA 3DXMA 3BF3A 2A40A 3VEXA 1K8KB 3MN9A 3VERA 2GELA 4Z94A 1JCGA 4FPBA 1U6ZA 1MA9B 3EKUA 3MMVA 5BN8A 1YXQA 3JS6A 3ZX2A 3VESA 5BPNA 4FWLA 3LDQA 3FFKB 1GLLO 3UKUB 3G25A 3I8BA 3FZFA 3VF2A 2E1YA 2P9SB 4AM7A 4CBUA 2P9KA 4BG8A 3KVGA 4BQLA 4H0TB 3BUZB 4FPAA 2AP1A 5LJVA 4FWOA 3RSEA 1TYQB 3ZX3A 3HTVA 2A6AA 4DB3A 5AQGA 5JMVA 1ZC6A 2ASMA 4BRCA 2E2OA 3CERA 3HI0A 1QZ5A 2UYTA 3HM8A 3WT0A 1Z6RA 5E84A 2GUPA 3ZX0A 1BA0A 1XUPO 2GWJA 3EO3A 4PKHA 3LDNA 3TU5A 1RGIA 2GWKA 1KAZA 1X3NA 4O8KA 3MN7A 1J6ZA 2A5XA 4NB4A 3DJCA 3HZ6A 3O08A 2GEMA 4BR9A 1TUUA 4FWQA 4BVPA 3ID8A 3HBTA 4Y0WA 3WXIA 4JD2A 5AQKA 2KHOA 2QM1A 1XQSC 4LC9B 4A61A 4BR4A 2P9LB 2YJEA 3MK6A 1YAGA 1GLCG 3MCPA 3DXKB 4C23A 2QWLA 2P9UA 5FPNA 5AQLA 1NGDA 2E20A 4H0OA 4BR0A 3AY9A 4GNIA 1WUAA 2Q0RA 1CZAN 4AM6A 3H1QA 4EAHD 1BWFO 4F9OA 4MO5A 2V51B 3BF1A 2IVNA 4MO4A 3ATUA 1QQOA 3FZKA 2ITMA 3LDOA 1HUXA 5AR0A 2CH5A 3D7EO 3O1BA 1E4GT 2DPNA 1HKBA 3QDKA 4CZKA 4NO7A 3D2FB 3ZETB 4IZ9A 1QQNA 4I6MA 2E8AA 2P9IA 4DQ8A 2IVOA 1ZBSA 4H0XB 2NLXA 3M3ZA 1R59O 3R9PA 1LOTB 2F9WA 3U9ZA 5LJWA 3QBWA 2P9NA 3UKRB 2FSJA 5AZIA 5AQWA 1IG8A 1BO5O 2YHYA 2IVPA 4H5RA 1ESVA 4IJAA 3WQUA 1QQMA 1GLJO 3EZWA 3QB0A 5EXWA 3WXKA 1XC3A 3WEEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C8LA 3LM9A 4EP4A 4CFAA 1XC9A 3HRGA 3IDHA 3O4QA 2O8DB 4FLYA 3KD1E 1O13A 1KXPA 3KK1A 1KAXA 1DGKN 3MX5A 4UQGA 3ENHA 1KLNA 3DLKA 5GAGP 3NF7A 4BRGA 3CPEA 5CY4A 1T6DA 5FRMA 4OX9K 4ELVA 1LWCA 3B6OA 1YHQN 3WNHA 2ZF5O 2G8UA 5E26A 5KPZA 4CZJA 2ETJA 1JCFA 4CJ5A 2D0PA 5JS1A 4OGCA 3HJFA 2J4RA 2O4GA 5M1NA 3LDPA 3ULEB 4C1NI 3GL1A 4GV9A 3L3UA 2QTDA 3IG1A 5DM7L 4IXCA 4Y1CA 2OPQA 4Z0UA 3VA3A 3D2EA 5C0YA 2G8VA 1VK0A 2F8TA 4EFHA 1JLFA 2YV0X 1GOBA 1UOCA 5CZ2A 3CQ8A 4DKWA 1EX4A 1RTHA 4DTOA 1Q82O 4KTWA 3NVMA 1W97L 4JKGB 3SBGA 3DMJA 3LP2A 3QLHA 4LFAK 3FLCO 4FM2A 3OYHA 3MXJA 3F9MA 3G71N 3PIOL 4IBNA 3LZIA 3C6HA 3LWLA 4CZHA 4O5BA 2VG5A 1EWQA 3K5NA 4FO0A 4B9LA 1N5YA 4F2RA 1VQ5N 5FRNA 4FJGA 4LF5K 2CGJA 1QS4A 5JS2A 3DI6A 5JLHA 3NGIA 3A0IX 3O9QA 4E72A 3NGYA 4XH5A 4B1VA 5BR9A 4CK2A 4DFPA 1X9WA 3CQYA 4OJRA 1SUQA 1CXUA 3MN6A 1S72N 4JKCA 4FLZA 4FOEA 4DTUA 3KLIA 4FLUA 2A3ZA 3OA9A 4A2BA 4CFCA 4GVEA 3SAHA 1VRTA 1NLVA 5AQTA 4IFEA 2DFFA 3O9TA 1I3AA 3FZMA 3OVNA 1WSHA 5GADP 4PUOA 4IOCL 4A5AA 2Q36A 3DRPA 5EY4A 4DR7K 3W3DA 2D0BA 3CG7A 1WSGA 1NK5A 2NRZA 4KPYA 2W40A 4DQSA 2Y1IA 4OO1J 2NUBA 3SUQA 1TKZA 3T3FA 3KK3A 4G9ZA 1JKHA 2P51A 5MLCQ 2WUSA 4PL7A 2PBDA 1XHXA 1J5EK 2OANA 1SKRA 3S3MA 3SJHA 4GKJK 3BP8A 4FVMA 2A41A 4LSLA 2XY5A 3O5BA 1KAYA 1LAWA 4CERA 4CZMA 1BIZA 3ZT3A 4FJXA 2IS3A 3MEEA 4XH1A 1HJRA 4LH5A 3SQ2A 3CYGA 4FJ9A 1RDDA 3C7NA 1NU0A 1S1UA 3UKUA 1UA0A 2P9SA 3D2EB 2FC0A 4A2AA 3VEOA 4DR4K 2OPSA 4ISGA 1XMOK 4NLBA 3IFRA 4FZYA 3TTDA 1JLEA 1V4SA 1A5VA 3KJVA 1V4TA 2YHAA 4FJ5A 5AQRA 3AAQA 1NWKA 2O8BA 4DV5K 2HF4A 3V81A 2G8IA 3HXMA 4JI2K 4BC5A 1WB9A 3VEYA 4M41A 3EL2A 3ZEUA 1EO1A 1I39A 4CEZA 4M3WA 1OH6A 4O0IA 3IRXA 2W00A 4E7KA 5IT9O 5HRSA 1G99A 3CQXA 3OYAA 3ALYA 3GG4A 1TVRA 3LP0A 5AQNA 5M1FA 5C10A 2ZGYA 3O9RA 3OYCA 2KQ2A 5GIPA 1BHLA 4JRQA 3QEVA 4KH4A 4I7FA 1WOQA 1HKGA 1Q18A 2ASPA 2KLAA 1RNHA 3R3LA 1FK9A 2X6NA 3E01A 4RCHA 2KKZA 4BC3A 2QEXN 4BGBA 1U2VA 1RT3A 2VG6A 5AQJA 3O8MA 4NCGA 4H5VA 4YOVA 1D4XA 1FW6A 3MN5A 2YNFA 4B8AB 4CJUA 3ID6A 3LALA 4CIFA 1RBSA 4EHUA 3L2UA 5LMUK 5TKYA 5CE3A 1OKJA 3V9WA 1IJJA 3L0QA 3WEEB 4JKEA 2GTDA 4W5OA 2Z1JA 3NGZA 3R6MA 2PY5A 4MLEA 4M63C 3O9UA 1BDGA 4JK9A 4KAZA 1ATSA 3UKRA 5I3UA 4LF7K 2I7NA 1NGCA 4BG9A 4CJKA 3AO3A 1JLCA 3NF8A 3CJ9A 2V7YA 3T1YK 1RCHA 4FWSA 3CJBA 3CFPA 3ZT1A 4BE0A 4DF8A 3CCJN 4DU3A 2HHHK 3AA3A 3BF3A 4E1NA 3VEXA 2IDOA 5M1QA 1KCFA 2Y1JA 1JCGA 2GBZA 1U6ZA 2QXFA 1JL2A 1YXQA 1KTQA 5BPNA 4FWLA 3LDQA 1GLLO 3UKUB 3IKMA 2Q3SA 3I8BA 4CBUA 5C15A 2P9SB 2PZSA 3E1YA 3PX0A 1C0UA 1UA1A 2W42A 1VQ8N 3BUZB 1ZBLA 4BEBA 2NRVA 1A5WA 5LJVA 3RSEA 4FJHA 3KK7A 3SAFA 3CCLN 4B9NA 5C42A 2VG7A 1YITN 5JMVA 1ZC6A 2UXDK 1LAVA 3QEWA 1WSEA 2O8BB 3A2FA 2PFUA 5J2PA 1QZ5A 2VGMA 2UYTA 3CM6A 4F3OA 5HRPA 2UUAK 3ZX0A 3QEIA 1XUPO 4LF4K 4KB1A 1VSFA 1RGIA 1HRHA 2A5XA 5JVHL 3WXIA 1TK0A 2RE2A 4A57A 1XQSC 3AVMA 3K5OA 1VQKN 4BR4A 4JI5K 1J9AA 4N41A 3DRSA 4KO0A 2O8EA 1HYVA 3CFOA 5FPNA 1IKVA 5DM6L 3HPOA 2IC3A 1NGDA 5HROA 2OA8A 4BECA 1KVBA 1NJYA 4DV6K 4JEPA 1WUAA 3JAMO 4CHYA 4W5TA 1TK8A 4FJ7A 4EAHD 1BWFO 4MO5A 4DSJA 3BF1A 3TAMA 3ATUA 2VWJA 3FZKA 1NK9A 1RDAA 3LDOA 1QSLA 3OTOK 4FK4A 3I0RA 5AR0A 2CH5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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