3A5LC

Crystal structure of a dictyostelium p109a mg2+-actin in complex with human gelsolin segment 1
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
QALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAALNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAAAAIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
publication title Structural basis for actin assembly, activation of ATP hydrolysis, and delayed phosphate release
pubmed doi rcsb
molecule keywords Gelsolin
total genus 115
structure length 363
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5lC01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5lC02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3a5lC03
4FOIA 1Z6RA 5AZJB 5BN8A 2VWBA 3M1FA 4FPAA 3GL1A 2ZF5O 2YHXA 1Y64A 5BRHA 1H1VA 4FWRA 3VESA 3HI0A 3GOIA 3J8AA 4FWSA 3S41A 3VF4A 4BRNA 3JS6A 4IO8A 2GWKA 3O5BA 4BC3A 4CJ7A 2D4WA 4BRFA 1GLDG 3C7NA 3MN9A 3UKRB 3F9MA 3ZETA 1DKGD 3CQXA 1U2VA 4K41A 4EHTA 1XUPO 5KPTA 1GLBG 3WEEB 5B8HA 1DGKN 3HBTA 1SQKA 3DAWA 3P4IA 4YDUA 4L3QA 5AQZA 4B1WB 1NGJA 4BVOA 5EX5A 3WXKA 3H3OB 2FLOA 5AZJA 3VPZA 4XEIA 5AQUA 1NGEA 3ULEA 1OKJA 3R6MA 2P9SA 3EL2A 1GLLO 3O1WA 2HF4A 2P9UB 1K8KB 1TUYA 2QWNA 1NGAA 5AZIB 3D2EA 1XQSC 4BRMA 5F0XA 4BG8A 2DPNA 3DXKA 4FWMA 1WOQA 3VOVA 1TUUA 1Q18A 5JICA 3U9ZA 1NWKA 1QZ6A 4H0YB 2IVOA 2KHOA 4B1YB 3KVGA 3HZ6A 4C23A 3FFKB 3ZX0A 5AQRA 4BQLA 3AARA 1QHAA 2P9IA 3EZWA 3SMSA 2A6AA 4FWKA 4XH1A 2E88A 2V51B 4NO7A 5EY4A 2WUSA 3A5LC 4O5FA 4CI6A 1D4XA 3O8MA 1IG8A 1NLVA 2V7ZA 3HTVA 4BC4A 3R8EA 1NMDA 5JLHA 4DB3A 4RTFD 3SJHA 3ID8A 3D2FA 5AQWA 3H1QA 3LL3A 4H0XB 3R9PA 1ZC6A 5CE3A 3O1BA 4FWQA 4H5VA 2QWPA 5JMVA 1NGBA 3WT0A 3LDPA 5AQFA 3WXJA 3A5OC 3FE1A 1KAXA 3CETA 1IJJA 3GE1A 2A40A 3LDNA 4H0TB 4I6MA 4EAHD 3ATUA 3BUZB 3MCPA 3QFUA 1QQNA 5EOYA 4EHUA 2Q1NA 3MDQA 1HKBA 5BPLA 3UKUA 2YJFA 2GEMA 3WQTA 2EWSA 4K25A 1QQMA 3VEYA 3WQUA 4BRPA 1E4FT 3O4WA 1MWMA 1R59O 5AQYA 1U6ZA 1CZAN 1YXQA 4FWOA 3D7EO 4H5RA 4CZIA 2ASMA 3DJCA 3DXMA 4FO0A 5ADXA 3QDKA 3VGMA 3VEWA 5KQDA 3O08A 1BUPA 2NLXA 3BEXA 2QW9A 2FF3B 3I8BA 3IDHA 2I7NA 3W0LA 5JLFA 1KAZA 4JHDA 2E8AA 1DEJA 4B1VA 3QFPA 2A41A 3CJ1A 3A5NC 3LDLA 5FPNA 4BROA 4BRLA 4CD3A 4CBUA 4H03B 2FSJA 1T44A 5AQHA 5AQOA 2P9PB 5AFUH 4H0OA 3AAQA 3CJCA 1QQOA 3EO3A 5AQIA 5AQKA 2W40A 1ATNA 1SAZA 3QB0A 2P9KA 1J6ZA 5E84A 1TYQB 2V7YA 2OANA 2P9LA 2I7PA 3QICA 3H45C 1RFQA 3M6GA 4CBWA 5F1XA 1GLJO 2ZGZA 4K43A 4QS9A 1X3NA 3M3ZA 5AQJA 1WUAA 1BA1A 5EXWA 1HX1A 1XC3A 1BDGA 1X3MA 2E2OA 3BF3A 1YVNA 2YJEA 1BG3A 5LJWA 3A0IX 1S22A 4EFHA 1HPMA 5BRDA 3BP8A 4BRAA 4ISFA 3WXIA 1NGGA 4BRIA 2QXLA 4CZHA 3ENHA 5BN9A 2BTFA 3UKRA 2CH5A 2Q2RA 4FWNA 4WQ5A 5AQVA 4CZGA 3FZMA 2CGJA 3LM9A 2Q97A 5AR0A 3WEEA 4RWTA 3HM8A 4FPBA 4BRGA 4M7YA 5AQMA 4BGAA 4BRCA 4FOEA 4F9OA 1MA9B 3MN5A 3VEZA 4QS7A 2FF6A 3B8AX 3A5MC 2FSKA 4CD1A 2VCPA 4BC2A 2IIRA 4BRDA 2D1KA 5BR9A 4M7XA 2GTDA 5FPDA 2P9UA 1K8KA 4B9QA 2F9TA 3LDOA 2E2QA 5AZIA 1NGHA 1ESVA 2Q0RA 5LY3A 2GELA 4A2BA 5AQGA 3GDQA 2FSNA 1BO5O 3WUHA 3MN6A 4H0PA 4PKIA 3OHRA 4H5TA 1BWFO 2BUPA 2QM1A 3L4IA 4DHYA 4H5NA 4FSVA 3FZKA 4H0VB 1HUXA 3G25A 2Q0UA 3H46O 3ATVA 4K42A 1GLEG 5AQNA 1SZ2A 4XH5A 3H3NO 3VGKA 3GG4A 3SMPA 3AAPA 4PL7A 2QWQA 4E1JA 3LDQA 2A42A 3FZFA 4HTLA 2AP1A 4ISGA 1NBWA 3VEOA 3L6QA 5BREA 4MO4A 3W3DA 5TKYA 5LJVA 3CIPA 3CJ7A 4KBOA 4Y0WA 4CZJA 5AQLA 4MLHA 4WQ4C 3MMVA 1KAYA 2W41A 1BOTO 2QWLA 4MLEA 5AQPA 2HMPA 3O6WA 3ZETB 5F2RA 4MO5A 3EN9A 2QWMA 4B1UB 1T6DA 3ZEUB 3FR0A 2E20A 3FZLA 2IVNA 3HSCA 3EKUA 3GBTA 4JAXA 5E26A 4BRKA 4BR4A 4BGBA 3UE5A 4JD2B 3FGUA 4DCHA 4GNIA 2J4RA 4CZMA 5BPMA 3ULEB 3CERA 4DQ8A 2P9SB 5EVZA 3VEXA 3I33A 1T6CA 4A2AA 4PKGA 3D2EB 4IJNA 4CZLA 1ZXOA 3CJAA 1YUWA 3DXKB 5BPNA 3MK6A 2E2PA 1MWKA 3SK3A 3ZEUA 2P9PA 3DWLA 3LM2A 5ADXH 3VF6A 3CJ9A 1HLUA 2UYTA 3QBWA 1V4SA 2AA4A 4AM6A 2D0PA 3RSEB 4IXCA 1YAGA 2Q31A 2P9IB 3A8YA 4JD2A 2VYPA 3QMLA 4FWLA 5BRFA 5FPMA 4PL8A 2YHWA 1TYQA 4BC5A 2ITMA 3VERA 3U8XA 1RDWX 3C0BA 2ASPA 2CGKA 4BR5A 3ZX3A 1LOTB 2YHYA 1JCFA 1C0FA 1HKCA 1JCEA 2A5XA 2PBDA 2ZWHA 3D2FB 5KPRA 3U9DA 4BREA 4LC9B 3TU5A 1NGDA 3VETA 4M63C 4Z94A 4BR0A 2HOEA 3FLCO 5ELZA 2F9WA 1X9JA 4CZEA 1ATRA 1GLAG 4WQ4A 3EKSA 1EQYA 4QS8A 3TPQA 4IWVA 3U4LA 3FZHA 3VENA 3CI5A 4A61A 4CZFA 4H5WA 2ZGYA 1QZ5A 3CQYA 1ATSA 4I6MB 1E4GT 3SLCA 1BU6O 1Z05A 2E1ZA 2GWJA 1S3XA 3L0QA 4GY2B 3RSEA 4BQZA 4CBXA 1KXPA 5AQXA 2E1YA 2NRHA 1RGIA 2CH6A 4NB4A 4O8KA 4AM7A 4BG9A 2Q36A 3O80A 2IVPA 4BVPA 3UKUB 1NGIA 2PAVA 1V4TA 2H3GX 1HKGA 2QWOA 3IUCA 4CZKA 2YCHA 4ISEA 5AQQA 2NZTA 4YDUC 2GUPA 2HF3A 4PKHA 1BA0A 2CGLA 2P9NB 3CJBA 3KZBA 4WYBA 3DXMB 5AFUA 2YI1A 4BRQA 4BR9A 3ENOA 1JCGA 4IZ9A 4JNEA 4FWPA 1ZBSA 3H6EA 4JHDB 3BF1A 2V52B 5AQTA 3ZX2A 5I9EB 3VF2A 4J8FA 4HWIA 5KPZA 1NGFA 4IJAA 3VEVA 1MDUB 3MN7A 2D0OA 5AQSA 1C0GA 3JXUA 5FPEA 3WXLA 1NGCA 4WQ5C 3C7NB 5KQ8A 4BRHA 4B1ZA 2QWRA 4XH4A 4BR7A 4EIAA 1HJOA 1GLCG 1NM1A 2FXUA 3VGLA 4BR2A 4B1XB 1GLFO 1P8ZA 1U2VB 3H1VX 2P9KB 4RCHA 3AY9A 2E2NA 4A62A 2P9NA 3IMXA 2P9LB 3IFRA 3KHYA 2A3ZA 3CHWA 3QBXA 1G99A 2ASOA 4FL9A 4JN4A 1LCUA 3UB5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LW0A 5HROA 2G8HA 4DFMA 1NU0A 5BRHA 2ZJRL 4FWRA 3GOIA 4FWSA 4ID1A 3VF4A 4IO8A 3E1YA 2GWKA 3CC2N 1VRUA 2D4WA 3C7NA 2OTLN 5DM6L 4IOCL 4EZ9A 3ZETA 1DKGD 3MCAB 3NFAA 3CQXA 1XUPO 1Q8IA 2O8BB 4CJ4A 1NJZA 4FZXC 5KPTA 4FVMA 3PO4A 3L3VA 2D0AA 2NNWA 3QIOA 1N8RO 2BANA 5AQZA 1B9FA 3ZLJA 5AZJA 3H3OB 1L3TA 3CCEN 4XEIA 5C10A 3T1YK 4KRFA 4CEBA 3ULEA 4JI2K 3AGRA 3R6MA 4ZTFA 1KQSM 1GLLO 5M1PA 2HF4A 3TANA 2G8IA 1VSEA 5F0XA 2G8WA 1WSEA 4FWMA 5MLCQ 1WOQA 4ILJA 3VOVA 3J7ZO 4FLVA 1Q18A 4YNQA 2HNYA 1NWKA 4B3TK 2XY7A 2UXCK 2Q3SA 1GOAA 3ITHA 4M41A 2D0BA 1NK6A 1VQKN 4EP5A 2BE2A 2O8DB 5M1FA 3C6TA 3WNEA 4NO7A 3I0SA 2A1RA 1D4XA 3ZSYA 3D45A 2V7ZA 4BC4A 3R8EA 4W5NA 1QVFM 3IRXA 4B8AB 5JLHA 3SJHA 3RR8A 3D2FA 2HHTA 3I56N 4BE1A 5AQWA 3R9PA 5CE3A 3C94A 3M5RA 3O1BA 4IFVA 1J9AA 4H5VA 2E6LA 4W5TA 3OBYA 3P38A 5AQFA 4B9UA 3WXJA 3FE1A 1KRPA 3CETA 1IJJA 1KTQA 3LZIA 4CHQA 4FJLA 1QQNA 4NXNK 3L2RA 1WAJA 3MXMA 4I2PA 4KHNA 3UKUA 2YJFA 4CEOA 3WQTA 2HHIA 3VQBA 3VEYA 1S5JA 1VSHA 4BRPA 3AO1A 1E4FT 1C0MA 4CF0A 5AQYA 1U6ZA 3V9WA 4FWOA 4MQ3A 3CCMN 1XNRK 2OPRA 2ASMA 1LAVA 2QI2A 4CHNA 5ADXA 3VEWA 3G10A 3QDKA 3CCUN 3O9TA 3SZ2A 3LWLA 3NGYA 2E8AA 4B1VA 3QFPA 3LDLA 1D8YA 1X9SA 4B9LA 1K6YA 4Z0UA 4OKEA 5HBMA 5AQOA 3VMFB 2P9PB 4CEFA 4PQUA 1Z25A 4FJ8A 2DFEA 1JLQA 3O3FA 4DQIA 5AQIA 3E9OA 3KK3A 5AQKA 3VQPA 3SCXA 2HW3A 4IOXA 3DI6A 1BISA 3THYB 4BDZA 4GMJB 1X9MA 3PY8A 4XIUA 1GLJO 2WBNA 3HP6A 1HPZA 1X3NA 3G0ZA 5AQJA 3NGZA 4LSLA 3OW2M 4B3RK 3C6UA 1X3MA 3BF3A 1IH7A 2JWKA 3A0IX 3HP9A 3CCLN 4EFHA 3R3LA 1QVGM 1TK8A 3BP8A 4JI5K 4ISFA 3WXIA 4CK1A 4BE0A 2QXLA 3RRHA 4J2DA 5BN9A 1TKDA 3UKRA 3P31A 4WQ5A 4CZGA 1K73O 3TAQA 1NJIO 3G4SN 3IKMA 1IKYA 5AR0A 4AHUA 1QTMA 3K5MA 4FPBA 4C8MA 4BGAA 4BRCA 2VG7A 4BDPA 1VSIA 2ETJA 1LWEA 4CD1A 4F3TA 3V6DA 4N56A 2BGGA 2RPIA 4X66K 4DU4A 4BRDA 5BR9A 2GTDA 1EKEA 3VTHA 2P9UA 3DRRA 3LDOA 5AZIA 4NYNA 4DSFA 3DMJA 3DLHA 3ENBA 4DQQA 2GELA 4B9NA 1RT4A 1TAQA 3RMDA 4CECA 4H0PA 2FC0A 4KAZA 5CHIA 4H5TA 3V81A 5FRNA 3IAYA 1HYSA 2BUPA 4Y1DA 4H5NA 4FSVA 4CEZA 5FDLA 1DLOA 3AV9A 3L2QA 3S5TA 3VQ5A 5EU7A 1YF5L 5JVHL 1C0TA 5AQNA 1IKXA 1WBBA 4XH5A 3H3NO 3GG4A 3AAPA 2VG6A 1J53A 4Z4FA 1NBWA 4BE2A 2IC3A 1OH7A 4MO4A 1Z26A 1KVBA 1RTDA 4Y0WA 1JKHA 4O55A 3VQEA 1CZ9A 4CF2A 4CGFA 1IBKK 4WQ4C 1KAYA 4M3TA 1BOTO 3L2UA 2NRXA 3QNNA 2HMPA 1RTJA 2QWMA 4IDHA 2RHKA 1REVA 1T6DA 4RW4A 3SJJA 3JYTA 1A5WA 2IVNA 3N4PA 3EKUA 3GBTA 1JLFA 4BR4A 4BGBA 3A2FA 3ZSXA 3CYGA 3RWUA 1U04A 4JKAA 2QKKA 2R7YA 2J4RA 4CZMA 1N36K 4YOVA 5FROA 4TSXA 1D9FA 3OYEA 1VQ6N 4DR2K 4E7KA 3AO2A 3OYDA 2GUIA 3B6OA 3F73A 1T3VA 3DXKB 1OH8A 3TSQA 5BPNA 4N76A 3TTDA 1LWFA 1MWKA 1XMQK 3ZEUA 2VGNA 4A5BA 1VQ5N 3LM2A 5ADXH 2OA8A 3CJ9A 5LL6Z 1T03A 1O1WA 3QBWA 4E89A 4LF7K 3RSEB 1SL2A 2VYPA 4CF8A 1QQCA 3DM2A 1RTIA 4OPAA 1TYQA 1O13A 3NVMA 3AA5X 3CMAN 1IO2A 4JRQA 3AVCA 3ZX3A 3CFOA 1C0FA 1NG9A 3CC4N 1TKZA 2PBDA 3U9DA 3TU5A 1IV0A 2QTDA 4BWJA 4DTUA 2F9WA 1X9JA 4WQ4A 4CF1A 3EKSA 4IWVA 4FLUA 3FZHA 3KLEA 4H5WA 3F9KA 3SUPA 1ATSA 1NK4A 1Z05A 2E1ZA 1TK0A 4DR6K 4CBXA 1NKBA 2CH6A 3S3MA 2QKBA 3VQ7A 3O80A 4BVPA 2RF2A 3EEQA 4RW8A 2DTUA 2H3GX 5HRRA 4FLTA 1HYVA 2YCHA 5AQQA 3MX2A 4DFKA 4LF6K 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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