3A5MC

Crystal structure of a dictyostelium p109i mg2+-actin in complex with human gelsolin segment 1
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
370
structure length
364
Chain Sequence
QALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAILNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAAAAIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for actin assembly, activation of ATP hydrolysis, and delayed phosphate release
pubmed doi rcsb
molecule keywords Gelsolin
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 364
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5mC01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5mC02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3a5mC03
4NB4A 3EN9A 2P9IB 4ISFA 5AZJA 4B1YB 3FR0A 5AR0A 1X9JA 2ASOA 1DGKN 3IDHA 5AFUH 5AQTA 1GLBG 4XEIA 4H5VA 3VF2A 5AQMA 1GLLO 2A40A 1U2VA 3I8BA 4JNEA 4GNIA 3O5BA 1NGFA 5F1XA 3R8EA 3C7NA 3HBTA 3VEYA 4FWRA 1HLUA 3D2FA 3FZMA 4QS7A 3VERA 4B1WB 3WXKA 4RTFD 2QWNA 3IFRA 3LDNA 5BR9A 3CJAA 4K43A 4WQ4A 3ENHA 1GLJO 3O08A 4BR0A 4BRMA 4BGAA 1SZ2A 1HUXA 4CZHA 3O80A 1NWKA 3FZHA 1BO5O 3WXLA 4BG9A 2ZWHA 2IVNA 2GWKA 3HI0A 1NGDA 5AQHA 3ZX2A 3DXMB 3HSCA 3TPQA 3VEZA 3GL1A 3R9PA 3GE1A 3WT0A 4DB3A 1G99A 3WQUA 4BC5A 4BRCA 3FZFA 4EAHD 4K42A 4BC2A 1ZBSA 1QZ5A 3ENOA 5AQWA 1LOTB 3KHYA 5AFUA 1ESVA 4B1VA 2Q36A 2CGLA 5F0XA 1NGBA 3W3DA 3UKUA 4EIAA 5KPZA 4IZ9A 4CI6A 1BOTO 1Y64A 2P9KB 3GOIA 2NLXA 5AQIA 3MN6A 2PBDA 2D0OA 5AZIB 5FPEA 1T6CA 3KVGA 1P8ZA 2AA4A 4CZIA 2QM1A 3FZLA 1KAYA 3FZKA 4FWKA 1WUAA 2NRHA 4FWPA 4BRGA 2AP1A 3H46O 4PL8A 5EX5A 1Q18A 5AQGA 1QQNA 2H3GX 4ISGA 4Y0WA 1NGCA 3VEOA 3CERA 5BN9A 2QXLA 3O1WA 3ZEUB 4AM7A 1SQKA 2NZTA 3EL2A 4FWNA 4BROA 4M7YA 1S3XA 1JCGA 2E2QA 2P9NA 5KQ8A 2P9KA 4K41A 5BN8A 1NGGA 4MLHA 2GEMA 4GY2B 3VGLA 5AZIA 3VGMA 4FOIA 4BQZA 3OHRA 3VENA 4H0XB 3CETA 5AQYA 4WQ5A 4KBOA 3MN7A 3LDPA 4HTLA 4M7XA 4BRAA 4DCHA 3GG4A 4JAXA 2ITMA 2Q0RA 3RSEB 2UYTA 4YDUA 3IMXA 4FOEA 2FSJA 4BC4A 4CD1A 3G25A 4BG8A 5BRFA 3S41A 4I6MA 2GTDA 5I9EB 2E88A 3QFPA 4XH1A 1E4GT 3MCPA 1KXPA 1EQYA 2VYPA 5BRHA 5AQQA 3FLCO 4CZMA 2QWLA 5ADXH 3SK3A 3DXKB 2QWQA 3CIPA 1HPMA 4XH4A 4AM6A 3FFKB 4YDUC 4BRFA 5BPNA 2IVOA 5EY4A 4H5RA 1QQMA 4QS9A 5AQOA 4CJ7A 4FWLA 4IO8A 3GDQA 4BC3A 3LL3A 4BR5A 3SMSA 3A5NC 2I7NA 2P9UA 2ASPA 3MN9A 3AAQA 3M3ZA 2QWMA 3AAPA 3MDQA 3VEXA 3WEEB 2P9IA 3LDLA 1CZAN 4BQLA 3H1QA 3VF6A 2A5XA 4O8KA 2CGKA 2EWSA 4IJAA 4B1XB 2BTFA 2YHWA 4JHDB 3DXKA 4BVPA 1D4XA 4PKHA 3MK6A 5EVZA 2F9TA 4IJNA 4O5FA 3HZ6A 1NMDA 4B1ZA 3VF4A 1T6DA 5LJVA 3L0QA 4M63C 3CJBA 4WQ4C 5E26A 4BVOA 2GELA 1E4FT 2FLOA 1MWMA 3LM9A 5ELZA 3A5MC 3C0BA 3HM8A 3LM2A 5AQXA 5LY3A 5B8HA 3CJ9A 3CHWA 3CJ7A 4MLEA 3WEEA 2YHYA 2P9PB 2V51B 3ZX3A 4BR7A 1MDUB 3TU5A 1K8KB 1YAGA 5ADXA 3UKRB 1KAXA 4H5TA 3WQTA 3VESA 3ATVA 4FWOA 4LC9B 2IIRA 1WOQA 4L3QA 2CH6A 2V7ZA 3R6MA 4H5WA 1MA9B 5AQVA 4JHDA 4CBUA 1RGIA 1U6ZA 3DXMA 3CQXA 3ZETB 5AQLA 1NBWA 4CZJA 5JLFA 2VWBA 3VEVA 3GBTA 2E8AA 1Z05A 3J8AA 1TYQB 5JLHA 4FL9A 3D2EB 1X3MA 2Q97A 3A5LC 3O4WA 4J8FA 2V52B 2PAVA 2YJFA 4B9QA 2P9PA 3B8AX 4ISEA 1K8KA 3UKRA 3CI5A 4A2AA 1NGJA 4CZLA 1V4TA 5BREA 5JMVA 1ZC6A 4FO0A 5BRDA 3FE1A 4NO7A 1BU6O 1XUPO 2HF4A 3ZETA 1GLEG 1R59O 2VCPA 4FPBA 2ZGZA 4IWVA 1XC3A 2ZF5O 3JXUA 3QB0A 1ZXOA 5JICA 1TYQA 3AY9A 5BPLA 3D2EA 1LCUA 3A8YA 1Z6RA 1C0FA 2FSKA 2HF3A 1QQOA 2YJEA 2YI1A 5FPDA 1BA1A 2HMPA 4A62A 3AARA 1NM1A 3O6WA 2V7YA 3ZEUA 5FPMA 4HWIA 5EOYA 3VETA 3F9MA 1IG8A 1ATSA 3BEXA 5AQSA 2FF3B 4RCHA 4BR2A 4WQ5C 1U2VB 3LDQA 1BWFO 1QZ6A 2Q2RA 2KHOA 2CGJA 3EKUA 4BRIA 5E84A 4BRLA 3C7NB 1J6ZA 3H3OB 2A42A 4CD3A 4H0VB 4H03B 3VGKA 3WXIA 4A2BA 3DAWA 3P4IA 2Q31A 1NLVA 2GUPA 3CJCA 3RSEA 2F9WA 2BUPA 4PKIA 4CZFA 1DKGD 4FWSA 1BG3A 3U9DA 1HKBA 4WYBA 2DPNA 3U8XA 4BRKA 3QBXA 2W41A 3EKSA 4H5NA 4BRDA 3EO3A 5AQRA 1X3NA 5AQKA 2QWPA 4DQ8A 3L4IA 3DWLA 3HTVA 3LDOA 4FWQA 3WXJA 4A61A 2QW9A 5F2RA 4H0YB 4FWMA 4CZKA 1NGIA 3JS6A 3VOVA 2IVPA 2D1KA 3BF1A 3BF3A 5EXWA 2GWJA 3FGUA 4JN4A 2CH5A 3QMLA 1JCFA 3VPZA 1GLCG 4H0PA 3QBWA 3UKUB 4BR9A 3CQYA 3H45C 1YXQA 2WUSA 4MO4A 4BRPA 2ASMA 2OANA 3O1BA 4FPAA 3U9ZA 1MWKA 2A3ZA 5AQFA 5CE3A 3SLCA 3L6QA 4CBXA 2Q1NA 3U4LA 2QWOA 4BREA 3A5OC 4F9OA 3ULEB 4QS8A 4XH5A 3M6GA 5FPNA 4CZEA 4RWTA 1YVNA 2A41A 4B1UB 1JCEA 2HOEA 2YHXA 3SMPA 3A0IX 3D7EO 1NGHA 3I33A 3W0LA 4PL7A 2P9LB 3VEWA 1BDGA 3UE5A 3IUCA 3H1VX 1HJOA 3DJCA 2I7PA 1QHAA 5KPTA 4MO5A 2FF6A 2P9NB 3EZWA 5AQZA 3ATUA 1ATNA 2W40A 1T44A 1HKGA 1YUWA 2YCHA 1OKJA 4C23A 1NGAA 3H3NO 1KAZA 4PKGA 1IJJA 3ULEA 1GLAG 1TUYA 4JD2B 5TKYA 1S22A 2ZGYA 3UB5A 5KPRA 2E1ZA 1TUUA 4BRHA 2QWRA 4CBWA 1RDWX 4BRNA 2P9LA 1HKCA 4BRQA 4H0OA 4EHUA 3H6EA 2Q0UA 1RFQA 3KZBA 1BUPA 5KQDA 4CZGA 2E2NA 5AQUA 2P9SB 4Z94A 3QICA 4I6MB 4E1JA 4EHTA 4BR4A 1SAZA 1H1VA 3CJ1A 3MN5A 5AZJB 4DHYA 4EFHA 2E2OA 4K25A 1NGEA 2E2PA 3SJHA 3BP8A 3ID8A 2A6AA 4IXCA 1GLDG 2FXUA 1DEJA 4JD2A 3BUZB 4FSVA 5AQPA 1GLFO 3ZX0A 5AQJA 2D4WA 3WUHA 2E20A 1V4SA 1XQSC 3MMVA 5AQNA 1ATRA 2D0PA 3O8MA 4BGBA 2FSNA 5BPMA 4H0TB 2J4RA 2E1YA 3QFUA 3D2FB 2P9UB 3M1FA 5LJWA 1HX1A 3QDKA 2P9SA 1C0GA 1BA0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EN9A 2P9IB 1VSJA 5AR0A 3OYNA 3TR8A 3IS9A 5LMUK 1VRUA 4CGDA 2Q3SA 4H5VA 1N32K 5AQMA 3I8BA 3R1XA 1J5EK 4GVEA 5JVHL 2Z1IA 1TV6A 1VHXA 3AO3A 3NGIA 5F1XA 2WC9A 3KK2A 4KPYA 4FWRA 4CF2A 2RE2A 3D2FA 4AHCA 4CJKA 4B8CA 4K43A 4WQ4A 2WONA 3NF9A 1GLJO 1KLMA 2XY7A 4BR0A 2YKNA 1SZ2A 4FW1A 2F96A 3O80A 3K5OA 1KVBA 3AO5A 1M90O 3S3NA 4B8AB 3WT0A 3K5LA 4BC5A 4DFPA 2HBKA 4CGIA 3S5TA 4BC2A 2W6LA 2VWKA 4C8KA 1Q9XA 3HL8A 4OPKA 1VSLA 4LH4A 5AFUA 3KHYA 4X64K 2Q36A 4M41A 2CGLA 3EEQA 5F0XA 3OS2A 1MU2A 3W3DA 3UKUA 3L2VA 3CPEA 3GOIA 2XO7A 4HHTA 3I8DA 1ILYA 4C1NK 1A5WA 5M1PA 3V9WA 3QESA 4HUGA 3ITHA 4LFAK 2WBNA 3TABA 1XHZA 2YX6A 4PQUA 2QM1A 1KAYA 2QXFA 4FWKA 4FWPA 2AP1A 3V9UA 4PL8A 5EX5A 3OYJA 3KLEA 2H3GX 4Z4HA 2A1SA 3VEOA 3CERA 5BN9A 1ZBFA 4CEDA 3EL2A 3THXA 5EU7A 1JCGA 2P9NA 3SBTA 3C6AA 3QLHA 4K41A 5BN8A 1NGGA 5FLXO 2GEMA 3VGLA 4A59A 1RT5A 1N6QA 4KRFA 3OHRA 3S3MA 4DSFA 4H0XB 5AQYA 1S1XA 3C94A 3OYGA 3MCAB 4HTLA 2HHWA 4CJEA 1NKCA 4M7XA 5HOOA 3OS0A 3ZSVA 2ITMA 2Q0RA 3RSEB 4DTRA 1WN7A 2UYTA 1NJXA 2NRZA 1BL3A 3AVFA 1KVAA 3CM6A 2E88A 3EZ5A 1E4GT 4EP5A 4KHYA 1R0AA 4DFKA 4IOXA 4FLUA 1YHQN 1VQMN 1FK9A 5ADXH 3DXKB 4E3SA 1HPMA 4FLTA 5HRRA 4H4OA 3VQBA 5EY4A 4M3YA 1QQMA 1LWFA 2BGGA 4FLYA 2E6LA 4IO8A 3GDQA 4F4KA 3OYDA 4BR5A 2XHBA 3RTVA 1TK0A 4LF5K 3QO9A 2HNYA 3OJUA 3AGKA 4B08A 3SAFA 1VQ8N 1U4BA 4H4MA 4FJKA 1CZAN 2IGIA 4FJMA 3VQ8A 2CGKA 2UUBK 2O8CA 3NE6A 4FLWA 2F9TA 4IJNA 4LF4K 1C0MA 3IAYA 1ASWA 1WB9A 3AVAA 1NMDA 4QCLA 1T6DA 3T3FA 4I9QA 3CJBA 4BACA 5CR4A 3LM9A 5ELZA 3A5MC 5LY3A 3KLFA 4IDKA 3CD6N 1VQPN 4AF1A 2HBLA 3CHWA 3CJ7A 4OLBA 3LANA 5M1OA 4BE1A 4FJ9A 1D9DA 1JL1A 2P9PB 4DV0K 2G8VA 3OYIA 4YNQA 3AVJA 3NMUA 3DLBA 4FWOA 3KWGA 1WOQA 2V7ZA 3HYFA 5AQVA 3RWUA 3OW2M 1RGIA 1FW6A 1OH8A 3HJFA 1U6ZA 3K9KA 3ZETB 2O4GA 1W0HA 2QKKA 2IC3A 4CZJA 3DMJA 1VQKN 3SAGA 1S1WA 3OJSA 3K2PA 4DLGA 1LW0A 3D2EB 1SL0A 1X3MA 4AH9A 3RR8A 5HRSA 4C8MA 1IH7A 3TWHA 4OKKA 2PAVA 4NXNK 3RR7A 3ZT2A 3JAMO 1RT3A 3AA4A 2OTJN 1IBMK 4CEEA 4M3XA 2Y1IA 4CZLA 1V4TA 4I9LA 4E19A 4JI0K 4EZ9A 2UU9K 4LH5A 4NO7A 4I2PA 4N56A 3AV9A 3SAHA 2ZGZA 3AVNA 4IWVA 1NNEA 1XC3A 2ZF5O 1ZXOA 3N4QA 4FM2A 3AY9A 3MWTA 4XIUA 1M1KO 4B3OA 2NRRA 2O8FB 4B9SA 3CXCM 1BA1A 3LP0A 3KD1E 2G8HA 3CCVN 3O6WA 4E89A 2V7YA 1WAFA 5EOYA 1NK5A 3PY8A 4DQSA 4DQIA 1VSDA 1WSEA 1HQUA 1RNHA 1ATSA 1TKTA 2VWJA 2IAJA 1BGXT 1BWFO 1QZ6A 2Q2RA 3T7ZA 3CFPA 3DOLA 4LF7K 3B6PA 1JLBA 1XMQK 4B3RK 2A42A 4H03B 5TKWA 3VGKA 3ZLJA 1FJGK 4YFUA 4A2BA 3P4IA 4BDYA 2Q31A 4YOWA 4FJHA 3ULDA 1JKHA 5HLFA 1S1VA 1Q9YA 3L3UA 2F9WA 1JLFA 2ZJRL 4YOVA 3U9DA 3OA9A 4F2SA 1QTMA 1J5OA 4BRKA 1HNZK 3EKSA 4A5AA 2C1IA 3M8SA 4BRDA 5AQRA 1X3NA 4X65K 2QWPA 4LD0A 3L4IA 3DWLA 5JENA 4DR4K 2AJQA 2QW9A 1CLQA 4FWMA 1C0UA 1A5VA 3LP3A 2IVPA 4JKDA 2OA8A 4E72A 4O44A 1IG9A 1RDBA 3MXMA 1T03A 5EXWA 2GWJA 3FGUA 5CHIA 4JN4A 3KK7A 2G8IA 3CG7A 3UKUB 1OH5A 3CQYA 4G9ZA 3SBGA 4BRPA 4FPAA 3U9ZA 3HO1A 5JS1A 4KHWA 5AQFA 3L6QA 4BREA 3THVA 4XH5A 1VRTA 5FPNA 4RWTA 1YVNA 3THYB 4KAZA 4FK2A 4B1UB 1UWBA 2GUIA 3NGZA 3VQ6A 2RF2A 4KKOA 4KHUA 4M3ZA 3SMPA 4V19S 2BDPA 2P9LB 1Q81O 4BY9C 3LALA 1BDGA 4CJFA 3IUCA 4FW2A 1HJOA 1ZBUA 3QIPA 1NG9A 4PY5A 2P9NB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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