3A5OC

Crystal structure of a dictyostelium p109i ca2+-actin in complex with human gelsolin segment 1
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
366
Chain Sequence
QALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAILNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAAAAIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for actin assembly, activation of ATP hydrolysis, and delayed phosphate release
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Gelsolin
total genus 114
structure length 366
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5oC01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5oC02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3a5oC03
1T6DA 3BF3A 1X9JA 5TKYA 4H5VA 1NGEA 1QHAA 1BDGA 2W41A 1HKGA 3FZKA 3O80A 3UE5A 1JCEA 5AZJA 4BG9A 3KHYA 4CBUA 5EOYA 1HX1A 2ZGYA 2ZWHA 2ASPA 3VESA 3W3DA 4BC5A 1XUPO 4CZJA 2BTFA 3WQUA 2A5XA 5ADXH 3GOIA 3GG4A 1GLLO 3VEOA 4DB3A 3RSEB 4ISGA 2V7YA 3EO3A 1DKGD 5AQFA 1XQSC 3AARA 2WUSA 3TPQA 2P9NA 3CQXA 4C23A 3O8MA 5AQQA 1NGCA 2HOEA 2P9LB 1GLJO 2YI1A 3VF2A 4BRKA 2Q0UA 4FOEA 4B1ZA 1JCGA 2E2QA 4JAXA 3VEZA 1D4XA 2ITMA 5E26A 1C0FA 2IVNA 1ESVA 4BR4A 1QZ6A 3ZX0A 4JD2B 4CZMA 2P9NB 3CJ9A 5LJWA 3R8EA 3VERA 1GLFO 3UKUA 2GWJA 1HKCA 1NM1A 2P9UA 5JLHA 4GNIA 4H5WA 2QWNA 3VF4A 1MWMA 4O5FA 3LDNA 3BP8A 5AQTA 2ASMA 5AQPA 3AAQA 3U9ZA 5FPNA 4IJNA 5BR9A 5AQZA 4B1WB 3FLCO 3A0IX 3A5NC 2ZF5O 2D4WA 5AFUA 2GTDA 5AQWA 5BPNA 1GLAG 3H45C 3I8BA 4CBXA 4IWVA 2A3ZA 3JS6A 5KPRA 5KQDA 1BA0A 2QWOA 3DXKA 4BC2A 1BUPA 4FWQA 2P9PA 4A2BA 4XH5A 1HJOA 3ATVA 2IVOA 3D2EB 4BC3A 3VGLA 4B1YB 1TYQB 3DJCA 2Q36A 2J4RA 2QWPA 3ZX3A 1NGJA 1KAXA 3WEEB 3S41A 4RWTA 5JICA 4BR7A 3LDOA 4FWMA 3VPZA 5KQ8A 3JXUA 2EWSA 2F9TA 3G25A 4FWSA 4H03B 3A5OC 3QBXA 3CIPA 4M7XA 4BGAA 3H3OB 2FF3B 1YXQA 4MO5A 1LOTB 2DPNA 5FPEA 4DHYA 1P8ZA 3P4IA 3ENOA 1CZAN 1TUUA 1ZC6A 3QB0A 2E2OA 1QQOA 2YJEA 3UKRA 2Q97A 2IVPA 1Z6RA 3VOVA 1GLDG 1NGAA 1ATRA 1G99A 1Z05A 2BUPA 2FSKA 3ENHA 3WT0A 2P9KA 4M7YA 4BGBA 4BRFA 3H1QA 1NMDA 1MDUB 3O08A 1ZXOA 2D0PA 2YHXA 2Q1NA 3EKSA 4WQ5A 2NZTA 4BRPA 2QWLA 3L6QA 1Y64A 4PL8A 1NLVA 4BRQA 4JNEA 3D7EO 2V51B 3CI5A 3J8AA 5EXWA 1R59O 3CJBA 2Q2RA 4CZIA 1U2VA 3LDQA 3L4IA 3IUCA 5AQKA 3FFKB 2QWMA 3O6WA 4MLHA 3U4LA 2PBDA 4BRGA 1S22A 4BVPA 4QS9A 3MN7A 4ISFA 4K25A 5AQRA 2VYPA 3KZBA 2IIRA 4B9QA 3ZX2A 5AZJB 2GWKA 3CHWA 4I6MA 1E4FT 1QZ5A 4BQZA 4BRMA 1U2VB 4A62A 4EHTA 1T44A 4FO0A 3ZETA 5F2RA 3VGKA 1S3XA 2GEMA 4BVOA 4CZFA 2FSNA 5FPDA 3H1VX 5AQSA 4H5NA 1LCUA 3C0BA 4PKIA 2AP1A 1NBWA 5ELZA 3M1FA 4I6MB 5F1XA 4XEIA 3VENA 4F9OA 3CJCA 2FLOA 1EQYA 1T6CA 2HF3A 3A5LC 2P9IA 3SMPA 4A61A 5EY4A 4L3QA 3AY9A 2P9SA 1BG3A 1IJJA 5B8HA 4YDUA 4E1JA 3MN6A 4FWNA 5AFUH 5BN9A 4XH4A 3A5MC 4FWPA 3VEXA 1HUXA 3M3ZA 2A41A 2FXUA 4IO8A 1KXPA 4FWLA 2PAVA 2VWBA 3C7NA 5AQMA 4EHUA 3UKUB 5BPMA 3DWLA 1RFQA 2P9UB 3EL2A 2P9SB 4BRCA 1BO5O 2E2NA 4BR0A 1MA9B 2CGLA 4H5TA 4WQ4A 4MO4A 3MDQA 3VEYA 4WYBA 5BPLA 1BA1A 3VEVA 3QMLA 3CJ1A 1X3MA 4BR9A 2CH5A 4O8KA 4CZKA 3MN9A 1DEJA 5AQIA 5KPZA 4BR2A 2E20A 3F9MA 1K8KA 4MLEA 3L0QA 3W0LA 3DXKB 5AQGA 4BROA 1JCFA 3LL3A 2P9PB 3QDKA 3FGUA 2F9WA 4BRIA 3GE1A 4KBOA 4A2AA 5AQJA 2YHWA 2D1KA 3H46O 3MK6A 1SAZA 3HTVA 5AQYA 5BREA 3A8YA 2NRHA 4PKGA 3ULEA 3ZEUA 2ASOA 1RGIA 1K8KB 3HM8A 3LDLA 4IJAA 1BU6O 4BC4A 3LM9A 1BWFO 3EKUA 1ATSA 1NGBA 3FE1A 4HTLA 4DQ8A 4LC9B 5KPTA 3HZ6A 4CBWA 2Q31A 4IXCA 1ATNA 4H0PA 1NGGA 3EZWA 2VCPA 5I9EB 3I33A 4BRDA 2FF6A 5AQXA 1IG8A 3CETA 3QBWA 3GL1A 3IMXA 3VF6A 3FZMA 5AQOA 4ISEA 3ZEUB 3UKRB 1V4SA 1V4TA 3BF1A 3O4WA 3D2FA 2QWQA 3ID8A 3LM2A 1DGKN 2W40A 4AM7A 2FSJA 2QWRA 2P9KB 3CJAA 2CGKA 5EVZA 5AQUA 4WQ5C 2I7NA 2UYTA 4J8FA 4BRNA 4K41A 2H3GX 1MWKA 3O1BA 4CZEA 2E88A 4FSVA 2D0OA 3BEXA 4CZHA 2YJFA 3R9PA 3VGMA 1OKJA 2GELA 3M6GA 3D2FB 5BN8A 3CERA 3WUHA 3O5BA 3QFUA 4RCHA 4FL9A 3RSEA 3ATUA 3SJHA 3TU5A 3FZFA 5AR0A 2P9LA 3WXJA 4EAHD 3CQYA 2GUPA 3FZHA 1HKBA 4B1VA 1NGHA 4BRAA 3IFRA 4M63C 5FPMA 1Q18A 3MCPA 4Z94A 3VEWA 4JHDA 3KVGA 4CD3A 4JD2A 5ADXA 1YVNA 3ZETB 2ZGZA 1NGFA 4CZGA 3O1WA 1H1VA 2CH6A 3AAPA 1YUWA 2E1YA 5JLFA 1KAYA 4H0XB 3WXIA 2E1ZA 4BRHA 4AM6A 1X3NA 4GY2B 5AQVA 1XC3A 4FPBA 3UB5A 2A40A 3HI0A 4JHDB 4H5RA 4YDUC 3DAWA 3WQTA 1J6ZA 2P9IB 3R6MA 3QFPA 4XH1A 3QICA 5BRDA 2HF4A 4CD1A 3MN5A 4EFHA 1YAGA 2E2PA 3U8XA 2NLXA 3MMVA 5AQNA 3D2EA 4FOIA 1TYQA 5BRHA 3OHRA 4Y0WA 1NGIA 3EN9A 3C7NB 2OANA 4WQ4C 3SK3A 4QS8A 5AZIA 3WEEA 4H0VB 1BOTO 4H0OA 4BG8A 1SQKA 1QQNA 4H0YB 4BRLA 3LDPA 5LJVA 2AA4A 4NO7A 1U6ZA 2HMPA 2V52B 1NGDA 5E84A 4BREA 4B1XB 1GLCG 2V7ZA 4BR5A 3H6EA 3BUZB 3CJ7A 3HSCA 3GDQA 1SZ2A 4DCHA 4CI6A 5AZIB 1TUYA 1E4GT 2CGJA 3FZLA 4JN4A 4PKHA 1C0GA 4CJ7A 2KHOA 2E8AA 5CE3A 5BRFA 2QM1A 1HPMA 4H0TB 1WOQA 3WXKA 3FR0A 1NWKA 1KAZA 3B8AX 4B1UB 4FWOA 4NB4A 3H3NO 4FWKA 3WXLA 4EIAA 4QS7A 5JMVA 3DXMA 1ZBSA 2A6AA 2YCHA 5F0XA 1QQMA 4RTFD 2QXLA 3ULEB 2I7PA 2QW9A 1GLEG 4FWRA 4K42A 4HWIA 5LY3A 3HBTA 2Q0RA 3U9DA 5AQHA 1RDWX 3GBTA 4FPAA 4BQLA 2YHYA 4CZLA 2A42A 5EX5A 4PL7A 3SMSA 1GLBG 1HLUA 3IDHA 5AQLA 3DXMB 3SLCA 4IZ9A 1WUAA 3VETA 4K43A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJVA 1IKXA 1WLJA 3HPOA 4JKHA 2HSTA 3QEIA 4Z4EA 1LAWA 4CCHA 4UQGA 3VQPA 2W41A 3FZKA 4W5RA 3KKSA 2RHKA 1QHTA 3AA5X 4CBUA 5EOYA 1HX1A 4RW9A 5M1OA 3VQ7A 3VESA 1XUPO 1JJ2M 1ZBFA 2BTFA 3LP2A 1EO1A 3L2WA 3NE6A 3E66A 3DI6A 4ZTFA 3RMBA 3PLAA 4DWIA 2RE2A 2HBLA 3LP0A 4DB3A 1QVGM 2V7YA 3EO3A 1DKGD 3BY5A 1T03A 3AARA 1T7PA 4BE2A 3O8MA 5AQQA 2HOEA 2VQEK 4DQIA 3TTFA 3CC4N 3N4QA 5GIOA 1JCGA 1JLEA 3H08A 5FRMA 2G8FA 4JAXA 1D4XA 4K8XA 4PA1A 3ZCMA 4CZMA 3CJ9A 4DTRA 4FJMA 1TL3A 3CCQN 2HBMA 3R8EA 4E3SA 3UKUA 4LSLA 3L2QA 5JS1A 3LDNA 3BP8A 3C95A 4A5AA 1YVUA 5AQPA 3D0PA 1VQ9N 3FFIA 3KD5E 1S6PA 5AQZA 2X78A 3FLCO 2ZF5O 3NVKA 2QI2A 4E19A 1KFDA 3LALA 5AQWA 1REVA 4YY3K 1GLAG 3VN5A 4HVJA 3H45C 3OJSA 1VAZA 4DU1A 4IWVA 4CFCA 3F73A 2A3ZA 3QEPA 3JS6A 5KPRA 1KSPA 1VQLN 4BC2A 1G15A 1FXXA 2IVOA 3D2EB 4BC3A 3MECA 3DJCA 2Q36A 3CD6N 3ZX3A 3S41A 4DV0K 4AF1A 4BR7A 3VPZA 2F7TA 3TTCA 1J5OA 3AVLA 4YOTA 2EWSA 1VSIA 2A1SA 2YX6A 3G25A 4H03B 3MWTA 1N8RO 2G8IA 3NGIA 2KTQA 3G10A 4BGAA 1Z25A 3EZ5A 1S9EA 1P90A 3JSMA 4MO5A 4JLHA 2DPNA 2ZQBA 3THYA 3MXJA 1RTJA 4CIEA 5AJ3K 2D5RA 4KB1A 3I56N 3UKRA 4F3TA 4CEEA 3O9TA 1Z05A 3THVA 2BUPA 3WT0A 2P9KA 1NK6A 3SQ4A 4NCBA 3O9UA 3K59A 3C65A 3L2UA 1K73O 1ITGA 1KLMA 1NMDA 3NCIA 3THWA 4WF9L 4C8OA 3SJJA 3TAPA 4BRPA 3TABA 3D7EO 3AV9A 4I9LA 1XC9A 2IGIA 4G9ZA 4CFBA 3CF5L 4OGCA 2PBDA 1S22A 2D0BA 4ISFA 5AQRA 5FLXO 2VYPA 3OA9A 2IIRA 3ZX2A 1E4FT 2BH1A 3QNOA 4EHTA 4IKFA 3RVCA 3NF9A 1KLNA 2PYJA 4C1NK 2KLAA 2QKBA 4PY5A 4KI6A 3V4IA 5J2NA 2FSNA 3OS2A 3PO4A 2LSNA 3ZSOA 1Q86O 2HVHA 1TKZA 4KTWA 1SL0A 4KHPK 4W5NA 1EKEA 1D9FA 4JKAA 1J5EK 1EETA 2IDOA 1VQ5N 1T6CA 3LDSA 3SMPA 4DMNA 3QETA 5EY4A 4DV7K 3AY9A 3OYBA 3B6OA 1VQ4N 1NJXA 4CIGA 3VQ5A 1YITN 3NBPA 4E1JA 1D5AA 1TVRA 3AVBA 4FWNA 3ZT1A 3RMAA 4M3RA 3A5MC 3OYLA 1SL1A 1QS4A 4FWPA 1HUXA 2XO7A 2NRZA 4FWLA 3C7NA 3ZSZA 5BPMA 3V6DA 3RR7A 3DWLA 1VQ8N 3DLEA 3L4QA 4BRCA 2PFUA 3TAMA 4OPKA 4DTNA 4H5TA 1KTQA 4WQ4A 1J9AA 4MO4A 3VEYA 3VEVA 4EZ6A 3QINA 4O8KA 3PSIA 3ZSWA 4OPAA 4CEZA 3MN9A 5KPZA 3QIPA 3F9MA 3J81O 3OYGA 1Q82O 3DXKB 4BROA 3LL3A 3CQ8A 1S1UA 4LF8K 2EHGA 1XMQK 3AO3A 4LF5K 3SPYA 4X64K 3ZLJA 3A8YA 4OPJA 1NK0A 4BC4A 1RGIA 3HM8A 4IJAA 3LM9A 4FZXC 4CJQA 3C6UA 2O4GA 4DQ8A 4H0PA 1NGGA 2VCPA 1K8AO 3I33A 5AQXA 3LPUA 4FJ8A 3V9ZA 1V4SA 3CFRA 1TV6A 1DGKN 3EE9A 2NUBA 4JKGB 1WSFA 2FSJA 4CVNE 2QWRA 3EEQA 2CGKA 2D0CA 5AQUA 2UXDK 4CJEA 3ZT3A 1HMVA 1O13A 2D0OA 3M8QA 3AA2A 1VHXA 3R9PA 3M6GA 3CERA 5HL7L 3OBYA 3VTHA 3O5BA 3QFUA 1IH7A 4OO1J 3HJFA 2HHHK 4B9UA 4CEQA 3FZFA 4ELUA 5AR0A 3WNEA 3PSFA 3OW2M 3WXJA 5I3UA 3JYTA 2FBYA 2PYLA 4B1VA 4FJ5A 3AVGA 4JRPA 2QTDA 2VG7A 4K0KK 4I9QA 3E9OA 4MDAA 4JD2A 4CD3A 2OPRA 3NMUA 2ZGZA 3V9SA 4YOUA 3O1WA 1H1VA 1WNSA 3AAPA 3NH2A 3F9KA 2G8KA 2O8EA 4DSIA 4FJNA 1U47A 4GY2B 1VQKN 4FJGA 4DQRA 4DSEA 3HI0A 1OH5A 3VMFB 2A1RA 2DTUA 1VSEA 2ZJPL 4CE9A 4ZTJA 5BRDA 3SV3A 4XJXA 3U8XA 4FLVA 5LMUK 1DTQA 3T69A 1KVCA 2WFBA 4U7BA 5DM7L 2PZSA 4DTPA 1Q8IA 3S3OA 3SK3A 1HQEA 1NMNA 4H0OA 1SQKA 3TAFA 1QQNA 3LDPA 3ZSXA 4YORA 4NO7A 4B3SK 1RT5A 4HUGA 2GUIA 4BREA 4DV1K 1XHXA 3AVKA 5C25A 3H6EA 3BUZB 3CJ7A 3RRGA 4DCHA 1E4GT 2CGJA 2B5JA 4JN4A 1X9SA 1C0GA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4HCB A;  4ILH A;  4J2E A;  3O4W A;  3D2F A;  3SUP A;  2O8D A;  3TAQ A;  1ILY A;  3CYG A;  2OA8 A;  1IO2 A;  5EVZ A;  1N5Y A;  4Z4H A;  1QSS A;  2OPP A;  1WSJ A;  1ZBH A;  2YJF A;  3TR8 A;  2O4I A;  2VGN A;  2GEL A;  1HYS A;  3D2F B;  5BN8 A;  3HRG A;  4CED A;  4FL9 A;  4X66 K;  3RSE A;  4M3Y A;  1QE1 A;  4CJS A;  3OYN A;  1U45 A;  3UIQ A;  3TU5 A;  4BEC A;  1RT6 A;  4FJX A;  4Z4I A;  2P9L A;  4EZ9 A;  1N36 K;  2WC9 A;  1X9W A;  3FZH A;  1HKB A;  3OS0 A;  5LL6 Z;  5J2Q A;  3RR8 A;  4BRA A;  1BCM A;  3G0Z A;  3IKM A;  4MDB A;  3MCP A;  4FW1 A;  3S9H A;  2UUB K;  2JWK A;  1LWE A;  4C8L A;  5ADX A;  1NGF A;  3DM2 A;  2HHQ A;  1CLQ A;  3CC7 N;  2CH6 A;  4LH4 A;  4CF1 A;  4IFE A;  4FW2 A;  4JI6 K;  3ENB A;  4AM6 A;  1VQN N;  4HHT A;  3C6T A;  4CJL A;  3AA3 A;  3MEG A;  4DU4 A;  4H5R A;  4CJT A;  1KD1 O;  2WBN A;  1VRU A;  2W42 A;  3S3M A;  4DU3 A;  3MN5 A;  1S1X A;  1A5V A;  1YAG A;  2E2P A;  1CZB A;  5LMN K;  4FLZ A;  1VSK A;  4YOV A;  1UAX A;  4DR4 K;  3HT3 A;  3DMJ A;  4DFJ A;  5AQN A;  3KWI A;  4DR1 K;  1TYQ A;  1HYZ A;  2QKK A;  4Y0W A;  4M3Z A;  1Q81 O;  1KC8 O;  2OAN A;  3KD1 E;  4WQ4 C;  4QS8 A;  3WEE A;  2IAJ A;  2X6N A;  1LW2 A;  4H0V B;  5M1N A;  4BEB A;  1NK7 A;  4BG8 A;  4CJ3 A;  2VG6 A;  1RDB A;  3CFP A;  1A5X A;  1WSI A;  4DSJ A;  4H0Y B;  4BRL A;  5CYM A;  5LJV A;  2ZJQ L;  4ELT A;  4AHS A;  1U6Z A;  3S5T A;  1TKD A;  1NGD A;  4AHR A;  2O8F A;  3DLB A;  4C8M A;  4B1X B;  1QVF M;  2V7Z A;  4BR5 A;  2P5G A;  3VQ6 A;  1JXE A;  1HNW K;  1SZ2 A;  3NF8 A;  3R1X A;  4CI6 A;  1IBK K;  2WOM A;  2RF2 A;  1TUY A;  4CEF A;  3OYK A;  3VA3 A;  1RT3 A;  4LSN A;  4A57 A;  3SNN A;  3TAG A;  3ULD A;  3CXC M;  3MEE A;  4H0T B;  4BY9 C;  1KAZ A;  3B8A X;  1L3U A;  1BQN A;  4NXN K;  4Z4G A;  2O8F B;  4FWO A;  2HHI A;  4FWK A;  4EIA A;  3AO5 A;  3V1R A;  2P1J A;  3NHG A;  1ZBS A;  2A6A A;  3P5J A;  5F0X A;  4YNQ A;  3HP6 A;  1ASV A;  1IBM K;  4EP4 A;  2AJQ A;  4BE7 B;  4HWI A;  1RDW X;  1K9M O;  5KGX A;  1Q7Y O;  3CCE N;  4IG0 A;  4IZ9 A;  3VET A;  4CHO A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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