3A5OC

Crystal structure of a dictyostelium p109i ca2+-actin in complex with human gelsolin segment 1
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
366
Chain Sequence
QALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAILNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAAAAIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for actin assembly, activation of ATP hydrolysis, and delayed phosphate release
pubmed doi rcsb
molecule keywords Gelsolin
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
total genus 114
structure length 366
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5oC01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5oC02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3a5oC03
5AR0A 5AFUH 2GWJA 1GLDG 4M7YA 3HBTA 4FOIA 4FSVA 4BRDA 1YAGA 2W40A 3FLCO 5AQMA 5AQXA 5JLFA 2D0PA 2E8AA 3M3ZA 3FZFA 1HX1A 2GELA 4BVPA 3UKRA 3P4IA 3FFKB 2P9PB 2E1YA 1T6DA 4CZEA 1HJOA 5BN8A 4B1UB 2D4WA 5F0XA 3C7NB 3KVGA 4JAXA 3VEZA 2QWLA 4MO5A 5EX5A 4HTLA 2QWQA 4EFHA 2E2PA 5AZJA 4H5VA 4BRQA 2QXLA 1XUPO 3CI5A 3FZKA 5F2RA 3RSEA 4XH4A 4DHYA 1MWKA 3ZEUA 4WQ5A 1HKBA 2FSKA 3WQTA 3CJCA 3VF4A 3WXKA 3W3DA 5AQNA 2F9WA 4IWVA 3LDPA 3LDOA 4ISEA 2QWOA 4BROA 1TYQA 2CGLA 2P9KB 1HKCA 3D2FB 3OHRA 3VETA 2E2NA 1GLLO 3VEYA 2HOEA 2E1ZA 4CBXA 5EVZA 2H3GX 4DCHA 3ATVA 1LOTB 5EOYA 4CZIA 1GLBG 2FF3B 3H3OB 3GL1A 3WXLA 1NGFA 3BF3A 3H1VX 3QFPA 4BRHA 4FWQA 4RWTA 2P9UA 2I7NA 4FPBA 3WQUA 4CZLA 4O8KA 3L0QA 4BRIA 4ISFA 1G99A 3IDHA 4CD3A 4PKGA 4BC5A 3CJ1A 3C0BA 3O6WA 5AZIA 4CZFA 5AQIA 2DPNA 3QICA 2E2QA 3I8BA 3M6GA 2QW9A 4ISGA 2NZTA 3MMVA 2Q97A 1KXPA 3MN5A 5F1XA 4IO8A 3CQYA 5FPNA 1P8ZA 1QZ6A 5KPZA 3VGLA 4MLHA 3IFRA 4BR7A 4K42A 3LDNA 5ELZA 2UYTA 4BR0A 4JHDB 2CGJA 2IIRA 2YHYA 1NGGA 4BRCA 3ULEB 2A40A 1RGIA 4K41A 2BUPA 5TKYA 1MDUB 1HPMA 3BEXA 3MN9A 1K8KA 2A3ZA 1U2VB 3LDLA 3LM2A 4A62A 2HMPA 5AQWA 1V4SA 3WEEA 2WUSA 1OKJA 1JCEA 1NGCA 5KQDA 2F9TA 3DXKB 2YHWA 3H6EA 1T6CA 5LJVA 1HUXA 3A5MC 4BRPA 2ZF5O 1BA1A 1SQKA 1Q18A 5AQJA 3L6QA 5LY3A 3VEOA 1YXQA 3A8YA 1NM1A 2E2OA 4NO7A 3VEXA 3HI0A 1CZAN 1MA9B 3UKRB 3IMXA 4H5NA 1E4FT 1V4TA 2A6AA 4B1VA 2QWNA 4CBWA 4Y0WA 1E4GT 4M63C 5BPNA 4B1ZA 2ZWHA 4Z94A 1NLVA 2A5XA 2YCHA 3QFUA 5JMVA 5AZJB 3CQXA 4BRKA 1J6ZA 4CJ7A 3RSEB 1QQOA 4I6MA 5BRFA 4BC3A 2ASOA 3O5BA 3ZEUB 2OANA 4FWOA 3JXUA 3VF2A 4BC4A 1ATSA 1BWFO 2P9NA 1DEJA 4FOEA 2HF4A 1TYQB 1Z6RA 2EWSA 4QS8A 4BQZA 4CZKA 3BUZB 5EXWA 4B9QA 5AQSA 1GLAG 1ATRA 2YI1A 2D1KA 3GE1A 4CZJA 3U9ZA 4CZMA 4BVOA 4JN4A 4BR5A 1WUAA 3SJHA 3WXIA 1JCFA 2FSNA 1C0GA 5AQOA 4YDUC 4HWIA 3EO3A 2P9UB 2GUPA 4QS9A 2HF3A 3O08A 3O1BA 2KHOA 4GY2B 2A41A 3QDKA 4L3QA 4FWKA 4FWSA 2VCPA 4BC2A 3A5NC 5AZIB 2FF6A 3JS6A 3D7EO 3MCPA 4H5TA 4BRMA 4PL8A 3W0LA 1T44A 4WQ5C 2V51B 2ASMA 3H46O 4K25A 4PL7A 2P9SA 2P9LA 4QS7A 5BN9A 2A42A 3EKUA 3MK6A 3GG4A 5AQVA 1ESVA 2D0OA 4H5RA 4BG8A 1X3NA 5BPLA 2AA4A 5AQRA 4GNIA 3KHYA 3CJAA 3CJBA 3MN7A 3ENOA 2V52B 4E1JA 4FWRA 3H45C 3ZETA 4C23A 1NWKA 3O80A 5FPEA 1IJJA 3R9PA 1K8KB 5AFUA 2VYPA 4J8FA 3WEEB 3UE5A 1IG8A 1BG3A 1NGBA 4FWNA 2ZGZA 4DQ8A 3VEWA 4B1WB 4DB3A 5ADXH 2P9IA 4B1YB 1Y64A 4IJAA 1TUUA 4XH5A 1QZ5A 4JD2A 2Q2RA 3FZLA 1X9JA 2ASPA 2PAVA 4BRLA 4EIAA 3ENHA 5AQQA 3U9DA 4AM6A 2PBDA 4RTFD 2AP1A 3WUHA 3O1WA 2QWRA 3ZX2A 3A5OC 1NMDA 3DWLA 2YJEA 5CE3A 4BG9A 2FLOA 4H0YB 3ZX0A 3CJ9A 3BF1A 4XH1A 4BR9A 2NRHA 5AQZA 2V7ZA 3ZX3A 4BGAA 5FPDA 1HKGA 1R59O 3IUCA 5LJWA 1ZXOA 1KAXA 1D4XA 2ZGYA 4PKHA 3UKUA 3EKSA 4H0OA 4I6MB 4IJNA 3SMPA 4AM7A 1BOTO 2QWMA 2GTDA 4EHTA 1GLCG 2P9NB 4BRFA 1MWMA 4PKIA 3DJCA 4XEIA 1NGAA 1HLUA 1XQSC 3FZHA 2ITMA 3QMLA 2FSJA 2QM1A 2IVPA 3A5LC 4F9OA 4WQ4C 3CETA 4LC9B 3EN9A 3I33A 4RCHA 3QBXA 3VOVA 4NB4A 2BTFA 4JNEA 3AY9A 2QWPA 3A0IX 4BR4A 2Q0RA 3DXMA 1BU6O 4CD1A 3AAPA 5BRHA 5KQ8A 4FWLA 5AQPA 3J8AA 3LDQA 1BO5O 1QQNA 4IZ9A 4H0VB 3M1FA 5BPMA 5BRDA 1BA0A 3U8XA 2GWKA 4KBOA 1C0FA 5AQGA 3G25A 4YDUA 4WYBA 3VESA 1EQYA 2CH5A 3S41A 4A2BA 2P9SB 2P9LB 1S3XA 1JCGA 5FPMA 3GBTA 3LL3A 5ADXA 2FXUA 5AQYA 4BRAA 5B8HA 4H0TB 2P9PA 3TU5A 4CI6A 3GOIA 1H1VA 3C7NA 3HZ6A 4EHUA 3VGKA 5E26A 3AAQA 4MO4A 1RFQA 2E88A 3ZETB 3H3NO 3WT0A 1GLEG 3KZBA 4H0PA 5AQFA 5BREA 1RDWX 1NGEA 1NGHA 3B8AX 3CHWA 3H1QA 3DAWA 3SLCA 1Z05A 4CZGA 4BREA 3VGMA 1ATNA 1GLJO 4FWPA 1X3MA 4FO0A 1KAYA 5JICA 3O8MA 4MLEA 1NGDA 2P9IB 3EZWA 3UB5A 3VERA 3VENA 5I9EB 4M7XA 3F9MA 3VF6A 4CBUA 3QBWA 1DKGD 3R6MA 1QQMA 1YUWA 1LCUA 2J4RA 2P9KA 4JD2B 2IVNA 5KPRA 3D2FA 3EL2A 3D2EB 4H03B 2Q0UA 2NLXA 2W41A 5E84A 1NGIA 3FR0A 1GLFO 2V7YA 2YJFA 4FPAA 4BRNA 1ZBSA 3SK3A 4FL9A 2CH6A 2GEMA 3U4LA 3O4WA 5AQTA 5KPTA 3VEVA 1ZC6A 3LM9A 3HM8A 3D2EA 3MN6A 4H5WA 1BUPA 1KAZA 4IXCA 2E20A 1YVNA 3VPZA 3FGUA 1S22A 3CIPA 3FE1A 3FZMA 3HTVA 3UKUB 4CZHA 2Q36A 2VWBA 3ATUA 5BR9A 4H0XB 3R8EA 4A2AA 1XC3A 4BR2A 5AQLA 1QHAA 4BRGA 3QB0A 2Q31A 3MDQA 4K43A 5AQUA 4FWMA 1U6ZA 2I7PA 2YHXA 4JHDA 2IVOA 1BDGA 3L4IA 3ID8A 4BGBA 3AARA 3ULEA 1DGKN 5AQHA 3HSCA 2CGKA 1NBWA 3TPQA 3CERA 3CJ7A 1WOQA 5AQKA 5EY4A 3DXMB 4B1XB 1U2VA 1TUYA 4WQ4A 4O5FA 4EAHD 3GDQA 3SMSA 1SZ2A 1SAZA 2Q1NA 4BQLA 5JLHA 3WXJA 4A61A 1NGJA 3DXKA 3BP8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CFAA 5IT9O 3MWTA 4AHTA 2F8SA 2OPQA 2VWKA 3OYHA 3AO2A 4BRDA 2W40A 3FLCO 2O8FB 3LDSA 5AQXA 4BDYA 4CJFA 1FJGK 4ID1A 1HX1A 3H08A 4BVPA 3AGKA 3P4IA 1T8EA 2E1YA 1T6DA 2WTUA 5BN8A 2IAJA 4AH9A 3CCVN 2JGUA 5CHIA 4MO5A 2O8EA 5EX5A 4EFHA 5JVGL 1YTAA 2B4JA 3CI5A 4A59A 4CEOA 1ZBFA 3ZSXA 5F2RA 4N47A 1NK9A 1YVUA 4DTJA 2HB5A 4HHTA 2GX9A 4FLZA 1WB9A 3W3DA 1A5VA 4FLXA 4CERA 4KHNA 4ISEA 1BL3A 2OCEA 4G1QA 3CC7N 2P9KB 3NVMA 4FVUA 3OY9A 3BY5A 4JKGB 2NRWA 2VG5A 4IEEA 1NJYA 4CBXA 2H3GX 4DMNA 3UIQA 4RG8A 1LWFA 3KKRA 4CGGA 3H3OB 4DV2K 3WXLA 3QFPA 1DLOA 2JWLA 1BIUA 4E7IA 3RMAA 4QOZB 2I7NA 4IKFA 1C6VA 2G8IA 3L0QA 4RW6A 3PSIA 1JLQA 4PKGA 3L3UA 4BC5A 3CJ1A 2G8UA 4JI3K 3HVTA 2QW9A 2JLEA 1RBTA 1KXPA 3MN5A 1HYZA 4JI4K 3NGYA 5FPNA 1RDCA 4NXNK 3DLGA 1NK7A 3CYMA 3QIPA 4JHDB 4B3MK 1NGGA 1A5WA 3IG1A 3CC4N 5TKYA 2DFEA 1ASUA 3MN9A 2Y1JA 4A62A 2QI2A 1V4SA 3KLGA 1OKJA 3OYMA 1IKXA 5KQDA 4CJUA 3K2PA 3CCEN 3DXKB 3E01A 4WCEL 1EO1A 1T6CA 2HNZA 4J2EA 1Q18A 2JWKA 4O8UA 4OX9K 4BDPA 3I56N 3NHGA 4NYFA 5AQJA 5LY3A 1VQ4N 2HBMA 1YXQA 1TAQA 3VEXA 1IKVA 1CZAN 3UKRB 1HR0K 3MXJA 1E4FT 1V4TA 4N5SA 4RW7A 4FLWA 1S72N 3L3VA 4CJRA 3F9KA 1DTTA 1E4GT 2I5JA 5CY4A 4PY5A 4I9QA 4B1ZA 5I3UA 2YHBA 1SL0A 1UA0A 1J5OA 1NKCA 1WNSA 2Z1GA 5DK5A 3CQXA 3MEGA 3ISNC 3RSEB 2QEXN 3L2VA 3O5BA 3ZEUB 3ZSYA 2OANA 3VF2A 3JXUA 4F4KA 3NH1A 3IS9A 1BWFO 1DEJA 1VRUA 4FOEA 3NCIA 2PZSA 4AHRA 3LWMA 2WONA 3K5NA 3ID6A 2OPSA 4DFMA 3CPEA 3L2WA 3O3GA 1C0UA 3CYGA 2E6LA 1YT3A 1C1AA 3E66A 4BE7B 3U9ZA 4JN4A 1X9MA 1YITN 4CCHA 3PLAA 3WXIA 4CFCA 3O9SA 5A2QO 3PX0A 3KLFA 1QHTA 2HNYA 4BY9C 4YDUC 5LMUK 4DU3A 3WNGA 4DR3K 4KHQA 3C6TA 1XHXA 4QS9A 4KHYA 4GY2B 3L8BA 4L3QA 2VQFK 5JS2A 4QCLA 3FFIA 4U7BA 4ILHA 3J7ZO 2O8BB 3OYGA 2FF6A 3JS6A 3D7EO 3MCPA 1W97L 3OW2M 4IEIA 2V51B 2ASMA 4K25A 4N76A 4KRFA 3J81O 3RRHA 1RT6A 3EKUA 3OYJA 3VQBA 1ESVA 4AHCA 4DQRA 4JV5K 3L4QA 1XHZA 3MAQA 3QESA 1HNXK 3P83D 2V52B 1Q7YO 1KVAA 1IJJA 4BECA 1NU0A 4J8FA 2EX3A 4E0DA 1IG8A 4CW7B 3SQ2A 4FJ8A 4B1WB 1VQNN 3J80O 4IJAA 3OA9A 3NFAA 1IG9A 4H4MA 1OVQA 3MCAB 4M3RA 2ASPA 3M8QA 5TKWA 2NRZA 4KREA 3I8DA 3RMBA 1WSFA 3CFRA 3U9DA 4AM6A 2PBDA 1K9MO 1REVA 1CXQA 1W9HA 2QWRA 1IBKK 2HHWA 1NMDA 1WLJA 4C8LA 5CE3A 4BG9A 2FLOA 4H0YB 3CJ9A 3BF1A 4XH1A 2Y1IA 1WSIA 5J2MA 3ZX3A 3CMAN 2KFZA 4B3OA 3SUOA 2ZGYA 4PKHA 3EKSA 4H0OA 5J2NA 3CM6A 4EHTA 4C8OA 2AJQA 1GLCG 4FJMA 4PKIA 3OYLA 3OYFA 4L8RB 1RT3A 1XQSC 4KI6A 1VSHA 2KLAA 1A5XA 2FSJA 4CHYA 4JKEA 3EN9A 2UUBK 3VOVA 5HRPA 4NB4A 4DSEA 4DS5A 1RT4A 1NJXA 1VSFA 5HL7L 4NYNA 4OVLA 4HUEA 4CD1A 3AAPA 2X74A 4CHZA 3RVCA 3EEQA 4J2AA 1NKEA 3OJUA 3VQ9A 5BRDA 4DQPA 4M3ZA 3AA3A 4CHQA 1JKHA 4YFUA 3G25A 5T7BA 3PIPL 4YOUA 3CM5A 3LAMA 3VESA 4FK2A 2CH5A 3S41A 4YY3K 1JCGA 3DLEA 3NGIA 2FXUA 3NVKA 4H0TB 4CI6A 2W6KA 1OVYA 4FJNA 4WE1A 2HBJA 3WT0A 4B9VA 1RDWX 1NGEA 3TSUA 1YJ9N 4OPHA 3CHWA 3H1QA 2B6AA 4LY7A 4CZGA 4FWPA 1BI4B 2YX6A 3KD5E 1RT7A 4FZXC 3UB5A 4LF9K 1YUWA 1LCUA 5AJ3K 2ZE2A 3EL2A 4DQQA 2NLXA 3VN5A 3ZT0A 1P90A 4DTUA 1NGIA 3FR0A 4FPAA 3CMEN 1HNWK 4FL9A 2CH6A 3U4LA 3O4WA 2ZJPL 1K6YA 5AQTA 3VEVA 1YTUA 1ZBUA 1I3AA 2ZJQL 1KD1O 4E19A 4I2PA 4JEPA 4BE0A 4KHSA 5BR8K 1LWEA 2E20A 3VPZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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