3CI5A

Complex of phosphorylated dictyostelium discoideum actin with gelsolin
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
372
structure length
366
Chain Sequence
DVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGMGQKDSVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Modulation of actin structure and function by phosphorylation of Tyr-53 and profilin binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Major actin
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 366
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ci5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ci5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ci5A03
4A61A 1CZAN 2H3GX 2HF3A 4Z94A 2PAVA 5BPMA 1H1VA 1YXQA 4EFHA 1R59O 2A40A 2A41A 4IXCA 4A62A 4B1VA 4CD3A 4BRHA 3O4WA 4FPAA 4FWRA 4BRGA 1NGIA 5BR9A 1GLLO 2EWSA 4PL8A 2IIRA 1X9JA 3H6EA 3S41A 4K41A 2QWNA 1IG8A 3UKUA 1GLCG 4JAXA 3EN9A 2P9SB 4BROA 3D7EO 2Q1NA 3ATVA 3WT0A 3M6GA 4BG8A 3GOIA 2IVOA 3GE1A 4I6MA 4DQ8A 5I9EB 3R9PA 3QMLA 1RDWX 5EX5A 3WXKA 4WQ5A 3A5OC 3UE5A 2J4RA 5ELZA 1DEJA 2E8AA 2FF6A 4IJNA 4K43A 1KAYA 1XC3A 1HKGA 3KHYA 3GDQA 1MWKA 3I8BA 1EQYA 4RCHA 1HUXA 5BREA 4CJ7A 4RWTA 2BUPA 2QW9A 4M7XA 1ATRA 3A8YA 4O5FA 5AQFA 5F1XA 1KAZA 2E2NA 5BRFA 2GEMA 3VEWA 5AQKA 3DJCA 4H03B 3WQTA 1NWKA 3CJ9A 3BF1A 4FWOA 4H0YB 4Y0WA 3QICA 3TPQA 2P9SA 4H0OA 3BP8A 3BEXA 3R8EA 2P9KB 1NMDA 3KZBA 1NM1A 1BU6O 4A2AA 4CD1A 2CGJA 3LM2A 3QB0A 2YHXA 3MDQA 2QWOA 3CERA 2CH5A 2E20A 4M63C 2WUSA 5AQWA 1NGFA 2BTFA 4AM6A 2QWLA 3FFKB 3FZFA 5AQUA 2NRHA 5FPNA 2QWRA 3IUCA 3LDNA 3AARA 4BQZA 4WQ5C 5AZJB 3H3NO 4K25A 1NGAA 1X3NA 1HLUA 4J8FA 1SZ2A 1MDUB 2ZGYA 3VERA 3VF6A 4BRIA 3VPZA 4B1WB 3OHRA 2P9PB 4DCHA 2D0OA 1ZXOA 4ISGA 2P9KA 3SJHA 1OKJA 4BRDA 2Q36A 4FWSA 3VGLA 3DAWA 4B1XB 3M1FA 5KPTA 1NGBA 4JN4A 2CH6A 3G25A 1GLEG 2ASMA 3FR0A 1BA0A 4JD2B 3VOVA 4H0TB 3U4LA 2FXUA 1YAGA 2HOEA 1BG3A 3O1BA 1Z6RA 2A42A 2VWBA 1QZ6A 1HKBA 4CZMA 4F9OA 3DXMB 5AQZA 2E2OA 2YHWA 4MLEA 5AZJA 3HI0A 2F9WA 2GTDA 3ATUA 5E84A 4MO4A 4CZKA 4XH1A 1LOTB 4H0VB 3A5LC 2KHOA 3GL1A 3FLCO 3AAQA 2P9PA 3VF4A 5AQGA 2F9TA 5JICA 4FWMA 1WUAA 1BA1A 3M3ZA 1S3XA 4BVPA 4H5WA 3U9ZA 4BC3A 4BRQA 4CZIA 4E1JA 1XUPO 2P9NB 3I33A 4MO5A 4EAHD 1SQKA 5CE3A 4JD2A 1JCEA 3HM8A 2NZTA 2OANA 4B1ZA 3DXMA 3GBTA 3L6QA 4FWLA 2GUPA 4WQ4C 4CZFA 4FPBA 3ZX3A 2AP1A 1Z05A 4H5TA 4IZ9A 5JLFA 5KPRA 3WXJA 1J6ZA 1HPMA 2E1YA 2P9IB 3LM9A 2V7YA 2A6AA 5AQLA 4H5NA 1TYQB 2FSNA 3WUHA 4XH4A 1QZ5A 3ZETB 1E4FT 1ZC6A 4BGBA 4H0XB 2P9NA 2IVPA 4NB4A 3FE1A 3EO3A 2YJFA 3HZ6A 1TUYA 1P8ZA 3DXKB 4BR4A 3O1WA 3RSEB 1HX1A 4YDUA 3EKSA 2Q0UA 3CJAA 2V7ZA 2Q2RA 3JS6A 4BC4A 1BOTO 3KVGA 5AQSA 1S22A 3J8AA 1XQSC 3C0BA 3HSCA 4M7YA 3CQXA 3JXUA 1DGKN 4BQLA 4B1YB 4ISEA 5AQIA 3CI5A 3VGMA 4CZJA 2GWKA 2VYPA 4BR0A 5AR0A 3MN6A 4AM7A 5FPDA 2P9IA 3P4IA 4BVOA 4FOEA 5F2RA 3U9DA 1TYQA 5AQPA 2ASOA 3F9MA 4O8KA 1ATSA 3ZETA 3CJ1A 4EHUA 5BPLA 2ASPA 5EY4A 3C7NB 2W41A 4BR9A 4BRMA 1LCUA 3EKUA 2D4WA 3DXKA 1QHAA 3RSEA 4DB3A 1X3MA 5E26A 2DPNA 3SLCA 3L0QA 5BRHA 5AQTA 5AQXA 1TUUA 5AFUH 2E1ZA 2Q97A 4IWVA 4YDUC 3H1VX 4MLHA 1NGGA 4BG9A 4JHDB 4CBUA 3WXLA 5AZIB 1MA9B 5FPMA 4WQ4A 2D1KA 2Q31A 5EOYA 2FSKA 4BC2A 4BRLA 3QDKA 3WEEB 1NBWA 3EZWA 5F0XA 4PKIA 2ZWHA 3UKRB 3C7NA 3MN9A 3O80A 1D4XA 3SMPA 3LL3A 1NGCA 3ZX0A 2P9LB 2PBDA 4PKHA 5AQNA 4HTLA 4RTFD 5AQQA 2HMPA 1T6DA 2D0PA 2GWJA 3LDLA 2HF4A 3VEYA 2YJEA 4B9QA 5ADXH 3FZKA 3QFUA 2CGLA 2ZGZA 3ENOA 1IJJA 5LJWA 4FWKA 5AFUA 3W3DA 2NLXA 5AQRA 3AAPA 4QS8A 4JHDA 3VEXA 5AZIA 2ZF5O 4PKGA 1NGHA 2P9UB 5AQHA 3VEZA 4BRAA 3H46O 3LDOA 3B8AX 3IFRA 4H0PA 4BC5A 1GLDG 3ID8A 1NGDA 1ESVA 1G99A 3CJBA 3WEEA 3CJCA 5AQYA 2YCHA 3A5NC 4LC9B 3UKRA 1BO5O 2FSJA 4EIAA 1BUPA 2VCPA 2P9LA 1V4SA 1SAZA 1JCFA 1K8KB 4BGAA 2IVNA 2FLOA 3CETA 5ADXA 3ZX2A 4CI6A 4BR2A 4FSVA 3A5MC 1V4TA 3O8MA 5BN9A 2Q0RA 1KAXA 5KQDA 2QWQA 2QWPA 4WYBA 1JCGA 3HTVA 4GNIA 3CQYA 1Y64A 3O5BA 4PL7A 1RFQA 3LDPA 4FO0A 3DWLA 4GY2B 4XH5A 3HBTA 1BWFO 3VESA 4FL9A 5AQMA 2P9UA 1GLAG 5EXWA 4BR7A 3QFPA 3W0LA 2V52B 3QBXA 3H45C 4A2BA 3H1QA 2YI1A 3BUZB 4H5RA 1HJOA 4B1UB 5LJVA 2UYTA 3MMVA 4CZHA 1QQOA 1GLBG 3SK3A 1NLVA 3GG4A 4NO7A 3BF3A 4EHTA 5AQJA 1YVNA 3ULEB 4CZGA 2YHYA 1K8KA 3ZEUB 4CBXA 3D2EB 1U2VB 5JMVA 3CIPA 4FWNA 4BRFA 4BR5A 5BRDA 3QBWA 4QS7A 3VENA 2I7PA 3CHWA 4ISFA 5EVZA 3MCPA 3UB5A 3EL2A 1C0GA 4BREA 3L4IA 3VF2A 3FZHA 1QQMA 3VEOA 1WOQA 1E4GT 3D2FB 1U6ZA 2AA4A 4XEIA 5FPEA 1BDGA 2E2QA 5AQOA 1NGEA 5AQVA 3AY9A 4IO8A 3U8XA 2A3ZA 2I7NA 1RGIA 5KPZA 4K42A 1YUWA 5LY3A 2E88A 3FGUA 3LDQA 2QXLA 3IMXA 3TU5A 1ZBSA 4FWQA 1KXPA 3ULEA 2A5XA 1GLFO 3ZEUA 4CZLA 3VETA 2CGKA 3D2EA 4BRPA 1U2VA 4C23A 2QWMA 3A0IX 2QM1A 2GELA 3WXIA 1Q18A 4HWIA 3VEVA 3FZMA 5BPNA 3CJ7A 4IJAA 5JLHA 3MN5A 3MN7A 4CZEA 2V51B 5TKYA 3O6WA 4L3QA 1HKCA 1DKGD 1T44A 4FWPA 5B8HA 3UKUB 3ENHA 5BN8A 4CBWA 3MK6A 3VGKA 3D2FA 3R6MA 1ATNA 3WQUA 2ITMA 3IDHA 4QS9A 1MWMA 1GLJO 4KBOA 1T6CA 4BRNA 3O08A 4I6MB 1NGJA 1C0FA 2E2PA 2W40A 3FZLA 4FOIA 4DHYA 5KQ8A 2FF3B 4JNEA 3SMSA 3H3OB 1QQNA 4BRKA 4H5VA 4BRCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S6QA 2H3GX 3VA3A 2O8DB 1H1VA 2OA8A 2A40A 2WONA 4IDHA 2HBJA 4A62A 4CD3A 4CF1A 3O4WA 3TTCA 4BRGA 1GLLO 4A59A 2IIRA 1NKEA 1MU2A 1X9JA 1SL2A 2OPQA 2QWNA 4JAXA 4BROA 3CPEA 2Q1NA 3WT0A 1FKPA 4B3MK 1GOBA 2GBZA 5I9EB 2HNZA 3C94A 3K57A 2QK9A 1RDWX 5EX5A 1LWFA 1Q8IA 1Q9XA 2B4JA 3A5OC 3UE5A 4M3WA 4JRQA 1QE1A 3P39A 3O3GA 1KAYA 3BY5A 4RCHA 5C12A 1NJXA 2QW9A 4M7XA 3T1HK 2G8IA 3T19A 1RTIA 5LL6Z 5AQKA 4H03B 4CJ3A 1NWKA 1SKWA 3CJ9A 3AVKA 4Y0WA 3S3OA 4RW8A 3BP8A 2QKKA 2KFNA 5M1NA 3V9XA 3LM2A 3QB0A 3IAYA 2YHXA 4WE1A 3NH1A 3WNHA 4HUGA 4FLXA 3K5MA 1WSGA 4GVEA 4FLZA 2P1JA 3FFKB 5M1OA 1T03A 3LP3A 3TSUA 4KHQA 4CIFA 3PSIA 4NYNA 3SYZA 3IUCA 3AARA 2XY5A 3P5JA 3ULDA 4FK0A 1SZ2A 4Z4CA 2ZGYA 3VF6A 4YFUA 3L3VA 2P9PB 1JLFA 3K59A 3LP2A 1YF5L 4CF0A 4ISGA 3SJHA 2P51A 1VQ7N 2R7YA 3ALYA 4FWSA 3DAWA 3MXJA 4DTUA 4CJWA 2VWJA 1YJ9N 2CH6A 3G25A 2ASMA 4N41A 5GAGP 3NGZA 2KZMA 1YAGA 2HOEA 3O1BA 3V6DA 2B6AA 1RT4A 1HKBA 4F9OA 4OPHA 3ZYYX 4DV2K 2E2OA 4GV6A 4FJIA 2YHWA 5GAHP 3CFRA 2GTDA 1YTAA 3ENBA 3LP0A 4MO4A 3I8DA 4JI3K 1NK4A 3HL8A 4H0VB 2O8EB 1YTUA 3AAQA 3NF6A 2YX6A 2OPRA 3K5LA 3V9SA 4FJGA 2F4VK 1OVQA 1WUAA 4KKOA 1BA1A 1NK0A 1S3XA 2UUAK 2HW3A 4CZIA 4E1JA 4FJ7A 4MO5A 4CJ5A 4FK4A 1IBKK 4M3XA 4KFBA 3WNFA 2HHIA 2ZM6K 3TI0A 4O8UA 2OANA 3AO1A 4B1ZA 4FWLA 4WQ4C 4CZFA 4FPBA 3KD5E 1Q82O 4KB0A 1VQ8N 1JLCA 3THXA 5KPRA 5JLFA 3SZ2A 2XO7A 4FYDA 1J6ZA 3LM9A 1ZBFA 2V7YA 1QSYA 2FSNA 4NXMK 3WUHA 4XH4A 3G71N 3OJSA 5JENA 1FK9A 4BGBA 3L2VA 2PYJA 3RR8A 1U49A 4CEBA 2YJFA 4DQQA 1CZBA 1BQNA 3THYB 3S9HA 3RR7A 2FBVA 3V9ZA 3CJAA 4BC4A 1SS6A 3CMAN 5AQSA 1I3AA 1S22A 4M7YA 1XQSC 3JXUA 4B1YB 5DMRA 4YOUA 1ZBLA 3VGMA 4CEOA 5AR0A 2VWKA 3PO5A 1TYQA 5AQPA 2HHTA 3DYAA 4EHUA 1ATSA 1K6YA 4CFBA 4JYAK 3FFIA 2A1RA 2ASPA 5EY4A 3HT3A 1YIJN 4OLBA 1LCUA 4B3TK 1B9FA 2D4WA 3E9LA 4DU4A 4OPJA 1KRPA 1QHAA 3RSEA 3HPOA 4CERA 4CHQA 1JXBA 5BRHA 3AO3A 1R0AA 1S1TA 5C10A 1VQ9N 5AFUH 2E1ZA 3PUFA 4IWVA 5M1FA 3C6HA 1RCHA 1MA9B 5FPMA 2IS3A 3M8PA 4NLBA 2D1KA 2HHHK 1K9MO 3LPUA 3NDKA 3QDKA 1U04A 4LF8K 3EZWA 2ZWHA 3CC4N 3MN9A 3JYTA 3LL3A 4CHYA 5I3UA 3ZX0A 4CW7B 2PBDA 4PKHA 4DLGA 4HTLA 4RTFD 1NKBA 4FVMA 1KVAA 2D0PA 4IDKA 3HJFA 2YJEA 5ADXH 3FZKA 3OBYA 2CGLA 5LJWA 5KI6A 1IJJA 4G9ZA 4DR7K 4FWKA 4IG0A 3IS9A 3J81O 4QS8A 5KRSA 3L2WA 1XMOK 4JHDA 4CVNE 5AZIA 2RE2A 1NK9A 3EY1A 3VEZA 1RDAA 5HRRA 3LDOA 4BRAA 4H0PA 4BC5A 3PX4A 1GLDG 2VG7A 3EZ5A 1G99A 3SUQA 3CJCA 4CIGA 1EXQA 2YCHA 4B08A 2KLAA 3J7YP 4YOTA 1BO5O 1L5UA 5M1QA 2P9LA 4JI2K 4N76A 4M45A 1K8KB 3AVHA 3CCJN 1T8EA 1KVCA 4DQIA 1U4BA 1E3MA 4BR2A 4FSVA 5C2DA 5BN9A 4BACA 1KAXA 4DV0K 4WYBA 1TVRA 4GNIA 1HQEA 2OZSA 1X1PA 3KWGA 4W5RA 3LDPA 3AO4A 5LMUK 2P9UA 4HUFA 1GLAG 1RBVA 5EXWA 4BR7A 3QFPA 4M41A 2RN2A 4FM0A 4YNQA 1S72N 5C0YA 1TKDA 1TKTA 5LJVA 3AO2A 1HJOA 4YY3K 5FROA 1RBRA 2VQFK 4IG3A 1GLBG 4OLAA 3OYLA 4CJQA 4ZTFA 4EHTA 3BGRA 4CZGA 3CCQN 2W00A 2UXBK 2LSNA 3U3GA 3D2EB 3CIPA 4FWNA 4DF4A 1UA0A 5JS2A 3CPWM 3VENA 2I7PA 3CHWA 3CD6N 3MCPA 5JVGL 4M3UA 3F2KA 2XY6A 1E4GT 2AA4A 4JI1K 4DSIA 4BECA 2YNGA 1EWRA 2FC0A 1J9AA 4GW6A 5KPZA 1SUQA 4B3OA 2Z1HA 2E88A 4IFYA 4B8AB 3IG1A 1VQLN 4FJ8A 4B9MA 3VEVA 3CXCM 4HUEA 1D9DA 1O1WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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