3CI5A

Complex of phosphorylated dictyostelium discoideum actin with gelsolin
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
372
structure length
366
Chain Sequence
DVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGMGQKDSVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Modulation of actin structure and function by phosphorylation of Tyr-53 and profilin binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Major actin
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 366
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ci5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ci5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ci5A03
4DB3A 2YJEA 4ISFA 1NGGA 3DXMB 2CH5A 2P9PB 5AQHA 5AR0A 4JD2B 1NGIA 1NWKA 3DXKB 5AZJA 3WEEB 3MN5A 1E4GT 3VF6A 3VENA 2FF6A 1Y64A 4FL9A 4H0TB 3CQYA 5AQRA 5AQTA 3EKSA 3MCPA 3ZEUA 1C0GA 5TKYA 4B1XB 2Q97A 4WQ4A 4CBXA 1XQSC 1RDWX 3BP8A 3CJBA 4IWVA 4JN4A 4CJ7A 2NRHA 1XUPO 4B1YB 3GL1A 3SLCA 3BUZB 3CERA 1WOQA 2A5XA 3VEOA 5ADXH 3CIPA 3BF3A 1T6DA 2ZWHA 1V4TA 3FZFA 1RGIA 2I7PA 3SK3A 4BGAA 3C7NA 3VEVA 4H5NA 5AQQA 2CGKA 1QQNA 3ULEB 4FO0A 3CI5A 2P9KA 2E8AA 1BA0A 3ENOA 2QXLA 1GLEG 2P9NA 3GE1A 5E84A 3ZETB 3CHWA 2GWJA 3VETA 3UE5A 5BPLA 4MO4A 3ENHA 4A62A 1BU6O 2CH6A 2FSNA 4GY2B 4BR7A 2VWBA 3H45C 4O5FA 3MMVA 3C0BA 3D7EO 2GEMA 1QQMA 4IJNA 5LY3A 5AQGA 1GLCG 2FLOA 1QZ5A 2HOEA 5EOYA 1E4FT 3I33A 4BC4A 3FGUA 1NGAA 1HPMA 4IO8A 2ASMA 2HF3A 4QS7A 3VEWA 2ASPA 4CZEA 3JS6A 4B1UB 3H46O 2QWLA 4H0XB 4C23A 2V7YA 3UKRA 1EQYA 1CZAN 3CJ9A 3S41A 4CZHA 4J8FA 1JCGA 2QWNA 3A5MC 3ZX2A 3UKUB 2YHWA 1TYQA 4XH4A 2IVNA 3FR0A 4FWOA 1SZ2A 2IIRA 3O80A 5E26A 2YJFA 5JMVA 5LJVA 5AQIA 2PBDA 3RSEA 3EL2A 4BGBA 3MN9A 2BTFA 2VCPA 4FOEA 4FWLA 4K42A 2FSKA 1K8KB 3ZX0A 2W40A 1YUWA 4FWNA 2PAVA 5LJWA 4FWQA 1C0FA 1HKBA 4CD1A 4CZFA 3VPZA 3TPQA 2E88A 1Q18A 2YHYA 2FXUA 3QB0A 1HUXA 2OANA 4H0OA 3AAQA 5AQLA 2I7NA 1BUPA 1QZ6A 1X3NA 2P9SB 3UB5A 3GOIA 3M6GA 3ATUA 2V52B 3W3DA 2QW9A 2E20A 4RTFD 3WT0A 1YVNA 1GLBG 1D4XA 1NGEA 3P4IA 4MO5A 4BRCA 1HKGA 1BDGA 1NBWA 2BUPA 1G99A 3WQTA 3ZX3A 2FF3B 3AAPA 3ATVA 3O1BA 4FSVA 1DEJA 2Q1NA 3FE1A 2P9UA 3QFUA 2CGLA 2FSJA 2E1ZA 2P9LB 1DGKN 1P8ZA 4H0PA 5FPNA 3VEXA 3FFKB 2KHOA 4PKHA 2Q2RA 3O8MA 3KZBA 1KAZA 4BQLA 3SMSA 1LCUA 1V4SA 5ADXA 1GLJO 3R9PA 4BR0A 4RWTA 4H0VB 3EN9A 1JCEA 3O1WA 2ASOA 4L3QA 1NGBA 3MN6A 2P9IB 2DPNA 1S3XA 3MDQA 2A3ZA 4AM7A 1ZBSA 4JHDA 2IVOA 4BQZA 2Q0RA 2ITMA 5KPTA 1OKJA 1J6ZA 4EAHD 2QWRA 2QM1A 4HWIA 4RCHA 3R8EA 3A8YA 4FWSA 4B9QA 1BA1A 4FPBA 1MA9B 5AZIA 4M63C 1GLAG 5FPEA 2CGJA 2D1KA 3VESA 1ZXOA 4BRLA 3WQUA 4I6MA 2E1YA 3G25A 3U4LA 3D2EA 5ELZA 4GNIA 4WQ5C 4ISGA 4MLHA 4PKIA 3O6WA 3FZMA 3LDQA 5AQNA 1ESVA 4O8KA 3D2FA 3FLCO 1LOTB 3QICA 4H5WA 3GDQA 3QFPA 1NGHA 4BVOA 1RFQA 4FWMA 3DWLA 3VGLA 4K41A 3KVGA 5BN8A 3H3NO 1DKGD 3HTVA 1SQKA 4M7YA 4LC9B 4PKGA 1KAXA 1NGJA 3DAWA 1HLUA 2P9KB 3H1QA 3BF1A 3LM2A 4BRMA 3WXIA 2VYPA 3H6EA 4DCHA 2P9NB 4XH5A 3VF4A 5BRFA 5I9EB 4A61A 2YHXA 3I8BA 5B8HA 2A6AA 3IUCA 4BR2A 1HX1A 1U2VA 4IJAA 5KPZA 1R59O 4BC5A 3AARA 4NO7A 4FOIA 3VOVA 4QS8A 1ATNA 3IFRA 3HI0A 1Z6RA 5BREA 1NGFA 4CZKA 2EWSA 4EHUA 3U9DA 5AFUH 3VGKA 3WXKA 3CJAA 2A40A 5AQPA 3JXUA 3O4WA 2J4RA 1QHAA 5AQSA 3UKRB 4H0YB 4YDUC 3R6MA 3L4IA 2WUSA 4FWKA 1MWKA 2GWKA 4MLEA 3GG4A 5F1XA 4M7XA 3H1VX 3DXMA 3LDOA 5FPDA 1TYQB 2P9PA 4XH1A 4JD2A 1GLLO 3DXKA 1NM1A 2IVPA 1QQOA 3M1FA 5F0XA 3WEEA 4BR5A 5AQFA 4B1ZA 3IDHA 3VEZA 1U6ZA 4K43A 5JLHA 4CZMA 3QBXA 5BR9A 3A5NC 3EZWA 3A5LC 2E2PA 4EFHA 1NGCA 1BOTO 1YXQA 5F2RA 4BRAA 2UYTA 2ZGZA 3WUHA 4A2AA 3SMPA 4PL8A 3LDPA 4BREA 3B8AX 1ATRA 4BRDA 3A0IX 4WQ5A 1X9JA 1XC3A 4EHTA 3H3OB 1JCFA 4CZLA 4CBWA 2AP1A 4H5VA 4BRNA 4BRHA 3FZLA 3A5OC 4Y0WA 4BC3A 3OHRA 2HMPA 1T44A 3IMXA 2E2QA 4IZ9A 3ULEA 2QWOA 4AM6A 2HF4A 4CD3A 3VEYA 3QBWA 3HSCA 4BG9A 4HTLA 5AZJB 1GLDG 2P9UB 2QWQA 2QWMA 4KBOA 4BRQA 3ZETA 2D0PA 4JNEA 1MWMA 3ZEUB 1HJOA 3M3ZA 3LL3A 1NLVA 2Q0UA 3EKUA 3VF2A 4Z94A 4NB4A 1BG3A 2NLXA 3FZHA 1BWFO 3VERA 3SJHA 1GLFO 3KHYA 4BRGA 3LDNA 3CETA 5AQWA 2GTDA 4A2BA 4B1VA 2QWPA 4FPAA 4JHDB 1ATSA 5BRHA 4FWPA 5BPMA 3J8AA 1IJJA 4E1JA 2ZGYA 4BC2A 3VGMA 3QMLA 3C7NB 3L0QA 4FWRA 1HKCA 4XEIA 1H1VA 4QS9A 5BN9A 5AZIB 1NMDA 1BO5O 3HZ6A 4K25A 2ZF5O 4CZJA 3MK6A 4YDUA 5EXWA 1S22A 2V51B 4WQ4C 2A41A 3UKUA 2H3GX 5AQKA 3WXJA 4CI6A 4I6MB 3BEXA 4BRKA 1KAYA 3U8XA 3D2EB 4BG8A 3CQXA 1TUYA 3FZKA 3U9ZA 4CBUA 4BR9A 3HBTA 1WUAA 2V7ZA 3DJCA 3D2FB 5AQXA 1IG8A 5JICA 5AFUA 1X3MA 1ZC6A 3CJ1A 3F9MA 4ISEA 5EVZA 3CJCA 1K8KA 5BRDA 4BRPA 3O08A 3O5BA 4PL7A 5AQOA 3CJ7A 3ID8A 1MDUB 3LDLA 1KXPA 2D0OA 4IXCA 1SAZA 2GELA 2Q31A 5EX5A 4CZGA 3HM8A 2F9WA 3QDKA 4H5TA 3AY9A 1T6CA 2D4WA 2YI1A 1YAGA 2YCHA 4BR4A 5AQYA 4DHYA 4WYBA 3GBTA 2P9SA 5EY4A 4DQ8A 3WXLA 3MN7A 4BRFA 2Q36A 3W0LA 3EO3A 2GUPA 2W41A 1U2VB 5AQVA 4B1WB 5BPNA 5JLFA 5FPMA 4BROA 4F9OA 5AQMA 2E2NA 5CE3A 2P9LA 5KQ8A 1Z05A 5AQZA 3TU5A 1NGDA 3RSEB 5KQDA 4BRIA 4CZIA 4H03B 4H5RA 4JAXA 2F9TA 2NZTA 2E2OA 3L6QA 2AA4A 3LM9A 4BVPA 5AQJA 1TUUA 4EIAA 5KPRA 2P9IA 2A42A 5AQUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5J2MA 4M45A 3LPUA 4DFPA 3DRSA 3LWMA 3ITHA 1NGGA 5AQHA 1WSHA 2ZJQL 2OYQA 4WFBL 4PA1A 3SV3A 1E4GT 1L3TA 4PWDA 3VF6A 3TAMA 1Y64A 1FJGK 3THYA 4E89A 3MCPA 1Z25A 4FW2A 3EYZA 2Q97A 4YOWA 5FRMA 3IS9A 4LF6K 4CBXA 2JWKA 3BP8A 4JN4A 1XUPO 3SLCA 3C6AA 2A5XA 1W2BM 2YHBA 1VQ7N 5C2DA 1V4TA 5M1OA 1TKZA 2UXDK 4FLZA 4ELTA 1A5XA 3OYLA 3F73A 3ENOA 3MWPA 1NJYA 2P9NA 4CF0A 4GKKK 1KSPA 4X62K 2GWJA 4C8LA 2Z1JA 2FBTA 3HPOA 3MXJA 3ZSZA 1BISA 3SZ2A 3KLGA 2CH6A 3D0PA 3H45C 4ILHA 4F8RA 4IJNA 4HTUA 4DV4K 1GLCG 3T7ZA 4DSJA 2HOEA 2QI2A 1E4FT 2P5GA 4IO8A 1HPMA 3OY9A 3SYZA 3L3VA 2ASPA 4KRFA 2ZQBA 4O4GA 3RTVA 1XMQK 3DRPA 1ZBLA 1JLQA 2NRWA 2QKBA 1JLCA 4J8FA 1FKOA 4OO1J 3CCRN 3ZX2A 2QEXN 1TYQA 2IVNA 3FR0A 4E1MA 3PSFA 4AHUA 5E26A 2YJFA 4CJWA 5LJVA 3MEEA 1BCOA 4M3UA 2YHAA 1IKXA 4HHTA 4CEEA 3PX0A 3D45A 5J2QA 4B08A 4E7JA 1VRTA 5LJWA 1C0FA 4CZFA 4CJEA 3K57A 2E88A 3G71N 2FXUA 5C24A 3F2KA 3V1QA 2OANA 3F5TA 3LAKA 1EX4A 3HL8A 4CHZA 3OS2A 3OYEA 2O4GA 1QZ6A 3UB5A 2P9SB 1WBBA 4DUYK 3M6GA 4B3RK 3J81O 5I3UA 2OPRA 1W97L 3P5JA 3WT0A 1YVNA 4CEAA 3M8PA 1QVGM 1NGEA 1G99A 3ZX3A 3VN5A 3O1BA 1LWCA 1DEJA 2Q1NA 3QFUA 2NRTA 2FSJA 2P9LB 3PIOL 3VEXA 3NVKA 4KHQA 3LP2A 3SMSA 2W00A 3SNNA 1GLJO 3R9PA 5GADP 3O1WA 1NNEA 4FJ5A 1NGBA 3MN6A 1U48A 4AILC 2A3ZA 3J80O 4PY5A 4TSXA 1XWLA 4YOXA 4JKDA 3PX6A 4GVEA 2QA4N 2ITMA 3QESA 2JLEA 2QWRA 2HHQA 1VAZA 3CFPA 3QNNA 2UUBK 4BE2A 4C8KA 4I9QA 4HUGA 2IS3A 1SL1A 3ZT4A 1KC8O 4FPBA 3SUOA 1GLAG 5FPEA 3DLRA 1XNRK 2D1KA 4BRLA 1C1CA 1G15A 5HRPA 3CF5L 2KFZA 3D2EA 1K73O 4E7KA 4FJXA 4WQ5C 4AHRA 4PKIA 4FJIA 3KLEA 4NCBA 3LDQA 5KRSA 1C6VA 2BE2A 3VQ6A 3TAPA 1RTDA 4CJLA 2IDOA 4OGCA 3VA3A 4CF9A 3CC4N 3AVNA 4KTZA 4FJ7A 4F2RA 4FLXA 2XY5A 1HNVA 1SQKA 3S3MA 4MDBA 4B9UA 1U45A 1KAXA 3HT3A 1NGJA 3AO3A 4YFUA 3IAYA 2HHHK 1YHQN 1XC9A 4JK7A 4KHSA 5C12A 3T1YK 4FM1A 3SQ0A 4FXDA 4DCHA 4KHYA 4CIFA 3MWTA 3I8BA 3KD5E 4CEZA 3DOLA 4CEOA 3VQ4A 3CM6A 3AARA 1JL1A 2C1IA 3NH2A 4IFYA 3ZSVA 1ZBIA 3BZKA 1HYZA 2VG7A 3OYIA 3AA3A 4G9ZA 1NGFA 3VGKA 2P1JA 2A40A 3DOKA 1T7PA 3VQBA 3VQPA 4EP5A 3J7AP 4ILJA 4DSKA 3MX2A 3O4QA 5FDLA 1MWKA 4OPAA 4WCEL 1Q86O 4CK1A 3H1VX 3DXMA 3TWHA 1YJNN 1YTAA 1GLLO 4LF4K 1IKVA 1NM1A 1QQOA 1VQNN 4FLWA 3WEEA 1HQEA 3SPZA 1J5OA 4CZMA 5M1PA 4RW9A 3A5LC 3VQ9A 1QSSA 4EFHA 1L5UA 2UYTA 2ZGZA 3EE8A 3VQ5A 4ID5A 3ID6A 3LDPA 3HVTA 1SL2A 2ZJPL 3A0IX 4WQ5A 5MLCQ 4HVJA 4JEPA 4ELVA 5HROA 1X9JA 3KKSA 3C94A 3BY5A 2E6LA 4H5VA 4IG3A 3TTCA 4OLBA 3A5OC 5A2QO 2HMPA 1T44A 2YKNA 3IMXA 4IZ9A 2F8TA 2QWOA 3HK2A 3M8QA 3HSCA 3THXB 2QK9A 2PYJA 5AZJB 4CW7B 1GLDG 2E4LA 5IT9O 2P9UB 2QWQA 2WOMA 3T69A 3HYFA 3HM9A 3DRRA 1EETA 3KD1E 3SAHA 3NGZA 3OYAA 1JLAA 4JI6K 1NLVA 2Q0UA 4CCHA 4NB4A 4AHTA 1BG3A 4J2DA 1TAUA 3AVBA 2NLXA 3SV4A 3KHYA 3MECA 1VQKN 4DV1K 2QWPA 3AVHA 3MEDA 4E1JA 3QINA 3VGMA 2YNGA 4FWRA 1H1VA 3QEIA 1T8EA 3MK6A 5EXWA 3K9JA 4OKJA 2A41A 4I6MB 4FJMA 4BRKA 3E9PA 4FYDA 4BG8A 2HB5A 4C1NI 3FZKA 1T05A 1TKDA 4C1NK 1RTIA 5AJ3K 1E3MA 1WUAA 4DV0K 4HCBA 5JS1A 5JICA 5AFUA 4ELUA 4BE7B 1ZC6A 1K8KA 4BRPA 3V9SA 4CGGA 1KXPA 4HUEA 1RT6A 3CCMN 5C10A 2O8DB 5K14A 3NMUA 4NCAA 4WYBA 4RW8A 4AQYK 3GBTA 3O3GA 3WXLA 3QLHA 4BRFA 3PIPL 1IG9A 3N4QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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