3CIPA

Complex of dictyostelium discoideum actin with gelsolin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
371
structure length
362
Chain Sequence
VQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Modulation of actin structure and function by phosphorylation of Tyr-53 and profilin binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Major actin
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 362
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cipA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cipA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3cipA03
1BU6O 1GLJO 4BRCA 3VF2A 1KAZA 3VENA 4IJAA 3CJBA 3GG4A 5AQGA 1K8KB 3VEXA 1ATRA 4CD1A 4DQ8A 2W40A 4CBUA 1RDWX 2P9SA 3QFUA 3MN7A 3JXUA 3BEXA 4KBOA 2AP1A 3VERA 4H5VA 3C7NB 1E4FT 4BRIA 4M7XA 1GLFO 4XH4A 4B1VA 3CJAA 3ATUA 3UB5A 5AQUA 4FWMA 2ZGYA 3LM2A 4RWTA 1NGEA 2E8AA 5KPRA 1YVNA 3LDNA 5ADXH 1QQMA 3CQYA 4H0YB 4O8KA 3MCPA 4PKIA 3H6EA 2A41A 2A6AA 2J4RA 3MDQA 1J6ZA 2IVOA 2QWNA 4FWNA 5AQFA 3WQTA 1NGHA 2H3GX 4A61A 3DJCA 4BQLA 4H5NA 3FE1A 4CZIA 2E20A 4EHTA 3WEEB 2NZTA 1H1VA 1TYQB 4MLHA 2Q36A 2FLOA 5F2RA 3M1FA 3FZHA 3SMSA 5AQQA 1GLEG 3A0IX 5KQDA 3S41A 2QM1A 2ZGZA 3O1BA 5BRDA 3AAQA 2EWSA 5BPNA 4FL9A 4HWIA 3SLCA 2YI1A 4JNEA 3AAPA 3FFKB 3O08A 3MN9A 1C0GA 3SJHA 3QDKA 4A2AA 4RCHA 1LOTB 4BRHA 1HKCA 3D2EB 1MWKA 3BF3A 3FZKA 4BC3A 3D2FA 3O5BA 5AQSA 4XH1A 1CZAN 1IJJA 4BRMA 4E1JA 5LY3A 5LJVA 3L6QA 3MN5A 5LJWA 2QWMA 3MK6A 4YDUC 5AQHA 3VGMA 5AQNA 3BP8A 4H0PA 2P9NA 2E88A 2FF6A 3CERA 3WXKA 2E2PA 1IG8A 4XH5A 4K42A 2P9LA 1EQYA 4JD2B 3UKUB 4BVPA 1GLBG 2YHWA 4FPBA 1YXQA 2V7ZA 4B1UB 4BR0A 1U2VA 2P9PB 3CIPA 4H0OA 2CGLA 2YHXA 3ZX3A 4BR7A 2A5XA 4EFHA 4IXCA 2ZWHA 5KPZA 1RFQA 2BUPA 2D0OA 4AM6A 2V7YA 3DXKB 3ZEUB 3HBTA 2V52B 4QS8A 3SK3A 5KQ8A 3ULEB 4QS7A 5AQTA 3VOVA 2DPNA 4PKGA 5AZJA 1NGFA 1RGIA 4EAHD 4FWQA 2VYPA 3I33A 4CZJA 2QWLA 3HM8A 2E1ZA 3A5LC 5F0XA 1MDUB 3ENHA 3FGUA 3O1WA 2CH5A 3VEOA 4FO0A 4IZ9A 4M63C 4Z94A 4QS9A 3W3DA 1HUXA 5AQRA 3WXLA 5I9EB 4BRKA 2P9KB 3VEYA 3O6WA 5EY4A 4FWLA 3EZWA 1TYQA 3DAWA 1X3MA 1OKJA 1WUAA 2GTDA 5JLHA 2P9IB 4BRFA 1QHAA 4JHDB 2GWJA 1C0FA 2P9UA 3UKRA 3RSEB 3P4IA 1D4XA 3CJCA 3H3OB 4IJNA 1NGAA 4BG9A 5JLFA 4F9OA 1V4SA 5AQJA 3KHYA 1NBWA 1G99A 5AFUA 2YJEA 3U4LA 3VF6A 1WOQA 2NLXA 3L4IA 3WXIA 2YHYA 5BN8A 4H0TB 2NRHA 1HJOA 3CQXA 4B9QA 2V51B 3A5MC 4XEIA 3GL1A 4J8FA 4BC2A 5AQIA 3HTVA 3ZETB 2E1YA 2ITMA 3VGKA 1MA9B 2QWPA 1BWFO 3FLCO 5AQKA 1QQOA 3IUCA 2IVNA 2F9WA 4H0VB 2D1KA 4H5RA 2A42A 2A3ZA 3VEZA 4MO4A 3A5OC 3TPQA 3WXJA 5AZIA 3VESA 4I6MA 4JD2A 1Y64A 3G25A 3CI5A 3MN6A 4BG8A 3L0QA 1T6CA 1DKGD 3B8AX 1QZ6A 1NGDA 4DCHA 4CI6A 4CZGA 3ZX2A 1GLCG 2P9SB 2HMPA 4PL8A 4RTFD 3DXKA 4HTLA 4IO8A 1SQKA 4NB4A 3ZEUA 3VEWA 3ATVA 1NGJA 3ID8A 3U9ZA 4K41A 2ASPA 2F9TA 3DXMB 4BC4A 4BRNA 4BRGA 2I7PA 4C23A 5AQWA 3EN9A 3JS6A 4BGBA 3ENOA 1QZ5A 1KAXA 1KXPA 2OANA 2HF4A 3EL2A 4FWPA 1NMDA 4BRAA 1XC3A 1ZBSA 2QW9A 3O80A 1K8KA 4H5TA 5BRFA 3FR0A 5BR9A 2WUSA 5EOYA 5ADXA 3FZFA 1ZC6A 3H1VX 4K43A 3WQUA 3WUHA 5AQYA 4L3QA 3C7NA 1Z6RA 2UYTA 3SMPA 4CBXA 2E2QA 3IFRA 2GELA 3RSEA 2QWRA 3H3NO 4A62A 4BR2A 2BTFA 4MLEA 4BR9A 4H0XB 1X9JA 1GLDG 2E2NA 2GEMA 1HLUA 5AQPA 1BA1A 5BN9A 1ATNA 3LM9A 5KPTA 3W0LA 3HI0A 2Q0UA 3R9PA 5AQVA 5EX5A 3LDPA 5AQZA 4CJ7A 3O4WA 1HKGA 1T6DA 2Q2RA 3I8BA 1HKBA 2D4WA 3IMXA 1NGCA 4B1YB 3HSCA 4B1WB 2CGJA 1HPMA 2FSKA 1BOTO 3WEEA 4DHYA 1QQNA 1V4TA 1XQSC 5AQOA 4M7YA 3D2FB 2GWKA 3EKUA 4DB3A 4BGAA 3DWLA 1NWKA 4FWOA 2W41A 1DGKN 3LDQA 1ESVA 1TUUA 2P9NB 4FWSA 3LL3A 1BO5O 4BRLA 1HX1A 2YJFA 3H1QA 2P9LB 4GY2B 4CZFA 2FSJA 3R6MA 1JCFA 3D2EA 1JCGA 3CJ9A 1U2VB 1GLAG 1U6ZA 4CZLA 3A8YA 3KVGA 4JN4A 3D7EO 3DXMA 5AQMA 4B1XB 3UE5A 5AR0A 3MMVA 3A5NC 4FOIA 1BA0A 2AA4A 2ZF5O 2PAVA 3QICA 2Q0RA 1Q18A 1ZXOA 3IDHA 3U9DA 2HF3A 3QBXA 4FWKA 5AZJB 4Y0WA 3M3ZA 4IWVA 3QFPA 3VGLA 4CZHA 2IIRA 3UKUA 5BPMA 2D0PA 4BQZA 2FF3B 5TKYA 4A2BA 1R59O 1NLVA 4BREA 4WYBA 3AARA 2P9PA 1S3XA 3CHWA 1BG3A 1E4GT 5B8HA 3GOIA 1MWMA 2QWOA 3QMLA 4BROA 5BPLA 4B1ZA 3GBTA 4O5FA 3QBWA 2IVPA 1TUYA 4GNIA 3U8XA 4H5WA 2QXLA 4H03B 2Q97A 5AQLA 4AM7A 3H46O 4BC5A 3ULEA 2ASOA 5ELZA 5JICA 3LDOA 2GUPA 5AQXA 3BUZB 1S22A 4EIAA 2P9UB 3UKRB 3TU5A 4PL7A 2FSNA 4FWRA 3CJ7A 1ATSA 3BF1A 4BRDA 3R8EA 3F9MA 3LDLA 4FSVA 4ISEA 2VCPA 4ISFA 5EVZA 5EXWA 2Q1NA 2P9KA 5FPEA 2Q31A 3VETA 1NGIA 5FPMA 4ISGA 1NGGA 4CBWA 3KZBA 3EKSA 3QB0A 1YAGA 3C0BA 5BREA 5BRHA 4JAXA 2CH6A 2HOEA 4WQ4C 2QWQA 4WQ4A 2P9IA 1Z05A 1XUPO 4YDUA 4JHDA 4BR5A 4BVOA 3J8AA 5AFUH 5CE3A 4LC9B 4BRPA 1JCEA 2ASMA 1DEJA 2FXUA 1P8ZA 4PKHA 4K25A 3VPZA 4NO7A 5AZIB 1KAYA 2I7NA 3AY9A 3O8MA 5FPDA 4I6MB 4CZEA 3VF4A 1NM1A 4CZKA 2PBDA 3OHRA 5E84A 4CZMA 2YCHA 3FZLA 4BRQA 2KHOA 5JMVA 1GLLO 1YUWA 5E26A 5FPNA 2A40A 3ZX0A 3CETA 3CJ1A 2CGKA 3ZETA 1T44A 1X3NA 1SZ2A 1BUPA 5F1XA 1NGBA 1BDGA 4FPAA 3EO3A 4WQ5A 4WQ5C 3GE1A 4FOEA 2E2OA 3WT0A 4EHUA 1LCUA 3H45C 3GDQA 3HZ6A 4CD3A 4BR4A 3M6GA 3VEVA 3FZMA 4MO5A 2VWBA 1SAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GLJO 1KAZA 4RW7A 3VENA 1HYZA 4FJKA 4M3UA 3QEIA 3C94A 1WSFA 1VQ4N 5C12A 2BGGA 1VQ5N 1KSPA 1WBBA 4KBOA 1VHXA 5J2NA 4C8OA 4H5VA 4BRIA 4M7XA 4XH4A 1UAXA 4DSFA 4F3TA 4RWTA 3NH0A 3SZ2A 5KPRA 3IAYA 3CFOA 4KHNA 3OYDA 4O8KA 4JI1K 5HRNA 3K59A 2O8DB 2A6AA 3ZSRA 5J1EA 1J6ZA 4JYAK 4YOYA 1NGHA 2H3GX 3AO3A 3CXCM 4LF6K 3ALYA 5HROA 4JS5A 3EYZA 3HT3A 4Y1DA 2ZJQL 4LF8K 3OJSA 2NZTA 2F7TA 1H1VA 3KJVA 2FLOA 1RT2A 1L3SA 3THWB 5CY4A 5AQQA 1NKCA 1C0TA 3A0IX 2OPQA 4KHYA 4FJXA 5KRTA 4JK7A 1WLJA 1VQ8N 3SLCA 1RT1A 3AAPA 3O08A 2NRTA 1C0GA 1LOTB 1BL3A 5M1KA 2XRIA 2HHSA 4AHCA 3D2FA 4JRPA 4JI5K 4DWIA 5LJVA 3KIOA 4CGDA 1SKSA 1B9DA 5AQNA 4B9UA 3HJFA 4ELVA 3CCEN 4CJFA 4H0PA 2FF6A 4GV3A 4L8RB 1XI1A 3S9HA 4CJ5A 1EQYA 4JKBA 1FW6A 1S1XA 4G9ZA 5K14A 4FZYA 4BR0A 1BI4B 3O3HA 4EFHA 5CR4A 5KPZA 3OBYA 2D0OA 2BUPA 4DQSA 2DFFA 3HBTA 3SK3A 2ITGA 5AQTA 2DPNA 2IGIA 1TVRA 1MU2A 2VYPA 4C8MA 4LF5K 3NH2A 2HHVA 2E1ZA 5F0XA 3OYKA 1MDUB 4CHNA 3O1WA 2CH5A 1QS4A 3LZJA 2JGUA 3VEOA 3AA3A 3G4SN 3THYA 4IZ9A 4QS9A 3W3DA 3WXLA 4AHSA 5I9EB 2BDPA 2F8TA 3H08A 3L2RA 4DQIA 4FWLA 3AVBA 4MQ3A 4M45A 1KC8O 3P83D 1BGXT 3VQQA 1X3MA 2XY5A 2WTUA 4YNQA 3PV8A 5AJ3K 4BRFA 3ZSZA 2W42A 3P4IA 1HNXK 3S3MA 4CF1A 1D4XA 3CJCA 4N56A 3M8QA 4IJNA 4DF4A 2IAJA 4F9OA 1U45A 4B3TK 1VQ6N 5AQJA 1L3VA 1K6YA 5KGWA 3M8SA 4ID1A 5AFUA 1A5XA 1NJYA 4CJ4A 4IFVA 3WXIA 2YHYA 4OPKA 5CHIA 3CQXA 3IG1A 4BWJA 1QSSA 3PSFA 1NK0A 4E0DA 2OCEA 4XEIA 3THVA 1W97L 2BANA 5AQIA 3HTVA 1MA9B 1BWFO 2HVIA 1QQOA 1W2BM 2IVNA 4NXMK 4DR2K 2A3ZA 1IBLK 4FJGA 3DLBA 3RTVA 1XHXA 3WXJA 5FRNA 2PZSA 1KTQA 4JI6K 2P1JA 3MN6A 2G8UA 4FZXC 4KPYA 2PFUA 2FC0A 4PQUA 1DKGD 1BIZA 2O8CB 1WAJA 1QZ6A 5GADP 1RTHA 5FDLA 1NGDA 2XY7A 4DCHA 1NNEA 3SBTA 4RTFD 4NB4A 4IO8A 3ZEUA 4FLVA 3VEWA 3ATVA 3ID8A 3U9ZA 4HVJA 4JKDA 1M90O 1IBKK 2ASPA 4O8UA 3RR7A 3MXMA 5C10A 5SZTA 1S1TA 4DF8A 4IOCL 2XY6A 4FM0A 4JKCA 1W9HA 4CEEA 4B3RK 4ZHRA 1WAFA 4JEPA 2HF4A 3HVTA 1NMDA 3D0PA 1XC3A 1K8KA 3K57A 4Q0BA 5BRFA 4CFDA 1Q86O 4JKAA 4N41A 3LZIA 5ADXA 4OLBA 2QI2A 2B5JA 4ZTFA 1RBUA 5AQYA 3SMPA 4DTPA 1Z6RA 1IBMK 1NOYA 4DG1A 4KKOA 3S3OA 1E3MA 4A62A 4BR2A 3OS1A 3RMAA 4BR9A 4H0XB 3VQAA 3QEWA 2QEXN 1GLDG 4B8AB 2GEMA 1BA1A 1ATNA 3W0LA 1NJXA 4B3SK 3LAMA 2X6SA 3ASMA 2Q2RA 2D4WA 3IMXA 3JSMA 4FLTA 2IOCA 2CGJA 4W5RA 2FSKA 3OYNA 3WEEA 1V4TA 5AQOA 2EHGA 1RBTA 4PHTX 3SQ2A 3PX0A 3AVGA 1KFDA 1LWCA 4W5NA 1RBRA 1TL3A 3MX5A 3AVJA 2W41A 2YHAA 4JI7K 1ESVA 1N8RO 3NF9A 3L2VA 3TWHA 5C2FA 4RW4A 4FJ8A 3NFAA 4FLWA 3LL3A 4GKKK 1BO5O 4DFKA 3QERA 5KRSA 4DFJA 2YJFA 4NLCA 2P9LB 2FSJA 1I39A 4CHZA 1NOZA 1RILA 2Y1IA 4FJJA 2KLAA 3MECA 1LW2A 4LD0A 3TANA 1TK0A 1QHTA 1EKEA 3A8YA 4DS4A 3KLIA 1KLMA 4B1XB 3UE5A 4I7FA 5AR0A 1JLAA 2HBKA 4BDPA 2HHWA 4FOIA 1BA0A 2AA4A 2ZF5O 2PAVA 2O4IA 3LP1A 4ID5A 3BY5A 5C0YA 4DLGA 1N33K 1HYVA 4J2DA 2Q0RA 4FK4A 3AA5X 3DYAA 1RDBA 4CK1A 4X64K 4FWKA 4CJUA 5CYMA 3P5JA 4FLYA 3SYZA 4F2SA 3QFPA 4BACA 4FCYA 2QK9A 2RN2A 4BQZA 4A2BA 4HCBA 1KVBA 3AARA 4QOZB 2P9PA 1S3XA 3AO5A 3CHWA 3OYJA 4J2AA 3MEEA 4JKGA 4LY7A 4BROA 4JI0K 2OPRA 4DU3A 3QBWA 2IVPA 4GNIA 4F2RA 1JLGA 2Q3SA 2Z1HA 5AQLA 3ULEA 4CCHA 1P90A 4OGCA 2HHXA 4K8XA 5FRMA 2P9UB 4TSXA 3KLHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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