3DXKB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck0944636
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
212
structure length
211
Chain Sequence
QAVLTLYAQGLLGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of two classes of small molecule inhibitors of Arp2/3 complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 56
structure length 211
sequence length 212
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dxkB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dxkB02
3ENHA 5CE3A 2A42A 3LDPA 5AQLA 4FWLA 4MLEA 4DHYA 3GL1A 1NGFA 1SAZA 4MO5A 4A2BA 3WQUA 3GG4A 2A5XA 3BF1A 3GE1A 5F2RA 4RCHA 2ASPA 1U2VA 4NO7A 4FL9A 3IFRA 1S22A 2V7YA 3MN7A 5AQSA 5AQVA 4BR0A 4PKIA 4Y0WA 4HTLA 2FSJA 3FZLA 2I7NA 4CZHA 4BG8A 3O08A 2YJEA 2QM1A 3L0QA 4B1ZA 2HF3A 4WQ5A 3MK6A 1NGBA 4IZ9A 3OHRA 3WXJA 2P9IA 3FZKA 4B1WB 5AZJA 5AQWA 4FWRA 3MN5A 3ZETA 4K41A 3EL2A 2HMPA 5FPMA 3H1QA 3D2FA 5BN9A 1NGEA 1QZ5A 5FPNA 3UKRA 3HM8A 1NLVA 3DXKB 3UKUB 1NGDA 3VF2A 3JS6A 5ADXA 5JLHA 3VEYA 4FWPA 2A6AA 2QWRA 1MDUB 1NGAA 3A5OC 1Y64A 2IIRA 3CHWA 2Q0UA 5AQXA 4KBOA 4FWSA 3O1BA 5AQUA 3WT0A 3AARA 3UE5A 3DJCA 4ISFA 2NLXA 1MWMA 3MN9A 2FSNA 4BRFA 5B8HA 1S3XA 2I7PA 3EZWA 3RSEA 4FPBA 2V7ZA 1XC3A 3WXLA 4FSVA 1YXQA 1X3NA 3LDNA 5I9EB 1GLBG 1HUXA 1HJOA 1DGKN 4BR2A 2AP1A 4E1JA 3LDQA 3P4IA 1MA9B 2P9LA 1C0FA 4CI6A 4BRQA 4CZMA 3VESA 4H03B 3O80A 3QMLA 4BRDA 2YHYA 4H5RA 1DEJA 4IJNA 2Q97A 2D0OA 3QFPA 4H0YB 3ZEUA 4B1YB 1MWKA 1J6ZA 3HSCA 1BA0A 5AQMA 4A62A 4BR4A 4CBWA 2IVOA 4CZEA 4K42A 5AQHA 5F0XA 3KHYA 3FZHA 3FR0A 1R59O 2GTDA 5AQFA 3U4LA 1YVNA 1SZ2A 1NM1A 5KPTA 3GDQA 1BO5O 1QZ6A 4IWVA 2QW9A 5AQNA 2VWBA 4BR9A 3WXKA 3ULEA 4IXCA 2ASMA 4IO8A 1NWKA 3FZMA 3SK3A 2P9KA 4B1XB 3H3OB 3FLCO 3DXMA 3VPZA 3CJCA 2BTFA 2QWOA 2VCPA 5AFUH 3B8AX 4B9QA 2GUPA 2P9NA 5E26A 3KZBA 4MLHA 1GLEG 1NGGA 3CQYA 4BVPA 4BC2A 2YHXA 2YCHA 5AQQA 4FWKA 3CJ7A 4QS9A 1QQNA 3C0BA 2A40A 5F1XA 4BRAA 3O5BA 5AQPA 3VETA 5BPNA 3CJBA 4EFHA 4DQ8A 1GLDG 4JD2B 2E2OA 3C7NB 4JNEA 4A61A 2F9WA 3G25A 4GNIA 1BU6O 3MN6A 4GY2B 4O8KA 5JICA 3D7EO 4CZGA 3CJ1A 3M3ZA 1E4GT 4CZFA 3BP8A 1GLCG 4FWNA 2ZF5O 4J8FA 4BGBA 3VEXA 2HOEA 3EN9A 5AZIB 4WYBA 3VEZA 1QQMA 3ZX2A 3BF3A 1Q18A 4RWTA 2P9SB 3ID8A 2YJFA 3CERA 4IJAA 5JLFA 4A2AA 4WQ4C 1Z6RA 3IUCA 3M1FA 4YDUC 3WQTA 1SQKA 4CZKA 1LOTB 4L3QA 3QDKA 1K8KB 1X3MA 1KAYA 3D2EB 4YDUA 4CD1A 1HPMA 4BRHA 1JCFA 1ZXOA 3DXKA 3UKUA 1KXPA 3LL3A 3R8EA 4DB3A 3ATVA 4CZLA 5BN8A 2W40A 4H0PA 3SJHA 1BOTO 1GLAG 1RDWX 2QXLA 1RGIA 4FO0A 5BPLA 3CIPA 3IDHA 3FZFA 1T6CA 2E2QA 3I8BA 2E1YA 3A0IX 3ZX3A 3QBWA 3O1WA 5KQ8A 3EKUA 4CZJA 4B1UB 4XH5A 1KAXA 2CH6A 5AQJA 2GEMA 1NGHA 1JCEA 2GELA 2H3GX 2QWMA 1NGCA 5EXWA 5KPRA 3FE1A 3L6QA 4M63C 5AQRA 3SMPA 5LJVA 3R6MA 4M7XA 1H1VA 1ZC6A 3A8YA 4NB4A 3FGUA 5BR9A 4H5WA 3VEWA 2FXUA 1BUPA 3VENA 4BROA 4FOEA 1LCUA 2P9PB 4HWIA 4M7YA 1NMDA 2FF3B 3TPQA 4BRKA 4BG9A 5BRDA 4AM6A 3DWLA 3F9MA 1T44A 4H0OA 4JHDB 4EAHD 3GBTA 1TUYA 2IVNA 3O6WA 4XH1A 5BRFA 2CGJA 2P9UB 5AQTA 3QFUA 3DAWA 3I33A 1TYQB 5AFUA 2D4WA 1BG3A 2CH5A 1P8ZA 1ZBSA 2E20A 3U9DA 1IG8A 3EKSA 2EWSA 4EHTA 4CZIA 3WEEB 3LM9A 4BRIA 5BPMA 5AQKA 4BC3A 3H1VX 3CQXA 1T6DA 4CBXA 4JAXA 2CGKA 2WUSA 3HBTA 4DCHA 3VEVA 5TKYA 3VF4A 1HKCA 2A41A 4BRCA 3CETA 2HF4A 4JD2A 3C7NA 1BWFO 4B1VA 1GLFO 2NZTA 4I6MB 4BGAA 4EHUA 1DKGD 3VGMA 5FPEA 3W3DA 3LDLA 3MDQA 1BDGA 2YI1A 3IMXA 4BRGA 2D0PA 3H46O 3L4IA 3TU5A 2ZGYA 2Q31A 3J8AA 5BRHA 3LM2A 1XUPO 1ATRA 5AZIA 4PKGA 2D1KA 5LY3A 2P9SA 4BRNA 4AM7A 1HX1A 4H5VA 4O5FA 5FPDA 1HKBA 4MO4A 3FFKB 1K8KA 3GOIA 3QBXA 2CGLA 3D2EA 2Q0RA 3VOVA 4WQ4A 3VERA 4BVOA 2Q2RA 2QWPA 1U2VB 2ASOA 2FSKA 3JXUA 1KAZA 1NGJA 2QWNA 2OANA 5AQGA 1QHAA 4WQ5C 1HKGA 3UB5A 4BQZA 1V4TA 4BC4A 3M6GA 3MCPA 2DPNA 3WXIA 3EO3A 3SMSA 4F9OA 2P9IB 5AZJB 3ZETB 2Q36A 2QWQA 3A5NC 4PL8A 3D2FB 2E2PA 4H0XB 4QS8A 3UKRB 2AA4A 1YUWA 5AQOA 4BR7A 1G99A 4H0TB 1WUAA 4BRPA 3QICA 4FWMA 5AQZA 4RTFD 4EIAA 5E84A 4K25A 2VYPA 1JCGA 3QB0A 1D4XA 1ATNA 3VGKA 3VGLA 2QWLA 3KVGA 5ADXH 3AY9A 1HLUA 3ZX0A 4BREA 2Q1NA 1V4SA 2J4RA 2P9PA 3ENOA 3VF6A 3CJAA 5ELZA 2W41A 4LC9B 4H0VB 2KHOA 1IJJA 4C23A 5BREA 2FLOA 3RSEB 4BRLA 4QS7A 1OKJA 3BEXA 2GWKA 3WUHA 1ESVA 3H6EA 4JHDA 3BUZB 4FWQA 2PBDA 2FF6A 2E2NA 4BC5A 3O8MA 2P9LB 2ZWHA 4ISGA 2UYTA 2NRHA 3CJ9A 3W0LA 2P9UA 2YHWA 3A5MC 4BQLA 2E8AA 1TYQA 5LJWA 5AQYA 3ZEUB 2BUPA 2A3ZA 2PAVA 5AR0A 3VEOA 1XQSC 4H5NA 3S41A 2ZGZA 3A5LC 1QQOA 3AAQA 4PKHA 2E88A 3H3NO 4BRMA 4FOIA 1GLLO 5EOYA 4BR5A 1RFQA 3WEEA 1NGIA 4Z94A 2IVPA 3O4WA 1X9JA 3U9ZA 4FWOA 4JN4A 4CD3A 5JMVA 1U6ZA 3CI5A 5EVZA 3ULEB 3LDOA 1ATSA 1C0GA 2GWJA 3MMVA 3H45C 2P9KB 1WOQA 2ITMA 4CJ7A 5KPZA 5AQIA 3U8XA 4I6MA 5EX5A 1TUUA 2V52B 1EQYA 4ISEA 3ATUA 3DXMB 1GLJO 4FPAA 4K43A 2E1ZA 4XEIA 1CZAN 2P9NB 4XH4A 1YAGA 3R9PA 5EY4A 3AAPA 1E4FT 1NBWA 3SLCA 1BA1A 3HTVA 2F9TA 3HZ6A 5KQDA 3HI0A 4H5TA 4CBUA 1Z05A 4PL7A 2V51B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ENHA 5CE3A 2A42A 4ICLA 4FWLA 1RT3A 3AVCA 1JLGA 3ZCMA 4DV3K 2QXFA 2NRZA 2F8TA 5FRNA 1RT5A 4B9TA 4BWMA 4NCBA 3KLFA 1U4BA 4IOXA 1TL3A 1QS4A 4HUGA 3RR7A 1IKVA 1SKSA 1Q9XA 1VSEA 3EYZA 3PY8A 4LF6K 3LPTA 2I7NA 1KLNA 4CZHA 3ID6A 3ASMA 3O08A 4CK2A 1SKRA 4CEOA 5FROA 1NGBA 3AO2A 5AZJA 5AQWA 3ZETA 1O1WA 1IO2A 2HMPA 1T3VA 2EHGA 1VHXA 4RW6A 3D2FA 5SZTA 4YNQA 3L2VA 3R1XA 4X62K 3V6DA 2E4LA 3VF2A 4CJPA 2PYJA 3JS6A 1S6QA 5E41A 4RG8A 4FWPA 4E72A 4LF4K 4CJVA 2VGNA 4JKGB 4YOVA 1MDUB 3A5OC 1SL0A 2HNYA 3QEPA 1WAFA 3O1BA 1JLAA 3CC2N 2WTUA 1Q7YO 3HRGA 3TWHA 1W2BM 4ILJA 2FSNA 4FLXA 3LZJA 4H8KA 4CJEA 3SBGA 1ITGA 4CJ3A 4BACA 3LAKA 4DTXA 1X3NA 3LDNA 5I9EB 4DLEA 5M1PA 1HUXA 1HJOA 4KB1A 2AP1A 5KRTA 1B9DA 1MA9B 1C0FA 4BRQA 4CZMA 3VESA 3TSUA 4W5OA 2YHYA 3LPUA 1DEJA 4YOWA 2D0OA 1MWKA 3OYFA 1J6ZA 3KK1A 5AQMA 4A62A 1FJGK 1B9FA 4CF8A 4K42A 3C94A 4OLAA 1WSGA 5AQFA 1SZ2A 3KLIA 2G8UA 1VSFA 5I42A 1WBBA 4DTJA 2XY6A 1NKEA 2JWKA 5JVGL 4BR9A 3WXKA 4FZYA 4IXCA 2UU9K 1FK9A 3FZMA 3CF5L 5CY4A 1NK0A 4AHVA 1O13A 3E66A 3L8BA 1RILA 3E01A 1K9MO 2BTFA 4NYFA 3QEWA 4N47A 4B9UA 2RF2A 3PX0A 3KZBA 4MLHA 4CJ4A 1ZBIA 4E1MA 4BVPA 4BC2A 2YHXA 3RRHA 2G8WA 1KVAA 1KVBA 4QS9A 5F1XA 2IOCA 4BRAA 1C1CA 3MEEA 4X66K 3O5BA 5BPNA 2O8BA 4DQ8A 3AGRA 4JKHA 4OKEA 4JD2B 4OKJA 3C7NB 3CYGA 4CEBA 4H4MA 5JICA 3D7EO 3M3ZA 3MXJA 3KD1E 3BP8A 1GLCG 2OA8A 2ZF5O 3HVRA 4CERA 3OJUA 2E6MA 5SWMA 5GIPA 3VEZA 4WFBL 5KGWA 5JLFA 2O4IA 4LY7A 1Z6RA 3VQCA 1SQKA 4L3QA 3QDKA 4DTOA 1TKXA 3THYA 4DV5K 4FYDA 4YDUA 1EP4A 4BRHA 3OYCA 1JCFA 1ZXOA 3DXKA 3NH0A 3K58A 2VQFK 1X1PA 1VRTA 3E9PA 4JV5K 4CJ5A 4M3TA 3DLGA 4C8LA 3EE9A 4H0PA 2B5JA 3CM6A 2KLAA 4MFBA 3IDHA 4BEBA 2VGMA 2RPIA 3CPWM 2O8DB 3I8BA 1S1XA 1J53A 2XY5A 4OO1J 3QEXA 4OGCA 4CZJA 4FK4A 2B4JA 4B1UB 4XH5A 3WNHA 2H3GX 4BDYA 1GOAA 4CE9A 5EXWA 4M63C 2BH1A 4CGGA 3SMPA 1L3SA 4KHWA 5LJVA 4DU3A 4E89A 4YOXA 4ELVA 4CJFA 3FGUA 4A57A 4FJ9A 4H5WA 3VEWA 4CIEA 3THWB 4HWIA 3F73A 4FVUA 3TSPA 1JLQA 4HVJA 4PHTX 3CCJN 4AM6A 1BISA 1T44A 4KHQA 2IVNA 1XNQK 2YX6A 1Q81O 1IKYA 2G8VA 3K57A 4WFNL 3U3GA 3QFUA 2XO7A 3DAWA 5AFUA 1BG3A 4FK2A 3AVLA 2CH5A 4Z4CA 1P8ZA 2ETJA 2X78A 1ZBSA 5BR8K 3RMBA 3EEQA 3PIPL 4EHTA 1WSFA 4LD0A 2BGGA 3R3LA 4DQSA 4CZIA 4DTPA 3MXIA 1KFSA 4BC3A 3THXA 3H1VX 1T6DA 2WUSA 2JLEA 4J2AA 3T7ZA 3VF4A 3NVMA 5C24A 1HYVA 1L5UA 1N6QA 1BWFO 3KTQA 4I6MB 1ASVA 2O4GA 3MEDA 4EZ9A 1VQ8N 4B9VA 1TK5A 1NKBA 3PSIA 2OZSA 4IOCL 3H46O 4CHPA 4JI4K 4DSIA 1E3MA 2Q31A 2NRXA 3J8AA 3PX6A 5BRHA 4KH6A 3AVFA 1ATRA 3ZT4A 4A5AA 1YHQN 3OYBA 4AM7A 4AH9A 4CJUA 3E9OA 5C25A 4BE0A 1HQEA 4E7KA 1K8KA 3GOIA 3QBXA 2Q0RA 2RN2A 4O5BA 2ASOA 4F4KA 3AVIA 2OANA 4RW4A 4CEZA 2HVIA 4NLCA 3SJJA 4DTUA 3MCPA 4CEDA 3NHGA 3SMSA 3K5MA 3RTVA 3CMEN 5AZJB 3RWUA 3ZETB 2NRTA 3UIQA 2Q36A 1ZYQA 4I9LA 2QWQA 3A5NC 3D2FB 2OYQA 3E1YA 1YUWA 1S1UA 4BRPA 4H0TB 3BZKA 4C1NI 3V4IA 3PSFA 4JI1K 3EE8A 4FJJA 2IS3A 4EIAA 3L2UA 1Q86O 4GW6A 4B3TK 4CHQA 1JCGA 4IFYA 1UA0A 3O9TA 3QB0A 3VGLA 3KVGA 5JS2A 2Q1NA 4CJKA 4NXMK 3AVJA 1BL3A 3VQ5A 3VF6A 1HQUA 5ELZA 4B08A 1LAVA 4H0VB 1A5WA 4E7LA 1W97L 1S1WA 2EX3A 1S9EA 2Z1GA 3OYMA 1VQ7N 3LALA 5C42A 3BEXA 2GWKA 1QSLA 3BUZB 4BC5A 2FF6A 2ZWHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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