3DXMB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck0993548
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of two classes of small molecule inhibitors of Arp2/3 complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 51
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dxmB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dxmB02
1IG8A 2ASPA 2I7NA 3LDOA 4BRKA 2QWLA 4BRDA 3ZX2A 3MN9A 4PL7A 3QFPA 4B1VA 3QDKA 4MO4A 4FL9A 2D4WA 4WQ4C 3U8XA 2ZGZA 4A61A 3M3ZA 3DXKA 4NO7A 5ADXA 4HWIA 3R9PA 5I9EB 3A8YA 3WXLA 4K42A 4IO8A 3O1WA 3IFRA 1HPMA 2FF3B 3O5BA 2CH6A 2P9NA 4IWVA 5BN8A 3DAWA 3VGLA 4M7XA 3OHRA 4QS7A 4A2BA 3BP8A 1E4FT 1WOQA 3H6EA 5E26A 2CGKA 3HTVA 4BC4A 5F0XA 3UKUA 1ZBSA 3L0QA 2E1ZA 4B9QA 4BR0A 5F1XA 4H0XB 3MMVA 4WYBA 4EAHD 2YHWA 5AR0A 4F9OA 3ZETB 3FGUA 5AQPA 3S41A 1E4GT 4WQ5C 4O5FA 3CQYA 5LJVA 4FOEA 2E2OA 3L4IA 2AP1A 3VESA 4BR7A 2YI1A 1TUUA 2VCPA 3D2EB 5AQKA 1NGDA 4C23A 5AZIA 5FPEA 1BA1A 4AM6A 5BRDA 2VYPA 1NGJA 3CIPA 3A5LC 1GLFO 2E20A 5AQOA 2E8AA 4JD2A 2Q1NA 5JMVA 1U2VA 4BQZA 2W40A 1TYQA 3HSCA 3I8BA 2E2NA 1KAXA 2PBDA 1KXPA 3DXMB 3HM8A 5KQ8A 1ATNA 4WQ4A 1MDUB 3O8MA 4B1UB 3D2FA 3CETA 1ATSA 3CERA 4H0TB 4BRFA 4E1JA 1DGKN 2D0PA 5KQDA 1X3NA 2QWNA 4CBXA 3RSEB 3KZBA 3KVGA 3FZKA 2ASOA 3CQXA 2Q31A 2A5XA 1ZXOA 2D1KA 2V51B 3GBTA 2Q0RA 3FFKB 1YXQA 2P9KB 3WUHA 3VF4A 3MCPA 4BG9A 3ULEB 3AAPA 2P9UB 3C7NB 1GLLO 2P9PB 3QBWA 1MA9B 3MDQA 5JLHA 4BRQA 3ZEUB 4WQ5A 1NM1A 4GY2B 3EN9A 1V4SA 1GLDG 2DPNA 5AQLA 4DCHA 2P9IB 2PAVA 2YJEA 3VGKA 4JAXA 4I6MA 3VF2A 3UKRA 4MO5A 3F9MA 1Z05A 5AQVA 5KPRA 3J8AA 3WXIA 3U9ZA 5AQWA 4BC3A 2YHYA 3SK3A 3UE5A 3GG4A 4BVPA 4BG8A 2E88A 4XH1A 4PKHA 1BU6O 4BGAA 4K41A 1GLEG 2IVNA 1ESVA 2Q2RA 2HMPA 3VEWA 1DEJA 1LCUA 4FSVA 3LDQA 4BRCA 3LL3A 3VPZA 2KHOA 4BRPA 4FWLA 3CI5A 3GOIA 2EWSA 4DB3A 5AFUA 2WUSA 5AQYA 1NGBA 4RTFD 5FPDA 4B1YB 5AQZA 5AZJB 4IJNA 1HX1A 1R59O 3M1FA 5E84A 4BC5A 4BRIA 3CJ9A 2QM1A 4FWMA 3VEYA 4CZEA 4BR4A 2VWBA 3FZMA 3VOVA 5CE3A 4A62A 2FLOA 2CGJA 1SAZA 2A3ZA 2GUPA 1BA0A 3BEXA 3BUZB 3A5NC 3DXKB 4FPAA 5LY3A 2IIRA 4CZFA 3QB0A 1SZ2A 2P9NB 2P9LA 3WXJA 3ATUA 4CZGA 4CZIA 2FSJA 2CGLA 3EZWA 1OKJA 2YHXA 4H5WA 1NGIA 4CZJA 4XEIA 3UKUB 5BRHA 4EHTA 5AQXA 5EXWA 3SMPA 3C0BA 5EY4A 1JCFA 3WQUA 5BREA 2YJFA 3MN7A 2AA4A 3MN5A 3VETA 1S3XA 3FR0A 4CBUA 3BF3A 1K8KB 2E2PA 4MLEA 3HI0A 2GWJA 4EFHA 4BRLA 1HKGA 1NGFA 4BR2A 2V52B 4BR5A 1NLVA 2V7ZA 3G25A 5AZIB 4FO0A 3SMSA 4M63C 4IJAA 2ZGYA 4PKGA 3SJHA 4DQ8A 4JD2B 1S22A 4H5NA 1U2VB 3FZHA 1TYQB 3FZLA 5AQFA 4H0YB 1NGCA 1YVNA 4RWTA 1SQKA 1GLAG 4BRNA 3QFUA 1V4TA 1HLUA 3ENOA 1T6DA 2D0OA 5LJWA 4BRAA 1IJJA 1BG3A 3D2FB 5AQQA 3AY9A 3EKSA 3VERA 1X9JA 3O08A 1HUXA 3FZFA 4JNEA 2J4RA 1NBWA 1NGEA 5EOYA 3QBXA 2Q97A 3CHWA 3VEZA 2H3GX 5AQIA 5BN9A 3GL1A 3H1QA 3R6MA 4JHDA 4NB4A 2YCHA 2QWQA 4CD1A 1XUPO 3H3NO 4QS8A 1BOTO 1QZ5A 3DWLA 1HKCA 4K25A 2IVPA 2P9SA 3CJCA 2QXLA 3CJ7A 4XH4A 4YDUC 2NZTA 1NWKA 5EVZA 3WEEA 3LDNA 4ISGA 5TKYA 3VEOA 1U6ZA 1ATRA 1NGAA 3I33A 5BRFA 4FWNA 3ZX3A 4H5TA 3VENA 3ZX0A 5BPLA 4FOIA 4IXCA 2ZF5O 4B1XB 5BPNA 3WQTA 4M7YA 3O4WA 5AQNA 3QICA 1XC3A 2ZWHA 3HBTA 1J6ZA 4I6MB 3LDPA 4DHYA 2QWRA 3UKRB 3D7EO 1X3MA 1G99A 3KHYA 1KAYA 5F2RA 4CZHA 1D4XA 3ENHA 3VF6A 3IDHA 1RGIA 3B8AX 3H46O 5ADXH 3U9DA 1EQYA 4CZMA 3H3OB 1Z6RA 1TUYA 3O1BA 2F9TA 3MK6A 1HJOA 4PKIA 3JXUA 3SLCA 4Z94A 4FWQA 3MN6A 4L3QA 3AARA 3WT0A 2A40A 2Q0UA 2E1YA 3BF1A 1BUPA 1BO5O 1KAZA 3M6GA 4MLHA 4BR9A 2QWPA 4KBOA 1GLJO 2GELA 1ZC6A 2GEMA 3L6QA 4J8FA 4B1ZA 4BRGA 3EL2A 1QQNA 2ITMA 1XQSC 1P8ZA 4JN4A 5FPMA 4EHUA 2HOEA 5B8HA 1GLBG 4ISEA 1BWFO 4B1WB 3ZETA 3TU5A 4H5VA 2FSKA 4H0PA 4H5RA 5KPZA 4YDUA 2BUPA 2GWKA 5AQGA 5AQHA 2ASMA 3LM2A 1NGGA 4H03B 4CBWA 2UYTA 4H0VB 4FWSA 3D2EA 4BQLA 2NLXA 3ATVA 2FXUA 5AQSA 2P9LB 4FWPA 3FE1A 4BRMA 3LDLA 4A2AA 2QWOA 3DJCA 1YUWA 3H1VX 1QHAA 1K8KA 3O80A 3CJ1A 4PL8A 2E2QA 1WUAA 4QS9A 3IMXA 1MWKA 3VEXA 3DXMA 1QZ6A 1Q18A 3O6WA 2I7PA 1NMDA 4FPBA 3TPQA 2HF3A 4RCHA 5AQTA 3A5OC 5BR9A 3ID8A 5KPTA 3RSEA 1C0FA 4BVOA 2NRHA 5JLFA 5EX5A 5BPMA 1LOTB 3CJAA 1MWMA 2QW9A 2IVOA 1HKBA 2A41A 4FWOA 4CZKA 3GDQA 4XH5A 4EIAA 1DKGD 2FSNA 2P9KA 4CD3A 2BTFA 3A5MC 3ULEA 2P9UA 5AQUA 3C7NA 5AQJA 4BROA 2A6AA 2P9PA 5AQRA 4CJ7A 3QMLA 4BC2A 1JCGA 4FWKA 4BRHA 5AQMA 3ZEUA 3H45C 4HTLA 2FF6A 1H1VA 2HF4A 1C0GA 1GLCG 2P9IA 1T6CA 1JCEA 3AAQA 2CH5A 1QQMA 2Q36A 2GTDA 1RDWX 4CZLA 4FWRA 3VGMA 2QWMA 3EO3A 3CJBA 4JHDB 4BREA 2V7YA 3GE1A 4CI6A 1RFQA 4K43A 5AZJA 3JS6A 3R8EA 4Y0WA 1NGHA 2OANA 1BDGA 2P9SB 5JICA 4LC9B 4IZ9A 3UB5A 4BGBA 2W41A 3WEEB 3W0LA 4GNIA 2F9WA 3VEVA 5FPNA 4H0OA 4O8KA 1YAGA 3EKUA 4AM7A 1QQOA 3WXKA 3W3DA 5AFUH 3FLCO 3IUCA 1CZAN 4ISFA 3U4LA 3HZ6A 3LM9A 5ELZA 2A42A 1T44A 1Y64A 3P4IA 3A0IX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IG0A 1VQKN 1KLNA 3LDOA 3NGYA 1OH5A 3CD6N 1XC9A 3MN9A 3THXA 4PL7A 3CFPA 4FM2A 3QFPA 4CIGA 3AA3A 3U8XA 2F8SA 2HVHA 4GW6A 3G10A 4HWIA 4K42A 3RTVA 1HPMA 3OYCA 2CH6A 3Q7CA 4DV3K 4M7XA 5JENA 3OHRA 3I55N 4AHRA 1WAFA 3BP8A 4ELTA 3MECA 3HTVA 2IS3A 1N6QA 1TGOA 1ZBSA 2O8DB 4E72A 4LH5A 4H0XB 3AA5X 4WYBA 3ZETB 3FGUA 2PYLA 3LAMA 1HNIA 4PHTX 1A5VA 4DV7K 3OS1A 4ZHRA 3L4IA 2AP1A 4BR7A 2NRWA 2VCPA 2ZQBA 4CF8A 5AQKA 1L3TA 2PZSA 4AM6A 3HT3A 1VQMN 3OY9A 1QVGM 5C25A 4JKDA 5JMVA 1U2VA 3HL8A 1TYQA 2X78A 3QEVA 3R3LA 1EWRA 3V4IA 1FXXA 2NRXA 3HM8A 4PA1A 3ALYA 3O8MA 1HMVA 1WSGA 1RT3A 3THWB 2E4LA 5LMNK 4GMJB 4C1NK 1LWCA 2Z1HA 3RSEB 1RT5A 2Q31A 4DFMA 1TL3A 3VQPA 3AVCA 3G0ZA 2P9KB 3ZSYA 4CGGA 1RBSA 2BANA 2VGNA 1CZBA 4MDAA 1GLLO 2P9PB 3LZIA 2ZJPL 3SUNA 2WOMA 3RRHA 1RT4A 5SWMA 5M1FA 5JLHA 3OYIA 4HCCA 3KLFA 1N32K 1NK8A 3PY8A 1F21A 3ZEUB 1NJZA 1NM1A 3OYFA 1U45A 4C8OA 2DPNA 1LV5A 3KJVA 2O8BB 3KLIA 1OH6A 4Z4FA 4YFUA 3CFOA 3VF2A 1HPZA 3F9MA 4FJXA 3PX6A 4CJKA 4B3OA 3WXIA 1R0AA 4M3RA 2YHAA 2EHGA 5AQWA 4A5BA 3QEWA 2E88A 4CESA 4XH1A 1BU6O 3VA3A 2OPSA 3P38A 1NK6A 4DKWA 3N4QA 1D9DA 2IVNA 1U48A 5LL6Z 3I56N 3SUOA 2F8TA 3NBPA 4B08A 1X9MA 1LCUA 4TSXA 1S1VA 4CVNE 3JSMA 4QCLA 1D8YA 5HRRA 2JGUA 5FLXO 3VTHA 4E1MA 3C6UA 2FBTA 4BDYA 1VHXA 1W0HA 4FWLA 3GOIA 5AFUA 3PSFA 3O9QA 3AGKA 3DYAA 3DRPA 3PV8A 4CJPA 4LF4K 4DTNA 5E84A 4DTXA 3VEYA 1C1BA 3L3VA 4CEEA 2VWBA 5CHIA 2UXDK 5CR4A 5CE3A 4NCAA 1W7AA 2A3ZA 1BA0A 4JKBA 4BECA 2FBYA 3DXKB 1YI2N 1NOZA 4LF9K 5I3UA 3OYKA 3ATUA 4DR3K 3WXMB 4CGDA 4Y1DA 2O8EB 1KLMA 2GUIA 2CGLA 1QS4A 3VQ6A 4FK0A 4XEIA 2G8IA 3CPWM 3AVLA 2IC3A 5AQXA 4DUYK 1ZYQA 3G6EN 3C0BA 5EY4A 5BREA 2O8FB 2VQFK 3MN7A 2AA4A 2FBVA 5CY4A 4YHHK 1T8EA 1S3XA 3FR0A 1K8KB 5C42A 2GWJA 3T7ZA 4BRLA 1S1UA 4CHNA 1UWBA 4BR2A 1OVQA 4FO0A 4M63C 4NXMK 4DLEA 1U49A 4PKGA 3ASMA 2AJQA 3TTCA 1QQCA 3EE8A 4J2EA 3DOKA 3FZLA 4M3ZA 1SQKA 1V4TA 4JKGA 1JLFA 1RCHA 3EZ5A 3DMJA 1T6DA 3AVKA 3TAQA 1NKBA 4LF5K 5HRPA 3U6FA 4M3XA 3O3GA 4NCBA 5AQQA 1EXQA 3O08A 3F73A 3S3MA 4JNEA 1BHLA 3CPEA 2IGIA 3QBXA 3VEZA 3OYEA 5C10A 2QXFA 1RT7A 3L2RA 4M3YA 4HUEA 4GKKK 1IKYA 2YCHA 1XUPO 1UA1A 3WNEA 2G8FA 1LW0A 4K25A 5C12A 1VQPN 2NZTA 3RWUA 1CXQA 2DFFA 1BQNA 3AVAA 1ATRA 3I33A 3OYDA 3ZX3A 2UXBK 4JEPA 3ZX0A 5BPLA 4DTUA 4FOIA 4IXCA 2XY5A 1BIZA 3O4WA 4B3RK 4LSLA 3VQBA 3HVTA 3LP1A 2ZWHA 4AQYK 2JLEA 3MXIA 3UKRB 3VQ8A 1HJRA 2W42A 3ENHA 3CYGA 3HPGA 4IG3A 3SBTA 3LP3A 3H3OB 5KGWA 3O1BA 4Z4IA 3SLCA 3HPHA 4DR1K 3LPTA 3M8RA 4DS4A 3WT0A 1GOBA 1RBUA 2Q0UA 1BUPA 2QWPA 4AH9A 1GLJO 1ZC6A 4J8FA 2O8DA 2Z1IA 1XQSC 4JN4A 5FPMA 4EHUA 2HOEA 1GLBG 4B1WB 3ZETA 1S72N 1S1WA 1L3SA 4WCEL 4KHPK 2GWKA 5AQGA 5AQHA 4C8NA 4C1NI 2UYTA 1ITGA 2P9LB 3AV9A 1OH7A 2YHBA 3KK3A 3DJCA 1WAJA 1YUWA 3H1VX 4FLVA 3SUPA 1QHAA 2E2QA 4CJQA 2DFEA 5D3GA 1WUAA 2XRIA 4DQQA 1OH8A 3VEXA 1SUQA 4JS5A 3JYTA 3O6WA 3CC7N 2I7PA 4DV2K 3TPQA 3L8BA 1L5UA 4RCHA 2KQ2A 5DM7L 3THWA 2UUBK 3OYNA 3IKMA 3T19A 4OVLA 5KPTA 3J80O 3NAEA 5J2PA 4FJIA 1VSFA 2OTJN 3RSEA 1C0FA 4BVOA 2NRHA 4FLYA 3HO1A 3O4QA 4PUOA 3SZ2A 1HKBA 1SKWA 3GDQA 4JRPA 3RR8A 5JS2A 2P9KA 2DTUA 3LZJA 1XNQK 2A6AA 2P9PA 4OLBA 4YOWA 4K8XA 4CJ7A 3AVHA 4YORA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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