3DXMB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck0993548
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Characterization of two classes of small molecule inhibitors of Arp2/3 complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
total genus 51
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dxmB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dxmB02
5BRDA 3EO3A 2ZGYA 3HM8A 4L3QA 3WEEB 2V7YA 4NB4A 3U4LA 3M6GA 4HWIA 1C0FA 3O8MA 4H5NA 3U8XA 4BRGA 2CGLA 4H03B 5AQFA 3LDQA 1MA9B 4JN4A 1Z6RA 4FWNA 3ZETA 5BRFA 2E1ZA 3TU5A 4BRAA 4H0OA 1NM1A 4XH1A 1HUXA 3VEOA 2BTFA 4EHTA 1BA0A 4BC2A 4RWTA 3UE5A 4DB3A 5LJVA 1NGGA 3C7NA 1BOTO 2A5XA 3QB0A 3A5NC 5AQSA 3FE1A 1Z05A 5AQUA 1LCUA 3O80A 4B1YB 4B1VA 3QFPA 5BREA 3A5OC 3BF1A 1E4FT 3QMLA 5AQYA 3ZEUB 3WXIA 4QS7A 4MO5A 3LL3A 3EL2A 3VEYA 1NLVA 4CZLA 4H0PA 2Q31A 3ZX0A 4MLHA 2Q0RA 4Y0WA 3CQXA 3VENA 5BN8A 1ZC6A 3MK6A 5ELZA 3D2EB 5JICA 2FLOA 4IJNA 4BROA 3CIPA 4ISEA 5FPMA 2GWJA 2P9LA 1BUPA 1D4XA 1BG3A 3ZX2A 3VF4A 3WXKA 3DAWA 1XQSC 2V52B 4K42A 3FR0A 4FWPA 5JLFA 1GLJO 3EKSA 3D7EO 4XEIA 3CHWA 4PL7A 4MO4A 1GLCG 4WQ5A 3EN9A 3MDQA 4PL8A 3H6EA 2FF3B 3FGUA 4CD3A 1OKJA 5FPNA 3UKUA 3VEZA 4ISGA 3QICA 1SZ2A 3L4IA 1GLEG 3QDKA 3SMPA 1NBWA 3A5LC 2FSNA 4B1WB 4WQ5C 1TYQA 3WUHA 4AM7A 1BA1A 2GUPA 2P9IA 3VGMA 4BRIA 2FSKA 3F9MA 3GOIA 3MMVA 4EAHD 4A2BA 4CZKA 3D2EA 3A5MC 1RDWX 4CZHA 5TKYA 1NGDA 3VPZA 4I6MA 1U2VA 5B8HA 4WQ4A 1HLUA 3KHYA 2IVOA 5AQKA 2QWQA 3FZHA 3H1QA 4JD2A 5AQXA 2VWBA 1IJJA 3ZETB 1IG8A 2KHOA 1XC3A 3DWLA 1HKGA 4XH5A 5CE3A 1BDGA 4CD1A 4BRNA 2FF6A 2YHYA 3UB5A 3B8AX 1YVNA 4BRHA 4WQ4C 1HKCA 3VF2A 4CZGA 5AQVA 3O5BA 3VGLA 1YAGA 4CBXA 3ZX3A 2P9KA 3LDPA 2D4WA 3LM2A 5AZIA 3O1BA 4CZMA 3WXLA 2FXUA 1NGEA 5AQOA 1GLAG 4BVOA 1QQMA 3CJAA 5KPTA 2FSJA 3ATVA 3H1VX 3DXMA 2IVNA 1YXQA 2CH5A 2P9LB 3WT0A 4FO0A 4FSVA 2E2PA 5ADXH 2Q36A 3GG4A 3MN9A 1ATSA 1NGIA 4PKGA 3ID8A 1P8ZA 3MCPA 2IVPA 3CJ7A 5AQQA 2P9SA 1S22A 3CJCA 4M7XA 4XH4A 2CGJA 3UKUB 1TUYA 3CJ1A 4YDUA 4B1ZA 1NWKA 1K8KA 4BR2A 2I7PA 3KZBA 2QWLA 2CGKA 1S3XA 3AAPA 1QQNA 1TYQB 2YCHA 2NZTA 1BO5O 4H0TB 5E26A 2P9IB 3H46O 4IO8A 3UKRA 4BR4A 4YDUC 4JNEA 5AQHA 1KAZA 3GL1A 4FWKA 4BRFA 3HTVA 2YJFA 1HKBA 4I6MB 1RFQA 1DKGD 5AZJA 1U2VB 3L6QA 5AQGA 4RTFD 4BVPA 4GNIA 2AP1A 2A42A 4FL9A 4JD2B 4JHDA 2QWOA 4H0YB 5FPEA 1JCGA 4BR5A 3SK3A 3QFUA 3TPQA 1JCEA 2V51B 3M3ZA 4BGBA 1TUUA 3WQTA 5AQIA 3IFRA 4O8KA 1H1VA 1X9JA 2QWRA 2YHXA 3LDNA 3VGKA 2VYPA 1U6ZA 3JS6A 3VESA 2E2NA 4H0XB 3ENOA 3VEVA 4QS8A 2NLXA 3ENHA 5AFUH 1DGKN 2E88A 2BUPA 2P9KB 3A8YA 3CJ9A 1V4SA 1QZ5A 3IMXA 3J8AA 5F0XA 5AQWA 5AZIB 2A41A 3A0IX 5ADXA 4BRPA 5KPRA 4DHYA 3FLCO 3FZMA 2QWNA 5F2RA 4CZJA 1SQKA 1QZ6A 4M63C 3GDQA 3DJCA 2Q97A 3VETA 3C0BA 5AR0A 4K41A 3DXMB 1QHAA 4PKHA 1CZAN 4BRDA 1Q18A 3MN6A 4CJ7A 4BG8A 4FPBA 5BPNA 3H3NO 2P9PA 2QWPA 3QBXA 2F9TA 2QXLA 3RSEA 3U9DA 4KBOA 4BR7A 4WYBA 1V4TA 3L0QA 4K25A 1MWMA 5EXWA 3AAQA 1NGAA 2DPNA 4BGAA 2AA4A 4BQZA 3MN5A 4BREA 3LDLA 2P9SB 4EIAA 4BRMA 4LC9B 5AQTA 3HI0A 1E4GT 4O5FA 3KVGA 1K8KB 2QM1A 2YJEA 4DCHA 1HPMA 1NGBA 3M1FA 3BF3A 4FWQA 5EOYA 3G25A 5EX5A 2PAVA 3HSCA 3O1WA 3VEWA 3R6MA 4BRQA 4RCHA 2YI1A 1GLBG 1MDUB 3UKRB 2GWKA 5FPDA 4BC3A 4A61A 2ASPA 1ESVA 5EVZA 3H45C 3VOVA 4M7YA 5AZJB 4B1XB 1QQOA 2D0OA 4HTLA 1T44A 5AFUA 4JHDB 4IWVA 2HOEA 1JCFA 4CZIA 5BPLA 5KPZA 3I8BA 2PBDA 2P9UB 2E2OA 3I33A 2ZWHA 3VERA 3FZKA 4B1UB 4F9OA 2CH6A 2NRHA 3CQYA 1X3MA 1NGHA 3W3DA 1C0GA 3FZFA 3CERA 3HBTA 4J8FA 1NGFA 2UYTA 3D2FB 3MN7A 1XUPO 2E2QA 1WOQA 3SJHA 3VEXA 3FFKB 4B9QA 2VCPA 2A40A 4IXCA 3EZWA 4BRKA 5KQ8A 4NO7A 5AQNA 1ATRA 1MWKA 3R8EA 3ULEA 2E20A 5E84A 4JAXA 1BU6O 4MLEA 2ASOA 5KQDA 2ZF5O 5I9EB 2P9PB 1HX1A 3RSEB 2P9NA 3SMSA 3CETA 4CBWA 1BWFO 2EWSA 2P9UA 3FZLA 2ITMA 3DXKA 3LDOA 4FWSA 4DQ8A 4EHUA 4FOEA 1RGIA 3WEEA 2Q0UA 2H3GX 2ASMA 3O6WA 1KAXA 1WUAA 5BRHA 1KAYA 3EKUA 1HJOA 3BP8A 3SLCA 3BEXA 1KXPA 4BC5A 2A3ZA 3D2FA 4FWRA 1NGCA 4H5TA 3O08A 5AQLA 2F9WA 3HZ6A 4BQLA 1NGJA 1ATNA 4CI6A 3AY9A 1Y64A 3VF6A 4BR9A 3H3OB 5EY4A 1T6CA 5AQRA 4H0VB 4E1JA 3BUZB 5JLHA 2QW9A 5AQJA 2I7NA 2A6AA 3QBWA 2GTDA 4FWLA 2Q1NA 3IDHA 2IIRA 4C23A 5AQZA 3GE1A 3ZEUA 1EQYA 1NMDA 2HF3A 3IUCA 2ZGZA 2GEMA 2QWMA 2J4RA 4CZEA 5F1XA 4H5WA 4H5RA 4BG9A 4CBUA 3R9PA 3W0LA 3LM9A 4K43A 5BPMA 2GELA 3AARA 2HMPA 2D1KA 2WUSA 1R59O 3OHRA 4IZ9A 2HF4A 5JMVA 3CI5A 2D0PA 1J6ZA 1LOTB 1GLDG 1G99A 3ATUA 3WXJA 4BR0A 4BRLA 3GBTA 1T6DA 1SAZA 4BRCA 2YHWA 4A2AA 4PKIA 4FPAA 2OANA 5BN9A 4H5VA 4IJAA 1ZBSA 1DEJA 3O4WA 2V7ZA 4ISFA 4CZFA 5BR9A 4FOIA 4QS9A 1GLLO 3WQUA 1X3NA 2W41A 4EFHA 4Z94A 5LJWA 3P4IA 3C7NB 3JXUA 2W40A 2Q2RA 1YUWA 3ULEB 3S41A 4GY2B 4A62A 4FWOA 1GLFO 5AQMA 2E1YA 2P9NB 5AQPA 3U9ZA 4BC4A 4FWMA 2E8AA 5LY3A 4AM6A 3DXKB 1ZXOA 3CJBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BRDA 3VQCA 4I9LA 2RN2A 4LF4K 1IKVA 3TTFA 1C0FA 3ENBA 3I0RA 5AQFA 1ASVA 4KO0A 1U04A 4CJWA 3TSQA 3CC7N 4BRAA 2YX6A 2BDPA 4KTZA 3HPOA 5KTQA 4JKGB 3MXJA 1EWQA 3T69A 1BA0A 3UE5A 4DB3A 1VQ4N 5JS1A 5GIOA 4ELTA 2D5RA 5AQSA 5AQUA 1LCUA 4DQRA 5CY4A 4B1VA 4GVMA 4LSLA 3TWHA 1ZBHA 4NLCA 3OYNA 3ZEUB 3OYLA 4FXDA 3O3FA 4CFAA 2I5JA 4H0PA 3ZX0A 3CQXA 3ZSQA 4LD0A 5JICA 2AJQA 4OPJA 3I8DA 5DK5A 3NF8A 5DMRA 4LF6K 1GOCA 1NU0A 2P9LA 5C12A 1JLCA 1D4XA 1BG3A 3CPWM 1RT2A 3DOLA 4B08A 5JLFA 4PL7A 4HUFA 3EN9A 4PL8A 2FF3B 1S1VA 2IAJA 1B9DA 5C25A 3NGIA 4PWDA 2HHTA 1JLEA 3C6HA 1NBWA 3SMPA 3HVTA 3AO1A 2D0CA 4B9LA 1BA1A 2P9IA 3THVA 3F9MA 3GOIA 1EO1A 4B3OA 4JI2K 4CZKA 4CZHA 3RMDA 3VPZA 2HNDA 4Z4IA 4OGEA 4JI6K 3ZYYX 1CXQA 2IVOA 2WC9A 3VQBA 1LAVA 4CEFA 2QWQA 5AQXA 1ZYQA 1VSIA 3SAHA 1VQPN 1IJJA 3VQ9A 4NCGA 3ZETB 1RT5A 5C2DA 4B3TK 5C15A 4Y1CA 1HKGA 3NBPA 4BRNA 3NCIA 3WXMB 4CEEA 2IS3A 4JI5K 2WFBA 2X78A 4OLAA 3VTHA 2DFEA 3KLGA 1RTHA 3DRSA 4LFAK 3E1YA 2P9KA 3LDPA 5HRRA 1N8RO 4A5AA 2D4WA 1YJWN 1NKBA 1XHZA 1NK7A 3HPHA 4AHTA 5J1EA 1NGEA 1SKSA 1Q7YO 1JJ2M 1J53A 1IBLK 1BI4B 1Q82O 1KFDA 3J7AP 3K59A 3JSMA 3DXMA 1K8AO 2IVNA 3NE6A 3SZ2A 4BDYA 1YXQA 2NRTA 1T05A 3DLGA 1FW6A 3F2KA 4Z4FA 1S6QA 4FVMA 3MN9A 4IFVA 5HOOA 1I94K 2OTLN 3VQ5A 4CGHA 1S22A 4FJMA 2G8KA 1IBMK 4JI1K 1TUYA 3CJ1A 4KHNA 4GVEA 4FYDA 5MLCQ 3BDPA 3AVMA 1K8KA 2YV0X 1BGXT 4BR2A 4C8LA 3SYZA 3V9WA 3MXMA 2QEXN 1QQNA 2YCHA 5E26A 1S1WA 3H46O 3WNFA 1VSKA 4IO8A 4BR4A 3OYEA 1NOYA 4X65K 4IEEA 4F8RA 4YDUC 3SCXA 5AQHA 1KAZA 2GBZA 3LP1A 4I6MB 1RILA 4NYNA 2JGUA 1U4BA 1W0HA 4RTFD 4H0YB 5FPEA 4DTSA 1JXEA 2HHUA 1GOBA 4BGBA 4J2AA 2VQFK 3WQTA 5AQIA 1JLAA 4O8KA 2W6LA 3ZSYA 3QESA 3V1QA 1U6ZA 3KLEA 1XI1A 3OS2A 3QINA 2E88A 1TKTA 3A8YA 3ZSWA 3T1AA 4F3OA 4OPHA 5F0XA 2EX3A 5AZIB 5ADXA 4RW7A 5KPRA 3QEXA 5HRPA 3KKSA 4DHYA 1IKWA 4FJ8A 1SQKA 1BHLA 3NGZA 1D9DA 2FBYA 3C0BA 4YORA 4X62K 3CMEN 5BPNA 4BG8A 4FPBA 5GINA 1A5WA 3VQ7A 2ZJRL 4KI4A 2P9PA 3U9DA 4KBOA 3U6FA 4I2QA 4WYBA 4KKOA 4K25A 3ZT2A 4OGCA 3T1YK 3UIQA 1VSLA 1HNZK 5JENA 2F4VK 3R1XA 3NF6A 2G8VA 5AQTA 2UUCK 1U48A 3KVGA 3OVNA 1RDUA 4B8CA 1NGBA 4E89A 4FWQA 3G25A 2PAVA 3O1WA 4ZHRA 2YKMA 4RCHA 2YI1A 4KH6A 4HHTA 1GLBG 3EY1A 5FPDA 4EP4A 2XO7A 4BC3A 4A61A 1XC9A 3H45C 2XY6A 4CHOA 1K9MO 3VOVA 1Y97A 4LH4A 4W5TA 1UAXA 4KHWA 3L2UA 3L8BA 2E5LK 4JHDB 4BDPA 4KHPK 2PBDA 1TGOA 3I33A 4WE1A 3EEQA 3HP6A 2O8BA 3ALYA 2FBVA 4CW7B 2UUAK 1NGHA 3W3DA 3F73A 4ILGB 3CERA 1J9AA 5M1NA 1C0TA 5SZTA 4F2RA 3MN7A 1K6YA 2KZMA 1WOQA 3HOTA 2HVIA 3LZJA 1NK8A 3VQPA 4BRKA 2VQEK 5AQNA 1MWKA 3B6OA 4JAXA 2OZMA 5KQDA 2ASOA 4CJLA 5CZ1A 4A5BA 5I9EB 1L3UA 4DTRA 1XNQK 4JYAK 3RVCA 4K8XA 3T19A 3OYFA 2OPPA 4O44A 3VQ6A 3ZLJA 5M1FA 1RGIA 2ASMA 1YF5L 4TSXA 1HJOA 2G8FA 2UU9K 1XMOK 1KXPA 4BC5A 3PSFA 4E7KA 4LH5A 1E3MA 1NGCA 3MEDA 3AGRA 3J81O 3T1HK 1OH7A 2F9WA 3HZ6A 4FJ7A 1NGJA 4CI6A 3CF5L 4BR9A 3QEPA 3H3OB 1WB9A 2O8EB 4B8AB 3O9SA 2QW9A 1U49A 2JLEA 2G8HA 3IDHA 3ID6A 2ZQBA 2A1RA 1KCFA 5AQZA 2HHWA 3NH2A 1EQYA 1NMDA 3IUCA 2ZGZA 2GEMA 2QWMA 3O9TA 3OY9A 4H5WA 3R9PA 5BPMA 4K43A 4CF2A 2GELA 1NJWA 1N5YA 5C2FA 3PV8A 4KB0A 3OHRA 4IZ9A 4FLUA 3P31A 4OKEA 3MCAB 1LOTB 1GLDG 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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