3DXMB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck0993548
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of two classes of small molecule inhibitors of Arp2/3 complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-related protein 3
molecule tags Structural protein
total genus 51
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dxmB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dxmB02
4FO0A 1QQMA 4BR9A 3H45C 4BRIA 3KVGA 2QWNA 4YDUC 2GTDA 4DCHA 4JHDA 4O8KA 2QW9A 4BRMA 3DXKA 2GWJA 2VYPA 3C0BA 3GE1A 3KZBA 3UKUA 2D0OA 3ATVA 5FPMA 1YVNA 3I8BA 5AQVA 3VPZA 3GBTA 4WQ5A 3VEZA 3CJ1A 4AM7A 3O5BA 3LM9A 5EVZA 5CE3A 1K8KA 2AP1A 2IVOA 2FF3B 5AQSA 1TUUA 1KAZA 4BC2A 1OKJA 4RCHA 2I7PA 3ZX0A 3CQYA 2IIRA 2QM1A 2E2QA 3DJCA 4HTLA 1MWMA 4BVPA 3O80A 1HKCA 2QWOA 2QWRA 1NGJA 3KHYA 5AZIA 3U9ZA 5AQQA 1WUAA 5BPMA 3EKUA 4CD3A 1Q18A 4FOEA 3VETA 1ATRA 2H3GX 4XEIA 3VERA 3H1QA 4IZ9A 3BF3A 2P9KB 3O4WA 4ISEA 3LDOA 1J6ZA 2V51B 2EWSA 1QZ6A 5JMVA 5KQ8A 2D4WA 4K25A 4QS8A 1R59O 5BN9A 3HI0A 2ZGZA 1SAZA 3FGUA 2HF3A 4FPAA 3MN5A 4H0VB 4BROA 3EO3A 2V7ZA 3L6QA 3UKRA 4JD2B 1YAGA 3HSCA 2GEMA 3WEEA 2WUSA 3IFRA 2ZF5O 3W3DA 2KHOA 3SMSA 4BR0A 4RTFD 2CH6A 3FZMA 5AQLA 2Q31A 4XH1A 4A2AA 3EKSA 4FWLA 4ISFA 4B9QA 4CI6A 4Z94A 5FPEA 3O6WA 3VF4A 4CZKA 5E84A 3CETA 3LDNA 1BUPA 4CJ7A 3C7NB 1BA1A 5F2RA 4B1UB 1NGHA 3VEOA 3OHRA 3VOVA 4FWQA 4BRKA 3CJAA 4YDUA 4BGBA 3U9DA 3DXMA 4EHTA 5AQZA 1LOTB 2E20A 2CH5A 1NGAA 2A40A 4M7XA 4EAHD 5KQDA 1EQYA 4GNIA 4I6MA 1MA9B 5AQOA 3BEXA 2ITMA 2P9PB 2Q0UA 4H5RA 2BUPA 3SLCA 3QFUA 5AQTA 2W40A 1XC3A 3D7EO 3TPQA 4CZIA 5KPRA 1CZAN 3AAPA 3H6EA 3LDPA 3AAQA 5AFUH 4H0XB 4H5TA 2E1ZA 4CZFA 3RSEB 3R6MA 2P9UB 4IWVA 5ELZA 5AQNA 4CBXA 3UB5A 1GLFO 1QQNA 4WYBA 4FOIA 2P9SB 3ULEB 4CZJA 4H03B 2CGLA 4IJAA 1MDUB 1WOQA 1HKGA 3MMVA 1XUPO 4GY2B 2P9IB 3VEVA 3EZWA 3QDKA 2D0PA 3JS6A 1BDGA 1V4SA 1E4GT 3O1WA 1ZC6A 4CD1A 3P4IA 5AQIA 4EFHA 2E8AA 1S22A 4BR4A 2QXLA 2YHWA 2VWBA 1DEJA 4BC4A 2GUPA 5F0XA 5AQKA 2FLOA 3TU5A 4BRLA 5B8HA 4JD2A 1H1VA 4CBWA 1RDWX 3A5LC 1X3NA 4B1YB 1G99A 2YI1A 4CZGA 3J8AA 3LM2A 4BRAA 3D2FB 3EL2A 3FLCO 1P8ZA 1NGDA 2F9TA 2IVPA 5AQFA 3FR0A 4CBUA 5F1XA 1TYQB 3A5NC 1ZXOA 2E2OA 3SK3A 1KXPA 4LC9B 5EX5A 5AZJA 1ZBSA 4QS9A 1HKBA 1LCUA 3CIPA 1RGIA 2YCHA 4EHUA 2QWPA 5EXWA 5BRFA 3LDLA 4FWSA 3ENOA 4FWNA 1U2VA 4IJNA 3ZX3A 1X3MA 4EIAA 2P9PA 1NGEA 4JAXA 3G25A 2ZGYA 1JCFA 2V7YA 3FZHA 4BR7A 1Z05A 4BRPA 4J8FA 1KAXA 3D2EA 3ZEUB 1BOTO 1C0GA 2GWKA 3BF1A 3MN9A 1ATSA 5ADXA 4IO8A 3VEYA 1D4XA 3MK6A 4BRFA 3FZLA 2P9NA 1XQSC 1YUWA 3M3ZA 1HX1A 1NLVA 4H5VA 3WXJA 3MDQA 4XH4A 4BRCA 4JN4A 2P9SA 2E1YA 2E2NA 3DXKB 5KPZA 1NGBA 3VGKA 2P9IA 3UKUB 3FZKA 1NMDA 3ZX2A 2OANA 1K8KB 2Q0RA 2ASOA 2Q36A 2NZTA 1DKGD 3GL1A 4FL9A 4BR5A 3W0LA 1C0FA 2E88A 5JLHA 4E1JA 1KAYA 2E2PA 4CZMA 2CGKA 5AZIB 1HJOA 2YHXA 1NGIA 1NM1A 3FE1A 4BRQA 5AR0A 5AFUA 5LJVA 1Y64A 1IG8A 2NLXA 3H46O 5AQWA 3WT0A 2A6AA 5FPDA 4C23A 2BTFA 3GG4A 1BG3A 4M7YA 2I7NA 3GDQA 2Q1NA 1QZ5A 1TYQA 1U6ZA 3CHWA 1RFQA 3BP8A 3F9MA 3DWLA 1GLAG 3VEWA 2YHYA 4H0OA 4H5WA 1BO5O 4DQ8A 3L4IA 3SMPA 1V4TA 2A42A 1Z6RA 3FZFA 2FF6A 2UYTA 3VESA 2FSJA 5AQJA 2P9KA 1NGCA 1GLCG 1YXQA 1T6DA 4BRHA 4WQ4A 3UKRB 3QB0A 3ATUA 3UE5A 3GOIA 1JCGA 5BRHA 3WEEB 2QWLA 4PKIA 1GLBG 2GELA 1ATNA 4NO7A 3WXLA 1BA0A 3ZEUA 4K42A 3A0IX 4CZHA 1NGGA 2NRHA 2ZWHA 3U4LA 5AQXA 3WUHA 4B1XB 3AY9A 4BQLA 3VGMA 3IDHA 4F9OA 2ASMA 2QWMA 3CJ9A 4FWOA 4RWTA 5E26A 4H0PA 4FWMA 3L0QA 4Y0WA 3M6GA 3DXMB 3LL3A 4ISGA 2V52B 2A3ZA 2P9LB 3U8XA 4H5NA 4PL8A 4A61A 1E4FT 5FPNA 3C7NA 4O5FA 4AM6A 3CQXA 3VEXA 3A8YA 4MLEA 5AQYA 3IUCA 5KPTA 4I6MB 2FXUA 4FWPA 4MO5A 3MN7A 4PKHA 3M1FA 2FSNA 5TKYA 2F9WA 2A41A 3HZ6A 2HF4A 4BREA 2PBDA 3CI5A 2YJEA 1NGFA 5AQPA 5AQHA 3QFPA 4WQ4C 3SJHA 1HUXA 4JNEA 2IVNA 5EOYA 4FWRA 1T44A 4HWIA 1GLEG 3FFKB 1NBWA 1S3XA 3O1BA 1NWKA 2QWQA 4H0TB 3CJCA 2W41A 5LJWA 3VGLA 5I9EB 3JXUA 1BU6O 3QMLA 3CJ7A 4L3QA 5BRDA 2CGJA 3O8MA 1GLDG 1JCEA 3ZETB 4NB4A 3RSEA 2P9UA 2VCPA 1SZ2A 5BPLA 3BUZB 4B1WB 5AQGA 3AARA 3WXKA 4BC3A 4XH5A 3ULEA 3H3OB 2Q2RA 4JHDB 4BRDA 1BWFO 3S41A 4A62A 2A5XA 4PL7A 3H3NO 4FSVA 2HOEA 3R8EA 1GLLO 4WQ5C 4B1VA 5LY3A 5JICA 3ENHA 5ADXH 4KBOA 3CERA 1TUYA 2Q97A 4QS7A 2ASPA 2YJFA 1GLJO 3LDQA 4IXCA 1HLUA 1QHAA 5BPNA 1IJJA 1QQOA 3A5MC 3QBWA 1HPMA 2FSKA 3DAWA 3WXIA 4BG8A 3EN9A 3WQUA 2HMPA 4BC5A 4DHYA 1X9JA 4BRGA 1SQKA 3HTVA 4K41A 4MLHA 4BR2A 3HBTA 3D2FA 3H1VX 2DPNA 5AZJB 3B8AX 2D1KA 3VF2A 4B1ZA 5BN8A 2P9LA 3CJBA 4CZLA 4FPBA 4MO4A 5AQMA 1U2VB 5AQRA 2PAVA 3MCPA 5BR9A 4BQZA 1DGKN 4H0YB 3A5OC 5AQUA 4BG9A 3MN6A 3IMXA 4DB3A 4BVOA 4A2BA 3D2EB 3HM8A 2AA4A 3QBXA 4M63C 5BREA 3QICA 3I33A 3ID8A 4CZEA 2P9NB 1T6CA 1MWKA 4K43A 5JLFA 5EY4A 4PKGA 4FWKA 2J4RA 3R9PA 3VF6A 3WQTA 3O08A 3VENA 4BRNA 1ESVA 4BGAA 3ZETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FO0A 4LF9K 1QQMA 5J2MA 1S72N 3OW2M 4YDUC 2GTDA 2G8HA 4B9UA 3LANA 5C0YA 2QW9A 3UKUA 2D0OA 2X74A 3ATVA 1S5JA 4MDBA 5FPMA 4GMJB 3JYTA 3VEZA 5EVZA 1VQMN 3PY8A 1BHLA 1KVAA 3V1QA 4W5QA 2NUBA 4NCAA 3ZX0A 4DG1A 3OYNA 3ZSOA 3OBYA 2HW3A 2AJQA 2IIRA 2QM1A 3DJCA 1CXUA 1IBKK 2KFNA 3O3HA 4BVPA 4CEBA 2WFBA 2ZM6K 2OTJN 2OPPA 3E1YA 3LP0A 1QTMA 1C0UA 1Q18A 1ATRA 2H3GX 5C12A 4IZ9A 2P9KB 3HSTB 4DTSA 4CECA 4WFAL 2VG7A 3SAGA 1KLNA 5KRTA 4IDKA 3O9UA 5JMVA 3DLBA 2D4WA 1R59O 1BQMA 3HI0A 1NJWA 1WAJA 1KVCA 4KTQA 2C1GA 2V7ZA 1D8YA 4KAZA 4JD2B 3HSCA 4YFUA 2GEMA 3V81A 2W00A 4DV1K 2X78A 4BR0A 4TSXA 3FZMA 2FBVA 3SJJA 5LMNK 1CLQA 1Q81O 4CJ4A 2Z1GA 4X62K 3O6WA 1RBTA 4JI6K 3VF4A 3ZSQA 2ZJPL 3THXA 5M1KA 1BUPA 1JLCA 5JS2A 3VEOA 4FWQA 3CJAA 2Q3SA 4YDUA 4BGBA 3U9DA 1S1WA 3DXMA 4OGEA 3AA3A 5AQZA 3S3OA 4CJVA 1NGAA 4EAHD 5HRSA 1SL0A 2EX3A 3BEXA 3V9SA 2Q0UA 2BUPA 3PIOL 1QE1A 1U4BA 4A57A 1XC3A 4W5OA 4IG3A 3NDKA 3OS2A 1L3VA 4RG8A 4M42A 3TR8A 3R1XA 4NYFA 3O9QA 4O8UA 4CVNE 3R6MA 4L8RB 4KHPK 3FFIA 4CBXA 1QQNA 1SKWA 4FOIA 2P9SB 4H03B 2CGLA 4CK3A 1HKGA 3MMVA 4GY2B 2I5JA 3VEVA 4FJIA 4CGDA 1HYSA 2HHSA 3JS6A 1BDGA 3QLHA 3LAMA 3VTHA 1Q8IA 4RW6A 4CD1A 3P4IA 4NLBA 3HL8A 5AQIA 4FLUA 4BR4A 2YHWA 4KI4A 3E01A 4CJEA 2PY5A 3HVTA 1RDWX 2FC0A 1SS6A 3DI6A 4AHCA 4IFVA 4N5SA 2QXFA 4E7IA 4BRAA 1Y97A 4OO1J 1WSGA 3EL2A 1P8ZA 4IDHA 5BR8K 2A1RA 3MECA 3THVA 1TYQB 2O8EA 3THWB 2E2OA 2OA8A 1ZBSA 4O4GA 3IRXA 1KFSA 2DFFA 4QS9A 1HKBA 1NK0A 1RGIA 4BE2A 1EETA 1NKBA 1BCOA 5FLXO 1S1XA 4IJNA 1X3MA 1BIUA 4EIAA 2P9PA 1X9WA 4DSKA 3AVJA 1NK4A 3O9SA 1Z05A 1JJ2M 4BRPA 1KAXA 3BF1A 3KIOA 1ATSA 4IO8A 4BDYA 3DLKA 4BRFA 3NH0A 1WSJA 2Z1HA 1HX1A 1NLVA 4H5VA 3MDQA 4JK9A 3OYIA 4CEQA 2O4GA 4FJMA 1RT7A 1KRPA 4K0KK 2E1YA 3AO1A 5HP1A 5LL6Z 5KPZA 4U7BA 3V6DA 3KK1A 1JXEA 4IOCL 4B3RK 3FZKA 4CFAA 3ZX2A 5GAHP 1JLBA 4M3XA 3DRPA 1ASWA 2Y1JA 2NZTA 3TSQA 3GL1A 3VQEA 3BDPA 4FL9A 3T1HK 1N6QA 1T7PA 1U48A 3H08A 2UUCK 4CEDA 4C8KA 2E88A 5JLHA 4JS4A 3HXMA 3SV3A 2ZJRL 1IKVA 2E2PA 3K5LA 2JWKA 3TWHA 2CGKA 5AZIB 3EYZA 3FE1A 4J2DA 5AFUA 1Y64A 4ZTJA 1CZ9A 3H46O 1VAZA 3WT0A 4CJUA 5TKWA 2BTFA 1JLEA 3CFPA 3RR8A 1HNXK 3J80O 1U6ZA 1RFQA 2G8IA 3VEWA 2HVHA 4H5WA 3MWTA 1Z6RA 4Z4GA 5DM7L 3CCVN 3QINA 4DQQA 4FJGA 4FZYA 3M8PA 1RDUA 1DTQA 4RW7A 4BRHA 3UKRB 4ID1A 5C2FA 1K73O 5GAEP 1DT9A 1ZBFA 1NNEA 3DOKA 4PKIA 1GLBG 4NO7A 4LFBK 1A5XA 2NRRA 4GV9A 4K42A 3TAPA 3A0IX 4CJSA 3MX2A 5AQXA 3VGMA 2W42A 4H0PA 3L0QA 1S1TA 2A3ZA 3AO5A 3KK7A 4WE1A 3L3VA 3U8XA 4H5NA 4PL8A 1VSHA 3K9KA 3K2PA 2IAJA 3RMBA 1E4FT 3C7NA 4JKGA 1KTQA 3MEEA 3NE6A 3MN7A 3HPHA 1E3MA 2IS3A 3M1FA 3G0ZA 4CERA 5CY4A 2A41A 5M1NA 5EU7A 4GVEA 4ILGB 4F8RA 3OYKA 3CCQN 4B9TA 2A1SA 1KFDA 3K5NA 3OS0A 3N4QA 4FWRA 4DV5K 4W5TA 1T44A 3NMUA 1GLEG 3CC7N 4FXDA 3MWPA 3KLGA 3L8BA 3CJCA 2W41A 4AHVA 4LF8K 3SQ1A 3T69A 4CE9A 1GLDG 1JCEA 4NB4A 1T03A 4LFCK 2P9UA 1HQUA 3TAQA 3F2KA 4B1WB 3DMJA 3EE9A 3AARA 4BC3A 4JHDB 3C65A 5I42A 4Q5VA 3IS9A 3R8EA 1GLLO 3BZKA 3EZ5A 1ZBIA 3ENHA 4CFCA 4CJ3A 5ADXH 3CERA 3F9KA 2Q97A 2ASPA 2YJFA 4IXCA 3ZYYX 1VQ7N 1L3SA 1QHAA 5FRNA 2D0AA 3A5MC 1J9AA 3KLHA 2R7YA 4CJTA 3T3FA 3EN9A 3J7AP 4IO9L 2HMPA 2HHWA 2DTUA 3OYMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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