3DXMB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck0993548
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of two classes of small molecule inhibitors of Arp2/3 complex
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
total genus 51
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dxmB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dxmB02
1LOTB 3AARA 4H0OA 2ITMA 1TUYA 3MDQA 4DQ8A 2I7NA 3FGUA 5BN9A 3QFPA 5AZJA 3KHYA 2E2OA 5LY3A 1T6CA 2NRHA 2D0PA 3O08A 4H03B 5E26A 3DAWA 5ADXA 4IZ9A 3QBXA 1MA9B 2ZWHA 2P9IA 2Q36A 2QM1A 4FO0A 4A2AA 1DGKN 3H1QA 2H3GX 3CQXA 4CZGA 4JD2A 3UB5A 1E4FT 2YCHA 2PAVA 5BRHA 3OHRA 4XH5A 1RDWX 4BR7A 2A41A 2Q31A 4C23A 3FFKB 1TYQA 4LC9B 3MN6A 3CJBA 4IO8A 4WQ5A 4O8KA 5TKYA 4AM7A 3DXMB 3BEXA 3JS6A 4QS9A 3QB0A 5BRFA 3GBTA 1D4XA 3DWLA 5F2RA 4RTFD 5AZJB 5BREA 3CJ7A 3EKSA 3S41A 4MLEA 4M63C 3O1WA 1Y64A 1QQNA 1YAGA 3O1BA 4CJ7A 3H3NO 1R59O 3KZBA 4BR9A 2YHXA 1MDUB 2P9IB 1X3MA 4PL7A 2A3ZA 4FOIA 2YJFA 3UKUA 3ENOA 5AQVA 3TU5A 3QBWA 4JD2B 1IJJA 2GWKA 2IVNA 2OANA 4IJNA 2ASPA 3VEWA 1GLDG 3IUCA 4HTLA 1HKGA 1G99A 2FSKA 3HSCA 1TYQB 2E88A 1RFQA 2AP1A 3VENA 3WEEA 3A5NC 1NGAA 1GLFO 1NGEA 1S3XA 5F1XA 5AQUA 1C0GA 3QICA 1WOQA 4BC3A 4CI6A 2FSJA 3IMXA 2FF6A 4CZKA 3LM2A 3M3ZA 5AQKA 5LJVA 2A40A 4B1XB 3VGLA 5AQSA 4DCHA 4PKHA 3U9DA 2P9UA 5AQJA 4WQ4A 1NGBA 1T44A 2QW9A 4BR5A 5B8HA 3B8AX 3QFUA 3WXIA 1X3NA 2A6AA 3JXUA 3C0BA 3G25A 4HWIA 4QS8A 1BU6O 1KAYA 3UKUB 3BUZB 4BRDA 1U2VA 1V4SA 1YUWA 3WXLA 1GLEG 1ZC6A 4NO7A 3SJHA 3FZMA 4FWNA 4FPBA 3U8XA 5BR9A 1U6ZA 3FR0A 3W3DA 4BROA 3H46O 5AFUA 3BF3A 1GLAG 3CERA 1NLVA 1NWKA 1RGIA 2P9SA 3WXJA 2D1KA 1ESVA 3FZFA 3A5LC 3ZX3A 2E1YA 2ZGYA 3VGKA 3F9MA 3CJCA 2NLXA 3C7NA 1K8KA 4NB4A 3VEVA 4K43A 4BR0A 2GWJA 3ATVA 3CJ1A 4H0XB 4BRCA 3SK3A 4CZHA 1HKCA 3CIPA 3GE1A 4L3QA 3LL3A 3ULEA 4ISGA 3VF4A 4H5VA 5AQZA 2P9UB 4Z94A 3SMSA 3EZWA 5JLHA 3VESA 3MK6A 3WUHA 3U4LA 2QWMA 3LDQA 3WXKA 3LDNA 4CZFA 5AQYA 5LJWA 4QS7A 2E2PA 3M1FA 4B1UB 3H45C 1U2VB 3SMPA 1V4TA 3MN7A 2V7ZA 3O80A 2CH5A 1SQKA 3HZ6A 3M6GA 5BPNA 5KQDA 1Z05A 3VEZA 4H0PA 4M7XA 2P9SB 4JHDA 1C0FA 4BRFA 4BC5A 5EXWA 3L4IA 2CGLA 2E2QA 2NZTA 4EHUA 3R8EA 3MMVA 4JNEA 3D2EA 4H5WA 3C7NB 4AM6A 1K8KB 2ASMA 1ZXOA 2UYTA 4BRGA 1KXPA 2GUPA 3VERA 4BREA 4CZJA 1JCGA 2YHWA 1HPMA 2Q2RA 2YHYA 4CZLA 3W0LA 3H3OB 3ULEB 4CD1A 5KPRA 4FWLA 1ATRA 5AZIA 1XUPO 1YXQA 2IVPA 2A42A 4B1ZA 4BVPA 2W41A 4YDUA 2QXLA 1SZ2A 1IG8A 4BVOA 1HKBA 3ZX0A 2HF4A 3SLCA 3A5OC 4FWOA 4PL8A 1NMDA 2IIRA 1P8ZA 3DXKB 3R6MA 1NGJA 3LDLA 2E1ZA 2E20A 4BQLA 2GEMA 3HBTA 4JHDB 4CZMA 3R9PA 4BG8A 2CH6A 2FF3B 2WUSA 1ZBSA 4MO4A 1KAZA 2Q0UA 4EHTA 3GL1A 3EN9A 1MWMA 4XH4A 4BRNA 4CD3A 3D2EB 1NGGA 3RSEB 4I6MA 2P9KA 5AQMA 2F9TA 1QZ5A 3ZEUA 2PBDA 3VF2A 1XC3A 2VWBA 4FOEA 4K41A 5AZIB 1GLBG 2F9WA 5AR0A 5FPEA 4CBWA 1BDGA 1Z6RA 4PKGA 3VEOA 3BF1A 3FE1A 1NBWA 4K25A 2CGKA 3D2FA 3A8YA 3FLCO 1Q18A 1S22A 3I8BA 2VCPA 4Y0WA 1BA0A 5AQLA 3O5BA 3DJCA 3VETA 5I9EB 4B1YB 4H5NA 2ASOA 1WUAA 2QWQA 3ZETA 5AQWA 4BRAA 3CI5A 3AY9A 3UKRA 4IWVA 4FWQA 1YVNA 4GNIA 2P9KB 4I6MB 3QMLA 4CZIA 2J4RA 3FZKA 5BPMA 2BTFA 3ZEUB 1HX1A 1MWKA 1JCFA 4FWPA 4WQ5C 4BQZA 2VYPA 4ISFA 4A2BA 2DPNA 5BPLA 1BO5O 3LM9A 4WYBA 4H0TB 4FWMA 3I33A 3WQTA 1BG3A 5KPTA 3GDQA 4BRQA 3HM8A 2V51B 3FZHA 4RCHA 5AQIA 4BRLA 4BRIA 1BOTO 3D2FB 4YDUC 2HMPA 1BUPA 4MO5A 2D4WA 2P9PA 3IFRA 3ATUA 4CZEA 1GLJO 3D7EO 4RWTA 3WT0A 1T6DA 1X9JA 1OKJA 3LDPA 4EIAA 3ZETB 5ELZA 3DXKA 4BRPA 3UKRB 2YJEA 1TUUA 4BRKA 3H1VX 2Q0RA 2W40A 1XQSC 3MCPA 2V7YA 3GG4A 4B9QA 3FZLA 4BGAA 5EVZA 4JN4A 4BRMA 3RSEA 3ID8A 1ATSA 5AQQA 2E8AA 1J6ZA 3O4WA 5JMVA 4B1VA 3HI0A 3IDHA 4FWKA 4CBXA 4BRHA 5F0XA 5BN8A 3UE5A 2BUPA 5AQXA 4B1WB 5ADXH 3AAQA 1NGHA 3A0IX 3O8MA 2P9PB 2KHOA 4MLHA 4WQ4C 5FPNA 3VGMA 1NM1A 5AQGA 3CQYA 5AQPA 3A5MC 5AQFA 4BR2A 4O5FA 5JLFA 5AQTA 2ZF5O 3ZX2A 2AA4A 3CHWA 2P9LA 3WQUA 4FSVA 4J8FA 2HOEA 1DEJA 2QWRA 3AAPA 1JCEA 4GY2B 4EFHA 5E84A 3O6WA 1KAXA 1QZ6A 4EAHD 2P9NA 3EO3A 1HJOA 1HUXA 1NGIA 5KQ8A 2V52B 3CETA 1HLUA 3BP8A 2FLOA 2IVOA 2YI1A 2Q97A 4K42A 3GOIA 2D0OA 4XEIA 2QWLA 4FPAA 2I7PA 4E1JA 3EL2A 3CJ9A 4BGBA 2CGJA 3VOVA 1LCUA 1E4GT 3MN5A 3VEXA 3H6EA 5CE3A 2QWNA 5AQNA 3LDOA 4BC2A 4IJAA 4H0VB 3HTVA 3P4IA 4BC4A 5AQHA 1QQMA 4JAXA 1BWFO 3J8AA 1CZAN 5EX5A 4FWSA 4H5TA 2P9LB 1SAZA 1QHAA 2E2NA 1NGDA 3VF6A 4ISEA 1DKGD 2QWPA 4M7YA 3MN9A 4IXCA 3L6QA 5FPDA 4H5RA 2A5XA 2P9NB 1NGCA 3QDKA 3U9ZA 4BR4A 2FXUA 4DHYA 4A61A 5EY4A 2HF3A 3ENHA 4FL9A 4F9OA 3KVGA 1H1VA 4CBUA 2EWSA 4XH1A 1ATNA 4A62A 3CJAA 4PKIA 1BA1A 5EOYA 1GLCG 4FWRA 5AQRA 1QQOA 2ZGZA 2FSNA 4DB3A 3TPQA 5FPMA 1NGFA 3WEEB 3VEYA 2QWOA 5AFUH 4KBOA 1EQYA 2GTDA 3EKUA 4H0YB 5AQOA 3VPZA 5BRDA 4BG9A 3DXMA 2GELA 3L0QA 5KPZA 2Q1NA 5JICA 1GLLO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H0OA 3MDQA 3O9RA 1C6VA 3FGUA 3PSIA 2D0AA 1SS6A 2E2OA 4CF0A 4CK3A 2OYQA 4FM2A 1XMOK 1JLBA 1RDCA 3P1GA 1S1XA 4BWJA 5ADXA 1MA9B 3CD6N 4U7BA 1B9FA 2ZWHA 3TAPA 1IV0A 4GVEA 2PAVA 2BH1A 3QETA 3OHRA 4JK8A 4ZTJA 1RDBA 2WTUA 4OX9K 2A41A 2Q31A 3FFKB 1TYQA 3CCUN 3DM2A 5TKYA 1HNIA 4QS9A 1VSIA 4JLHA 4X65K 1NMNA 2HHSA 3QB0A 4X62K 3NH0A 1MU2A 1EXQA 1HNVA 1NU0A 1YITN 4M63C 1QQNA 4KTQA 3KZBA 2YHXA 1MDUB 3C6TA 4FOIA 5M1OA 4W5NA 3D0PA 2NNWA 4JD2B 4IJNA 3HXMA 2FC0A 2PY5A 4HTLA 3TSQA 3OTOK 2FSKA 4E3SA 5AJ3K 2AP1A 2XO7A 1WSIA 3WEEA 2ZD1A 4FJJA 3KLGA 1N6QA 3QICA 1WOQA 4CI6A 2HBJA 2FSJA 5HL7L 1HMVA 4CF2A 1KD1O 3TAMA 4IO9L 1B9DA 5AQSA 2QKKA 1S1WA 3OYLA 2P9UA 5AQJA 4WQ4A 1YF5L 1VSJA 2ZJPL 2QW9A 5B8HA 1WSGA 1X3NA 2A6AA 3QO9A 3JXUA 4DTRA 4KREA 3G25A 3IG1A 3SBGA 4BRDA 4WE1A 3WXLA 1GLEG 3V1RA 1ZC6A 4NO7A 3FZMA 3TABA 3W3DA 3H46O 5AFUA 3AA4A 3CERA 1NWKA 1ESVA 2NRXA 2GV9A 4PA1A 3VQDA 3VGKA 3F9MA 5H1SQ 2NLXA 4DLEA 1IBKK 1K8KA 3OBYA 1TGOA 1EKEA 3ATVA 5HBMA 3CJ1A 4E1MA 4YOUA 3CIPA 5HLFA 3TTDA 1UA1A 4ISGA 3I0RA 4M3ZA 4H5VA 3VQBA 3MEEA 3VESA 4JI6K 2QWMA 3TI0A 4CZFA 1QSYA 4OPHA 3NGZA 3EYZA 4KHNA 3O3FA 4B1UB 1U2VB 1TKTA 3MN7A 4OVLA 3C6HA 1U47A 5SZTA 2YX6A 5KQDA 3VEZA 2P9SB 4JHDA 1C0FA 4FJHA 5EXWA 1B92A 2E2QA 2NZTA 4EHUA 2XY7A 4H5WA 4DUYK 2ASMA 1XHZA 2UUAK 3KWGA 4NCBA 3M5RA 4AH9A 3VERA 4CZJA 1P90A 2YHYA 4CZLA 4FVUA 1EWQA 1FXXA 4AQYK 3LANA 4CD1A 4IEEA 2R7YA 1TK5A 2KTQA 5AZIA 3OY9A 1YXQA 2OPPA 1JXEA 2A42A 2YKNA 3VQ7A 2W41A 3ZSVA 2QXLA 1S6QA 4BVOA 2G8KA 3E9PA 2Z1HA 1KQSM 2IIRA 1P8ZA 4CJQA 2WC9A 3RMAA 3HBTA 4BG8A 3D6RA 2Z1JA 1K8AO 2NRZA 1ZBSA 4IKFA 1KAZA 3GL1A 2HHQA 3RTVA 5AQMA 3V1OA 1QZ5A 3ZEUA 3G0ZA 3F9KA 3VF2A 1U4BA 3KTQA 3T1HK 2VWBA 1NJWA 4FOEA 4KTWA 1J53A 1YIJN 4C1NI 1BDGA 3LDSA 2O8CA 1IKWA 4PKGA 1ZBUA 3FE1A 2VWJA 2YNIA 3P39A 3D2FA 3N4QA 3EEQA 3FLCO 1S22A 3I8BA 2VCPA 4KHWA 5AQLA 3DJCA 1WUAA 2OTLN 2IC3A 3AY9A 4BE7B 2VQEK 3G6EN 4PQUA 4I6MB 1BCOA 3DLRA 3V4IA 1KRPA 1SL2A 4A2BA 4O0IA 2DPNA 4H0TB 2O8DB 4YOYA 2Z1GA 3HPHA 1WBDA 3DOLA 4FXDA 4YNQA 3KK2A 5AQIA 1YJWN 4IG3A 3VQEA 4YDUC 1BUPA 1DLOA 3C65A 3IFRA 3ATUA 2DFHA 1GLJO 1DT9A 2W6KA 5GADP 1T6DA 5DK5A 4I9LA 3DLHA 4JEPA 2YV0X 4HCBA 4C8OA 4FJ5A 5FRNA 1KVCA 1HQUA 1RTHA 4NYFA 3VN5A 4DFJA 2V7YA 3FZLA 1TK0A 3OVNA 4KPYA 3ID8A 1ATSA 1J6ZA 1EO1A 4B1VA 3HI0A 3ZSYA 4CBXA 1RT3A 3EE9A 3Q7BA 3OJUA 4E7LA 4FJXA 5F0XA 3ZSWA 1T03A 5BN8A 4C8MA 3O9TA 5AQXA 3OYFA 3DMJA 4DR5K 4B1WB 5ADXH 1VQ8N 1NGHA 4LD0A 1ASUA 5GAGP 1R0AA 2NRVA 2KHOA 1CXUA 3TR8A 1LWCA 5M1NA 2I5JA 3CQYA 5AQPA 3A5MC 3U6FA 1X9SA 2ZF5O 3ZX2A 3WQUA 4RW4A 3AGRA 4KAZA 4FSVA 2HOEA 4DFMA 3C95A 4IFVA 5CR4A 4BE0A 4GY2B 5E84A 1RBTA 4XIUA 3K5LA 4DWIA 2P9NA 1JLCA 3EO3A 3HO1A 4WCEL 1HUXA 1OH7A 3CETA 1QSSA 3BP8A 2FLOA 1C0TA 1NKEA 1L3SA 3CFRA 5C12A 4I2PA 3K58A 3NH1A 3VA0A 4M3YA 4FPAA 4E1JA 4BGBA 1VQ6N 3VOVA 4FJKA 3HPGA 3VEXA 5I42A 4RW9A 4IJAA 4H0VB 4BC4A 2ITGA 5AQHA 3F73A 4A57A 3J8AA 4H5TA 3HK2A 2VGMA 4FLYA 3PIOL 1QHAA 4DV3K 4GMJB 3OYNA 3VF6A 1O1WA 2F8SA 4IXCA 1KLNA 4H8KA 1VSDA 4Z4HA 3MECA 4LF7K 1DTQA 1GOBA 4WFNL 5C42A 4A61A 1VQKN 3ENHA 4IDHA 4J2AA 1C1AA 3SAFA 4CBUA 3LAKA 4NCAA 1ATNA 3ZSZA 4CERA 4PKIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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