3EKSA

Crystal structure of monomeric actin bound to cytochalasin d
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
molecule tags Contractile protein
source organism Drosophila melanogaster
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3eksA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3eksA03
1BWFO 3CETA 1Y64A 3QMLA 4MLEA 4A62A 1Z05A 4BVOA 1GLEG 4BR7A 2D4WA 2HF3A 3ULEA 3A0IX 3GBTA 4CD3A 4DCHA 3FR0A 4ISGA 3R9PA 3UKUB 3HSCA 3LDQA 4H5WA 3VGLA 2P9LA 2GWJA 4EIAA 3AAQA 3SLCA 3ZEUB 3IUCA 3WEEA 2IVNA 1HX1A 1KAYA 2GWKA 2UYTA 3I8BA 5AQJA 5LJVA 2IVPA 3HTVA 1T6DA 1YVNA 3VERA 5JLHA 2CGLA 3J8AA 2I7PA 4WQ5A 2IIRA 4BRKA 1DKGD 4A61A 2CH6A 2E2QA 3ZETB 2HF4A 3WUHA 1KAXA 1SAZA 2NRHA 4YDUA 4DHYA 1U2VA 3FZLA 2YCHA 4RTFD 2V51B 2W40A 3OHRA 2BUPA 4PKIA 5AFUH 4BREA 3G25A 2A3ZA 2GELA 2Q97A 3QBWA 3O8MA 1J6ZA 1NMDA 3SJHA 1EQYA 4B1VA 4I6MA 4A2AA 5BRFA 4XEIA 1LOTB 4IJAA 4CBWA 3EO3A 5AQZA 4BQLA 1SQKA 2D0PA 2QWNA 5AQHA 5JICA 4O5FA 3CQYA 3H1VX 4H0YB 2CGKA 4CD1A 3CJAA 3HM8A 4K42A 3VGKA 4F9OA 1MA9B 5JLFA 1ATNA 3VF4A 3VETA 3DAWA 4MO4A 2E1YA 1JCGA 3KZBA 3VEZA 4H5NA 2NLXA 1XC3A 4NO7A 3VEOA 3QBXA 3U9DA 1NM1A 4MO5A 5AR0A 4PL8A 3UKUA 1CZAN 1KXPA 2ASMA 4PKGA 3VF2A 4EFHA 3WQTA 3B8AX 4B1YB 3FZKA 4JNEA 4BR2A 2QW9A 5AZJA 5F1XA 3DXMB 4FO0A 3ENOA 1E4GT 2Q36A 5AQXA 4BVPA 1QZ6A 5BPNA 5BR9A 4M7XA 3BP8A 5KQ8A 4CZMA 1U6ZA 4WYBA 5AQUA 4K43A 3EZWA 5AQTA 1HPMA 4Y0WA 3ZETA 3ATUA 3VGMA 5AFUA 4XH1A 4IWVA 1NGJA 4FWLA 2E2PA 4CZLA 1WUAA 1S3XA 4B9QA 4CJ7A 5KPZA 1K8KB 2GTDA 4MLHA 4RCHA 3H3OB 5CE3A 2ASOA 3UB5A 5BPMA 1YAGA 3O5BA 3P4IA 1Q18A 2AP1A 4CZGA 1GLLO 5BREA 3CHWA 3ZX3A 3SK3A 4XH5A 4QS8A 1G99A 1S22A 1V4SA 5EOYA 3U9ZA 2BTFA 3VEYA 3AAPA 4BR4A 1YUWA 5AQVA 1MDUB 3MK6A 2P9IB 1RGIA 1BOTO 2GEMA 3WT0A 1JCFA 2QWPA 4M63C 3RSEA 1QQMA 5KPRA 5AQFA 3CJ7A 3BF1A 5AQLA 1DGKN 4BR9A 2WUSA 2QWRA 3GG4A 2ITMA 1QQNA 5E26A 5AQNA 4JHDB 4IXCA 3AARA 3VF6A 3W0LA 4CBXA 1HJOA 3BF3A 4C23A 3H6EA 4K25A 4BRHA 4BRNA 3MCPA 4IO8A 3FZHA 2YHWA 2P9PB 1TYQA 3FLCO 2FSNA 3A8YA 1V4TA 1GLCG 3M1FA 4NB4A 2YJFA 3L6QA 3WXLA 4CI6A 3O80A 1D4XA 3L4IA 2P9UB 3O1WA 3SMPA 4FWMA 4FWKA 2CGJA 3D2FB 3MN7A 1OKJA 3ATVA 2Q1NA 2E88A 4H03B 2YI1A 4E1JA 1R59O 3D2EB 1XQSC 4H0TB 2ZGYA 2E8AA 3DXKB 3O6WA 2CH5A 4BRFA 3ENHA 2IVOA 3LDPA 1X3MA 3F9MA 2HOEA 4GNIA 5AQKA 2VWBA 4B1UB 4FWNA 5AQYA 1TUYA 2A41A 3LDNA 4H0VB 4IJNA 3C7NB 3CJCA 1GLFO 2W41A 1LCUA 4BRLA 3M6GA 1H1VA 4L3QA 1ESVA 2V52B 2HMPA 2Q31A 4CZKA 4JAXA 5B8HA 1GLJO 1BO5O 4H0OA 3LL3A 4FWRA 2QWOA 2P9KB 3D7EO 2FLOA 5AZIB 5AQIA 3M3ZA 1ZBSA 4JHDA 1NGDA 4DB3A 2ASPA 4AM7A 4BC3A 3VEWA 3MMVA 3ZEUA 1NGEA 2ZGZA 3FZMA 4JN4A 3ULEB 1BA0A 1NGIA 5BPLA 3FE1A 3UE5A 2A5XA 1QZ5A 1ZXOA 2Q0RA 2VCPA 3CJ9A 3LM9A 3WXKA 2P9LB 2D1KA 3MN5A 4CZFA 2P9UA 4O8KA 4XH4A 4BRDA 3D2FA 1X9JA 3MN9A 3WEEB 3DJCA 1ATRA 1BG3A 4A2BA 3U4LA 2YHXA 4H5RA 3BUZB 3IDHA 2P9NB 1BDGA 2ZWHA 3IFRA 4FWSA 3DXKA 2A40A 5ADXH 5FPDA 3H45C 2Q2RA 4WQ4C 4Z94A 4BG9A 5AQQA 1NGFA 5AQMA 3EL2A 4DQ8A 4KBOA 3ZX0A 3A5OC 1U2VB 3C7NA 2FXUA 2V7YA 4H0XB 5ELZA 1Z6RA 1C0FA 1NWKA 4EHUA 3WQUA 2KHOA 5TKYA 4CZIA 2QXLA 5I9EB 1IJJA 3O1BA 4FOIA 2DPNA 1JCEA 2A42A 1NGCA 3C0BA 1DEJA 3W3DA 2P9KA 2YHYA 1MWKA 2D0OA 2J4RA 4QS9A 3GL1A 5AQWA 5AZIA 4BGAA 5EX5A 4B1XB 1GLAG 5LJWA 2F9WA 4H0PA 2A6AA 3H1QA 1E4FT 3MN6A 4K41A 3CQXA 1HUXA 4RWTA 3DXMA 3GE1A 4EHTA 4BC4A 2E1ZA 1T44A 2Q0UA 4FWOA 1HKGA 4JD2B 1HLUA 1BU6O 3R8EA 4BRAA 2QWMA 2FSKA 2P9SB 3QB0A 4LC9B 5KPTA 4BRGA 4BGBA 4FWPA 3HZ6A 2E2NA 4H5TA 3LM2A 2VYPA 5LY3A 5EY4A 3R6MA 5AZJB 3LDOA 5AQOA 5ADXA 3CJ1A 4ISEA 3UKRB 2QWQA 1K8KA 2P9NA 4BRIA 5BRHA 1QQOA 3GOIA 1RDWX 3EKSA 4HWIA 2NZTA 2V7ZA 3A5MC 2ZF5O 1X3NA 3QFUA 3KHYA 3FGUA 5JMVA 4WQ4A 3L0QA 4FL9A 4AM6A 1GLBG 3IMXA 4FSVA 1TUUA 2EWSA 1C0GA 1KAZA 1IG8A 1NGHA 3A5LC 2P9IA 4CZEA 4GY2B 3QICA 2YJEA 4BC5A 4FOEA 3U8XA 3WXJA 3EN9A 2H3GX 2OANA 5AQGA 3TPQA 3HI0A 3BEXA 1GLDG 1SZ2A 2I7NA 5AQPA 4BROA 3JS6A 3LDLA 2FF3B 4BRMA 4BG8A 4BR5A 4BC2A 1ZC6A 2AA4A 5F2RA 3VEVA 4BQZA 3GDQA 3H3NO 4J8FA 3RSEB 3VESA 2P9PA 3EKUA 3ID8A 3ZX2A 5E84A 4CBUA 4JD2A 5BN9A 3SMSA 4BRCA 4CZJA 1BUPA 2F9TA 2GUPA 4BRPA 2P9SA 5FPNA 4CZHA 3I33A 2FF6A 3HBTA 1P8ZA 5AQSA 3AY9A 3H46O 4QS7A 1NGGA 2PBDA 4FWQA 4FPBA 3D2EA 4IZ9A 4WQ5C 4H5VA 5F0XA 3FFKB 3UKRA 3CERA 1NBWA 1TYQB 4BRQA 1XUPO 5EVZA 5BRDA 3CI5A 1QHAA 1ATSA 3FZFA 2PAVA 3VENA 1NGAA 1RFQA 3CJBA 3WXIA 4YDUC 5BN8A 4HTLA 4M7YA 3TU5A 1WOQA 5FPEA 1NGBA 3DWLA 5KQDA 1HKCA 1HKBA 1MWMA 4B1WB 1BA1A 3VEXA 3MDQA 5EXWA 5AQRA 2FSJA 4PL7A 3O08A 2E20A 4PKHA 4FPAA 3VOVA 4EAHD 4BR0A 5FPMA 1T6CA 2QM1A 3KVGA 3A5NC 3QFPA 3S41A 4B1ZA 2QWLA 3QDKA 4I6MB 1YXQA 3VPZA 3CIPA 3O4WA 3JXUA 4ISFA 1NLVA 2E2OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CETA 4A62A 4BDPA 4CD3A 5T7BA 3FR0A 1O1WA 4DV6K 3T1HK 3PLAA 2X78A 3N4PA 3R9PA 3KD5E 4F2SA 3ZLJA 2P9LA 3LZJA 4UQGA 4A57A 3PY8A 3SLCA 3IUCA 5LJVA 4FK4A 1RILA 4OPAA 4DR5K 4DUZK 3L3VA 3O9QA 4HUGA 2CH6A 2OPPA 3ZETB 3WUHA 4X62K 2NRHA 4CEFA 1RBTA 1VSHA 3OY9A 3OHRA 2BUPA 1BCMA 4EP4A 3G25A 4U67L 2XY5A 4CF1A 4DV0K 2Q97A 1NMDA 3SJHA 1YITN 1EQYA 3G10A 3LP1A 4I6MA 4CEZA 2HHUA 5BRFA 4XEIA 4CCHA 1RT2A 4PWDA 3HSTB 1T8EA 3THVA 1Q81O 1NKBA 3CQYA 3O9SA 4CD1A 3CJAA 1VQ4N 1YVUA 3T3FA 2P51A 3ZT1A 3ZT4A 4F9OA 3HK2A 3U3YA 5KGXA 3VF4A 5GAHP 1VQON 1A5VA 3VEZA 3VEOA 4NO7A 3ZT2A 3KLGA 3L2RA 4N56A 4E0DA 3TAFA 3UIQA 3UKUA 3RWUA 3AVGA 3NGYA 4PKGA 5LL6Z 3ASMA 3WQTA 3NH0A 3KWGA 1WBDA 2P1JA 4JNEA 1JKHA 4BR2A 2QW9A 1M90O 4H8KA 2HBMA 3THWB 5AQXA 4BVPA 4L8RB 4CGGA 1U6ZA 4JI5K 4JK9A 5CYMA 3TAGA 4AHSA 1HQEA 1QTMA 3EZWA 5AQTA 1HPMA 1UA0A 3L2QA 2NRRA 3VGMA 3ALYA 1XWLA 3SPYA 4XH1A 1VHXA 1IBLK 4CZLA 5KPZA 1VQ8N 4N41A 1KVCA 3O3HA 3VQDA 3OBYA 1HRHA 4MLHA 3H3OB 3CC7N 3O5BA 1JXBA 1Q18A 3OYBA 3OYMA 1GLLO 1D9DA 1OH7A 1G99A 1ZBUA 4YHHK 2XHBA 4YNQA 1JCFA 2QWPA 4M63C 4O55A 3AVMA 2EX3A 3CJ7A 4W5NA 3BF1A 4JK7A 4CJPA 2QWRA 3SUNA 1QQNA 5E26A 5AQNA 3W0LA 4YFUA 3VTHA 4KTQA 4BRHA 3VQ8A 4KHPK 4IOCL 1REVA 5MLCQ 4G1QA 1DT9A 2YHWA 1FK9A 1TYQA 4IOAL 1HNWK 4DSFA 3A8YA 1V4TA 1GLCG 3THXA 1WSEA 2XY8A 3M1FA 4XIUA 4CI6A 4B9MA 3O80A 2QKKA 3L4IA 4JV5K 1W7AA 4FJ7A 3OS1A 1QSLA 2E88A 4C8NA 2YI1A 4FJ5A 4KFBA 4ELVA 3O6WA 1ZYQA 3HO1A 4W5RA 3MEDA 1RT7A 3F9MA 3AO1A 3E9PA 3NBPA 3ISNC 4B1UB 1HYSA 5AQYA 1TUYA 3LDNA 3ZSQA 1XC9A 1GLFO 1LCUA 5IT9O 1K73O 1ESVA 3CXCM 1SUQA 4ID5A 4CHQA 1GLJO 3VQPA 5C42A 3LL3A 3TABA 2QWOA 3CM5A 1KRPA 3D7EO 4KI4A 3CC2N 3CQ8A 4B3TK 1WSGA 3M3ZA 4FM2A 4O0JA 1RBRA 4CJ3A 1NOZA 3SQ4A 4CE9A 4KHNA 4B3OA 2ZGZA 3FZMA 3KK1A 3HOSA 4NCBA 4CIEA 1XHXA 1BL3A 3UE5A 4KAZA 2C1GA 2VCPA 2RE2A 3LM9A 2P9LB 4DTPA 2P9UA 3D2FA 3DOKA 3BGRA 1BG3A 4H5RA 3BUZB 3MXJA 2VWKA 3CMEN 1XMQK 3DXKA 1J54A 1TV6A 2FBYA 4WQ4C 2HW3A 4OKEA 3V1QA 1Y97A 4C8MA 3J7AP 3ZSYA 2W00A 2O8EA 4KBOA 4CIFA 4IKFA 2V7YA 1C0FA 4E7HA 4DU3A 4HVJA 3BZCA 5I9EB 3NAEA 1IJJA 4DU4A 4GKKK 3K9KA 1WSFA 1DEJA 3W3DA 4J2DA 1EWRA 1YIJN 1XMOK 2F8SA 3DRPA 5HRPA 3O4NA 2YNHA 2KKZA 3T69A 3L2UA 2E6MA 3NDKA 4H0PA 3CQXA 1B9FA 3MX5A 2QXFA 4EHTA 2Q0UA 4FWOA 1HLUA 3NH1A 4FM0A 2A1SA 4Z4FA 3NF7A 1WSJA 2QWMA 3MCAB 4BRGA 4FK0A 4CJUA 4O44A 3OS2A 2E2NA 4H5TA 3LM2A 3QLHA 2BH1A 3R6MA 4WFAL 4R5PA 4KH5A 2O8BA 3CJ1A 4ISEA 2O8FA 1T7PA 3L2WA 3I55N 1RDWX 4HWIA 5JS2A 2V7ZA 3F2KA 3KJVA 2ZF5O 3AO5A 4WQ4A 1QSYA 4AM6A 1J5OA 1GLBG 4CJLA 5LMUK 1VAZA 1C0TA 2HHHK 1MU2A 1BQMA 1NGHA 3ZCMA 1YT3A 1U47A 3CCJN 4GY2B 3PO4A 4PA1A 3AA4A 3U8XA 3WXJA 2DFEA 2XO7A 1QHTA 4DLGA 1VQNN 4LF7K 3I0SA 3I56N 3BEXA 4BROA 2QI2A 3AA3A 4RW4A 4WE1A 4JEPA 2IS3A 1OH6A 4F8RA 1Q9XA 3C95A 4BC2A 2KQ2A 4CF8A 3TWHA 3FFIA 5D3GA 4J8FA 3NGZA 1HJRA 2P9PA 1I94K 4CHNA 1WLJA 3C94A 2Z1JA 4KTWA 2O8CA 3ZX2A 1ZBHA 3CG7A 1BUPA 1SS6A 3PO5A 4CF2A 1ITGA 1K6YA 3I33A 1RTIA 4WF9L 4FJGA 2NUBA 4NYNA 4YOTA 4HUEA 2PBDA 4A59A 4IZ9A 4HCCA 3UKRA 3CERA 1NBWA 1TYQB 4BRQA 3HVTA 3M8QA 5EVZA 5BRDA 3THXB 3FZFA 1EX4A 3QESA 3A2FA 2HHIA 4YDUC 5BN8A 2QKBA 1WOQA 4CEBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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